3N51A

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with bumped kinase inhibitor rm-1-95
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
463
structure length
448
Chain Sequence
AIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKEQISVDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent and Selective Inhibitors of Calcium-Dependent Protein Kinase 1 (CDPK1) from C. parvum and T. gondii.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Toxoplasma gondii
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
total genus 156
structure length 448
sequence length 463
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2010-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3n51A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3n51A01
2GFSA 3R6XA 3RK5A 1UWJA 3EHAA 1BI7A 4D1SA 3M1SA 4ZJIA 5LVOA 4LG4A 3MH1A 5J95A 3FMMA 5K4JA 5DI1A 2FSLX 4EKLA 1XBCA 5HE3A 3OXIA 4FV5A 4Y5QA 3CD8A 2J5FA 2VX3A 1R0PA 3Q5IA 4FKOA 1L8TA 3Q9ZA 2H34A 4X7QA 4BHNA 2LGCA 4MYGA 3UO5A 5BYLA 3CQEA 3L1SA 1YHVA 2QI8A 4ALUA 1SVEA 1M2QA 3S3IA 3ZLXA 4NH1A 3R7VA 3BGZA 5G1XA 2X8IA 3FPMA 2P4IA 3GOKA 4K11A 3R0TA 3NNWA 2WFYA 3BE2A 4E73A 2Z2WA 3BHUA 4WUAA 2VN9A 3OWKA 4U40A 4EK5A 5EM8A 4C33A 4IANA 5HVJA 3F5PA 3GXLA 5FLFA 4EC8A 4L43A 4QQCA 2W1CA 3OWJA 2GNFA 5CI6A 3UMXA 4CRLA 2PVKA 4ZTHA 3RNYA 5AR8A 2BTSA 3QTXA 4JQEA 2J9MA 3V5JA 3RAHA 3VS0A 3IONA 4FL1A 5AR5A 2OF2A 3F9NA 5AV3A 3OOMA 5EHYA 3A99A 3NYOA 3NW7A 4RFMA 4EOKA 3PSCA 5IDPA 4Y72A 1PXJA 3PRIA 4FKVA 4UEUA 4P7EA 3MY1A 4DCEA 4R78A 3R8PA 5ACBC 3RAIA 4OR5A 1PMEA 2P55A 4P5QA 3KXZA 1PYEA 4MNEA 4BDBA 3PLSA 5K0XA 2ZV8A 3AC3A 1YI3A 4ZZOA 4O86A 4BFMA 3QKLA 3RNIA 4S33A 1U54A 4C61A 4QMYA 3EH9A 4I0SA 3TNIA 2BKZA 2PE0A 4EBWA 3NGAA 4F70A 3FMNA 3MIAA 2JITA 4MXYA 3GCQA 3LMHA 1XBBA 4YJUA 4BGHA 4FVRA 2HZ0A 3FY2A 4DFYA 1Q99A 4YPSA 1H26A 2CMWA 3K54A 5AP7A 2ZYBA 3TNQB 2WHBA 3ORTA 5HE2A 1LPUA 2OI4X 3SA0A 3ZFMA 2FUMA 2YDJA 4FK3A 3F3WA 4A7CA 5CU0A 1WMKA 1UNHA 3ZRKA 3UYSA 2FO0A 1BL7A 1A48A 4L3PA 1LEWA 4DHFA 4CFUA 4EORA 3FPQA 3QHRA 2GNHA 5L8JA 3OOGA 5CALA 4BDIA 4FV8A 5DNRA 2PE2A 5E4HA 4YZNA 1QL6A 4EH6A 4QYYA 4K9YA 2C6EA 2JAVA 2B7AA 3A7IA 2OXDA 3DXNA 4QNAA 4AS0A 4YUQA 2IVVA 1TVOA 4OBPA 2XYUA 1R78A 1XH6A 4QMMA 5AAFA 4FIFA 4AZTA 2V7OA 2VGOA 3DJ5A 4JIAA 5AP3A 2VTNA 4F99A 3KK9A 4QMZA 4CFFA 3ACJA 3Q04A 3QL8A 5HEZA 4BZDA 5CAVA 1H1WA 2X2KA 3FAAA 4CV9A 3A60A 5M06A 2OJJA 5C9CA 4PNIA 5FBNC 2XKEA 5AP5A 2JLDA 5AV2A 2PVRA 2YABA 4FV7A 3UOJA 2CPKE 3F2NA 3LXPA 4LRKA 4F9BA 4FVQA 5AV0A 5C26A 5D12A 1OMWA 4YURA 3BV3A 4ANBA 5FXQA 1FVRA 2O3PA 4FTMA 4M12A 4U3YA 2CJMA 4ERKA 4DH5A 4BCPA 3DBCA 4V05A 4FUYA 5IEXA 2WOUA 3DKFA 4QT1A 3QRTA 2HWOA 3I79A 4ZXTA 1OL6A 4C4JA 3PY0A 2EB3A 4A4LA 5L8KA 3D2KA 5DH3A 4CEGA 5ANJA 3FXWA 4B6LA 2Y4IB 2XJ0A 3R73A 2PMLX 3DQWA 3O17A 3FDNA 5TE0A 2UZUE 4X2GA 4YNOA 3I81A 3DBDA 3QXOA 4FV6A 4QMOA 4ZJVA 4FSYA 2VTRA 3Q5ZA 3N4UA 2O2UA 2VRXA 2W1FA 3TUCA 4LQMA 4JNWA 4WBOA 2JBOA 3WARA 4GK3A 3PFQA 2W5BA 2WQBA 4ANNA 5KMIA 2YCSA 3PXKA 2CNQA 3CGFA 2VWXA 2QNJA 3OS3A 3P1AA 2XM8A 4C35A 1W0XC 4ERWA 3BQCA 3NPCA 4CZUA 3DTCA 3K5VA 4TN6A 4XRJA 5AADA 3OXZA 5DFPA 2C30A 3TZ8A 1GOLA 3HZTA 3II5A 2QONA 3P0MA 2YISA 3IQ7A 3IGOA 4K6ZA 3Q4CA 3NVKI 2UZWE 2UUEA 4J99A 2B53A 4AZFA 3GU5A 4EZ5A 1W84A 1LP4A 4KAOA 4MH7A 4RT7A 3AC2A 2R7BA 4HPTE 1AD5A 5J1VA 4O7LA 4C62A 1R0EA 2VGPA 1IASA 3C4WA 2Q0NA 4NK9A 4JBOA 4FGRA 5KZIA 2GNGA 3QFVA 4IZAA 1U46A 4Y8DA 4GT3A 3VRYA 4CTBA 4QMUA 4IH8A 3UZPA 3H9FA 3I6WA 3LJ2A 4KBAA 3MPTA 3W8LA 4H36A 2VD5A 3E3BX 4QMPA 4D1ZA 3FSKA 4YPDA 2OO8X 2QURA 2PVJA 3DB6A 4TWNA 1BLXA 3D0EA 3OTUA 4FTLA 5CT7A 4YLKA 2A1AB 5L2WA 5AIRA 4DF3A 3EL8A 4YLLA 4D4YA 2PVYA 4BKZA 2YJRA 1Q4LA 4FTRA 3PJ3A 4D4VA 4E6DA 4EK3A 3MESA 4FUXA 2ZOQA 2UZOA 2Z7SA 4IMYA 4O7WA 5A6NA 4O38A 4CLJA 2GS7A 3QQHA 4NTTA 3LLAA 2IPXA 4K0YA 2R3FA 1Q8TA 1ZMVA 2W17A 5KKRB 2OW3A 3FUPA 4RMZA 5EI6A 5CZIA 3TACA 3GEQA 4J52A 1GZKA 5AP4A 4H58A 2PZ5A 5HTCA 3DV3A 4ANSA 4YBJA 2XNNA 4NM3A 1Z57A 1OUKA 3COIA 4JBQA 4C3RA 1YXTA 5IA5A 3SG8A 4C38A 3TNPC 3OD6X 4F4PA 4DT8A 1JNKA 4JDHA 3UDBA 5CLPA 4IAFA 4D5HA 4AA4A 3D5UA 5DPVA 4W4VA 2CCHA 2ETRA 5HX8A 2Y4IC 4U0IA 4WA9A 3RAWA 4AE9A 4FG7A 2B55A 4I41A 1KE7A 3HL7A 2R3HA 3I7CA 1CKIA 2I0HA 2X81A 2JEDA 3NCZA 3BYMA 4PY1A 5ANGA 4NCTC 4S32A 4V0GB 3UMWA 3F69A 5ITAA 1FQ1B 4U81A 5AM6A 4AXAA 3HAVA 4J8MA 3QQUA 3LQ5A 4O27B 4RLKA 3CPBA 2W1ZA 3LQ3A 1MRUA 4G9CA 1ZARA 1UNGA 4KBKA 2QVSE 3MJ1A 2WXVA 1BYGA 1U5RA 1BKXA 3DK3A 4E5AX 4BBMA 3QCQA 4WNOA 4IIRA 4S30A 3WF7A 3U54A 4IAIA 4DFXE 5ETCA 1OI9A 5GHVA 2W05A 2R3OA 2C5OA 3BEAA 3LCTA 2YZAA 2HAKA 3BYSA 3KGAA 4QRCA 2PZYA 4RWJA 5CSPA 3TEIA 4GYIA 4JX7A 4QMQA 2PSQA 4C34A 1JOWB 3EIDA 3KKVA 4OUCA 4JIKA 2Z7RA 4DE4A 1F3MC 3F6XA 3LM0A 5CU4A 3PVWA 1YRPA 2OGVA 4XG8A 2B1PA 3QZFA 3TUBA 2UZNA 1REKA 2YHVA 2QU6A 4B8LA 3VRZA 4G17A 4O1OA 3NNVA 4UMQA 4KA3A 4PX6A 2W4KA 3DBQA 4ZOGA 5IF1A 5KMLA 1J7LA 1B39A 2BILB 4GFGA 1VZOA 4YTHA 4NT4A 4UMRA 2CDZA 1YOJA 3NUUA 4W4YA 3UE4A 5IZFA 4Z7GA 3OFMA 1GJOA 2XKFA 3D9VA 1S9JA 3A7HA 3E8NA 4GFMA 4J96A 4OTPA 4P5ZA 3SG9A 1H4LA 2G01A 1IG1A 4FVPA 2HCKA 1Q8UA 3UQCA 4KIKB 4X2NA 4RC4A 4YC8A 2IW9A 2ZMDA 3QRIA 4F6WA 4PV0A 4E20A 4DTBA 5FP5A 2BHHA 4IZ7A 5CVGA 3ZM4A 4EZ3A 3QCYA 3DOGA 5TOZA 4DN5A 1OL7A 4O1PA 3D14A 1APME 3QAME 2XNOA 3GI3A 1XH7A 3BIZA 3ZTXA 2GSFA 2R0UA 4JI9A 4IM3A 4BYJA 3NNUA 4QPSA 4E5BA 2CGUA 4R7HA 2X8EA 2JFMA 4O6EA 3TKHA 3ZXTA 4FZDB 4CKRA 3EQDA 3ORMA 2JKKA 5CAQA 5I5ZA 4RX9A 3BU6A 1WBOA 1OPKA 4HYIA 5E8YA 3VAPA 3W10A 4O0YA 4AA5A 3DTWA 1WBSA 5GIPE 2ZM4A 2HY0A 3O51A 3OBJA 4C2VA 3AQVA 4QTEA 4HGSA 1FBNA 2I6LA 5LMKA 3MSSA 3NCGA 2GPHA 5C4LA 4FSZA 3VBXA 4K18A 4F65A 3JYAA 2ZDUA 1P4OA 3ELJA 1SYKA 5DE2A 2CGVA 3NUNA 1DAYA 1QPCA 5D11A 4EHGA 3TXOA 3LLTA 3KVWA 4CXAA 4F6SA 2RFNA 2YEXA 2RFEA 1DAWA 2VAGA 4NU1A 3UP2A 5BMMA 4DYMA 5J9YA 2PUPA 5L2QA 1WVWA 5CEOA 3SLSA 2R3LA 3ITZA 4M67A 5I9XA 5ANOA 5JFVA 3LCKA 5M53A 3LFBA 1ATPE 4MBIA 5C27A 4YZCA 1KV1A 3O96A 3DU8A 4PQNA 3OW3A 5IKWA 3I0OA 2VTJA 4JG8A 5IQGA 3MWUA 3WI6A 4U7ZA 4P90A 4GJ2A 3GU6A 5KCVA 4NIFA 4O0RA 4A06A 5ANEA 2PUIA 3SHEA 3DAKA 4D4SA 2UW5A 2EVAA 3VS5A 3WZDA 4OTGA 4U6RA 4UXLA 5D1JA 5D41A 3MB7A 3RZBA 4CYJA 3ROCA 3DK7A 4ITHA 4Q5HA 5LVMA 5JQ5A 4XP2A 4BL1A 3R7OA 5HNIX 1Q5KA 3ORZA 3GCPA 4ZMEA 2HYYA 5EI8A 3HV3A 2PULA 1MQBA 3GFEA 3NIZA 4EH5A 3NDMA 4NIFB 2XBAA 2C0OA 2CLQA 3HGKA 4XBRA 5M4CA 3DPKA 4FKIA 5A6OA 4FSRA 5I9WA 4DFZE 4D2PA 1XH9A 5IUHA 5HLWA 1PXKA 3UODA 2VNYA 3DFAA 4ZSJA 4ZTRA 2V7AA 4DLJA 5L6PA 3S00A 4ID7A 4CNHA 5JSMA 1RDQE 3V6SA 3DLZA 4RJ3A 3VUKA 4M68A 5B2MA 2VWZA 5DWRA 1FINA 4EK6A 4DFNA 5HD7A 1LR4A 5AAGA 5BUEA 5HG5A 4UBAA 2OZAA 1H01A 3ORIA 4FIIA 4WG5A 4AG8A 3ET7A 3QF9A 4OT5A 4D2VA 4TL0A 3KMMA 5BVOA 3F88A 3MPAA 4LOOA 4YLJA 2I7QA 2V62A 2YAAA 4G16A 4FA2A 3C50A 2XNMA 1GY3A 5AUTA 3Q6UA 4M14A 4PPCA 4P4CA 4RC3A 3QA0A 3A8XA 3PJ2A 4YJVA 2OXXA 2OZAB 5DYJA 4L42A 3V5TA 2BFYA 4E6AA 5CU2A 3R2BA 2X4ZA 5ETAA 4BCFA 4ZSLA 5DT0A 5IQCA 3CR0A 1WBWA 4JOAA 3A7GA 3QTZA 4ANQA 2RL5A 3SC1A 2B0QA 1SZMA 2YM6A 4GIIA 4B99A 1RW8A 5FM2A 2HWPA 2DS1A 3KRRA 4ZSAA 1IAHA 4FOBA 5CNNA 3I6UA 3P23A 4MF0A 5J5TA 3N9XA 3F2RA 3ERKA 4O7VA 2VO3A 4IBMA 2QHNA 3K3IA 2CGWA 3ZLYA 5JFSA 5I9YA 4RJ4A 2BRBA 3RCDA 4ZAUA 4WBBB 3IDBA 4B9DA 3RPOA 3VS6A 4O0XA 3BHTA 1IRKA 1YDSE 2OG8A 3F7WA 4FNYA 1O6LA 4M69B 1XR1A 2C6KA 2HW6A 3WIGA 3EYGA 2C6TA 3RBWA 2XNBA 4RIXB 4ZTNA 4MXCA 4H3PA 2C1BA 2ERZE 3KXXA 1K3AA 3EOCA 3NUXA 3OG7A 4Z16A 4R7BA 4AOIA 3Q53A 3QC9A 4FSWA 3E3PA 3EN4A 4CZYB 3UOLA 3QTIA 5A14A 5H8EA 2Z7LA 2GTMA 1B6CB 3HDNA 4C4GA 3JVSA 1UWHA 3O50A 1OKZA 3AT4A 4ZZMA 3TJDA 3E62A 4KIOA 5K0KA 4ASEA 2QODA 4ACMA 3QQGA 3ZS5A 4LOPA 2YIQA 3PXZA 4M8TA 4DC2A 5EQEA 3EFJA 2E9VA 2JBPA 3QQKA 4FL3A 3EQGA 4AP7A 1YQJA 2C6LA 2PUUA 4GEOA 2FB8A 4L44A 4XV3A 4L3JA 5H9BA 4YJSA 2BHEA 2EXEA 5AEPA 4FKSA 4UY9A 5DT4A 4DGGA 2QO2A 4EOSA 1ZMUA 4KD1A 2IZTA 3F3UA 3UOHA 4J97A 3R9HA 3DFCB 2B9HA 3QUPA 1Q24A 4AW5A 5CWZA 2ZB0A 3FYJX 4IJ9A 3HNGA 1XWSA 2EXMA 3FZRA 3OF0A 4FV2A 4WG3A 4N6ZA 3PXRA 4PDOA 4LM5A 4QYHA 5CS6A 5CT0A 4A07A 5CF4A 4OAUC 4IAYA 1OGUA 5DRDA 3IDPA 1M2RA 3RI1A 4DG2E 4GFOA 5H3QA 4IJPA 3U55A 2C0TA 3REPA 2BPMA 3C4EA 3AT2A 4YJTA 3R7IA 4AX8A 2AC3A 4ZTMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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