3OTVA

Crystal structure of the intracellular domain of rv3910 from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
VQLVPGARIANGRYRLLIFHGGVPPLQFWQALDTALDRQVALTFVDPQGVLPDDVLQETLSRTLRLSRIDKPGVARVLDVVHTRAGGLVVAEWIRGGSLQEVADTSPSPVGAIRAMQSLAAAADAAHRAGVALSIDHPSRVRVSIDGDVVLAYPATMPDANPQDDIRGIGASLYALLVNRWPLPEAGVRSGLAPAERDTAGQPIEPADIDRDIPFQISAVAARSVQGDGGIRSASTLLNLMQQATAVADRTEVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A phosphorylated pseudokinase complex controls cell wall synthesis in mycobacteria
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords PROBABLE CONSERVED TRANSMEMBRANE PROTEIN
total genus 70
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-09-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3otvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3otvA01
4D2PA 4TYHB 3EYHA 3SOCA 4LMUA 5HO6A 3MB7A 3LAUA 4L9IA 4G5PA 3HRFA 3CS9A 2XB7A 5JH6A 4M15A 3DXNA 2VZ6A 3PPZA 4YC6A 3U9CA 4J8MA 3THBA 4GS6A 2ZYBA 3KXNA 1O6YA 4WUAA 3EFKA 4AN3A 3Q2MA 1ZY4A 2AYPA 2V7AA 3ACJA 4MXAA 4XLVA 4WA9A 1YWVA 5EW3A 4ZMEA 2UUEA 3ZBFA 4FKSA 1WVYA 5AADA 2RSVA 3BGPA 3S2PA 3VUIA 2V22A 5FP5A 4Y5QA 4X21A 2BPMA 4RT7A 5BVDA 5HD4A 2HZ0A 3C4XA 4FKIA 3PIYA 5ANIA 2YIWA 4O1OA 3RWQA 5BPYA 2Y8OA 4CD0A 1X8BA 5EI2A 3IDCA 2HW6A 4QPAA 3VUMA 4D5KA 2QLQA 5HG5A 5AUVA 5BVKA 4IM0A 1YI3A 2C5VA 2OK1A 3FQHA 4WBBB 1WVWA 2IW6A 4GG5A 4QTBA 4BDGA 4DBXA 2IW8A 2YJSA 1Z57A 4FTTA 2CLXA 4HVHA 3EQDA 3VNTA 3FL5A 1GOLA 1PMVA 4HGEA 5E9EA 3UOKA 3QTWA 2FA2A 3R63A 1UV5A 4XV3A 3RPYA 3WF5A 5HVKA 3V01A 4IDVA 4BTJA 5D41A 4LL0A 3VVHA 4USEA 5G6VA 5BVWA 4JX3A 2B1PA 4TKSA 4LOQA 4M14A 2YISA 1H00A 2XNEA 3GC7A 4FIHA 4GU9A 4HYUA 3E3PA 5FDXA 5BMMA 4BHZA 5M44A 3LJ1A 3DDQA 1H8FA 2OJFE 5D7AA 1NT2A 4MD8E 5HU3A 3CR0A 5IPJA 4MK0A 3ETAA 4BDEA 5L6PA 3KC3A 5AR4A 3K3IA 4IAZA 3O23A 2OIQA 2JAMA 3VUDA 3VS3A 3RGFA 1GIHA 3WYXA 4BWXA 4X3JA 1ZYJA 3KU2A 4Y85A 3RJCA 3LCDA 3NSZA 4BCPA 3LM0A 4QP4A 3UZTA 4G9RA 4CKIA 1VYZA 2A2AA 3CGFA 3RI1A 1IR3A 2FB8A 4BICA 3NRMA 3QTZA 1LEZA 1I09A 2XYNA 3HV5A 1U54B 4AP7A 3DTWA 4FBXA 3ZM9A 3RPSA 2ITVA 1XJDA 3EN5A 3EYGA 2GMXA 2ZM3A 3R04A 5DR9A 2HY81 4DYMA 3EHAA 2HW7A 2NP8A 3IQ7A 4PL3A 4Y72A 4U42A 5ANOA 2X8DA 3AD5A 3H30A 1YDRE 4FKLA 4L67A 3NW5A 4ZY4A 2XJ0A 4XOYA 1G8SA 2ETRA 3FMMA 5FXSA 2QO2A 2HXLA 4ZK5A 3V5TA 4PP7A 3UMXA 2WTCA 3QGYA 1VJYA 2QOOA 4ZTHA 2W1HA 2BDFA 5HBJA 1Y6BA 3F3UA 3EKKA 4NK9A 5JFVA 5HKMA 5BQ0A 3BU6A 1OIYA 3BYUA 4LM5A 4RVLA 1Y6AA 4E6AA 3T9TA 3DK6A 3W18A 5BNJA 4HZSA 3DK3A 2BFYA 3KRLA 1F0QA 4BDHA 4AT5A 4M7IA 4D1SA 4GEOA 4HVDA 2VWZA 5EG3A 4PWNA 4KSPA 4RJ7A 2C0IA 2BFXA 4DH5A 5HU9A 3RK7A 4BDCA 2X9EA 3CD3A 4GL9A 4TWOA 3P4KA 3C50A 4PX6A 5J8IA 3W2QA 3KMWA 2RGPA 1PKGA 1R78A 1WFCA 3RKBA 4ACHA 4ANNA 1TQIA 3QALE 2EB2A 4CRSA 1BI8A 4NJ3A 2LAVA 4AAAA 3I7BA 3JVSA 4IE9A 4ZAUA 5HTBA 3FUPA 4FEXA 3I79A 4XV2A 4RJ8A 3FZTA 2JD5A 4MNEB 1OL2A 4FZDB 4QMZA 5C27A 4K33A 5CTPA 1YWRA 5CAUA 4YHJA 3VULA 4A07A 3LLAA 2O8YA 2YM3A 4FTAA 4G3EA 5AV3A 3RWPA 4IJPA 5FEEA 4WNOA 4IWQA 4WOVA 2WQEA 3DTCA 2GCDA 3D7TA 4M97A 3E5AA 5ETAA 2ZMDA 4O2ZA 5IQGA 2UZUE 4J8NA 4IANA 2R3NA 4QMSA 2Z7LA 1H4LA 1TQMA 5AM6A 4CKJA 4KUJA 4MYGA 5AA9A 4FYOA 2OFUA 1Q62A 2CLQA 3MBLA 4B7TA 5HD7A 3DPKA 2YM7A 3PJ3A 3FSKA 2JIUA 4B8LA 1HCLA 3O0GA 3VQUA 1KSWA 4O0YA 3WZDA 5LWNA 1P4FA 5CXHA 5CU0A 1PF8A 4R7IA 4EWQA 4FE2A 5LMKC 4FNXA 2GS6A 3R9DA 5CAOA 2J90A 1F5QA 3T8OA 2Q0BA 4L7SA 3GXLA 4RJ6A 4A9RA 4KABA 2YIRA 5C8KA 3G51A 3ZM4A 4C4JA 1YHSA 2CCHA 5HE3A 4IVDA 5FM2A 5LMBA 1PXKA 4ORKA 4JBQA 4L8MA 3OCTA 4IW0A 4BBMA 1Q97A 3TZ7A 2HK5A 4EC9A 4TWNA 3FXWA 3QTSA 3HRBA 4BCIA 2AC5A 3DU8A 4MWHA 1LR4A 3G0EA 3NIEA 3PXZA 4JLCA 2GHLA 5HO8A 2BILB 3VF9A 4F6WA 4J99A 5HEZA 3NIZA 5M51A 2VO0A 5H9BA 1QPEA 3VF8A 2OF2A 3FKLA 4GK3A 4AXAA 2RF9A 3ZBXA 4I41A 3SXFA 1MUOA 2GHGA 3C4CA 3C4ZA 2C4GA 3FPMA 3Q3BA 4I5MA 5J5SA 1ZOHA 2ZAZA 3LIJA 5ACKA 3ORNA 4QMMA 5DT0A 1M2PA 3UOHA 4QTAA 4YLKA 3R1YA 4QYYA 4DFNA 5ANGA 4OTPA 4ZJIA 4EK3A 2ZDTA 3BBWA 3G0FA 4FIJA 3A7HA 2RKUA 3WIKA 1OUYA 3HMIA 3BX5A 4Z3VA 3U54A 3FMLA 2Z02A 5KHXA 1Q61A 5I9XA 3QCYA 2VTTA 5A14A 4FV9A 3AC8A 3PY1A 1DM2A 4M69B 4A9SA 4EH7A 2XK9A 4B9DA 2VGPA 4BTKA 4MH7A 3SLSA 4CCUA 3A8WA 1JPAA 4OTFA 3M2WA 5EHLA 3WZEA 1ZYLA 3CTHA 3K5VA 3UP7A 3BYVA 1KV2A 3I0OA 3NUPA 4OTQA 4EJNA 3EQPA 4XG7A 5CANA 2IO6A 3UIXA 4XS2A 4DGOA 4EBVA 1UWJA 4W4VA 1KE9A 1WCCA 2PMIA 4XV1A 4BKYA 1KV1A 5KCVA 3O71A 4JBOA 4XH6A 2FSLX 4GK4A 4KBKA 5ANJA 3MPTA 3MH0A 2XA4A 4KIPA 1MRYA 3HMOA 4FV5A 2XMYA 4MKCA 1FINA 5CENA 1E9HA 4BFMA 2GSFA 2ZB0A 4HYHA 1E1VA 2GNLA 2IN6A 5KKRB 1Y57A 4X6QC 4L3LA 2YACA 3ENMA 1Q24A 2IJMA 3BQCA 3F5XA 5HLNA 4I5PA 4RIWA 2GNFA 2BAKA 4K18A 3ORXA 4AA0A 4RSSA 4FK3A 3RAHA 4FSNA 3MY5A 5C03A 5E8WA 3Q9YA 5M09A 2J0IA 5BMSA 4O7SA 4IM3A 3AOXA 4YUQA 2YCRA 2YIXA 5EYMA 2YCSA 4HPTE 4LOPA 1FVRA 1XR1A 5M4UA 2C6MA 2V5QA 3ZHPC 4BI0A 2PVKA 1Y8YA 2R0IA 3OUKA 3ZTXA 4CTCA 2JDOA 4RVMA 3ULIA 4TZRA 2Z7SA 3EWHA 3F2RA 2GNJA 3NGAA 3QQKA 4FIEA 3VHEA 2Z2WA 3FLSA 3KCKA 3C51A 2UZTA 4FV1A 3ALNA 4D4VA 3OF0A 4RIWB 2J4ZA 4UWBA 5E4HA 4QP2A 3OCSA 1UU3A 4U44A 1WBWA 4UX9A 3HZTA 3DKCA 4ZS4A 3K3JA 1V0OA 2E9VA 5AX9A 3HUBA 1SVGA 3O7LB 5GZ9A 5IA5A 4ERWA 3RK9A 4FV6A 3PG3A 5T68A 4L3PA 2X6EA 1PJKA 4LUDA 4ZTMA 5C26A 3GQLA 4FTLA 2I40A 3BCEA 1H1SA 2WOTA 4FSWA 4UWCA 5DG5A 2JDSA 5FBNC 5AUYA 5KE0A 5DMZA 4IACA 4JG8A 3II5A 3OW3A 4FUXA 4YZNA 3D94A 4HPUE 5HCYA 3O51A 4EOOA 4FEQA 3KMUA 5JT2A 2PULA 4DFUA 3NVKI 4YZMA 2W1ZA 2YCQA 5CVFA 5CSPA 3HMMA 2Y9QA 2VTAA 3QQJA 3D5XA 5AR7A 5KBQA 2P33A 1BL6A 5EDQA 3FLWA 4M66A 4ZTQA 3QA0A 5ICPA 2ITNA 3B8QA 3QFVA 1H0WA 1OB3A 3LXNA 5HE1A 4UMPA 2I0HA 2R3FA 4K11A 2OLCA 4BCMA 4M84A 4F6SA 3CEKA 1OKWA 2YM6A 3FYJX 2CPKE 2QOKA 3FY0A 3HUCA 1ZMUA 3OROA 3PY3A 2WMUA 2A27A 4JDHA 2YZAA 5HESA 2QCSA 4DT9A 2QO7A 3POZA 3PXKA 4L45A 4PMSA 2JKKA 3ZO2A 4AN9A 2QU5A 4RX8A 2RL5A 2Y4IB 4C37A 5BYZA 2EU9A 4CCBA 5LQFA 4YPDA 5KMLA 3A7FA 1NVRA 5JFWA 3R0TA 2BIKB 5AIRA 1STCE 4NTTA 3TKHA 2J6MA 2BDWA 5IQHA 3IO7A 4UMTA 3PZEA 4Z7HA 1RJBA 3MV5A 4ALUA 1J7UA 3ITZA 4KAOA 1QL6A 2F49A 2OO8X 2ITTA 1BUHA 2KULA 2VNYA 3FHIA 3C1XA 2WHBA 2W4OA 3G9NA 4J98A 4AS0A 1M17A 4HOKA 3V6SA 4XX9A 2XK3A 4IADA 4QTDA 5CVGA 2OJJA 3H9FA 2X4ZA 3RHKA 1U5QA 2C5XA 3REPA 5BVFA 4EJ7A 4GYGA 4RLKA 4D55A 1KE8A 2XIZA 5KKRC 3QQLA 4DGLC 3LFEA 4QMYA 4E5WA 1Z5MA 5AA8A 2F7XE 3LJ0A 4R8QA 4C38A 3CTQA 1JKKA 3UNKA 2HWPA 3EB0A 2FUMA 2X7GA 4PTCA 3HL7A 3EN4A 3OHTA 5J5TA 3WZUA 3G5DA 5JEBA 1XKKA 3NAYA 4IB1A 4DFBA 1U4DA 4CFMA 3OT8A 4YSMA 4JI9A 2OZOA 1G8AA 4B0GA 4RA4A 2WTVA 4C02A 4L00A 2FVDA 4O0XA 2W5HA 4GT4A 4ONAA 4O7NA 3KULA 2PE1A 3QX4A 4TT7A 3W8LA 2BHHA 2VTOA 2X4FA 3CJFA 3QF9A 4N0SA 5HBHA 3C4WA 3GT8A 2P2HA 3SC1A 3V5PA 5J7HA 4IWDA 3LFSA 4NFMA 3R83A 3FJQE 4F08A 1W82A 4CZTA 3MJ2A 3BGQA 3VJOA 1YHVA 5JRSA 2CSNA 4M12A 3AC2A 1XH6A 3FZPA 4NIFB 4YP8A 3CSVA 3HAVA 4FT3A 3NR9A 3RBWA 1BLXA 3TM0A 3KRXA 4JG6A 3V5QA 2CMWA 3HA8A 4NM7A 3SVVA 4AACA 4WSQA 3R1NA 3CKWA 3KULB 4O81A 3A62A 4EOPA 5HLWA 4O7RA 5B0XA 1BX6A 1W0XC 3D2KA 2A4LA 1H1QA 2X2MA 2VTMA 3A61A 4L53A 5CASA 5JGDA 1J7IA 2PUPA 2ZJWA 3QHWA 3AMYA 4KB8A 5AAEA 3MTLA 4I92A 3ZU7A 2O0UA 2HY0A 2XKCA 3LXKA 5D7VA 3SOAA 2CKPA 4I22A 3BYMA 2OXXA 4OTHA 2XEYA 4YZBA 3U6HA 5E91A 3GU6A 1CKPA 5A54A 1W84A 1B6CB 2V62A 3N4VA 4LQMA 4S2ZA 2ZV2A 1BYGA 4XLIA 5H8BA 4M67A 4GFOA 2YM8A 3PFQA 2UVZA 5M06A 5KMNA 2DWBA 3IOKA 3NYVA 3PWDA 4RIXA 4Z9LA 1CKJA 5LVPA 4EHEA 5ANKA 5D12A 5HX6A 3TCPA 1YQJA 1K2PA 3FC2A 4G3FA 5F9EA 2UW9A 4RX5A 1R0PA 4IMYA 1CKIA 3QUEA 3VS1A 3QX2A 2X2LA 3L1SA 1V0BA 5FM3A 1CSNA 3DT1A 3PA4A 3A4OX 2W0JA 3CY2A 2JKOA 4QP8A 4EKLA 3HDNA 5B2KA 2W1DA 3V5LA 4OBQA 2C5NA 2OZAB 4IX4A 4MCVA 2XK4A 5LCJA 3A2CA 3MVLA 5CLPA 4A9YA 2YJRA 4S34A 3JYAA 4WNKA 4O22A 1XH8A 4FG9A 2VTQA 4RZVA 3MPMA 3A99A 4DG0E 3UYSA 5BUIA 5CYIA 3OY3A 2X8EA 5CT0A 2WZJA 3MH2A 4YO6A 3RALA 3LQ3A 4IIRA 1DAWA 3BEGA 4E5AX 1J1BA 2CN5A 4FSYA 4USFA 4L6QA 3AXWA 4MX9A 2XNNA 1OKZA 4F1OA 3PG1A 4JOAA 4TTHB 4AGWA 5HG7A 4II5A 2XK6A 4LL5A 5EM8A 3RM6A 5EM6A 4YR8A 4BR3A 4EOLA 1YXXA 2B9IA 4GT3A 2HIWA 4CV8A 4C61A 4C59A 3EOCA 2WMSA 4PPBA 4UMUA 2CNVA 3BYOA 4W4XA 4ASDA 3VUGA 1OBGA 2BTRA 4DC2A 5LVLA 2R3JA 3Q04A 4QMPA 4TL0A 4EK6A 5GINE 1Q4LA 4V0GB 4E4XA 1R3CA 5GJFA 3W10A 2PTKA 3LM5A 2OSCA 4DH1A 3R9RA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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