3PSDA

Non-oxime pyrazole based inhibitors of b-raf kinase
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
276
structure length
262
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Non-oxime pyrazole based inhibitors of B-Raf kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords B-RAF PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE
total genus 68
structure length 262
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3psdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3psdA01
4EWQA 3C4EA 2YERA 3DKCA 1YKRA 3PLAE 1Q61A 1ZMUA 2B54A 4D4RA 3CE3A 4QPAA 4L68A 3QZFA 4F7SA 4BWPA 3OS3A 1YI3A 3F3UA 4FG9A 5AUYA 3W18A 4EZ3A 2C0OA 3EQIA 5GZ9A 2CN5A 2OZAA 3DA6A 3FY2A 5CU3A 4YJTA 5AUWA 5KMJA 2WAJA 5LMKA 1KWPA 5M51A 3KVWA 3PXFA 4FG8A 1OZ1A 4FKRA 4UYAA 2OIQA 3IS5A 4BTMA 4EH2A 5M4UA 4BWXA 5CAPA 3PJ8A 3Q32A 2OJ9A 3OROA 5T3QA 3Q9ZA 4FT3A 4IDTA 3ZSHA 4BCIA 1E1XA 4PNKA 4LL5A 1PXIA 5EW3A 2F49A 1Y8YA 2WMXA 2W1GA 3IO7A 4XCUA 1OITA 4M68A 2OU7A 5DN3A 4X6RA 3UVQA 5G1XA 1T46A 3DS6A 4D55A 3H0ZA 4FKTA 4IADA 2ERKA 5EH0A 1IAJA 3TIZA 3OT8A 5EKOA 5H3QA 4M97A 2YDKA 4DE4A 3UGCA 3P7CA 3G9NA 3KCKA 3KXXA 4OTDA 4YURA 3HMIA 4Y72A 4HPTE 4QNAA 2I0YA 3TZ9A 4DH5A 1P4FA 2R3RA 3MYGA 2C5YA 4GK4A 4U44A 5J7BA 4YTCA 1GZOA 3FMMA 3LFSA 4F6WA 5E4HA 3NVMB 4D1SA 2ITVA 5CXZA 2WNTA 3IW6A 2ZAZA 3Q6WA 4TYHA 2B4SB 4ANNA 4MQ2A 4AWIA 4MXCA 4IFCA 2ZOQA 4AGUA 4MNEB 4DEDA 5HU9A 5KMIA 2EUFB 4DGMA 3MPMA 3DXQA 2BAJA 1VJYA 3SXSA 4AN9A 1Q99A 4ANSA 1MP8A 3W16A 3VULA 2YCSA 2C5OA 3W2CA 2BFXA 3QALE 3QRUA 1XH8A 3PTGA 2X7FA 2VX1A 1QPCA 3OCSA 3D7ZA 1RJBA 3ZMMA 5LWMA 2BZKB 4FZDB 2ZMDA 4KAOA 2XVDA 4PF4A 2PUIA 3FMHA 5CEPA 5HVKA 1BLXA 3UTOA 3ZZWA 2C30A 4A9UA 4AW0A 1Q97A 4JBPA 2ZV7A 4R1YA 4BB4A 4TZRA 4L45A 4RX9A 3ZUVA 3JPVA 1RDQE 3MA3A 4B8LA 3TDVA 4OAUC 3ANRA 3PJ2A 3VBTA 2QOOA 5HZNA 5I9ZA 3PA3A 4G3FA 5E7RA 4DH3A 3SX9A 2X7GA 5ETIA 5EYKA 3GCPA 3H9OA 3TNHA 4LGHA 1TVOA 2WB8A 3VO3A 2WPAA 4NEUA 4NH1A 4RX7A 3WIKA 3IOKA 5FBNC 3UOLA 3M42A 4Z9LA 1M7NA 4XV1A 2HOGA 4WRGA 5LXMA 3A7IA 1YI6A 5EOBA 3ZSIA 4AOJA 1NVRA 3CC6A 3DB6A 3ZSGA 2HZNA 3ZFXA 2W05A 1JOWB 4RJ8A 5I9XA 3FLWA 4CRLA 4D58A 2UW7A 2F2CB 4GW8A 3C4ZA 3Q4CA 5D7VA 5EG3A 4GT4A 4RVLA 3FMDA 3VJNA 5AV0A 4E5AX 3K3IA 4J98A 3UOKA 1J7LA 3WARA 3OWPA 3KXMA 3AGMA 5CAVA 4FTCA 4IB5A 4DC2A 4EZ5A 3BLHA 3FC2A 5A54A 4RX5A 1PY5A 3KC3A 2GFSA 3EOCA 4UZDA 4KUJA 2VO6A 3QX4A 4OTHA 4QP4A 2BROA 4LV5A 2O0UA 5F94A 4C3RA 4CZTA 2G2FA 5I9UA 5LJJA 2YM4A 3PIYA 2WTKB 4IACA 2CGXA 4M0ZA 4YPSA 5B2KA 4AA4A 3OF0A 4RT7A 4CT2A 4MKCA 4J8MA 4AU8A 3PRFA 4G3EA 2BZHB 4BFMA 3QXOA 3OXZA 3GVUA 3ORPA 5E8XA 3RPSA 3VBQA 1AGWA 4RQVA 3RNIA 4C8BA 4YHTA 2J0MB 5KX8A 4RJ5A 1OMWA 5HIDA 2EXEA 3QRKA 3S95A 3TI1A 3WI6A 5HG5A 1PMVA 3KEXA 1O6LA 3CY2A 4PPAA 1W82A 1BUHA 5JGBA 4LG4A 3W33A 3HEGA 5M07A 4XG3A 5H8GA 5FXRA 4A4XA 4YZ9A 2IW9A 4FKLA 3SKCA 4F9YA 4HPUE 3DCVA 3CTJA 4LQMA 4YBKA 4PRJA 2YZAA 2WTWA 3S3IA 3V8WA 3ULIA 3TDWA 4HJOA 3VS1A 4B9DA 4K0YA 3AD5A 3MH2A 5CAQA 3SV0A 2J5EA 1GIIA 1DAWA 3IGOA 3LM5A 2J2IB 3IECA 4EOKA 2ZB1A 4Q5HA 4DITA 4AZVA 3I5NA 3TZ7A 4BCJA 3GUBA 3H30A 3D5VA 4C3PA 5LVLA 3MW1A 5HLPA 5JFSA 4S2ZA 3DKFA 4YJVA 3KMMA 4LV8A 4N0SA 2OSCA 4QP7A 4MD9E 5JQ5A 3EQHA 2IVSA 4N4SA 4XBRA 4EH8A 3C5UA 4R7IA 3R7IA 1DM2A 2W1CA 3RKBA 4NZWB 4D9UA 4TWOA 3LQ5A 1H8FA 4X3FB 5CEMA 1UWHA 3Q53A 3UMXA 5K4JA 1UU3A 2OGVA 4IHPA 5EHLA 4D1XA 4Q2AA 3LE6A 3F2RA 4J8NA 4RX8A 4DFLA 2XBJA 2EXMA 3D9VA 1XH9A 2W9ZB 4MBLA 2R3HA 4C4HA 4DLJA 5GJGA 3GOKA 3JY9A 5ANIA 4BDIA 3LXPA 4FSNA 3DK6A 3LAUA 4JG6A 4FGRA 5AR4A 4FT5A 1URCA 2VTRA 4EQCA 2QU6A 3R8LA 1F3MC 2ZJWA 5J1WA 4I6HA 2WMAA 3LOKA 2HY0A 4L3JA 3TIYA 1FBNA 4EKLA 4JQ7A 1JKKA 3DTWA 3ZHPC 1OI9A 2C6TA 3FWQA 3UP2A 4V04A 5AAGA 4HCVA 3LZBA 5A4QA 3R7EA 4IX3A 4BIBA 1JSVA 2GS6A 3WILA 3UE4A 3CJGA 3TNIA 2IZSA 2EB3A 2R3QA 4FBXA 3WYXA 2WQBA 3C4FA 5GIOE 1FOTA 2ONLC 3ZS5A 4CQGA 3UNKA 2QO7A 4FK3A 2JLDA 3UODA 5A4EA 3ZDIA 3DAEA 3DFCB 3Q2MA 5HVYA 5K0XA 4O96A 1OKWA 4NWMA 5M44A 1U54A 3LVPA 4QTAA 3F5XA 4TWPA 1K2PA 3L8SA 2Y0AA 3FLSA 3VBWA 5JRQA 4RZWA 4DN5A 4RZVA 5IA2A 4D2SA 2NRYA 4FC0A 3ODYX 1YOJA 3G6HA 2VV9A 2IZTA 4NW5A 4DEEA 2QG7A 2PZYA 3VC4A 4BWKA 1YWVA 2WIHA 3DBQA 4G5PA 4ZLOA 2IW6A 4D2WA 3GCQA 5EM5A 3MB7A 4RQKA 1H1WA 2HWOA 3UJGA 3BX5A 4K2RA 4LOQA 3TT0A 2CGWA 5AP6A 1XBBA 4ERKA 2XIKA 4ZAUA 5J8IA 2GS2A 4ITJA 4GMYA 4RLKA 4HVIA 3QF9A 4PWNA 4O83A 1Q8TA 3OW3A 2YIXA 4PTGA 3CQEA 4AFEA 3WF6A 4DFXE 5IQIA 3BRBA 1QMZA 3R1YA 4XNEA 3ATTA 4UWCA 2H8HA 2I6LA 3W10A 5IH4A 5KBQA 4CTCA 3H10A 3R71A 4BTJA 3LM0A 3G6GA 5KKRB 2QOFA 5BUIA 4Y83A 1ZXEA 4K6ZA 1PXMA 2OJGA 5CF8A 3NNWA 3BZ3A 5L6OA 5L6WL 3UMWA 4JAIA 3LXLA 3P23A 4RIYA 3O7LD 2ACXA 5M53A 4FKQA 3VQUA 1R1WA 4AGCA 3PXZA 2YJSA 3DJ6A 5IQFA 4I41A 1M2QA 4AE9A 4F4PA 2J0IA 3GC7A 4GK3A 4EOLA 4YP8A 4S31A 5AM7A 3ZO2A 1OPJA 3EHAA 3QYZA 4AZTA 4HCUA 4BCQA 3A7JA 3FMNA 3IW8A 4Y8DA 3U9CA 4BTKA 4IAFA 2UZOA 4FMQA 3EN6A 3F7ZA 3GQIA 4BKJA 5HTBA 3KVXA 4CFMA 2ONLA 2VAGA 1ZYDA 3NZ0A 2I0VA 2QO2A 5L8KA 5GNKA 5M08A 2GDOA 2J7TA 3MH1A 2RG6A 1XO2B 5DT0A 4H3BA 4FTQA 5AAFA 3V6SA 2XNNA 1GZ8A 2CN8A 4EJNA 3UQFA 3ELJA 5E1EA 4E7WA 3D7TB 3T9TA 4DTBA 5K9IA 2W5AA 2R3IA 3FY0A 3F6XA 3ERKA 5M06A 1REKA 2XEYA 1W0XC 2H9VA 4AP7A 1JSUA 1KV2A 3PY3A 2PK9A 3PE1A 4PTCA 3GGFA 2DWBA 1H4LA 1ZYSA 4TWNA 1PXOA 3KGAA 4EI4A 2QNJA 2QC6A 1ZY4A 3OMVA 4RJ4A 4WKQA 5BQ0A 2BAQA 4G3CA 1Y91A 1ERKA 2WMSA 4QP3A 3KF4A 5AX9A 3OUNB 4DTAA 4FIJA 2QODA 4ZTHA 4AACA 4G34A 4RIOA 4M84A 4PY1A 5AM6A 4EOPA 1OKVA 1H07A 2BHHA 3DK3A 4O7YA 1BMKA 4RSSA 4APCA 2UUEA 4F6UA 2WU7A 3DB8A 4ZSGA 4RG0A 1ZMWA 3BBWA 3LCDA 2X8EA 4XG6A 5JFWA 3E87A 3EQRA 2ZMCA 4GU6A 5TE0A 2PULA 5EQPA 2VO7A 1MRVA 4EHVA 2EXCX 3P7BA 2ERZE 3JS2A 4C4EA 2Y7JA 2JAMA 4G1WA 4MNFA 5L3AA 2X9EA 3U6JA 4ZTNA 3NIEA 4QTDA 5HO6A 4CD0A 1CKPA 4OBOA 1B39A 1M2PA 2W4JA 4YZDA 3O8UA 3R8PA 3AC3A 4D5KA 5C8MA 5ITAA 3E7OA 3E88A 5IU2A 4BR3A 4F65A 1YOMA 5DT3A 3IDBA 2YABA 4R7HA 2CCHA 4D2RA 1PYXA 3R9DA 4ANBA 5LWNA 5IUHA 5AA9A 5M55A 3B2TA 4GRBA 3FZ1A 3QLGA 4C4GA 3L9LA 3UIMA 5KNJA 1FMKA 2Z02A 3CD8A 4NTTA 4AN2A 4D2VA 3TV6A 4E3CA 3N51A 2C1AA 3R9OA 5HD7A 5I3OA 2GCDA 4BGGA 5HE0A 4EK5A 4WNPA 4UN0C 5CLPA 3FXZA 4GCJA 4O7TA 4UXLA 3SOCA 4WT6A 4DA5A 4IQ6A 1UKIA 4P4CA 4JIAA 4JI9A 2CKPA 4LMNA 3OXTA 5I0BA 4KRCA 1OUKA 4FKPA 3WE4A 4L01A 2B0QA 5HVJA 1P14A 4BCFA 3UZPA 4QQTA 5IA3A 3QX2A 4DGOA 4RIWB 4QMPA 4PV0A 2NRUA 4A06A 4TKSA 5AP5A 3D14A 4G3DA 4IIRA 5CSVA 3ZLXA 4E26A 4CMOA 4GG5A 5CALA 4M14A 2H96A 5DRDA 2X6EA 2C3KA 4KIQA 5IF1A 4HVSA 3ORXA 2YM3A 5CI7A 4MBJA 2BRMA 4XX9A 5LVPA 5J9LA 2VTTA 3TZ8A 3DBDA 1OIUA 4BZNA 3GB2A 2BDJA 2PVFA 4U3YA 1DS5A 3LCKA 4ZTLA 5HU3A 5JFVA 4CTBA 3FYKX 2VNWA 4FTAA 3PG3A 3FSKA 2C47A 1BI7A 2OJFE 2QCSA 3FHRA 3R1SA 4ASXA 5A46A 5L8JA 2PZRA 4BZDA 3MDYA 3RZFA 4FTTA 2UW4A 4QYHA 1OECA 2QD9A 3QCXA 5E8ZA 3RPOA 4RIXA 3VUKA 5IA1A 1MQBA 1R0PA 2O64A 2W7XA 4FV5A 3UNZA 4EC9A 4K9YA 1BL7A 2XS0A 3GU7A 1SM2A 3PIZA 2ESMA 3CXWA 2RG5A 1EH4A 4FVPA 5AV3A 5FM2A 2C5NA 4FSRA 4YNEA 2YACA 3FMLA 4BL1A 4LRJA 3SVVA 1YW2A 3Q4UA 5BYLA 4XG4A 3RTPA 4O84A 4WHZA 4C02A 4DFUA 4AOTA 3QKMA 3QTRA 3D5UA 3R6XA 2YDIA 4I24A 3PY0A 2QURA 4JRVA 4MD8E 4W9WA 4L3PA 4ENXA 3FV8A 2WTDA 3NAXA 1X8BA 4OBQA 2WMTA 4K1BA 2XNGA 3NCZA 5DR2A 3FQEA 3UO4A 3W55A 5DPVA 4NJ3A 3TUBA 3ZTXA 4L67A 3GXLA 1H0WA 5AUXA 3BEGA 2YIYA 4KWPA 4N6YA 5DVRA 5EYDA 4ACMA 4F1TA 4YO4A 5C26A 3WF9A 3IOPA 4CMUA 4P90A 5HLWA 2GQSA 2BFYA 3ZO3A 3L9PA 4J95A 4PP9A 4B7TA 4F9CA 2GQRA 3NYVA 5TKDA 3OW4A 2PZPA 3R04A 1URWA 3DU8A 3F3ZA 4PQNA 3NUXA 5KUPA 3HP5A 1Q4LA 4MQ1A 4XLIA 1P5EA 3V01A 2FB8A 5EHOA 4O27B 4V01A 3UG2A 4LFIA 4UV0A 3DFAA 3I7BA 4XP2A 2WEVA 5CEKA 1A9UA 4IX4A 2HIWA 2PVKA 4FSUA 4G17A 4I94A 1GIJA 4WIHA 4FTUA 1JSTA 3HP2A 4IW0A 4WG4A 2PE1A 3HVCA 4O1PA 3VS3A 4CFXA 4XG7A 4WRSA 3KCFA 4ZJJA 3LCOA 2BPMA 1OL6A 3PE2A 4Q5EA 2IZUA 5C01A 3DLSA 3KRWA 5AADA 2JBOA 2OZAB 4I4FA 4YJUA 2FSLX 4B8MA 2P2HA 3MESA 4QYYA 2W06A 4QPSA 4QP9A 4TRLA 4NW6A 4FZAB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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