3QYZA

Crystal structure of erk2 in complex with an inhibitor
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
346
structure length
339
Chain Sequence
PEMVRQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNLNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTDLKICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDLPKEKLKELIFEETARFQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title In-plate protein crystallization, in situ ligand soaking and X-ray diffraction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 1
total genus 121
structure length 339
sequence length 346
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2011-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qyzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qyzA01
3Q4ZA 4F70A 1JKSA 5JFWA 3QWKA 3GOPA 1WBNA 5DGZA 3WIGA 4JXFA 2PVJA 1XBAA 2WQBA 3FI8A 1OGUA 4JS8A 2VRXA 4GIIA 4YO6A 1F3MC 4DH7A 2HCKA 5E8VA 4M12A 3BYVA 4MXXA 4HPUE 2OSCA 4IAIA 4CLIA 4EOJA 3QKKA 3ZUTA 4EUUA 1Y6BA 4FSMA 4D9TA 4G17A 5AP1A 4FKUA 1R0PA 5DIAA 1HCLA 2XKEA 4IMYA 3VRZA 3FQEA 2P33A 1PRYA 5BVDA 2IZSA 3PSCA 3DJ7A 3PXRA 4RX8A 4F4PA 3PXKA 2F7EE 5AUVA 4AX8A 3VS3A 2XNMA 2XEZA 1NA7A 4FZDB 3LLTA 4HVIA 3S95A 5H8EA 4CCBA 2O65A 2WB8A 2ZV7A 4EOIA 3FLQA 4QMUA 2V7OA 3VJNA 5E9EA 2CPKE 3LFSA 4YJUA 4D0WA 4EKLA 5IG1A 5TKDA 3GCPA 4D2VA 2VUWA 4FKOA 4YBJA 4KAOA 3SA0A 4O7YA 2H34A 2JLDA 4KSQA 5AM6A 4ORKA 1KE5A 3DK3A 4KB8A 4ANMA 5DI1A 4HVSA 1TQPA 3W18A 5IU2A 3G6GA 4UXQA 2IW9A 5M57A 4QMYA 1OIUA 2WEIA 3E88A 2HOGA 4O38A 2ETMA 3HMOA 3BE2A 4G9CA 3LCKA 4I21A 5AA8A 3ROCA 3A4OX 4QTBA 2WU7A 4MXOA 4YZNA 4YZMA 4F9BA 2ZB0A 3BLRA 4QMWA 3UO4A 2PZYA 3K3IA 5ETCA 3GNIB 4FV4A 5CQUA 5IH5A 1O6LA 3QUPA 5KKRB 1GIJA 1QPJA 5M55A 2GNHA 3K3JA 3UG2A 3W2CA 3TCPA 5C1QB 3QD2B 1SNXA 3PVGA 5A9UA 4KKHA 3AC3A 5M07A 3NGAA 3BQRA 2VWUA 1SYKA 3PSBA 2UZEA 2VO6A 4MQ2A 5ANJA 4RJ8A 3KF4A 4E4LA 3RPYA 3O71A 4YR8A 4RJ3A 2VWIA 4BKYA 1XH7A 4GKIA 3SXSA 4RVTA 5FM3A 3RAKA 4R3PA 4J52A 2OJJA 3VULA 4EZ3A 5EQYA 4GG7A 2BR1A 4U5JA 4LRJA 4AT4A 3OY1A 4IM3A 4M84A 1Z9XA 4IACA 3CJGA 4K9YA 2EXCX 4PPAA 3R7IA 4DA5A 5F9EA 3HDMA 3PLAE 3C5UA 5I9UA 3NLBA 1KV2A 5I9XA 4FNYA 1UV5A 4C37A 2G1TA 4UY9A 2BRNA 1JKLA 2REIA 4IAFA 4D5HA 3CC6A 2HXLA 2VTTA 4ZJVA 3FLWA 1YI4A 3HP2A 2OWBA 2QO9A 4ZEGA 4G3EA 4G2FA 1IAHA 2PYWA 2BKZA 4MF1A 3OD6X 3FL4A 4CFVA 2W4JA 2IO6A 3NNUA 4CG9A 4NCTC 3W8LA 4C3RA 4GFGA 4BICA 1CM8A 4L68A 3VHKA 4FIGA 4PY1A 1WBWA 4IB0A 4RA5A 5LWNA 5FTQA 1MQBA 5A3XA 4HNIA 2I0YA 3QFVA 4NWMA 2JGZA 4OUCA 4G5JA 4USEA 5CSPA 3TL8A 3G15A 1PMNA 4NYEA 1JAMA 3QL8A 3KFAA 4IAKA 1B39A 4W8EA 5L6WL 5A14A 4KBAA 5L4QA 2WMWA 5HTBA 4D58A 4R7HA 3TEIA 4CZTA 2E9NA 4FSRA 3KL8A 5FLFA 3ANRA 4MCVA 4LGGA 4Z55A 5JN2A 5BPYA 3WILA 1YHWA 3NR9A 1PY5A 5BVFA 2QO2A 4GUBA 3ZRLA 3C4CA 4MH7A 1OPKA 2J5FA 3GI3A 4LV8A 5HO6A 4AAAA 4Z3VA 3NW6A 2NNWB 4FKVA 5JQ5A 3HUCA 4UEUA 4ITIA 2XP2A 4TWOA 3VW8A 2YDKA 3KK8A 5KZIA 4CKIA 1ZYSA 1TQIA 3RK5A 3G9NA 3FE3A 5HCYA 3K5UA 3Q3BA 3R1YA 1NVSA 3OBGA 4MKCA 5M53A 3MYGA 3PJ8A 2WOUA 1PYEA 3VJOA 3KREA 4ZZOA 3KXZA 2PMIA 1ZYCA 2R3IA 4J8MA 4JVGA 3HV4A 2PVNA 3UIBA 4X0MA 4ACGA 5GINE 5CWZA 3I4BA 1DS5A 1KE7A 2JAVA 3KEXA 3IDCA 4QOXA 1J3HA 4P90A 2IVVA 5CENA 4GEOA 3QRIA 5KMOA 3I60A 4LRMA 3MFUA 4QMSA 4AFJA 4EJ7A 2CCHA 3Q2MA 2BPMA 2UVXA 3ORLA 4XX9A 5F95A 2WIPA 4F9AA 3BYSA 3VUGA 3DBCA 4U97A 2W1FA 2E9VA 3QZGA 1AGWA 4TYJA 3TKHA 4ZY6A 3UC3A 3S2PA 4IZYA 2OF2A 3R04A 2C6DA 4IM0A 4J98A 1BL6A 3Q53A 3UNJA 4FZAB 4PL3A 4F99A 3UNKA 3VUKA 3B2WA 1OECA 1JKKA 2W9ZB 5EKOA 5AUYA 4BDEA 1UKIA 3MY5A 2JFLA 4E93A 5JRQA 3HV6A 3TACA 4O6EA 5JKGA 3QUEA 1PXIA 1VR2A 2BZKB 2C1BA 3MVHA 3T3UA 4UMUA 4PMTA 3QCXA 3N9XA 4CSVA 4MWIA 3CQEA 1JVPP 3LFBA 2FO0A 3V5JA 3QZFA 4FL1A 5JMSA 5L6PA 2P55A 5D10A 1XWSA 4Y8DA 3RHKA 3VBYA 2PVMA 2XKDA 1W8CA 4WT6A 2YLEA 4E73A 3LJ1A 3CP9A 3D7TA 3ULIA 4EOPA 5M06A 1URCA 1WBVA 4IH8A 2XNPA 5BVOA 1J7UA 5HE3A 4RRVA 5AR8A 2OBJA 3DB6A 4QMMA 5CI7A 1P4OA 3RNIA 3VS0A 4TL0A 2VV9A 1OKVA 2IZUA 5ANDA 3PLSA 4M66A 2V62A 4RX7A 4YTCA 3TWJA 4EK6A 4XEYA 2C3LA 5EYCA 4QPAA 4O0SA 1PXLA 3I81A 2PWLA 3PJ1A 4WKQA 2VD5A 2R3QA 3EN7A 3HX4A 3H30A 5FXRA 2JIVA 1CKJA 2V5QA 5CYIA 3UG1A 2X2MA 1W82A 4R1YA 3F5UA 4KABA 5ACKA 2C1AA 4K1BA 1NXKA 3LFQA 5DH3A 5J9ZA 1L8TA 3EN6A 3JXWA 4AZVA 2CLXA 1OBDA 1ZOHA 2BFXA 2HYYA 2C0OA 4ZOGA 3UP7A 2R7IA 3FV8A 4IDVA 4AE9A 1YWVA 2GFCA 3C4WA 4U3YA 1FGIA 2JD5A 4A9UA 5GZAA 3ZLSA 5E8YA 1ZZLA 3FQSA 4RWLA 4GV1A 4JG6A 5AV1A 1A48A 2WQMA 5AADA 4JBVA 4FT7A 4KKGA 1VZOA 2Z60A 4GFMA 1IAJA 2WOTA 4YTFA 3MH1A 4MHAA 3UVQA 4TWPA 1OL1A 4ALWA 4E26A 3LCTA 2W1EA 2XM9A 5EDQA 5E8SA 3KXXA 3NIEA 3M2WA 3OEFX 4IC8A 4TYHA 3I1AA 3RK7A 1O6KA 5F20A 3C9WA 3QD0A 4DN5A 3TT0A 5CASA 5KMKA 1MRVA 4XJ0A 3JS2A 3NYNA 5D1JA 4LFIA 2YJSA 4W4WA 4D4VA 3EQBA 4ASDA 5C8KA 3UP2A 4ONAA 2CGXA 4E6AA 4DHFA 2ZMDA 2R3OA 4J8NA 5LVOA 4M3QA 4WNOA 3ZZWA 4GT4A 3VF9A 5AV2A 1JNKA 5E1SA 4YJOA 3P7AA 4FZFB 4PL5A 2VZ6A 4TYHB 2OH0E 4IJ9A 1E1XA 1PKDA 4IZAA 4X6RA 2FVDA 3D94A 3LJ0A 3IW7A 3DKOA 4I6HA 3TTIA 3QAME 3Q9WA 2WTDA 1YDTE 4LMUA 3CTJA 4I0TA 2FSTX 2ITPA 3OUNB 3ZM9A 2CLQA 1ZZ2A 2WNTA 2J6MA 3G90X 2Z02A 5TF9A 2ZDTA 4OBOA 5F1ZA 4QMNA 3QGYA 2H8HA 2PUUA 3EYHA 4HZSA 5KCVA 2HENA 4EZ5A 5IEXA 1KE9A 2RKUA 2YAKA 5FD2A 2JC6A 1IA9A 3FAAA 2UW9A 4F9YA 2XNGA 4RX9A 5BUEA 4L53A 4K6ZA 4NFNA 3NUNA 3HV3A 1YKRA 5HE2A 2UZUE 4PMMA 3CGOA 3FHIA 3FL5A 2ITXA 1YVJA 3V8SA 5I4NA 5J5SA 2Q83A 4IADA 2IN6A 4X6QC 5TE0A 1CKIA 3P7CA 4L7FA 4BIDA 4IXPA 4IW0A 3F61A 3U6JA 4DGNA 3Q04A 3LCSA 3DTCA 2V0DA 3BYOA 3QBNA 2CNUA 3TV7A 2ACXA 3WYYA 2QG5A 2ZOQA 4LG4A 5A46A 3AMYA 4FIHA 4V01A 4AOIA 1CKPA 2JDSA 4FTCA 4WNKA 4TNBA 3PG1A 4DTKA 1UU8A 4FIJA 4PUZA 5BQ0A 2QODA 4YC6A 3A8WA 4LMNA 5BVWA 5AAFA 4AOJA 1NT2A 2P3GX 4JNWA 2BIKB 4FODA 3UIXA 3UO6A 3DOGA 2WMSA 2XK4A 5G6VA 2OFVA 3NCZA 4NM0A 2P2IA 3ZM4A 2QNJA 3KC3A 4TNDA 3ZO4A 5AUTA 3EYGA 1QCFA 4I6FA 4CKJA 2Y8OA 3NAXA 4RQVA 2XYNA 4JR3A 1Q3WA 4DFUA 4MYGA 3NNWA 5DPVA 4JX7A 3HNGA 2X1NA 4U8ZA 3ZEPA 4XG9A 3R2BA 2B0QA 4CZUA 4RIWA 3MY0A 4QTEA 3F6XA 5GJGA 4QMXA 5AA9A 2QOQA 3NUAA 4FF8A 3PA5A 2O3PA 2X8IA 4IVCA 5I0BA 1Q8YA 4XHKB 4OBPA 4JIKA 3NUYA 4FZ7A 3R2YA 5HESA 2ZVAA 4I0RA 4OTFA 5L2SA 5IA1A 3UZTA 2DYLA 4GS6A 4DH3A 5J1VA 3JYAA 3QD4A 5C8NA 3COMA 2PTKA 3LQ3A 5AWMA 4RIWB 4ZLZA 4KIQA 2BALA 5KUPA 4ZTNA 1KUTA 2VTHA 1W84A 1WZYA 5CSWA 5HCZA 2E9PA 4U9AA 3VBWA 4EOMA 4UWCA 3G6HA 2CMWA 3QTWA 4O1PA 2CGWA 4DCAA 5CEMA 4BDFA 2B9JA 4WNPA 3DFAA 3FXXA 3R73A 3G51A 4HYSA 4YZBA 3PP1A 4NUSA 3R22A 3P23A 4CTCA 3NUUA 5HU3A 1Q3DA 1M2RA 4U6RA 3EMGA 3WOWA 3LW0A 3OCSA 4F0GA 2OW3A 3D2KA 2A1AB 1UVRA 5EG3A 4ZTMA 3KXGA 1WBOA 2BDWA 3M11A 3E5AA 5CVHA 4FKIA 4L9IA 1OI9A 2ONLA 4HJOA 4EH3A 2HW6A 4XUFA 3LXPA 3P79A 3LMGA 4E8AA 3CR0A 2J50A 3DZOA 3ROYA 4D5KA 2IW8A 5AR2A 4GMYA 4NFMA 4BZDA 4O7SA 3F3UA 4CQGA 3ZBFA 2RFNA 5DNRA 4ERKA 4HVHA 3TZ9A 5ICPA 1BL7A 2YERA 3EQCA 3LCOA 3OTUA 4E7WA 3C5IA 5EYKA 3GENA 3VQHA 2J4ZA 3RGFA 5FWKK 5BNJA 2OXYA 3RVGA 2BZHB 4HGSA 4AU8A 4UN0C 4FGRA 5KO1A 1MQ4A 2CSNA 1HOWA 2YZLA 2HY81 4EI4A 3GBZA 2EVAA 2QOFA 3P0MA 3MWUA 3E7OA 4FBXA 1PKGA 5IQFA 2W9FB 4AW1A 5HO8A 3F2NA 1FMKA 2PZ5A 2WD1A 4KINA 4NT4A 4QTCA 3SRVB 3ZONA 3ZSGA 3SVVA 3K2LA 2WTIA 3KVXA 5JZJA 3PXQA 3UNZA 3QX4A 2YCFA 2HK5A 2PY3A 4JIAA 2PE2A 4W8DA 5BUIA 4XYFA 4ZLYA 4U41A 3RWPA 2BUJA 4C4HA 4KD1A 4EONA 4WHZA 4DYMA 4Q9SA 5HG9A 2J0IA 4RBLA 4ACMA 1PXKA 5EK7A 4ZTQA 3W2OA 5HI2A 3UYTA 2XK7A 4EH2A 5KMJA 3W8QA 2XKFA 2OZOA 3W33A 4YJNA 2YITA 5HE0A 4CD0A 5J1WA 2ZV8A 3IECA 5TO8A 4ASXA 4FTTA 3BU6A 3O8UA 2VWYA 1OPJA 3EQGA 4B4LA 2RG6A 1UWJA 2HELA 2BAJA 4OLIA 4Y85A 3A7HA 3IW4A 4K11A 2Z7QA 3QHWA 3R8LA 1ZYLA 4B9DA 5E8TA 5M51A 4Q2AA 4WA9A 4X2FA 1SMHA 1OVEA 5CU4A 5LCJA 4KNBA 4YNOA 1G8SA 4FUYA 1G3NA 4QP2A 3CXWA 3AMBA 5IDNA 4OTPA 3TM0A 4QNYA 5HIBA 4FI1A 4BTJA 4KKEA 3FSKA 4ZJJA 1PMUA 4PTCA 4CNHA 2KULA 4FEVA 4DCEA 5GNKA 4J99A 3QRTA 3QQLA 4XRJA 4BWXA 2WTVA 5LVMA 4D2PA 3FKLA 2B9FA 1ZYJA 2ZAZA 3PXZA 2AC3A 3LHJA 4I4FA 3FDNA 5D9HA 5B2MA 1SVGA 5GJFA 1OUKA 3DQXA 3V51A 4MNEA 5HX8A 3VQUA 2WMQA 1XH8A 2VTIA 4F7NA 3Q6UA 1IRKA 3WBLA 1Q61A 4ACHA 1H00A 3L8XA 5KMNA 2YWPA 1H24A 4C61A 4ZAUA 4FEUA 4I6BA 2QLQA 3DAKA 3QTZA 4TN6A 3ZXTA 4DH5A 1H27A 3R7YA 2XRWA 4AGDA 4GSBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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