3MPMA

Lck complexed with a pyrazolopyrimidine
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
261
structure length
257
Chain Sequence
WEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPSGIKLTINKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRNLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTARFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title New pyrazolo[1,5a]pyrimidines as orally active inhibitors of Lck.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Lck
total genus 82
structure length 257
sequence length 261
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3mpmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3mpmA01
2XA4A 5GJGA 3AD4A 3JPVA 1FINA 2UZDA 2IZRA 3AC1A 4RVTA 5KUPA 5JGBA 5D11A 3IDCA 2R64A 3EZVA 2CNQA 2OICA 2R7IA 4BRXA 5AX3A 3VN9A 1LEZA 1ZYLA 3GU4A 3PY0A 3VS5A 3ALNA 3V6RA 4MKCA 4FKTA 4RIYB 1H1QA 3ORNA 3EQGA 4QYGA 4RGJA 4IQ6A 4F99A 3NVMB 4AN2A 4S34A 1XKKA 4L01A 4CEGA 4FBXA 3MPAA 4J8NA 2WPAA 1DAYA 2VV9A 5FP6A 4R3PA 4RJ3A 1UU7A 4RLLA 3C4CA 1YHSA 4L67A 4IW0A 4PRJA 4NTSA 4EJ7A 3E3BX 4M8TA 4W9XA 5BVWA 3FKLA 2XRWA 3DXQA 2PE0A 3P9JA 1H26A 2W1HA 3OXZA 3TJCA 4YLKA 1KV2A 4C02A 4WG4A 5K0XA 2O64A 4BWXA 2ZYBA 4P5ZA 1OPKA 2BZJA 3ORKA 4BIEA 2ITVA 3EN5A 1GZNA 4USFA 5EOBA 1EH4A 4IX5A 3OTUA 4OTHA 3UPXA 1Y8YA 3VF9A 4CV8A 4KBCA 4DINA 4NWMA 3R8LA 4YHFA 2QHMA 2GPHA 1CSNA 2AYPA 3O7LB 3ZSHA 5CQWA 4EEVA 3LFBA 3DB6A 1OB3A 4JRNA 4ERWA 3NW6A 3FMDA 4RWIA 2UW4A 4QP2A 5CEPA 4AGDA 3A2CA 3C4FA 1U4DA 3I0QA 3R7UA 4FUXA 3SRVB 2XK7A 3QTRA 2WQOA 5IG1A 2F49A 3NW5A 2WTWA 4ASXA 5M08A 2VX0A 3ZSIA 4IAZA 1VYZA 3MS9A 4EYMA 4C2VA 4J8MA 4IE9A 2VWBA 4RIXB 3E88A 3FQSA 5EHOA 5B2MA 1KSWA 2R3HA 4BI2A 2WMVA 4F6SA 5IF1A 1STCE 1ZY5A 5DGZA 1YOJA 4PPBA 2OZAA 5E1SA 4DG0E 2UZLA 4U81A 5DA3A 4ACHA 5A4EA 5IMXA 2W1GA 3DBFA 3H9RA 4R5YA 2WQEA 3PPZA 4TZRA 4ZOGA 2A2AA 1NT2A 4OAUC 4AW1A 2OG8A 3PSBA 5AV1A 1CDKA 5DR2A 4U43A 3G0FA 4IX3A 4JQ8A 4RQKA 3SOAA 3BI6A 5LVLA 5FBNC 2UVYA 1VEBA 4R7HA 3TKUA 1YHVA 2WEIA 3LPBA 4KIOA 2C30A 3QQFA 4B7TA 4D4YA 4O7LA 4YPSA 3KMMA 5CXHA 3A62A 3CE3A 3GC0A 4EJNA 4BCQA 2OLCA 4YJNA 2VWWA 1B38A 2WQNA 3GU8A 4Y73A 3UBDA 1GY3A 2OXXA 4NK9A 1P5EA 4PDSA 4QMWA 4D55A 5IA4A 3O23A 2VAGA 4HVGA 2C3IB 4A07A 5DT4A 3NWWA 3RI1A 3UC4A 4FYOA 5BVDA 4DCEA 5JQ8A 3QRTA 4CRSA 2CCIA 3IW8A 2QKWB 4KKHA 4K2RA 3KF7A 1QPCA 3KVWA 4WUNA 5M06A 2X8EA 5CQUA 1OPJA 2WTCA 2ITTA 2V62A 5AAFA 3VS3A 3NW7A 4QRCA 3FMKA 4BWKA 3R8UA 4U0IA 4ZS4A 1PXKA 4FGBA 1E1VA 4ZK5A 4U9AA 3BEAA 4M0YA 5E8SA 5I3OA 3GUBA 4CSVA 3ID6C 2A19B 1YWVA 5AP1A 1NXKA 2B55A 3LLTA 4HYIA 4JX7A 4W4VA 4X3FA 1KE6A 2NRYA 1U5QA 4WD5A 4EUUA 4TYHB 3U54A 4ZTMA 3KU2A 3EN6A 4X21A 3RWQA 2UZTA 4XLVA 1YOMA 1JLUE 1Q99A 4PDOA 4ZXTA 3WILA 2WTVA 3ODYX 4A4XA 4OTPA 2AC3A 2P2IA 4Q5HA 5IQCA 4O7YA 5HTIA 5HLPA 4S30A 3I6UA 1SVEA 3TZ7A 3DQXA 2FSMX 1IEPA 4R7IA 1H24A 4DFZE 2NNWB 5BVFA 2WMAA 4HNFA 4UMQA 1WBNA 1IA8A 2J5EA 2RSVA 5IEYA 1RE8A 4NCTC 4AW5A 5D7AA 3LCOA 3TUDA 4QMLA 4EK3A 4CFWA 4F9CA 4FKQA 4BKZA 4FTIA 5AV2A 4FIFA 4BTJA 2YJSA 1IG1A 3LXPA 4D9UA 5CVFA 4HYUA 3GCUA 4FL3A 3PJ8A 4PTEA 4RA4A 5EM5A 3NIEA 4LG4A 4EYJA 2OKRA 3GT8A 4WOVA 2WMSA 3BX5A 3CC6A 3L9NA 2XBJA 3HMIA 4FKGA 3S95A 3MWUA 3OFMA 3QD4A 3KULB 2QKRA 1K9AA 2XMYA 4QNYA 4FKIA 5AUUA 1J91A 2GTMA 3EIDA 3Q5ZA 4MXXA 1K3AA 5HIEA 2C1BA 4FV1A 4BN1A 5CZIA 5IA0A 5HICA 4DGLC 3DBCA 3G15A 4D1ZA 3FUPA 4KIQA 1FBNA 2VWVA 4WNOA 5AP3A 1KE5A 4HGLA 4D4SA 3FLWA 1G5SA 4YZMA 4UZHA 4DGOA 5BX0A 1AD5A 2YIXA 5FUTA 4DGNA 2HZ0A 3BU6A 2VTOA 3QLGA 2XNMA 5J9ZA 5CAVA 3HV5A 1LPUA 2V0DA 4YP8A 2HZIA 4WNMA 4ZP5A 4V04A 2VO6A 4FA2A 1WBPA 4ACCA 1PMVA 1A9UA 3ZRKA 2W1FA 4JG6A 2XK9A 5CEKA 5JKGA 2RGPA 4OTWA 4EH3A 2C69A 3U9NA 3PIZA 4FVRA 4EOMA 3DCVA 5DEYA 3GEQA 3EFWA 5I9XA 3W2RA 5K5XA 5B0XA 4FT0A 2QOKA 5AWMA 3B2WA 3BHHA 4FYNA 2OXDA 4H1JA 2C5VA 3LFDA 2PPQA 2C6KA 4CZUA 2XP2A 5E9EA 2E9OA 5BPYA 4RIWB 4AA5A 2I0YA 5JRSA 4LFIA 3IO7A 1XWSA 2WQMA 3CKXA 3RMFA 4ZY5A 4FZ6A 2A4LA 3FC1X 2QNJA 4FZ7A 2QU5A 3K5VA 4F6UA 2FB8A 4U8ZA 2UZVA 2IZTA 4AU8A 4YUQA 4CTCA 1CMKE 4I4FA 2J50A 4RX9A 4NM0A 3UPZA 5M4CA 5LVMA 3OWLA 4BDJA 3T9TA 5IA2A 1IR3A 4BZOA 5KBQA 2BRMA 2WGJA 2OJJA 4M68A 4YO6A 4PUZA 1PMEA 2C5YA 4FT3A 2KTYA 3FI3A 3FXWA 5H8GA 4CCUA 2F2CB 2BR1A 2HENA 4BKYA 4RPVA 2H8HA 3F88A 4ZIMA 4EK8A 4CYJA 5CVGA 2B9JA 1XH8A 4Y83A 4IDTA 3HECA 3GB2A 1YDTE 4K1BA 2C3KA 1FOTA 4C4IA 3PXQA 3RJCA 3WBLA 5ICPA 4EH9A 5DLSA 3E63A 2ZDUA 2QONA 4S31A 2JKKA 2PUNA 3NYOA 4XH6A 1REKA 2R3RA 4O7TA 4EOJA 4M84A 2YDIA 4NM3A 2BAKA 4EH5A 3HMMA 5CSWA 3NUPA 3RHXA 3E8CA 5LXMA 5AEPA 5GIOE 4OTGA 1YXSA 2ITYA 2PSQA 3BGPA 4G6LA 5L2QA 2H34A 3F7ZA 4AS0A 3QALE 4DC2A 5HG8A 1SVGA 3G5DA 2X9EA 4DFNA 3QTXA 3K54A 2C6EA 4O0VA 5HTBA 5M4FA 3BU3A 4X2FA 3R0TA 1ZAOA 3DBDA 1NVRA 3R1SA 3U6IA 1U54B 3PXYA 2VTAA 4X2JA 3T3UA 3AGMA 4IZ7A 4YTFA 4YNEA 3ZMMA 2VGPA 4JDIA 4O2PA 1TQPA 2VN9A 2R3IA 4QMZA 5I0BA 3KKVA 4E4MA 3QTQA 2F57A 2XCKA 4IVAA 2C1AA 5FTQA 3PY1A 4E5BA 2PZIA 4XRJA 4FTMA 4DH5A 4V05A 5ANDA 4DEIA 3CPCA 2PHKA 4IAYA 3BELA 2PYWA 2X4FA 4MYGA 4MEDA 3VWAA 2BRNA 2GSFA 2WELA 3BQCA 5B2KA 2GQSA 3EOCA 3R73A 4BGGA 3L9LA 3TWJA 3E64A 3LOKA 2QQ7A 3O8TA 2GTNA 4M13A 3WE8A 5A46A 3D14A 1MUOA 4XV2A 1V0OA 1P2AA 5D9HA 5IUGA 1MRUA 3V5TA 2CGUA 4FV4A 4HYSA 4EK4A 4YTCA 5LCKA 2UZEA 4BDKA 4O7VA 5E91A 4ASZA 2W17A 4OTQA 5E8UA 4PNKA 4NYEA 4U3ZA 1PYEA 3BLHA 4AW0A 4KSPA 3BKBA 3A4OX 2SRCA 4O38A 4FT7A 4BYIA 2VTIA 2CN8A 3HRFA 3E7VA 4L45A 3BPRA 5CZHA 3O8PA 4QP1A 3FL5A 3HGKA 3ZTXA 4C34A 1YI4A 2AUHA 5BYYA 1GNGA 1WFCA 2B4SB 3S0OA 4OTRA 4GT4A 3PXZA 2C3JA 5D1JA 4C62A 1YWNA 3NX8A 4RX5A 1KE7A 4JDHA 3LJ1A 2XUUA 2PWLA 2PY3A 4C35A 2VWUA 3BGZA 3GXLA 4O0YA 4KS7A 1OITA 3HA8A 2GNHA 3OP5A 2UV2A 4GK4A 2ZMDA 5ANGA 4EKKA 3QXPA 4JDKA 1XH9A 3DXPA 1JVPP 5I9WA 2PVNA 3NYNA 4E6AA 3FWQA 4AFJA 2XK4A 3QD2B 2Q83A 1BLXA 1JNKA 3MJ1A 3ZHPC 5I4NA 4CKRA 3HV3A 4MXAA 5EM6A 3UNZA 5HO7A 2DS1A 4KABA 2GNIA 3GGFA 3EFKA 3W8LA 3QTUA 4BTKA 4FKWA 2UW9A 3C50A 4ITHA 1OZ1A 1W8CA 3HUBA 1YXXA 1PXNA 4R1VA 3V8SA 5I5ZA 1FVRA 5E4HA 4RQVA 4HCVA 3VULA 5HCYA 2W1EA 2JKQA 4FV7A 4NM7A 4DA5A 3IGOA 5TR6A 5AV4A 5FXSA 4ZZMA 4C4HA 3EZRA 2I6LA 2BAJA 5JQ5A 4IC7A 1GAGA 5IUIA 4C4FA 4JG8A 2VTRA 3RCDA 4DG2E 2OF4A 5EYKA 4BCNA 3LJ2A 2CKQA 1OKZA 3N51A 3JVSA 4O0UA 3GOKA 3UVQA 4ASDA 2Z7LA 4BHNA 3VC4A 3QQUA 4BCGA 2VGOA 1OBGA 3SLSA 3PSCA 2XKFA 4KKGA 2OH4A 1URWA 3F5PA 2C5XA 5DR9A 5L8JA 1ZYJA 3TNWA 3S3IA 3ZCLA 4PDYA 2ZV8A 3PA5A 4O0RA 5A4TA 3UMWA 4BDCA 4BCJA 2VWYA 1WZYA 4IADA 2C4GA 5DN3A 4N57A 3CXWA 4MWHA 4RVKA 2VTLA 3ETAA 5CSVA 4D2WA 3NNUA 2QOQA 5HO8A 2BVAA 3ULIA 3QKKA 3ZUVA 2G9XA 1F3MC 1PYXA 1HOWA 3HMNA 4YZBA 4C58A 1M2QA 4QP9A 4CQEA 3LFFA 4IDVA 4EH6A 4MHAA 2G1TA 1YW2A 2PVMA 3KXMA 4J99A 4DT9A 5DFPA 1J3HA 4MQ1A 4A9TA 4E20A 5CEMA 2X0GA 2QG5A 2IVSA 1OGUA 3SVVA 3Q04A 5C8NA 3F3WA 4O1PA 4V0GA 4EH7A 5JT2A 4UMPA 3NDMA 2PE1A 4GFGA 3DPKA 4U6RA 4KUJA 2YM4A 4I41A 1WBOA 3IW4A 4ALWA 4IX4A 4FT9A 3GU6A 3ROCA 1IRKA 1XBAA 1CTPE 1OM1A 4JQ7A 3LXLA 4QQJA 4QMUA 4EQCA 4X0MA 2WMTA 3QFVA 5HX8A 1DS5A 2NO3A 4ZLOA 2RL5A 4XG6A 3PZEA 3TKIA 5KMKA 4FEUA 3LZBA 3MPMA 4KKEA 5IA5A 4R78A 4DCAA 4FNZA 4BKJA 5I9ZA 4DLIA 3WZKA 4JI9A 1PY5A 4DGGA 5FTGA 4WT6A 3ZO4A 4I93A 2QLUA 2R3FA 3D5UA 1DM2A 1CM8A 2QHNA 2QLQA 4FTKA 5AP0A 5BMSA 1Y6AA 1OL2A 2WQBA 4AE9A 3KK9A 4EHEA 3SAYA 2JDVA 3MTFA 4L3PA 3PA4A 2W5BA 1FGIA 5AX9A 3D7TB 3FMHA 1NVQA 3H30A 2VX1A 3FMMA 3MVHA 4RWKA 2R3LA 1H4LA 3ZC5A 2XS0A 3DNDA 1FGKA 5K0KA 3NAXA 2XCHA 5AR4A 4BDHA 4BI1A 5JFSA 3EQHA 2ITPA 3OCSA 2C68A 3R02A 2VU3A 3P23A 5HNGA 3R2YA 4AE6A 4XX9A 3OWJA 4XMOA 3WZUA 4EUTA 4L6QA 2W0JA 4FTAA 5J5SA 4XRLA 4DTKA 3VS1A 4QQ5A 5E8ZA 4CQGA 4EK5A 4ZSGA 3QKMA 4DGMA 3VBXA 4QP3A 2CN5A 4TYIA 4YNOA 3FJQE 5ITAA 4UBAA 2OXYA 4LOQA 1V1KA 1URCA 4L68A 3QCSA 2J0LA 5CLPA 2ZM3A 5CAPA 4NU1A 2XIZA 3F5UA 3MBLA 5AUZA 5DR6A 5BYZA 5CU4A 3C4WA 2C6MA 2J4ZA 2O0UA 2REIA 3AD6A 3BWJA 3MW1A 4M0ZA 2ONLC 2C6OA 3QD0A 3AMAA 2HYYA 4OBPA 3FZRA 1FVVA 4S2ZA 2R3GA 1KWPA 3PPJA 3P7CA 1E1XA 4YBJA 5KX8A 1UVRA 4OT5A 5DOSA 4MCVA 5CSHA 4EI4A 2H9VA 4IIRA 4E3CA 2XEYA 1R0EA 3QQJA 4AFEA 1XH5A 3VUKA 5DMZA 3UNKA 4QTBA 3ZM9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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