3Q9WA

Crystal structure of human ck2 alpha in complex with emodin at ph 8.5
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
GPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and functional analysis of the flexible regions of the catalytic alpha-subunit of protein kinase CK2
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 112
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3q9wA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3q9wA02
2C5VA 2CGWA 4G17A 4JQ8A 1R39A 3PJ2A 4EK8A 3FLWA 5AR5A 2RSVA 1QPCA 2IW9A 5E91A 3PPKA 4G1WA 4JL9A 4FKIA 3U9NA 3TWJA 3EYGA 4D5KA 5BVFA 3K5VA 4R6VA 3I5ZA 2UZDA 2XYUA 4FV4A 1JKLA 3A60A 4O27B 4U80A 4WIHA 3D5XA 3W32A 4EK3A 3W8LA 4MD9E 3HMPA 3W16A 4DFUA 5D12A 3FSFA 1P2AA 2XRUA 2IG7A 4C4EA 3UO5A 4J8MA 3ZFYA 4N0SA 3EZRA 2C5XA 5KNJA 4E26A 1ZWSA 3E92A 3P7BA 4RT7A 3CQEA 4YJOA 5E1EA 3TZ8A 4MBLA 2BR1A 4QQTA 3VBTA 5E8YA 4QOXA 2Y7JA 2R3IA 2ACXA 3HRFA 2BKZA 4RRVA 4YJQA 2XK6A 4IC8A 3DCVA 4XLVA 4BDFA 1P4OA 3T3VA 4ID7A 3TNPC 4E4XA 3TUDA 1OPLA 5L6PA 3VAPA 4XH6A 5FBOA 5CQWA 4PDOA 1T46A 2O3PA 2YIYA 4MBJA 3TL8A 2Y6MA 2XCHA 3HRBA 3HEGA 4FSZA 4MNFA 4MK0A 4EOSA 3BQCA 3NVMB 1GOLA 2IVUA 3VS6A 5JK3A 3IW4A 4BCGA 3VW6A 4C3PA 4GK3A 1JLUE 2UZLA 3DTWA 3ZU7A 4CRLA 4IAFA 4PPAA 2XUUA 1TVOA 1OKVA 5EQEA 2H34A 5GIPE 3S0OA 3F3VA 2IWIA 5EG3A 3BHVA 4GVJA 2UW9A 3IDBA 4GW8A 2YCRA 4ZIMA 2OXXA 5KMKA 5M44A 4B7TA 5A14A 4CMTA 3EN9A 5K5NA 2ERKA 2FA2A 5AR2A 5CEKA 2PPQA 2JFMA 2P33A 3L9MA 2FSMX 3HNGA 4XG9A 4YTHA 1MQ4A 1NY3A 5E8TA 3SW4A 5K3YA 3ZZEA 3SA0A 4FG9A 4KIKA 4DG0E 3MH1A 3PSDA 3OXTA 5EW8A 2XK9A 2R7BA 4K9YA 4QMUA 1Y8GA 4I4FA 4WO5A 3R30A 4O91A 2JKKA 2ZV9A 5AWMA 3AGMA 2XKFA 5K0KA 5ACKA 4F09A 4F70A 1YXUA 4GU9A 2UUEA 3UO4A 1SNXA 5JGAA 2HK5A 3DLSA 3ZRMA 3T9TA 1G8AA 3NWWA 4AZTA 4BWXA 4ANNA 4QMOA 3RAWA 2G9XA 4W9XA 3TM0A 4W4XA 1Q8YA 5CAOA 5HNBA 3V8SA 5A4TA 2C6LA 1APME 3M1SA 2P55A 3PSBA 2X8EA 4U41A 4G5JA 4C4IA 3H3CA 3OY3A 5AIKA 2W1ZA 5HLNA 2J0KA 4QNYA 2ERZE 1H8FA 1WBNA 2YWVA 4K0YA 4KIPA 3EFJA 4QO9A 3VS5A 1OMWA 4FT5A 4U81A 5J9LA 3OOGA 3Q04A 4DEGA 4F08A 3VRYA 2HXLA 1V1KA 2R0UA 3FI8A 2PUPA 3WIGA 5KBRA 3LFBA 3A8XA 5EKOA 4IM0A 4UWBA 4F1OA 4YNOA 4ANOA 2SRCA 4ASZA 4D0XA 2WMQA 4FTRA 4HGSA 4BRXA 2B1PA 3A7JA 3CPBA 3CJGA 3QQHA 4FNZA 1TQPA 3WOWA 3DK6A 3W2SA 4O0XA 3VW8A 5JFXA 5AAFA 5KE0A 2JDRA 2IZTA 3P5KA 4KABA 4U3YA 5EOBA 5CALA 4J99A 1GZOA 1NXKA 5M07A 4IFGA 4TXCA 4CFWA 3RPSA 2I1MA 4FX3A 4KIKB 2RFNA 4UEUA 4JIAA 1REJA 1JKSA 3HMIA 3LXKA 5HG5A 3BGPA 4QMZA 3DQXA 2WKMA 1Q41A 4MXYA 4HYIA 3FMHA 4G3FA 3G5DA 3VRZA 3MJ1A 2BRBA 4BZOA 3TTJA 3N4VA 2FSLX 4DGMA 3UPZA 4QMMA 3SQQA 3FWQA 4RWJA 4EOPA 3SC1A 2PUNA 4DLJA 3VS7A 1CDKA 2QCSA 4GUBA 1UU7A 1W98A 2BILB 3DU8A 3KXNA 4L53A 1YQJA 4GFOA 4A9YA 5CXZA 2VWIA 5GZAA 1FGKA 4AW2A 4IAAA 3H10A 4UX9A 3TI1A 4AZSA 2XK7A 4HNFA 2XKCA 4WA9A 3UE4A 3UVPA 1Z57A 4TKSA 5DH3A 3TV7A 5CU0A 3OWJA 3WZDA 4HPUE 2BALA 2JKQA 3LJ0A 3ORNA 4ZJJA 2B0QA 4ZY5A 4R3CA 2F7ZE 2NPQA 4BF2A 5HX8A 1UKHA 5E8WA 3PE1A 4X2NA 4AN9A 2OZAA 4G31A 3QRJA 2UW0A 2JIUA 3H4JA 5KX8A 4QP1A 2R3JA 4FEXA 1U5QA 1ATPE 2HAKA 4LRMA 3QLFA 4NCTC 3ZXZA 4D2PA 5AV3A 3ZYAA 3BU6A 4K2RA 4BCFA 4G3CA 3DNDA 3VBQA 3FQSA 3WZUA 5LCJA 4D2VA 4EH5A 5BMSA 4UMPA 4H3BA 5HGIA 3Q2JA 3D2KA 1CM8A 5EM8A 3A62A 3FL5A 5IA0A 3RZBA 4GRBA 2C0OA 2BRMA 3NZ0A 3R1YA 3ZSIA 2NRYA 4DT9A 2ONLA 5C8NA 1ZYJA 4ASDA 4EKKA 3B8QA 3MVMA 3H0YA 3DXPA 4EOQA 5KMMA 2LGCA 2QQ7A 3QTXA 3W2QA 3AC5A 5HG7A 4Q5EA 3EFKA 2WNTA 3DLZA 4HVDA 1PYXA 4DH7A 1YOMA 2PVKA 3OS3A 5DE2A 5IA5A 4C4FA 5DBXA 3EH9A 3G9NA 4N6YA 4MCVA 4YTIA 2W4OA 4ZEGA 5LXMA 2XIKA 3D5WA 2HYYA 5E8UA 2XK4A 4OR5A 4FZFB 4O1OA 3FPMA 5FWKK 3UC3A 4RFZA 1H24A 1VR2A 3OC1A 4UXLA 3TKIA 4BDIA 4AT4A 1H1SA 3NPCA 4QYGA 4PTCA 4TPTA 4RFMA 4IB5A 5DGZA 2VO0A 5I3OA 2OICA 4D9TA 5CF5A 5CVGA 3FQHA 3MB6A 2OZAB 1IAHA 1PXJA 5CU6A 4M13A 1QPJA 4QYHA 4M69B 4FTJA 3G2FA 5TKDA 3AT3A 4IC7A 2FUMA 4CEGA 5BPYA 1ZARA 3NMUF 3CTHA 3BBTB 3BV2A 3G0EA 4E3CA 3ACKA 3NCZA 3LFNA 3HUCA 4O2ZA 2VTTA 4XJ0A 4BBFA 2Z7LA 5CSVA 3SD0A 4B8MA 2J51A 4Y83A 2BHHA 4YO4A 4OW8A 4QMYA 3PG1A 4AFJA 2VAGA 3MY5A 3QD2B 4JG7A 2BAJA 3ZO3A 4IE9A 4L68A 1OIUA 5E8XA 5B2KA 3C4FA 4RZVA 3HDMA 2BIKB 3KN6A 1KUTA 2VRXA 2WD1A 4DFBA 4E6AA 3PWDA 5AR3A 2X8DA 2G2FA 4K8AA 3EB0A 5HX6A 4BGGA 4TN6A 3LCKA 4QNAA 5CASA 3R7EA 5EM7A 2OJJA 4OT5A 3F5UA 2REIA 3KF4A 3R8UA 4DEEA 2C6DA 2R3MA 4RIOA 1NT2A 4CGAA 3LCSA 4RIWA 1IR3A 1LPUA 2WXVA 3DBEA 4BI2A 3ZBXA 3Q9XA 3WBLA 3QQUA 4FG7A 4OUCA 4B8LA 4EH6A 4GG5A 1XH9A 3P0MA 3QQJA 4BWKA 3DAEA 5BVOA 3HZTA 2VNYA 1YVJA 4XHKB 3UQCA 4F6WA 2C6TA 2F2CB 3HDNA 4C36A 2E2BA 2XNPA 5CSHA 5B2MA 4BTKA 3GU8A 2XNBA 2IVTA 4V04A 4OTGA 5M55A 4EOLA 4EORA 1WVXA 4RMZA 4V05A 2WQNA 3ITZA 4M84A 1JVPP 4DGOA 1UNLA 4QRCA 4KIOA 2P3GX 4S33A 2WU7A 2QLQA 5LQFA 2HY0A 2UW4A 3O2MA 5K4IA 4IWDA 1BYGA 1XWSA 3D9VA 3LFCA 4Q5HA 4ITIA 3NUYA 2B53A 1SVHA 2WB8A 3LFQA 4KRDA 3PRFA 3LLAA 4IH8A 2PMNX 3NUAA 3ENHA 3FZPA 4S31A 4PNKA 5EHLA 4D4RA 4FE2A 3UVQA 5JQ8A 3JYAA 4IQ6A 2X4ZA 4AGUA 1Q8UA 4U43A 1VZOA 2YDIA 3BQRA 4BB4A 2JAVA 3DS6A 3O71A 2YLFA 4W9WA 5ITAA 1NW1A 1PXKA 3LZBA 3TJCA 2OJFE 3JUHA 4JBOA 4YPSA 3ROCA 1PXIA 4GEOA 3I7CA 4I6HA 3OXZA 4FKLA 4FIEA 4DEBA 4QTCA 2GS7A 4FBXA 4RIWB 3KFAA 5A3XA 3JXWA 3NYNA 3QWKA 3G6HA 2ITZA 4F7NA 4GH2A 3A99A 4JDHA 5FM3A 4YJSA 1BI7A 2VUWA 3Q6WA 2B9IA 2V7AA 4X3JA 5AR8A 5ANJA 3RGFA 5IZFA 3E62A 3R9RA 4JT3A 4L67A 4QQ5A 3C0GA 4ZY6A 2HZIA 4ZK5A 1O6YA 3OT3A 3V3VA 2AC3A 2XEYA 3RZFA 2R3PA 3BWFA 3RMFA 3GC9A 3QC4A 4YZNA 5DWRA 4Y85A 2C5OA 2VTJA 5FEQA 2AUHA 5GJGA 1YXVA 5L8LA 3COKA 2KULA 3A7IA 4J7BA 3GC7A 4YZMA 3NEWA 1GZNA 4HZSA 3MGYA 3ANQA 5FBNC 4A4XA 2VGPA 3C4XA 5FDPA 4D0WA 1S9IA 3KGAA 4TTHB 4FF8A 3GBZA 2OK1A 1E1VA 5AR4A 5IMEA 3C13A 3MH0A 4QP9A 3K5UA 3E8NA 1MP8A 4MF1A 2BPMA 4YSJA 1GIHA 4YPDA 5D7AA 1W84A 3OTUA 2VTOA 2W17A 4V0GA 4BBEA 3PPZA 3F2RA 1LUFA 3O7LD 3F88A 3RCJA 2A19B 3R7YA 5IU2A 5GJDA 5AP5A 2QODA 4GJ2A 1OECA 2VTLA 3EN5A 3K54A 1YHWA 3EQPA 4C2VA 4XBRA 2OIQA 2PZPA 4X21A 2CMWA 2OO8X 4PTGA 4Z16A 1FOTA 2WEVA 4FTQA 2NRUA 4QPMA 4BI0A 5FTOA 2O0UA 1FVRA 3EKNA 3PLSA 5M57A 2QOIA 3CJFA 5BUJA 4BIEA 5AUTA 5I9VA 4F63A 4CV8A 4CMUA 4MYGA 2GU8A 3QCQA 3W2CA 4F1TA 4YTFA 3SXSA 3WF5A 4L45A 3SG9A 1YRPA 4TYEA 4Z3VA 3V5LA 4BHNA 4GIHA 3LM0A 3PUPA 5EOLA 5H9BA 2BZKB 4XRLA 4Q9ZA 3RWQA 2X2MA 4I0TA 2XIRA 3LXPA 2C0IA 1SVGA 3BU3A 2B9JA 2W1DA 3KEXA 4ZSJA 4E5WA 5HBHA 2IZRA 2GS2A 4RWLA 3O8PA 3UMWA 2IZUA 2Z2WA 3IOKA 3NYXA 4FL2A 4JRNA 4DFLA 3KQ7A 3LOKA 4NEUA 3F61A 4ANLA 2WTWA 3QRIA 4ZTNA 5B2LA 3ZO1A 5KMLA 5CEMA 5HO8A 3KK8A 3QC9A 4ZLOA 2HXQA 4V0GB 3FQEA 4GK4A 3EIDA 2R3LA 3E88A 4MWIA 4AN3A 4TWPA 4D2TA 4YZDA 4E6QA 3WZJA 3ZFXA 3ZLYA 4XUFA 1Y6AA 2EVAA 5AADA 3ERKA 5HORA 4MKCA 4I4EA 2F49A 1YHVA 3EQBA 2IO6A 3EFWA 4N4SA 3QXOA 4ACGA 4BCNA 5D7VA 3ZSHA 1YXSA 2CNQA 3EKKA 4HNIA 4PNIA 4II5A 1ERKA 5BVNA 3LKMA 4CFNA 2W4JA 3QUPA 1E9HA 4C4HA 1OL7A 4E8AA 4RX7A 3MTLA 4IM2A 2X9FA 3D14A 1XBCA 4JJRA 1IA9A 3AXWA 3VJOA 3DNEA 3I81A 3QZGA 3LXNA 3R1QA 3V01A 3ATSA 4RWIA 2GCDA 3DXQA 3ZM9A 3AGLA 5IA3A 1YWRA 3ZUTA 3OZ6A 5FQDC 3ID6C 3PPJA 3VO3A 4WNPA 4ZTHA 4P2KA 4A4OA 3JY9A 2J5EA 1XO2B 3QKLA 5AV4A 4K33A 1OI9A 2C3KA 5L2SA 2J0MB 4CCBA 4DINA 1I09A 4AZWA 4CD0A 4R5SA 3LFSA 4F7JA 1M7NA 3BZ3A 3RAHA 3RVGA 3VQUA 1XBBA 2OFUA 1BLXA 3L8VA 4L9IA 3M2WA 2F2UA 1OKYA 3Q2MA 3RHKA 1H25A 3UJGA 4KSQA 1H1QA 3RI1A 5H2UA 3QD4A 3KA0A 5AEPA 2XNNA 4ACMA 2RL5A 4V01A 4FGRA 3HV3A 2YIXA 3UMXA 4FOBA 2R64A 5CVFA 4LGHA 2XH5A 3PVGA 3COIA 4Y95A 4JOAA 3O8UA 3CR0A 5LVMA 2ZM3A 4I5HA 3VS4A 2YWPA 3CXWA 4ANQA 3BYSA 2ITPA 2VWXA 3Q52A 4EH7A 4O38A 3SG8A 3U6JA 4YR8A 4J97A 2XIZA 3FLZA 4NM7A 3A7FA 4RX9A 2C6KA 4RVMA 4UYNA 2W1CA 1U5RA 1FVVA 4AA4A 4EOKA 5J5SA 3I79A 3V5QA 2E9VA 5D10A 5F95A 3GB2A 4OTPA 4MQ2A 4NT4A 5EFQA 4RGJA 2JITA 2X7FA 2XIXA 5EDQA 4WRGA 3GUBA 3ATTA 3QTQA 3ORKA 2G01A 2W1EA 4EOOA 3OP5A 4FYOA 4FKQA 4I94A 3H30A 4J96A 5I9YA 2JKOA 1HCKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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