3QX4A

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-1-78
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qx4A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qx4A01
4BYIA 3AQVA 1H1WA 2V62A 4UXQA 4D1XA 1Y8GA 2HOGA 5CQWA 4C4FA 5DIAA 1BMKA 2PVHA 3ZXZA 3G9LX 3BELA 1CM8A 3FLWA 3BLQA 2JDOA 5FP5A 3MVJA 3ZSIA 4U3YA 4BDEA 4EK5A 4JR3A 3OEFX 5CAQA 1H8FA 5CI7A 4J96A 2WOTA 5TF9A 3PE2A 5HCXA 4FKIA 1GOLA 4UEUA 3WIGA 3LJ1A 4DA5A 4AZVA 4FKQA 1IAHA 4IMYA 1PMEA 5EM6A 5FM3A 3ZC6A 5JFWA 3ATSA 3SAYA 4FNYA 5BVEA 4MXZA 3VWAA 3MH1A 4J53A 4BCFA 4G3DA 1OM1A 4CZTA 3UBDA 1ZMWA 2WMTA 2FB8A 3REPA 2JIVA 1SYKA 4XBUA 3TNWA 1ATPE 2UZLA 3LAUA 4O0XA 3Q2MA 3CY2A 3A8WA 3TUDA 4QMZA 3ZDIA 1KUTA 4NFMA 1YDSE 2WXVA 4QPMA 4LI5A 2XIKA 3B2TA 4C4IA 4NCTA 4TYIA 3W2RA 3D9VA 3COKA 4EUUA 4L3LA 4CRSA 4APCA 4LG4A 5KMJA 3GNIB 4FZFB 2WTVA 3WF6A 1OIQA 4U6RA 4TKSA 2F57A 1T45A 4QMPA 4YGAA 4DEGA 1Q8UA 1O6YA 4GVJA 4IZAA 4U42A 3U4WA 5IUGA 3VS3A 2C3LA 3MA6A 3HAMA 2ITWA 2C6KA 4FIGA 5H3QA 3E8EA 5KHWA 3KGAA 3C9WA 2P0CA 4S32A 4ITIA 2VWUA 4R3RA 2R3PA 3PWYA 2GFCA 3UOKA 2X9FA 3W10A 2C5OA 3KXHA 1RDQE 3ZO1A 4U80A 2GNGA 3D4QA 4Z3VA 4YNEA 1FBNA 1P14A 1J1BA 2VUWA 2VWWA 4OTDA 3JS2A 4GU9A 4BRXA 2EXCX 1XQZA 3EJ1A 1Q8TA 2A0CX 3AC8A 2J4ZA 4FZDB 3N4UA 5I5ZA 5HICA 4FODA 3TV7A 3IOPA 1AGWA 3LXNA 2CSNA 2PY3A 3ENHA 3QHRA 4AE6A 4WBBB 4DG2E 5I9XA 4CKJA 3D0EA 1G5SA 4BL1A 5L2SA 1BUHA 3AMBA 3BE9A 3DTWA 1E1XA 1SZMA 4AAAA 3CPBA 3QZGA 5A4CA 4EOKA 1FGIA 3GU5A 4L3JA 2H8HA 2YCRA 1OL1A 1W83A 3L9LA 3L8VA 5I9WA 4DFNA 5A4EA 2BAQA 5JMSA 3LFQA 1G8AA 2R3OA 2ZOQA 4DT8A 2ZMCA 3WIKA 2ZV9A 4L46A 4D4RA 4EH4A 4PMPA 4M7IA 5DVRA 5HVJA 3RHKA 4YSMA 2B9HA 3PXFA 3Q9ZA 4ACHA 1PKGA 3MH0A 4CEGA 4DHFA 4OAUC 3BBTB 2LAVA 2XNPA 4AGCA 1VZOA 3DK3A 2WB8A 3TNHA 1H1SA 4K8AA 4AGDA 5M53A 4O0VA 5AMNA 3GU6A 3U9CA 5EYCA 5K5XA 2PUPA 4M68A 4G3GA 4WUNA 3ZRMA 4F1MA 2XKFA 2Y8OA 4X2NA 3L8XA 3MB7A 5GJGA 4ARKA 3NR9A 1U59A 3OXZA 2FA2A 3HKOA 3QBNA 1H08A 1Q3WA 2FO0A 3TDVA 5EW3A 2QONA 4ASXA 4IAKA 4A9RA 4HZRA 1Q97A 4Q5EA 5E9EA 3MGYA 5E8UA 2DYLA 5DBXA 4CFNA 2ZB1A 3G5DA 3LXLA 4PPBA 4HCUA 3F5XA 4FV5A 4V04A 3T3VA 4FTQA 1CKIA 1PXPA 3DJ6A 3KN5A 3R7GA 4I23A 2CJMA 4IZ7A 3R83A 2QOCA 4XJ0A 4F1TA 3ZU7A 3BZ3A 2PUUA 1FINA 5C01A 2BAJA 4XH6A 4NTSA 4YHFA 1H28A 4FICA 4L01A 4C4JA 1M17A 2OJ9A 3UOLA 3FZRA 3R8PA 2VTLA 2X8IA 3DT1A 4HJOA 2PVMA 5HCYA 4CZYB 3PWDA 1OUYA 4D2PA 3EQBA 2W5HA 3FI2A 3P7BA 5IQFA 2YITA 4EK8A 3H9OA 2UW3A 3R8ZA 2VWIA 4GMYA 4AUAA 4EC9A 2Z7RA 5CALA 3IDBA 3G90X 3ORNA 4FV8A 3E7OA 4U5JA 3LHJA 1BKXA 2J50A 4RIWB 4KRCA 4LUEA 4QP1A 5DH3A 1CSNA 2GNJA 3QUDA 4FTOA 3AD4A 3DQXA 4I4FA 1LP4A 2SRCA 5CVGA 4C37A 5BVNA 3RPYA 4FTMA 4XOZA 3QGWA 5HORA 3E7VA 3PY0A 1EH4A 3DOGA 4NIFA 4ASEA 4I6HA 5ETAA 4RIXB 3LLAA 2R5TA 5K4IA 4DH1A 4L8MA 4CV8A 3RI1A 2PK9A 4G6LA 3G2FA 1JQHA 1J7IA 2BROA 2YISA 3QQLA 4FTCA 3ZC5A 3H9FA 2X2KA 1H1PA 2CN5A 2P4IA 3LM0A 3QD0A 5DEWA 4ZZNA 3VHEA 4RBLA 5C1QB 3Q4TA 1MRYA 2G15A 4P7EA 5HU9A 5DYJA 2UW4A 1B38A 3L9MA 3QWKA 4FNXA 5CSXA 4QMSA 1XR1A 4LQMA 4Y8DA 3PXKA 3W2OA 3RMFA 3ZXTA 3C4EA 3N9XA 4X3FA 2XIXA 5AAEA 4BIEA 5AUUA 4JX7A 4RJ3A 3PIYA 3ODYX 3FLQA 2VWVA 3U9NA 3NW7A 1UA2A 2KTYA 4RVTA 1RW8A 2BFYA 4R1YA 3JY9A 4Y85A 4BWXA 3BYUA 3RHXA 2NNWB 4ZEGA 3FWQA 3HRBA 3M2WA 5ITAA 3Q53A 4RIOA 4X2JA 4FIFA 4YSJA 2JC6A 2XF0A 3GOKA 2W9FB 5K0KA 3ALOA 3NDMA 4TYGA 4YMJA 3W2SA 4AN2A 5GJDA 1A06A 1Y8YA 1ZYSA 4BCNA 4CTCA 4IM0A 2CKPA 4FOCA 4IJPA 4DINA 2C4GA 3HP5A 2JAMA 5C4KA 5DG5A 4C2WA 4MXCA 3MFSA 3V51A 2XNGA 3U51A 3H9RA 2XVDA 2EUFB 3QYWA 3F2NA 2F2UA 3ELJA 4YJSA 4EL9A 1CKJA 2OI4X 4II5A 4J98A 3WZKA 2J7TA 3BQCA 2XK4A 2YERA 3O50A 3VJOA 4L42A 1FMKA 3VF8A 1V0PA 2UZTA 4G31A 4O7RA 4WA9A 3H4JA 3EFJA 3ANRA 1Q8YA 2XBAA 3CXWA 1OIRA 4JS8A 2YIQA 3L9NA 4QYEA 3RAKA 4RVKA 5M57A 2XKEA 3CE3A 5DRDA 5KMOA 4V05A 2JIUA 3QTZA 4D9TA 4FX3A 5AV0A 4OBPA 4RPVA 5EW9A 2UW9A 3CEKA 3BX5A 3HNGA 1JSUA 4X3FB 1KV1A 3DLSA 5M09A 3RNIA 1H1RA 3G6GA 3FKOA 2XYUA 3Q52A 4FKRA 4K18A 4K1BA 4AU8A 3UMXA 4K2RA 4XEYA 1PW2A 1B39A 3C4FA 1W0XC 2IW9A 3ZSHA 4DEEA 5L3AA 3OCBA 2WTKC 3VW6A 5T68A 3I6WA 2XNMA 4DGMA 3V5WA 5AM7A 3GCPA 4L6QA 1JAMA 4MTAA 1UVRA 4WG4A 3BPRA 1UNGA 5J9LA 3ZZWA 4KD1A 4F6SA 2XH5A 2J0LA 3QD3A 3OT3A 4O0WA 1ZY5A 4P4CA 5AP4A 4FT9A 4A4LA 4EHEA 5DE2A 4CLJA 4DTAA 3TM0A 4IM3A 3Q9WA 5AP2A 4O2PA 5IQCA 2UZOA 3G6HA 2UW5A 4D4YA 1XBAA 2W5AA 4FGBA 3CTHA 1QL6A 3F88A 4RX8A 4YJUA 5KMNA 3KULA 4WG3A 3WI6A 4RFMA 3ORTA 5DFPA 3EQHA 4V01A 2E9UA 3LCTA 3BHYA 1Q24A 5HO6A 4LL0A 4MXAA 2BIYA 5FD2A 5HG8A 4FIJA 3CKWA 5I9ZA 2GQSA 1WBWA 4YZBA 5L2QA 1DI9A 1V0BA 2W1EA 4GJ2A 5LVOA 3RZBA 4BCGA 5IH5A 3NLBA 3R0TA 4LV5A 3QGYA 2PMNX 2UZEA 4FZ7A 4O0RA 4AZSA 4EOPA 2G2FA 2UZBA 2ZM1A 2WKMA 3MB6A 3UIXA 4YR8A 4D0XA 3NPCA 2W4OA 5HTCA 2YLEA 4X6QC 3UZRA 2RL5A 4CG9A 3LFNA 4JG8A 2OJIA 4MF0A 4QMXA 5HESA 4JI9A 4FTRA 4IIRA 3UOHA 3DKGA 3PRFA 3V3VA 2ZVAA 5EM5A 3II5A 4U45A 3F3VA 3O17A 3PA3A 1ZY4A 2C68A 4O0UA 5IF1A 3LFBA 5J1WA 4IWPA 4D5KA 4HGTA 1OITA 3HL7A 3GFEA 3BU3A 4AOTA 4YU2A 3EYGA 5JQ8A 2O3PA 2ZYBA 4FG7A 2QO9A 4IVDA 3KRJA 4YC6A 3NNWA 4IC8A 1PF8A 4BVUA 1JWHA 2PL0A 4ZJIA 3RNYA 4CYJA 5CAUA 4AACA 2YDKA 5FEQA 4FI1A 5T6KA 4EH6A 4AX8A 3PPZA 4P5ZA 3PLAE 3VW8A 3ODZX 3R7VA 4O0TA 3RAHA 3QD2B 5EKNA 3A7FA 4O2ZA 2GNHA 3IW5A 4QYYA 4ACGA 2UVZA 2RGPA 1JKSA 2QR7A 4WRSA 2ITOA 4XV2A 2BCJA 3O23A 4JDJA 4ZZOA 1R39A 4BDBA 5IA1A 3FY2A 2PPQA 3LFSA 4UALA 3A61A 1GAGA 4I94A 3RVGA 3U55A 3ZO4A 2HIWA 2JKMA 3DZOA 4TNBA 3NYVA 4N57A 4DF3A 4NK9A 1QPJA 5LWNA 4AW2A 2GQRA 3VC4A 1LEWA 3QRTA 3C4ZA 4FKPA 3R00A 2HY81 2PVYA 2YM7A 4AG8A 4BGHA 5KZ0A 3FLSA 2NRUA 2W1FA 1WBOA 5HTBA 2R64A 1WBPA 2WFYA 3NGAA 2C6MA 5HEZA 3NX8A 2EXEA 2IJMA 4FF8A 4DE4A 3A4OX 3KMWA 3AC5A 3BIZA 3A99A 4U3ZA 5B0XA 3SHEA 4ZSEA 5E1EA 4TL0A 5AIRA 4GIHA 5CX9A 3VO3A 3VULA 3QL8A 3Q60A 5AP5A 4AOJA 4FTLA 3K5UA 3TTJA 2QVSE 3OZ6A 3KRRA 4M69A 3VUDA 2C0TA 3OC1A 4LMNA 4R1VA 1KOBA 4NW5A 4B99A 3VUHA 3VS4A 2R3LA 3Q6WA 4E4MA 2JKOA 3VUKA 5E8XA 5KKRB 4DTBA 2YJSA 3D5VA 5AUZA 3BKBA 2QKWB 3Q04A 3UE4A 4QRCA 2P55A 2QOIA 5CEIA 3Q32A 3C1XA 4H1JA 4C3RA 3QQKA 5BYYA 3QUEA 4IBMA 4BIBA 5HLWA 5J9YA 3DBCA 3HMMA 5JN2A 4PL5A 4WSYA 4B6LA 2BZHB 2XZSA 3ZMMA 2PZRA 4X2KA 3PXYA 5AUYA 4PMTA 2YABA 4D2WA 4E6QA 2VO7A 3ORPA 3NVKI 1KV2A 2J6MA 4YPSA 5CEMA 4QMVA 3DBDA 2WMUA 3NUUA 5K4JA 1GZNA 1R78A 3ZFXA 4FKGA 5D7AA 4PX6A 3Q4CA 1MQBA 2BDWA 4YHTA 2W1ZA 2PZ5A 3OUNB 4I1ZA 3UZTA 2A1AB 2CGXA 3OCSA 4JBQA 5DT3A 3QU0A 3F3WA 3CJGA 3EL7A 2QHNA 5FUTA 3E3BX 5HE1A 3DTCA 1I09A 4PTCA 4QP4A 3LZBA 2Z60A 4XHKB 4QP2A 3NIEA 4AP7A 4CFVA 3WF8A 4I0TA 3DPKA 5A6NA 2YM5A 5HX8A 1M7QA 2V5QA 3RK5A 3BHVA 3SQQA 3QXOA 1JPAA 3JVSA 4XRLA 3COHA 4EK4A 3TDWA 4DFBA 2VO6A 3KL8A 3VBWA 5I3RA 3FI4A 3A60A 4TWPA 5HLPA 1IAJA 3R7OA 4GYIA 4NM7A 2Z02A 5IQEA 3RBWA 4O1PA 4M69B 3BWJA 3K54A 4EOIA 2RG5A 4K11A 4L53A 5EH0A 3COIA 4I0SA 2J0KA 2VZ6A 4W9WA 5AV2A 4FSUA 4ANMA 5HNIX 5L6OA 3U6JA 4NL0A 3BBWA 1PMVA 2OJGA 3MVHA 1ZLTA 3TZ9A 4DEHA 2QU6A 1QPDA 3TN8A 4IADA 4UWYA 4U81A 4C59A 2YIRA 3GB2A 3I4BA 5AX3A 5E91A 3UGCA 2W99B 4RA4A 2UUEA 5BX0A 4DYMA 3FSFA 3SLSA 3R1QA 3IGGA 3NYNA 4AA4A 3EQCA 1ZOHA 2B54A 5CEKA 5HBHA 4AN9A 3BV3A 3NNXA 3O8PA 4WNPA 5AR3A 4W9XA 2ITXA 5FEDA 2J5FA 4EH8A 2F7EE 4PTGA 1G8SA 3EL8A 1RJBA 3K5VA 4XP3A 4C8BA 2YM4A 2G01A 4WRGA 4EZ5A 3ORMA 2YAKA 2V0DA 4E4LA 4QQCA 4DFLA 3B8QA 4BDAA 4I24A 2WD1A 3NNUA 3OXTA 3CTQA 4WUAA 3NSZA 3ANQA 4G2FA 3EQPA 3FHIA 3PIXA 3QC4A 4G6OA 3G0FA 3LQ5A 2X2LA 5LOHA 1YOLA 3LCOA 3OCTA 5IH6A 2CNUA 3UC4A 5AA9A 2UVXA 4D4VA 2W1HA 2W1IA 5CNOA 5HG7A 3NUPA 4E5BA 4LGDA 5K3YA 4ALUA 3S1HA 3MIYA 4P90A 4IXPA 2QQ7A 4JRVA 3ZOSA 4BCJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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