3OD6X

Crystal structure of p38alpha y323t active mutant
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
349
structure length
344
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPTDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Active mutants of the TCR-mediated p38alpha alternative activation site show changes in the phosphorylation lip and DEF site formation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 96
structure length 344
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3od6X02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3od6X01
4QP7A 1DI8A 4S34A 3ZZEA 1PF8A 2CN5A 3G0FA 4WA9A 3WF8A 1QL6A 4BYIA 4ZLOA 1KE5A 2F2CB 5M57A 3RMFA 4PF4A 2FSLX 2QCSA 4CCBA 4Z3VA 2C5OA 3CD8A 1VZOA 5DRBA 3F61A 4HGSA 4C0TA 3NX8A 4IWDA 2X0GA 3MVMA 1ZY5A 3D83A 1VYZA 2ZDUA 2AUHA 4FK3A 4TYHA 3PPJA 1Q8TA 3D5XA 4ZEGA 4ZTLA 3RM6A 3LFDA 4CFVA 1UU7A 3ET7A 5EKNA 3IOPA 4K77A 3Q60A 4O7LA 1NT2A 4IX6A 3IGOA 5CSVA 3WE4A 3IOKA 3LMHA 4ZIMA 2PE0A 5EYCA 4MXCA 5HG9A 2JIIA 3O2MA 4FSQA 4W9XA 3VJNA 4BDKA 5AAGA 3W8LA 5KO1A 2B9IA 2X6DA 4M84A 5CU2A 3QLFA 5DFPA 1U54A 3BBTB 1JLUE 3HV3A 3PG3A 3T3UA 3U55A 5M09A 3RNYA 3MFRA 5H9BA 5HCYA 3ANRA 3FSKA 5IA2A 3ALNA 3L8VA 3FC2A 4FT7A 2QC6A 5IISA 4DEDA 3ZFYA 3LFFA 3ZLXA 3QCXA 3RJCA 3R1SA 2HYYA 5CQUA 3ACKA 1H24A 4FTJA 2XJ1A 5E8VA 4FC0A 1STCE 1CDKA 1IG1A 3OVVA 5E8YA 4PNIA 2HY0A 3EFLA 4P7EA 4EZ7A 1G5SA 5JGAA 4UN0C 1IASA 5M56A 5KMOA 2PZIA 3PXQA 5D10A 3FHRA 4O1PA 4E20A 3PWYA 2XS0A 2UW3A 1ZYSA 1Q8YA 2R3LA 4I6QA 3FY2A 3VO3A 2YLEA 3O50A 3PJCA 4O2ZA 4QP1A 4U6RA 3FBVA 3R7YA 4BZDA 4CRSA 4YMJA 3LMGA 3UP7A 2QOOA 4IE9A 3P5KA 4FIHA 3CQWA 3FL5A 4DLIA 3UE4A 3SXSA 4BWPA 4D4RA 3HA8A 4I4FA 5J1WA 4IXPA 2F9GA 4FL3A 3P78A 4X2JA 4I94A 3VHKA 2J50A 4HYUA 4EQMA 4KS7A 4LRKA 4ASZA 2HIWA 2E9PA 3KF4A 4XMOA 4DGNA 4KNBA 4EEVA 3FMNA 5JH6A 3ZMMA 3KGAA 3QD2B 1W0XC 1OM1A 1PY5A 3FLZA 2ZVAA 1Q41A 1M7QA 3F3WA 5LMAA 5CALA 3F7ZA 3Q2JA 3HMIA 2WQBA 1LR4A 2OIDA 5ETIA 3VWAA 4KIPA 3PXZA 4HYSA 3UIMA 3PLSA 3QKLA 3ORMA 2RSVA 3W55A 3A8WA 4F65A 2DS1A 2JGZA 5A4CA 4A4OA 3ELJA 2ERKA 3M11A 2YISA 3N51A 1BUHA 4UMUA 2OXDA 5DT4A 4C35A 2RG6A 1I44A 3W16A 3CGOA 4B0GA 4JQ8A 4ZJVA 1H28A 4OAVB 1OI9A 5BVFA 3OWLA 1R0PA 4BY9E 4O0RA 2QG5A 2OIQA 4EH7A 4F09A 5B7VA 1YI3A 3RTPA 3HVCA 3SRVB 5CF4A 5D9HA 3E7OA 2IPXA 3F3UA 2FB8A 4FR4A 1ZOGA 1YOJA 5JK3A 5KHWA 3UJGA 4CZUA 2BALA 2VTQA 5E91A 4F1TA 5M4CA 3NUNA 2IVVA 2WTJA 3D94A 4XP0A 3DLSA 3TUDA 4GFMA 2G2HA 3QTRA 4ZTNA 5E4HA 2XK6A 3EJ1A 4BCNA 1J7LA 3VQUA 4MX9A 2WTDA 3OCTA 1CMKE 4IACA 4FEUA 4DFYA 2Z02A 5GJFA 2B55A 4NIFA 4FYNA 2V22A 1H0WA 4NM7A 4H39A 2HZIA 3C13A 4ZJJA 4BCGA 1R78A 3MV5A 5J9ZA 5ACBC 1TQMA 3W2OA 4QMUA 4O0VA 4DN5A 2QNJA 2Z8CA 3HMNA 4K1BA 3S3IA 5L2IA 4YZNA 3G51A 2R5TA 2ZAZA 1J7UA 3KQ7A 1RE8A 2ITTA 2IZTA 3F7WA 1GOLA 4OT6A 3CSVA 3FLSA 4HNFA 2Z7QA 4TKSA 4YZDA 1Q3DA 3C4FA 2UZNA 4NCTA 3ROCA 4WUNA 3P08A 4D2WA 2EXCX 2IN6A 4RVKA 2UVZA 4G6NA 3BHTA 4AT5A 3GBZA 4KKGA 4Z16A 3D14A 4YBJA 1GZOA 3NAYA 4PTGA 4XLIA 4CTCA 4HVDA 5AV4A 4LQMA 4TWPA 4BB4A 3H3CA 4FTNA 4RA5A 5M06A 4RVMA 2CCIA 3WF7A 4CMUA 2XA4A 5IH6A 3LXLA 4G6LA 4RVTA 1Q61A 3MBLA 2VD5A 3EH9A 5I9YA 4RFYA 1REKA 1ZARA 3QC9A 5EM8A 1GZ8A 4R6VA 5HI2A 4BI0A 4TRLA 2RFNA 5CAOA 4IVDA 4QTEA 4EYMA 3C4ZA 1FVTA 5AUWA 3A7JA 3ZC6A 2PE1A 1W82A 3R00A 3MSSA 4QQ5A 4M0YA 3W2SA 4G3FA 2B53A 2WMAA 3QA0A 3TZMA 4CFXA 1OBGA 1PW2A 4LUEA 4U42A 2UW8A 4C7TA 5LMKA 5J5SA 2X8EA 4NKAA 3THBA 2IW8A 2YM7A 5IA5A 3R8PA 4C57A 3T8OA 4XNEA 5C4LA 3KRJA 3PYYA 3GFWA 3Q9XA 4O0XA 3VBQA 4BI1A 4EWHA 3E64A 3DKCA 2C6IA 4FG8A 4FV3A 3VJOA 3SG8A 2O65A 3MN3A 4G3EA 4UMQA 2PU8A 2YFXA 5BVDA 4OUCA 3G9NA 4A4XA 3AD6A 2LAVA 3KCKA 4G16A 3QHWA 2CPKE 1TVOA 2ONLA 3RWPA 4EORA 2YABA 5AP2A 2ITZA 1GIJA 4F6WA 3W8QA 5IKWA 3KXGA 1SNXA 3UGCA 4FSWA 3F69A 4I6FA 4F9BA 4XRLA 5KE0A 3HYHA 4ID7A 4F08A 3QWKA 4CG9A 3V3VA 5E92A 4C3FA 3E8NA 1BI7A 4RVLA 4X2GA 3KULB 2HXQA 4DT8A 1ZMVA 2YWPA 4AGWA 4JS8A 4E1ZA 2WMWA 4G17A 4J1RA 4IZ7A 4MBIA 5CEPA 4JIKA 4WG4A 4X21A 3LJ0A 1XH9A 3HV7A 3OXZA 5LVPA 5IZFA 5IEVA 5M4FA 2WHBA 3IW5A 2C6MA 3I4BA 3QRUA 1URCA 2PZYA 3QQHA 3BV3A 1QPEA 4RIYB 5L2SA 5FRIA 4EI4A 2CGXA 4RQVA 2RIOA 3ATSA 3VF9A 5EHYA 2VO6A 4G5PA 3E8EA 2I1MA 4H1JA 4NCTC 3VUDA 5M4IA 1OGUA 3LJ1A 4NSTA 3CJGA 3NWWA 3LFBA 3NW6A 3QZGA 3A61A 3D7TB 2F7ZE 4P90A 4MD9E 3LXNA 4X2NA 2A2AA 4ENYA 2OWBA 4NUSA 4CSVA 5E8TA 4L3LA 4CZYB 4E4LA 4TWCA 5B2MA 4GFGA 2VWXA 1M2QA 3A2CA 4F6UA 2NNWB 2OJIA 5DG5A 1UWHA 4USDA 1JKTA 5F4NA 2WELA 3FZOA 4BBEA 3MWUA 4UYNA 3NIZA 4ANBA 4O96A 3BV2A 4EKLA 4DEAA 5IQDA 3QCSA 4DG3E 3OXIA 3BRBA 3FYJX 5AX3A 2YJSA 4FKLA 4EQCA 3U6IA 2W4OA 4L8MA 4NZWB 1OKWA 4AOJA 2XF0A 5EG3A 4C3PA 4CT1A 1PXMA 5AMNA 5HEZA 3ID6C 4FG7A 4U45A 5C1QB 3EB0A 3NEWA 3OF0A 2P2IA 5LMKC 3C4XA 3LKMA 3BGZA 3ZDIA 2X9EA 3ODYX 4FTKA 3FMHA 2RL5A 2XJ2A 2C5VA 3UG2A 1ZZ2A 3EQHA 2I7QA 4FTLA 4EOLA 5DT0A 2ITYA 4G34A 2PUIA 5E8SA 3FQSA 4A07A 4BWKA 4FTMA 1U46A 4J53A 4N6YA 1VJYA 3NR9A 4QYFA 3UYTA 2FSMX 2W1GA 3QTIA 3RK5A 2QHMA 4ZTSA 4GUBA 2VRXA 1QPJA 4IC8A 4CG8A 5DR2A 2VTPA 3S2PA 3FHIA 4APCA 3UOJA 3GVUA 3ZUUA 3ACJA 4R3PA 4XS2A 4F7LA 5HOAA 5I4NA 4JR7A 1Q97A 2UZWE 1X8BA 1YWVA 2XNPA 3QUEA 4IFGA 1PYEA 4IQ6A 4O86A 2V55A 4JG7A 4ACCA 2P3GX 3EYGA 5AUXA 4DGLC 3UO5A 1PXIA 3IONA 3KVXA 2QOBA 2UVYA 3FKNA 3OD6X 4DFUA 2WTCA 4U5JA 3P4KA 2W9FB 4YTFA 3ERKA 4ZY4A 5ACKA 3GC9A 2C1AA 4FIEA 1XQZA 4CQGA 3ZC5A 3C50A 4AZVA 3NUXA 5HHWA 3L8PA 2ZB1A 2ZV7A 4C4IA 4ACGA 3A60A 4AN3A 3AC1A 2BDFA 5CAUA 1JBPE 1NVQA 1V0OA 4HJOA 4IWQA 2XIRA 4IANA 1RJBA 3R7VA 2VX0A 4ZTRA 3W33A 4GIIA 2OF4A 3M42A 2QLUA 2O5KA 3PUPA 4KINA 4C4FA 3TM0A 3UMXA 4DINA 3FWQA 2GNJA 2J0KA 3OWKA 3BWFA 4X7QA 4LI5A 3D4QA 2P0CA 3QYZA 1PXNA 4FVQA 4NTTA 5FTGA 5HE1A 4ZJIA 5L2QA 3KMUA 5KZ0A 4I23A 1HOWA 2PVRA 4E6AA 2C6EA 4HPTE 5A6OA 2B9JA 2VO0A 5M44A 2VV9A 5EH0A 5D7VA 5I0BA 2HWOA 5CVFA 3R7EA 2OLCA 2HW6A 3PIYA 4P5ZA 5A54A 4I4EA 5HZNA 4JLCA 3HMMA 4DFZE 4UX9A 2QOHA 5GJGA 4QNAA 4BDDA 5C8NA 4R5SA 3O17A 4BL1A 4MF1A 3QF9A 4BN1A 2CHLA 3FZSA 1NW1A 4MVFA 4YR8A 1FOTA 1FVVA 5FXRA 4I20A 5FG8A 2UZBA 4JBOA 1U5RA 3D5VA 3BEAA 4GRBA 2HZ4A 2UVXA 4WIHA 5EI2A 3L1SA 4YTCA 4LOPA 3S4QA 3UNJA 3DJ5A 2YIXA 3QUPA 4O7TA 3SOCA 3KEXA 3UVPA 3G6GA 4EOMA 4FKOA 4HZSA 4IDTA 3NAXA 1YI4A 4BCQA 3COMA 3FY0A 3UOLA 2QQ7A 4C4HA 4H05A 5A14A 3LFEA 5BNJA 4EH4A 3CKWA 4R7BA 4DITA 2UW6A 1GAGA 2NRUA 3UTOA 2PVHA 3V5WA 3KCFA 2YHVA 4O7YA 5EW8A 3MH1A 3V01A 1H8FA 3DPKA 4I6HA 1ZYCA 4O83A 4FV6A 3D0EA 1OL2A 3PY0A 2DQ7X 3IW8A 3PXKA 5AUTA 2XYNA 1H26A 5DHJA 5AUVA 4FEVA 3GP0A 2C0OA 4L01A 2VWVA 3MVHA 1KE8A 1ZLTA 3A4OX 3FYKX 1TQPA 4X3JA 4J52A 1OKYA 2X2KA 1YRPA 2UW7A 3HUCA 3K54A 3NUAA 3ZLSA 2GU8A 4R7HA 1J1CA 5M55A 4L46A 1DM2A 2H96A 5FBNC 4RT7A 5E8UA 3TNHA 5EM5A 3D9VA 3HL7A 3R6XA 4XLVA 2F7EE 2V5QA 4RJ5A 3QQKA 4FNXA 4Y5QA 3RAIA 4YC6A 1UU9A 1ATPE 3UC4A 5DEWA 3ATTA 2BPMA 4ZOGA 3PPKA 3TJDA 2JKQA 5BMSA 3C0HA 4YHTA 2XNNA 1QCFA 4HPUE 4ALUA 5CENA 1WVYA 3I1AA 4PMMA 3FPQA 4C4EA 4CRLA 2HWPA 3UQGA 3SV0A 2C3LA 2PMNX 4QQCA 4UYAA 4D1ZA 3M2WA 4Z9LA 2GFCA 5EOLA 3NVKI 4AW1A 4E5WA 4F1OA 2BZIB 4BDJA 4JI9A 4ACDA 2F7XE 4BF2A 1T45A 1WZYA 3FZRA 4YJVA 3T9IA 3F2NA 4DEEA 3EFKA 3ODZX 3R28A 4ZS4A 2ITVA 4C4GA 3FMLA 4BI2A 2RFDA 3BYVA 4EC9A 4A4LA 3G15A 4FF8A 3L9MA 3PSDA 4I92A 3QBNA 4MHAA 4O6EA 5L8LA 4J96A 2B4SB 4GYIA 3TUCA 4RX8A 3VAPA 1KE7A 5F9EA 3FE3A 5J5TA 4DBXA 3BGQA 3FZPA 5F20A 5AA8A 3AQVA 5ANOA 4HGLA 3GQIA 2C30A 3E88A 4L67A 1Q8ZA 1XJDA 4PQNA 2IG7A 4N57A 4R77A 2ZV2A 5D1JA 2BTSA 4FV2A 5HTIA 5TO8A 5H2UA 5CZIA 1VYWA 3QKKA 2C5YA 2X4FA 1LEWA 1Y57A 3EKKA 4ZZOA 1YQJA 1IAJA 2VWIA 4AGCA 3IDPA 2X39A 4HVSA 3P7CA 4XG7A 1APME 1F3MC 4AS0A 4K8AA 2WMSA 3MH0A 5JKGA 3WZKA 4ZMEA 1NXKA 4D2TA 2H34A 1PMUA 3FXXA 5JSMA 4ITHA 2OBJA 2OW3A 2PTKA 3TDWA 3AOXA 4KUJA 5IA0A 5K0KA 4Y72A 5KKRB 3Q4ZA 3WBLA 1O9UA 2XM9A 1WVWA 2HCKA 1JNKA 4PL4A 4IZ5A 4KIKB 2QD9A 3BHVA 4PY1A 3MH3A 4AG8A 4EOIA 2W96B 3RM7A 4BCIA 3O8TA 4X6QC 4ZS0A 1H1QA 3OUKA 5E8ZA 3ULIA 5IDPA 3TV4A 2XKDA 5IQFA 3VRZA 1PMEA 4DBNA 1OPLA 2BROA 4MKCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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