3OFMA

Structure of a human ck2alpha prime, the paralog isoform of the catalytic subunit of protein kinase ck2 from homo sapiens
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SRARVYAEVNSLRSREYWDYEAHVPSWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNERVVVKILKPVKKKKIKREVKILENLRGGTNIIKLIDTVKDPVSKTPALVFEYINNTDFKQLYQILTDFDIRFYMYELLKALDYCHSKGIMHRDVKPHNVMIDHQQKKLRLIDWGLAEFYHPAQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRREPFFHGQDNYDQLVRIAKVLGTEELYGYLKKYHIDLDPHFNDILGQHSRKRWENFIHSENRHLVSPEALDLLDKLLRYDHQQRLTAKEAMEHPYFYPVVKEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the reduced affinity between the protein kinase CK2 subunits CK2alpha prime and CK2beta
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha'
total genus 114
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ofmA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ofmA02
4XYFA 3MW1A 3ZZEA 5A4LA 3UQCA 4DT8A 3GOPA 3ROCA 4FK3A 4DGMA 3F2RA 1XBAA 2B4SB 1NVRA 2G2HA 4L00A 2GQRA 1R39A 3L1SA 3PJ8A 3E88A 1NY3A 4RWKA 2QOOA 3I79A 4XCUA 5E9EA 4YUQA 4YTHA 4CVAA 1CKJA 1G8SA 4DG3E 4JG6A 5BVWA 3P9JA 3VHEA 3VJOA 4BDGA 4MBJA 4BDBA 4EZ7A 3V5PA 3PRIA 4O7NA 4FZDB 3VUMA 4LOOA 1J1CA 4LRJA 4K77A 1I44A 1REKA 3A4OX 3JS2A 5TR6A 3TUBA 4O82A 1GAGA 5JGAA 3BHUA 3PY0A 5A4TA 5HHWA 3GU5A 3IO7A 4RRVA 2VX0A 3R9DA 2VN9A 3KQ7A 2A27A 4AX8A 2VTAA 3HRBA 3NUXA 1Q97A 3V5LA 4GG7A 3ZLXA 4X2FA 3HAMA 4EKKA 4L67A 3TG1A 4F64A 2R3PA 3EFJA 4E4LA 3RZBA 1BL6A 2YZAA 1YI4A 1UU3A 3F3UA 2VTSA 2W5BA 3QCYA 2R3LA 4FV7A 4EOLA 3H30A 5FEEA 3E92A 3F61A 3GCPA 4FKJA 3UIUA 1ZOEA 5E1SA 3THBA 3NYVA 2QNJA 5EQEA 4YTFA 3UIBA 4XRLA 4DEDA 4DFYA 2X2LA 3IDCA 1Q8UA 2C47A 3QA8A 4F1MA 5HU9A 4EORA 1UWJA 3IDPA 2VTIA 4IM2A 1A9UA 4KWPA 4MWHA 1YRPA 4YO6A 2UZTA 3RPYA 3MSSA 3VS6A 2UW7A 3FMKA 2OZAA 2VGOA 4NT4A 3LCOA 3BHTA 4K8AA 5HTBA 2G2FA 3LFBA 4YMJA 1OIQA 3TWJA 3MA3A 3VC4A 3WF6A 1PXLA 2F49A 1IRKA 2VGPA 3U9CA 3PPJA 1PXOA 4K0YA 4RIXA 2ZOQA 4QTDA 3RKBA 4E6QA 2WQMA 2PPQA 5I5ZA 4AGCA 2PHKA 4LGHA 4MXCA 5D9HA 5AX9A 1JNKA 2R3KA 4NU1A 4UZDA 3OCGA 3ORZA 2XA4A 2BAJA 1PYEA 4YJRA 3NW6A 3OWKA 2VNWA 1OITA 3ZFXA 1KE9A 4P90A 2QO9A 4AGWA 4QP1A 4B7TA 4KD1A 4CEGA 5CF4A 4S33A 5EYMA 3RPOA 4C3FA 3OXZA 4LMNA 4ACCA 4U97A 4IVAA 4O0TA 5TF9A 2Z60A 2J0KA 4FICA 3FBVA 3QRUA 3TEIA 3TUDA 3RMFA 4JAJA 3EQGA 1H07A 2H6DA 3ZOSA 5M09A 3KMMA 3Q96A 4FV4A 1R3CA 2VWXA 4GFGA 4CG8A 2R3OA 4Z16A 3DNDA 2OXDA 5K9IA 5M53A 5M56A 3PPKA 2R3HA 4E4XA 4OLIA 3FZ1A 3CC6A 2CGXA 2QG7A 3ZHPC 3W18A 4I92A 4C4FA 3KN5A 4BC6A 2ZB0A 3VW8A 5DA3A 5IH4A 3VS0A 3QZGA 3MVJA 4IHPA 3NMUF 3QQGA 3U87A 3E63A 1YDRE 3ROYA 3NPCA 2C0IA 2GPHA 4D2TA 4D1XA 3NDMA 1G8AA 3ZC6A 4F1TA 2PWLA 5DE2A 4NW5A 2W9FB 4FL2A 5L2QA 4ANBA 3KVWA 4FTKA 3EN5A 3SOCA 3VJNA 4O2ZA 2P55A 3TZ9A 1PRYA 3NCZA 5AX3A 3RI1A 4RJ4A 3LFFA 4MXZA 2WELA 4JVGA 4ENYA 3OROA 4LOQA 2PVKA 2WQOA 1YVJA 1M2QA 4RZWA 5DT0A 4XX9A 3IECA 4BWXA 2R9SA 3DAJA 3UJGA 4CKJA 2X6EA 5JQ5A 2DWBA 1YDSE 2UVXA 2AC3A 1LR4A 5DR6A 4XEYA 2FYSA 2WTKB 4W9WA 4ZTQA 2B9JA 1FVVA 3M1SA 3ATSA 3QUPA 4PTGA 5HBEA 3I1AA 5CS6A 3BLHA 3SG9A 4XMOA 4CRLA 2BILB 3H9RA 4RJ3A 1IG1A 3VNTA 4UMQA 5JFSA 2JFMA 4EEVA 4EOOA 1YW2A 4CCBA 3QLFA 2ITOA 1CDKA 5AR4A 4GK3A 3OBJA 3R7VA 1URWA 4I41A 3M2WA 2I40A 1H08A 1YQJA 2BHEA 3A61A 2C6LA 4GT3A 2BRMA 2YM6A 2JEDA 4OTWA 4C8BA 1SYKA 4O6EA 2YWVA 1OIRA 4DEEA 4I94A 1YOJA 4ZK5A 4PPCA 2HXQA 2WHBA 3QLGA 3R7UA 5BVNA 3ZYAA 3DGKA 3GFEA 3LCTA 3O8PA 4E1ZA 3UOKA 5DMZA 2WMVA 1MQBA 2W1ZA 1T45A 4USDA 4BKJA 2CCHA 2OICA 3JVSA 3S3IA 4CMOA 4O38A 3HV4A 2H8HA 4XG2A 3RCJA 2OIBA 5IG1A 2GDOA 1Y57A 4H39A 5DYJA 3TKUA 3EN6A 4RFYA 3UE4A 4E6CA 1GZNA 3QTSA 5ETFA 3MDYA 4C37A 3UGCA 5L8LA 3DY7A 3JVRA 4UB7A 2XJ0A 4JRVA 1ZYSA 4WUAA 3CD8A 4L43A 5HIEA 3SG8A 3C1XA 3C5UA 4NUSA 2YM4A 3DLSA 4L42A 3QBNA 2EB2A 3KCFA 4QYFA 3A7IA 3TL8A 4U40A 4BZOA 1J7UA 2A19B 3U55A 3PG1A 3ZONA 5H3QA 1WBNA 2XJ2A 5AAGA 4H3PA 2PZYA 2PUNA 1YOLA 2J2IB 4QD6A 1Y6AA 4APCA 3EL8A 3QQFA 3E8NA 3NUUA 4XNEA 4HNFA 4GU6A 4DCAA 3EN4A 4YJUA 4ZZNA 2W1CA 3SXFA 3CSVA 5H2UA 3W33A 3KY2A 2GQSA 3DJ6A 2JAVA 3AMYA 3BBWA 5HG5A 5HIDA 3DK7A 3PJ1A 5FLFA 3IS5A 3KULB 4E8AA 4OR5A 3ORKA 3KK8A 4IJ9A 4FKRA 4YZBA 4P2KA 4O22A 5D10A 3SHEA 3NYNA 4FEVA 4FTMA 4FNYA 2QCSA 4F7JA 3FKOA 3BEAA 4EH8A 1JKKA 4IAZA 2ERKA 4KKGA 3U54A 4ZLZA 3Q6WA 3Q5IA 3HL7A 2CCIA 2HWPA 3PWYA 5CT7A 4F08A 4RG0A 4HCVA 5BYLA 2HK5A 1PHKA 1K3AA 1Q62A 4YU2A 2PSQA 3RPSA 2F2UA 5M06A 4RFMA 4GIHA 4MCVA 3RK9A 2E9OA 5DWRA 3OT8A 4IC8A 3MIAA 3T3VA 3A8WA 2W1IA 2ITVA 5AP4A 1GOLA 3R8PA 2OIQA 3HNGA 4BCGA 4AW1A 4O83A 5K0KA 5EOBA 1S9JA 4J95A 4RC2A 3PY1A 1OIYA 2ZDTA 4Y8DA 3UBDA 3F69A 1WVYA 3ULIA 4FKSA 3V5QA 3JYAA 2BVAA 3D5VA 4X6QC 2C6MA 3ERKA 4IB3A 4AZTA 3W10A 4CKIA 4NCTA 2IVSA 3PZHA 4C3PA 3UYSA 1JBPE 4EHVA 2WO6A 4IFCA 4V01A 2B9HA 3ZEPA 4NM0A 3R21A 2PUIA 4NSTA 3RPVA 2C3IB 2UVYA 3EQBA 3G6HA 4I3ZA 3NCGA 4LUDA 4QMLA 4TWPA 4A4OA 1J7LA 2OJFE 2RFDA 1UKHA 4G3EA 3UZPA 3B8QA 3POOA 4QP8A 3R8UA 2OH0E 4UXLA 2XK9A 2J0LA 2YACA 4TPTA 3LQ3A 4LRMA 3TM0A 4ZS4A 5JT2A 5FM2A 4EOPA 5E8SA 1Q99A 4KBAA 3F3ZA 4X2KA 3TKHA 4E5WA 5B2KA 3R28A 4NKAA 4HJOA 4QMZA 1BUHA 5KMIA 3F82A 4YC3A 3C9WA 2VTHA 3F6XA 3VWAA 4XV9A 1PF8A 3FWQA 3LHJA 1SVHA 4O81A 4IWDA 4IQ6A 2QR8A 2VWZA 4WG5A 1WBTA 3IGOA 3QU0A 4D58A 4G5JA 4CSVA 1GZKA 3ANRA 3QD4A 3OVVA 4Z7HA 4XG9A 1BL7A 5HE2A 5IEXA 1RJBA 2W5AA 4O2PA 2C30A 1WMKA 4UZHA 2I1MA 3KXXA 2DQ7X 2JKKA 2XNOA 4QQJA 1MP8A 1RW8A 5C8MA 3VULA 4MEDA 4QMMA 5IQGA 4UALA 2O63A 4DFUA 3PVWA 4FV2A 3WF7A 2W1EA 2XRUA 3D94A 2IJMA 2XCHA 4O21A 5ICPA 2Y7JA 1M7QA 2W06A 4PWNA 4ARKA 1FVTA 5AP1A 4KB8A 4HCTA 3TZ7A 4QMQA 5AP0A 3LIJA 4YZ9A 4BF2A 4GJ3A 4IMYA 5AUVA 4F65A 1FQ1B 4LUEA 5DOSA 3D7TB 4RC4A 4OGRA 3LQ8A 4A9YA 3C51A 5ETCA 3HMNA 4MH7A 1J1BA 3NVMB 3CS9A 4GV1A 5AP5A 5A14A 4FYNA 2NPQA 4OUCA 5EHLA 3GOKA 3FZSA 4M3QA 5BPYA 3TIZA 3NLBA 3FMJA 5H8EA 5KUPA 1SVGA 2HZ0A 2IPXA 4EHZA 3P5KA 3AGMA 4MWIA 4KRCA 3LJ2A 4PL4A 2CKPA 2WD1A 5HTCA 4L45A 2BHHA 2GCDA 2OJGA 2PY3A 4O96A 3R9HA 3V04A 3ZMMA 3KFAA 3MTFA 4R1YA 1CKIA 1PY5A 2FSOX 4I21A 4DH3A 3UVRA 2OU7A 2UW4A 4QTAA 4QP4A 2PUPA 3EYHA 3FI8A 2F4JA 3NYOA 2YHVA 3EFWA 4AFEA 4XRJA 5JH6A 3QYWA 2J7TA 2Q83A 4FT5A 3V8SA 5A6NA 2ITYA 3QAME 4H3QA 4XG8A 2KULA 4ALWA 5FXSA 4EJ7A 1H1SA 2XJ1A 1BKXA 3HA8A 4LM5A 1KE6A 4EH2A 5ANOA 2VWWA 4JRNA 4BICA 4HVHA 3A4PA 1PXPA 1YXUA 4RFZA 2YDIA 5J9YA 1BX6A 5I9UA 3LXLA 4O0SA 1H00A 2OIDA 2VAGA 3GU7A 4M0YA 3W55A 2X0GA 4PF4A 1BLXA 5EK7A 4Y85A 2FVDA 3AT2A 4C4HA 1ZYLA 1P14A 1M52A 5HKMA 4TYHB 1APME 4XHKB 4K11A 4ASXA 5AV4A 3COIA 3HKOA 3IOPA 3K5VA 3QZFA 3PLSA 4TY1A 3I7BA 3IPHA 1TKIA 4JLCA 2YAKA 2ERZE 2XZSA 2C4GA 3FLQA 3M42A 2IWIA 2W05A 3R6XA 4J53A 4PDOA 3P7BA 3RAIA 5A46A 2IW8A 1OL1A 3LVPA 4FKPA 3V01A 1U46A 5HCYA 5EYCA 1FMKA 4FTOA 4D2RA 3S4QA 3FMEA 3VHKA 3F7WA 1WBPA 4FKIA 1GNGA 1W83A 4KA3A 3QL8A 2LAVA 3VUGA 3KREA 1H1WA 5JZNA 3TNIA 1F5QA 2G2IA 5M57A 2WTWA 3I60A 2XF0A 4Q5HA 2XBJA 1Q8TA 2RGPA 4YJSA 4DH7A 4Y5QA 4LV8A 4LG4A 5I3RA 5EQPA 3UVPA 2PMNX 3GCUA 3BEGA 3AC1A 4WG4A 5HIBA 4BWKA 5LMKC 2EB3A 4F4PA 3L9PA 3QXOA 4WSQA 3D15A 3S1HA 1LEWA 3G9NA 4RIXB 2WOUA 5JN2A 2F7ZE 2HELA 2QOBA 2QOFA 2I0HA 1EH4A 3AMAA 4IZYA 4R8QA 3FQSA 5HBHA 3R9RA 3VVHA 4WRGA 3T9IA 1UV5A 5DPVA 4AW2A 4UMRA 3DB6A 4JIKA 3BE2A 4FZFB 2C6OA 4EZ3A 3HECA 5T3QA 2XM8A 2PZRA 3QF9A 3NWWA 4J97A 2KTYA 3R9NA 3DK6A 2CDZA 3C4WA 3O0GA 5AR8A 4RA4A 4RC3A 3AGLA 3PLAE 3GT8A 4TYGA 4D5HA 1VZOA 1XBBA 2XIKA 5H9BA 3OY3A 4YSMA 2ESMA 4RBLA 2Z02A 2WGJA 4FSMA 4BDFA 4MX9A 2QO7A 3ZH8A 1CM8A 1ZMVA 2ITPA 2ITUA 4E7WA 2XNMA 3IW7A 3OZ6A 4F7LA 2VTRA 4W4XA 4AS0A 2VD5A 2ETMA 2YIQA 3KK9A 4JNWA 2QOKA 3VS5A 2PYWA 4FV8A 1B6CB 2BUJA 3ORNA 3SKCA 2V62A 3OMVA 4U79A 3QRTA 4M67A 3VIDA 5L2TA 3QQKA 4IZ5A 4O6LA 3MPTA 3ZM4A 2XK6A 3OT3A 2ITNA 3QKMA 4JBPA 4WG3A 2YCFA 3NNWA 5C26A 1H0WA 5CY3A 2PVJA 5DI1A 1DS5A 3CTQA 4GYGA 4A9RA 5IQIA 1OUKA 1WZYA 4OBOA 3GCVA 3ODYX 4P4CA 3TV6A 3G90X 5IU2A 3TN8A 2X4FA 4YZDA 3PRFA 4J96A 4C58A 3PXFA 3LLAA 4ZTHA 4DFZE 3AXWA 4CLJA 3WZDA 4MQ2A 4PNIA 4CXAA 3TNHA 4FTQA 4K1BA 4PMSA 3ENMA 3DQXA 1F0QA 2JDOA 3F3WA 3QHRA 3Q60A 2BFYA 3TNQB 2X9FA 3ACJA 3FZRA 3NNUA 5EM6A 3DKGA 3FXWA 3GC7A 3KMUA 4O27B 4FL1A 4D2VA 2YERA 3F66A 4H1MA 2XCKA 4XBRA 4FEWA 4LL5A 5FRIA 2WMAA 4ZY6A 3P4KA 5CF6A 2WZJA 2BZHB 3OS3A 4DT9A 2VTJA 4FV3A 2ITTA 3D2KA 3O7LD 4BDIA 1FPUA 3BELA 4L3PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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