3U8WA

Crystal structure of p38a mitogen-activated protein kinase in complex with a triazolopyridazinone inhibitor
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of triazolopyridazinones as potent p38alpha inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 111
structure length 349
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3u8wA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3u8wA01
1H0WA 5J9YA 1VYZA 5KMIA 2GHGA 3UQGA 3DV3A 1WVXA 2X4FA 4MD9E 5K3YA 4LV8A 3VHKA 5E1SA 3RCJA 2E9NA 4A4XA 4C3PA 4DGLC 2HW7A 4QMOA 4RVTA 2UZEA 2XK4A 1I44A 4I20A 3QX2A 4IX3A 4IXPA 3GU8A 4RGJA 2QLUA 4FSQA 3D7TB 4FICA 3KY2A 2GNJA 2IWIA 3P86A 2YABA 2JLDA 3W32A 3N4TA 3BGQA 3IO7A 4EOJA 1JWHA 5EM7A 4YO4A 3MY0A 4I24A 2EUFB 5AUZA 5KZIA 4WSYA 2ZV2A 3NAXA 4H36A 4DHFA 2HZNA 3PVUA 2Y7JA 3PYYA 4BBEA 4QO9A 4M66A 2B4SB 1O9UA 3LLTA 1ZARA 4CMTA 5EI6A 5IG1A 4BZNA 3V51A 3EIDA 4KS8A 3DBFA 3OOMA 4NCTC 2Q83A 4F7JA 4FUXA 4NW5A 3DK7A 4RFMA 4FTMA 3ORPA 3ZHPC 2W1HA 2A0CX 4RQVA 5AA9A 1BYGA 3I7BA 2OICA 2XBJA 5HORA 5HTIA 3OOGA 1QPCA 2PZPA 5HE3A 3TJDA 4FGBA 4GJ3A 2O63A 4F9CA 3ZLWA 4ASXA 4RJ5A 2PVMA 5C03A 2OWBA 1PYXA 4F0GA 5M08A 4YC6A 1NVRA 3PVGA 2FB8A 4CNHA 3BQCA 3JUHA 3SC1A 4ERWA 4F7SA 2ITXA 2EVAA 4ALUA 3PDTA 3BIZA 3MV5A 1OL7A 4RWLA 1G8AA 1RJBA 2WNTA 4W4YA 2QCSA 3JVSA 4P90A 1KUTA 3LIJA 4IAAA 4D0XA 2CHLA 2YERA 4K9YA 1Q24A 1REJA 3QUEA 3RHXA 3POZA 3TNHA 3V5LA 4J95A 3JVRA 3EQCA 5ETFA 3S95A 3ZO3A 2GFSA 3HEGA 3OD6X 4OT6A 2BZHB 3ITZA 2FYSA 4HCTA 3V5JA 4BWPA 4EK6A 3RWQA 3E87A 3IGGA 5C1QB 2ZYBA 3BV2A 4FSZA 3T8OA 3LFEA 4O6EA 3D94A 2VAGA 4I3ZA 4WG5A 3F82A 3P4KA 5FP5A 5CAOA 3SA0A 4CG9A 2JFMA 3GU4A 2CNUA 3G0FA 4W9XA 3VAPA 2UZVA 4WNPA 3V04A 3DAJA 4O0VA 2W1GA 4NJ3A 5H3QA 4QYGA 2IN6A 1OGUA 3TV4A 4BDGA 2R0IA 4Q5EA 5AV3A 2OU7A 4HVHA 5CNOA 3UOLA 4BDIA 1V0BA 4L45A 3F7WA 5LVOA 4RA5A 4TYHA 4KNBA 1PXOA 3KEXA 2HENA 4BCQA 2G15A 2E9VA 3BLHA 2BVAA 3D4QA 3DBQA 4FV7A 5M55A 4ANLA 5HLPA 3UIMA 3EYGA 4ENYA 4BI1A 3NW6A 5CAUA 2GFCA 2XRWA 3UIXA 2QO7A 1YQJA 3BCEA 4JLCA 2V5QA 4CXAA 4RG0A 5HI2A 3RI1A 3RK9A 4GV1A 2BHEA 3M11A 3TKHA 4A9UA 5KX8A 3HP5A 3G9NA 2RG5A 4RZVA 3TN8A 4BR3A 5GZ8A 4K2RA 2XRUA 1M7NA 2JBOA 3RINA 3VBVA 2W5AA 2W9FB 3VJOA 4TY1A 3OFMA 4FA2A 4L52A 4QQTA 5HCXA 2J5FA 4BDAA 3QTUA 3QZFA 4MF1A 1Q8TA 4U40A 3AC8A 3HMPA 4C36A 4PY1A 3R7VA 3OWPA 2QOCA 4AN2A 3F2AA 3CEKA 4CCUA 3E7OA 1WBNA 4EQMA 5A4CA 3Q60A 4ERKA 2NO3A 5ANOA 4I1ZA 1H4LA 3ZZEA 4O0TA 4OR5A 4D9TA 1VZOA 5IUGA 3IDCA 4CCBA 4X6RA 1TKIA 4E1ZA 4AE6A 3DK6A 4FTJA 2C6IA 4MBLA 3H10A 4ZTQA 4FEWA 4QYEA 4JRNA 3NCZA 5J7BA 2ZB0A 1PXPA 3KRWA 5J87A 2IZUA 2WMTA 2YZAA 5J8IA 3UQFA 4HNIA 5AR4A 2OSCA 3GVUA 4QT1A 4H05A 1QCFA 2HZ0A 4RIOA 4AZFA 5AA8A 4HCUA 3TTJA 4UXLA 1DS5A 2W5BA 2YIRA 3MTLA 4V04A 3UO6A 2NNWB 2XIZA 4RC3A 5GNKA 1MQBA 5BVEA 3FI3A 4MYGA 3IW5A 4Y46A 3BYSA 4DGOA 4AT5A 3PJ3A 4UY9A 5AJQA 4GU9A 2ZM3A 1GZ8A 4JDJA 3OXIA 4FODA 3TDWA 4IVBA 1Q3WA 2YHVA 2VO3A 4JT3A 3ZCLA 5JQ5A 3CQWA 4LQMA 4H58A 3VULA 5DH3A 3W33A 4CSVA 3V8WA 1MUOA 4FK6A 4UYAA 1JKSA 2BZKB 4CFWA 2WQEA 3W55A 3BU6A 3R9RA 1BKXA 3VUTA 4CVAA 1GNGA 1ZZLA 3UYSA 4BDDA 3DNEA 3QQFA 3FL5A 3MVLA 4FTQA 4PF4A 3ZO4A 2DQ7X 4D2RA 1GZKA 2XBAA 5HX8A 4AP7A 2PUIA 3VUHA 2EB2A 5FM2A 3C7QA 2XYNA 4H1MA 3VO3A 3FC2A 3SOCA 3WZKA 5C01A 3SXRA 1UU3A 3DY7A 1O6KA 5FDPA 3GI3A 4IJPA 4WBOA 2VTQA 2XUUA 3LJ1A 3I60A 3OT3A 2ZOQA 4YHJA 4YJVA 3F66A 3KGAA 5H9BA 3O50A 3MH0A 5CNNA 5JFWA 4IWOA 5HU3A 2OK1A 3E3PA 3PTGA 3VW8A 2W17A 4ZSLA 2HZIA 4YU2A 1IR3A 2YCRA 4JAIA 4TYJA 4U41A 5DT3A 1BI7A 4WNMA 3T3UA 2WQBA 4IW0A 3OWLA 5ETAA 3A62A 5KKRB 4JDIA 3VRZA 4BGGA 2QQ7A 2W99B 5CAVA 3R9NA 1YXVA 3R8MA 5K4JA 2A27A 4ZAUA 2R0UA 3QKMA 2BR1A 3BBWA 2JAVA 4AGWA 1WMKA 2R3RA 4L01A 4KS7A 4QNYA 3LMGA 4BTMA 4I6HA 3U4WA 2BILB 3LQ5A 2FSTX 3QZIA 2PPQA 1A06A 4IAIA 2QG7A 5DR2A 2XJ0A 5CENA 4DEIA 3DKOA 3DA6A 5TR6A 2G2HA 4FZAB 1JKTA 1CKJA 5CVGA 3VVHA 4AZVA 4QP3A 3SW4A 4CZUA 4O7ZA 3A7GA 5HIBA 4XG8A 4TW9A 4CGAA 1LR4A 4YJTA 1H1RA 2QOKA 2I6LA 4FEVA 4QTAA 5TO8A 2GS6A 1O6YA 4FK3A 4ZTRA 3QQUA 2XNBA 2HWOA 3Q5ZA 4RWJA 1DI9A 2J0JA 2VWUA 3QQLA 4NUSA 2VX3A 3SOAA 3TZ7A 4FE2A 3MH3A 1RDQE 3TXOA 3CD8A 5EM5A 3LVPA 2P55A 4OW8A 4P5QA 5CSWA 5L8JA 3RAHA 3THBA 2J0LA 4U5JA 3B2TA 3HMMA 3PLSA 5EFQA 2QOLA 2PYWA 4GFGA 5ACKA 4EK8A 2X8IA 2XA4A 3FMEA 4GFOA 5M4CA 4F7NA 2YIYA 2PZ5A 2R3NA 3HYHA 2PVRA 2J7TA 2VN9A 1YHVA 4G2FA 4CFUA 4ZEGA 4FIJA 3M42A 4BHNA 3L8SA 5C9CA 3ZLYA 4APPA 3NUUA 4KA3A 3TI1A 5AP2A 2YFXA 3NUYA 4DFZE 1H00A 2QOQA 2OZAA 3MGYA 5E8SA 3PA3A 5EW3A 5H8BA 3PJ1A 3QGYA 3G9LX 1Q8UA 4QTDA 3KQ7A 4O0WA 5FQDC 3TJCA 5JZJA 3TWJA 3NDMA 2QU6A 2XKEA 4KIKA 5KZ0A 3EWHA 2W9ZB 2YJRA 3S1HA 1XR1A 3FLQA 5ANEA 3FXXA 3LFFA 2PL0A 4O0XA 5LWNA 2LAVA 2UZTA 3CTQA 4JBOA 5JFXA 5HO8A 2BZJA 3FZTA 3HUCA 3UGCA 4O38A 4CRLA 1IAHA 2PZIA 4YP8A 4ZJJA 3F5XA 2RSVA 5EDRA 4DFXE 4S34A 1JPAA 3ET7A 3U87A 1YOJA 4BYIA 2EXEA 2P0CA 3D5VA 3F6XA 3PG1A 4QMLA 1YDSE 2SRCA 2R2PA 4FKRA 4HGLA 3SXFA 2PE1A 3ORNA 4ZJVA 1J1BA 1H1WA 3AGMA 5L2QA 4AS0A 1OECA 4P4CA 1I09A 2X7GA 2YM8A 2Y9QA 3DJ6A 3QAME 3VF9A 4M69A 2CCIA 4TTHB 1WBOA 2YLFA 5C8NA 3QL8A 4CV8A 4O1OA 4WUAA 5HD7A 4OAVB 3NUAA 4EK5A 3ID6C 2KULA 3CR0A 1OL2A 5K5NA 3PXKA 2W5HA 3R7IA 5H8GA 3LCKA 5IA2A 4TL0A 3D5XA 1PXLA 3FXWA 4F6UA 5HBJA 4UMUA 4GYGA 5L2IA 4PDYA 1Y6AA 3F7ZA 4G3FA 3SV0A 2JDTA 2OH4A 3V6SA 3E7VA 4AG8A 3QTRA 4QMUA 2E9OA 4M8TA 3AD5A 4KKHA 4QMQA 1PMVA 2ZV9A 2QODA 3LW0A 4UWCA 3FHRA 2XYUA 5AEPA 2XEZA 5KHXA 2XIKA 3FLNC 1FGKA 2X9FA 2WAJA 4DN5A 3QYWA 3DB8A 3K54A 1GZNA 5F1ZA 1MRUA 3MB7A 3ODZX 3QKKA 5EK7A 1BX6A 3RALA 4E6DA 2CKOA 4O83A 4YURA 4JNWA 5BPYA 1FMOE 3EFKA 3EN7A 3FWQA 3PUPA 3QRTA 4GG7A 3EQFA 2FA2A 4N70A 4MAOA 4FV3A 2OJGA 3R73A 2PVFA 4FKGA 3BX5A 2XM9A 3QWKA 4X7QA 4O21A 3H9RA 4L8MA 3UZRA 2XNOA 3RPOA 3PXQA 4FV6A 2XKDA 4KSPA 5M4FA 3IQ7A 4IB1A 3ZBFA 2FH9A 3QWJA 5EH0A 2YM5A 1ZY5A 4NM5A 1T46A 4LI5A 5E8YA 1YI4A 4RC2A 2B1PA 4QP9A 5ETCA 4EOMA 4AZWA 2VGPA 1NVQA 3PWDA 3FC1X 4FNXA 3R63A 4IZ7A 2ITWA 3NUSA 2R3QA 4HVSA 3DAEA 3ZSGA 4HGEA 4ACGA 2EWAA 2WHBA 4CFXA 4RJ8A 3P7AA 4EZ7A 4C4FA 5DR9A 5EM6A 1OUYA 2J50A 3IW7A 4B8MA 3P7BA 4OBQA 3TV6A 1ZXEA 4BGHA 4F9WA 5HOAA 3BYVA 3NX8A 4RX8A 1ATPE 2J0KA 4FR4A 4IM0A 4PL4A 3Q9ZA 1STCE 4U97A 1BLXA 2Z2WA 2W4OA 3W2RA 5IQEA 4A9TA 4LM5A 2VNWA 4LOQA 3V01A 4X2FA 4QTCA 3HLLA 3MIYA 5DBXA 4K18A 3WF5A 5AAEA 3BWFA 1UNGA 3FPMA 4E8AA 2HY0A 5EW8A 4OLIA 3L9MA 3P7CA 1WCCA 4FTRA 3BBTB 4AN3A 4AZTA 4DBXA 2OJFE 4ANNA 4P2KA 4JBQA 3WF6A 4GS6A 1UWJA 3VNTA 2W96B 4X3FB 4KRCA 5GJGA 3ZC6A 4AXAA 4LL0A 2WPAA 4MF0A 3ROYA 4BTFA 3QHWA 4J7BA 4QTBA 5IQHA 1AD5A 1XH7A 3NNXA 4PQNA 3PVWA 4WA9A 3UTOA 4G6NA 4FEUA 3FE3A 4FIGA 1VJYA 2OZAB 5AR5A 3LAUA 4C57A 1PXJA 4AAAA 5EQPA 5IQGA 4AZSA 4IC8A 2B9FA 4FSMA 4KIKB 4F99A 2RIOA 3NYVA 4CYJA 3UO5A 5GINE 3VJNA 3AOXA 4RLKA 4IX4A 1A48A 4J97A 3L1SA 4G5JA 3NVMB 5A4LA 3QQKA 3MS9A 5AP6A 4EJNA 4EHVA 3AD6A 3I81A 2ZDUA 3EKNA 1REKA 3AC5A 3GQLA 3O8UA 4QMMA 3R71A 4O22A 4QP4A 3GT8A 3GFEA 4JRVA 5GZ9A 1P14A 3PJ8A 4EONA 1U5QA 4CZTA 5EG3A 3P08A 3E63A 4OTPA 1SVGA 3GEQA 4IVAA 2C5VA 3BYOA 4FV8A 4APCA 2CN8A 3U6JA 5EDPA 4UBAA 4EK4A 5BVFA 4PRJA 5LMBA 3CLYA 3SDJA 4MKCA 1XWSA 1ZMVA 3GB2A 1DI8A 2Y4IB 4WG4A 4XRJA 5IQDA 4AX8A 2J51A 2XIRA 3D7TA 4DFNA 3ALNA 3F3VA 3BI6A 4IQ6A 3QU0A 3POOA 3F3ZA 4M3QA 4FZ7A 4ITIA 3UODA 4NM0A 2UZWE 1T45A 3NNUA 3HECA 3PSBA 3VRYA 3LM5A 4AUAA 3LMHA 1E1XA 4LL5A 3M1SA 5EOLA 3FY2A 5T68A 3OROA 4GUBA 3GP0A 2VV9A 4QMVA 3ZONA 4D2TA 4RX7A 4BDEA 2JDVA 1YWVA 5M44A 2CMWA 3DT1A 5EHLA 5AR7A 3TUDA 4L3JA 5LQFA 1U59A 4NK9A 4DEHA 2GNFA 2V7AA 3HRCA 4LYNA 3V5QA 1MQ4A 2PE2A 3V8SA 3R1YA 2CGUA 2WKMA 1B39A 4MD8E 3F3WA 4U9AA 5ANGA 4XRLA 3SW7A 5G6VA 1LPUA 2IJMA 4LGGA 2GU8A 3DJ5A 2CKQA 1QPJA 1M14A 2OG8A 4UXQA 4AFJA 2P33A 4BIEA 1GOLA 3BEAA 2OGVA 4K1BA 5FDXA 4ZTSA 5HBHA 3R7EA 1Q4LA 4WIHA 4FKVA 4A4LA 4XJ0A 5CU4A 2FSOX 4WKQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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