3QALE

Crystal structure of arg280ala mutant of catalytic subunit of camp-dependent protein kinase
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
350
structure length
339
Chain Sequence
GNAASVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKAFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A conserved Glu-Arg salt bridge connects coevolved motifs that define the eukaryotic protein kinase fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Mus musculus
total genus 106
structure length 339
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2011-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qalE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qalE02
3GEQA 4U6RA 4A4LA 1YOJA 4QP3A 4X2KA 5JZNA 5CAUA 3PZHA 2JBPA 2YIRA 3GGFA 3SDJA 1K9AA 2PE2A 3MB7A 2XF0A 4M67A 4EHVA 3DJ7A 3CY3A 5EYMA 1U46A 1M17A 5BUEA 3DNDA 4GU6A 4L8MA 3B2WA 2BZIB 4E4LA 2ZB0A 2REIA 1KUTA 2GPHA 2R3NA 4RJ4A 3JXWA 3TIZA 3QQJA 2QODA 4G3EA 2W5AA 4MKCA 5CVFA 4V04A 3ZTXA 4QOXA 4G34A 2YM6A 3LMGA 3PG1A 4QQTA 2E9PA 4D1SA 1JSUA 3P7CA 3K2LA 1Q8WA 4W4VA 4AN9A 5A54A 1FQ1B 4O84A 3UIBA 4UMQA 5LWNA 4FIFA 4QT1A 4EQCA 3IGGA 1YXSA 2VTNA 3D5XA 5AR7A 3VWAA 2YABA 3KL8A 3D2KA 4IB3A 5HE3A 4CT2A 3Q2JA 4DA5A 4MF1A 1PXNA 2P55A 4AOTA 5DYJA 3CKXA 4P2KA 4XOYA 1T45A 4BGHA 4NU1A 5B0XA 3FMMA 2XP2A 4XG9A 4R7BA 2Y9QA 2PK9A 3LJ0A 2J5EA 2JKKA 1NVRA 3UNJA 3ZHPC 2Q83A 3N9XA 4BIEA 4U81A 1JPAA 4UB7A 4FL3A 3BU5A 4ZJVA 2W4OA 3UC3A 4MXXA 1BL7A 1FVTA 4EBVA 2BALA 2GFSA 4YO6A 5FBOA 3VHEA 3LJ1A 4BHZA 3FKNA 4JDHA 5AAEA 2WQMA 3O71A 4W9WA 3R7VA 3QYZA 4EHZA 4Z16A 5HNIX 4Y72A 1SM2A 4XBRA 5DGZA 5HG8A 3KKVA 3BLRA 3FXXA 2PL0A 4J7BA 4ZIMA 4AUAA 1YQJA 3BX5A 2YIYA 4RFZA 2AC3A 3DBDA 4ZZMA 3BHVA 2VO0A 3C0HA 2BKZA 5EM8A 3CIKA 3FLYA 4ZTLA 3OEFX 4C58A 5CTPA 4GS6A 4DGLC 1GY3A 4YGAA 3UG1A 3DCVA 3FHIA 5K0KA 2KULA 2PE0A 2XKEA 3MJ1A 3R7GA 3GP0A 3FEGA 2OBJA 3TXOA 5C26A 1PYXA 2ERKA 2HZIA 2RG5A 4J53A 3GCVA 3WZKA 4XRLA 3DY7A 1OIRA 4NCTA 3I5ZA 5M44A 4CVAA 4RWIA 1J91A 4IXPA 3VRZA 3ZUTA 1YWNA 3EFJA 1YI4A 3VHKA 2JIUA 5IMXA 2R3PA 3DXQA 4ZJIA 3PVBA 5J1WA 4AGUA 3PIZA 4CKIA 1XHAA 2HIWA 2VZ6A 3EFLA 4BCQA 2V5QA 4N4SA 4NW6A 3RK7A 3VJNA 2XA4A 2W1GA 3NYVA 2QC6A 3VS3A 3T9TA 5DA3A 4QMOA 5KX8A 1OBDA 4O7ZA 5AA8A 2PVJA 2C5OA 3VC4A 2WD1A 3QUDA 2YIXA 4BZOA 5KBRA 4M66A 3DS6A 3G33A 4L6QA 4RIYA 4DCEA 4F1TA 4RIXB 2CSNA 4I6QA 4JOAA 1MRYA 3FV8A 5HNBA 3ZLSA 3EQHA 5CSHA 3FHRA 5EW3A 2HW6A 1SNXA 2J4ZA 3EKKA 5D9HA 5IF1A 3SD0A 2VTQA 3SOAA 5IA1A 4FVRA 4I20A 2IZTA 3ZRKA 2BRBA 4FG8A 4J95A 3UTOA 3G0EA 1URCA 3GU4A 1CDKA 4YJPA 4QTDA 4W4YA 4RZWA 4F6WA 3R8ZA 4LQMA 1OKWA 3EQBA 3BPRA 3UC4A 4AAAA 1YVJA 5HLNA 3C13A 3E87A 3WF7A 5CF8A 5E8XA 4D2VA 2QONA 2VWXA 5CANA 2XCHA 3ZXTA 4BIDA 5J9ZA 1Z9XA 3HMIA 3NDMA 4MNEB 4W4XA 3UOKA 3S4QA 3WI6A 4CFNA 5HVKA 4BWKA 5L4QA 5LMBA 2WNTA 3R02A 3QTUA 4MBJA 1ZRZA 3QZIA 4D9UA 3LXPA 5GIOE 2GS2A 4IAFA 3PLSA 1BX6A 2W1IA 3QD4A 4TT7A 4EEVA 4ENXA 5M4CA 5DT0A 1OKVA 1YXTA 4DH5A 5A14A 4BBMA 2B9JA 4GUBA 3SA0A 4IFGA 5K9IA 1ZYJA 3FDNA 4IAYA 3A7HA 1B6CB 1OZ1A 4ZSJA 4AW2A 1E1XA 3PPZA 4BWXA 3UQFA 4FUXA 4YSMA 5HIEA 4EYMA 5FEQA 4I6BA 4E3CA 3C4ZA 4C35A 4DLJA 3PXQA 3OWKA 3NW5A 3FKLA 4G9CA 3RPRA 4ZSAA 4CV8A 2WEIA 2CMWA 4W8EA 3CTJA 3SW7A 3WILA 5DIAA 4BRXA 2W1DA 1GZOA 1O6LA 3G6GA 3OEZA 3OMVA 1Y6BA 3OWPA 4HZRA 5CT7A 4C59A 5CF5A 2BRNA 2PUPA 4G6OA 2DQ7X 3WE4A 2BTRA 2YN8A 5M56A 4KWPA 2AC5A 3AD4A 5HTBA 4FKVA 3TWJA 4F9YA 5IQDA 2YFXA 4P7EA 5AV2A 3F3TA 4FKJA 1H0WA 2WELA 3MVJA 3EB0A 2GNGA 4DCAA 2WGJA 4FGBA 3THBA 3VIDA 2OJFE 3QKMA 2C6OA 2Y6MA 3BWJA 4FTLA 5GHVA 4O0TA 2XEYA 4ARKA 3PUPA 3BEGA 4QMVA 3DBFA 3POZA 2Y0AA 5IKWA 4EOLA 1VYZA 2YJSA 1OUKA 3FUPA 5HIBA 3KULA 2QO7A 3PWDA 3TTIA 4BCOA 5L8KA 2VRXA 4PV0A 4BTKA 4XV9A 1TVOA 3MVHA 3WARA 3ACKA 3NYXA 4K11A 4Q2AA 3TTJA 4YBKA 4D0WA 4YTCA 1JWHA 3MN3A 2O65A 5HVJA 5A4QA 2XNOA 5I9UA 2YM4A 3KCKA 4EOQA 4MTAA 4FT3A 1V0PA 3U51A 4ORKA 4J99A 3VN9A 1YXXA 2GHGA 3BGPA 4AA0A 2VO7A 3LFQA 5AR8A 4B0GA 5DEYA 5LVOA 5EI2A 5EYDA 1A9UA 3FMEA 4IZ5A 4RX5A 3V5QA 2RF9A 3A4OX 3VBTA 5M06A 3FL4A 4IEBA 4YTIA 1IAJA 5CASA 2CKPA 5BVOA 3UOJA 2JIVA 1GIJA 3MW1A 4IX4A 5AP7A 4M3QA 3W18A 5JMSA 5G1XA 3ZO3A 2ZV2A 4H39A 4IANA 5L2SA 4KIOA 1KE6A 3GC0A 3PP1A 5LMKC 1K2PA 2BVAA 2F49A 3TIYA 3SC1A 1PW2A 3V5PA 3W2PA 4JT3A 1PXKA 3Q2MA 3ZFYA 2G01A 3ZO2A 4B99A 4DBXA 2P4IA 3E62A 4FKPA 1U54B 3PSCA 1ERKA 2R3JA 2WPAA 3G90X 4CQEA 3GVUA 4XMOA 2W1HA 3Q5ZA 4WNPA 2JDSA 4JBOA 3K5VA 4I6HA 3QD0A 3ZSHA 3DK3A 5CQWA 1OBGA 3FL5A 3AD6A 2CKQA 4JBPA 2Y7JA 3OY1A 3MFTA 5EK7A 4RLLA 3ZYAA 4BVUA 2PZYA 5L2TA 4CTBA 5CEQA 5IPJA 5HKMA 4CZUA 1OGUA 1P14A 3FPQA 4HCTA 1R0PA 3GU6A 2V55A 1OL6A 3UQCA 4AX8A 2WTKC 3VQHA 4YHJA 5J9YA 3AGMA 5HD7A 3NLBA 2GDOA 3DFCB 4AWIA 3FZ1A 3W2CA 4PDSA 4BDJA 3ORZA 5CZHA 1G3NA 3GOPA 5DLSA 5H8GA 3UZTA 3HUCA 2XUUA 3QZGA 2QKRA 2R3LA 2UZTA 3OVVA 4WIHA 3W32A 4A06A 4PRJA 4UN0C 3UZRA 5HX8A 2JAVA 4FE2A 4X6QC 2PTKA 3KRRA 4FG7A 4XG3A 2VWIA 2UVXA 3QA8A 5GINE 5IISA 4DC2A 3SV0A 5I9YA 4O7WA 3EL8A 4X21A 4A9RA 4AQCA 4MQ2A 5HE2A 4FOCA 4E1ZA 5KZ0A 4BCPA 1M7NA 4TKSA 3MB6A 4C37A 2O64A 2X0GA 3LM0A 4FT9A 3EYHA 2XIXA 1PY5A 4QMPA 4DEBA 2C6LA 4I21A 4CLJA 3F3WA 4U45A 3A8WA 5A3XA 1OPKA 4LYNA 3WE8A 1PXPA 1SNUA 1MRVA 2GU8A 3QTXA 3GCPA 4O83A 4ONAA 3LM5A 3EQPA 4R5YA 1H25A 3AQVA 3R83A 4GG5A 4GMYA 3A7GA 4OTGA 5E91A 1WBWA 2BZJA 5FP6A 3NX8A 2O3PA 3ORPA 2HXLA 3D2IA 4DGGA 4YLKA 3NW6A 4K8AA 3C51A 2FVDA 5JRSA 3GXLA 1IA9A 3D9VA 2GHLA 4UXLA 5CSPA 3BU3A 2YCSA 4UMRA 2JLDA 4CFFA 2WEVA 2VUWA 3C4EA 5JGBA 1XWSA 3DKOA 4JBVA 3RZBA 4JVGA 4C8BA 4DEGA 5ETFA 5JGAA 4MWHA 4FUYA 4L01A 1H26A 2JDVA 3QTRA 4MD9E 3QTQA 4WUNA 4BFMA 3PE2A 5HOAA 4O82A 3HRCA 1VR2A 3LKMA 4FV8A 4RC3A 5DRDA 4QP9A 2O2UA 1ZOGA 4CXAA 2CLXA 2H34A 5DBXA 1V0BA 2OWBA 1OL7A 3MFRA 5A4TA 5EH0A 3LE6A 3OOGA 2J5FA 2C3KA 1I09A 5BYLA 4Z7HA 2YEXA 3R8PA 3FMNA 3VVHA 2IJMA 2WXVA 2OLCA 5DHJA 3TUCA 2EXCX 3VUKA 3MWUA 3NUYA 1YWVA 2X4FA 3VS7A 2XKFA 4TYJA 1W0XC 4RWLA 4D4YA 2F57A 3NAYA 4IBMA 2PMOX 2QD9A 4O0YA 5HO8A 4ZK5A 1ZY5A 4RQKA 3D7TA 3V01A 5HE0A 3ZFXA 1Q41A 2ZM1A 4EONA 5HZNA 1RQQA 5AR5A 2QURA 3W8QA 4FEXA 3ZLXA 5HBHA 4YSJA 3CPBA 2B1PA 1XR1A 4WA9A 2WIPA 3PPJA 4PPAA 2JFLA 5ANOA 3P23A 3R73A 4V01A 4B6LA 5IH5A 1A48A 4FTJA 4FEWA 1Y8GA 4D58A 1U4DA 3PE1A 5C27A 4PX6A 3UVRA 2C6EA 1Q8YA 4AGCA 4FX3A 4E4NA 2C0IA 4QQCA 3WF8A 4E7WA 3VF9A 3ZEPA 3FMHA 3UMWA 4HVGA 4KBAA 1B38A 1Q8UA 5IEXA 5EKNA 3ID6C 4FSTA 4J8MA 3SX9A 3SQQA 4U42A 3AC2A 3EN7A 2CJMA 4ZP5A 3W1FA 3GU7A 4WRGA 2SRCA 3RVGA 3PVGA 4I5HA 4GT4A 3SAYA 3KCFA 2WFYA 5HCYA 5LMKA 3CGOA 3EN9A 4YNOA 3PZEA 4QMSA 1WBOA 3FZTA 3DTCA 4K18A 4CFVA 4D5HA 4C36A 3EJ1A 2CCIA 3E8NA 4GK3A 5J95A 1IEPA 2B4SB 1MP8A 2XK7A 3F5UA 3QGWA 4M0ZA 2Z7LA 4L68A 2HWOA 4JNWA 3W2RA 2GHMA 3OXIA 3SHEA 2UZVA 4WKQA 2XK3A 3MBLA 5CQUA 3AC3A 3DLZA 2BTSA 3PYYA 4YLLA 2Z02A 2WTCA 2QU6A 3MH1A 5JGDA 2J6MA 4L00A 4QMYA 4BZDA 1F3MC 4EZ3A 4USEA 3MPMA 2JGZA 2R2PA 3L8VA 3PJ3A 5CXHA 3TKIA 3ZCLA 4M69B 3Q3BA 4DEAA 5EI8A 4KD1A 4QNAA 1WBSA 2OH4A 2OJIA 2VTTA 3F5GA 1H07A 4AP7A 3HV4A 3PSBA 4WNOA 2IW8A 5A9UA 3LFEA 5KCVA 1I44A 3E93A 2WOTA 3PA5A 4OUCA 2F4JA 4BY9E 2X6EA 1L3RE 3K54A 3OT3A 4EUUA 5EM7A 3G0FA 2W1CA 4BDFA 2EWAA 4NM3A 4RX7A 4WOVA 4HCVA 1W84A 1OMWA 3GU5A 4QMQA 2GS7A 3O8TA 4OR5A 3QCSA 4AN3A 3DBCA 4ACMA 3GNIB 4IJPA 3MVMA 1UWHA 3TJCA 2BAKA 4DH1A 2FB8A 3UIUA 4FA2A 4K0YA 5HORA 1Q24A 4IWDA 1APME 1BKXA 2HZ4A 3OCTA 3BV3A 3TV6A 4ACHA 2BRGA 4HVSA 3F69A 5CU6A 1NVQA 4E6AA 5EHLA 2XZSA 5CY3A 3GOKA 3LCOA 3W8LA 3CGFA 3G15A 2VX3A 3TUBA 5L6OA 2X1NA 4A4XA 4CG8A 3ZUVA 3SRVA 3P78A 1FVRA 4EC9A 4UMPA 3F61A 3FZOA 4IHPA 1OVEA 5IZFA 3NMUF 2GS6A 5IDPA 3KMUA 3COIA 1PMVA 3AXWA 4GCJA 4YJTA 3DB8A 3RPSA 5GIPE 3DGKA 5C03A 1UNHA 3CE3A 3QGYA 3T3VA 1WMKA 2VX0A 3MIYA 3A7FA 3PG3A 3TN8A 5ICPA 1JQHA 3O7LD 4TTHB 5J7HA 1NA7A 4YBJA 2PU8A 2O63A 4X2FA 5DR6A 2BDWA 4CTCA 3BE9A 4QQJA 3OBGA 1FBNA 4F7NA 2B9FA 3GU8A 3ZSGA 4DINA 5E1EA 3R01A 3CKWA 4RVMA 3UQGA 5E7RA 4BI0A 4UX9A 2IVSA 4S2ZA 2UW5A 1DAWA 3UNKA 2UW6A 5HG7A 5FLFA 5BVFA 3F3UA 3BU6A 5FTGA 2B9HA 4ASEA 3TM0A 2ZYBA 4QP6A 4YZCA 4FODA 2IPXA 3FMDA 2ESMA 3HA6A 2FSTX 2QR8A 4IX5A 4QYHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4FV0 A;  2P33 A;  3QFV A;  2WMW A;  1WVW A;  2WHB A;  2RFN A;  1FMO E;  3KB7 A;  4DGM A;  5BVK A;  3HEC A;  1WBP A;  3O8P A;  3ZU7 A;  2IZS A;  5FP5 A;  4I5P A;  5BUJ A;  5FXR A;  2IVV A;  3IG7 A;  5LWM A;  3VBY A;  1XBC A;  3HP2 A;  1V0O A;  4HVD A;  3FLQ A;  3DK7 A;  3A62 A;  1H27 A;  3ROY A;  2W99 B;  4AFE A;  5BVW A;  5IQA A;  4EZ5 A;  3FQS A;  4RWK A;  2YAC A;  2W96 B;  4ALV A;  3TDV A;  3HMN A;  4IVA A;  5C01 A;  2WU7 A;  2A1A B;  3QUE A;  4EK8 A;  4M97 A;  3EZR A;  3PXY A;  1REK A;  3OP5 A;  3Q4U A;  4WNM A;  1WCC A;  1RDQ E;  4IFC A;  4XG2 A;  3BKB A;  3FJQ E;  3V8S A;  5IQG A;  1DI9 A;  4JQ7 A;  3R7U A;  3VUT A;  5IA3 A;  4E26 A;  2OIB A;  4DAW A;  4QMU A;  3PFQ A;  1LEW A;  3UPZ A;  4APP A;  2YWP A;  3DJ6 A;  3VBQ A;  4G1W A;  2C6T A;  2QO2 A;  4IX6 A;  4YZ9 A;  3AMB A;  5AV1 A;  4I22 A;  3V5J A;  4DG2 E;  2Y4P A;  3Q04 A;  4DG0 E;  3NUU A;  5CAL A;  4O7V A;  5J1V A;  4XV2 A;  4QP1 A;  4C4F A;  2R9S A;  3O23 A;  2PVY A;  5HVY A;  3EN4 A;  1BL6 A;  2OID A;  4D2T A;  2WO6 A;  4BF2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GEQ A;  4U6R A;  4A4L A;  1YOJ A;  4QP3 A;  4X2K A;  5JZN A;  5CAU A;  3PZH A;  2JBP A;  2YIR A;  3GGF A;  3SDJ A;  1K9A A;  2PE2 A;  3MB7 A;  2XF0 A;  4M67 A;  4EHV A;  3DJ7 A;  3CY3 A;  5EYM A;  1U46 A;  1M17 A;  5BUE A;  3DND A;  4GU6 A;  4L8M A;  3B2W A;  2BZI B;  4E4L A;  2ZB0 A;  2REI A;  1KUT A;  2GPH A;  2R3N A;  4RJ4 A;  3JXW A;  3TIZ A;  3QQJ A;  2QOD A;  4G3E A;  2W5A A;  4MKC A;  5CVF A;  4V04 A;  3ZTX A;  4QOX A;  4G34 A;  2YM6 A;  3LMG A;  3PG1 A;  4QQT A;  2E9P A;  4D1S A;  1JSU A;  3P7C A;  3K2L A;  1Q8W A;  4W4V A;  4AN9 A;  5A54 A;  1FQ1 B;  4O84 A;  3UIB A;  4UMQ A;  5LWN A;  4FIF A;  4QT1 A;  4EQC A;  3IGG A;  1YXS A;  2VTN A;  3D5X A;  5AR7 A;  3VWA A;  2YAB A;  3KL8 A;  3D2K A;  4IB3 A;  1G8J A;  5HE3 A;  4CT2 A;  3Q2J A;  4DA5 A;  4MF1 A;  1PXN A;  2P55 A;  4AOT A;  5DYJ A;  3CKX A;  4P2K A;  4XOY A;  1T45 A;  4BGH A;  4NU1 A;  5B0X A;  3FMM A;  2XP2 A;  4XG9 A;  4R7B A;  2Y9Q A;  2PK9 A;  3LJ0 A;  2J5E A;  1W2C A;  2JKK A;  1NVR A;  3UNJ A;  3ZHP C;  2Q83 A;  3N9X A; 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