3PP1A

Crystal structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (mek 1) in complex with ligand and mgatp
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
322
structure length
291
Chain Sequence
MELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of TAK-733, a potent and selective MEK allosteric site inhibitor for the treatment of cancer.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
total genus 84
structure length 291
sequence length 322
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2010-11-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pp1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pp1A01
4M66A 4I0RA 4Z9LA 3BBTB 4JQ7A 3IO7A 2F7EE 2QOBA 5CWZA 4NFNA 4UYAA 3A7GA 4FKTA 3HL7A 4FEVA 4GT5A 5GJFA 4CCUA 1Q5KA 3ZM9A 4U5JA 4QYFA 5ACKA 3HMNA 4GS6A 2CN5A 3GBZA 5HIDA 3ZBXA 2P2HA 1F0QA 2CNVA 1NT2A 3RCDA 2WMRA 3COKA 5BVWA 4X6RA 2HK5A 3VW8A 4EH6A 2OICA 4RA4A 4J97A 5IQFA 5H8EA 3RVGA 3UIMA 3ZEPA 2C5OA 1PXIA 3LZBA 4E6DA 4F1TA 5BVNA 5CEPA 4IX6A 5M56A 3NAYA 4O82A 3E7OA 4IM0A 2X9EA 3H9RA 3TCPA 3JY9A 4YSJA 4YBKA 4Y83A 3R1QA 3R8ZA 3AGLA 4QMWA 5E8ZA 5DEYA 2RF9A 5HCXA 4WNMA 3L8XA 5BVDA 3KXMA 4FIIA 1FOTA 1ZY5A 2UVYA 2O2UA 1Z9XA 3EYHA 4QP6A 4ZTHA 5B0XA 4PMTA 5JH6A 2WFYA 4FSWA 4BDIA 1WBNA 4FT9A 2R3LA 3E63A 2YITA 2PZ5A 3H30A 1WBTA 5M06A 2Y0AA 2ITWA 2OIBA 3VULA 3EQHA 3HV4A 3UOKA 5KMOA 1AQ1A 4A07A 3A7JA 5K3YA 2CKEA 5E8WA 2BFXA 5M4FA 2WQEA 5TF9A 2NNWB 1GZNA 2WMSA 1K2PA 2ITQA 2PZIA 2WU6A 3DQXA 3HV3A 4AW1A 1PXLA 2YWPA 2NRYA 2H9VA 2W9FB 2YM6A 4D9TA 2O5KA 2X8IA 3TTJA 4G3CA 4CZTA 2EB3A 4D5HA 3DTWA 3LFQA 4C4GA 4E93A 2ZV7A 3EQBA 2XK4A 4BTMA 4DG0E 4C37A 5EI2A 2B0QA 1S9JA 3FZSA 5JFSA 2R4BA 1PXOA 1Q8TA 5JN2A 2XH5A 4ZTNA 4AZTA 3DLZA 1DI9A 4FL2A 2WMBA 1K3AA 3R04A 4S33A 4TWNA 1OM1A 4DGLC 3SQQA 4RJ4A 4BCFA 4MH7A 3HAVA 5LARA 1DM2A 2YN8A 3MTLA 1DS5A 2W4OA 4ITJA 3WI6A 1JOWB 2HXQA 4RIYA 4E5BA 4MWIA 5C8MA 1F5QA 1FMKA 5AUTA 2ZMCA 1IAJA 4KNBA 4FEWA 4UXQA 3HV7A 2UZLA 3OVVA 3H0YA 1YOMA 3QL8A 5E90A 5AP1A 1FQ1B 1OKVA 5C4KA 5E4HA 4AUAA 4ACCA 1H01A 3GC0A 2VTRA 5EI6A 4EOMA 2HXLA 5IH5A 3AT2A 4QPMA 3Q6UA 4DC2A 2XKEA 4U97A 3GU5A 4F7JA 5F9EA 3UZTA 4ENYA 2IPXA 2JIUA 2XKCA 1QPEA 4Q5EA 3C0HA 3BLHA 3VUHA 4XG4A 3FPMA 1QL6A 1JSTA 3DDPA 2B54A 2JKQA 3C0IA 2CGVA 3OCGA 4PP9A 4R3PA 1WVYA 4NW5A 4CSVA 3R9RA 4PY1A 4ZMFA 4G3EA 3CXWA 5A46A 2WMTA 3QTUA 3D7TA 4LL5A 3RPRA 3W2OA 3P7BA 1XH9A 2IWIA 4M97A 1E1XA 3LXLA 3SA0A 1H1RA 2ZDTA 4P5QA 4TXCA 2EB2A 5EW3A 2R3IA 3RK7A 3WZEA 4BB4A 5JGAA 3BI6A 3R1YA 3P1AA 3Q4CA 3RI1A 5CSXA 2G15A 3SDJA 1HCLA 3KXGA 2GDOA 4IQ6A 2C1BA 1TQIA 1OKZA 3DTCA 3VUIA 2CLQA 3GCVA 4QP2A 4YJUA 2BZIB 4GH2A 4ZSJA 4ALVA 3PXKA 5CSVA 2BFYA 2ZB1A 5AP2A 4DEAA 4M7IA 5D41A 5EHYA 4AG8A 4FTUA 4FK6A 1SNXA 1O6YA 3NR9A 3OXTA 3V5PA 4FTJA 4FZ7A 3K3JA 4PMMA 5I9ZA 4QRCA 1GIIA 2BAKA 2W1GA 1JBPE 3ZOSA 3EOCA 3BQCA 1UV5A 4NJ3A 2R3HA 1LEWA 2VWUA 4XLIA 3VUDA 3EQDA 1J7LA 2UVXA 2Y7JA 4R1YA 2GNLA 2W7XA 2OFVA 1Q97A 5JKGA 4CNHA 2Z8CA 4AA0A 4H1MA 3DQWA 3PVUA 4YP8A 4AOTA 3OW4A 2R2PA 2XIRA 4DITA 2PE1A 3ZTXA 2XP2A 4JBVA 4O7TA 4IJPA 3BLQA 1J3HA 3CCNA 2BIYA 3ORXA 4MWHA 3UO5A 4F7SA 5CU3A 5HKMA 3FXZA 4KRDA 3NUYA 2Q0NA 3THBA 4ASXA 4FI1A 1KV1A 5JFVA 3UOJA 3W16A 4MXOA 2HCKA 3NW7A 3LPBA 3E8CA 3NUAA 5CAVA 3ANQA 4G31A 3VBXA 3ZLSA 4TYIA 5KMNA 2CN8A 1PMVA 4X21A 5AR5A 4F09A 4EZ3A 1OI9A 1PW2A 3POZA 3ZZWA 1W0XC 3PRIA 4FG8A 4H3QA 4X2FA 3R28A 4NK9A 3Q4TA 3RGFA 4CVAA 5AFVA 2W0JA 4DFYA 4H39A 4DBXA 4ASDA 4M0ZA 3AOXA 5K4JA 1HOWA 3QHWA 3DS6A 4HGSA 3FSFA 3VS2A 3FDNA 3VUGA 3HA6A 3KF4A 1BX6A 3NUPA 4HCVA 1OECA 2CGWA 2BRBA 1KE8A 2C6DA 1KSWA 4FTNA 4MF1A 2OXDA 2C6TA 4FSRA 4F6UA 3PG3A 3KFAA 4ZTRA 1M2QA 3GCSA 4B9DA 4BCPA 3FY2A 4F9BA 4ZSAA 2Q0BA 4PTGA 4BC6A 4OBQA 1URCA 2XVDA 2ZYBA 5J9LA 2WMVA 4OTRA 2CKQA 4BY9E 4PDPA 1FVRA 3GC7A 2PUIA 1BI8A 3SVVA 4BRXA 2DUVA 3NW5A 4JQEA 3OCTA 4DFUA 3A4OX 5ANJA 3R7OA 1TVOA 1T46A 1YQJA 1K9AA 4I6HA 4B4LA 5I0BA 5B2KA 3QGYA 3P78A 3R0TA 4HYSA 4GL9A 5GJDA 3TV4A 4IWQA 5HG5A 3OY3A 4YTIA 5DRDA 2BAQA 3LIJA 4KBKA 4O0WA 3HV6A 4FOCA 3QTIA 4M0YA 4M15A 4Z3VA 1VYWA 3EZRA 4UB7A 2C5YA 5DT3A 2X8EA 3V8TA 4ANOA 3FSKA 4Y8DA 2QU5A 2VTMA 3NUSA 3QC9A 1KOBA 3CIKA 4CYJA 1Y91A 2PTKA 4OTPA 3CQWA 2LAVA 2GU8A 4EOIA 3ATTA 1PXNA 2Z60A 5JSMA 2XRWA 3JVSA 2IW6A 3UO4A 5AA9A 4DHFA 1XH6A 2QI8A 4MQ2A 3RWQA 3QZIA 4TWOA 3G5DA 4M14A 4DFLA 3FLQA 1KE6A 3DCVA 3K3IA 3RBWA 5DBXA 4IACA 2Y9QA 3QALE 1R78A 3TJCA 1J7UA 3D5WA 3S1HA 1FMOE 2XIZA 2UW5A 3BHHA 3C5UA 1XH8A 2J6MA 2XJ2A 3V6RA 4EI4A 5IUGA 4APPA 5IEYA 3BQRA 5EG3A 4BDBA 2XNEA 4IFCA 3UNKA 2HY81 4KBAA 3LMIA 4I6BA 4KINA 4Z7HA 1Q41A 3MVHA 4PUZA 3QKLA 1ZWSA 3A2CA 3P23A 4MHAA 4H3PA 3NYNA 3FZTA 5KHWA 4CCBA 4RVTA 2PU8A 4RC2A 3V6SA 4ZAUA 2CCIA 3TEIA 4R5SA 2QOLA 3EN4A 3O7LB 4J53A 1YXUA 4YJSA 4EOOA 3GFWA 3VRYA 1DAYA 3MB6A 4CFMA 3A61A 4D4YA 3AD6A 4EBVA 2B9JA 2A1AB 3QRTA 5I9WA 4GKHA 4JBPA 4NM5A 2IO6A 3R6XA 5L2WA 2XNBA 3PZEA 5G1XA 4NEUA 4FF8A 3PSBA 2X2LA 3GEQA 4FTIA 4EC8A 4EEVA 4G16A 3AMBA 2VTLA 4S34A 5C8KA 2CGXA 2R5TA 3BU6A 3PLSA 4HJOA 4EH3A 4X2JA 3QTZA 2PY3A 4RRVA 3C4FA 1YHWA 4O0XA 5IQGA 2JEDA 4YZNA 1OZ1A 4F9WA 2IW8A 3ZO4A 3TNPC 5L2SA 4ZIMA 3TZMA 3VS7A 5FG8A 1P14A 3F2NA 1ZYCA 3TXOA 4X0MA 4D4VA 4FV2A 5CENA 4KD1A 4OT6A 3V5JA 4EK6A 5LMKA 1OKWA 4L53A 1PXPA 1UNLA 3VS0A 4NUSA 3SOAA 4LOPA 4IZ7A 4DCEA 3G90X 4GMYA 4LFIA 3ZDUA 3DXPA 4U9AA 4FX3A 2W5HA 3SD0A 4O7VA 4PDOA 5CVHA 5EKOA 3LCSA 2FGIA 1W82A 3C13A 3DGKA 4LRKA 4JLCA 3WF7A 3WOWA 4UMUA 4ZOGA 5HBJA 5CF6A 2XRUA 3LJ2A 2X8DA 2BHEA 3F3UA 5A4LA 4XP0A 5C8NA 2GTNA 3TUDA 4YNEA 4BHNA 5CI7A 3RPYA 1LUFA 4ZJJA 3H0ZA 3MVJA 2OZAB 1OGUA 4CG9A 3PJCA 1PXJA 2E9VA 4CZUA 3QQFA 4D0XA 4W8DA 4G34A 3SXFA 5IH6A 2XBJA 1H0VA 3HMOA 3QYWA 1RW8A 3BGZA 3NZ0A 3CPCA 5EM5A 4QYHA 2GNJA 1H24A 2Z7RA 4U6RA 1Q4LA 4O0TA 3OCBA 4H1JA 2W17A 5AIKA 4GEOA 3ZS5A 5IG1A 4OUCA 3UE4A 1FVVA 4DG2E 2XK9A 3TT0A 3R83A 3R8PA 4YTHA 2BKKA 2Z2WA 1R3CA 2YABA 4GU9A 4ZTQA 4DEBA 4AACA 4FIHA 4B8MA 4ANLA 2REIA 5J79A 2GS2A 4YLLA 1YXSA 2C0OA 2WMXA 4RC4A 4RFZA 4BR3A 4QMMA 4CLJA 4LRMA 3GQIA 5AV4A 2ZM4A 4RWIA 1TQPA 2XS0A 4D1ZA 1KE9A 5KMKA 3V3VA 3Q52A 2V7AA 1W8CA 3UOHA 2OLCA 5ACBC 4M8TA 2ETMA 2UZVA 3E64A 2ACXA 5M4UA 4LM5A 2YM3A 1BYGA 1WCCA 4QNAA 3C4CA 4XRJA 4D2VA 5IA0A 3QA0A 4J7BA 3R9DA 3P86A 3RM6A 4D2WA 4E4NA 3CKXA 4UMTA 3EH9A 4TL0A 1OBGA 2BPMA 4MXAA 3UYTA 4A4OA 5FLFA 3FC2A 3WZUA 2AC3A 2WGJA 4ZZNA 1Q3WA 2W4JA 4MBIA 3COIA 5EKNA 2VV9A 5BVKA 4UN0C 4IAZA 4NCTA 2DQ7X 2XK6A 3GI3A 5IA5A 4RX5A 3OWKA 1JKSA 3HX4A 4FTMA 1IAHA 3PZHA 2OF2A 2YFXA 3BEGA 4RJ5A 2JDRA 5HICA 3NRMA 4AF3A 4MNEB 4FIFA 2FSTX 2R0IA 3BYSA 4FT0A 4EUTA 4AW0A 5KMJA 4KWPA 4I6FA 1R39A 1CTPE 3WIKA 3UYSA 4C4EA 2O0UA 3UP2A 2BDJA 3I6WA 4TWPA 2QO7A 4NWMA 3SLSA 4YPSA 5EK7A 4ALWA 4FEXA 2R3MA 4R8QA 4UWBA 4ZTSA 5J7BA 2IZUA 3QWKA 3DK3A 3NDMA 3NNVA 2R3PA 4FV3A 2PVFA 2ZV2A 2VRXA 3ANRA 3LE6A 1STCE 3OXIA 4OTDA 2UZDA 5A6NA 4O0UA 4ID7A 2OJJA 3GP0A 4EOLA 4ASZA 5DMZA 3PIYA 3QRKA 3QQHA 2OH4A 3HGKA 3O7LD 4QTAA 3E62A 4DGNA 1NXKA 4DEIA 5L2TA 2GS6A 2WTKB 5FM2A 4ZJIA 2A0CX 4GG7A 3P7CA 4E8AA 2I1MA 4V01A 2HENA 2VTSA 4KRCA 2F2UA 1OBDA 3EZVA 3PXQA 5IISA 1M2RA 3GU6A 2PK9A 3RNYA 4BCGA 2WTVA 4EH4A 4CFVA 1W98A 5TKDA 5M44A 4KKEA 3TM0A 3PIXA 4LGDA 3ZM4A 4UALA 3KREA 5IQIA 4I5MA 5JFXA 1YKRA 1NVQA 1SVEA 3EQCA 5L4QA 5LJJA 3FI8A 4OTFA 3NSZA 3MN3A 3EKKA 3RPSA 5HE2A 4C3RA 3MPAA 4BTJA 4M3QA 5GZ8A 2UW4A 4IMYA 4ZSEA 2V5QA 4LGGA 3TN8A 1NA7A 4J98A 3HRBA 2GHGA 2WQNA 4RJ6A 4CFXA 3OUNB 1SVHA 4L3PA 2E9OA 2I0YA 3I5ZA 4TY1A 3QX2A 4FSYA 5EHOA 4XBUA 5AR7A 3TIZA 3WZKA 4ZZOA 3FZ1A 4RQVA 3E8NA 1BMKA 4RIWA 3MV5A 4BKJA 4AZEA 4MBLA 1YXVA 4AE9A 4IWOA 3MESA 3EQIA 3NS9A 4WUNA 3RK9A 2PE0A 3JUHA 4O6LA 4QMVA 4TYGA 4AP7A 4AXAA 1IEPA 4YZ9A 5A14A 4YJQA 2PHKA 2YIRA 2YJSA 4JIAA 3DDQA 2QODA 5BPYA 4DTBA 5M55A 3NGAA 5HHWA 2C6MA 3SG8A 4WSYA 4Y95A 2G2FA 4ZSLA 3KU2A 2JLDA 3UO6A 3PA4A 3UPXA 3I60A 4XG3A 5K0KA 2VX1A 3MS9A 3AD5A 3DB6A 2JAVA 2JIVA 3MY1A 3O50A 3NVKI 1RDQE 2DS1A 2J9MA 4AW5A 1FVTA 3RNIA 4F0FA 4W9WA 4A06A 2XNNA 3D15A 2ERKA 3K2LA 4C59A 3HLLA 4E6CA 4EJ7A 1CM8A 3OC1A 4L67A 4BYIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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