3RVGA

Crystals structure of jak2 with a 1-amino-5h-pyrido[4,3-b]indol-4-carboxamide inhibitor
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
292
structure length
285
Chain Sequence
PTQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIEILKSLQHDNIVKYKGVCYSAGRRNLKLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHIKLLQYTSQICKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEKVSPIFWYAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGNDKQGQMIVFHLIELLKNNGRLPRPDGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDQIRDNMAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Discovery of 1-amino-5H-pyrido[4,3-b]indol-4-carboxamide inhibitors of Janus kinase 2 (JAK2) for the treatment of myeloproliferative disorders.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK2
total genus 88
structure length 285
sequence length 292
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rvgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3rvgA01
3LCOA 4AGDA 3GGFA 5CEPA 2Z8CA 3R01A 4FICA 4RVTA 5E8XA 3DKGA 5EM6A 3KRRA 3BEAA 2BIKB 2BAJA 5FRIA 3UPXA 2Z7RA 3SXFA 3DBDA 3M11A 4JDIA 2XKEA 1Y57A 3VBYA 4F6UA 5J9YA 3OWLA 2C1AA 2YEXA 4GKHA 4JAIA 2VTTA 4H05A 4KRDA 4G3GA 3DTCA 3UZPA 1VJYA 4DFBA 3NNVA 3BHUA 3ELJA 2R3RA 2BRBA 1HOWA 3C5UA 4NM3A 4LRMA 4FKTA 5FDPA 4CFWA 5EDQA 5FEDA 4XLVA 4H1JA 3I6UA 4K8AA 5FTOA 4BIBA 3EFLA 2B9JA 5DHJA 3NUUA 3FMMA 2W5BA 4YJSA 3VUGA 2Y4IC 5HVJA 2XIKA 2JFLA 2X8IA 4PV0A 3Q3BA 3QRIA 1VYZA 4G3FA 3L1SA 3Q9XA 4E6QA 4JG8A 5AX3A 1H8FA 2OGVA 3KVWA 3R9RA 5J8IA 1R78A 5LVLA 4DEBA 3Q52A 4JAJA 1E1XA 2P3GX 4J1RA 1SYKA 4GFMA 3R8ZA 3ZCLA 1YXTA 4FL3A 4HNIA 5ETAA 3PXRA 4GK2A 3LXLA 4F7LA 4KS8A 1L3RE 4I0RA 4NCTA 4QTEA 3WZUA 3I60A 3FI4A 4Z55A 2QCSA 4CZUA 4K18A 3VUMA 4USDA 2OICA 2PE1A 1KE9A 3EFWA 4QO9A 4DGMA 4BDCA 3ALNA 3HUBA 3N4TA 2HZNA 3PPJA 3ZO4A 2WQNA 3DT1A 3SC1A 4H58A 4S31A 2XIYA 3AC1A 3R0TA 4M14A 4FI1A 1OL7A 3WYYA 5DEYA 1OUYA 5HO7A 4YJQA 3ZSHA 5FBOA 3N4VA 5C1QB 3IQ7A 3RM6A 4N6YA 4O0WA 3EQHA 1WMKA 3Q60A 2BILB 3R7IA 2YHVA 4HZSA 4K11A 2Y0AA 3B2TA 2QOLA 4TYGA 3OEZA 2XP2A 3NIEA 4EORA 3BLQA 2XNEA 1J7IA 3ZFYA 2RFNA 2LGCA 2QOFA 5IEVA 3RBWA 4PDSA 3NPCA 2IN6A 4U5JA 1CM8A 5JZNA 3UNJA 4FTAA 2QOIA 3WIGA 3A7GA 2YIWA 3ORLA 3VVHA 4MXOA 1NVQA 4UMQA 1YXUA 4XCUA 3BU3A 2VNWA 4QQCA 4V04A 4YC3A 5EKOA 2C1BA 4I6BA 3CXWA 5FEEA 4C33A 5IH6A 4CSVA 2IVVA 3NUXA 2UZUE 4UWCA 3VS3A 4IZ7A 1S9JA 3O8PA 3NMUF 1JNKA 4GG5A 3NW6A 4C62A 3ZU7A 2XUUA 2CMWA 4YO6A 1PY5A 3MPMA 3TNWA 4CT1A 3I5ZA 4WG4A 2VGPA 5DE2A 4E6CA 1OKZA 2YISA 1FBNA 2BDJA 3FSFA 5EHYA 4TNBA 3V8WA 4MD8E 4Y85A 3ZOSA 4E4NA 1ZOEA 3MB7A 4YNEA 4IVDA 4W4VA 4E93A 5ETCA 4JRVA 2GNHA 4QMTA 4RIYA 3W2RA 4KIOA 4ZY5A 3BBTB 3FXXA 4IADA 3UOHA 2CKEA 4QMWA 1Q4LA 3E8CA 3NUYA 1R1WA 4NFMA 5GJGA 3QQFA 3W55A 3AC3A 4ANLA 1Q99A 3KN6A 4C4FA 4X2FA 4ANSA 3LW0A 2G01A 2DYLA 3EQGA 2F7EE 2QONA 3G0EA 4P7EA 1R3CA 3P86A 4HGEA 5BUJA 4ZTRA 4EC9A 4FYOA 4U3ZA 4IC7A 1FVRA 3H3CA 4QRCA 3GC0A 2A19B 4PL5A 4D58A 2UVXA 4C4HA 3POZA 4Q5EA 4YZBA 4DTAA 1M2PA 4Y95A 5CZIA 2I0EA 4N6ZA 4X0MA 3C9WA 3FE3A 2BZHB 3EQCA 4LL5A 5T6KA 1PYEA 3ZUTA 2XK6A 2QQ7A 5KZ0A 4QPSA 4QP2A 3QTRA 4DTKA 3SOCA 4APPA 3HDNA 5A54A 3ZBFA 3LE6A 4Z7GA 3QWKA 3PA3A 5DMZA 4Z3VA 1SVGA 2C5YA 4D4VA 4XH6A 4F7NA 5F94A 1UU9A 3FZRA 1RQQA 3LCDA 4XG4A 4O38A 5AP6A 4QPAA 4O7NA 3VS4A 3ZSGA 1URWA 4ZSGA 2JDVA 4G9CA 4PTCA 2J5EA 5KNJA 3UE4A 4IX3A 3PWDA 2VWYA 3DOGA 5AEPA 3VUIA 4FL1A 4FODA 4NTTA 4X21A 5ETIA 1Q61A 2C5NA 3GXLA 1IAJA 3EQDA 4EOSA 2XEYA 3VS2A 4KNBA 3WI6A 2XBAA 3NUNA 4RVLA 3CBLA 3FMJA 2VTPA 4D1SA 2JDRA 2GS2A 4UYAA 3JS2A 4CCUA 4FV2A 4L7SA 2VTIA 5M55A 2ZM3A 1UU3A 5EI6A 5DN3A 5G6VA 5HNGA 3F2AA 3Q2JA 5HD7A 4D2VA 4D2RA 2EVAA 3OHTA 4QYHA 2QO9A 5EI2A 2Q83A 1BLXA 1JLUE 3AMAA 4QMMA 1PHKA 2OFUA 5IU2A 4FTMA 4FVQA 3I1AA 3C0GA 3DK7A 3QTWA 4IC8A 5F4NA 4QMNA 4RA5A 3THBA 5FD2A 3MY0A 4EJ7A 2C69A 1JKLA 1FMKA 2W06A 4CFFA 3G2FA 4M66A 5EH0A 5DG5A 2B1PA 3NRMA 3LFEA 4FMQA 1NT2A 3COIA 3Q5IA 3WIKA 5AUUA 4CV8A 4I4EA 4ONAA 5J9ZA 2EWAA 4YTCA 4FG9A 3CGFA 4GU9A 4EYJA 4I4FA 4AE9A 1PYXA 1QMZA 2GS6A 4BKJA 4JX7A 3UO5A 2ZJWA 4ACHA 4O7WA 5JFXA 4DGGA 4A4LA 2OO8X 3EYGA 4ANNA 4X2JA 1U4DA 2YN8A 1OPJA 3PJ1A 3R73A 3UZRA 4FSRA 2ITUA 4FSQA 5IG1A 3SG9A 1H1SA 3V01A 2QHMA 3HA6A 3MY5A 4J98A 3ULZA 5AR3A 1QCFA 3KGAA 2HW6A 2IZUA 3PJCA 3C4CA 4L44A 3TN8A 2FUMA 1U59A 4ALWA 2FSMX 4ASXA 4C4JA 4CV9A 3VBVA 3D14A 3S95A 5CAOA 3KMWA 2C0OA 1FGKA 3HV7A 4M69A 4WNKA 5HBJA 1YOJA 3U6IA 4O86A 4PPCA 4U43A 4BCHA 4AZSA 4E5WA 4IAAA 1OKWA 4OTRA 2B4SB 4LMNA 4GV1A 2Z02A 3GB2A 3MDYA 2XA4A 2YCQA 4FKQA 5FLFA 2PZYA 2WMBA 2YJRA 2XCHA 4O22A 1H28A 3ALOA 3ZFMA 4JJRA 5JFSA 4G3CA 4AACA 4ZTNA 2CSNA 2X2KA 4LGGA 4RX9A 3RK7A 2AC5A 4AA0A 5M08A 4W8DA 5LVPA 3EJ1A 3U8WA 1Q5KA 4DA5A 4OLIA 3TIYA 2PUNA 3COHA 4CD0A 3GC7A 4DC2A 4CGAA 4EZ7A 3NIZA 4O0UA 5BVKA 4PX6A 3KULB 3DCVA 4I94A 1A06A 4FTTA 1SM2A 5FXSA 1Z9XA 4AWIA 2WTKC 3HLLA 5CVHA 5C27A 4E73A 4EK6A 2G2IA 2V62A 4AOIA 2E9PA 2VWWA 4DLJA 2V7AA 3HMOA 4E3CA 4HVSA 4R5SA 4GU6A 4FV7A 3VS7A 3LFBA 4CLJA 1M52A 4U41A 4M13A 3VUHA 1AQ1A 3W32A 5ANDA 3PA5A 5ICPA 2F49A 2B9IA 3ZHPC 4ALVA 4UN0C 1TQIA 5M07A 2ZV9A 4GKIA 3L9LA 2ZM4A 3ANQA 5EYDA 3FY0A 1APME 2OH4A 4H3QA 2QO2A 4XP0A 5LVMA 2WZJA 3MJ2A 4TYEA 3TKHA 4BCMA 4W4YA 1WBOA 2PHKA 2O5KA 1ZYCA 3PXQA 2NPQA 4E6AA 4R77A 3FAAA 2UZNA 4YUQA 3SLSA 1MRYA 1OITA 3A99A 3R2YA 4KKHA 2C30A 2I1MA 5LJJA 4G5PA 4GIIA 4YC8A 4ZSEA 4LOOA 1BKXA 2EXCX 2XKFA 2PVKA 4BDAA 3CKWA 3QCXA 4PNIA 5A4TA 1B38A 3GQIA 4QTDA 4M0YA 3QKMA 3AC4A 2HWOA 3D5WA 4RLLA 4U8ZA 4BHNA 5AP2A 5B2LA 1VEBA 5EM7A 2C6MA 3TV6A 3D2IA 4EOMA 3VUDA 4AGCA 3KEXA 5KCVA 3V5LA 5A4CA 2YIXA 4RRVA 1MRVA 5A46A 4G31A 3QZHA 3KU2A 4K2RA 3VS0A 4D2SA 3FZTA 4XRJA 3U4WA 2A4LA 3DA6A 3E7OA 3DBCA 2XRWA 4AG8A 2R3PA 4HVIA 2ZDTA 4C37A 4FTCA 4NT4A 3HA8A 4IB3A 4DEEA 3DNEA 5C9CA 4FKUA 4J7BA 4DN5A 1E1VA 4BTKA 4YLLA 5B0XA 5HCYA 4DBNA 2UZDA 3LXNA 1H01A 1XR1A 5CAUA 5LMBA 1MQ4A 1JSTA 1DS5A 5J7HA 5IISA 3H9OA 4D1XA 4FVRA 4UB7A 4ZTHA 4J8MA 4GT4A 1MQBA 5TT7A 3V5WA 4O21A 5AV2A 4BBEA 2GHGA 3OBJA 4OBQA 5AV4A 3A4OX 3TTJA 1M17A 2I0YA 2OF2A 2XRUA 4O7RA 2X6DA 1KE6A 2ZB0A 4RZWA 3P7CA 4O0VA 1ZOGA 3F7ZA 2J0KA 2QI8A 4MWIA 1FPUA 2YDJA 3PSDA 2JDSA 1ZYJA 3C4WA 1YI4A 3BWJA 3CKXA 5DR6A 4D2WA 2R3MA 3GT8A 3FHRA 2XK4A 1OBGA 5EM5A 4R7IA 2XJ1A 4RFMA 5FM3A 3FLQA 5TKDA 5J7BA 4R1YA 5KMJA 4FKOA 2G15A 1URCA 2QKWB 4IQ6A 2XEZA 5EK7A 2OJIA 4AN2A 4FKJA 3DXNA 4B7TA 5IQGA 4IFCA 4QNAA 2X2LA 5DT3A 5L8LA 1Q8WA 4XP2A 2P4IA 4QMQA 2EU9A 2JIVA 4R5YA 4QTAA 4RX8A 2W5AA 2UW5A 1XH9A 2C6OA 2ITPA 4J71A 2OWBA 4XG9A 5EW9A 2FGIA 2RIOA 3F3WA 5A3XA 3A4PA 1BX6A 2X39A 3PTGA 3R8MA 4BC6A 5HTBA 1U46A 3CE3A 4FIFA 3GUBA 4UMTA 4E20A 5J1VA 3EN5A 2IPXA 2UW4A 2R3IA 4FKSA 3VQHA 4C0TA 3WZJA 3D5XA 3C0HA 3DGKA 2OG8A 3EL8A 4RSSA 2WMRA 1YXSA 3QUDA 5BMSA 3QYWA 3EL7A 3QZFA 2JGZA 3II5A 4MEDA 2BKKA 4FEWA 5CQWA 5T3QA 3EN6A 4L52A 4CNHA 4A7CA 5KBQA 1W84A 2WOTA 3A62A 3ZO2A 2PMIA 4IVCA 5GZ9A 1CTPE 4MQ2A 1GIJA 5EQPA 1YXVA 4FSUA 4BDJA 3LXKA 1F3MC 2BRGA 4BFMA 1PF8A 1UKHA 1G5SA 1R39A 4UV0A 5JFWA 4EZ5A 4RQVA 2Y4PA 1M2RA 4JIKA 1Z5MA 1XBAA 4KKEA 5E7RA 4AQCA 3F3TA 1H4LA 3UGCA 3QD2B 3HYHA 4IDVA 4CFMA 4FTQA 1YHWA 5DVRA 3G9LX 4O82A 4GYIA 5M53A 2A0CX 3RAIA 4F0GA 3E8NA 3ZTXA 1WVWA 5EW3A 3TDWA 1ZAOA 4HZRA 3SGCA 1M14A 3LHJA 1LR4A 3ORXA 4RFZA 3K5VA 5DH3A 5BVEA 3WE8A 3MPTA 2XNGA 4TN6A 3PLSA 5HD4A 2BVAA 2Y4IB 4HVHA 5HCXA 4YZMA 4OTDA 3OCGA 4GFGA 5B2KA 4APCA 5M06A 1JOWB 4MAOA 3DLSA 5GINE 3OP5A 3P79A 2QKRA 4KIKB 5HZNA 4WNPA 4Y46A 1YDTE 3O50A 3FYJX 3WBLA 4KB8A 3G90X 5HE2A 2PL0A 2FYSA 3EFJA 2JITA 3RVGA 3ATSA 2R2PA 2WAJA 3VUTA 4FZAB 3FUPA 5M4IA 1OL1A 3QTIA 5HLPA 4BCKA 3OXZA 2VTMA 4GW8A 1Z57A 2XK8A 2OSCA 4IWQA 2GQSA 2R3KA 3C50A 2I40A 3OCBA 4BCPA 5JGDA 3DLZA 3EHAA 5HORA 3QQUA 3ZSIA 2G2HA 3DAJA 3KMUA 5DR9A 4KINA 1F5QA 2PZIA 3IW5A 5E90A 2QVSE 3LM0A 4O7ZA 1LP4A 5LQFA 2J50A 1V0OA 4TYJA 1X8BA 4U6RA 2OJFE 1XKKA 1XWSA 5E91A 4M84A 4MBJA 3DJ6A 2YITA 2GQRA 4S30A 3HEGA 2CDZA 4O0TA 3VHEA 4ANQA 1Q3WA 3H9FA 4OTGA 2J7TA 2Q0NA 2O8YA 2UZEA 3ZC5A 4EOIA 4DEHA 1IAHA 4OW8A 1KSWA 3W8LA 3I0QA 2G9XA 2HCKA 4WBBB 4QMZA 1O6KA 3T8OA 3I5NA 3PRIA 3QC9A 3BGZA 5EYKA 3PIXA 5DOSA 4UWYA 5L6WL 5FP6A 4XG8A 4F0FA 3QAME 4AS0A 5CF6A 4QYYA 4RT7A 4WT6A 3FZPA 4QT1A 3QRTA 5CT7A 5AR5A 1NXKA 3TV7A 4JDKA 4FSNA 2WHBA 3UQFA 3DBQA 3LKMA 2WMTA 4WBOA 3UNZA 3WOWA 5K0KA 1M7QA 3QCYA 2YFXA 3NDMA 4RIXB 5DFPA 4HJOA 3U55A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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