3PZHA

Crystal structure of maize ck2 alpha in complex with emodin at 1.92 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
328
structure length
327
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural and functional analysis of the flexible regions of the catalytic alpha-subunit of protein kinase CK2
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Zea mays
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 113
structure length 327
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pzhA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pzhA02
3FMDA 4OBQA 4O0WA 3R63A 3DCVA 4UV0A 5AIRA 4BF2A 5DMZA 1FINA 3CKWA 3WILA 5GZ8A 3WZDA 3HAMA 4C37A 4IC8A 2JGZA 2JC6A 1XH9A 3E64A 3RPVA 2QOCA 3UO5A 3GCSA 1ZARA 4I5HA 4PPCA 5CZIA 5LMBA 3NUYA 3N4VA 4JIKA 4D5KA 4GVJA 3WF7A 1Q3WA 2PE1A 2RFSA 3MY5A 1VR2A 3DBEA 3DXNA 4I23A 4C3RA 2JFLA 2HAKA 3N51A 3K5VA 4ZOGA 2R0IA 4BWXA 4BCNA 2WTWA 2WQBA 2X4ZA 1OECA 4U80A 4B9DA 2CCHA 4N57A 3ZRLA 2OKRA 2IW6A 5JMSA 3LM5A 4IHPA 4L6QA 4IDVA 4BDKA 4FKRA 4C2WA 3QCXA 2VWIA 5DR6A 2JAMA 2P33A 3MFSA 4FUXA 3GU4A 4N6ZA 3UJGA 3ZM9A 1DI8A 1FOTA 4F4PA 4CZYB 5HBJA 4IWQA 4GKIA 2C3IB 3NUNA 3PVUA 5AUWA 5HBEA 2QC6A 5ANEA 3EN4A 5E8SA 4QYFA 5CAOA 4B8LA 3O71A 3MYGA 5I9VA 2E9PA 2YM6A 4D0WA 5BUJA 3C0HA 3MSSA 5C27A 2WO6A 4QMZA 5AAGA 3GFEA 4DN5A 4RGJA 2X2LA 3LFFA 2PMNX 3TZMA 4HVHA 4GUEA 1JAMA 4QNYA 3UBDA 2W06A 1ZMUA 3PTGA 5CEQA 4PDYA 1OKZA 3VW8A 1GZNA 4WA9A 2BKZA 5CSXA 5FXQA 4GFMA 3VRZA 5KCVA 3EHAA 3ZO1A 4EBVA 1F5QA 1H08A 5J95A 1XWSA 3HEGA 3PJCA 3W2CA 1H4LA 4RWLA 3RK9A 1OBDA 1JBPE 4C61A 4NKAA 4EH4A 5IKWA 4YNOA 4FKSA 4MNEB 4HCVA 3UQFA 3EMGA 4FA2A 2XIRA 2GS2A 5AA8A 1YHSA 3IQ7A 4I0TA 3ZU7A 3MVMA 1OVEA 3UP7A 3ZZWA 1WBSA 4BI2A 2R5TA 3QRJA 3P23A 3FZSA 3NUPA 2EB2A 4EZ3A 2OGVA 1Y8GA 3AC2A 4ZLZA 2RL5A 5HU3A 5IQDA 3I5ZA 4DTAA 3UODA 3W32A 4Q5HA 3C5IA 4HPTE 5JQ8A 3A99A 4DFZE 4CYIA 3GGFA 3LFEA 4U81A 3ATSA 4WRGA 1UKHA 1H0VA 1H1WA 3DKCA 3S00A 3E5AA 3FKLA 4ASZA 3F3WA 5K0KA 4GEOA 4C4JA 1B6CB 3SD0A 2XK8A 2HENA 1HCLA 4ZAUA 4EOSA 4L44A 3HP2A 3KRRA 4YJSA 3KXHA 4UMPA 4BY9E 5BVEA 3K2LA 3UYTA 1WVXA 2OFVA 3EH9A 3CTQA 2CLXA 5JFXA 2F7ZE 5J7HA 3KMUA 4PDOA 1ZY5A 3QQLA 5E8ZA 4FK3A 5JEBA 3B8RA 2VTHA 3FZPA 5KX8A 1NVQA 4UXQA 2VWZA 4HOKA 5F1ZA 2YDIA 4OT5A 1L3RE 4XP3A 5BYLA 4MD9E 2VX3A 2QR7A 3Q9WA 3W18A 2ERKA 2UZLA 3VVHA 5CAVA 5A4LA 4E7WA 4OT6A 4FV8A 5TE0A 3QC9A 1R1WA 3TJDA 2BCJA 3OY1A 4WG3A 4DH8A 2OSCA 5CF6A 3D5VA 1MRVA 2JBPA 3VC4A 5EHYA 4USDA 5HLPA 3I6UA 5E8VA 3ZHPC 4HVIA 3EQFA 1GY3A 5H8GA 4E5BA 1LPUA 2BR1A 2YM7A 3BEAA 4FV4A 3C5UA 5D11A 5E8UA 3S0OA 1O6LA 5ETFA 4I21A 1Q3DA 2HWOA 2Z2WA 5DH3A 4BCQA 4LGDA 5D10A 3EFLA 4F70A 3DLZA 2PZYA 3O8UA 1P4FA 4IZ5A 2W1GA 4A06A 3AGLA 4O27B 3SKCA 4NFNA 1DAWA 5FEEA 3MFTA 4KABA 3NUXA 5EI6A 2Q0BA 4Y5HA 4U42A 2C30A 5AM7A 4RSSA 5DE2A 4Q5EA 4ALVA 2EU9A 3R7UA 3PRIA 1KV1A 3Q6UA 3QYWA 4X2FA 5A14A 1GIJA 4YBKA 3ZCLA 2W5HA 3MV5A 5FXSA 3AC5A 4F0FA 2GHGA 4QMNA 1Y6AA 3FSFA 4YJOA 2CNUA 2F9GA 4M12A 2BTRA 3RHXA 2QOHA 4L3LA 4BKZA 4UYNA 1W0XC 3KXNA 4YLJA 4ZTRA 2VTMA 2X7OA 1ZZ2A 2F49A 2UV2A 3R1NA 3PY0A 5AP6A 5EM6A 3SDJA 3U55A 2OIDA 4JDKA 4R1YA 1ZLTA 2VAGA 2SRCA 3FUPA 3U6JA 3PJ3A 2UW5A 4EHGA 1YXXA 2I0YA 1SVEA 2CKQA 3G5DA 3QF9A 5FP6A 4FTRA 4Q9SA 1X8BA 3PIXA 4B99A 3ZTXA 3LHJA 5AP7A 3PXKA 3MA3A 3G9LX 4P4CA 2PK9A 4ZTQA 4XBUA 4YZCA 1UWJA 3COMA 4D9TA 4J95A 1OL5A 1WFCA 4XJ0A 3PLAE 4AOTA 4ORKA 4RG0A 1M2RA 2VWWA 2BALA 3U87A 4CLIA 1GIHA 2OJIA 4IVBA 3PSDA 2C0OA 4EK4A 4ZTHA 4ZMEA 1NY3A 5T3QA 4XG7A 3CY3A 3QQUA 4KIKA 4FKPA 3A4OX 3M1SA 5K9IA 3C1XA 2WTJA 4YLKA 3MS9A 1NVRA 5FRIA 4D2SA 1JKTA 4NM5A 5HCZA 5CXZA 2Z7LA 5HNGA 3FL4A 1O6KA 1OIRA 4IE9A 4IANA 4JXFA 4KINA 2GNIA 2O3PA 4KKGA 5G6VA 3E3PA 4XP2A 2VTNA 3NCZA 4DCAA 1G8SA 2CNQA 4L01A 3C0IA 3PA4A 5DN3A 2BDFA 4FV7A 4H58A 4YJVA 3C4FA 2QO7A 4I22A 4JG7A 3D0EA 4M66A 3SX9A 4GIHA 3R9OA 3MW1A 3OXZA 2O0UA 4BZOA 5L3AA 5M4UA 2JLDA 1ZOEA 2BILB 2VO3A 3LCTA 4DGOA 5DHJA 3LXNA 2IWIA 4FSTA 4C59A 5AUTA 5BQ0A 2XKEA 1CTPE 2ZV7A 4OTDA 2VN9A 3KMWA 3MH3A 4IADA 4EUTA 3OCTA 4A4XA 3I1AA 3IPHA 4WHZA 2R64A 4L43A 2PY3A 1H0WA 1JKKA 4PNIA 4EJ7A 4BVUA 4EH2A 4FL3A 4D1ZA 1YDTE 1PMEA 2G15A 2YDJA 2CCIA 2XK3A 4BDGA 3HL7A 3POZA 5ACKA 4RVMA 5HO6A 2B9FA 4U5JA 1F0QA 3KF7A 4I0SA 3GP0A 2HWPA 3PP1A 5DOSA 4EK6A 3COHA 3DTCA 3ZS5A 5CU0A 5CYIA 4A9SA 2BRHA 3QKKA 2EXMA 2XNBA 3M11A 4FSQA 4TPTA 4BKYA 4IM0A 5LMAA 4WOVA 2ZYBA 2C5NA 3I81A 4DH1A 3G90X 3NX8A 4IAYA 5E8XA 3HX4A 1YXUA 4O2PA 4MX9A 3EB0A 4MF0A 4NJ3A 1JPAA 4F9WA 2BPMA 4EONA 4I5PA 3NMUF 4FV2A 3NIEA 3UG1A 3EZRA 4EHZA 2BAJA 3WIGA 3QTUA 3OC1A 4F99A 1YWVA 3BELA 2V5QA 5E8WA 1XBCA 5E8TA 5BVOA 1A9UA 1R3CA 3QQFA 3V5JA 5E4HA 4JR7A 2BZIB 2GHMA 2J9MA 3R6XA 4C38A 5C8MA 4XLIA 4MEDA 2F7EE 3ORTA 3VS1A 5IF1A 2X7FA 1KOBA 5IQCA 2XJ2A 5AR8A 4J97A 3NUAA 2YLEA 3I0OA 4Z7GA 4I93A 4CG9A 3QD4A 5B2MA 3SRVA 5AV3A 3RKBA 4AQCA 4IX6A 5F4NA 1PW2A 4EOPA 4QYGA 5CQUA 2YLFA 4U44A 4QP1A 4K1BA 1K9AA 4TKSA 2JDVA 4BI0A 3QTSA 1OI9A 4EOMA 5BNJA 3FYKX 4UN0C 2ZDUA 2HZIA 5HD7A 1BX6A 1OL7A 1XO2B 2GNGA 5EW8A 5A54A 2HYYA 1OL6A 4XP0A 1FVRA 1Q8TA 3MIYA 5FEQA 3VS3A 1OM1A 2UUEA 3AC8A 2HXLA 4AFJA 2FB8A 4UX9A 1EH4A 2XA4A 3UZPA 3MPTA 4CLJA 1GJOA 3NCGA 3R1YA 1GNGA 2C0IA 4RIOA 2R3LA 3UIXA 5CF8A 3OWPA 1YOMA 4IQ6A 2XBJA 4YHFA 3WZJA 1LR4A 5AP0A 5LCKA 2XYNA 4YJUA 4EQUA 4NM0A 1CKIA 4ZZNA 2PZPA 5HCYA 1F3MC 2H8HA 3FLSA 3QWJA 4QD6A 4A4OA 2R3GA 4C58A 1PYEA 4H1JA 3DQXA 4OR5A 3S4QA 4AN3A 5L2WA 4RIWB 4UEUA 3PSCA 3IECA 4YP8A 3HDMA 3IO7A 3QTQA 3ZRMA 2C0TA 4AZEA 1UNGA 3FI8A 4EKLA 3U8WA 4CEGA 3LMIA 4BDIA 4R3RA 4BDHA 5DT4A 2YZAA 2AC3A 3CD3A 4J99A 3O2MA 4B8MA 3L9PA 1AD5A 4TWCA 4DG2E 5AV4A 4YJTA 5L8LA 3FKOA 2ITNA 3W2RA 5B2KA 4E6AA 4M69A 5CAQA 3NVKI 3R22A 3DGKA 4L45A 3HKOA 4DBXA 1SMHA 4RVTA 1JLUE 4RWIA 4DFYA 4FF8A 4UBAA 2R3JA 2WB8A 3QXPA 3A7IA 4K9YA 3RPOA 3BYVA 3VF9A 3IONA 2C6MA 4O7TA 5J7BA 2RFNA 4L7FA 5ITAA 4UMQA 1OBGA 3ZO2A 2JIUA 4U6RA 3BWFA 4JDJA 5FM2A 3V8TA 3RCDA 4R77A 3FZRA 1T46A 5M08A 4DLIA 3HUCA 5CNNA 3GU5A 4V0GB 3KKVA 3C50A 3BQRA 5E9EA 5JK3A 3AQVA 3MFRA 2CGUA 3IKAA 2KTYA 4FT3A 5AX9A 3MVLA 4E6QA 3TNWA 4GYIA 4AN9A 4UZHA 4R1VA 4NTTA 2QD9A 5CSVA 3R21A 3W16A 4KSPA 4ZLOA 2FVDA 4FK6A 3JS2A 3GUBA 1JQHA 4L68A 3R7VA 3U51A 2WMSA 4ZY4A 4IJ9A 3QX2A 3SG9A 5CVFA 4HGLA 5E92A 1O9UA 2QG7A 5LJJA 3PG3A 3DNEA 1Q8YA 3EYGA 4BIBA 3LJ2A 4EC9A 3C4WA 4O1PA 4D2WA 3KXGA 4TY1A 1FGKA 3GC8A 4G34A 4BYIA 3O51A 4TL0A 2ITTA 5ANJA 4IM3A 4ANQA 4C4FA 3GI3A 4I6FA 3FHIA 4QPAA 1G8AA 1FBNA 3VF8A 3TI1A 2WPAA 3JYAA 5DVRA 4HCUA 1W8CA 5HIDA 3RI1A 4U40A 2CHLA 3R0TA 5I5ZA 2XVDA 4QMXA 2W1FA 5AR2A 1SNUA 2PWLA 3QQHA 3W2OA 3PXRA 4LI5A 2IW8A 1J1CA 4G9RA 1MUOA 3FMKA 3P08A 5HI2A 1YWRA 5BYZA 3JY0A 4QPSA 3DAKA 1BMKA 1JSVA 2C6KA 2UZWE 3DKGA 4ZZOA 4XH6A 4IVDA 3AMYA 4XG8A 5AP4A 4D2RA 4D4VA 5IH4A 5FBOA 3PVGA 1FVTA 2WMXA 2GTMA 3H0ZA 2GS6A 1XHAA 2HZ4A 4XYFA 2WOTA 2XB7A 3FI4A 4I3ZA 5DR2A 2F57A 2NPQA 2RKUA 4RIYB 5EK7A 5IH5A 1XH8A 4MNFA 4UB7A 3C13A 4XV9A 2RG6A 5HBHA 3U6HA 1U59A 4MH7A 3EN5A 4LL0A 4EOIA 2R3IA 2YWPA 4DA5A 4BCOA 1H1PA 5FUTA 2V7AA 2QKRA 1IG1A 3TTIA 3SVVA 2UVYA 2A19B 2ITUA 4YZNA 4I6HA 2ETRA 2PZRA 3HRFA 3OUKA 4QTAA 4AF3A 3PA5A 5IUIA 1TQIA 3H9RA 4FZ6A 4K6ZA 4MXYA 2UW9A 4B4LA 1H1QA 2BRMA 2XMYA 2ONLA 3A2CA 1ZOHA 3CTJA 1Y6BA 4BDDA 3CS9A 3F88A 3PG1A 3HMIA 5L2QA 4BIDA 2NNWB 4BCPA 4JBOA 3QA8A 2XNNA 1ZYJA 1UU8A 3DJ7A 2IZRA 3TNIA 3RJCA 2UZUE 2I7QA 2WMQA 2R0UA 2JKOA 2P4IA 3RINA 3HAVA 4G17A 4O0TA 4PQNA 3R8VA 3S95A 2UZOA 5D7AA 3FZTA 4GK4A 3U9NA 4JAIA 5JGDA 4EOJA 1KV2A 4FG9A 2JIVA 3PSBA 4E4XA 3ZUUA 5LVOA 1ZRZA 3RAKA 4Z16A 3CQWA 4IC7A 4FEXA 1PXMA 3OMVA 1PHKA 2C69A 5M07A 2W9FB 5D12A 3UIBA 4OAUC 3ZSGA 4FV1A 3F3VA 3FWQA 3NNWA 1TQMA 1U5QA 3R00A 4WSYA 3R7EA 2IG7A 2FSLX 4M0ZA 4BTJA 4R3PA 3E63A 4PL3A 3H9FA 3D5WA 4FNYA 3S2PA 3WOWA 2PVKA 3EQRA 4ENXA 5IQFA 4QP3A 2X2KA 2J6MA 3EQHA 4TYHB 2XIKA 3KF4A 3PPKA 4QMPA 2HY81 5AUYA 4D55A 1BI8A 4IM2A 4GG5A 3QKLA 3RNYA 4R5YA 4G16A 5KMOA 2OIQA 4LQMA 3F2NA 5FDXA 4CRLA 4GKHA 5HG8A 3TKIA 3HA8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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