3Q9YA

Crystal structure of human ck2 alpha in complex with quinalizarin at ph 8.5
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
GPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and functional analysis of the flexible regions of the catalytic alpha-subunit of protein kinase CK2
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 107
structure length 327
sequence length 327
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3q9yA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3q9yA02
2GCDA 2YDIA 1UNGA 4BBEA 4YSJA 4F1TA 2V22A 4IC8A 2NRUA 2BRGA 4FI1A 4BTKA 3SGCA 4RVTA 5CQUA 3PXQA 3NIZA 4IHPA 1GNGA 5HIEA 4YLLA 5FXSA 4F7SA 3QAME 3QFVA 5FXRA 4KIOA 1YQJA 2F4JA 3FSFA 3HRCA 2WTDA 5CF8A 3LFQA 5GJGA 4WIHA 5J7BA 5KBQA 4QMNA 1OKYA 1YW2A 3G2FA 4E8AA 5CASA 4QYEA 5FTOA 4FV8A 3LQ3A 5HG7A 2HYYA 1H0WA 5AP0A 3ZM9A 1FVRA 2XNPA 3UG1A 1OIRA 4JXFA 5A4EA 3POOA 2RGPA 2WMUA 4FTAA 4MX9A 5CI6A 5BVDA 2PZYA 3EIDA 3ERKA 1YOLA 3QUPA 4G3CA 3D7TB 5GIOE 1O6KA 4C4JA 3VBWA 2EWAA 3KL8A 5AV3A 3WF8A 4PUZA 2VTOA 1BUHA 4N70A 2YM4A 3QCXA 4FKPA 1YDTE 4RC3A 1WBOA 3ZRLA 5IEXA 4FE2A 2WQBA 3EQGA 2PVMA 2QURA 3TIZA 4QMXA 3ACJA 4MXCA 4R3CA 2X4FA 3LIJA 5AUWA 4O1PA 5GINE 3KULA 1YRPA 2R3GA 5TO8A 1FGKA 4I5MA 2WEIA 4MQ2A 1NW1A 3NAXA 1JKSA 2W1DA 3OEZA 2H96A 3ZYAA 3VAPA 1Q8TA 2W4KA 4ZK5A 3ZCLA 3O8TA 5EKNA 3ATSA 4H1MA 4FTNA 2H34A 3FI8A 5ANDA 2NPQA 2WQNA 5LVNA 2QI8A 3VRZA 1U46A 4DFXE 1ZAOA 2VO0A 4YZCA 2QOLA 5M4IA 3PY0A 5HO7A 2OU7A 3BHTA 5JGBA 2C5XA 4QMYA 3NUYA 4E73A 5EYCA 2ERZE 5HGIA 3U8WA 3HMMA 4HGLA 4CTCA 4EQUA 2Z60A 2R64A 4YTIA 4FF8A 3UPZA 5IF1A 4JT3A 2F2UA 4FR4A 1CM8A 4BCNA 5CSPA 4OT5A 4NSTA 3KY2A 4K18A 1E1VA 4AN3A 3QXPA 4II5A 1Z5MA 4FZ7A 2RF9A 4LMUA 4HVHA 1PY5A 5LCKA 5IA5A 4YU2A 3NVKI 3FUPA 1JSTA 3PJ2A 4I94A 1BMKA 2Q0BA 4G3FA 3V5JA 3SAYA 3VUGA 4W9XA 5HLNA 3SOCA 1JOWB 2BRMA 3WIGA 4BZNA 4D1SA 4C4GA 5GIPE 4D1ZA 4YZ9A 2F7ZE 1OBDA 4BY9E 4EC9A 4R7IA 3UPXA 3DKCA 1ZOEA 4WG3A 5EOBA 3OROA 3P9JA 5GJFA 4AW0A 2OJJA 5BVWA 3MBLA 4IWOA 3JS2A 4HGSA 4O7SA 3D7ZA 4FVPA 2R3QA 1M14A 3KN6A 3TZ7A 3QRTA 1A48A 3D83A 5I4NA 3QWKA 4ANLA 2VNYA 3LLAA 4I4FA 4WHZA 5ANEA 3FYJX 3R9NA 3WIKA 1ZARA 3EQCA 2FUMA 3BIZA 3FZSA 1W84A 5CEQA 1IA9A 4UV0A 4G31A 4Q9ZA 3EN6A 3QRUA 3BYMA 2BAKA 4YLJA 5DG5A 2OKRA 4Q5HA 4I5PA 2C3KA 4M69A 3WF6A 3A7HA 3ATTA 3LM5A 5CANA 4JAIA 3MVMA 1WMKA 2C3IB 2ITTA 3F5UA 3IW4A 3ODYX 4LL5A 2GPHA 4NH1A 2ERKA 3E93A 3OW4A 4QP6A 3HDMA 3KXMA 4C33A 3ORIA 1FMKA 3Q9YA 4TYHA 3JPVA 3LE6A 4XEYA 5DH3A 5DEYA 3TZMA 2OZOA 4FEXA 4BCPA 2C6LA 4H58A 4FKQA 3NIEA 2ESMA 2XIXA 3M42A 5FM2A 3BHYA 2XP2A 1ZMUA 3CIKA 4TYGA 3M11A 5HVYA 4L52A 4BVUA 4HNFA 1YXVA 4FV3A 4LOOA 4BHZA 4EH8A 4L3PA 3RI1A 4D2WA 3OMVA 5JFVA 4IADA 4PPBA 4GT4A 4QQJA 4QNAA 1UWHA 1J91A 3FXXA 3RINA 3S1HA 3BHVA 5I9YA 3OXZA 3PSCA 4LGGA 3PWDA 2WPAA 4QD6A 4IC7A 3NNUA 3JXWA 2PUIA 4PV0A 4MD9E 3KMUA 2X81A 3VS3A 2GQGA 2Y4IB 4CFNA 3V6SA 4F6WA 2BKKA 1YKRA 4YPDA 2IZTA 4YTHA 1OL6A 2OIDA 2XJ0A 4AZTA 3ACKA 3FKNA 1UV5A 3VBXA 3VC4A 4FZFB 4UMPA 1YHSA 1YI6A 2DUVA 2OZAA 3KULB 3OP5A 5H8BA 2PZ5A 3ZC6A 4FV9A 4L67A 4GKHA 1R39A 2X6EA 3OD6X 3L9MA 1BL7A 2W1ZA 2DS1A 4M68A 4AOTA 4DT9A 4WNOA 4QMSA 3GUBA 4EH4A 3LXNA 4LV5A 3KRXA 3R6XA 2V7AA 3F2NA 4BDCA 4EOQA 4ERKA 1QPDA 1V0PA 3DKOA 3NUNA 4I22A 4AZVA 4ALUA 3TT0A 2GSFA 3U4UA 1GZKA 2B54A 1TQPA 2VTJA 4GKIA 4EOLA 4A9TA 4PDYA 1J7LA 2EXMA 3FZOA 3N51A 4JBQA 2C6DA 3FY0A 4D2RA 4MWIA 5K4JA 2UZBA 4TWNA 4UXLA 5EHOA 2BMCA 4UN0C 4O7TA 3I5NA 4EBWA 3SOAA 4YTCA 1BYGA 1JPAA 4YJSA 4K0YA 5HG8A 3PDTA 2WAJA 4IAKA 3ZRMA 5AR3A 3CC6A 2PVNA 4X6QC 3IK3A 4EQCA 4UMUA 3FZRA 3FZ1A 4F1MA 2G1TA 2YJSA 2VAGA 3BELA 3DLSA 4QTCA 3VUTA 5EOLA 4BKZA 4U97A 2QD9A 1WBVA 4H3QA 4OT6A 5KUPA 1YHWA 2ETMA 3KEXA 5IUHA 2Z02A 5IQFA 4QTAA 1OITA 2SRCA 4RJ8A 3PSDA 1PYXA 4DN5A 3FMKA 1H1RA 5ETFA 5FTQA 4RIXB 3AC2A 2QO2A 4WD5A 4GCJA 1KUTA 3QRKA 5B2MA 3DTWA 4FUXA 3UVRA 4GVJA 5M55A 5FEQA 3ORMA 4EOOA 3HZTA 1KOAA 1MQBA 4AT3A 1KE5A 2QO9A 4XNEA 3GC9A 3PWYA 4U41A 2X7OA 4BDBA 5HBJA 2YDKA 4G6NA 2ZMCA 4E20A 4U40A 4JBPA 2X0GA 4QYYA 4D2VA 1Q8YA 3EZRA 4V01A 4QQCA 3VRYA 2BRNA 2C0IA 4JIAA 4GU9A 4LM5A 3LMHA 3ZXTA 1F3MC 3L8PA 4C34A 4GUBA 5L8KA 3QD4A 1OPLA 5A4CA 4NM3A 2C1BA 5E8TA 5FP6A 4D5HA 4EHVA 2CGXA 2HAKA 2QVSE 4M69B 5ANKA 5A4QA 4F9CA 1WBWA 1XJDA 4TN6A 4ALWA 3QTQA 5HNBA 2UW3A 5HX6A 5L8LA 2HK5A 3MJ2A 4N6YA 2C5OA 3RHKA 4JL9A 3PVGA 3KRRA 3Q4TA 5L4QA 4TYHB 5HX8A 1OL7A 2PZRA 4GL9A 4XV2A 1HCKA 1F0QA 5AR8A 4AACA 4JJRA 1M2RA 1UU3A 2B52A 5A4TA 1OIUA 3ZOSA 2J0MB 2A19B 2BDJA 4W8DA 5HKMA 4ITIA 4F70A 3NUPA 3PA4A 4FSNA 3C7QA 4FEQA 2VNWA 4BWXA 4IFCA 4AGWA 5IMXA 3ORZA 3OWJA 4HZRA 4XG4A 4DEBA 3CKWA 4HJOA 2PUPA 4DCAA 5I0BA 1UU8A 3A99A 4X2FA 5A54A 2W9ZB 2HWPA 2YIRA 2BRBA 3EZVA 1PF8A 4AUAA 2A2AA 4QMPA 1R78A 3W10A 2QC6A 4BZDA 5E8VA 4UMTA 2JBPA 3P7CA 3H3CA 5E7RA 3EFJA 2OW3A 3GCVA 4M0YA 5I3RA 3C5IA 2VRXA 4FT7A 2O3PA 4IDVA 4JVGA 3ORNA 3QQUA 3F7ZA 5HVJA 4NT4A 4DGLC 2GDOA 1W83A 2OZAB 4FSUA 5DR2A 3PXKA 2VO3A 3VS6A 1ATPE 2B9JA 5EDRA 4HZSA 4I23A 4Q9SA 3CQUA 4F9YA 1KV2A 3FWQA 3F3UA 4F6SA 2OH0E 3LFCA 4V0GA 4TTHB 1Q62A 2WOUA 2ONLC 5CU6A 4IAYA 3LQ5A 4IB1A 3P4KA 1BI8A 5E8XA 3QUEA 4FKTA 4AN9A 4APCA 4C2WA 2CLQA 2J9MA 2Y6OA 5DT3A 2OGVA 4EK6A 3EQBA 2YLFA 2XIYA 3OS3A 4O0SA 3MPAA 4M66A 2CHLA 1SVGA 5I9UA 4BCKA 3TUCA 1RE8A 5T6KA 4DFLA 3Q9XA 4MXYA 3RMFA 3UMWA 3IDCA 3BYSA 3F5PA 4Z16A 2BALA 4CLJA 3D0EA 5HG5A 1CMKE 4Y85A 2JAVA 3LQ8A 4EH5A 2JBOA 1QCFA 4IB0A 1GOLA 3ZFXA 4PMPA 4FKRA 5CU4A 3ZUVA 4JDIA 5JMSA 2GNLA 3DA6A 1YOMA 3C9WA 1VYWA 4R5SA 3AQVA 3PE2A 4GJ2A 2G01A 1RDQE 4H36A 4X6RA 3R7VA 5C03A 4ERWA 3NYVA 4KBKA 4F6UA 3FMJA 1FMOE 5IG1A 5CXZA 1Y8GA 2YIWA 2B7AA 3MW1A 4QP4A 4YNOA 2JFLA 4BKYA 3AD4A 3NPCA 4ASDA 5KNJA 2IZRA 3R02A 4HNIA 1U4DA 5EYDA 2DWBA 3JYAA 1PXKA 4EZ7A 4PMMA 3T9TA 3VUKA 5A3XA 2IW9A 3WE8A 2W1GA 2WEVA 4DGOA 4EH3A 5DHJA 3RZBA 4EH2A 1P4FA 2QQ7A 3HEGA 2X1NA 3IDBA 4IZ5A 4XJ0A 4FKUA 4U45A 3W2QA 2PVKA 3DOGA 4BFMA 1WZYA 1Y91A 2BRHA 5FLFA 4Y46A 5M06A 3QTXA 2HELA 4FIGA 4C62A 2ONLA 2WMBA 4X2KA 4FTQA 3V8SA 2XNOA 1U5RA 3MJ1A 3VHEA 4B99A 4RC4A 5GZ8A 4YC3A 4ANBA 2QO7A 2JKOA 3COKA 4L44A 1GIHA 3PA5A 2FVDA 3VIDA 5G6VA 3GU7A 5BQ0A 5HIBA 1MRUA 3ZO4A 3IS5A 3ZSHA 3GC0A 4YR8A 3FPQA 3JY0A 4FKVA 2QU5A 5FBNC 4LOQA 4YHTA 4AZFA 1CKPA 4WO5A 5HIDA 3VULA 5HVKA 2ZV7A 2RSVA 1H1SA 4XBRA 3WI6A 3S95A 5KMMA 4KSQA 5E91A 4D58A 4IAIA 4BKJA 4KABA 3OG7A 3OCBA 4KKGA 4K1BA 4C58A 4ZOGA 2QG5A 4DG3E 5ANJA 2X7GA 5J1VA 2UW9A 3FLSA 4EHEA 3QGWA 3UJGA 4ZTRA 2GHMA 3QTUA 4G9RA 3OCTA 5EI8A 5TOZA 3RKBA 2VWXA 1WVXA 3ZLSA 2VWZA 4RLKA 2R3MA 4FIEA 3LVPA 3A62A 2BZKB 4NUSA 4BGHA 3UP2A 2HOGA 1KOBA 2CMWA 2E9VA 3QWJA 4ZSGA 2CKOA 2WGJA 4M97A 4HVSA 3MTLA 3IQ7A 3BEAA 4CQEA 1J3HA 4DG2E 3NRMA 3SD0A 4YSMA 3UDBA 2VTPA 3PRIA 3ORPA 4MEDA 4NZWB 5AP5A 4IAFA 3NCGA 4JDJA 4AGCA 3FHIA 4CFUA 3FEGA 1FOTA 1KV1A 3KVXA 1J1BA 3QZIA 4KNBA 2YEXA 3OOMA 3PRFA 4IH8A 5CAVA 5K0XA 4GSBA 2YAKA 4O96A 3DJ6A 1PMVA 3R9HA 3R1YA 4JS8A 3SRVA 4EONA 5GZAA 3RWQA 5EM5A 4GG7A 3H9RA 5J5TA 1QPJA 4YHJA 5I9ZA 5BVOA 4APPA 4C38A 2C3JA 5E90A 4FTMA 1NT2A 2XK6A 4YGAA 2G2HA 4JIKA 5C8MA 3G5DA 1Q3DA 3TUBA 3GU6A 2ITOA 5IH5A 2WMWA 1FGIA 3LJ0A 4FUYA 5EHYA 4CRLA 1H4LA 3Q4UA 2VTLA 5CEKA 3TI1A 3LAUA 2IZUA 3VBTA 4O7RA 1YI4A 4C4FA 4IWPA 3UBDA 3PVUA 3SDJA 5DI1A 5BPYA 4DTBA 4XG9A 5CZIA 3MI9A 1DS5A 4NM0A 1NVQA 2C0TA 4BTFA 5AV1A 1K3AA 4FL1A 4FK3A 4YJTA 4NFMA 4P2KA 5IQHA 3D2KA 4XG6A 2YZAA 4RWIA 3TNIA 1PKGA 1MP8A 3V3VA 3KK8A 1U5QA 3A2CA 5FWKK 4BDFA 4CQGA 4F64A 2CN8A 1OL5A 5EH0A 4BYIA 3QQHA 2F57A 4QMMA 4CT1A 4FBXA 5J8IA 4QQ5A 5K9IA 3JR1A 4QMLA 4LMNA 5CNNA 4E93A 4NW5A 5JFXA 2QHNA 4WUAA 5KMJA 1GZNA 3GC8A 3NS9A 5EQPA 2WMQA 3O50A 2J5EA 1X8BA 1UKIA 2ZJWA 2WZJA 2XIZA 2NO3A 2F7XE 3EKKA 3HNGA 3I60A 3QALE 4RWLA 3W55A 3TEIA 1YOJA 3QYWA 2PU8A 3KA0A 4M84A 2EUFB 3Q96A 5HQ0A 2ZVAA 2VU3A 1LUFA 2R3OA 1IR3A 3G0EA 3MVLA 4NCTC 5FEDA 3OHTA 5IQBA 3DBFA 2UW8A 3QA8A 4GT5A 3RPSA 2PWLA 4AU8A 4XOYA 2BHEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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