3U6JA

Crystal structure of the vegfr2 kinase domain in complex with a pyrazolone inhibitor
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
310
structure length
308
Chain Sequence
EHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVITEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKVAPEDLYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDRHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Vascular endothelial growth factor receptor 2
publication title Structure-based design of novel class II c-Met inhibitors: 1. Identification of pyrazolone-based derivatives.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 308
sequence length 310
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3u6jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3u6jA01
2JBPA 1QMZA 2YEXA 3NAYA 2V0DA 4RJ3A 5CY3A 5EYKA 4DFBA 1JKLA 3DLSA 3GGFA 4WNOA 2GQGA 2B9HA 2JIUA 1JOWB 3H10A 3QUPA 4FV8A 3VQUA 3UZPA 3D5VA 2QCSA 3KU2A 5TT7A 4AE6A 2QU6A 4FZ6A 1ZOHA 3KK8A 2UZVA 3NDMA 4HGTA 1LEWA 5GHVA 4B7TA 4FSZA 3DXPA 1XWSA 1OKYA 3KN5A 2EVAA 3BE9A 3PY0A 1YHSA 1H08A 4QO9A 3FI3A 3RPYA 4NJ3A 1H00A 4W8DA 1REJA 3NCZA 1Q8UA 2E2BA 3HUCA 4RPVA 4TN6A 5DNRA 3O2MA 2W5AA 3SG8A 4QTDA 2IZTA 3COKA 5CSXA 2IZUA 4J97A 3HYHA 3ZFXA 5EDRA 4YJUA 4HYSA 1Y91A 4IW0A 5ANGA 4BCNA 3EKKA 4EK6A 5HTCA 4E26A 1OB3A 2I0VA 3GU8A 3CLYA 3OCSA 3UYTA 1E1VA 2W1EA 5HORA 3UMWA 4BWKA 2ONLC 1UNLA 4MAOA 2PL0A 4UEUA 1G5SA 1URCA 3ORZA 1FMKA 4OR5A 4XJ0A 4EH5A 2JDVA 3MBLA 1PRYA 4LUEA 4PNKA 4G6NA 3C4CA 4U97A 4X6RA 2CGXA 3KRWA 4P7EA 2Z7LA 3UC4A 1FOTA 3OCGA 4Z3VA 2C6LA 4NSTA 3IOPA 1JKSA 4C34A 4NZWB 3C5UA 1H1RA 4QYFA 3UO4A 3HMNA 5B2MA 5CU2A 2RGPA 3MTFA 5JGBA 3F61A 2JGZA 4BDGA 3RK5A 5FTQA 3QQLA 4FTLA 4BYIA 4G6OA 4LOOA 3ZLSA 3UOKA 2F4JA 2OH0E 5E8VA 3G15A 3GOKA 3DY7A 4LG4A 3WZEA 1KE5A 3DFCB 3EQRA 3Q9WA 2I6LA 3ZC5A 4A9UA 3WF9A 5M4UA 4KUJA 4XUFA 3OFMA 2C1AA 5M51A 1Q8ZA 3HMIA 3KCKA 4E5BA 4O0XA 5J7BA 3V8SA 5DT3A 5E8YA 2VTNA 4YC6A 3DK6A 4GH2A 3E64A 4QQCA 4BCOA 4C3RA 2ZB0A 3OT8A 4TW9A 4YC3A 2VN9A 3R9DA 3RPRA 5J95A 4FUXA 5C8MA 4C0TA 3UPZA 2C5NA 1LR4A 1P4FA 3KGAA 3R8LA 2PE0A 4NUSA 3QQUA 5EW9A 4DFUA 4IC7A 4LGGA 3PJ1A 4EHVA 2C6KA 4FA2A 2BDJA 4O7TA 5I5ZA 3UO5A 4BTFA 1NW1A 5HZNA 5KCVA 3C5IA 3PIXA 4TWCA 1KWPA 4JBPA 2BRBA 3A7JA 3LXKA 4MBJA 2YHVA 2PZIA 3SOAA 5AJQA 3E8DA 3TTJA 5IA4A 5LMKC 2OZAB 2XEZA 2ZMCA 4UXLA 2W1IA 3ID6C 4FBXA 3FXZA 3EQPA 2ZDTA 4FV0A 4N70A 2RL5A 5IH6A 3NWWA 1MRYA 4FT5A 4FEUA 4AACA 3IW7A 2XH5A 5H9BA 4MK0A 2V5QA 4M69B 4NEUA 3FJQE 3SA0A 3VW8A 2QR8A 3QL8A 2WQOA 4AZFA 2WNTA 3AMBA 3U55A 3O96A 4KIKA 3PA5A 3AC3A 3NMUF 2OJFE 1MQ4A 4ZY4A 2FYSA 4FKPA 5CF6A 1XH9A 1JSTA 1Q3DA 2YA9A 3BV3A 3CXWA 4XG2A 4O0YA 5JMSA 4U40A 1DAYA 4OTPA 3QHRA 5HG8A 4UZHA 2QOCA 2BTSA 4DTBA 4O7RA 4U81A 4GK2A 5CZHA 5LMBA 3KVWA 4XRLA 1S9JA 3WF5A 2PUIA 2OSCA 2VTTA 3F3UA 3Q2JA 3NUUA 4TRLA 5I3OA 4DN5A 1WBVA 3E8EA 4I0SA 3RVGA 4EUTA 2VRXA 3ZC6A 2FSMX 2OJIA 3QTWA 5DPVA 2J0IA 3BELA 4I5PA 4ZAUA 3VJOA 4BBFA 4B99A 4L9IA 3HMOA 4OTQA 5IQFA 1S9IA 1IA9A 4ENYA 4I94A 5EFQA 5AADA 4KD1A 4TWPA 4DEAA 4M8TA 3AMYA 4E4NA 4RC2A 4EH8A 4EOOA 3C50A 4BBEA 4I6QA 1ZY5A 5J87A 2IO6A 3SQQA 4O83A 4C36A 3SXSA 4D9TA 4L7SA 2Y7JA 5EQEA 4ANLA 1GZNA 4GEOA 4BI1A 2PZ5A 2OFVA 4JNWA 4L8MA 3LJ0A 3E88A 3OT3A 2CNQA 4D0WA 1QPCA 2W99B 3VS7A 4BDJA 3HEGA 4I23A 3C0HA 2CNUA 4LOPA 3KMWA 3MJ2A 3EQFA 5H3QA 2REIA 4EOJA 3BCEA 5FXRA 1OIYA 2UZBA 4MXAA 2QD9A 4QMLA 2O5KA 2C69A 1FQ1B 1UVRA 4H05A 2X8EA 4AGDA 4DGLC 3JY9A 5KHWA 3OCTA 5M4CA 3F2RA 1ZMVA 4AZVA 5FG8A 3VBQA 5HIEA 3OTVA 4Y46A 2ITVA 4DAWA 5CALA 2ITNA 4O2PA 5EKOA 1JLUE 4H3PA 5D11A 4IIRA 1FPUA 3FC1X 3SD0A 2R5TA 3UDBA 2NO3A 3TV6A 5CAUA 5JFXA 4FE2A 3EFLA 5KE0A 3WIGA 3LFCA 5IQEA 3FV8A 1H25A 2CCIA 4G16A 3Q4ZA 1R3CA 4J53A 4P5QA 3ZO2A 4AN9A 2C47A 4GJ2A 4AN2A 4BKZA 4F9YA 3SW7A 2XNNA 2YM3A 5AP2A 4EH7A 4HCVA 5EQPA 2XIXA 2WELA 4YO4A 5CAVA 5LJJA 4HVGA 4M15A 4HPUE 4MD7E 1QCFA 3H9FA 4JBVA 4ZLYA 2UW9A 2CGWA 4CSVA 4EBWA 4AT3A 5IEYA 1YOMA 3Q9XA 4IFGA 5HCYA 3VBYA 4DG3E 3PG3A 4EHZA 3JYAA 4C4JA 5AV3A 2UZNA 3CQEA 2IPXA 4RJ5A 2C6TA 3TWJA 1O6LA 4AX8A 2CHLA 5AAEA 3ZFYA 2VWYA 3QRUA 4C4FA 2PVFA 3MTLA 5C8KA 1OL7A 4YJQA 2OGVA 3E63A 4O6LA 4EH3A 4BBMA 5L6PA 3DBEA 4TYHA 2R0UA 4GU9A 2GNLA 4Y73A 2X9EA 2HOGA 2ZVAA 3DZOA 4FIHA 4NIFA 4B6LA 2RSVA 2OWBA 3AC1A 1F3MC 3HMMA 4I6HA 3CCNA 2C5VA 3EL7A 4OTDA 2C5XA 1VYWA 3ULZA 3KRLA 5CENA 2Z60A 5J9ZA 2VWXA 4YJNA 4IXPA 4M67A 4UMQA 1UU3A 1PYEA 2WTKC 2BRNA 4ANBA 5K4JA 1YHVA 4O27B 3DDQA 4GK4A 1J3HA 2GHMA 3BHUA 3TUCA 4G3DA 5B2LA 3CC6A 1NVRA 3EN9A 4ZP5A 1OL6A 3A62A 3FMJA 4D5KA 3KMUA 1TQPA 4BYJA 3LFFA 1OUYA 2F7ZE 3PVUA 4S33A 3FEGA 2WQNA 3LKMA 3R01A 4QTBA 4FIEA 5K0KA 3SGCA 3MY0A 4AGUA 4F9BA 5IEVA 3NIZA 4DFYA 4KB8A 4DC2A 4TYIA 3LFNA 5IQIA 2CGUA 4CCBA 5JGAA 3JS2A 2VWBA 4R6VA 3PVGA 4BDBA 1IRKA 4D58A 5BUEA 3D83A 1OBDA 4DH8A 4FKIA 3PUPA 3PP1A 5E8SA 2R3NA 4TTHB 1WVWA 2P2HA 4RVKA 4D1ZA 2QOQA 2BHEA 3WIKA 4CT2A 5CANA 5H2UA 4JBOA 3ET7A 3D5XA 4KSQA 3F5PA 2OFUA 3PDTA 4M7IA 5HG5A 2JDTA 4S34A 3IGGA 2VTLA 4RZVA 4EH6A 4LRMA 1GOLA 5DEWA 4ERWA 3NUYA 3P79A 3A60A 4YJSA 5FP6A 3B2TA 3Q32A 3I7CA 1M52A 4O0UA 3GC8A 3U87A 4OTGA 2X8DA 3KXZA 3FMKA 2PVRA 5HX8A 4QMNA 2QHMA 5ANOA 4C57A 3E3PA 2VWWA 4YPDA 4QYHA 3V5PA 1SVGA 2CCHA 2PZYA 5AUZA 5AP1A 5HNBA 1B39A 2VZ6A 5KBRA 4GSBA 4JQEA 5J9YA 3PJ8A 2W0JA 4F0FA 2XNMA 4FICA 5CI7A 2A1AB 2F9GA 5BVWA 3QRKA 4EHEA 3CPCA 1Q8YA 3GXLA 3R1YA 3VWAA 1Y6BA 5FRIA 2HWOA 3M42A 2WMWA 1OI9A 4K11A 2B4SB 3ORMA 4FV4A 2YCRA 3ACKA 3B8RA 3V51A 5L2IA 5JT2A 3EZVA 4K8AA 2H9VA 3QD0A 3RCDA 1W84A 3BPRA 3ZXZA 3S4QA 3O23A 5M56A 1KE6A 3NX8A 4PPCA 4CFNA 3F7ZA 4AFEA 2WKMA 4F6WA 3AMAA 5EYCA 4XS2A 3P7BA 1MUOA 4BVUA 3FLZA 4RIWB 4DGGA 1XH8A 4RZWA 4EZ3A 4U9AA 4DT8A 3G5DA 4YNOA 1BI8A 4WA9A 3FY0A 3CIKA 3LFQA 5E8ZA 3QKKA 5HO6A 5L6WL 3I81A 3LCTA 4IE9A 3Q2MA 4ZJIA 4RFMA 3G51A 4ZMEA 3UOHA 3D14A 3LXLA 3RGFA 4ZTMA 2OK1A 3VC4A 3LMIA 1NA7A 3LCOA 1L3RE 5D7VA 2AC3A 4IAZA 2YDIA 2R4BA 1CKIA 1WBWA 2HW6A 4DBNA 2B9IA 4CKRA 3VBXA 1SNXA 4RX9A 3PPJA 2OXYA 3SRVB 3AT3A 3UVQA 3NSZA 3FUPA 3MPTA 3H4JA 3QGYA 2E9OA 1E9HA 3CTJA 4MQ1A 5DH3A 2JLDA 1OM1A 3RINA 1T46A 1XBAA 3OROA 2ZAZA 3R8ZA 4AOJA 5A4QA 2W06A 3HVCA 4D2WA 3TEIA 3L9NA 4UWYA 4QQTA 2O65A 4I22A 4QYYA 3G0EA 2W9FB 3COMA 2QKWB 2WTWA 3L9PA 3BEAA 3DOGA 4FKGA 4FTAA 4USFA 1OPKA 2Q0BA 3PXRA 3TKIA 4AN3A 5AV2A 4E1ZA 5FTOA 4MXOA 2P0CA 4RWLA 3KULA 4U44A 4J8NA 3ZS5A 5FWKK 2UZDA 4EHGA 1STCE 3KFAA 3C1XA 4C33A 1PXOA 5KNJA 2FB8A 3ACJA 3DXNA 3FAAA 4JDKA 2Z8CA 1XH7A 4P90A 3E7VA 3FMHA 5C27A 3PZEA 4CKIA 4Y8DA 2C4GA 4BWXA 4E7WA 3ZRMA 3IS5A 5EG3A 3F3TA 2G1TA 4KKHA 5E8UA 4YTCA 5FLFA 3R21A 4KA3A 1M14A 2V62A 3G9NA 2GS6A 5C01A 3QQGA 3QRIA 1H01A 2J9MA 1KE8A 3PJ2A 4ZTHA 3HRCA 3ZEWA 4U3YA 4KKEA 3AXWA 3CE3A 4S2ZA 3ORLA 2IZSA 2PU8A 1VEBA 3ANRA 4RLKA 3C4EA 1FVRA 4GJ3A 4L00A 1OL5A 2OXDA 2VX1A 4MXZA 2PK9A 2QVSE 3ALOA 3U54A 3QUEA 1ZARA 3QXPA 1Q99A 1LP4A 5DGZA 4EJNA 4DGNA 4UN0C 2XS0A 1AD5A 4FYNA 3F5GA 4FUYA 5D10A 3HX4A 3RALA 3TCPA 4HVDA 4XG9A 4C2WA 1O9UA 3PIZA 5EI8A 3ZDUA 1Z5MA 5CWZA 5GINE 2YABA 4HZSA 3JPVA 2XYNA 4J52A 3GB2A 4YHJA 4F1MA 3UTOA 1BL6A 5IA3A 3MDYA 3A7HA 4C61A 2ZB1A 3PIYA 5FDPA 5C26A 4DTKA 3A2CA 5AMNA 5BX0A 3TN8A 3VHEA 2ETMA 3GP0A 3MW1A 2O64A 4L68A 1GAGA 2XM9A 4FT0A 4DF3A 3FKLA 4M0YA 4XLIA 3RAKA 4C4GA 5L2WA 4E6DA 3MSSA 2ITXA 4ASDA 1WFCA 4YJVA 3ZTXA 5AX3A 3BE2A 4DG2E 3FMLA 4MNEB 2WIHA 2QO7A 4QP9A 3DQWA 5M07A 3W33A 3QQFA 1BMKA 3G90X 4Z9LA 4ANQA 2QODA 2QG5A 2VV9A 5HU9A 3DA6A 4L01A 5BVFA 3G6GA 1O6YA 2CJMA 4NCTA 4V05A 2CKEA 5AM7A 2KTYA 2VTRA 4PMPA 2P3GX 1WZYA 4OUCA 4U7ZA 5HNIX 1YW2A 2GTMA 3DKOA 3HP2A 3JR1A 4CLIA 3QQJA 4F65A 3JVSA 3ZONA 4FV5A 4RQKA 4EYMA 4GVJA 4XOZA 2J0JA 2XNPA 5DN3A 5E8TA 3UOLA 1ZOGA 2WMRA 5L2SA 1RW8A 1UU7A 4HVSA 1ZY4A 5IQHA 3PLAE 3VUGA 4E93A 5AP3A 2EXEA 4V0GA 3UQFA 3E8CA 3AQVA 4G6LA 3G6HA 5HD4A 1ATPE 1XKKA 3ETAA 3R73A 2Y6MA 4PX6A 5IDNA 2O8YA 4FZ7A 4D1SA 3SHEA 2VTQA 2YAKA 3GT8A 5AAGA 4FTCA 1KV1A 4BDAA 3EB0A 4IWOA 4WUNA 3U4WA 5CX9A 1BL7A 2CLQA 2XVDA 3F69A 4APPA 4L43A 3PSBA 4ZSLA 5IA5A 1OVEA 1P14A 4PUZA 4CMOA 4GKHA 5G6VA 4YZDA 1B38A 4IZAA 4KAOA 4EWQA 2ITOA 3IKAA 4NM7A 2J5EA 3DT1A 2WTIA 2OBJA 3AC5A 4WG3A 3ZUUA 4C4IA 4FTMA 2W1HA 4RLLA 1H1PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2JBP A;  1QMZ A;  2YEX A;  3NAY A;  2V0D A;  4RJ3 A;  5CY3 A;  5EYK A;  4DFB A;  1JKL A;  3DLS A;  3GGF A;  4WNO A;  3W0M A;  2GQG A;  2B9H A;  2JIU A;  1JOW B;  3H10 A;  3QUP A;  4FV8 A;  3VQU A;  1W2D A;  3UZP A;  4AXD A;  3D5V A;  2QCS A;  3KU2 A;  5TT7 A;  4AE6 A;  2QU6 A;  4FZ6 A;  1ZOH A;  3KK8 A;  2UZV A;  3NDM A;  4HGT A;  1LEW A;  5GHV A;  4B7T A;  4FSZ A;  3DXP A;  1XWS A;  1OKY A;  3KN5 A;  2EVA A;  3BE9 A;  3PY0 A;  1YHS A;  1H08 A;  4QO9 A;  3FI3 A;  3RPY A;  4NJ3 A;  1H00 A;  4W8D A;  1REJ A;  3NCZ A;  1Q8U A;  2E2B A;  3HUC A;  4RPV A;  4TN6 A;  5DNR A;  3O2M A;  2W5A A;  3SG8 A;  4QTD A;  2IZT A;  3COK A;  5CSX A;  2IZU A;  4J97 A;  3HYH A;  3ZFX A;  5EDR A;  4YJU A;  4HYS A;  1Y91 A;  4IW0 A;  5ANG A;  4BCN A;  3EKK A;  4EK6 A;  5HTC A;  4E26 A;  1OB3 A;  2I0V A;  3GU8 A;  3CLY A;  3OCS A;  3UYT A;  1E1V A;  2W1E A;  5HOR A;  3UMW A;  4BWK A;  2ONL C;  1UNL A;  4MAO A;  2PL0 A;  4UEU A;  2X0Q A;  1G5S A;  1URC A;  3ORZ A;  1FMK A;  4OR5 A;  4XJ0 A;  4EH5 A;  2JDV A;  3MBL A;  1PRY A;  4LUE A;  4PNK A;  4G6N A;  3C4C A;  4U97 A;  4X6R A;  2CGX A;  3KRW A;  4P7E A;  2Z7L A;  3UC4 A;  1FOT A;  3OCG A;  4Z3V A;  2C6L A;  4NST A;  3IOP A;  1JKS A;  4C34 A;  4NZW B;  3C5U A;  1H1R A;  4QYF A;  3UO4 A;  3HMN A;  5B2M A;  5CU2 A;  2RGP A;  3MTF A;  5JGB A;  3F61 A;  2JGZ A;  4BDG A;  3RK5 A;  5FTQ A;  3QQL A;  4FTL A;  4BYI A;  4G6O A;  4LOO A;  3ZLS A;  3UOK A;  2F4J A;  3TMO A;  2OH0 E;  5E8V A;  3G15 A;  3GOK A;  3DY7 A;  4LG4 A;  3WZE A;  1KE5 A;  3DFC B;  3EQR A;  3Q9W A;  2I6L A;  3ZC5 A;  4A9U A;  3WF9 A;  5M4U A;  4KUJ A;  4XUF A;  3OFM A;  2C1A A;  5M51 A;  1Q8Z A;  3HMI A;  3KCK A;  4E5B A;  4O0X A;  5J7B A;  3V8S A;  5DT3 A;  5E8Y A;  2VTN A;  4YC6 A;  3DK6 A;  4GH2 A;  3E64 A;  4QQC A;  4BCO A;  4C3R A;  2ZB0 A;  3OT8 A;  4TW9 A;  4YC3 A;  2VN9 A;  3R9D A;  3RPR A;  5J95 A;  4FUX A;  5C8M A;  4C0T A;  3UPZ A;  2C5N A;  1LR4 A;  1P4F A;  3KGA A;  3R8L A;  2PE0 A;  4NUS A;  3QQU A;  5EW9 A;  4DFU A;  4IC7 A;  4LGG A;  3PJ1 A;  4EHV A;  2C6K A;  4FA2 A;  2BDJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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