3NIZA

Cryptosporidium parvum cyclin-dependent kinase cgd5_2510 with adp bound.
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
297
structure length
288
Chain Sequence
YFQGLMEKYQKLEKVGEGTYGVVYKAKDSQGRIVALKRIRGIPSTAIREISLLKELHHPNIVSLIDVIHSERCLTLVFEFMEKDLKKVLDENKTGLQDSQIKIYLYQLLRGVAHCHQHRILHRDLKPQNLLINSDGALKLADFGLARAFGIPVRHEVVTLWYRAPDVLMGSKKYSTSVDIWSIGCIFAEMITGKPLFPGVTDDDQLPKIFSILGTPNPREWPQVQELPLWKQRTFQVFEKKPWSSIIPGFCQEGIDLLSNMLCFDPNKRISARDAMNHPYFKDLDPQI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cryptosporidium parvum cyclin-dependent kinase cgd5_2510 with ADP bound.
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Cryptosporidium parvum
molecule keywords Rhodanese family protein
total genus 74
structure length 288
sequence length 297
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3nizA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3nizA01
2RFDA 5IQEA 4YJVA 2ZVAA 3LFSA 5M53A 2C5VA 5EYKA 5J95A 3CE3A 4AZFA 4ZTQA 2DYLA 5I3OA 1OKZA 5EQYA 2R3QA 2J4ZA 1SMHA 5AIRA 4X3JA 3BZ3A 5JZNA 3A2CA 3LLAA 5A4CA 3II5A 2WTVA 2UVXA 3R01A 2RGPA 1OITA 3E8CA 4D2WA 4EOJA 1UU3A 3SRVA 3T9IA 4PMSA 3VN9A 3TUBA 4J98A 2X6EA 4RVTA 4LFIA 4JR3A 2UZBA 3RPYA 4YZCA 5M55A 5AP6A 3W32A 4K18A 3NUUA 3FZ1A 2R4BA 5M4UA 4CFUA 3MPTA 2RL5A 4JQ7A 1BL6A 3DQXA 4CGAA 2F9GA 4M3QA 2HELA 3TNQB 1ZOHA 3GVUA 3HECA 2O3PA 4MK0A 4RJ3A 4QMYA 5L2TA 2JKKA 3UBDA 3A8WA 4WG4A 3UYSA 4MNFA 3PY0A 1XBAA 3SG8A 4ALWA 3L9PA 3R7EA 4GS6A 2QO7A 3QCQA 4BTMA 3NWWA 4O7WA 3GENA 4TKSA 3BQRA 2C69A 4YO6A 3UIBA 1XBCA 3VUTA 2C6MA 1W84A 5DFPA 1GNGA 4X3FA 5L8LA 4YPSA 3VF9A 4HVGA 5AIKA 2J51A 3ZFMA 3PE2A 4BZDA 1PY5A 4FT3A 3GUBA 1XH5A 4USDA 4Q2AA 4JOAA 3MA3A 4BCHA 2I6LA 4EYMA 1JSVA 2VO7A 5FTQA 2XEYA 3CSVA 5CNOA 5DR6A 3DFCB 3IW4A 3R8MA 4IAFA 5HBHA 3RJCA 4BHZA 4O91A 3HMOA 3UGCA 3BWFA 4LRMA 3BHHA 2QR7A 5IEVA 2WTDA 3V5JA 2R7BA 2A2AA 2UZUE 3ETAA 2CSNA 2JD5A 3BV3A 2PMLX 3H9OA 3ROCA 5AUUA 2R64A 3FYKX 3COMA 3PG1A 2X7FA 1Q97A 4S2ZA 3DDQA 5FP6A 5EW3A 3PXFA 3NMUF 3UODA 4K1BA 3LW0A 2R3KA 5DNRA 3DKCA 3G51A 4RRVA 4O1PA 4GJ3A 5LARA 3BLHA 3KXGA 1BI7A 3HUBA 3NNXA 4MX9A 3WF5A 5JRSA 3SX9A 3SOCA 2UW8A 3F5GA 5IA5A 3BU6A 3GFEA 3NGAA 1H25A 4FTMA 2YIQA 4KIKA 3DBDA 3A7IA 3DCVA 4CFNA 5A4EA 3QRUA 4FIJA 3V5LA 4AFJA 3O71A 5I4NA 2ERZE 3IOPA 4FI1A 3WZUA 5HG5A 4BYJA 3P86A 1ZOEA 2YIXA 4WRSA 3V3VA 3K3JA 1X8BA 1Z9XA 4YNOA 3G15A 1QL6A 2BZKB 3JR1A 1U54A 3MVHA 3DY7A 1TQIA 2C5XA 3E92A 5DI1A 4EHEA 5L6PA 3NNWA 1GOLA 3BE2A 2VO0A 3Q9ZA 3TV6A 4BCGA 4O7YA 2C5NA 3GP0A 3KF4A 3RNYA 1S9JA 5C26A 5DT0A 4AAAA 5G6VA 3C0HA 2PZPA 4GUBA 5AR4A 1PXJA 3GB2A 1STCE 4FV6A 4YJOA 2BIKB 3UJGA 4CXAA 4DG3E 5LMAA 4GV1A 4EONA 3LXPA 4EL9A 5HO7A 5AMNA 5EW8A 4O0UA 1OUYA 2WTIA 2CLQA 3FXWA 4IH8A 2YCFA 1IAHA 4XBRA 4O0XA 2GDOA 4CEGA 4O82A 2ITPA 4FV8A 3OW3A 4IWOA 3U9CA 2XK8A 2BDJA 4F08A 2BROA 4U9AA 5CU6A 4UMUA 1GJOA 4E4LA 3FXXA 3KULA 3PWYA 1U5QA 1XO2B 2BFXA 4RMZA 4CQGA 3QALE 3QRJA 4D2PA 4B7TA 3R71A 3ENHA 5A54A 2HK5A 5I0BA 5M4CA 2F2UA 2ZMDA 3IKAA 3LE6A 4G9CA 3ZC6A 3FSFA 4Y85A 4N4SA 3ZOSA 2UZEA 5B7VA 5L8KA 2GHGA 3OXZA 4PQNA 4FZ7A 5J5SA 4ZTNA 4G16A 3PXRA 5E8TA 4DTBA 2UVZA 4O7LA 2PY3A 2NP8A 3OD6X 1ZY5A 3K3IA 5CASA 3EJ1A 3IOKA 2XIRA 5HLWA 5IG1A 3ODZX 3LMIA 4BDIA 3I5ZA 3VUHA 4DGGA 4NM7A 2ITZA 3DQWA 1WVWA 4O0WA 3Q4UA 2P55A 4F7SA 3MYGA 1Q8WA 4FTJA 5JMSA 1PYEA 4CV8A 4ASXA 3NW7A 4GH2A 4ITJA 4ZSEA 4YR8A 1J1CA 2XKDA 2GFCA 3OTVA 5ANEA 2JIUA 4I5PA 4AT3A 3NUAA 5TT7A 2YWPA 3P5KA 4RWKA 2VTRA 2EB3A 3SXSA 4EOIA 4HJOA 3HZTA 5H8GA 4OT5A 3ZHPC 1GZKA 4X6QC 4FSQA 3IGOA 2W9FB 5DIAA 4BRXA 5HTBA 5BNJA 2OSCA 5I9YA 5KO1A 4F0GA 4F9WA 5DMZA 1YI6A 2WMTA 2C1AA 3HL7A 4TYJA 4MD9E 4PY1A 3RP9A 5HU9A 4AA5A 2X81A 3H10A 4IBMA 4IFGA 2EXEA 4IC7A 2IW8A 4UWCA 2XJ2A 3BV2A 3SKCA 3W8QA 3PTGA 4AN3A 2QLUA 3O23A 4ACMA 4FZFB 4U41A 5ETAA 4A9SA 5M56A 4DGOA 4FYNA 5HCYA 3EYGA 5AV4A 1P14A 2I0VA 2UW6A 4ZK5A 4LGHA 3R02A 5A6NA 4KRDA 4C58A 4U81A 3CS9A 1FPUA 4IX3A 4R5YA 2HYYA 3COKA 4FKRA 2QD9A 3AG9A 4E73A 2R3RA 4F6SA 2I7QA 4GK4A 2XEZA 5ETFA 5IUGA 2W7XA 4IJPA 4AZTA 3ZUUA 3QQJA 3VJOA 3E88A 3D5XA 1VJYA 4FV3A 3S0OA 3FC2A 4QP7A 5AWMA 5L6OA 3VULA 2UZLA 4C59A 4EH7A 2OFUA 5CLPA 4AQCA 2QLQA 3P9JA 2OW3A 4K9YA 1WBOA 3E8DA 1PW2A 4FKVA 4QOXA 5C01A 3RNIA 2P33A 4CRLA 4CYJA 2C3IB 5IA1A 3RK9A 5TKDA 4E6QA 5TR6A 4UALA 4BI2A 4ERKA 4FOCA 1V0PA 2FUMA 2PE1A 2WQOA 3PA5A 5IQFA 3ZLSA 4A07A 4AP7A 3F2RA 1YRPA 4IMYA 1PKGA 2BRHA 4BBMA 1H28A 4FL3A 3L8VA 4QMPA 4WOVA 5TF9A 4AN2A 5KCVA 4ORKA 5ETIA 4KB8A 2WNTA 3RVGA 1KOAA 2ZM1A 3HMMA 4NZWB 2I0YA 3A62A 4ANSA 1OIUA 5I9ZA 1DI8A 3E8EA 1YDRE 4AA0A 3VUKA 4B0GA 1VZOA 4QYYA 3NRMA 2RFEA 2VX0A 2XMYA 2G9XA 3PXYA 2QOLA 3DNDA 2E9OA 3TXOA 3KGAA 3SGCA 5AR3A 2ZMCA 3ORMA 2O63A 2WU6A 4JX7A 3ZEPA 2VTMA 5L2IA 3PJCA 2QU6A 4QTEA 4RQVA 1TQMA 2W17A 5TOZA 3CTJA 4WIHA 4ZOGA 4RJ6A 3NVMB 2XIXA 4MWHA 4BF2A 2VNWA 3P0MA 2W5AA 2C4GA 5HLNA 2XBAA 3LIJA 3MWUA 4ZZOA 2CCIA 3IDPA 1Q41A 4C7TA 1BUHA 4K77A 4YNEA 3VBWA 3ZO3A 5KBRA 3PYYA 3R2YA 3VHEA 3POOA 5B2MA 3MESA 3EWHA 4O6LA 4JG7A 4HGLA 2YN8A 4NW6A 4LL0A 3FJQE 4OTQA 1CKIA 3KCFA 4RVKA 5HE3A 2GCDA 2JKMA 4FTNA 4WD5A 4A4OA 5JQ8A 3PSBA 3M42A 5LVMA 4V05A 4ZJIA 4MNEB 2YISA 2YLEA 1XR1A 5FXSA 3LCTA 3R7GA 4OTIA 2YAKA 3PIXA 1R39A 4BDJA 3M2WA 3QQHA 3UP2A 3C4XA 4BDAA 4HGEA 1UNLA 1BI8A 5HCXA 4D9TA 4NT4A 4OAVB 4KRCA 4L43A 1TKIA 2XS0A 1VR2A 5AUTA 2W5HA 3IW7A 4QYGA 3QQFA 4OUCA 4DEIA 1FMOE 5M57A 4XG7A 3LQ8A 2JEDA 5BVOA 1JSTA 3UO6A 4DYMA 3G9NA 4C3RA 2BZJA 4U97A 1IR3A 5FTOA 4ANNA 4O7ZA 2BFYA 4K11A 1KUTA 2XIZA 2UW0A 3BEAA 3HNGA 2GNIA 4ALUA 5K0XA 4EK6A 4JLCA 4QP9A 4ENXA 4IQ6A 3D5WA 4MQ2A 1YQJA 3P1AA 4GT4A 3GNIB 4C61A 3SC1A 4E4NA 3VAPA 3WIKA 4OBQA 4GK2A 3AGMA 4ZSGA 4UXQA 2UZWE 3UE4A 5FDPA 5L2QA 2FB8A 2X39A 3D2KA 2C5OA 3PPJA 4JX3A 5EFQA 5AJQA 5HZNA 5FLFA 2JDSA 3TDVA 2PE0A 3KFAA 3QZHA 1JKKA 4GVJA 4MXXA 1HCLA 4R1VA 3IG7A 4MHAA 4FEQA 3QCYA 3C7QA 3VS4A 3MH1A 3P7CA 4KBCA 4U80A 5EK7A 2B9HA 3SW4A 3W2QA 2CN8A 2GQSA 4NTTA 3MIYA 4MCVA 4FEXA 5HNBA 4BDGA 4XG4A 4DEHA 4FF8A 3TJDA 3DKFA 4HCVA 4S34A 3HUCA 5LOHA 3U54A 3HV3A 4EBVA 1T45A 3BLRA 5D7AA 4RZVA 3HP5A 3GOKA 5HIDA 2PMOX 2E2BA 1QMZA 2XYUA 3OT8A 3OWJA 4QMTA 5HI2A 3C9WA 4FKUA 4IACA 1LR4A 3A60A 4CTBA 4LL5A 4I21A 1OBGA 2R7IA 2RFNA 3R04A 5DPVA 3BQCA 3E7VA 3EQFA 1YWVA 2QOCA 3VUIA 4B8LA 1YW2A 2C6IA 4N6YA 3LKMA 3EZVA 4PNIA 5AUYA 3Q3BA 3OT3A 2UZOA 2J0IA 1RW8A 4F7NA 2IVTA 4E1ZA 3NUSA 3Q6UA 3UP7A 1M17A 1PXLA 2PTKA 3OTUA 5EI6A 4BIEA 4FOBA 5CT0A 4YTIA 3IK3A 2ETRA 4F9AA 4AOIA 5EYDA 3V01A 3EFLA 4D58A 4G1WA 5GHVA 3HRFA 3LJ0A 3QUPA 2VUWA 3UNZA 3R1SA 4FVQA 2H6DA 3COHA 3H9FA 3I4BA 2XRWA 4R6VA 2Z7LA 2CGUA 3QTRA 5C8MA 4WNOA 4AG8A 1JLUE 3NYNA 4E3CA 4FNWA 4AU8A 2WQBA 3L1SA 4NKSA 3VS6A 4FKWA 3LXNA 2ITTA 4V04A 3R2BA 4E93A 4ZY5A 1ZXEA 3EKKA 4D5HA 4O83A 4KKEA 2XKCA 4FZAB 4G5JA 1RDQE 4A4LA 4E8AA 4FBXA 4M15A 4WNKA 3OCSA 3GXLA 4I1ZA 4LYNA 3KRWA 4Y5HA 3TV4A 3QGYA 4M67A 2ZV2A 3NAXA 4OTWA 4IVDA 4RWIA 4BKZA 4EHVA 1WVXA 4E5BA 2YIRA 3JXWA 4CVAA 2WTJA 3F5PA 3TKHA 4KWPA 4YJSA 1YXTA 1UNHA 1MUOA 4IVBA 1Z5MA 2X9FA 2I0EA 2HOGA 4O96A 3MN3A 1ZYCA 3PVUA 3MDYA 4W8EA 4Z7HA 5FM2A 4YHJA 2XIYA 3FPQA 5T6KA 4F9CA 2GSFA 3GQLA 3OWPA 1PJKA 3BHYA 3KKVA 3LFFA 4UZDA 4WHZA 2XNGA 4KIQA 1WMKA 2E9PA 2BRBA 4PUZA 3R7YA 5LVLA 4YC3A 3D7TB 3F6XA 3O8TA 5FGKA 4C4FA 4CG8A 2OJJA 1ZRZA 3GEQA 5DYJA 2VTPA 4FUYA 3MY1A 2H8HA 5FDXA 4FC0A 3CPBA 3RPOA 4MXCA 4RWJA 4X7QA 3ZFXA 4E4MA 4CMOA 5KMIA 4JG8A 3LJ1A 3FMJA 2QOHA 3FL5A 3QKMA 4DG2E 4C02A 5K5NA 2R0IA 3QA0A 3QZIA 5L2WA 1YI3A 4U3ZA 2G2IA 3FZSA 4JT3A 4MYGA 3OZ6A 3CQWA 4FKIA 3VQUA 4HVDA 2QG7A 3GCPA 4MEDA 2ITNA 5CF6A 5KNJA 2R3IA 3ID6C 3UIMA 3EIDA 4FSTA 3ORZA 3SG9A 3TUDA 3QD0A 4GL9A 3BYOA 5IQIA 3JVSA 5A4QA 4MF1A 5HO8A 1MRUA 2YCQA 3F3VA 4BCIA 5JGAA 3C0GA 2H9VA 3CTHA 4AZWA 2QOKA 5ACBC 4B6LA 3OVVA 4F09A 2BR1A 3TI1A 5T68A 2VTLA 5IA2A 3PXQA 3U55A 4J53A 5CEIA 3F5XA 2W1FA 1LP4A 1WBNA 3KC3A 3Q9WA 5C8NA 5LCKA 4ASDA 2UW9A 3NUPA 4IHPA 4IE9A 1B6CB 2ITVA 4DFXE 3BIZA 2XKFA 2W9ZB 3A7GA 4BR3A 4XV1A 4FL1A 4LM5A 4C37A 4C38A 3QU0A 4H58A 3GU6A 3QHRA 3EB0A 4N0SA 4BCOA 4MKCA 5EM5A 2HZ4A 4ANLA 5HGIA 5AV0A 2YIWA 4GT5A 2YM6A 5AR5A 3FKOA 3GQIA 5IEXA 4AOJA 4RJ4A 3EN5A 4MXAA 4FR4A 5CAVA 5IEYA 3FI2A 2QC6A 3FYJX 2BIYA 2CJMA 4XLIA 4RIOA 5C9CA 4F64A 2VD5A 4QO9A 1XJDA 3BE9A 3MVMA 3RPRA 3TZ8A 1Y8YA 4FTTA 2X8IA 2FH9A 2W4OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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