3Q4CA

Crystal structure of wild type braf kinase domain in complex with organometallic inhibitor cns292
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
276
structure length
264
Chain Sequence
DDWEIPDGQITVGQRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKMLNVTAPTPQQLQAFKNEVGVLRKTRHVNILLFMGYSTKPQLAIVTQWCEGSSLYHHLHIIETKFEMIKLIDIARQTAQGMDYLHAKSIIHRDLKSNNIFLHEDLTVKIGDFGLATVKSGSILWMAPEVIRMQDKNPYSFQSDVYAFGIVLYELMTGQLPYSNINNRDQIIFMVGRGYLSPDLSKVRSNCPKAMKRLMAECLKKKRDERPLFPQILASIELLARSLPK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of BRAF in complex with an organoruthenium inhibitor reveals a mechanism for inhibition of an active form of BRAF kinase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase B-raf
total genus 68
structure length 264
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3q4cA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3q4cA01
2XKDA 5TOZA 3WARA 3UJGA 4QP9A 4C3FA 1SYKA 4XG7A 3PTGA 2YZAA 1UV5A 4OT5A 3UTOA 3L8XA 4YSJA 4MNFA 5EK7A 4BRXA 5CYIA 3RPRA 3QRUA 1JSUA 3HNGA 3FKNA 1H01A 4NH1A 4XOZA 4Y5QA 5EDQA 2VTTA 5AIKA 4AX8A 5HORA 4MX9A 4AOTA 2ZYBA 2F4JA 4EH3A 4UN0C 2HCKA 3VW6A 5HD7A 4L67A 5AX3A 2C69A 2QU5A 3QGYA 4HCUA 3MY1A 1KV2A 2HY81 1O9UA 4RJ7A 4DINA 2OF2A 2YEXA 3BYSA 5EHYA 3QF9A 4DEEA 3LLTA 1JKSA 4HW7A 2EB3A 3DB6A 4MH7A 3C0GA 4ZSLA 3SQQA 3AC4A 3IW4A 4EKLA 3ZBFA 4C34A 4YJOA 3U4WA 3FPMA 3UIMA 3ZLXA 4YLKA 3LXKA 5CAPA 3FMDA 5A4TA 4YMJA 3VS6A 5A14A 3OROA 4O84A 3R7YA 2IVUA 3GUBA 3W2CA 2O0UA 4V05A 5FWKK 5HD4A 4WG5A 1Q24A 3JY9A 1XKKA 5EQPA 3OWLA 1YHSA 4WG4A 3R73A 4F9WA 3EN4A 4BCIA 4FSRA 4WD5A 4ZK5A 4FV8A 3THBA 4BICA 3F7ZA 3RK9A 2X7OA 5M4FA 2A27A 3NPCA 3TKIA 4H3PA 1ZZ2A 2ITNA 3DTCA 4O22A 4CV8A 5A4QA 4PX6A 2WOUA 5IQAA 2JGZA 4FSYA 4YP8A 2GNHA 2YLEA 4WG3A 4YLLA 3PA4A 5ANEA 2OJGA 3C4WA 3AMYA 4E5AX 3GI3A 2CCHA 5DHJA 4G9RA 4H58A 3V5TA 1Y57A 2W5AA 3PFQA 3RM6A 2BDFA 3HDNA 3D5UA 4U45A 3LKMA 2G15A 4DH5A 3LXNA 3COHA 3C4CA 5IH5A 4AA4A 2PVHA 4J95A 1XQZA 3RPOA 2J6MA 2PVFA 2WNTA 4UY9A 5E1EA 3TZ9A 3VRZA 3WF6A 4CZUA 5CT7A 3WI6A 4ZAUA 3UQCA 3NUPA 1IAJA 5LXMA 3FQHA 3Q6WA 5A4LA 2ITTA 1Q4LA 2C6IA 3QL8A 3QLFA 4IZAA 2P3GX 4JOAA 4NIFA 5ETCA 4O38A 4RJ5A 4BYIA 5CT0A 2ESMA 4BGQA 2BFXA 4JS8A 4BDJA 3Q4ZA 2B9JA 2UZEA 4MBLA 1YWNA 2Q0BA 2ZJWA 3ORXA 2VU3A 3TUBA 2ERZE 2C0TA 3F3TA 2V7AA 1Q8YA 2HWOA 3UQFA 4LV5A 1PJKA 2J51A 2BUJA 4XLIA 5AAFA 3EN7A 4DEHA 5JN2A 1APME 3QUEA 4XRJA 4AP7A 3H3CA 5EW9A 1OKYA 2R3LA 1VJYA 1O6LA 2YFXA 4M97A 4CD0A 4CFWA 4GT3A 4YJUA 4IVCA 1OKVA 2JBPA 2OICA 4YTIA 2YCQA 4ACDA 5M09A 2W1IA 4DE4A 4GIHA 4HPUE 3ORPA 4J8MA 4XG4A 4PNKA 2C1AA 5CI7A 5K9IA 3BU5A 1ZAOA 3W8QA 1WBWA 3MIAA 5LMKC 2YM6A 1PXOA 3NUUA 3Q53A 2OH4A 3F66A 3FMMA 4CG8A 2GU8A 3IDBA 1J7IA 3PSCA 4DEGA 2X2KA 4MYGA 4RWJA 5D41A 5FXSA 2QONA 3RM7A 5IMEA 4WSQA 1ZY4A 1H24A 4RIYA 4O82A 4M12A 3FL4A 3VF9A 3NW5A 4ACCA 5IDPA 1KE7A 2P4IA 3LAUA 3OY3A 3WILA 5HKMA 1UU3A 4F0GA 1REKA 5D10A 1GAGA 2I0EA 3EH9A 2W06A 3DV3A 4IWPA 4PTCA 4C33A 2W1EA 2UVZA 4G3GA 3RAHA 2O2UA 2QOCA 4AT3A 5KMJA 4CKRA 4XHKB 5GZ8A 2C6TA 1QPDA 2UVXA 3NMUF 1LP4A 2HY0A 5BVEA 4BDKA 3IDPA 4MXCA 3DY7A 3LFCA 1KOAA 4KRDA 2VWVA 3UYSA 2R2PA 4AN9A 3HP5A 4DTAA 3VRYA 3PXZA 5L2QA 3R83A 3Q3BA 4QMLA 2J4ZA 3DLZA 4W8EA 2YA9A 4FYNA 3SW4A 2C5OA 3POZA 4M66A 4XBUA 3V01A 4FTLA 1UKIA 3VUGA 4BTKA 5BUJA 2V62A 2X1NA 3GC0A 1R78A 4GH2A 5M4IA 3EZRA 3Q2MA 1PXNA 3WBLA 3F6XA 3MA3A 2XM8A 4FICA 2QOIA 5FP5A 5IZFA 1FBNA 2FA2A 5DGZA 4E1ZA 5KBQA 1JKLA 2J7TA 1H1PA 3KXGA 4QQ5A 2JIIA 4AT5A 1CKIA 4PPCA 3BU3A 2OIBA 4LGGA 5DRBA 3A4OX 4P5QA 4AN3A 4HYSA 3QC9A 1XBCA 4FV1A 2Y4IC 3MY0A 3TNIA 4DH7A 4RC4A 3KXHA 1KE9A 1WAKA 4TYHB 4XV3A 2A2AA 2PUNA 4Y83A 3ANQA 4OLIA 1VYWA 4EQUA 3D83A 5AP1A 4QO9A 1WVWA 3ZLWA 2FO0A 4CFFA 3TZ8A 4JRVA 4L7FA 3UG1A 4C38A 1OIYA 4IM0A 4A07A 3ZS5A 3VUKA 5IEYA 2O8YA 3OFMA 4DEAA 1T45A 2W17A 3FZSA 1WMKA 1ZMWA 3KULA 4FSMA 5I9VA 2ITXA 2PMIA 3F61A 4YSMA 3SRVA 3E5AA 3FLQA 2BPMA 4AA0A 3LJ0A 2G9XA 2YM4A 4D4RA 3FC2A 3JPVA 4E3CA 2R0IA 4FT7A 4FEUA 4KKGA 1PXPA 2VWZA 3UIXA 3ENMA 2Z02A 3R63A 5DVRA 3W2PA 4O7RA 5KMLA 5BVKA 5TE0A 3W2OA 3P23A 1CDKA 3TL8A 1OIQA 1JSVA 2PHKA 2J50A 3DTWA 2RIOA 2UUEA 3R04A 3WYYA 5LCKA 3ZEPA 4CMOA 1NXKA 5DEYA 4CRLA 4X7QA 3KEXA 1NVQA 3BYMA 4I5CA 4BWKA 5KZIA 1YI4A 4HGTA 1VEBA 3VULA 4YUQA 1URCA 2VX3A 2JKOA 4F0FA 2VZ6A 4CFUA 4BDFA 2C47A 1GJOA 4FEQA 2OJ9A 4G6LA 1FVTA 4GT5A 2B55A 1W8CA 3ZLSA 3R9HA 2RFDA 3W8LA 3Q4UA 3MVHA 3PP1A 4CEGA 3GC7A 1GNGA 2EVAA 4MNEB 4RVKA 5J95A 3D9VA 3FAAA 5HIBA 5IH6A 4K6ZA 1IR3A 3OXTA 2XYNA 3V3VA 3F5PA 3VW8A 4C3PA 5AP3A 2WKMA 3VBWA 3FSFA 4FV9A 5LMBA 3C5UA 4XV1A 4APCA 3NUXA 1QPJA 2XBJA 4EH5A 2G2IA 3WF5A 3GENA 4JLCA 3OCBA 3NR9A 2C6DA 1KE6A 2WMUA 5K5XA 4I41A 3TNQB 3QUPA 3O96A 3GCPA 1IA9A 4PF4A 4O7LA 2XNNA 4DG0E 3Q5ZA 2WTKB 4A4XA 4C57A 3TIZA 3IS5A 4GUBA 5C27A 3QRJA 4IAKA 4RIWA 3HRBA 3PIZA 4I6FA 1UWHA 5TF9A 5FDPA 4GU6A 3UZRA 5E8WA 5CXZA 4FTJA 3QTUA 2ZV8A 4HGEA 5IG1A 2BHEA 4Z7GA 2VUWA 5ANIA 4OBPA 1UU9A 4PDSA 4YZCA 5AR4A 4E26A 1J1CA 2JDVA 4ZSGA 2VWYA 4FTRA 4KRCA 1J7UA 3K5VA 3JUHA 4U7ZA 4NM5A 4UXQA 4DHFA 3G9LX 4NWMA 3PIYA 2PYWA 4FL2A 4FSWA 3HV7A 3G0FA 2G01A 1REJA 2WB8A 3CLYA 4LRKA 5CEIA 3W2RA 4BZNA 4EORA 2OJIA 2OJFE 3GP0A 5HU9A 3AT2A 2JKMA 1CM8A 2JC6A 4QQCA 3E8CA 2WTCA 3TNPC 3ORZA 4GFOA 3SVVA 3FEGA 1XO2B 4EK4A 4K9YA 5JRSA 3W55A 5CEKA 4FT5A 4BDBA 4NJ3A 3FWQA 4GIIA 2ONLC 4LQMA 4RJ3A 3ROYA 5KBRA 3MJ2A 3QQJA 2W4KA 4FOCA 5CNOA 2HZ0A 2IW6A 3MWUA 4S34A 3R8PA 4FV2A 4BR3A 1OL7A 1TQPA 4NW6A 2WMXA 3AGLA 4DGLC 5CF6A 4XV9A 4FKQA 4PQNA 4C3RA 4H3QA 4RA5A 4F70A 2CN5A 3QZIA 3II5A 1JVPP 4D1ZA 3TTJA 3Q2JA 3DJ5A 4FI1A 4R1YA 4LI5A 4BGGA 2CJMA 1RJBA 5KO1A 4DTBA 4U6RA 2QOFA 4XX9A 4YC3A 5B2LA 4IE9A 3SOAA 5DPVA 3NW6A 2PZYA 2ERKA 3R8MA 4EBWA 4FG7A 3QQUA 4S2ZA 2XK3A 3LOKA 4APPA 2OSCA 2YIQA 4LV8A 2IG7A 3E3BX 3EQHA 5KZ0A 2VX0A 1Y91A 3E63A 1OIRA 4QTBA 4O7YA 1OBGA 3DDPA 2UW5A 5H8BA 3ZSHA 4DF3A 5BVDA 4GKIA 4I0TA 4EOPA 1A06A 5CWZA 2FSTX 4F9AA 3A62A 4OTWA 5E8XA 3ATSA 4XH6A 3T8OA 2JDRA 4PMTA 1GZNA 4L6QA 4UWYA 5LARA 3LFDA 4I6QA 3MH1A 5HO6A 4C0TA 4UZDA 5DYJA 4DG3E 2FYSA 3PE2A 4RWKA 2P33A 3D4QA 3RINA 5HE1A 2C6LA 5CI6A 3ODZX 2I40A 2GS7A 4M0YA 3PVGA 2HELA 4FKIA 5ANKA 4EHVA 3B8RA 1PMVA 4CCUA 4EWQA 4TTHB 4AFEA 3DBEA 2ZV7A 3M1SA 5AEPA 3PPZA 1OZ1A 2EU9A 4IVAA 4EC8A 1H0VA 1YXUA 2YJSA 4U40A 3VS2A 4FZ7A 3QTIA 4CFNA 2X0GA 3DXNA 3N9XA 1G3NA 5LCJA 4FSQA 1J1BA 1H26A 2BAQA 1DAYA 3DK6A 3RI1A 3RK5A 2R5TA 1Q8TA 5IUIA 2WTJA 3JR1A 3FZ1A 2GQGA 4QP1A 3L1SA 1ZMVA 2OXXA 3KRXA 2F9GA 4S32A 4HVGA 3F3WA 3PLSA 2CNVA 3H30A 2X8IA 2UV2A 2W9ZB 3HRFA 4E6QA 3D15A 3FUPA 2B9HA 3FLSA 4OTFA 5C01A 3BELA 2NRYA 5HU3A 2PZIA 4KIOA 1PXLA 4MEDA 4Q2AA 3NUNA 3FZOA 4CCBA 2XJ0A 4DEIA 3TT0A 4C4GA 5HNGA 3RWPA 2J2IB 4GSBA 4BCPA 4OGRA 3UVPA 2PU8A 3TNHA 3KREA 2GNIA 2UW6A 2VTLA 2XM9A 3EOCA 1XWSA 4KKEA 2XIXA 5CSPA 3AMAA 2X7GA 2Y6MA 3R28A 3EB0A 4QNYA 4AW0A 4XBRA 3PVUA 4QQTA 4FNWA 2C3JA 1H1WA 1ZXEA 2XK4A 3SOCA 2WZJA 4O81A 3C0IA 4F63A 1WBNA 2XF0A 5IPJA 4QMMA 2XYUA 3D5WA 4IFGA 1YOLA 1U5RA 4L00A 5HG5A 1KOBA 1IEPA 3VUMA 4KABA 5BVNA 4FSUA 2Z2WA 2EXCX 5AM7A 4L01A 3OCSA 4E4NA 1E9HA 3QYZA 5ANGA 1PXMA 1SVGA 3DFAA 5T6KA 4YZNA 4FTQA 3MFSA 3NZ0A 4D1SA 4QT1A 5HBHA 3HX4A 1WBVA 4OTHA 3O8UA 3LIJA 1ZRZA 4TYEA 2QOBA 3GB2A 4MBJA 3R8ZA 3U51A 4ARKA 2AC3A 3SW7A 2F57A 3U9CA 4C4IA 2PUPA 4JVGA 2R3GA 3AD4A 4JBOA 2XEYA 4GEOA 3CR0A 2XK9A 2YM3A 3HUCA 3QHWA 1NT2A 4QOXA 2O64A 2WQBA 4M0ZA 3QAME 5AUVA 4YJNA 4BBMA 4YHFA 5LWNA 3B2WA 5ACKA 2C30A 2WTWA 2VTNA 3K3IA 3R1SA 2QLUA 5DR6A 5H8GA 3H9RA 5AX9A 1YXVA 2BZJA 4C8BA 3KCFA 3W10A 3GCSA 3PXYA 4J97A 3DA6A 3H4JA 4RFMA 4MD8E 5DFPA 3W18A 3VUDA 3HV5A 5E8ZA 4D1XA 2X2LA 3E93A 4QTDA 3FKLA 4AS0A 3R1YA 4IW0A 4CYIA 3FDNA 3I60A 3HUBA 2R3RA 4ZTHA 4G3CA 5F9EA 3MJ1A 1YDTE 3KL8A 2WELA 1R1WA 4ERKA 1NW1A 3R9DA 1TQIA 1L3RE 3TXOA 2G2FA 2OJJA 4AN2A 1WFCA 3NAXA 3F5XA 4L3JA 4LOQA 4MWIA 2YLFA 4QRCA 4O21A 2WGJA 4QYYA 2QR8A 5F94A 5EKNA 3C4XA 4EQMA 4A9UA 3MW1A 5BNJA 3F88A 4W4WA 3VO3A 2WQEA 4M69B 3RNIA 4WO5A 3WZJA 4EYJA 2W1DA 3UOJA 4PY1A 2PUIA 3FI8A 4U0IA 5J5SA 1QMZA 3BE2A 3E8NA 4ZLYA 2PL0A 2B53A 2PVMA 4FGBA 4G3DA 4Z16A 2YWPA 5TO8A 1ZMUA 2NRUA 4D2WA 5LOHA 3QD2B 1OL2A 2YITA 4CTBA 4ZLOA 3TKUA 5FRIA 4TL0A 3CPBA 5BYZA 3ZFYA 5LVNA 4X2NA 4FMQA 3FMNA 4KIPA 4JQ8A 4XP0A 3TDVA 2WTKC 3D5VA 5EW3A 3PVWA 4CFXA 2BTSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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