3ODYX

Crystal structure of p38alpha y323q active mutant
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
350
structure length
321
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLAVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPQDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Active mutants of the TCR-mediated p38alpha alternative activation site show changes in the phosphorylation lip and DEF site formation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 92
structure length 321
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3odyX02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3odyX01
4K6ZA 2BDJA 3POOA 2XBAA 2ITVA 2R3IA 3LCKA 5C8NA 3RWQA 4GCJA 4PNIA 4R3PA 4S30A 5IQHA 4EHVA 5E9EA 4YTFA 5CASA 1BLXA 1G5SA 4RJ6A 4JI9A 4PDYA 1CKIA 4MNFA 4MXZA 1DM2A 2V7AA 3UIXA 4L7SA 1LUFA 2JKMA 3LQ3A 4GT3A 3GC9A 3PG1A 3D14A 5E8WA 4HNFA 5H3QA 2CMWA 5EM8A 4EH9A 3IW7A 2PVKA 3EQFA 5JSMA 2V7OA 2JBOA 4YZNA 4ZMFA 3QALE 2W0JA 1MRYA 2HZ0A 1V0OA 5CU4A 3BELA 4FSQA 5CEIA 4YPDA 3S3IA 3ZLWA 4PP7A 4U6RA 4Y83A 4RX8A 3QLGA 4I4FA 4X2JA 3TTJA 5J7BA 3RKBA 5L2SA 4LGHA 2PPQA 3COKA 1URWA 2Q83A 2IW9A 1YOLA 3TWJA 5JGDA 4OBQA 3NCGA 5EOBA 4JBQA 3QRUA 2RL5A 1YWVA 4Q2AA 4BI0A 3KREA 3C4WA 2PVMA 1YXXA 3QQJA 4L52A 4MVFA 1JVPP 1XO2B 3ELJA 4O0SA 4QMXA 4RJ5A 4AE6A 4I6FA 4F4PA 3BE2A 3H10A 5AP1A 3FBVA 3FKNA 3K3IA 2CKQA 4CLJA 4ZMEA 3PXYA 3BZ3A 1LEWA 1OB3A 4JRNA 3SOAA 2EUFB 5DLSA 2XIYA 3CKWA 2J0JA 3HP2A 3OUNB 5HVJA 1XHAA 4C58A 3SX9A 3ALNA 5IU2A 1YXSA 3UC4A 1UU7A 2DUVA 5HO8A 4FSTA 4DHFA 4F7NA 2YM6A 5L6WL 2W7XA 4RFZA 3DAKA 4IB0A 4AFEA 2Z02A 4ZTSA 3BLHA 2ZAZA 3HGKA 1TKIA 4APPA 4IAAA 4EUTA 2W4JA 1U54A 1ZY4A 3RPVA 1MUOA 5DEWA 5F95A 4CFNA 2A0CX 2VTAA 4G16A 4DTKA 4O83A 3OOMA 4HGSA 3R9NA 3EFWA 3D2IA 1B6CB 2HZNA 2X2LA 3IG7A 4FT9A 5FGKA 3PIZA 4TZRA 4O7ZA 4IJPA 1NVRA 1NA7A 1V0BA 3ZM4A 4F9WA 3U55A 4DEBA 1O6LA 3ZOSA 5FDPA 4TNBA 3PJ3A 4BZOA 1GJOA 5J8IA 3BYSA 4RIXB 1NY3A 4M13A 3LMIA 5EW3A 1JPAA 5KMLA 4MKCA 3W2CA 3E3BX 3TDWA 1YHSA 1IAJA 2BIYA 4QP3A 3V5PA 3VHEA 1YI6A 1BI8A 3TEIA 3R1SA 2X6EA 4EK5A 3UVQA 3ID6C 4Y85A 5K3YA 3TIZA 3FYJX 3ZTXA 5L2QA 2WPAA 4MNEB 3B2WA 4CSVA 4O38A 2R3GA 5IA5A 4TKSA 3AC4A 4QYGA 2Y8OA 4U80A 3ORMA 4BKYA 1QL6A 2A1AB 4MXCA 3FDNA 3IS5A 5HBHA 4AN2A 3VUGA 4EOIA 4U45A 2X8DA 1XQZA 2UVXA 2ZM4A 2UZWE 3L1SA 4RG0A 3UJGA 2WTCA 5IQIA 3W8QA 3H0YA 5HBJA 3R8VA 5IEYA 2ITUA 4DGNA 3N4TA 5F1ZA 4ZSLA 4GT5A 3WE8A 2QC6A 4KNBA 1XH4A 4Q5EA 3VS2A 2A4LA 3KKVA 3L9NA 3OMVA 4AZSA 4I3ZA 2QI8A 4K11A 1REJA 2C47A 5A4TA 1H4LA 4DA5A 1H1WA 2QHMA 4FICA 2X7GA 3ZCLA 2RFDA 4ZIMA 1PYEA 1VYZA 4DH3A 4CLIA 3P7CA 5D1JA 4BF2A 5CSWA 1UA2A 4LUEA 3D2KA 4FV5A 3MIAA 3HUBA 4F1TA 4UMPA 3NLBA 4QYFA 1OL1A 5G1XA 5BYLA 3ZRMA 4BCPA 2R3QA 3CLYA 1DI8A 2B52A 2HW6A 4FTRA 5HU3A 5LJJA 4LOPA 3O17A 1YDSE 2BTSA 4KA3A 4U9AA 3Q9YA 3NUXA 1J1BA 1WBOA 5CSHA 2Y4PA 2ZJWA 3HV4A 4U5JA 1ZRZA 3EYGA 4GK4A 5HCXA 3TJCA 2NRUA 3TZ8A 3NCZA 2WGJA 4CMUA 4BDCA 4USFA 4Y95A 4PQNA 3WF5A 2AC5A 2PE2A 3DDPA 3I79A 3IDPA 2W4OA 4IAYA 3F9NA 2XUUA 4NTSA 4PV0A 1H28A 3FMNA 3GNIB 5ANKA 4EH8A 4X3FC 2BROA 5J95A 3DB8A 3FLYA 4FV6A 2QVSE 2UZVA 4YLJA 5KMJA 3FI3A 2ZDTA 2BHEA 3NIEA 1GAGA 3P5KA 3RP9A 2FYSA 4IE9A 3PTGA 5E8ZA 5CQWA 5BVWA 5C01A 3RPOA 4M14A 3FY2A 4HYIA 5LARA 2XCKA 5M4IA 3NYOA 2WU7A 3C0HA 3U87A 2GNLA 1KV2A 3LPBA 2YZAA 1G3NA 3F3WA 3E8DA 2C3JA 4XP3A 3F6XA 5DI1A 4U79A 4FKJA 4OTWA 4BC6A 2UZOA 5HO6A 4L9IA 3Q32A 3QU0A 4YZBA 3ZRLA 1ZOGA 3BV3A 3PE1A 4RFYA 4ZY6A 3FMEA 4RJ8A 3G51A 4FTIA 3DJ7A 1K2PA 2OBJA 1JOWB 4CYIA 4IJ9A 3QRJA 4M66A 4F9AA 4FV2A 2RKUA 3GP0A 4PL4A 4M0YA 4EOLA 4B6LA 3NNWA 5K4IA 3ZC6A 3KRLA 5L2WA 3GB2A 2EXCX 5AIRA 3C4FA 3HRBA 2BKKA 4CGAA 3IKAA 2XIKA 3D5VA 4QP9A 4C59A 4BICA 4QTEA 4NM3A 2UZLA 3ODZX 4NEUA 3F3UA 1QPEA 4RLLA 2YN8A 3ACKA 3SRVA 4CTBA 4G9CA 5DRBA 5L3AA 1J7IA 5IQFA 3NAXA 2FSOX 4U44A 4E4LA 3FMDA 4C37A 3IW5A 4LUDA 3ZYAA 4AF3A 4FKWA 2IZSA 2OJJA 3R8LA 2Q0NA 3CGFA 3NUPA 4FVRA 4JJRA 1M7QA 1XKKA 3COHA 4RMZA 4TYGA 5IQDA 4IZYA 2PMNX 1Q62A 3HDMA 2BALA 4F64A 2C68A 4M84A 3LQ8A 3DBFA 3OOGA 2GQGA 2UW8A 3SV0A 5KHWA 4M67A 3MFUA 2WEIA 3NUUA 4WO5A 4IXPA 3G9NA 3QWJA 1HCKA 1NXKA 1TQMA 2QNJA 3HDNA 3W32A 1W82A 5EQYA 1A9UA 2QOLA 4CT1A 4CG9A 3OTVA 3QAME 3NDMA 4I4EA 5EKNA 1W84A 3F69A 3FV8A 4FTAA 3QTIA 3RALA 3E64A 3TG1A 4KABA 3FI8A 4UWCA 1MQBA 4MD8E 5EM7A 2QD9A 4DT9A 2KTYA 4OAUC 3ANQA 3AD6A 3QF9A 4IADA 4O0UA 3R0TA 4Y73A 4NM7A 4KKHA 4KAOA 5BVKA 2OU7A 4JX7A 1PW2A 2R3OA 4LMUA 4NU1A 3PY0A 2XNBA 3TUCA 1KE6A 2W99B 3Q9WA 5LCKA 3EQGA 3R8ZA 5KMNA 3S00A 4JT3A 3EN7A 4D9TA 2FH9A 2XYUA 4FSYA 4PPAA 4DFNA 2OIDA 4I20A 2VX3A 3ZHPC 3BBTB 3AGMA 3QRIA 4Z7HA 3MESA 3E5AA 1Z5MA 3QTUA 4FKPA 1ND4A 4JG7A 3QUDA 4RQVA 3WILA 1W98A 4FI1A 1GZNA 1YWRA 2XK3A 3RAWA 3RZFA 4C35A 3TT0A 2HY81 2BPMA 3EQRA 4HGEA 1R78A 3VW8A 5IMEA 3PA5A 1PXJA 4HCUA 4EKKA 2W1HA 4EK8A 5EQEA 2IZRA 2WMUA 3UQGA 3CC6A 5CEMA 1PMEA 4RJ3A 4EH5A 3EWHA 2VWZA 4H1MA 4XG3A 3T9IA 2H6DA 3F7WA 2PVLA 5HE1A 3VUMA 4ZTNA 1KE9A 5IZFA 4D55A 4KD1A 4WNMA 5LCJA 2Q0BA 3O96A 4M8TA 3V5QA 3WF9A 5KMKA 3ZU7A 4OUCA 1PHKA 1ZOEA 3D5UA 4JBVA 4DC2A 5DT0A 1ZOHA 4G6LA 2O5KA 3HV5A 4EYMA 5JH6A 4F09A 5M08A 3D15A 3CY3A 1ZYDA 3BLRA 3CD8A 1ZYJA 2ETMA 5E8VA 4E8AA 5CENA 4X3FA 3UBDA 3BQCA 3OF0A 3R71A 3QUPA 2JDSA 4CKRA 4I23A 4CXAA 3EL7A 5DGZA 4KB8A 3IONA 3PJ8A 5CVFA 3LCSA 4O22A 5A54A 4ZK5A 4WG3A 2YHVA 5ANGA 2I6LA 4FVQA 3R8MA 4AGWA 3GEQA 2F57A 3I5NA 1V1KA 4MBIA 5CSPA 2VTRA 2BFYA 5J7HA 4IM2A 4QPAA 3GUBA 3D4QA 2DQ7X 4IVAA 2GU8A 4NFNA 5L8JA 2YIYA 4M69A 1Q8UA 3FZRA 4EK4A 3PP1A 5F9EA 4S34A 5A14A 4MCVA 4RVTA 4LL5A 4BRXA 3R7IA 4U40A 3UE4A 3FLZA 4BIDA 3OW3A 5FQDC 3MA3A 5IA0A 3MSSA 4HVDA 4QTCA 4V0GA 4KBKA 4ZJJA 3UOKA 4AA5A 3BYOA 5CU2A 3MH0A 3NW6A 3BU5A 4QMLA 3MW1A 2WQNA 4EZ5A 5B2LA 3PVWA 2VNWA 3QHRA 2VTQA 2Y4IC 4IDVA 1M52A 3ZEWA 2BDFA 4J8NA 1Q5KA 4IW0A 4UEUA 4D2SA 2VTJA 4X2KA 4E6DA 5EKOA 3RGFA 4BIBA 2YISA 3QD0A 3RK9A 4EORA 1R39A 3HV7A 2ZM1A 4PL5A 4XOZA 3VS5A 3R83A 2W4KA 2WTKC 3WZEA 4YC8A 3ROCA 3V01A 4FG9A 3VO3A 4AA0A 1XH9A 1H0VA 1KE5A 1VJYA 1FGKA 4XBRA 4CEGA 3D83A 3FZTA 3UZRA 2E9VA 5GJFA 3IDBA 2JFMA 4MXYA 5HI2A 3PP0A 3FKLA 4RX5A 4RFMA 4J52A 2I0EA 5IEVA 3NNUA 4B99A 4JL9A 1OIRA 4O2ZA 4F63A 3F5XA 3A7GA 4G9RA 5DN3A 4J96A 5J9LA 2ACXA 3TKIA 3BLQA 4YHTA 4K18A 3CTHA 3G6GA 4KS7A 3CP9A 3RMFA 5IH4A 5IISA 4BTKA 3SW7A 3HMIA 5BVFA 2QU5A 3MS9A 3R73A 4XH6A 2E2BA 3JVSA 5FDXA 4E5WA 1GY3A 4RGJA 1ERKA 2WMWA 3PVGA 5AUXA 4W9XA 1J7LA 3IGGA 3FEGA 3QTSA 3FKOA 3MFTA 5T6KA 3MA6A 3KQ7A 4BGHA 3V8WA 5B7VA 3S0OA 4LFIA 2PUIA 3C5IA 2IPXA 2P0CA 3PXQA 3OW4A 5FM3A 1O6YA 2C5XA 4FKRA 3EH9A 1LP4A 3GQIA 4FKUA 5CAQA 4YR8A 4C4FA 4CG8A 4DGGA 5C26A 3C51A 5KBRA 3VF9A 1R3CA 4RWKA 3MDYA 4H3PA 5ANDA 4PL3A 1OL6A 5CZIA 4NSTA 4EHZA 3OXTA 1TQPA 2WNTA 4EOQA 4EHGA 3R9RA 3NAYA 5TO8A 3O8TA 2X0GA 5AR4A 1DS5A 4QMOA 2Z60A 4E6QA 1IA9A 3R7EA 3QCYA 3MH1A 4JG6A 2GNGA 3F7ZA 5AUVA 3G9LX 4YC3A 4KUJA 2WTDA 2CN8A 3IW6A 3ZONA 2J7TA 3DY7A 1URCA 3KVWA 5FG8A 4WG5A 2J0KA 2YACA 3OBJA 5EYDA 3PUPA 3R2YA 4O6LA 1YI4A 1SYKA 3F66A 5HCZA 2WMBA 3CJGA 4CCBA 5F94A 2QG5A 3ZO3A 4OTPA 3WIGA 3VBYA 5ITAA 4RWLA 3ZMMA 3LM5A 2OF2A 3WARA 5M53A 3FWQA 3A7IA 4S31A 5D10A 4NM0A 3TIYA 4O7YA 4ZTQA 1H1QA 1XBBA 3DQXA 2CCIA 2G15A 4LMNA 3CIKA 3LFFA 4GG7A 5JK3A 3I1AA 2YAAA 4E3CA 4OTHA 3DBEA 2CPKE 1YHWA 3DQWA 1U4DA 3BYUA 5EQPA 4BCJA 1Y6BA 4U43A 4FTJA 5FP6A 4FYOA 5AWMA 1YHVA 2YEXA 4L3LA 3VAPA 4BWPA 4FT3A 1OITA 4YGAA 1OKWA 4DFXE 4TTHB 3W2OA 1NW1A 3OY1A 3P1AA 4R7BA 3R00A 4TY1A 2R64A 4MTAA 4U42A 2YITA 4W4XA 3KXHA 3L9LA 3ZBFA 4BDBA 3PRIA 5CLPA 3R7YA 4GKIA 4L45A 5HE2A 4D4RA 2F9GA 5L2IA 3PZEA 4ITIA 2YM5A 3DDQA 3EB0A 4QQTA 5ETAA 5TKDA 1UNGA 4NK9A 3FHRA 4AGCA 4FIHA 1GZOA 4NW5A 1BL7A 3DXPA 2BRBA 1OIUA 1OUKA 5JQ8A 3UNKA 4YC6A 5CT0A 3H30A 3W18A 3I6WA 2VD5A 2PE1A 4XP2A 1ZMUA 4C57A 2HK5A 3MPMA 3R28A 4AACA 1U5QA 3I0OA 4ENXA 4F6UA 5A46A 4FIFA 4D4YA 4NTTA 1UKHA 3UPXA 4OLIA 3BHVA 4K9YA 1F0QA 5KMMA 4QP1A 3VS6A 2WQBA 5BVEA 3IOKA 5BPYA 4WA9A 4Q5HA 5GIOE 3VHKA 3CSVA 1IG1A 4GW8A 3UC3A 4IB1A 4RX7A 4UXQA 3PY1A 4W8DA 3GC7A 3QGWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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