3RPSA

Structure of human ck2alpha in complex with the atp-competitive inhibitor 3-(4,5,6,7-tetrabromo-1h-benzotriazol-1-yl)propan-1-ol
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
334
structure length
334
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Enzymatic activity with an incomplete catalytic spine - insights from a comparative structural analysis of human CK2alpha and its paralogous isoform CK2alpha'
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
total genus 104
structure length 334
sequence length 334
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rpsA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3rpsA02
2E9OA 4FG9A 1J1CA 3TNIA 4MNEB 2WU6A 2IVUA 5DRDA 1YXXA 2PUIA 5JKGA 1A06A 3QTQA 3C4ZA 2GSFA 1VJYA 2X9FA 3MDYA 4YZMA 2B9HA 3PP1A 1PMNA 4G34A 5LVMA 4QQ5A 2A27A 3ETAA 3FLZA 3MI9A 3R7EA 5HBJA 3L9PA 2RG5A 2GHGA 3VRYA 4B99A 1GAGA 5IG1A 4C4IA 4C61A 2NRYA 5L2IA 4AZEA 3QTWA 4NM0A 5I9WA 1GZKA 1VR2A 3KREA 1UKIA 3RCJA 1MQBA 3V5WA 4ERWA 3F6XA 1YDSE 2IW6A 5A4CA 2JIIA 3ENHA 3UZPA 3SC1A 2XYUA 2QG5A 4KNBA 4D5KA 2YJSA 3E87A 2UZOA 4IX5A 2OICA 4GRBA 4BCGA 2VTLA 5LQFA 3I79A 2QOFA 3QXOA 4BWPA 5LWNA 1O9UA 3DBEA 3RPRA 4B9DA 3F88A 4AOJA 3HLLA 4O7TA 4QYGA 5E8UA 2WU7A 4PTGA 2GNGA 3OBJA 5KHWA 2GNIA 4EKLA 4C7TA 5CYIA 4FICA 2LAVA 4DEDA 4E8AA 3F2RA 3KF4A 1WBNA 2V7OA 4HNIA 4CT2A 2OKRA 3G15A 2IW9A 1UNLA 4ASDA 1R0EA 3WE4A 3NUNA 4ENXA 1H07A 2ZJWA 4BDBA 5IQIA 1YDRE 1MRVA 3MTFA 5AP3A 3KMMA 3ZFMA 3RPVA 2YERA 3OT3A 3LQ8A 3QZIA 1E9HA 2OFUA 5FEDA 4HCTA 3W16A 4YHFA 3WBLA 2HCKA 4DTKA 4CG9A 4G9CA 4EQCA 3NUUA 4GL9A 3RI1A 2OJFE 5HE0A 5FTOA 3UGCA 3A7HA 3E93A 5HTCA 3HECA 5FBNC 2B55A 3T9IA 4QTEA 3RZBA 2XK7A 4LFIA 4YNEA 3LVPA 4R6VA 4DG0E 3VUKA 5AMNA 4WHZA 2E9VA 4IWOA 4GYGA 4RJ3A 3PG3A 2QOBA 4WRSA 2WQMA 3KN6A 3V3VA 4FODA 4F9WA 1CDKA 2WXVA 2HIWA 3E62A 1V1KA 4D9TA 4ZEGA 4O7LA 1JOWB 2BHEA 4FBXA 4RVKA 4YTFA 1IAJA 3ZO1A 5HE2A 3ZLXA 3KY2A 3QRTA 4BWKA 3GU4A 4H39A 3M2WA 4L3LA 3ZSGA 4ZY4A 3TACA 5AM7A 1WBVA 1LUFA 3DK6A 4U8ZA 5E90A 3UNJA 4D4VA 3VUGA 3QWKA 4O22A 1QPJA 4RZVA 3M1SA 3U87A 5KMJA 2VX0A 3TEIA 2J50A 3PRIA 2W17A 2BPMA 1YI3A 2RFDA 2XB7A 1PY5A 4F9BA 5D7VA 3COKA 3ZEWA 5LJJA 3ROCA 3W2QA 4Y72A 2Y4IB 4Y8DA 4EORA 4GVJA 4FYOA 4BTFA 2WMVA 2QR7A 4O7RA 3PPZA 5L6OA 5CAUA 1W98A 4HPUE 5CXHA 2BR1A 4JXFA 3R7UA 3P78A 2BIKB 4XYFA 5HVKA 2IG7A 4GKHA 1ZWSA 3V01A 3NUAA 4M3QA 3W8LA 4BKYA 4EK5A 2CN8A 2XYNA 4XLIA 2VO3A 2DS1A 3FMNA 5HG5A 3FLQA 3LM5A 3OW3A 4QTDA 3THBA 5CT7A 5T68A 1XBCA 4TRLA 2HW7A 2QI8A 4D1XA 4YTHA 1IA9A 4C59A 3C4XA 1S9JA 4BCFA 4ORKA 4OTGA 4Y73A 2PMNX 5HVYA 1DAWA 5BUJA 1UVRA 4F64A 4BZOA 3G2FA 4FV5A 3E3BX 2HXLA 3RAHA 3O71A 1CMKE 2XKFA 3KF7A 4FR4A 1B39A 3MIYA 4EQUA 2VTQA 2X2LA 1ERKA 2ZVAA 1H4LA 2F7ZE 2O0UA 2XM9A 1GY3A 3WYXA 3E8CA 3AC1A 3TKUA 1OL1A 4FTAA 3BGZA 5CEQA 4ERKA 2YIWA 4E4MA 5EM6A 3UNZA 4NKAA 3PE1A 4FKRA 3NMUF 1XO2B 1VYWA 3CP9A 3NUXA 3ZSIA 3CLYA 4FYNA 5FTGA 3OP5A 4WNKA 2R5TA 3VJOA 4QMPA 5DH3A 3CD3A 4UWYA 3HGKA 1BMKA 2C4GA 2JAVA 3Q5ZA 4FTUA 2J7TA 5CSWA 3SGCA 4CG8A 2OH0E 5EYKA 1JNKA 2OBJA 4C3PA 4D55A 4ANLA 2IPXA 1Q97A 4E20A 4CXAA 3KRLA 2SRCA 3OW4A 3TKHA 5CQWA 3DKCA 4EH7A 1A48A 3FDNA 3QALE 2OJGA 4P90A 2UZVA 3DXPA 5DFPA 1J7LA 4I3ZA 3L8VA 5D11A 2X7FA 1PXKA 2J0KA 3COHA 2H96A 3BYVA 4WO5A 4CRLA 4LGDA 4U7ZA 3IPHA 5BUEA 5JFWA 5EM8A 5IEXA 1H1PA 1APME 4YZDA 2ITTA 3RK7A 4FSQA 1G3NA 2J0MB 1Q8WA 5D7AA 4EOMA 3C51A 4L8MA 2PZ5A 3POZA 3NGAA 1CKJA 3LJ1A 5EK7A 4FKJA 4FI1A 4DEAA 1FBNA 2VX3A 4X3JA 4CFWA 3UO4A 4GFGA 2X0GA 3NW7A 4ZTHA 4ZZMA 4JRVA 1WVXA 3ORNA 3QLFA 5AR4A 2HELA 5EYDA 4AWIA 4FMQA 2A2AA 4HVGA 4FTLA 4G16A 2JKMA 3EN9A 1J7IA 1B6CB 2PZPA 5KKRB 4C57A 5CSPA 5HCZA 5DMZA 1PHKA 4IEBA 3FQSA 3FZSA 4G2FA 3EQCA 4BCHA 5ITAA 2VTIA 4WG3A 4L46A 2OF4A 4FKTA 2NO3A 3TZ9A 5F20A 1YXUA 4IAAA 5EKNA 4CLIA 4ONAA 5A4EA 4WA9A 3TN8A 4ZTNA 3VVHA 3MESA 4FKLA 3T9TA 2ITWA 3VUMA 3U55A 4AGCA 1U54A 1YKRA 3LMGA 2BCJA 2Z7RA 5LMAA 3AG9A 2XKEA 4ZLYA 2W1IA 3A2CA 3EQHA 3QTUA 4KBCA 4RC3A 5L2WA 1L3RE 3R1SA 4FSNA 4MAOA 2WPAA 3QFVA 4C02A 5CXZA 3U6IA 5DN3A 3RK9A 4EOQA 4C58A 3MH2A 1H1WA 4PRJA 1OBGA 3QF9A 3EHAA 2ZAZA 3R21A 4G3CA 1ZLTA 3TT0A 3O8UA 3VBTA 1RDQE 2OI4X 2C6EA 2WQBA 2Z7SA 4DH5A 4U3ZA 4HYUA 3R00A 1RE8A 3EN6A 3WZUA 3PA4A 4FTCA 3AT2A 4PTEA 3SDJA 5TE0A 4BTJA 2PVNA 4KIKA 5GINE 4HCUA 2QHMA 4NL0A 4JNWA 3P9JA 3L8PA 1PF8A 3MJ2A 3KK8A 4YJVA 3FPMA 3LE6A 4N0SA 4QTAA 4O6EA 3A62A 3K2LA 2BAKA 4EOJA 2OW3A 2UZUE 1JSUA 3VHEA 3S00A 2C68A 2WZJA 3ZLWA 3KCKA 1Q3DA 2XCHA 5C26A 5M56A 5EW8A 1OKVA 5ANEA 5AUWA 2G15A 4APCA 2YDJA 4JIKA 4ZSLA 4IAIA 5DPVA 3QQLA 3EFKA 4J8NA 2F57A 3H10A 1H8FA 4LQMA 3NZ0A 3GGFA 4QPAA 4TT7A 3ZDIA 4GT5A 4HCVA 4RQVA 3QU0A 3D9VA 3R2YA 3NUPA 4G3DA 2OIDA 4WBOA 4CT1A 2HOGA 5HTIA 2UZTA 3LFBA 2BRGA 4BL1A 5LMKA 1UA2A 3PWDA 2WEIA 3LFAA 3OT8A 4XRJA 3A8WA 4R3RA 4L01A 1OITA 5HIDA 4JG6A 1T46A 2HY0A 3R30A 4YBJA 4ACHA 3REPA 3D15A 4BBEA 3AQVA 3PVGA 1WBSA 4W8EA 5FP5A 1XBAA 3PY0A 4KKGA 2R64A 2G2FA 4GG5A 4CLJA 3IDPA 1PXLA 4PPAA 3NR9A 4BCJA 5TT7A 4GG7A 5EDQA 2B9FA 5ANGA 5AAGA 3NWWA 4E93A 2CJMA 4IQ6A 1OL5A 2XK4A 5EDRA 5AUTA 2Z8CA 3ALNA 3S0OA 1YHVA 4WUNA 3GB2A 3D0EA 3BYSA 3CIKA 3IW8A 4XG6A 4FV6A 3PIXA 5LCKA 4FIEA 4L7SA 3ORIA 3PRFA 4IE9A 4TYIA 4BCIA 3HP5A 2G1TA 2WOUA 3HV7A 4W4YA 3ZFYA 4M0YA 3KULA 2J4ZA 4FKWA 4ACGA 2Z02A 3FMMA 4R1YA 3IW4A 4ACCA 3KVXA 3U54A 2R3RA 3HMPA 5ACKA 3DQXA 3RAIA 4CMUA 4L44A 2PVMA 4DGNA 4ASXA 3UIBA 3ZXZA 5HGIA 2YZLA 2YACA 3PA5A 3JY9A 3GC9A 2CGUA 3BLRA 2YM6A 1Q62A 3KGAA 1FQ1B 1URCA 4FV2A 3CY3A 5B0XA 3VRZA 4GW8A 4XOZA 2VWZA 4U81A 4L3JA 4TN6A 3ODZX 5CSXA 3I0OA 3F61A 3VBQA 2GHMA 4LRJA 4R7HA 4TY1A 3DKOA 4GMYA 4ITIA 1U54B 2R3QA 3R02A 2OZAB 2VU3A 4FV7A 4S31A 5FM3A 4AE9A 5K4JA 1LP4A 3LJ0A 1VYZA 3QD2B 1F5QA 2J0IA 3DXNA 4P5QA 3QZGA 3TJCA 4X2GA 5M55A 1ZYSA 2YDIA 2NRUA 3PY1A 3BKBA 4WNOA 4LOOA 4GT4A 5D12A 3EYGA 2VTTA 4RIOA 4Z55A 3RAWA 5AR5A 3FI2A 3KU2A 4PNIA 5ANIA 3NDMA 5BVWA 3PLAE 5LVOA 1GZ8A 3R83A 3PPJA 1XH5A 4KIKB 3MPAA 3P4KA 2UV2A 3FHIA 4Y85A 2W5BA 3BBTB 4G6NA 4NM7A 5D41A 4O86A 4GYIA 4FL2A 4ACDA 3SA0A 4BCOA 3JPVA 4EOOA 5HE1A 1M7QA 1YQJA 4OGRA 3RNIA 2XRUA 3G0EA 2YM4A 3OWJA 4RGJA 2W9FB 3DB6A 3I7CA 4IIRA 4JBPA 4HPTE 5E91A 3VULA 4DLIA 4ZMFA 5FRIA 4CCBA 2X6DA 3NX8A 4NFNA 3E63A 2RIOA 3FBVA 2I0EA 4ACMA 1CSNA 3I4BA 3QCYA 4JL9A 3WF9A 3F66A 2WFYA 1PXNA 2ITUA 3TNQB 2VV9A 3FUPA 4EBVA 4EH4A 3EWHA 3IONA 4PUZA 2VD5A 1SNUA 5JZNA 4EK8A 4EOPA 3UDBA 4QQJA 4AN3A 3KB7A 2WMUA 5KMIA 4KIQA 4IACA 5K0XA 2XIXA 4IAZA 4AXAA 4GK3A 4JQ7A 4FE2A 3BV2A 2BZKB 4RFZA 2ETRA 4UXLA 5H2UA 2WTJA 3KEXA 3TNHA 4UWBA 4QNAA 5M4UA 2FGIA 4JG8A 3DNDA 2WO6A 4CQGA 4QMZA 3POOA 2IZSA 3ZS5A 4AACA 4QP1A 4C2WA 5M06A 2YCRA 5C1QB 1ZY5A 2XA4A 5GZ9A 3BX5A 2CN5A 5AIKA 2PVHA 3VBXA 1NT2A 4MQ1A 4PX6A 5CF6A 3KXMA 4IC7A 1FGKA 1XQZA 3QQGA 2A0CX 3KRWA 5DLSA 1RQQA 2CCIA 2QONA 3WF6A 2XEYA 2UZDA 3U6JA 5TR6A 2OU7A 1DI9A 5AIRA 5M53A 3DBDA 3COIA 3NEWA 2H9VA 4IBMA 5DEWA 5AP7A 5J79A 5M57A 3N4UA 3FLWA 1OI9A 3KULB 3ZLSA 2ZB1A 4ANNA 1J91A 3ZHPC 3G6GA 2FSOX 3OY3A 3ZO4A 2DUVA 4BZNA 5JEBA 2UZBA 1U59A 4A9TA 3DZQA 4DE4A 5HOAA 4UZDA 4DFNA 1NXKA 4JJRA 1SM2A 5AFVA 3D2IA 5E7RA 3PP0A 4RBLA 3KMWA 4ANSA 3ACKA 4AT4A 1M14A 2R3IA 4BTMA 4EHEA 2BDFA 3JUHA 2HW6A 4N70A 1PXIA 2O3PA 2VUWA 3C13A 4IXPA 3EFLA 4I21A 4C0TA 5LVLA 3TUDA 3R6XA 2UVXA 2BALA 4FEVA 4O81A 2B54A 3ULIA 3NS9A 4AGDA 4CKRA 4ZSEA 4BIBA 4UYAA 3ZM9A 1H1SA 2R9SA 1KE8A 4H3BA 4KKEA 4E6CA 2IW8A 2C3IB 4KUJA 5A14A 2QO7A 4DGOA 3N51A 2R4BA 4FKQA 5C27A 4ITJA 4A4XA 1M2RA 2IZRA 5HU3A 3DJ7A 2JFLA 4NEUA 1ZMUA 3HA6A 5L2SA 4YZCA 3VBVA 4AUAA 4YU2A 3EMGA 3ROYA 1BL6A 4NJ3A 2WTDA 4YC3A 2E9PA 5F95A 4JR7A 3T3UA 5M4IA 4FZFB 1ZMVA 4DEIA 2VN9A 4U44A 4M12A 2R3OA 3G51A 4OAVB 2CMWA 2BRHA 4LG4A 3PJCA 4BBFA 4NCTA 3OEFX 4I6QA 4G6LA 4TYHB 2JFMA 3HMOA 1ZARA 2FYSA 3BEGA 1TQMA 2C30A 1UNHA 2OF2A 3C1XA 1PKDA 2X6EA 1M52A 4CV9A 3FWQA 5J1WA 3OEZA 1KOBA 2VWYA 3ZRMA 5E9EA 5BYYA 5IISA 2Y0AA 3UQFA 4LI5A 3QQHA 1ZOHA 1ZZ2A 5HCXA 1ZZLA 4QYHA 4RX8A 4AF3A 1JQHA 4DBXA 2IZTA 4FEXA 2YFXA 3IECA 2UZWE 3C0GA 4HGLA 5K5NA 1U5QA 3B2TA 3KVWA 4Q9SA 3BYOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1ST4 A;  2OKR A;  3G15 A;  2IW9 A;  1UNL A;  4ASD A;  1R0E A;  3WE4 A;  3NUN A;  4ENX A;  1H07 A;  2ZJW A;  4BDB A;  5IQI A;  1YDR E;  1MRV A;  3MTF A;  5AP3 A;  3KMM A;  3ZFM A;  3RPV A;  2YER A;  3OT3 A;  3LQ8 A;  3QZI A;  1E9H A;  4LV7 A;  2OFU A;  5FED A;  4HCT A;  3W16 A;  4YHF A;  3WBL A;  2HCK A;  4DTK A;  4CG9 A;  4G9C A;  4EQC A;  3NUU A;  4GL9 A;  3RI1 A;  2OJF E;  5HE0 A;  5FTO A;  3UGC A;  3A7H A;  3E93 A;  5HTC A;  3HEC A;  5FBN C;  2B55 A;  3T9I A;  4QTE A;  3RZB A;  2XK7 A;  4LFI A;  4QEB A;  4YNE A;  3LVP A;  3BL7 A;  4R6V A;  4DG0 E;  3VUK A;  5AMN A;  4WHZ A;  2E9V A;  4IWO A;  4GYG A;  4RJ3 A;  3PG3 A;  2QOB A;  4WRS A;  2WQM A;  3W0O A;  3KN6 A;  3V3V A;  4FOD A;  4F9W A;  1CDK A;  2WXV A;  2HIW A;  3E62 A;  1V1K A;  4D9T A;  4ZEG A;  4O7L A;  1JOW B;  2BHE A;  4FBX A;  4RVK A;  4YTF A;  1IAJ A;  3ZO1 A;  5HE2 A;  3ZLX A;  3KY2 A;  3QRT A;  4BWK A;  3GU4 A;  4H39 A;  3M2W A;  4L3L A;  3ZSG A;  4ZY4 A;  3TAC A;  5AM7 A;  1WBV A;  1LUF A;  3DK6 A;  4U8Z A;  5E90 A;  3UNJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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