3ROYA

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-1-154
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 85
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3royA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3royA01
3KXZA 4GKIA 1H07A 4IMYA 1YI4A 3HV3A 5KBRA 3Q6UA 3EQBA 4AFJA 2GS7A 2UZTA 4N4SA 3FMKA 3M1SA 4O0XA 4PNIA 4KB8A 4QMWA 4U6RA 2C1BA 5CSHA 3VUTA 2EB3A 1M7NA 2HXQA 4ZTLA 4A07A 5LVOA 4GT4A 2W17A 2C5VA 2VTOA 2Z8CA 1U59A 2UVYA 3WZEA 4ZZOA 2P2HA 2WFYA 4APCA 4LRMA 4DLJA 4I93A 4YTHA 2VWUA 3GC8A 4USFA 1JAMA 5HOAA 2W5HA 2ZDUA 4E6QA 4ZSLA 2ETRA 3C4ZA 3NUSA 3Q9ZA 5EW9A 3DCVA 4FOCA 2W1EA 3NZ0A 4NKSA 2ETKA 4R5SA 2WPAA 4BWKA 3FPQA 3QXPA 3OROA 4FUXA 4C59A 3FI2A 3FMEA 3HMNA 4IQ6A 2HOGA 4CT1A 3HMMA 5KMMA 4XRLA 1ZARA 5D11A 2E9PA 5AR5A 4QYFA 3EFLA 4C38A 2CKPA 4XG2A 2ZYBA 5IQIA 2QI8A 3W1FA 4AE6A 3KC3A 5ETCA 1WVYA 3ORNA 1H26A 3FJQE 1G5SA 4KS8A 1ERKA 1JKTA 4USDA 4EEVA 4H3BA 2XJ1A 4E20A 4I20A 3RPYA 3PSDA 2UW9A 3E7OA 3Q60A 2V0DA 4C2VA 1PXPA 3VBWA 2YZLA 5AP1A 1RJBA 2LGCA 3E8NA 1VYWA 3POOA 3QBNA 2PVFA 5EDRA 1SVHA 5E8TA 4AUAA 3IPHA 5AR3A 2J9MA 3RM7A 2VGPA 4D1XA 2G2IA 4DH8A 1YHVA 1FMKA 3U6HA 5CSWA 1YI6A 4U97A 2VAGA 5M4UA 2QONA 3PRIA 4L3LA 3AG9A 4XOYA 5DBXA 4D1SA 4GL9A 1UNGA 5BYLA 2YCQA 4XCUA 2VV9A 2JKQA 1M7QA 3GOKA 4W9XA 3TV4A 3DBCA 4XH6A 3OW3A 1QMZA 2WMQA 2OWBA 2QO7A 4GIIA 5EYCA 5HGIA 3QCQA 5IF1A 5JFXA 3I5ZA 3DQWA 3BEGA 4RA5A 3QFVA 3BHTA 4FUYA 4S33A 4RA4A 3ZXZA 5I4NA 4UWYA 4LQMA 2HK5A 5EQEA 2XK8A 4EH8A 5IH6A 4DG2E 3ELJA 4FG8A 3ORXA 5D7VA 3MA6A 2JITA 3ZFXA 1WZYA 4AW2A 4BDGA 4CTBA 1JPAA 2C69A 1PXKA 2QLQA 5JFSA 3R7UA 3EL7A 4YLKA 5HCZA 2R3IA 2XNGA 4JRVA 5M07A 4QT1A 5CVGA 1XH4A 5JQ8A 4X2JA 3FQEA 3G15A 4DH1A 4GG5A 4C8BA 4YC8A 4HW7A 3BGZA 2Y8OA 2XEYA 3CBLA 4BBFA 3TUBA 2SRCA 5IQGA 5E8SA 4FSTA 3CGOA 2GNIA 4QP8A 3TNHA 5FP5A 3BRBA 2H8HA 1QPCA 5HVYA 4KD1A 2PYWA 3II5A 4BDEA 2E9UA 1O6LA 5CU2A 5DEWA 4B99A 5AUUA 3TDWA 1ATPE 3UO4A 3SG8A 3UO6A 3GEQA 3EQIA 2ITXA 4FV0A 2C3IB 1CSNA 3SDJA 3PXQA 4BIBA 3ZFYA 4ITJA 3T3UA 3WF7A 4CTCA 3CSVA 4CFWA 4Y72A 5CS6A 1M17A 2DS1A 3BWFA 4CZYB 4RJ5A 4ID7A 4PMPA 4FTLA 3FXXA 5EYDA 3GCQA 4F08A 3ET7A 3DS6A 3L8VA 1KOAA 1U5QA 4JG6A 3F3WA 1IAHA 3DT1A 1Q8YA 3FMNA 2J90A 3BLRA 3CTJA 4D4RA 2XJ0A 3OP5A 3FXZA 3E93A 4J8MA 2YIWA 4DA5A 2OU7A 3SLSA 3R71A 4FTMA 4A4LA 4RWLA 4DC2A 5E8UA 2Z02A 4GV1A 3G5DA 4ZY5A 5K9IA 2WQMA 3ODZX 4MEDA 3VUGA 3ZONA 3UYSA 4ASZA 4FGBA 4YNOA 4BVUA 3WYXA 3TDVA 2QR7A 3BHHA 5JFWA 1H0WA 3A7FA 5ETFA 4O38A 4F9WA 4NM7A 1W82A 4TL0A 4O7NA 1PYEA 4UEUA 4QMXA 3R8PA 3LFFA 1K3AA 3MA3A 1OECA 2VTIA 3QX2A 4RQKA 5CEMA 2JFMA 4CCUA 4RX9A 3GT8A 1GNGA 2WTDA 3RNYA 4XLVA 2UZEA 3RAHA 4IW0A 5LMKA 4FZ6A 4YGAA 4CFUA 4G9RA 2R3FA 2BZHB 3ODYX 4I6BA 3WZJA 1WVXA 3VRZA 3FLSA 4FL2A 3FHIA 2HIWA 3MTLA 4JLCA 2AYPA 3KMUA 4MTAA 5HLNA 2BIKB 1J91A 3DGKA 3VW6A 3GC7A 3NX8A 5CF8A 4CMTA 4ENYA 2BPMA 1B6CB 3MFSA 3QQUA 4RIXB 4FKSA 2HZ4A 3SW7A 1OITA 2PVHA 1CKPA 1PF8A 4KRCA 4LL5A 4F1OA 1G8SA 3P23A 4C34A 2XNNA 2ERZE 3D4QA 5CQWA 1PW2A 5AFVA 4OTFA 3KRRA 1E1XA 4F1MA 3PJ8A 4Y46A 3V5LA 2E2BA 5KE0A 3FZRA 3WOWA 3GCPA 4I0TA 1J1BA 4BCJA 4U45A 5HICA 4ZIMA 4CFVA 3DXNA 5HD4A 4AN2A 3EN9A 2DUVA 4M69A 1MUOA 2OZOA 3OBJA 2BDWA 2BDFA 4EBVA 2WQOA 5CSPA 3V01A 5CNNA 4XYFA 2BTRA 4QP4A 4FTAA 3QZHA 3PXYA 3LQ5A 2QOLA 4NTSA 1T46A 3HNGA 3FZPA 4ZTHA 3S4QA 4OR5A 4EUUA 3ZO1A 2XJ2A 2YWPA 3G51A 5M08A 2FVDA 2E9OA 3DFAA 2Y9QA 1T45A 2OFUA 4ZTRA 2BDJA 2C6EA 5E92A 3ULIA 2QKWB 3GQLA 5L2WA 1XH7A 2X2KA 4AN3A 3SC1A 5AUWA 2QD9A 3COIA 4DAWA 4PPBA 4QTCA 2F57A 1Q61A 2XCHA 3F7WA 2JGZA 1ZXEA 4NKAA 4F9BA 3A99A 1R0EA 3VQHA 4O81A 4X3JA 1Y6AA 4BDDA 2WMRA 2YCSA 3UIXA 5AP4A 4I5PA 4IWPA 2WTKC 3NYXA 3TV6A 4IB5A 4CD0A 4IAAA 3AXWA 2B0QA 3VUKA 1ZRZA 3R2YA 4HCVA 3ROCA 1ZY4A 4LRJA 1REJA 5L2TA 4G5PA 1UU9A 4NJDA 4P7EA 3R8MA 3ALNA 4O27B 2PHKA 5HVJA 3BE2A 2AC5A 4XG4A 3OF0A 5C27A 5CAQA 2CKQA 2XK4A 3EFWA 2IVTA 5DH3A 4FZ7A 3VUMA 2WQBA 5DVRA 5T3QA 1Z57A 3EKNA 5GZAA 3Q32A 5CEQA 3DKCA 5HCXA 3RBWA 2DQ7X 3AC1A 3GC0A 3MY1A 1ZYDA 2CHLA 3MB6A 2W1HA 4II5A 3R28A 1Q3DA 5AJQA 2WQEA 3G6HA 3R02A 5HO7A 1F0QA 2C3JA 4O7TA 4NFNA 4Y73A 2GFSA 3QRTA 5M51A 4DGGA 3F5XA 4MQ2A 2XKFA 4EOMA 5AUTA 2CJMA 3NLBA 2BHHA 4RC3A 4BYJA 3H9OA 2OIBA 2FSTX 4V04A 4CYJA 2BRMA 4M97A 4I41A 3WF6A 4ONAA 4EJ7A 4L6QA 3R7VA 5K3YA 3VS7A 2VWWA 2YN8A 2CPKE 1U54B 2UW0A 2W0JA 3DBQA 3HLLA 3JVRA 5GHVA 4MBJA 1PXMA 5HIEA 1OBGA 5ACKA 3L1SA 4GFMA 4D58A 3NWWA 4JRNA 3MDYA 4EUTA 4O91A 2BIYA 4MHAA 5CF5A 2ZJWA 4N0SA 2EXCX 1QPDA 5JT2A 4BTKA 4EH3A 3KXNA 2QG5A 2BHEA 5M44A 2OI4X 4RJ6A 2WMSA 4ITHA 5TF9A 2B9JA 4GH2A 3RPRA 2PE2A 3UPZA 4OBQA 1TVOA 3R7YA 2GHMA 3SVVA 2WIPA 3AMYA 3UNKA 1F5QA 1OMWA 1WBSA 4FT7A 3ZC5A 4E6CA 2EWAA 4ZJIA 3WE8A 4U79A 4UYAA 3QKKA 4BBMA 1XJDA 2XIXA 3VW8A 4FEWA 1GZOA 1G3NA 4M15A 5HBJA 5DMZA 3SGCA 3DJ7A 4F6WA 4FICA 1W98A 3VF8A 4L44A 2HY0A 3IECA 3ZRMA 1JNKA 4YJQA 4GJ3A 3RWPA 4FE2A 3AQVA 4QMQA 5IQCA 5BUIA 3WE4A 3HV5A 4KIKA 5FP6A 4BGGA 2FYSA 2IZRA 1ZYLA 5B2MA 3LKMA 4CZUA 2PY3A 3R9DA 2QODA 3OZ6A 1Q97A 4ACGA 3S0OA 2YITA 3PJ2A 3QZIA 4JXFA 3QTQA 4B4LA 4BDAA 4D55A 3UQFA 4GKHA 4EK6A 1Q8ZA 2WIHA 3CQWA 2WQNA 1NA7A 3JR1A 2XK9A 4D4SA 5F9EA 5BVOA 4YSMA 2XVDA 3OXZA 4IZ5A 5GJDA 2BILB 3CC6A 3EQFA 4QOXA 4BZNA 4EQUA 3UP2A 4PL5A 3COMA 4O7ZA 4KSQA 4PDSA 5HE2A 3MH0A 1OKYA 3Q4TA 5CAPA 3FMHA 3JVSA 4LGHA 1XH5A 4BCOA 4XNEA 1IAJA 1FVTA 2VTQA 4MAOA 4AZTA 5HZNA 2OICA 3DJ5A 4PL4A 5ANIA 3CTHA 3G2FA 5HHWA 3A4OX 3C13A 3Q6WA 4AACA 4ACCA 1W0XC 2X2MA 4APPA 5CAUA 3WIGA 5C8KA 3QXOA 3ZLXA 3VUDA 2QG7A 5IG1A 1J1CA 1XH9A 4GUEA 4I92A 4FV3A 2H96A 3C4WA 3F3ZA 4F65A 2GU8A 2W06A 2QOQA 1W7HA 2QHMA 2YCFA 3SRVB 1XO2B 4YZ9A 4ALUA 4BZDA 4N57A 2GS2A 4BKYA 3OOGA 3QUPA 1KE9A 3KRWA 2F7XE 3L9MA 3FWQA 3FL5A 3QTXA 1WAKA 3PIYA 4QP3A 5A4LA 3MTFA 1J3HA 4EHZA 2J5EA 5IQDA 2YERA 1YXXA 4FSUA 4YMJA 2X7FA 3FSKA 4C58A 3WILA 2C6OA 1DM2A 2ZV2A 4QPMA 3VS0A 4B0GA 3QX4A 3R6XA 4BCMA 4AZVA 5IUIA 4HYHA 3FC1X 5T6KA 4EH6A 1O6YA 3OW4A 1UKHA 1Q8WA 4ALVA 2QCSA 3FBVA 1IA9A 2JDRA 3V04A 3LCKA 5JZNA 4OTQA 3PG1A 4AW5A 5H8EA 1YWRA 2IZTA 2YDJA 3GBZA 3R22A 4ZSGA 1B39A 2XNOA 5HO8A 5KHWA 2XZSA 5J9YA 2X9FA 4JBPA 5J1WA 4QYYA 2HXLA 5H8BA 2IVVA 3I60A 4NM0A 4RFZA 3A2CA 2W9FB 4W4VA 3TN8A 3AC2A 4PMTA 5AR4A 3KULB 4RIWA 5EI8A 5H9BA 1FVRA 4D2VA 5EYMA 5AUYA 3RAIA 5AA9A 5IDPA 3D5VA 1KE7A 3R1YA 1YDRE 1JSVA 5ANEA 2WELA 2XF0A 3WARA 3UZTA 3H4JA 1WBOA 5HESA 4D2TA 2W5BA 2YM7A 4L3PA 1FVVA 2ONLC 4BL1A 5AX9A 4EK8A 4TY1A 2H6DA 3DK7A 4DH3A 2QOFA 5E7RA 4O6EA 4DBXA 4XX9A 3LFEA 2UW6A 4BCKA 4C7TA 4BGHA 5JSMA 4S30A 5K5XA 3H0ZA 1YOJA 3FE3A 3ZSHA 3R2BA 5I9VA 4EC9A 4D2SA 4PF4A 4J96A 3S2PA 2CNQA 4H3PA 1JBPE 4JR3A 4RJ7A 4NK9A 4ZS4A 1H1PA 3GVUA 2ESMA 2W1IA 4TWOA 5TKDA 4IC8A 4L46A 1BYGA 2QOBA 1AQ1A 3LCTA 3DXPA 4FGRA 4BN1A 3A60A 3MPTA 3ATTA 3R9RA 4WUNA 2YIRA 2PWLA 3JUHA 5AR8A 5J87A 2XIRA 2WMXA 5HE1A 4C4EA 3I81A 4G16A 3HVCA 3FMJA 3U87A 2G01A 4GYIA 4QP1A 2GHGA 3PE1A 2OF2A 2X8DA 4E73A 4ASEA 2X0GA 5M57A 3R00A 4ZLYA 2VWIA 3LQ3A 4RIYA 3NRMA 2YJRA 1YXVA 1OL1A 1K9AA 3IDBA 2A0CX 3UO5A 1PXIA 4PNKA 3C4XA 3MSSA 4Q9SA 4JI9A 3ZEPA 4ZEGA 1H8FA 4QPAA 5DA3A 3OMVA 5HE0A 3WIKA 2JBPA 3T3VA 5CEOA 4RJ4A 4BC6A 2VWVA 2ZV8A 1DAWA 1ZOGA 3NUPA 3VJOA 3C0GA 3PXKA 3QTRA 3RMFA 3RWQA 2P3GX 4DITA 4AZEA 4WG5A 5I9YA 4RPVA 5IA4A 4NL0A 4U9AA 3RGFA 5HO6A 3UOJA 2V62A 4KS7A 3PSCA 3QTZA 2JDTA 3G33A 2ZV9A 4ZK5A 4XEYA 2VTHA 5AAEA 2YCRA 3NS9A 4EH2A 3BV2A 3QGYA 3G9NA 3P79A 4ZLZA 3LZBA 3VHKA 5E8YA 4A4OA 2XRWA 3GQIA 3FQSA 3OY1A 3K2LA 2C3LA 5FWKK 4R7HA 3AC4A 2X6DA 3TNPC 2WEVA 4EOJA 2GNLA 3DLSA 2XS0A 5HNBA 3TL8A 4R7BA 1SNXA 1CKJA 4WG3A 4TTHB 2IN6A 2WD1A 4C2WA 2PVLA 5A14A 4H36A 4IWDA 5A3XA 3R9HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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