3UBDA

Structure of n-terminal domain of rsk2 kinase in complex with flavonoid glycoside sl0101
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
Knots found
sequence length
298
structure length
287
Chain Sequence
EIAITHHVKEGHEKADPSQFELLKVLGQGSFGKVFLVKKISGSDARQLYAMKVLKKATLKVRDRVDILVEVNHPFIVKLHYAFQTEGKLYLILDFLRGGDLFTRLSKEVMFTEEDVKFYLAELALALDHLHSLGIIYRDLKPENILLDEEGHIKLTDFGLSKEKKAYSFCGTVEYMAPEVVNRRGHTQSADWWSFGVLMFEMLTGTLPFQGKDRKETMTMILKAKLGMPQFLSPEAQSLLRMLFKRNPANRLGAGPDGVEEIKRHSFFSTIDWNKLYRREIHPPFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Ribosomal protein S6 kinase alpha-3
publication title Insights into the Inhibition of the p90 Ribosomal S6 Kinase (RSK) by the Flavonol Glycoside SL0101 from the 1.5 A Crystal Structure of the N-Terminal Domain of RSK2 with Bound Inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 87
structure length 287
sequence length 298
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ubdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ubdA01
5AUXA 4JQ7A 4EK4A 3CE3A 4F7NA 3SV0A 4XP0A 1Q8YA 2YM7A 4FTOA 3F3WA 5EYDA 4C35A 5CAOA 3E93A 5KBRA 2R3HA 2WZJA 4ORKA 3DB6A 3OWKA 3F82A 1W98A 3HV4A 3PXRA 3EZVA 3GC9A 5KMLA 3MPMA 4U3ZA 4M68A 4NIFB 4FE2A 3NR9A 4G3GA 1OL6A 1V0PA 1RE8A 4J1RA 3OWLA 3A7IA 4YZMA 5AR2A 4S33A 3QYWA 5BNJA 2UVYA 4OT6A 3ATSA 3QTIA 4NYEA 5KZ0A 4U80A 4FKJA 5CEIA 2VTQA 3CKWA 1IR3A 2E9PA 4AUAA 3G9LX 3ZSIA 3ETAA 4I20A 5DT4A 5K0KA 3W16A 4GW8A 3COKA 3BYOA 5ACKA 5C1QB 4EOKA 1OL1A 3HZTA 1WVYA 1O6YA 3MWUA 4ARKA 3QQUA 2OXDA 1J1CA 3D83A 4YSMA 4G31A 4FOCA 2JIUA 3RK5A 2IPXA 3FAAA 4IWPA 5AEPA 1XH9A 3Q32A 1Y57A 2X4FA 3GOKA 2C3JA 5IQGA 5JRSA 1Q8UA 3FSKA 4IAZA 4C3PA 3OT8A 1NA7A 4L6QA 4RWKA 2ITQA 3CTQA 3HUCA 3O8TA 1XR1A 2BAJA 5M57A 4WSQA 3ATTA 3NWWA 1GNGA 3ZBFA 1M14A 3C4EA 3NDMA 4FR4A 4J97A 2CJMA 3RAWA 4FL1A 3QLFA 4BKYA 2BZKB 3DPKA 4FTAA 3KRRA 3Q6WA 4I24A 3GQIA 2PUPA 3ZM9A 5FEDA 4MEDA 5F94A 4CFVA 4GH2A 3KRXA 4LMNA 3MY5A 4UV0A 4AW2A 4F9YA 5LCJA 3OG7A 4PMTA 4UBAA 3KU2A 4EUUA 2BFXA 2EXEA 4TPTA 4Q5HA 3D2IA 3R7OA 4EJ7A 3G51A 5K4IA 3ZSGA 2JIVA 4AZWA 2O65A 2PE2A 3UIMA 4JNWA 3ZFYA 4GK2A 3RGFA 1O9UA 2WMQA 1Q8TA 3LFBA 2VX3A 3QQKA 2C3LA 3JXWA 4MQ2A 4D2WA 2R2PA 2LGCA 4ACHA 3DY7A 1W0XC 2CLQA 4ZTHA 2O64A 3R6XA 3SD0A 1NVQA 4G6OA 1DAYA 4H1MA 2FB8A 5JT2A 3HAMA 4IBMA 3DQXA 4FUXA 4DFUA 5F9EA 4WG4A 3DK3A 2AUHA 2W1CA 4RVLA 4I0TA 5AP0A 2R3OA 2C0IA 2VO6A 3MFSA 4IDTA 2PVKA 4XJ0A 5AP2A 3RPRA 3TWJA 4M69A 4ASZA 1OL5A 4OBPA 2R3QA 3DDQA 2Z7LA 1Y6BA 3FC2A 3KCKA 4QP1A 3TV4A 4E7WA 5AAGA 5JK3A 4RIXA 4BDKA 5F4NA 3FC1X 3U9CA 2QR8A 3O23A 5AP5A 3FI3A 2XP2A 4YJRA 2OJIA 4MHAA 2ITVA 3B2WA 3UOHA 1UU8A 1OIRA 2QKWB 3BYMA 3ET7A 4BTMA 4AW1A 4FTRA 4IHPA 5GHVA 3RAIA 4U7ZA 4R77A 4QMXA 1BI7A 1W84A 2J51A 3FZTA 4I5CA 5HVJA 4FYOA 5L6PA 1R39A 4RSSA 2OZOA 2REIA 3L8XA 4K33A 1REKA 3V8SA 3OS3A 3IG7A 3NUPA 2X2MA 4RFZA 3F88A 3MV5A 5E8ZA 2BVAA 3Q04A 2VTRA 5L6WL 1ZZLA 3VQHA 3WILA 4ACCA 4CTBA 1TQMA 1TVOA 3PXZA 2BALA 5L8LA 3TUBA 2FSLX 4CYJA 2P2IA 5CNOA 3CKXA 4MBIA 2AC5A 3C4CA 2JDRA 5ANEA 1ZYDA 3DXQA 4JLCA 3C4WA 3ORXA 2OG8A 2XK3A 3HV3A 1XH6A 3DJ6A 2A0CX 2WIHA 1SVEA 3FMEA 5DE2A 3VUTA 5CVHA 1CSNA 5AA9A 4CFXA 2WMRA 5T6KA 2W96B 4JBOA 5J87A 3OBJA 2VX1A 3WF9A 4JT3A 5M4IA 3COMA 1LUFA 2QC6A 1FMKA 1Q61A 4CG9A 4BVUA 2VGPA 3PIZA 2Y9QA 2I40A 1Y6AA 3FMHA 3R21A 1XO2B 4BDDA 4BICA 3RWQA 1KOAA 3AMAA 3GVUA 3QFVA 4KBCA 5FXSA 4L7FA 4BCIA 3GFEA 1B39A 3R63A 4D28A 5EQEA 3U55A 2VTIA 5M09A 1Q3WA 2O3PA 3H3CA 3KEXA 3R7UA 3R8PA 3BHYA 3NUXA 4JR3A 1VR2A 4KD1A 3RHXA 3CTHA 3PLSA 4QPSA 3ERKA 2YWVA 1YW2A 2JIIA 3FL5A 3PE1A 2XK4A 3TNPC 2UZDA 4EEVA 2YM4A 4D1XA 3H0ZA 3EN6A 4HGTA 3PA5A 4FL3A 1YWRA 4LOQA 4AN9A 4IQ6A 4A4LA 3W55A 3JUHA 4FSQA 3CEKA 3UC4A 2C68A 3PE2A 3BLHA 4PRJA 2FH9A 5L2QA 3SRVA 2XKDA 4XG4A 5BYYA 1PW2A 4AXAA 2BRMA 2IVVA 2FSTX 4O7SA 4I22A 4QTCA 5IH4A 4GIIA 2PL0A 1H25A 4Y95A 4FKGA 5AA8A 5KHXA 3VVHA 2O0UA 2UZNA 3DJ7A 1GZOA 2GS6A 1MQ4A 2XEYA 5E1SA 3UJGA 4EH3A 4K11A 3LQ5A 4FSUA 4DEDA 5JQ8A 4RVKA 1PRYA 3C5IA 3DAEA 4TNBA 4EZ7A 5HKMA 3F5UA 5HIBA 3L1SA 2C6EA 4ZIMA 2VWBA 3LW0A 4MTAA 3GCQA 3NYVA 3QC4A 3D15A 2WTVA 5K9IA 4RJ4A 3TKUA 3TXOA 4F1OA 4RX8A 5M4CA 4O0SA 3H30A 3ENHA 3VUGA 4BWXA 5J1WA 3A2CA 3VBQA 4J7BA 1H1WA 4FSRA 2V55A 5HHWA 2PK9A 3U87A 4C7TA 4XBUA 2PZIA 4Y46A 4YZ9A 3ZS5A 4HZSA 5KCVA 3ANQA 4EL9A 1YDRE 3R7VA 3AXWA 3UIBA 5KHWA 3FQEA 5FLFA 5IQIA 3D94A 5KNJA 2GCDA 1H1SA 1YWVA 3IDBA 4IZ5A 2W1DA 4UY9A 3UNZA 1OKVA 2C0OA 5I3RA 2YZLA 3PIXA 2YM3A 4YTIA 3ZM4A 4RWIA 4Z7GA 4L45A 3KB7A 1SNXA 5J9LA 3V8WA 5DEYA 4E73A 2QOBA 4C34A 4QMYA 3ZO2A 2WTCA 4KB8A 5ANGA 3G9NA 4LM5A 4RX9A 2C69A 3W32A 4LGGA 4G34A 1DM2A 1URWA 1GZKA 3HMIA 3LM0A 4LG4A 3ZXZA 2ZB1A 2RFEA 4EK3A 4OGRA 1QPEA 4GIHA 3MA3A 5BYLA 1KE7A 5D10A 5AP7A 2UUEA 3DTWA 3BPRA 2QKRA 3DAKA 4U45A 4KUJA 3FMJA 2UZEA 4ZJVA 2XK7A 4L9IA 4H58A 3KMUA 4OTQA 5M56A 2OJFE 1H0WA 1AGWA 3D5UA 1FVVA 4HVDA 3IGOA 4DH3A 5EG3A 3UE4A 4BKZA 2ZMDA 1YI4A 5CWZA 3QUDA 3MH0A 4FOBA 3E3PA 2IZTA 3MTLA 4XOYA 5T3QA 4WSYA 3BHHA 3DXPA 5I9ZA 3F2AA 2WB8A 4L42A 4B9DA 1I44A 4JAIA 2QD9A 4RC3A 4D0XA 2PE0A 2ITOA 5DR6A 5A6OA 2C1BA 5CSWA 2C0TA 4GJ2A 4YHFA 4B99A 5A6NA 5C26A 4KSQA 4QPMA 3F7ZA 4ZTMA 4L01A 1PXIA 3SDJA 1M52A 3Q4TA 4AGUA 2A27A 4MBJA 2WMVA 3ORLA 5KUPA 2X39A 3LJ1A 4I4EA 3OCBA 1R0EA 3QA8A 5CAPA 4FTIA 4PPBA 3Q6UA 2FGIA 3T8OA 4BKJA 5ITAA 4RRVA 2WEIA 4BTFA 2Y4IB 2BIYA 3OD6X 5AV3A 2CCHA 4FG8A 3FMDA 3W2RA 3OWJA 2GNLA 3F69A 5IDNA 1ZRZA 1MP8A 4QPAA 2XK8A 4TNDA 5HCZA 5J9YA 3EH9A 3ZUTA 2UZTA 4YNEA 3PJCA 4WD5A 5HX8A 1YXVA 3SQQA 5IMXA 2PY3A 4M69B 2F4JA 3SOCA 1DS5A 4G6LA 3TNQB 4RFYA 2YDKA 2BTRA 4GG7A 3KF7A 2VWZA 3CP9A 3DK7A 3THBA 4KABA 3GU4A 4D4VA 4YZDA 4G16A 3DK6A 1JPAA 2BZIB 3WYXA 1CDKA 3PUPA 2YEXA 5CI7A 3HRFA 4CTCA 1NW1A 4PTGA 4F1MA 2WHBA 4ZSJA 2QHMA 3ANRA 3Q4UA 5A4EA 4PP9A 3OF0A 4NTSA 1L3RE 2QONA 2F7XE 4R1YA 3RPOA 5TT7A 3COIA 4DFZE 4NCTC 2IO6A 5AR7A 2EXCX 3M1SA 4IVDA 3LXNA 4HPTE 3Q53A 2GFSA 4NSTA 3ZMMA 1PJKA 4FZ7A 4NEUA 3SA0A 2DUVA 5HZNA 3KL8A 1OBDA 1J3HA 2BHEA 3KN6A 4U41A 5HNIX 4ZY6A 4MXZA 2YJSA 4K0YA 3TIYA 4RQKA 3HEGA 2PVNA 2XCKA 4BCPA 2X8EA 2YM8A 3GQLA 4UZDA 1H1RA 2VAGA 4UWCA 4UB7A 4GT4A 4JVGA 3QRIA 4FSMA 3OCGA 4FG7A 3W2OA 2C1AA 2PULA 3BQCA 3BU3A 2XRUA 4ASXA 2H34A 4D2RA 5IA4A 2YIWA 1F3MC 2JBOA 3TZ7A 4D1SA 5HCYA 4ANNA 4YSJA 3KXHA 4AZVA 2H8HA 2O8YA 4NIFA 3UZPA 2Z2WA 4L00A 5AIKA 3ALNA 3TACA 3TNIA 4QP4A 4ACMA 4FC0A 2JBPA 1M2QA 4P7EA 2HWOA 2F2CB 2QLQA 3JY0A 5J7HA 4QTAA 1BL7A 4DT8A 4U5JA 5FDXA 3I4BA 3KF4A 3KXGA 4CZTA 4Z16A 5BQ0A 4XG3A 3PY0A 4AQCA 3GU8A 2JFLA 5EYCA 5A9UA 5D12A 3L8VA 2KTYA 3Q9ZA 3BU5A 5FDPA 4NJDA 3F2RA 2WMBA 4IAAA 1YI3A 3R1YA 3PSCA 3L9LA 2R3RA 3NCGA 3FSFA 5CEOA 3R9NA 5CNNA 2VTJA 5G1XA 1M7NA 2WMXA 3VUKA 1XJDA 2HY81 3G5DA 3JPVA 1M7QA 3S2PA 4C61A 2BIKB 3E3BX 3PSDA 4H3PA 2YN8A 4O0UA 3ZC6A 3LFDA 4OUCA 4U44A 3RAHA 3N4VA 4H05A 3NCZA 1W83A 3AC8A 4DG0E 1WMKA 3SRVB 3EIDA 3FMMA 3A7GA 4MVFA 4OR5A 5EI8A 2XCHA 4FTCA 1OBGA 4MF0A 5HCXA 2QODA 5HX6A 3RAKA 3SLSA 4QMOA 4YO4A 1H26A 1RW8A 3MY1A 5B0XA 4P4CA 5AADA 1F0QA 4MYGA 1T45A 4FK6A 1RDQE 5I9UA 3PTGA 2WQBA 5BUIA 4EOIA 5EKNA 5IH6A 4I1ZA 4M66A 2ZM3A 4K77A 3EB0A 1ZWSA 1FGIA 5DT0A 2ZV8A 2JDTA 4AT3A 5EQYA 2PVJA 4CKJA 4PDSA 3UBDA 2XIZA 3F9NA 5A3XA 4FIEA 4IXPA 3O71A 3U6HA 3ZDUA 2Q0BA 3C13A 4X3JA 4LRKA 3QA0A 5D9HA 5BX0A 5CZHA 3BKBA 5C01A 4V01A 2R4BA 4YBJA 1R78A 2VD5A 5F95A 4EK5A 4XX9A 4DHFA 3EZRA 4KA3A 3VRZA 4ZSLA 3ROCA 4G5PA 4CCUA 4GFOA 1LR4A 5H3QA 3L9MA 1PMUA 3OUNB 5CEKA 4IADA 5ANDA 3NVKI 2QO7A 1JSVA 2XM8A 4QMNA 3EQCA 3QZGA 4DTKA 3RVGA 3FZPA 4L8MA 5A4TA 2WEVA 4FIFA 4UZHA 5HTCA 5JGDA 4JXFA 1A48A 4KIQA 4X2FA 3E63A 3ZEWA 1BUHA 2W9ZB 3NS9A 1UNHA 1UU9A 2RF9A 4ZSEA 1PXNA 3F3ZA 5AMNA 4XUFA 4DGMA 2J50A 5DMZA 3EQIA 3DXNA 4TT7A 4FNYA 4LFIA 2BPMA 3BRBA 5DN3A 3TJCA 2B1PA 1H01A 3O2MA 3OP5A 3CR0A 3NW6A 4HCVA 4S2ZA 1O6LA 4L46A 1A06A 4IFCA 5FTOA 4CKIA 3CBLA 3KRLA 3FMNA 2OO8X 4LI5A 4P90A 3MBLA 4EH8A 4EKLA 5B2LA 3SG9A 2JGZA 3GC0A 4GV1A 4J98A 5C9CA 2ZV9A 3OUKA 3WZEA 2BDFA 2PZRA 2J5EA 2WTJA 4II5A 4YJVA 1OKWA 5D7AA 4D4YA 4PL5A 4YC8A 4E5AX 3JS2A 3FL4A 1MRVA 4FMQA 2Y6MA 3GC8A 4A06A 3D4QA 2W99B 3CPCA 2VTNA 2YFXA 2OXXA 2J90A 3HV5A 2RFSA 4FVRA 4WOVA 5D7VA 4DEAA 5IQBA 4MWHA 4O81A 2J0KA 3VRYA 3VN9A 1PXMA 3BYVA 4U8ZA 2WTDA 3FZOA 3SAYA 5CAVA 2WKMA 5EDQA 2HW7A 1VYWA 3DQWA 2C5OA 3LAUA 2VNYA 3D2KA 1G5SA 4P2KA 3UGCA 5DR9A 4IEBA 4AFJA 4QMSA 4WRGA 3TDVA 5FM2A 3WZKA 5J5SA 3UZTA 5CZIA 4O0WA 3ZC5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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