3ORPA

Mycobacterium tuberculosis pknb kinase domain l33d mutant (crystal form 5)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
290
structure length
274
Chain Sequence
MTTPSHLSDRYELGEILGFGGMSEVHLARDLRDHRDVAVKVLRADLARDPSFYLRFRREAQNAAALNHPAIVAVYDTGEAETPAGPLPYIVMEYVDGVTLRDIVHTEGPMTPKRAIEVIADACQALNFSHQNGIIHRDVKPANIMISATNAVKVMDFGIAIGTAQYLSPEQARGDSVDARSDVYSLGCVLYEVLTGEPPFTGDSPVSVAYQHVREDPIPPSARHEGLSADLDAVVLKALAKNPENRYQTAAEMRADLVRVHNGEPPEAPKVLTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allosteric activation mechanism of the Mycobacterium tuberculosis receptor Ser/Thr kinase, PknB
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Serine/threonine protein kinase
total genus 88
structure length 274
sequence length 290
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3orpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3orpA01
4PL4A 2YZLA 3LXPA 4JX3A 4OAUC 2Y4PA 5I9VA 4F6WA 2YCFA 5CEKA 3E92A 5GHVA 4G17A 3ROCA 5HNIX 3LCDA 4AX8A 2WFYA 4E6QA 3OCSA 3QTWA 4O0VA 4J98A 2ITPA 4PDSA 5CU6A 2CMWA 3NYOA 5EDRA 3A8XA 3MIYA 1SMHA 3IOKA 3F69A 2JEDA 3O7LB 1PXPA 3QTRA 2Y4IB 2X6DA 4YHTA 2VO0A 3I79A 2XK4A 3ZU7A 3DJ6A 3H30A 5EDQA 4I6HA 4AN2A 4EZ5A 3BZ3A 1KE7A 2GNIA 2XNBA 4OBPA 4DGOA 4AZFA 4EBVA 5M4UA 3Q3BA 5HTCA 4FTRA 4RIXA 4EK4A 5BMSA 3QD3A 4ZY4A 1M2PA 4CZUA 2WTCA 4YJTA 2YACA 2QONA 5KMKA 4Z55A 2QKWB 2I6LA 1YHWA 3BBWA 4U81A 5DHJA 3RZBA 4RX5A 4ZIMA 1QPCA 4IJ9A 3AMBA 4IEBA 4FEQA 4A4XA 4U43A 4ASXA 4AOIA 3FL4A 4ANNA 4U41A 4D5HA 2XKEA 4AACA 1DS5A 5AR7A 1A48A 2P3GX 3PY3A 3DGKA 2OIBA 2RIOA 2F4JA 3NR9A 3TWJA 1LEZA 5E4HA 2OSCA 3BE2A 4WD5A 4CV8A 2ITZA 2XM8A 4LL5A 4XG2A 3V5WA 5EQEA 2Y9QA 4M15A 3R7IA 5JQ5A 3UOJA 2GFSA 3VNTA 4FG9A 4ZTSA 4LI5A 4X2JA 1YXVA 4EOPA 5EDPA 4FE2A 3R8PA 2IVUA 3GU6A 4QNYA 5FEDA 3RI1A 5GNKA 4EBWA 3KMWA 2A27A 2FVDA 3PSBA 4GJ3A 2UZTA 4JIAA 5KUPA 3ZUVA 2Q83A 2QOCA 3NVMB 4W4XA 3MB7A 3R28A 2X4FA 2W1EA 3R30A 1GOLA 4QYYA 4GIIA 2ITTA 4WNOA 5AP4A 2VWIA 3VQUA 4BKJA 5GZ8A 4QP9A 4FTTA 4WUNA 5AP7A 4IWDA 5HGIA 5CVFA 2R3QA 2VRXA 4C4HA 4EQMA 3Q32A 3ZFMA 5EYDA 4BN1A 4F9CA 3I60A 1WFCA 3TNHA 4DBNA 3OHTA 1W84A 4JG6A 5LVMA 1NW1A 5AUVA 3OBJA 3HRFA 2J90A 4HOKA 4U44A 2JKQA 4FOCA 3UPXA 5HU3A 3LXNA 1WVXA 3R00A 2EXMA 2UW0A 3BV2A 3NDMA 2XEYA 5FXRA 2WMWA 4BR3A 4CEGA 4PF4A 4XLVA 4MVFA 4ZSGA 5DRBA 2ZV9A 2C0OA 3UIBA 1G8SA 3QQKA 3NLBA 3S3IA 3C0GA 2PWLA 4R7IA 3DAEA 5I4NA 3RBWA 2Z8CA 2YIRA 4ACCA 3FMMA 2BRGA 4F70A 4N70A 1J7UA 3O23A 4AA0A 4AZSA 3EJ1A 2XRUA 1OKVA 4A4LA 3DBCA 4L68A 1J3HA 5CI6A 4BCGA 2W17A 4C4GA 2F9GA 4FKGA 1B38A 3VN9A 2V22A 3V5JA 4DHFA 1XH7A 1FVVA 4FSYA 5ANOA 2C47A 4EH9A 3Q4ZA 2VV9A 4D5KA 1FBNA 4BDHA 4FA2A 2R9SA 4E3CA 2QVSE 4X21A 4YNOA 2HZIA 4QMZA 2ITOA 3ANRA 3NEWA 3QD0A 4O6EA 1ZLTA 4BCMA 3MVHA 4IZAA 4TRLA 4YZCA 4I94A 3FYJX 4CYJA 2AUHA 3OXIA 2R4BA 1ATPE 2XYUA 4O27B 4ACGA 4XOYA 5FEEA 4S31A 3D14A 4FV6A 4YC6A 3VUTA 3PE2A 4UMRA 2CKOA 2YA9A 3QU0A 2HWPA 4FTNA 3VS4A 4EHEA 5J7BA 2PU8A 5EW3A 3WF7A 3PLSA 4WSQA 4KUJA 4QMSA 3AC1A 4MF1A 3Q4UA 2BPMA 5HO6A 4QO9A 3LFNA 1CKJA 2BZHB 1FVRA 4FIIA 4L42A 4FUYA 4MXZA 5CVGA 5GJGA 2R7BA 3GCUA 3UGCA 4ANBA 5EM6A 4E8AA 2W96B 3CXWA 4CKJA 5D12A 4IVAA 3VUGA 3ZLXA 4DTAA 1WMKA 2UZEA 4QQCA 2XK6A 3CC6A 3MDYA 4HYIA 2GNGA 2O64A 3F3TA 3AGMA 3GP0A 2A4LA 4J95A 3SXRA 3UJGA 3DXPA 1OL5A 3MGYA 2ZB1A 5CT7A 2J51A 1WBOA 2JLDA 2VWXA 4CKRA 3H9FA 4H3PA 2VTAA 4XMOA 4QMLA 5ANKA 3UBDA 2BAQA 3LCSA 4MYGA 1REKA 1YI6A 5DA3A 4FT0A 3DXNA 3MN3A 3OROA 4FUXA 4FZ7A 2OH4A 3BGQA 5AP1A 4F0FA 2RFDA 3JR1A 1H25A 1ZZLA 4F63A 3GCQA 3UG1A 1OUKA 5D1JA 4ZSLA 4BI1A 3FY0A 4NM5A 2IPXA 4AU8A 5JGDA 1M14A 2WTVA 3VC4A 3ZSHA 1YWVA 4LRKA 5EI6A 2ZYBA 3EQPA 4C58A 3QGWA 4TWCA 3ZM9A 3ACJA 2X9EA 4WNPA 2WQMA 4UY9A 4FT3A 3R9RA 3A62A 4QYEA 2YM6A 3BKBA 4GUBA 5AP6A 2C68A 3GNIB 4K8AA 3I5ZA 3W1FA 2Z7RA 4FTCA 4EUUA 3RK5A 4MWIA 4O0SA 4QTBA 4WBOA 3GC8A 5JN2A 4FTJA 4I6FA 3LQ3A 4EZ7A 3Q96A 5JMSA 2B52A 4PPBA 5FLFA 4ZSAA 4QP7A 4BY9E 3DB8A 4QRCA 1F5QA 2HW6A 3R1NA 4M69B 4G6OA 5E1SA 3VRYA 4F1TA 2PZPA 3I0QA 2BZIB 2XJ2A 4UX9A 3WILA 2PVFA 4E5AX 3A99A 2VX1A 4DG2E 1Q62A 2QOLA 3TUCA 2C1AA 3MS9A 2O63A 3D2KA 3ORZA 4DFUA 3E88A 2KTYA 1OPLA 1YVJA 3KKVA 3SC1A 4EHGA 4RA4A 1E1XA 3TZ7A 4QTAA 3EB0A 5CI7A 4UXQA 3VF8A 4FKTA 2WTKC 4A06A 4OTWA 1T46A 3HP2A 4ZTLA 5F94A 3LJ0A 2O8YA 3UVRA 4ASEA 2ZV2A 3E63A 4TZRA 3UYTA 3GU5A 4YJSA 4KD1A 2BMCA 1WVYA 2E9PA 2WMTA 4RLKA 3TI1A 3E3BX 4YO6A 1GZ8A 5L6WL 5IDNA 1H28A 3DU8A 4FV3A 4BICA 5L2WA 1VYZA 3OTVA 3EN6A 4C4FA 2WIPA 5CVHA 3FZTA 2W1DA 2W1GA 3CE3A 4YGAA 5AV4A 3UIMA 1OBGA 4A7CA 3MBLA 5E8YA 3ATTA 3KGAA 3UP2A 3VRZA 4DFYA 5EH0A 4FV5A 4MXCA 5C03A 4AT4A 3UOKA 3LOKA 1OIQA 4ALUA 5B0XA 4KS8A 3U9NA 4DH5A 3OY1A 1H1SA 3DAJA 3QL8A 5CT0A 4DFXE 2BFYA 4X7QA 5AV0A 3GCSA 1M52A 2YLEA 2Z7LA 3LM0A 3QBNA 4ID7A 3R2YA 3PA4A 2I40A 5DEYA 4L45A 5AA9A 3E8CA 1XR1A 1BL6A 3KRRA 5C4LA 1IA8A 1CMKE 3F3WA 3L1SA 3Q2JA 4JDHA 5K5NA 4XG8A 4FZFB 4PTCA 5A4QA 3RPYA 2JITA 3BEGA 5C27A 4OT6A 1GZOA 3P9JA 3AGLA 5KO1A 4PRJA 4PNKA 2E9UA 3QCQA 3A7GA 2XM9A 5ETIA 4O7YA 3LVPA 1PYXA 5JKGA 4LRMA 4LUEA 2PVYA 3Q9YA 4ARKA 4ERWA 4QP3A 3TNWA 3O71A 3ZEPA 4GK4A 3BCEA 3HMOA 1Q8WA 3D7TB 5FP6A 4PTEA 4C36A 4M0ZA 2WOUA 3UVPA 1Y91A 4DEAA 4EH5A 3JUHA 4NUSA 5HZNA 4HVIA 2QQ7A 2UZWE 3AC8A 4M69A 2R3NA 2EWAA 5M06A 2IW8A 3T8OA 3H9RA 2UVYA 4O91A 1Z5MA 3PXQA 5CZHA 3F6XA 5AMNA 2J0LA 2B0QA 4CZTA 1OM1A 5JT2A 2QI8A 3O8UA 4FT9A 4CYIA 4O7ZA 4O81A 2YITA 2JAVA 3FV8A 3PJCA 4G3DA 4YHJA 5E8SA 4MNEB 2W1CA 3R1QA 4ACHA 4H05A 3BHVA 4FKWA 5BUIA 3SW4A 4YNEA 5HIDA 4QOXA 4EEVA 1UNHA 3DQXA 5ETFA 3QTUA 3HDMA 5CALA 3PTGA 3Q5ZA 4OBQA 4IVBA 3ACKA 3OMVA 3TKHA 5J5SA 3F88A 3I1AA 5LVLA 3PJ8A 5A4LA 4ZMFA 3R1YA 4NM0A 2P2HA 2QU6A 2W7XA 5AM7A 5BVDA 5AIRA 4Z7HA 4CG9A 4F7NA 3ODZX 5HBJA 3I6UA 2EU9A 5TF9A 2GQSA 3PXYA 2NNWB 2CCIA 4S30A 5DGZA 3RINA 3ZC5A 1XWSA 2ZDTA 3L8SA 1YDRE 4FIHA 1ZOHA 2BRHA 2V7AA 4BTJA 4HW7A 3QGYA 4M12A 4HVGA 5E9EA 4ITHA 3EKNA 4XV9A 5AIKA 5I3RA 3D5UA 3R0TA 4P5ZA 5CASA 2W4KA 4G16A 3PWYA 2VTHA 2XP2A 1YWRA 2QODA 3N9XA 3QC4A 3QTQA 4PP9A 4CLIA 2BDWA 4EHVA 5A54A 3PZEA 3C0HA 3DKGA 2QOFA 5DPVA 3WBLA 4BIBA 3OWJA 4USFA 2PVJA 3MSSA 4JBPA 4FVQA 3QRIA 3S95A 4BZNA 4YZDA 4F6SA 2QCSA 3BE9A 1DAWA 3QQLA 2J5FA 2QC6A 2CGVA 5KMIA 4L6QA 3RAIA 3W32A 1BLXA 1E1VA 4CQEA 3ZO4A 3C1XA 2B9HA 2WHBA 4WA9A 4C3FA 5IQAA 1YXXA 4L00A 5IEXA 4C62A 4FKPA 2PZRA 1JKLA 5CAQA 4FICA 5HBEA 2RG6A 5KMNA 5KX8A 5ACBC 2J50A 4UMQA 3LAUA 2UW6A 4FTQA 3NRMA 5C9CA 4D4YA 3DAKA 3QWKA 3D7TA 4JRNA 3ZUTA 3KXNA 2IZRA 3ODYX 3IONA 5AR8A 4O7WA 4GK3A 4A9TA 3LMHA 1J7IA 3TIZA 2C3KA 2WMSA 3OF0A 2UZOA 4RWIA 3ZH8A 3L9LA 2E9OA 4O7NA 3A2CA 2XMYA 3C13A 3F9NA 4JG7A 3UZTA 3U6HA 1H26A 5BVOA 4R77A 4CQGA 4O86A 4EOSA 4C3RA 5F9EA 4QNAA 2I7QA 5I9XA 4JOAA 4FEUA 3G2FA 3ORKA 4FTIA 4EUTA 3UZRA 2X7OA 5FXSA 4D9UA 4KRCA 4OT5A 5IQEA 2R5TA 4Q5EA 4MNEA 1SNXA 2PMLX 3PXZA 2PL0A 1O6KA 2RFSA 4IZ5A 4TNDA 4EKKA 4IIRA 3II5A 4U97A 4Q2AA 4AE9A 1SM2A 2BILB 3KRWA 4FGBA 2CHLA 4BDEA 4DTBA 4TWPA 5E1EA 2YDIA 3L8PA 1SNUA 3GBZA 3I7BA 4RBLA 4CRLA 2CLXA 3AT3A 5FUTA 2YZAA 4RVKA 2WU6A 5IA5A 4I20A 3E8DA 4IB1A 4C35A 2GCDA 4WHZA 3PDTA 3KVWA 4AZVA 2G9XA 3VUMA 1VR2A 3P86A 2XS0A 3UOHA 4QPMA 5J95A 4EONA 1IA9A 4PDYA 3FL5A 1B6CB 4D0WA 1Q4LA 1H24A 5DT0A 4OUCA 3FLSA 5IZFA 2ITWA 5D7VA 4EOOA 2C3IB 2WMXA 4ZY5A 3U4UA 3KREA 4CXAA 1PKGA 1H00A 3IECA 1NXKA 4W8DA 1OITA 3LFAA 2UZBA 3BYMA 3KN6A 2YM7A 4I21A 3WF5A 5LOHA 4O84A 3BIZA 4I0SA 2PVRA 5G1XA 3ZSIA 4DN5A 5AP3A 5BYYA 2YJSA 3QA0A 4LQMA 2JKMA 5F4NA 4ITIA 3F5PA 3RK7A 3BHYA 2IW6A 2Y7JA 4YBKA 5HU9A 2W9FB 4EORA 4ZZOA 4MQ2A 5HD7A 3OW3A 4RVLA 2W4OA 4GUEA 4G9RA 5K4IA 3LKMA 4DGLC 5E91A 1OB3A 2C6LA 3UG2A 2XK8A 3RNYA 3MFRA 3UC3A 1SVHA 4NCTC 5FDXA 4O96A 4FZAB 4FSMA 3ORIA 5M08A 5AR5A 5IPJA 4A9UA 3DKOA 3MH1A 3P7CA 3GFEA 3JVSA 2XK7A 3QCYA 3EOCA 2O2UA 2KULA 2V5QA 5B2KA 3ZC6A 4AFJA 4F9BA 4DEEA 1JKTA 3I4BA 3O96A 4IB0A 2Q0BA 1L8TA 2CNUA 4MH7A 2WEIA 3QF9A 3QTSA 5AV2A 1STCE 3R02A 2PULA 4DLJA 4LFIA 2W0JA 5CY3A 2HXLA 3LQ8A 3F2RA 2VGOA 3DBDA 2UW3A 5HE2A 3E8EA 4FGRA 4R6VA 3SOAA 3QLGA 3HMPA 4RWLA 1XBCA 2ETRA 5AJQA 3ZONA 2CLQA 5C1QB 1ZWSA 3VW6A 3DFCB 4CCBA 2CKPA 1ZYLA 2X2MA 4WG4A 4Y73A 4U3ZA 3ZLWA 4PQNA 5EHLA 1ZYDA 2W1ZA 5A9UA 3OS3A 4PUZA 1OKZA 3TZMA 4NK9A 5LQFA 3LCOA 4FKLA 2GHLA 2VZ6A 3N51A 1PXOA 4XG7A 4I93A 2XIZA 4GU9A 3IDCA 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