3ORKA

Mycobacterium tuberculosis pknb kinase domain l33d mutant (crystal form 2)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
292
structure length
274
Chain Sequence
SHMTTPSHLSDRYELGEILGFGGMSEVHLARDLRDHRDVAVKVLRADLARDPSFYLRFRREAQNAAALNHPAIVAVYDTGEAETPAGPLPYIVMEYVDGVTLRDIVHTEGPMTPKRAIEVIADACQALNFSHQNGIIHRDVKPANIMISATNAVKVMDFGIATAQYLSPEQARGDSVDARSDVYSLGCVLYEVLTGEPPFTGDSPVSVAYQHVREDPIPPSARHEGLSADLDAVVLKALAKNPENRYQTAAEMRADLVRVHNGEPPEAPKVLTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allosteric activation mechanism of the Mycobacterium tuberculosis receptor Ser/Thr kinase, PknB
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Serine/threonine protein kinase
total genus 86
structure length 274
sequence length 292
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3orkA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3orkA01
4XV3A 4K0YA 4M8TA 3BRBA 5HORA 1P14A 3NNUA 4UMRA 2GNJA 1JLUE 4N6ZA 4XYFA 3BHHA 3R02A 4LUEA 5K0KA 4EUUA 3ROCA 5JN2A 2GHMA 2VO6A 3O8PA 2VNWA 2BAKA 2WZJA 3REPA 2CCHA 5CAOA 5HE3A 4GG7A 5GHVA 5GJGA 1PMVA 3R0TA 4HPTE 3PIXA 2XJ2A 3MY0A 3RBWA 4HCTA 4L7SA 3OW3A 1WBOA 2QU6A 4PPBA 3QZGA 3FPMA 4E4XA 4O2PA 2YHVA 4FKPA 4IZ5A 4GKIA 5EI6A 3VS0A 5LMBA 2CPKE 2C6LA 2RFEA 1XR1A 2W5AA 5IQIA 5IA4A 4O7VA 2O65A 4UZHA 4S34A 4G2FA 3VBTA 4AQCA 4BCIA 5HQ0A 3V6RA 5L2QA 4TYHA 3ZTXA 4YJPA 5DMZA 4CRSA 4BYJA 3C7QA 4CKJA 3FZRA 5CSPA 4J52A 3P7BA 5IH4A 5LMKC 1PXOA 2XK6A 4JG8A 4C58A 2ZDTA 4AU8A 4BZOA 2VWUA 1Y91A 3CR0A 2ITNA 3PP0A 5FXRA 3ZRMA 4IBMA 5H8BA 1JPAA 4RWJA 3LFAA 4A06A 5EM8A 3CQUA 3ZEWA 3V04A 4S31A 5FBNC 3S0OA 3GU6A 4O38A 2DS1A 3FHIA 4QOXA 4XOZA 5ETIA 4EC9A 5CNOA 4F6SA 4F0IA 1OKVA 3NYOA 3P08A 4RJ8A 1GZOA 3OG7A 2XNPA 1JSUA 1U4DA 4TWPA 5DFPA 4FEVA 3KC3A 4FSQA 4QT1A 4DEEA 5K9IA 3PY3A 3LAUA 4LV8A 3ATTA 2OZAB 2XIXA 4ENYA 4GK3A 2HK5A 2BHEA 3DDQA 3TV4A 4I5HA 2JC6A 2UW3A 4MXOA 4UBAA 4R3RA 1CM8A 4C4FA 2ITOA 3DJ7A 3EJ1A 3QCYA 4RC3A 4AX8A 5C8MA 1ZMWA 4ENXA 3DXNA 3Q9WA 5E8YA 2OXXA 3ORTA 3TV6A 4O7RA 3FY2A 2RSVA 4LI5A 4JR7A 4LGGA 4DFNA 3K3JA 1F0QA 5BUJA 4E6QA 4BDKA 2C30A 1Q99A 3VULA 2PULA 3QRUA 2YWVA 3F66A 5C8KA 4F9CA 4QMNA 3WIGA 4FKSA 4FGRA 4KRDA 2BDWA 1SM2A 4JJRA 4UEUA 4AGWA 4R5SA 2B55A 4PX6A 5IF1A 3CC6A 3ZM9A 3ZEPA 4UY9A 3IDPA 2BZJA 4GH2A 4D1SA 4I6QA 2B9HA 2WTCA 3EH9A 4YHTA 4BF2A 3DFCB 2QOKA 2RFSA 4U97A 3KXGA 3CKXA 4QMMA 3RGFA 3RAHA 4FG7A 2YM7A 3DY7A 4G3FA 3R71A 3R30A 3F7WA 1OZ1A 3QWJA 3OWJA 3OY3A 5CTPA 4YO6A 2J0LA 3UODA 3ZONA 4KAOA 1IAJA 4NWMA 1FVTA 4EOSA 4CSVA 4IAFA 1H1QA 3RM7A 2WKMA 3V51A 4KIOA 4UN0C 4YSJA 3U6JA 2ZAZA 2XIZA 2OJJA 2W4JA 3B2WA 4EK3A 3Q96A 1H28A 1ZYDA 4W4XA 5FRIA 3VS6A 4ZIMA 4IW0A 3HA6A 2CKOA 4MNEA 5LVMA 3NS9A 2PVRA 2UW5A 3UO6A 1YXUA 3QQJA 1YDTE 4F7JA 4JQEA 2R3IA 4DH5A 4X2JA 2ZB1A 3GUBA 5L8KA 5M4FA 3UO5A 3PVGA 4PP9A 4RVTA 2QOFA 4JS8A 4DFUA 5M53A 3DLZA 2QOQA 2RF9A 3C4FA 2IVUA 2F4JA 4EWQA 4PDOA 1UKHA 4EOQA 1FGKA 1J1BA 4ANBA 4IX6A 5I9WA 3OS3A 1M2RA 2IZRA 2PZYA 4GUBA 5A3XA 3VS7A 4F7SA 2F2CB 4MX9A 4D2RA 4IX4A 5IQAA 1OB3A 2JD5A 3CY2A 4G17A 3BEGA 3VQHA 1ZY4A 3AC3A 5HX6A 5AP7A 3TZ9A 2DYLA 2YDIA 1H4LA 4F99A 4FV8A 4IE9A 2R3MA 3H9RA 2VGOA 3H30A 3JVSA 4MBLA 4A4OA 5FTGA 1CKJA 2VRXA 3RKBA 3W55A 4AGCA 5GJFA 3BZ3A 5KZIA 2J2IB 2GTMA 2QHNA 3ORXA 4HZSA 5E1EA 1XBAA 4FIIA 4HNFA 2YIXA 2HAKA 4FT7A 2ONLA 4FV7A 4GV1A 1L8TA 4KWPA 4OBQA 1GOLA 2FSTX 4HVSA 3EFKA 4X3FB 1Z9XA 4NCTC 4JIKA 4E5BA 3TKUA 2VWWA 3HEGA 3K3IA 4EH9A 4EYMA 5HICA 5CEQA 3S1HA 5AWMA 4AGDA 5KCVA 3OW4A 2G2HA 3F3TA 2CCIA 1JKKA 2W4OA 5LVLA 4C2VA 1WCCA 1XH6A 5EQYA 2J5EA 3PWDA 4LL5A 4F9YA 4IHPA 4MHAA 4W8DA 5EDQA 4IWQA 4I1ZA 3F2RA 4AFEA 1DAWA 5B2LA 2FUMA 2PE2A 2R3PA 4Y85A 4FE2A 2BKZA 3ANRA 3ZLXA 5T6KA 4ZS0A 4TWNA 2WTKB 4H3PA 2YZLA 1Z5MA 4R7HA 4DGMA 3P78A 2QOBA 4WSQA 5EFQA 2ZM4A 2IN6A 2VU3A 2WXVA 5EM5A 4AOJA 4RVLA 3VC4A 3PG1A 4BDCA 3EQIA 4K6ZA 3SW7A 3R7EA 1FMKA 5LCKA 5DVRA 4JLCA 2YA9A 4RWLA 4DTKA 3S95A 1REJA 2UVZA 2AC3A 2HWPA 4J99A 3Q4CA 4RQVA 4BY9E 4ZSEA 3HRFA 1Q4LA 1VZOA 4ZTMA 3FLQA 3C51A 4KBAA 2BDFA 2PZ5A 2GS2A 4NKAA 4EOPA 1JOWB 5CX9A 5B2KA 1I09A 3A4OX 3A7IA 3RPSA 4D4VA 4CFMA 3R1NA 3DA6A 3KU2A 2W4KA 4B0GA 4QPSA 5LVOA 1G8SA 3G9LX 4XEYA 3PVBA 3ZOSA 4FL1A 3TEIA 4BI2A 1ZXEA 3GB2A 5DIAA 4D5HA 2WTVA 1XBBA 1G3NA 3QTWA 4XV9A 3LFDA 3TT0A 4L3LA 4I0TA 4RZWA 4WD5A 5CLPA 4Z55A 5A4QA 4CT2A 4D28A 4FT0A 2JBOA 3HV4A 5DH3A 1YI6A 4I24A 4E73A 4GFMA 3UIXA 5M09A 4K1BA 4YR8A 3ZUVA 4MKCA 4UMUA 5KMOA 3NYXA 3ZMMA 5I9XA 4B9DA 4DINA 3I0QA 2C6OA 3SW4A 2OICA 2OWBA 3QQGA 3F7ZA 4HNIA 4FKTA 4AT3A 4NZWB 4N0SA 3ZLWA 1KV2A 3I1AA 3DXQA 4K9YA 5M4IA 5H8GA 3I7BA 2WHBA 3R04A 5BYYA 3WF5A 4TN6A 2NPQA 5FEEA 1NY3A 3KEXA 2BRBA 1ZLTA 5E9EA 5TO8A 3ZO3A 4TKSA 3ZH8A 3QQFA 1UVRA 3MN3A 1Q5KA 1WBTA 3HMNA 5KNJA 1MQBA 2W1GA 3NAYA 3LMIA 4ZTHA 4JRNA 2V55A 4RSSA 4H1JA 3KF7A 3ZSHA 4FSYA 2WNTA 2R3GA 3KCFA 2GQRA 5IA0A 3LCTA 3QCSA 2CKQA 3D5VA 4BDFA 5EQPA 2R7BA 5JFSA 2BTSA 3MIYA 5C4KA 2C3KA 3CD3A 3MFUA 5IU2A 1QPEA 4JAIA 4PDPA 4B99A 3PA4A 4NT4A 3B2TA 2GNGA 3TTJA 4QTCA 1CTPE 4C57A 2E9VA 2WTJA 1PYEA 4GS6A 2YISA 1JAMA 4IAAA 2I7QA 3NSZA 3TDVA 4MQ1A 3QTQA 4M84A 3VRYA 1S9JA 3KRLA 5KMKA 3OCBA 3T8OA 1WBVA 3LW0A 4D58A 1SNUA 2QC6A 3EN5A 4QMYA 3MTLA 2Y9QA 4K8AA 3TI1A 1OPJA 3QQKA 1K9AA 3AGLA 1V0PA 3OVVA 5CAPA 4CTCA 4DA5A 4Q5EA 3EQCA 3JVRA 4MXCA 4ZJJA 4CZYB 3NRMA 5F95A 4P7EA 4X2FA 4OUCA 3SGCA 3E62A 5DA3A 5KX8A 4IZ7A 4ZSLA 1V0BA 3C4WA 3BE2A 4C62A 2E9UA 2RG6A 2X4FA 3DJ6A 5EHOA 5T68A 3AT2A 2QD9A 4AZTA 3QTIA 3OROA 2OO8X 4QP8A 4XCUA 2GHGA 3P9JA 5L8LA 2WIPA 5AP0A 3UVPA 4WG5A 4QMLA 4FIFA 1ZARA 3QYWA 5HLNA 5I5ZA 1Q8TA 1YXXA 3KKVA 3Q04A 1VR2A 4C4IA 2X2KA 3SVVA 2GCDA 1V1KA 2OIDA 2V0DA 4E6AA 4BTFA 4CD0A 3ZLYA 2J4ZA 3V5PA 3PLAE 5E8UA 2BZIB 2B1PA 3G6GA 4FEWA 2BIKB 3E92A 5GZ9A 5K4JA 4IB1A 4CV8A 2QHMA 1XBCA 1OIUA 5BYZA 2J0KA 2YACA 2JGZA 3KMWA 2ITUA 2XIKA 4D0XA 4G3CA 3F3VA 2OZOA 2WTIA 3FAAA 2J9MA 5HGIA 5GIPE 4O0RA 4YC6A 1U5RA 2BAQA 2PE0A 3R8MA 4HOKA 4FTAA 2ITVA 5IQHA 4ZTRA 1WVYA 3P86A 2GQGA 4ONAA 3DK7A 3ZC5A 1FVRA 3MH2A 3V8SA 1F3MC 4TXCA 3UPZA 3MFRA 3DKCA 4UB7A 5EK7A 3VAPA 2PUIA 3C5IA 1ERKA 3P1AA 1Y57A 4I93A 4V04A 4TWCA 4BI1A 3W10A 4BI0A 4AN2A 1H1WA 4U79A 4FG9A 3UOKA 3O71A 3VBVA 3GVUA 2QLQA 2FVDA 3TXOA 2BZHB 2P33A 4WT6A 4J53A 3UYTA 3UIUA 4A9RA 1M14A 2NRYA 1URWA 3F3ZA 3PWYA 4G6LA 4I3ZA 4OR5A 4QMTA 4NM5A 3UVQA 3W2PA 2XP2A 5IMXA 3LFBA 4NEUA 4N70A 4DAWA 4EZ3A 2XF0A 2FSMX 3ZRLA 4O7NA 4U44A 4K11A 1Y6BA 4XRJA 2C5YA 4BC6A 2GS6A 2Y4IB 4WRSA 4NJ3A 5ANIA 3FUPA 4ERWA 1T45A 3MY5A 3Q9XA 3RPRA 1BMKA 4BN1A 5JRSA 5LVNA 4RMZA 1OKZA 5CXHA 3ZFYA 3KMMA 3PA3A 4R7IA 2X8IA 3KF4A 5CF8A 2E9PA 3G6HA 4F6UA 4BDIA 2YAAA 3WYXA 1BLXA 5GNKA 2XB7A 2CMWA 4O0WA 1URCA 3ELJA 3GQLA 3POZA 1WVXA 3EQRA 2VX1A 5I9YA 1ZY5A 2SRCA 5CSHA 4ASDA 3FLYA 3GFEA 3BU3A 1OIQA 1RDQE 4UZDA 5GJDA 4EQUA 5ETFA 4UXQA 3ZSGA 2VTTA 1WBNA 2XZSA 1OECA 5M4CA 4XP2A 2UW7A 1BI8A 2JDOA 4IC7A 4U81A 2YIRA 2OZAA 2PZIA 5HI2A 4BTKA 4OTQA 3IOKA 4YBKA 2R3NA 4RX7A 3L8XA 4UWBA 3A60A 5HVKA 2ONLC 2WMUA 3WF8A 3D5UA 3E8NA 5I9UA 4YGAA 4GCJA 1YXSA 2C47A 5FEDA 3ZBFA 4O1OA 5KHWA 5DRBA 2DWBA 4Z7GA 3C4EA 2A27A 3GXLA 5CSXA 5CALA 4HCVA 2W5BA 3PPZA 4YNOA 4WG4A 3R8VA 2YAKA 4DEDA 2Z7SA 2PMNX 2XNMA 2QOOA 4J71A 3UOLA 3PXKA 4EORA 1XWSA 2A0CX 3GQIA 3KULB 3QTXA 5DR2A 3RHXA 2C3JA 4G5JA 5GINE 2W9ZB 1ZMVA 2R2PA 5HHWA 3SKCA 3E8DA 4FT9A 4FTTA 3QRJA 3R1SA 5DT3A 4ID7A 3L8VA 1BKXA 2IVVA 5CENA 3AC5A 3F88A 3QGWA 3RK9A 3WARA 5F9EA 5K5XA 4YLKA 1B6CB 4L9IA 5DWRA 5HO7A 5I4NA 4I6HA 1NVSA 4Q5HA 4HGSA 3PA5A 4YJNA 4U80A 5FTOA 5L2SA 5GZ8A 4M15A 3SD0A 4XMOA 1M52A 2PPQA 4I20A 3TDWA 4FKLA 4S32A 3O8TA 3KRJA 4FODA 2X1NA 4Q9SA 4IZAA 4GT3A 2WTDA 3QC9A 4BR3A 2PTKA 3DOGA 3FI2A 3HMOA 1QL6A 3QRIA 3ENMA 5F4NA 3IGOA 5IA3A 1KE6A 4EH5A 2X9EA 1Q3WA 3EL8A 4X7QA 4FK3A 1GIJA 2ITYA 3KK8A 4HGEA 3MH0A 2F9GA 2XM9A 2XRUA 2CLXA 3DB8A 4O0YA 3C0GA 2ZJWA 2VN9A 4ZOGA 1OKWA 4KS8A 4D1ZA 3F5UA 1UNLA 1W8CA 2Y0AA 4BZDA 3E87A 3AD5A 3SDJA 3V6SA 3ZSIA 2C68A 4GW8A 4FNWA 2R3RA 1J7LA 5E92A 3LOKA 4FI1A 3HNGA 5DT4A 3UGCA 2GNIA 3LCKA 3HKOA 5AR8A 3UQCA 4H39A 2P55A 4EONA 4BCHA 2ITTA 2WD1A 5IH5A 1YWNA 5HG9A 4FIGA 2JIVA 4OTGA 3A7FA 4X6QC 4PDYA 1YW2A 5HG8A 3ZDUA 4BBFA 4HVDA 5LOHA 3R7UA 2C6KA 4AZVA 1H26A 4LMUA 1S9IA 3WZDA 3E8EA 3PXYA 5BUIA 4GSBA 3BELA 3VUHA 3RMFA 2W06A 4D2SA 4C4JA 2YITA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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