3U9NA

X-ray crystal structure of compound 1 bound to human chk1 kinase domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
265
structure length
257
Chain Sequence
EDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of a Novel Series of CHK1 Kinase Inhibitors with Distinctive Hinge Binding Mode
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 79
structure length 257
sequence length 265
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3u9nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3u9nA01
4WO5A 5C4KA 2XF0A 3QLFA 5BYLA 2O64A 3VS2A 4CFUA 2BZKB 4R3PA 4RIXA 3QRUA 2QOHA 3EN6A 5BVNA 3EZVA 4RVLA 4K9YA 1ZY5A 4JT3A 4BDCA 4EHVA 4FSRA 4AT5A 3IQ7A 2BHHA 2EU9A 3DKCA 4R1YA 2BRHA 3N4VA 2C1AA 3LQ5A 4F7JA 1PXNA 1REJA 2BIYA 2GMXA 3ORNA 3QA0A 4XH6A 3UMWA 4CGAA 2OXYA 3PXFA 2P55A 5IA2A 2JAMA 1G5SA 1A48A 4L9IA 4BGQA 5DIAA 3VJNA 4MBJA 3S4QA 1ZAOA 2ETMA 3WI6A 4NWMA 3OXTA 4TT7A 2PZPA 4FUYA 2OXXA 3UP2A 4ANQA 2C6OA 3OUKA 4QNAA 3MPTA 1KWPA 1J3HA 5AR8A 4EZ5A 4GL9A 5ITAA 4O96A 3NNVA 5BVFA 4IX5A 5HU3A 3GB2A 2QO9A 3U87A 4FIFA 2XNMA 2PPQA 1UU7A 4I22A 5M44A 3V04A 5CSHA 4AE9A 5CEPA 2O65A 3MH1A 2WMWA 3QRJA 3TNWA 3ZH8A 3ZO4A 2QKWB 1WVXA 5TO8A 3TKHA 3OUNB 3UE4A 4FG8A 2H9VA 4C59A 4XRJA 4F70A 2IZTA 2VX0A 1ZXEA 2Y6OA 4GUBA 4R5SA 5EW3A 4ZTLA 3V5LA 4ZS0A 2OU7A 2ZV8A 4KS7A 2ONLA 3BELA 3LAUA 4TYHB 4ZZMA 4LOPA 2E9OA 2HY81 4I21A 4WD5A 3O23A 4X2JA 5F9EA 4B9DA 4YTCA 4ASZA 5AWMA 2X8DA 2JIUA 4L01A 5HE2A 2HOGA 3UC3A 4P5QA 4K0YA 4D0XA 4Q9ZA 2VWYA 3MFUA 5G1XA 4O84A 2OJJA 4ENYA 1SYKA 5FQDC 4QRCA 2WFYA 3F3ZA 3KVWA 2PL0A 2W1GA 3C5IA 2CLQA 5DLSA 5FXSA 4Y95A 4CLJA 3MYGA 2WU6A 5CSXA 4TXCA 5GZ9A 4HVIA 4HCTA 4PPCA 4AN2A 3FJQE 4FIGA 3DT1A 3TDVA 1GIJA 4XX9A 5DWRA 3ZCLA 3VAPA 2ZM1A 4WUNA 4AX8A 5AUYA 2BKKA 2AC5A 3VBWA 3Q4TA 5AAGA 5EQYA 4FTNA 4X3JA 4F6SA 5FUTA 3ULIA 4FUXA 3QQHA 4O7ZA 1FQ1B 5ICPA 3LLTA 3JR1A 4DH5A 3FL5A 4W4YA 1KSWA 4A9YA 5HZNA 1K2PA 2QURA 3KRRA 5HESA 3ZSIA 4AGDA 3LCSA 2Y6MA 3UNKA 2R3RA 3E92A 4ACMA 5IG1A 4QP9A 4EL9A 2C47A 4EQCA 3ORXA 4QP6A 2VO0A 3O7LD 3C13A 1OL5A 3BHTA 4MXYA 1SNXA 3NNUA 4I4FA 3WZJA 5FEEA 4F9YA 3GC0A 5HIEA 4F0GA 4ITHA 5IMEA 3QCQA 2XS0A 4USFA 2P2IA 3ROCA 2EB2A 3NUNA 3FMJA 3PY1A 3R1NA 5DNRA 1GZ8A 2ZDTA 1J7UA 5AUVA 4XG3A 1BL7A 4MCVA 2IJMA 3CY3A 4KIQA 3QGWA 3VUMA 2OIQA 3HDMA 4XBRA 4GG5A 1GAGA 4U80A 4O2PA 4W8DA 3B8QA 4F7LA 3DCVA 3A99A 5J95A 3NYNA 5A3XA 1OL7A 4BCGA 1G8SA 1GIIA 4F9AA 4L46A 5LOHA 1AGWA 2ITPA 2VAGA 2A0CX 2G2IA 3O8TA 3GCSA 4DG2E 1H1RA 4MWHA 2XBJA 2PE2A 2V0DA 3CP9A 3TJCA 4XEYA 3FC2A 4RLKA 1MRVA 4N6ZA 5EKOA 3R1SA 5H3QA 3ZLXA 4J95A 2Z7QA 3Q6UA 3CC6A 4FNXA 3FLZA 1OPKA 4KBAA 4CNHA 4FKLA 4YHTA 2JBPA 3OXIA 4NH1A 5KMLA 3OW4A 2I1MA 3ZONA 3O50A 3RJCA 4N4SA 1GZOA 4B4LA 3PJ1A 1IA9A 4PP7A 2CKPA 4QT1A 4GFOA 4PX6A 3W18A 2W9FB 1SZMA 3G9NA 4FKOA 4FF8A 4UYNA 5E8UA 2R3IA 2UW9A 3CKWA 3O51A 3QHWA 3UZRA 1RE8A 4APPA 4EONA 3KXHA 4O0VA 3SLSA 2RFSA 1JVPP 2WMAA 3OVVA 2BAQA 4E6QA 4TYHA 2NPQA 2VX3A 2OIBA 4ZSGA 3W2SA 2XP2A 4H3BA 4CG8A 5C4LA 2VNYA 5KMOA 1H25A 3FXXA 4MTAA 3FMNA 4BF2A 2J6MA 4FTOA 4DFXE 5J5SA 1ZZLA 2IVUA 1OKZA 1ZLTA 3KF7A 5HTIA 4M15A 4FVPA 3TM0A 4ANMA 4E1ZA 1UU9A 2Q83A 1FVRA 1T46A 4UWYA 3EQIA 4TRLA 3QD4A 4OTQA 3FYKX 3QTQA 4QMZA 5HBHA 5J87A 4OTGA 5CYIA 1V0PA 5JFVA 2R3JA 1MRYA 2BRNA 3RAKA 2FUMA 5HIBA 5CENA 1Q97A 1WZYA 4MNEB 5D1JA 1IR3A 2X9FA 4O7WA 3LCKA 4AW2A 2PSQA 4TL0A 5IISA 4W8EA 3ENMA 2PUIA 3MY1A 3WF7A 3BWFA 4D1XA 2UVYA 3BZ3A 4FMQA 4QMUA 5EDQA 3FLQA 4ID7A 3JY9A 3F6XA 5AUUA 2VTQA 3EMGA 3QWJA 2OBJA 4UZHA 4YTHA 5BVKA 2GQSA 3OZ6A 4JAIA 1TQMA 3F2NA 4JIKA 2YISA 3PRFA 4QTDA 4BCNA 4E5WA 5DBXA 5KMIA 5IH5A 3GBZA 3KA0A 1NA7A 3I60A 3ZM4A 3VO3A 2Y4IB 5I9ZA 2OXDA 4K18A 2UVXA 4FV0A 4QYEA 3N4UA 4EEVA 4QMLA 4F7SA 5D10A 3A4OX 4GT4A 4OAVB 5EFQA 5EI6A 4GYIA 5AR2A 5FXQA 5EI8A 4UX9A 3R63A 4KBCA 1PXOA 3OCSA 4YMJA 2YJRA 4W4XA 3NVMB 2XJ2A 1PMVA 3TG1A 2C6MA 4FTKA 4RA4A 4UALA 4D0WA 4FTTA 3DZQA 5AP4A 3D83A 5A46A 4PMSA 3QX2A 4FL1A 2BZJA 2V5QA 1B38A 4IJ9A 4J52A 4L3LA 3FI4A 3RI1A 3MH0A 2R3QA 4R3RA 4H36A 3DBDA 4I0RA 3G6GA 2GFCA 4L00A 4RG0A 4TWCA 3QQGA 4WG4A 5EW8A 2CNQA 4G1WA 4ZJJA 5CI6A 3C4CA 5CZHA 1KE7A 1WBWA 3QRKA 4FV6A 4KAOA 4MAOA 3EIDA 4NZWB 2ZAZA 5HVYA 4E6AA 4I24A 3E8EA 4X2NA 4BI0A 3HMPA 2C6IA 4BDDA 2W5BA 3Q4ZA 1H0WA 5I9YA 3U6IA 2XNPA 1OL2A 3PLAE 5LVOA 2XIRA 3AC4A 4C3RA 4FKQA 5AIRA 2PMNX 5CTPA 5L4QA 3PXYA 5IUIA 4DGNA 2GS7A 4DEAA 3TUCA 4FKIA 3IGOA 4BFMA 5BVDA 5A4CA 1YVJA 4LQMA 1H24A 1NVQA 2CSNA 2R4BA 2VWVA 2EXCX 3G6HA 3KEXA 4JQ7A 5HOAA 4CEGA 1STCE 4MD8E 1F3MC 3CGFA 4IX6A 2ZMDA 4J53A 4L44A 4LGGA 4RVMA 3BGZA 2C6LA 1H28A 3GP0A 1TQIA 4K1BA 3FKLA 4IFGA 4R78A 3W2OA 3F5UA 5AP6A 4DA5A 3C9WA 5J1VA 3NIEA 3ORTA 3FZSA 3FLNC 4PNKA 2H34A 3SG8A 1SVGA 1XBAA 3FZRA 4MQ1A 2BROA 3A8WA 3P78A 4WA9A 2KULA 4F9WA 1Q8YA 4FTUA 3QUPA 1OKWA 5DMZA 5BVWA 2W99B 4FZ6A 5IQBA 3VUKA 2VTIA 4U81A 5CEOA 2ITXA 3DJ6A 4JLCA 4DFBA 5AV4A 2VTAA 3KRXA 4BRXA 3V3VA 3HA8A 5HEZA 3QQUA 5AUZA 4FNWA 4C4JA 1DS5A 1VYZA 4H1MA 4PL5A 3SXFA 3WYYA 4BN1A 3R1YA 4MXCA 2GS2A 3ZUTA 4AACA 3VUDA 4CTBA 4UMRA 5BQ0A 2QODA 4FKPA 2VZ6A 4IJPA 4U45A 4AUAA 3HUCA 4RC2A 2EXEA 1MRUA 1OB3A 2PTKA 2ZJWA 3PA3A 4NW6A 4FICA 4MQ2A 4RMZA 5HCYA 1LUFA 4B0GA 2XH5A 5JQ8A 2DUVA 3EFKA 4XNEA 1J1BA 5I4NA 3FQHA 3DNEA 4UY9A 3P9JA 4BDBA 5T6KA 2YM8A 2HCKA 3C5UA 2Y8OA 3F7WA 2WTCA 2BTSA 4IH8A 2B7AA 4LOQA 4D1SA 5BUIA 4DT9A 1G3NA 2XNBA 3FUPA 1WBNA 3FI8A 4FSUA 4OTHA 4RJ3A 1J7LA 3D14A 3PVUA 5AV2A 1PXMA 3FKNA 3FZPA 3NDMA 4BCFA 3RK5A 1MP8A 3C51A 4HYIA 1ZYJA 4DEBA 2CLXA 3C0HA 4IC7A 4M67A 4JG8A 4AA4A 3PJ8A 1YI4A 2YLFA 1XJDA 4YC8A 2ZB1A 4EK3A 3GT8A 4PTEA 5BVOA 2ERZE 1YI6A 4OT5A 3A7GA 4L45A 5FBOA 4NL0A 2PMOX 1H4LA 4IAYA 3CD8A 2WTDA 4EOJA 3AC5A 5JQ5A 3NX8A 3A2CA 5J7HA 4HYUA 1Q5KA 2WTIA 4HNFA 2CJMA 2PWLA 2QI8A 2IO6A 2VNWA 4C3FA 1J91A 1OUKA 2BRMA 5CNOA 3FZTA 4BCKA 1ATPE 3M1SA 1K9AA 2QOOA 2B9IA 2UZNA 3EFWA 5AIKA 3BYUA 4UZDA 3ODZX 2JDSA 3AD5A 3SW7A 5LJJA 4ASEA 4F99A 3TZ8A 3QTSA 2HZ4A 2VX1A 3LFQA 3F3UA 3UDBA 5JKGA 4FTAA 4JI9A 4AOJA 4DAWA 4JXFA 2UW4A 3TV6A 4BCQA 3R9NA 2B1PA 4C38A 3D7TB 1ZMWA 3KF4A 3D5WA 3PPZA 4ZOGA 4F9CA 4G3FA 5EYCA 4EK4A 3GEQA 1XQZA 3KK9A 2ZM4A 4O38A 4FSMA 2GCDA 2C5VA 3H0YA 2XIYA 4KKHA 4Y46A 3ZHPC 4UN0C 3VHEA 4F4PA 3U6HA 2Y4PA 4J96A 1Q24A 4JRNA 4D55A 3HV5A 4IWDA 4D5KA 2W7XA 1QPEA 4U43A 5HD7A 4LRKA 4XRLA 4RC3A 3WZEA 4QD6A 1ZRZA 2W5AA 4RQKA 4XHKB 4G2FA 3GOPA 1A06A 2UZUE 2X9EA 3IOPA 4Y85A 3R8VA 4U97A 3IDCA 3HAVA 4NW5A 2G2FA 2QCSA 3JVRA 4U41A 2YWVA 2OGVA 4CXAA 2R3FA 4E93A 4CLIA 3I7BA 5IA1A 5IA4A 3DOGA 5D41A 3AOXA 4IAZA 4FEVA 5D12A 1M2RA 3LPBA 3I4BA 5DRDA 3R00A 4ANLA 4QP8A 4JR7A 3UBDA 4C2WA 4KRCA 3HAMA 4YHJA 4LL0A 2KTYA 3IGGA 4YLJA 4X2GA 3MY0A 5I5ZA 2ACXA 4S33A 4NM5A 1R78A 4HZRA 2XK8A 4FT3A 1JSUA 3COHA 4N70A 2XK9A 3S00A 1YHWA 3GFEA 4J97A 2X4ZA 3JXWA 4XV9A 2HWPA 3CGOA 4XMOA 3IW7A 4MVFA 2GNJA 4U44A 4YPDA 3VUTA 3RM7A 3MVLA 2QU5A 4EOSA 4IZYA 4BWPA 1ZYLA 4BTFA 5L8LA 2YDJA 3C1XA 4G3CA 2AUHA 3LMHA 1BKXA 4EZ3A 3SRVA 2HZNA 1FINA 4QYYA 3V5WA 2VWBA 5M4UA 3KRLA 2XRUA 3OT8A 4IDTA 3OWJA 4FGRA 2VU3A 4S31A 5JRQA 2PVKA 4AZFA 4JDKA 4X7QA 4DTBA 4X2FA 4IMYA 3DK7A 4IAAA 4YZ9A 5AEPA 3IOKA 1ERKA 3DXNA 3OOGA 3I6WA 2OH4A 3KCKA 4CYIA 4DEIA 2Z7RA 4YLLA 5EOLA 2WELA 2XA4A 4KRDA 3MS9A 4PTGA 3MVHA 4WBOA 3S2PA 4Q5HA 5CU6A 3FHIA 1XBCA 5M53A 4C4EA 3QD0A 5A4LA 1WAKA 2OK1A 5GIOE 3AC2A 3T9IA 4OR5A 3POZA 3WYXA 4Q9SA 4X6QC 3ZMMA 2VGOA 4FVRA 3BHYA 4EK6A 3EQRA 4WKQA 3UIUA 3ZXTA 2WZJA 5DR6A 3D4QA 3SV0A 3MVJA 4EJ7A 3OWKA 2OLCA 5GINE 2V55A 3ZRLA 4G6NA 3TNPC 2FB8A 3M2WA 3ZO2A 5FM3A 3SAYA 3ZFMA 2BAKA 1WBTA 2XK3A 3D7TA 3FAAA 5M56A 1FOTA 3SC1A 3NWWA 4PL4A 1PJKA 3BBWA 5HGIA 4JG6A 3V5PA 5DA3A 5KNJA 1XHAA 2X2KA 5KZIA 2W06A 5JZJA 2BDJA 4DEEA 1NT2A 3DB8A 5CS6A 1URCA 3A61A 2NRUA 3WE8A 3OCBA 5LVLA 1CKIA 3VN9A 4DEDA 2UZOA 2BFXA 2IVSA 3L8VA 3RTPA 3QX4A 3PIXA 1J1CA 3MH3A 1V0OA 3VVHA 4E8AA 3JUHA 3EWHA 3H4JA 4J99A 4EOQA 2OJGA 4YJPA 4C4FA 4R1VA 1P5EA 2BTRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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