3QFVA

Mrck beta in complex with tpca-1
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
414
structure length
395
Chain Sequence
SAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEWAKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNFDVSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Co-crystal structures of inhibitors with MRCK beta , a key regulator of tumor cell invasion.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords CDC42BPB protein
total genus 103
structure length 395
sequence length 414
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qfvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qfvA01
2YCQA 4MXAA 3R7OA 2JKKA 4EHZA 1PXMA 3R02A 4BWXA 4F70A 2R3KA 4R8QA 3RK5A 4NCTC 1H24A 5M06A 3KVXA 2JDSA 3RK9A 4PUZA 2FSMX 1H4LA 3FLNC 3ZBFA 3KXMA 4GRBA 4L8MA 1YWVA 4YJPA 2HZ0A 3EJ1A 3BHUA 3F3TA 2EWAA 1E1XA 3NAYA 3R22A 5KZ0A 5C8MA 5KKRC 4AGWA 3FC1X 3IW6A 4Y85A 5JQ8A 4B0GA 4TYHB 5IISA 3SG8A 4UALA 1OECA 1YKRA 2J2IB 2WMWA 3GC9A 1A9UA 4RBLA 5AUXA 4JDIA 5T6KA 3QD0A 1MQBA 4MK0A 3GU6A 4F0GA 2UW8A 2E9NA 2WMUA 3DTCA 4JBOA 3EHAA 4H05A 1IEPA 3QBNA 5DNRA 4X2FA 3CD3A 3G51A 2W5BA 3MW1A 4IEBA 4OW8A 5DH3A 5A4LA 1Z5MA 3OZ6A 1BL7A 4L53A 4IWOA 3G9NA 3C50A 3UO6A 2BZJA 4GJ3A 4W4WA 5IUHA 1CTPE 3ORIA 4JDKA 4L45A 3ORKA 3QALE 4RIYA 2P4IA 4XEYA 3U8WA 5JKGA 5HE2A 2QOLA 2XNOA 3R21A 4JI9A 2WQBA 3IGOA 2VX1A 1OMWA 3NEWA 5CT7A 5HO6A 3UJGA 1OKZA 1WBPA 2OF2A 4RC3A 5J7BA 3LLAA 4O0YA 3OS3A 5HLPA 3BQRA 4L7FA 5ICPA 3BELA 4ASXA 4EJNA 3GQLA 5HIBA 1IAJA 1K3AA 3C0GA 4CKJA 3OWLA 4O7LA 3SOCA 5J9ZA 1M7NA 3R7VA 4RSSA 4I1ZA 3MB7A 1YDSE 4OTQA 5EI2A 4GFGA 5L8LA 4FKOA 3EQGA 3RK7A 4PP9A 2XK7A 3UC3A 4CFXA 4G5JA 4DH8A 4FEXA 1PXLA 5JQ5A 2VWWA 5TE0A 2W05A 3LXPA 4WO5A 3VUKA 5JMSA 3QX4A 5IQEA 4DBXA 4MQ1A 5CEIA 4AN9A 1JSVA 1ZMVA 4BBEA 5ETAA 3GFWA 2QLUA 5ETIA 1PMNA 3MIAA 3W2OA 4BDHA 2R3GA 4XLVA 2CLXA 2OH4A 3JUHA 4DYMA 3AC2A 3TDWA 4U3YA 4QRCA 2IZUA 3RI1A 4XUFA 3T9IA 5DYJA 3ZM9A 3HLLA 4KD1A 3M2WA 3OWJA 4ASZA 1Q8WA 5EHYA 1J1CA 4PTGA 3OWPA 3K3JA 4K6ZA 5E8VA 3CKWA 5JGDA 2Z8CA 1Q61A 4O6EA 2XZSA 3DB6A 4APPA 4RC4A 4IB3A 1RW8A 2RFEA 4YC6A 4F6SA 2F4JA 4M0YA 5HIEA 2OXXA 4ZSGA 3MV5A 2UVYA 2ZV7A 4XBUA 2WQOA 4YLJA 3MH1A 3NIEA 5C4KA 3CE3A 2H6DA 3W33A 2VRXA 4AA0A 5KNJA 2V62A 3RKBA 3EL7A 4LV8A 4M69A 4YGAA 4N70A 4J96A 4USFA 3FLWA 2BZKB 1TQPA 2GDOA 2QODA 4N6YA 5DT0A 4NM3A 3F5PA 4Z55A 3T9TA 3FEGA 2I1MA 2WXVA 5LMKC 3H0YA 4X3FA 2HY81 4R77A 3D5XA 3UQCA 1GAGA 1OBDA 2XIRA 4PNIA 4RX8A 4C37A 3BE9A 4FNWA 3E88A 4TT7A 5D7AA 4AZFA 4F65A 4MYGA 3TCPA 4QP2A 4G3FA 3QCQA 2YIWA 5FRIA 3PY1A 3QTUA 5GZ9A 4QP1A 5KMMA 5AUZA 4FEUA 2PL0A 4YHTA 2VX0A 3DLSA 3HP2A 4UZDA 4BCKA 4EK3A 5AAEA 4BCHA 4BKZA 2BDWA 4KKHA 2VWZA 3RNYA 2X9EA 2FSTX 4KBKA 3H0ZA 4C3PA 5HX6A 4KIKB 4FOCA 4QP7A 4CFWA 3VRYA 2GQRA 3BBTB 4S34A 3PUPA 3V8TA 3ZSIA 4V01A 2CCIA 3G15A 2OZAA 3LMHA 4QNAA 5HCZA 4MVFA 4DH7A 3VQUA 4G3EA 3UDBA 4EOOA 2UZLA 4DFNA 3L8PA 2GNHA 3KK9A 5BVOA 3DZOA 3IDCA 3NZ0A 3SDJA 5BMSA 5JZJA 2G2FA 1KOAA 3HMIA 4ZLOA 3IDPA 2X39A 3QCYA 4FT3A 1Q8UA 3VO3A 3EN4A 2P2IA 3TG1A 3UIXA 5I9UA 5A4EA 2J0LA 4ZTLA 1PMVA 4DTBA 4FKQA 3VULA 4JJRA 3AD5A 3O23A 3NS9A 2C30A 1YXTA 2RL5A 3NUSA 3R04A 3I6WA 1GNGA 3QRTA 1P4OA 4UWCA 3TZMA 3VBTA 1M7QA 3FSFA 3VW6A 5I3RA 1XO2B 5GIPE 3PE2A 1HOWA 5ETFA 1Q41A 3MH2A 3DQWA 3FY2A 5I3OA 4C0TA 2WMBA 1H26A 4CCBA 2YISA 3I4BA 4GYGA 3VS2A 4ZLZA 3TIYA 4C4GA 1STCE 3DS6A 3QZIA 2XKFA 1JWHA 2GHMA 4BTJA 3E63A 4QMLA 4Q5HA 4ERWA 2QQ7A 3P79A 2JFMA 4OTRA 2G2IA 1KE6A 3KB7A 3ZH8A 2R3QA 4CGAA 3LQ3A 1BL6A 2WMRA 4D2TA 2HK5A 2C5XA 3MFTA 3JYAA 1LR4A 3BYOA 4NCTA 4BWPA 4F4PA 5AX3A 5KCVA 4CG9A 3ENMA 4IX4A 3R9DA 2B9JA 2XJ2A 4BZOA 3EIDA 4JDJA 5AV3A 3EKKA 4MD8E 4C58A 4NTTA 3S00A 1GZNA 3ATTA 4AZSA 3ANRA 5E8UA 3Q5IA 3LCTA 4CV8A 4FV3A 4C7TA 4G16A 4Y8DA 5EK7A 4UV0A 4BICA 3E93A 1UNHA 2ZM4A 1M14A 4DCEA 4IACA 4L3JA 2OJGA 4AF3A 4U79A 5CAQA 1L8TA 4WUNA 3HA8A 2GFSA 2XKEA 4I92A 2QD9A 3ZONA 4KAOA 1A06A 2Z7SA 5DBXA 2W9ZB 3WBLA 4I5PA 2QG5A 2VTSA 4KRDA 4BY9E 2YM6A 1E9HA 3HMMA 4ACMA 3DBFA 3NVMB 3C4FA 4HGLA 4BCGA 4FNZA 1MRYA 3TI1A 2XJ1A 1JNKA 4IXPA 1QPDA 2YCRA 5ANGA 2PULA 3F2RA 5H9BA 1GJOA 4JQ7A 4BDBA 2C3LA 2HIWA 4PL3A 3ALOA 3GBZA 2CLQA 3ANQA 3DCVA 3G2FA 1FVVA 1YDRE 3CJGA 5HO8A 3SVVA 1Y8YA 1W7HA 3EH9A 4E4MA 1YXUA 2ERZE 3E3PA 3L8SA 3Q9YA 2BVAA 4S31A 4L68A 4EC8A 4YJNA 4IFGA 3GFEA 3F2AA 3FZSA 4FKTA 2UW6A 2R2PA 2YA9A 1F0QA 2PUPA 4WNKA 4EI4A 2J7TA 4QYFA 2IJMA 3GU7A 4NFNA 5T3QA 3MVMA 3LFCA 2B0QA 5DFPA 4WG4A 3P5KA 3VW8A 3DBCA 4AX8A 4L44A 4FG9A 4JX3A 4LRKA 3P23A 3ZM4A 2LGCA 2YM3A 3KRXA 2RF9A 4FUXA 4NWMA 4DGLC 4BCPA 2UW3A 2CGUA 4HNFA 4A9TA 4DEIA 4FTCA 4DBNA 4EONA 4IAIA 2C5NA 4PL5A 4ENXA 3KULB 3UQFA 1URWA 3DDQA 3UZTA 3IQ7A 3GENA 2R9SA 4GW8A 2OJFE 5CU4A 5ACKA 4D4SA 2VWIA 3MA3A 4FZDB 5H8BA 3JY0A 4IADA 1TVOA 3OWKA 3RHKA 2PSQA 5AMNA 4JDHA 3MJ2A 1VZOA 4D9TA 1WVYA 4Y95A 3OCBA 4HCUA 4O1PA 3OFMA 1TQMA 3DU8A 3B8QA 3QQFA 1V0PA 4BR3A 2WPAA 2UW5A 5L3AA 4JVGA 3QLGA 4AFEA 1OITA 1Z9XA 5K3YA 2CKOA 4RQVA 5CAOA 2YAAA 4U9AA 3WYXA 4BDEA 3FMNA 3VS4A 2FUMA 4BTMA 3PYYA 4XP3A 3IOKA 4FSZA 1K9AA 2F7ZE 2W1CA 3QD4A 3RHXA 3QX2A 3AMAA 3SXFA 3V01A 2JKOA 3PA5A 5AUVA 2H8HA 3W16A 4PP7A 3CSVA 5G1XA 4D2SA 3OW4A 1Q8TA 5HTIA 5IEXA 3PPKA 5KUPA 2QOQA 2XH5A 1PKDA 3QKMA 2A19B 4OTPA 1Y8GA 4IX5A 4IW0A 4BCNA 3T3VA 3C51A 5LMKA 3BHYA 5IH6A 3DZQA 3DFCB 3R63A 4IB5A 4MXOA 2RSVA 4ARKA 4CMTA 4CKRA 3S1HA 4FC0A 2WHBA 1U46A 1OI9A 2HAKA 3FC2A 4QMYA 4IIRA 4XG7A 4BZNA 4YJSA 1MP8A 2PMOX 2W1IA 2Y0AA 4CFMA 4M67A 3QXOA 3GB2A 3UNZA 4K18A 2J0MB 4RWIA 4WA9A 2IVUA 4DEBA 4FX3A 3BV2A 4ZY6A 3SA0A 3GOPA 5DR9A 1MQ4A 1KE5A 3BEGA 3OG7A 4QMVA 3UOKA 3SW4A 4JNWA 5HE3A 3DV3A 4UWBA 3S0OA 2OSCA 3B2TA 2WTWA 2E9OA 2BHHA 3ORZA 3R1SA 4TN6A 3VBXA 3R0TA 2XCHA 2ZMDA 2J4ZA 4RIWA 3U4WA 3DK3A 3PPZA 3PPJA 2HW7A 5HCXA 1V0BA 3OUKA 5C1QB 5DIAA 1MRVA 4XS2A 4I6BA 5CAVA 4QMXA 2OICA 2J5FA 4R3RA 5AR5A 1DS5A 4HYUA 4G9RA 1WVXA 4XX9A 3F9NA 3SRVA 4EOMA 3Q6UA 4WOVA 1Q24A 4RC2A 3A4OX 1H1PA 2HYYA 3MBLA 5I5ZA 3AT3A 5CQUA 2WTKC 2VO3A 2WMXA 2JDTA 1YQJA 3FY0A 2OZOA 3OW3A 4LI5A 4BCOA 2G1TA 4UZHA 4K11A 2XNNA 2C6EA 4CRSA 1M52A 4TYEA 5B7VA 4FIFA 3HUBA 3IO7A 2ITVA 3UVQA 4YLLA 3ZUUA 3LFBA 4O0TA 4D5HA 4AOJA 1ND4A 4I5HA 3AC3A 3E3BX 2B7AA 2V0DA 5IH5A 4K0YA 3LFFA 4M68A 3AMBA 4KBAA 2R3LA 2X2KA 4P5ZA 4AT4A 4DFLA 4B9DA 3QCXA 3VF8A 5FD2A 4USDA 2WD1A 4O2ZA 4JRNA 3SOAA 5IF1A 3DAKA 5CF8A 2A0CX 2IZSA 4QO9A 2HXLA 4IDVA 3FZOA 4YZCA 3OTUA 4YTFA 4O7SA 3NCGA 2ZOQA 1ZOGA 3NLBA 4ZTMA 5BPYA 2OU7A 4FZAB 4ACCA 5DR2A 5BYZA 5JGAA 2CKEA 4K9YA 4DFBA 2C68A 2A1AB 5DEWA 3GU5A 4ZSLA 4E93A 4FTTA 4I4FA 3LXKA 4JIKA 3R7YA 4CG8A 4GMYA 4P7EA 4FSNA 4H1JA 3CC6A 3QTZA 1ZMUA 1IR3A 4XG9A 3TZ7A 4TNBA 5E8XA 3FZ1A 4DT9A 3BGZA 4I5MA 4D2WA 2IW6A 3KU2A 2FO0A 4IAAA 1WBOA 3G5DA 3C5UA 3FI3A 5EW8A 3UIMA 4PDSA 3AOXA 1GZKA 2ZJWA 3DLZA 2B9FA 1J7LA 4B6LA 3FDNA 3KXHA 5K0XA 5AUUA 4L3PA 2IPXA 4FIEA 5TKDA 2W1DA 5AEPA 2R3FA 4QMPA 2HW6A 2WTCA 4FV2A 2OFVA 1PXKA 4IJ9A 3ZEPA 3UO5A 2PUUA 3FQHA 1G8SA 2GQGA 4IMYA 4U43A 4ZY4A 4U7ZA 4MHAA 5J5TA 4PX6A 1HCLA 1UU9A 3GP0A 4RIOA 3NNVA 5FTQA 3CXWA 1XHAA 3RP9A 2W5HA 4IM2A 5HNBA 3AT2A 3C4XA 4EHGA 1OUKA 2UZUE 3V8WA 4F7JA 4BVUA 5F95A 5CF4A 4O7RA 4O7TA 3VHEA 3JR1A 3GOKA 3HEGA 4PTCA 3LLTA 2W1FA 2OH0E 4O91A 3NDMA 1WFCA 4RZWA 5CU3A 5GJGA 3W32A 3QGWA 4UMPA 2HZNA 2YIQA 2GCDA 4YJUA 2WMTA 1LP4A 2XEZA 5M4CA 3AD4A 2JD5A 2P2HA 4F9AA 1CDKA 4LG4A 2ONLA 2GHLA 2GU8A 2W1GA 2XVDA 4RIXB 2GHGA 4FSYA 4RZVA 4GVJA 3HAVA 1ZAOA 3OT3A 3R7EA 3EQRA 3WIGA 5CSHA 3QC4A 1QL6A 2W5AA 2OIDA 4OLIA 3S2PA 2O65A 2UW0A 4EKLA 3IPHA 3WZDA 2KTYA 2O63A 4MWIA 4N6ZA 4QP6A 1YXSA 3R8LA 2Q83A 4IB0A 2VU3A 4O0VA 3RPRA 3DAJA 2RFNA 2QOFA 3R8VA 4ASEA 3ZEWA 1PF8A 1OL5A 2ITXA 4QMZA 4BZDA 4DN5A 4G6LA 4F6UA 5FBNC 5FDPA 2PMIA 2IO6A 2EU9A 1UU7A 3DXNA 3HUCA 3PP0A 4XRJA 5CF6A 3DXPA 2PVHA 4J98A 3POOA 4NKSA 4W8EA 5B2KA 1V0OA 4I6QA 3BQCA 3GCVA 2XS0A 1PJKA 3QRJA 2YACA 3G6GA 5IMEA 4BI2A 3FKOA 3UPXA 2BRBA 3KFAA 2WEIA 3PXKA 2C1AA 4G34A 3QTXA 1W82A 3VBYA 3W2PA 3WF9A 3U6JA 5BYLA 5G6VA 4E6AA 2ITZA 4FTOA 2UW7A 2DQ7X 5I9YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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