3OXTA

Human camp-dependent protein kinase in complex with an inhibitor
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWESPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Fragment based drug design on PKA
rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2010-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3oxtA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3oxtA02
5TF9A 1JKLA 2YIQA 3HV7A 3FMEA 3NZ0A 5FTOA 3T9TA 3O8UA 4J95A 3QQKA 4RA4A 2Z7SA 3EN4A 3O51A 5AR2A 3E8NA 5LARA 3R7VA 1BMKA 2IVVA 2OXDA 3OXIA 3BYSA 3EQFA 2PVHA 3UVRA 4B8MA 2RG6A 1RJBA 3HP2A 4OGRA 3S2PA 4UWYA 2OH4A 3F7ZA 3TG1A 4E73A 3LCSA 5E8TA 4EK5A 1R0PA 2BTRA 2PK9A 2W4OA 4N6ZA 4LGGA 4Q2AA 3BU6A 5HO6A 4BDAA 4HVHA 2UVYA 4E3CA 1IR3A 2EB3A 4MEDA 5CVGA 2C5NA 4CD0A 4ZAUA 1O6YA 3MIYA 2J4ZA 4UN0C 1V1KA 1XH4A 3H0YA 3HRBA 4IBMA 3TKIA 5H9BA 4BI2A 4TZRA 3NYXA 2OGVA 4I6HA 5ETCA 5HD7A 2JFMA 3KA0A 2BRNA 1FVRA 5AR5A 5A9UA 4MWIA 5BVKA 2IZSA 2CNUA 4O7ZA 4DT8A 1YWVA 2E9OA 2FSTX 1JKKA 3G5DA 4MXYA 3VJOA 2XK4A 3QZGA 4YJSA 3ZLXA 4BR3A 5HG5A 1OVEA 3Q9ZA 5AAFA 3TT0A 3DFAA 1YXVA 4W4VA 2CKPA 3WBLA 5E90A 3FHRA 4EONA 5I4NA 2CDZA 4FV6A 3P08A 4ZZNA 3KK9A 3FHIA 2YM5A 3PSBA 1YWNA 2HXQA 4FSYA 3WF9A 3FL4A 3MH0A 3UNKA 2C3JA 3EHAA 4RQVA 1NY3A 1H01A 1V0OA 2C5XA 3OEZA 4KIOA 4O0RA 2UZNA 4KINA 1OIUA 3U9NA 4GUEA 2BROA 2VX3A 3FXZA 4AN3A 4QOXA 4X3FC 1OIQA 2B1PA 4H3BA 3RPYA 2PVRA 3UC4A 3QALE 4O0YA 4AXAA 2QG7A 5IQBA 2CN5A 2PU8A 4DN5A 1Q8TA 2QCSA 3P78A 5ANEA 2RF9A 1FQ1B 3DB6A 3NAXA 3AOXA 3COKA 4IVBA 3HA8A 3MA6A 2X9EA 2W1GA 2IPXA 3QRJA 3DFCB 5FEEA 1U5RA 4XX9A 4XYFA 2YDKA 4ZIMA 4F7JA 5CXZA 3I6UA 4YJRA 3FC1X 3MSSA 2OLCA 3ATTA 3GU7A 3N4UA 4O7RA 1WVYA 3D5VA 3CD3A 4YTHA 4UMQA 4KRDA 1GJOA 4JX3A 2JD5A 4QYFA 3MVHA 3HAMA 2B55A 4DGGA 4FKTA 4XRJA 3FLNC 4JG8A 4IE9A 3KC3A 3LCTA 4O7NA 5LQFA 3ZCLA 4YHJA 2VTRA 3SG8A 4FE2A 1SZMA 3M1SA 3DT1A 3JY0A 5J9ZA 4CVAA 2V22A 3ZSHA 4FV0A 5I9UA 4YJVA 4U44A 3BWFA 5AR3A 4BCJA 4D2TA 2F2UA 1H00A 3OY3A 5BVNA 4TYEA 2PUUA 3RAWA 3QQGA 4DEAA 4F6WA 3COIA 4YZBA 3R01A 1BL6A 3DBDA 5D9HA 2YISA 4M7IA 2AC5A 2X8DA 3R63A 4MNEB 5CU2A 3TV4A 1HCKA 3WOWA 3RCDA 2GNGA 2O64A 3HNGA 4AT4A 2XM8A 5AR7A 3F5GA 5FEDA 3ORPA 4E5AX 3NUAA 3NNWA 1M2RA 4CQEA 1WVXA 4GK3A 4FMQA 5GJGA 2YABA 3D9VA 3QTZA 1IASA 3NDMA 4R1VA 5CVFA 3KXNA 3MB6A 2IWIA 3OUKA 3R1QA 3UZTA 4M84A 1QPDA 2OIDA 3QXPA 3MJ2A 2Y8OA 3FUPA 3QTSA 3D5UA 5CENA 3GFEA 3SKCA 3SW4A 3ZLWA 3FQSA 2R7BA 3RHXA 5AFVA 4AZEA 4NTTA 4JDHA 4E8AA 4HVSA 4G3EA 1Q41A 2OJIA 3F3VA 3ZM4A 5GZ8A 2R3KA 3OWKA 2J2IB 3AC2A 3L9NA 3FI4A 4XMOA 4NW6A 3WIKA 3E8EA 3KRWA 3LXKA 1OL5A 4KABA 2VO3A 4FV9A 3DS6A 2WOTA 3AMYA 4ENYA 5DBXA 5BX0A 4UYNA 1Y6AA 4LI5A 4FT7A 4IM0A 4KIQA 5DI1A 3UO4A 4C36A 3S0OA 4BTJA 5HE1A 4E4XA 5IMEA 5BUJA 3PIYA 3FZPA 3OC1A 4IADA 2A4LA 1B39A 5FXSA 3MFRA 4K1BA 2WTCA 3NUXA 5F95A 2V5QA 2F4JA 5FRIA 2ZM3A 3BYOA 2YCRA 2XKCA 5LVOA 2IZRA 2C4GA 4A9SA 2Y4IB 4KAOA 4DE4A 3MFTA 1YWRA 4CQGA 3LFQA 2X6DA 4K11A 3VVHA 4UY9A 2OF2A 5TT7A 4U43A 4M68A 4ZMFA 5KMOA 5CVHA 2UZOA 3LMHA 3EN5A 4S30A 4MAOA 4PRJA 2XMYA 2BRHA 5A4TA 4JG6A 2ZV9A 4XV1A 5HG9A 3UG2A 1UNHA 2PPQA 4RPVA 4YC8A 3FSFA 2ITVA 3LXLA 4X6QC 3L9LA 3DZQA 4N57A 4OTHA 2QOIA 2ITUA 4RFZA 5GINE 4TTHB 4DLJA 2P2IA 5LMKA 2F49A 3SVVA 1OPJA 3MS9A 5L8JA 3EL8A 4S33A 4FSMA 5EYKA 3RM7A 4PUZA 3PIZA 5A14A 4JRVA 3U54A 4RFMA 3R71A 3FSKA 4ZOGA 3M2WA 4G9RA 4JBQA 4QP3A 4BDFA 1GZNA 1H25A 4F70A 5KBQA 5KMNA 2G01A 1Q8UA 5BVDA 5EOBA 5J95A 4USEA 3GXLA 5GJFA 3HX4A 4CV8A 4ZMEA 4V01A 4ZSAA 3DLZA 3KMWA 4FSTA 3HL7A 5I3OA 3MVMA 1OUKA 5HEZA 4IJPA 3ANQA 4GK4A 3R9RA 4UWBA 2PMLX 1FMOE 2QO2A 3Q53A 4BDCA 4GKHA 4ASZA 4DH8A 3QHWA 3ORNA 3VAPA 3ZOSA 1OIRA 5HU9A 3D5XA 1NA7A 5KX8A 3KRJA 2NP8A 2BKZA 3EN7A 4WIHA 5E8SA 5AX9A 5L6WL 5JSMA 1BUHA 2XM9A 2WTKB 4RVTA 2J5FA 2I0HA 1L3RE 2HY81 2R4BA 3I5NA 3IW7A 3QLFA 3GU5A 4FG7A 4JAJA 4IH8A 3OD6X 5CWZA 5ICPA 5M4UA 1W82A 4JG7A 4X21A 4OBOA 2XNPA 4FZ7A 5CF5A 3MH3A 5EK7A 4ENXA 2PZIA 1WBTA 4XRLA 4FYNA 4JBOA 5FM3A 4IB0A 3ALOA 1UU8A 3IPHA 3DY7A 4HGLA 5LMBA 2VX1A 1H4LA 3KVXA 4F09A 4JBVA 4UX9A 2C3LA 3DKCA 3UYSA 3AC1A 4FZFB 2QO7A 4DFLA 2JKOA 4JAIA 1P4OA 3G15A 4MD7E 2QHMA 4JIAA 2UW9A 2JKMA 4X0MA 1NVSA 2WKMA 1REKA 2PYWA 3Q4TA 3NSZA 2O3PA 4TYIA 4GG5A 2HENA 4O21A 4ZSJA 4BBFA 2J51A 3WZJA 3NYVA 4WNMA 3HMIA 3W55A 3C9WA 3FMMA 4TWPA 3F3WA 3RAIA 4A4LA 4AE6A 3REPA 3R0TA 1NW1A 3GCPA 2C47A 3LJ0A 4GYIA 2J90A 5HE2A 3A99A 2DYLA 4F1OA 4DGNA 4G1WA 2W99B 3ZRLA 2DQ7X 3LXNA 4ARKA 3PXFA 4CKRA 4BI1A 2QOHA 3F7WA 1EH4A 4RGJA 5A46A 2G9XA 1URWA 3KMMA 3BX5A 2HWPA 3V5LA 3O8TA 5FDPA 3CBLA 3TZ8A 4O83A 1YDSE 2VTIA 1T45A 3TI1A 1PXMA 4FNWA 4IX3A 4BN1A 2IW8A 4E7WA 3W18A 2BAKA 2OFUA 1M14A 4L53A 5F4NA 4FTMA 2BHEA 2NRYA 4F63A 2OKRA 2GFSA 4FNXA 5EOLA 4X7QA 3SXFA 5IDPA 5ITAA 1U59A 3GC7A 1VR2A 4RJ3A 4XLVA 4ZSEA 4AS0A 1XH7A 2PUNA 1H27A 4FTKA 5HVJA 5AADA 3GOKA 2YAKA 4D9UA 1JOWB 4GIIA 4YSMA 5EHYA 5HLNA 2XEYA 2C68A 3UJGA 4DTKA 5CEOA 2BVAA 3AGMA 3KMUA 4PTCA 4Y95A 4O0VA 1V0PA 1U46A 2UZUE 1P5EA 4RWIA 4HGSA 2LGCA 2RIOA 4KIKB 3MV5A 4O7LA 1ZYSA 3E62A 4XV2A 1W84A 2QHNA 4DA5A 4CT2A 4D4SA 3G0EA 4LL0A 4NK9A 3KRLA 3L9PA 5HIEA 3OBJA 4FYOA 3RPVA 5C1QB 3PWYA 3MY1A 5GNKA 3ET7A 1W83A 3W2SA 2VX0A 3DCVA 3TTJA 3O8PA 4BTFA 4F0FA 1OECA 2XKEA 2XCKA 4BCFA 5EM5A 3DDQA 1O9UA 4B7TA 2CMWA 2C6OA 4L44A 2SRCA 3E87A 5CI7A 5AP7A 3PG1A 4G9CA 5M4FA 3DV3A 2W1CA 5DT3A 5EKOA 3DBQA 4BZOA 4X2GA 3V6SA 4U6RA 5IF1A 4ANBA 1ZY4A 3E3BX 5E8WA 4ITHA 1OIYA 2ITZA 5L8KA 5C8KA 4FT3A 3O7LD 1F0QA 3P4KA 4UMRA 1PMEA 4H58A 3MI9A 3N51A 4LFIA 4CFXA 4I5PA 5DT4A 3EN9A 5HE0A 3FMDA 3BV3A 4BZDA 3NNVA 2I0VA 2OXXA 4GRBA 3CP9A 3GENA 2WELA 2XB7A 2ZOQA 1YXTA 4PMPA 3DNDA 4MHAA 5ANGA 4QQCA 4RJ8A 2GNFA 3DJ7A 2PE0A 2ERZE 3ZC5A 4XS2A 1YI3A 2OIQA 3I79A 2C6LA 3EFWA 3VS6A 4KRCA 4KSQA 4MH7A 3Q2JA 4MBLA 5AX3A 2YCQA 2OU7A 3QRIA 2IVTA 4XG3A 4FKLA 3VQHA 5AUYA 2GHMA 5GIPE 4YJQA 3BIZA 3PA3A 4CMOA 5L2SA 3O2MA 4BGHA 4KBAA 1KUTA 5D7VA 2OBJA 1Q3WA 4D1XA 3C4FA 5FUTA 4I23A 4R5SA 1BL7A 4A7CA 2J0KA 4JDIA 4GIHA 5EW8A 4BWPA 4M69B 4D55A 1UNGA 4O1OA 1MRVA 1FMKA 1YVJA 2ITQA 4GT3A 3QQLA 1J7LA 4IAIA 4K18A 4MF0A 3UQFA 4B0GA 3SA0A 4QMZA 4FEXA 4BDJA 4RWJA 4LGHA 3P0MA 4F6UA 4EH7A 5AMNA 4BCIA 4I6BA 4PNIA 4E4MA 2XF0A 4FI1A 4DT9A 3OROA 4KA3A 5C8NA 4MXOA 2VO0A 2FVDA 2UW6A 2WMTA 3G51A 3NYOA 3NCZA 3EZVA 3IW6A 4ZZOA 3UPXA 4M66A 3PDTA 5AR4A 5HNIX 4I6FA 4NU1A 1ZOGA 4RJ4A 2WTIA 3N4VA 3EQRA 4G17A 2YLFA 2GTMA 1YHWA 4FKJA 3RZBA 3WIGA 3CSVA 5AP0A 4L7SA 5A4EA 4TNDA 5D11A 4FK3A 4PPBA 2W9FB 4EHEA 3KN5A 3LCDA 3P7CA 5AIKA 3UG1A 4BGGA 4EHZA 1FBNA 2PMIA 3FPQA 1XH8A 2W4KA 4EBVA 3OP5A 2LAVA 4FIEA 2YDJA 2B0QA 2F2CB 4FV4A 2B54A 3ZXZA 4FGBA 3HMMA 5DR6A 3GU4A 5AUWA 3SXSA 3A7FA 2YM3A 1MRYA 3DBEA 1OKZA 4OR5A 3EKKA 4FSWA 2YZLA 2RL5A 3RWPA 5HTIA 3IOKA 4CYIA 2O63A 1BI8A 2UUEA 1PMNA 3MDYA 3OVVA 3QA8A 2WHBA 3D14A 3I1AA 3NW6A 2AYPA 1CM8A 3BYVA 5AP6A 1K2PA 3W10A 4AWIA 3W8LA 1OBDA 4J52A 3JYAA 4DFZE 1H1SA 2JITA 3MN3A 4Q5EA 2C69A 3R83A 3A2CA 4XCUA 5EYCA 3QGWA 4ZJVA 3GBZA 1YXUA 3QWJA 4GKIA 4ASDA 3Q5IA 4HYSA 2XBJA 3GU8A 3R1SA 3D2KA 3GOPA 4ZTLA 4AAAA 3HMNA 3R00A 4OLIA 4FKWA 3VN9A 4O7TA 5IQIA 2EXMA 4ORKA 4F9CA 4IAFA 4GVAA 3ORIA 2R3PA 3OS3A 4Z16A 4X2KA 3LM5A 4TPTA 2VWWA 2XNOA 2A19B 4FBXA 2CLXA 4ONAA 4J53A 3KCKA 4Z3VA 4MXXA 1K3AA 3PJ2A 3KU2A 4TWCA 4FA2A 2VO7A 5I0BA 3FZSA 3BHYA 2XZSA 3DLSA 3ORXA 4IFGA 4AQCA 5AAGA 4K6ZA 4E6AA 1ZY5A 4CFUA 2C3IB 3QU0A 4QYHA 5FXQA 3DKOA 5FLFA 4DEEA 4YO4A 3OWJA 4O2ZA 2JLDA 2IZUA 2VWUA 2W96B 3D15A 3ORZA 4RWLA 4BVUA 3PXKA 4QQJA 2HW7A 2X4FA 3FPMA 1WBOA 4NJDA 4O7SA 5HLWA 5HG7A 4EKLA 4GK2A 1FOTA 4BDHA 4WO5A 3DXNA 4BB4A 4I1ZA 1TQIA 2Y6MA 3AG9A 4TY1A 3V04A 4GL9A 2ZJWA 3CTQA 4PPCA 4CYJA 4AZVA 1UNLA 3W16A 3CPCA 3PVBA 1PHKA 1ZOHA 3QF9A 5A4CA 1FVTA 3CJFA 3C4ZA 4OTQA 5CSXA 1H8FA 3TNIA 5K0XA 4XP0A 4CG8A 1XKKA 4MWHA 4EOIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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