3QD2B

Crystal structure of mouse perk kinase domain
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
332
structure length
271
Chain Sequence
ASRYLTDFEPIQCMGRGFGVVFEAKNKVDDCNYAIKRIRLPNRELAREKVMREVKALAKLEHPGIVRYFNAWLETPPEKWQEEMDEPKVYLYIQMQLCRKENLKDWMNRRCSLEDREHGVCLHIFIQIAEAVEFLHSKGLMHRDLKPSNIFFTMDDVVKVGDFGLVTAMDQDTHGQVTKLYMSPEQIHGNNYSHKVDIFSLGLILFELLYSFSTQMERVRIITDVRNLKFPLLFTQKYPQEHMMVQDMLSPSPTERPEATDIIENAIFENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The structure of the PERK kinase domain suggests the mechanism for its activation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Gene regulation
source organism Mus musculus
molecule keywords Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3
total genus 78
structure length 271
sequence length 332
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qd2B02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qd2B01
2UZBA 4AW5A 3CLYA 2E2BA 2YM7A 3CXWA 2GSFA 4FVQA 4GH2A 4DG0E 4EZ3A 2CN5A 3LFEA 3EZRA 1Q41A 3OCTA 2NRYA 2P2HA 4IFGA 2F49A 1W0XC 4F09A 2UUEA 1Q8YA 2B54A 3DY7A 5CANA 1OGUA 2H96A 3N9XA 4OR5A 4TYEA 3EL8A 3NCZA 3ZUTA 3F66A 4I5PA 3FPQA 3ZTXA 4ARKA 2J7TA 2BUJA 1FVRA 3GVUA 2X9FA 3IW4A 1V0PA 2C1BA 2QOQA 3PP0A 4YC6A 1O6YA 2W1EA 2O5KA 3CCNA 4JRVA 4KSPA 4D2RA 4FIIA 3ORTA 5GNKA 2O64A 3RBWA 3V8SA 2EB2A 3BBWA 3G51A 4HVHA 2BTSA 4RIOA 4K9YA 3V51A 3GGFA 2OIBA 3C4ZA 1VJYA 3AMBA 4NUSA 4YNOA 4D2VA 1PMUA 4XBRA 3WYYA 2W4OA 3F3TA 4I6BA 4E20A 5I5ZA 4UMQA 3FZSA 3R7UA 2YLEA 2B9JA 3FMDA 3R7GA 2WEVA 3NGAA 4QMSA 4W4XA 3WOWA 4BFMA 5J9LA 3PDTA 4XNEA 1NY3A 4DBXA 3IGGA 2VO6A 1XH7A 1A06A 3R30A 3KXGA 2XKEA 3C0GA 3OW4A 3KFAA 2VWVA 4FNWA 2YIWA 4MD9E 3MVHA 4QMLA 4PDSA 4FTNA 1ZYDA 4YJRA 3QHRA 2GNFA 2A4LA 4XHKB 2XJ1A 4MX9A 4W4VA 4HCTA 3LCSA 3ORLA 4C4FA 4EL9A 3HA8A 4ZIMA 3GCPA 3D2KA 1JKLA 3UOHA 4XG6A 2VTTA 3L8XA 5L6OA 4DH8A 1PKDA 3G9LX 4PP9A 3EQPA 2QU6A 3IOPA 1U54B 2FSTX 1GJOA 3QTXA 1REJA 3LAUA 4ZTSA 3I5NA 5HX6A 3DA6A 4C4EA 3A8WA 4BCNA 4A9TA 4FV4A 4EH4A 5J7BA 5AP6A 4MBLA 3AC2A 3TNWA 5IUHA 3MVMA 3NUSA 4IANA 4QMMA 4RIWB 3DKCA 1S9JA 4C61A 1YOJA 2B52A 1YDTE 3BELA 4QMWA 5IU2A 1Q8ZA 2IVUA 2OJ9A 3PY1A 3QUDA 5CU6A 3G2FA 4DE4A 1TQIA 1ZMVA 4G9CA 4IVCA 4K6ZA 1OITA 3KKVA 3KB7A 3QWKA 4TT7A 5JEBA 3FQEA 4ZLYA 5M57A 2VNYA 3S2PA 3V5TA 4ZSJA 4WIHA 4YJVA 3T3UA 1Z9XA 4C7TA 4FEVA 3Q4CA 3WZJA 2WMUA 2ZDUA 3NYNA 1Y6BA 4XRLA 3UBDA 1VEBA 5JZJA 4M12A 5AR8A 1FOTA 3KULB 2J4ZA 4BHZA 1SYKA 3ZMMA 1IRKA 4K1BA 3WZDA 1XBAA 1Q8TA 4G6NA 2I0HA 1STCE 3DBCA 5TT7A 4D4SA 2YLFA 4MYGA 4JX3A 4AA0A 4CYIA 3S00A 1UNHA 4HVIA 3UNKA 1QCFA 1UNLA 1H27A 2Z7SA 3RZBA 4CVAA 5E8TA 4D2TA 3GENA 1H1PA 2PMNX 4CFMA 1ZZLA 3FL4A 2YM6A 3R1QA 1H00A 3G90X 3QBNA 3VUKA 1DS5A 2KULA 4JBVA 4WO5A 3WE4A 4L01A 5IQFA 4BCMA 1V0BA 2P4IA 3PJ8A 4FSMA 4QQTA 4AW2A 4QPMA 5HIEA 1OUYA 2PMLX 3GNIB 4NYEA 2R3RA 2C6TA 3BHTA 3FMNA 3IW7A 4D2PA 3ZLWA 4Y83A 2XNMA 4TL0A 5HEZA 2CNQA 3I6WA 3A62A 2UZNA 2X4FA 2GQRA 2PVNA 4O0RA 4MH7A 5H8BA 4WBBB 4KS8A 4O6LA 4CCUA 4RIXA 3CGFA 3OW3A 4RVKA 4U44A 1KE9A 2BMCA 3DXPA 5M56A 5F95A 2OW3A 5HD4A 3LLAA 2WO6A 4IHPA 3EIDA 2ZV9A 3L1SA 4X3FC 3TIZA 2HK5A 3VVHA 4DFLA 4RQKA 3HV7A 3L8PA 3QUEA 4IC8A 5CX9A 1KE6A 2BCJA 4MAOA 1KE5A 2V5QA 3UVPA 5BVNA 3D14A 2FA2A 2ETKA 4S32A 2UVXA 3RINA 4O83A 5DRBA 2A19B 4PNIA 3NW7A 5CALA 4O2ZA 3C5UA 4IWOA 4WNPA 5ICPA 2QC6A 2ITPA 4HW7A 1FVVA 4JL9A 2VD5A 4DEBA 4RIYB 4YTHA 4E7WA 4ZJJA 1T46A 3TV7A 4H1JA 2YCFA 5A9UA 3VW8A 5GZAA 3VBQA 2PVMA 2CN8A 4F9YA 2GFCA 2JDVA 4ITJA 4I5HA 4O91A 5AM6A 4BCOA 4BYJA 4JVGA 3ZXZA 5AUXA 3KA0A 4MEDA 2C3KA 1YXXA 3QQGA 1MUOA 4EOOA 1E1XA 1UVRA 4HGLA 2VWBA 2YM5A 3Q96A 2VO3A 1E1VA 3FEGA 1HOWA 2X39A 1CKIA 4GUBA 4IFCA 2PZRA 3GXLA 3PTGA 3FLNC 4I24A 4O0VA 3NZ0A 5HVYA 4D2SA 3W2CA 3R73A 3EQHA 4LQMA 4QTEA 3R00A 4NM5A 2R0IA 3CKWA 4JG8A 4JJRA 4JRNA 2C68A 3RJCA 3BHUA 3FDNA 4FZ7A 5DI1A 4AGDA 2WNTA 1H1RA 2C3JA 5BVEA 5CAUA 4F4PA 5LMKC 1JAMA 5HD7A 2XYUA 4YGAA 5TKDA 4E6CA 4XG8A 3ZLYA 3CY3A 3UOLA 4E1ZA 1JSTA 2DYLA 2XIZA 1G5SA 1YRPA 4GFOA 4E4XA 4PTEA 1U4DA 3E7VA 4O7ZA 2G2IA 3DU8A 1YWNA 2BIYA 2QODA 3PWYA 3CTJA 4MVFA 4RJ5A 5KMOA 5DE2A 2B9IA 5HIBA 3R7EA 3GOPA 2VTMA 3FZPA 1OECA 4XJ0A 4U3YA 4C57A 2WXVA 2W4KA 4UMUA 1PXPA 5IQHA 4BWPA 5HG7A 5BNJA 5A4QA 5DEYA 2JEDA 4DGLC 2WQEA 3EN7A 3CR0A 5LVPA 2BILB 2ZV7A 1QPJA 2ITNA 3BLHA 3CC6A 2WU6A 3KEXA 4D28A 1RQQA 2BDFA 4QMOA 1UU8A 4O7LA 4OBPA 4Z7HA 4FTJA 3TZ7A 1H8FA 3TUCA 3VBTA 1JOWB 4EOQA 5BVWA 3M1SA 4Q5HA 1YVJA 4FV3A 4M13A 2RFSA 4X2KA 4AZWA 3DTCA 2OH0E 3PJCA 4BZOA 5FXQA 1OB3A 5K0XA 3N51A 4IB1A 3AGLA 2C5NA 2OXYA 5KMJA 2PUNA 5IQBA 4V05A 5EI2A 1MRYA 4Z3VA 3D7TA 4EOJA 3MA3A 4AN9A 4J99A 4L67A 2R3KA 3LFQA 2XNBA 4JQEA 5CQWA 2XK4A 5DH3A 4RFYA 4C2VA 4DFYA 3DLZA 2B53A 1FMOE 1OM1A 4ACDA 4W4YA 5LVOA 5BYZA 5AADA 4EJ7A 3SXRA 1BUHA 4RC3A 2XIXA 5AX9A 4NKAA 4USFA 1Z5MA 3QCYA 2RFDA 3PIZA 3LCTA 2XKCA 3R71A 3UIXA 3ZFMA 4K77A 4CMOA 5D10A 3DBDA 3PE2A 5K5XA 4JG6A 4ZZOA 5BMMA 2BRMA 5LWMA 3KRLA 2ITWA 2ESMA 4GUEA 5AV3A 4IAYA 2OI4X 3LJ2A 4B99A 3LFFA 2ZMDA 1JKKA 4MXXA 2ZJWA 3VS5A 4G31A 4QYEA 3QLGA 2XRUA 2QOFA 5JK3A 1PXJA 3HP5A 4EWHA 3TV4A 2C6LA 3Q6WA 3W8QA 3GU4A 3HRFA 3NYXA 4EOSA 4XOZA 4ITHA 3SX9A 2UZVA 3VHKA 1ZOEA 5M51A 3ULZA 4PDYA 4BB4A 5GJGA 1U5QA 4RJ7A 3ENMA 1HCKA 4Q2AA 4EZ5A 2UZWE 2C0IA 4GK4A 4F64A 5BQ0A 3GC9A 2CGWA 3WF6A 2GCDA 4O0WA 3A4OX 3O17A 5GJDA 4B7TA 1T45A 1FGIA 3QQHA 3MY1A 4F9WA 4KIOA 2GS7A 4BIBA 3OUNB 3UIBA 5KMLA 3HEGA 4M0YA 2XBJA 3QRJA 5T3QA 3UJGA 2X2LA 3OXTA 3MB6A 4I6QA 5IDNA 2BHHA 4C37A 5JGBA 3BQRA 2OJJA 1PMVA 4WT6A 3I0QA 2BALA 4CYJA 4PQNA 3MTFA 3COKA 2BRNA 4IVAA 4WNMA 4ZTHA 4O22A 3NS9A 4GV1A 4CRSA 2WMAA 4L68A 4PP7A 4LL5A 5KHWA 2WOTA 2XM8A 1CMKE 3OD6X 3HP2A 3ET7A 3RK9A 3ZC6A 2W5AA 3EN6A 3MGYA 1DAYA 3VNTA 3UODA 3ZBXA 3JR1A 3W2PA 3RMFA 3TCPA 3JY9A 3KY2A 4FOBA 4J98A 5HG9A 1GZKA 3LM0A 4FV2A 3N4TA 3DAKA 3FMLA 4QP2A 1Q97A 2XNPA 3AQVA 5EHYA 4BDFA 3UG2A 4ZY6A 1WBOA 4P5QA 5HQ0A 4BC6A 3LXNA 3UGCA 4QPAA 5E8ZA 3VJOA 1UU7A 3ZZEA 3DDQA 3RM7A 1PXMA 4DGGA 2BZIB 1URWA 5GJFA 5IZFA 4USEA 4GT3A 5CVGA 2YERA 2JLDA 4D58A 4RRVA 1XBBA 4NW5A 3T3VA 3WF5A 4DLJA 4QMQA 4XG3A 2PK9A 4CZYB 3HAMA 2AC3A 5JFSA 2PE2A 3DGKA 3DFAA 3LQ3A 4X3JA 4XP0A 1NW1A 2AYPA 3LFCA 1H25A 4AN2A 1BI8A 4IWQA 3KRJA 4P4CA 2X7FA 5LCJA 3BYVA 4CG8A 2VTHA 4IMYA 4L3JA 4I5MA 4O7WA 3V6SA 2VTIA 3SAYA 4NH1A 5HVJA 4UYNA 2XNGA 3SC1A 3IGOA 5IISA 1UNGA 4X2NA 2X9EA 4FK3A 2ZAZA 3S4QA 1PYEA 4IIRA 3ZUUA 4FV6A 5ETCA 1B38A 3KREA 4S30A 3UYTA 4M67A 1M7QA 2C3LA 2QOIA 1GZOA 2BFYA 3B2WA 3PA4A 3PE1A 4U7ZA 4CQGA 4EH7A 4UWBA 5AUVA 4GT5A 5EHLA 5EI6A 2QD9A 5HE1A 4B6LA 5LVNA 2PUIA 2WMSA 5C4LA 4LI5A 4R5SA 3BHHA 4NCTC 2HXQA 3Q32A 3FMMA 3L8VA 4GU6A 2Z7QA 4FIFA 4RJ8A 3NVMB 1YXTA 5T6KA 5DBXA 1IG1A 4OTIA 4X0MA 4ZSAA 1PXIA 4FT9A 2WQMA 2WTKC 4EQUA 4EBWA 2WTJA 3D5XA 2X8EA 1QMZA 3UO4A 3WIKA 3FSFA 4O0UA 2RGPA 1JSUA 3KMUA 4GFGA 4BGQA 4TWPA 5FP5A 2EXCX 5KHXA 4OW8A 3QGYA 5CYIA 5AA9A 3PSDA 4MXCA 5EH0A 3D5VA 3P08A 3P1AA 4WRSA 2CGVA 3U4WA 3OMVA 3LQ8A 4PPAA 3OXZA 3EFWA 4O1OA 3R22A 3UNJA 3R28A 3QQJA 5M09A 3OEFX 2XF0A 2C5YA 4QD6A 3R04A 2OF4A 1YOMA 5HE0A 5DGZA 5AR4A 4YBKA 4NWMA 2R3HA 2W1GA 3CP9A 3C7QA 2QG5A 3CEKA 3LIJA 4FV5A 4D4RA 2R3OA 4G3GA 3F5PA 5J7HA 3F3WA 3FC1X 5DWRA 2W7XA 3FYJX 4CGAA 1K3AA 4RLKA 3CPBA 3DKOA 2HENA 5AP4A 3UYSA 2CCHA 3R1SA 2GS6A 3FI2A 4O1PA 5I4NA 1UA2A 4LMUA 4B8MA 2HAKA 3ULIA 4WSQA 4PDPA 4EH2A 1Q99A 3FLSA 3O0GA 4KBAA 4XP2A 2PZYA 4ZY4A 4FYNA 1YXVA 3RPSA 5KMKA 2H9VA 5ACKA 3IDBA 1OL7A 4BDHA 2WTIA 3ZFYA 4DEIA 5M4UA 3GU8A 3NW6A 3A60A 1KOBA 3TNHA 4IEBA 3EJ1A 3HKOA 4NTTA 4PMMA 4U43A 4FNYA 4DEGA 4UX9A 3W32A 4Y73A 3ZDIA 2LGCA 1QPDA 4QT1A 3KXHA 4TYHB 4KNBA 3CS9A 4YTFA 5IMXA 5E8YA 5EKNA 4KB8A 4QYFA 2JAVA 5D9HA 3DJ5A 4UXQA 4BTMA 4AG8A 1PXNA 3BYSA 2WEIA 1XH5A 3BYOA 3PFQA 4FKUA 2HZIA 3O8TA 2FH9A 3GEQA 1WBPA 4XV3A 1PRYA 2YIYA 4G5JA 4HYHA 3S1HA 5C4KA 4C0TA 3LM5A 4G3FA 4JI9A 4R7HA 3KRWA 3V8WA 3F5UA 5BUEA 3HAVA 2J50A 2XM9A 4JBQA 4QOXA 5ANKA 2J90A 3ROYA 1XH8A 2O8YA 3DXNA 1AD5A 4D0XA 3NAYA 1WFCA 3NX8A 2J2IB 4RX5A 2GU8A 2IO6A 3SXSA 4YJOA 2BTRA 4QPSA 4V0GA 3WZUA 3NWWA 4F0IA 5BVOA 4FYOA 2R3NA 5B2KA 4R1YA 5CTPA 1UKHA 3QRUA 4HGEA 2I6LA 1WBNA 4ANMA 1U5RA 5A3XA 4F7LA 2JDOA 1H1SA 3ZU7A 3QZGA 4C36A 4ENXA 3KN5A 4MXOA 2GMXA 3ANQA 1Y8GA 4PX6A 2IZSA 2HCKA 2G2FA 3F2AA 3W2QA 4S33A 5I9XA 3G33A 1YDSE 4FR4A 2VTPA 4YSMA 3RPVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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