3UNKA

Cdk2 in complex with inhibitor yl5-083
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
298
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A Novel Mechanism by Which Small Molecule Inhibitors Induce the DFG Flip in Aurora A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 295
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3unkA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3unkA01
4H58A 1MQ4A 2YIXA 3BE9A 3EB0A 3DTCA 5D9HA 4QT1A 2BRHA 3D15A 2JIVA 2H8HA 2OO8X 5C27A 4AA0A 4A9TA 2C0TA 2HW7A 3KXMA 5I9XA 1P5EA 3GEQA 4I20A 3HRFA 5LMBA 1MP8A 3BLHA 1OL2A 2CN5A 4FKJA 4U44A 4X6QC 4JQEA 4F9AA 4B8MA 4NTSA 3VHEA 4MNEA 2YABA 3HDNA 4UMPA 4FG8A 4OBQA 1YOLA 2QKRA 2PVRA 4CMUA 3UO5A 2B54A 1JSUA 3PIZA 5FTGA 5HESA 3B8QA 2YCFA 1WBWA 3SAYA 1JVPP 4C4EA 2WD1A 2Z7SA 5HTCA 4A9UA 3VS0A 4MBJA 2ITXA 3LFNA 4KIPA 5KZ0A 4AQCA 4NZWB 1ZAOA 5CVGA 3SOCA 3QWJA 4E4XA 3C4FA 3SGCA 4O82A 4IM2A 5CASA 5HNIX 1VYZA 5HOAA 2XMYA 1OPJA 4D1XA 4XP0A 3H0YA 4FV0A 3WF7A 1VR2A 2R3LA 2B53A 3GU7A 1GY3A 5AX9A 3IGOA 5B0XA 3CKXA 4M7IA 2JDOA 3DKFA 4UALA 2XKDA 5AP4A 2J2IB 5D10A 1MRYA 4O7NA 3FMKA 4E93A 3PXYA 5K5XA 5L2IA 3OC1A 3IKAA 3CC6A 3V6RA 3PSDA 5CEIA 4CMTA 4FE2A 4YJUA 5ETCA 4HPTE 5FGKA 3V8SA 3QZGA 4LGDA 1XKKA 2B55A 3RALA 5AUUA 3IGGA 5JZNA 3ACKA 3CQWA 5KMNA 3R9RA 2WU7A 5IZFA 1YXUA 2G9XA 3FDNA 3MFTA 3BHUA 4JX7A 5DNRA 3SG9A 4GKHA 1J1BA 1ZYLA 3KEXA 1JQHA 4W8DA 4GT4A 3UQGA 4O21A 4BCQA 5LVOA 2YIWA 2IZTA 4FV2A 3QFVA 3QRJA 4O2ZA 2IW9A 3VQUA 4IBMA 4EJNA 4OAUC 4GCJA 3BYVA 4IM0A 4CCUA 3FWQA 4N4SA 2Z02A 5CY3A 1UU3A 3ZXZA 4F0IA 1YKRA 3BE2A 3EWHA 3FMMA 3GCUA 3MB7A 3ZUVA 1ZOEA 3IONA 3K3IA 3NPCA 4J8MA 4MCVA 5E7RA 5ACBC 2RG5A 3RP9A 3H9FA 2YJSA 4I23A 4CT2A 1BUHA 4AOJA 5AUTA 5HX8A 4U3ZA 4TPTA 4C59A 3LW0A 2R0IA 1M2PA 2YIYA 2O5KA 2WQMA 4DA5A 2W1FA 5IDNA 3U51A 3UZPA 3MPTA 4DBNA 1YHSA 4UWYA 5C9CA 5M55A 1R0PA 3QRIA 5FTOA 2VUWA 4FNWA 4W4YA 3PA3A 3HV5A 4AZVA 3F7WA 2VTAA 2XK6A 3RTPA 5KZIA 2KTYA 3QL8A 3RCJA 4EOSA 4RLKA 4LOOA 3TJDA 2W1EA 5LVLA 5I5ZA 3ZXTA 4CRSA 5E8YA 3PWDA 2UW5A 4IVCA 3NIZA 4J7BA 3EQIA 4ZTSA 4HVSA 2QOQA 5E8ZA 4YTIA 2E9UA 5HICA 1J3HA 2HZ0A 3F3ZA 1T45A 3HP5A 3P5KA 3ET7A 2C30A 3QC4A 4K33A 4M8TA 4B7TA 2BROA 2PWLA 2YIRA 3RZFA 3IDPA 1FVVA 3OBJA 5AA8A 1YOMA 1URWA 3BU3A 4NW6A 5CQWA 4HPUE 2C6KA 3E3BX 4O81A 3Q5IA 4F70A 4U7ZA 2FO0A 4UV0A 3GXLA 4ZLZA 2OF4A 4ZTLA 4XOZA 5DYJA 2PUUA 2J50A 3PSBA 5HCYA 5CF6A 1Z57A 4AGUA 4IAKA 3L1SA 4ALVA 5EKNA 4M66A 4A7CA 4B4LA 4FK6A 4R3RA 3RWQA 3E8CA 4FTTA 4F7SA 2W5AA 4F08A 2VTSA 4UWBA 4L7FA 2UUEA 3V5QA 5JQ5A 2W5BA 2Q0NA 2R3OA 2WMVA 4PTEA 2QOKA 4MTAA 1K3AA 5AV2A 4ENXA 4K6ZA 4RA5A 2CJMA 1ZY5A 1QPCA 2DYLA 2QOLA 3COHA 2O2UA 3NAYA 5EHOA 1WVWA 2PE0A 2R3GA 4L8MA 4XH6A 3DK7A 3FPMA 4G3CA 1AGWA 3GBZA 2GHGA 2QC6A 5AR8A 3UC3A 3IW6A 4GS6A 2IVUA 3KN5A 2XEYA 4Q9SA 2OXYA 5HU3A 3R1SA 5M44A 3CP9A 2PZYA 3HRBA 4ENYA 2VD5A 2WKMA 5HLWA 4EC8A 2X9EA 2QU6A 4IFGA 5TKDA 3TNIA 4XRLA 2HXQA 3DKOA 3NNXA 3PJ1A 4AOIA 4AE9A 3UOLA 5EG3A 5DRDA 3T3VA 1PXLA 2VAGA 2ZDUA 3VJNA 4A07A 5IH5A 3ZZWA 2X81A 4DG0E 1LEWA 2UW0A 4QMXA 4ZTQA 1E1XA 3RAIA 3JR1A 4UY9A 3PXKA 3V3VA 1OPKA 2GNJA 3A8XA 5CI7A 3QTXA 4FTNA 4CEGA 4O0TA 4FNYA 1SNXA 4QP6A 4EOMA 4GJ3A 4BCPA 4FIJA 4XV9A 4E6DA 5HTBA 4IX5A 4RJ7A 3FKNA 5HE0A 3V8TA 2GCDA 2CPKE 4S30A 5JFWA 4JLCA 2PULA 3O23A 5I9VA 4E4NA 2VNYA 2ONLA 3E8DA 4DYMA 3WF6A 4ZSAA 5J1WA 3VNTA 3M2WA 2HY81 4JDIA 2HZ4A 2XIKA 4O96A 3UMXA 4BWPA 3QYZA 4CFWA 3ZC5A 4IDVA 3V51A 4L45A 2XJ2A 4MNEB 3VBXA 4ACDA 2CGVA 4GUEA 3R8LA 3P1AA 3V6SA 4C8BA 3DDPA 4MYGA 3WZDA 5L8JA 4D9TA 2HZIA 1SZMA 4BDBA 1STCE 4FEWA 3GU4A 4RX8A 2YDIA 5KBRA 3BBWA 4D4RA 3N51A 3QA8A 4RX5A 3KREA 1H08A 2X0GA 4V01A 2XNNA 2XNGA 4RRVA 3HUCA 4DE4A 1PMEA 1R0EA 3EQBA 4ANMA 2W99B 3D7TA 4CD0A 5EH0A 3C0IA 2HWPA 4BHNA 5DR6A 2O3PA 4FK3A 4IQ6A 5TO8A 5GJFA 3D9VA 3F61A 2FYSA 3DA6A 3CXWA 3VO3A 4FTOA 3BLQA 4USDA 3KGAA 1FVTA 4E5BA 4BCJA 5IUGA 5HGIA 3OROA 4AU8A 5IEXA 4H1MA 5CQUA 2XS0A 5DGZA 2ONLC 5EOLA 2Y7JA 4YJOA 5T68A 2HW6A 2FUMA 2W06A 4G3GA 4MXXA 4BTJA 5EYKA 1BYGA 3REPA 4HOKA 4L67A 2PTKA 4D2VA 4IB1A 3O8PA 1YI3A 4USEA 5IQFA 2XM9A 5CVFA 4FV6A 4EZ5A 3JVRA 3R22A 3PY1A 3NUNA 5BMSA 2QO7A 1R1WA 5EFQA 1U4DA 4ANQA 4G34A 1MQBA 1IG1A 4RBLA 3U9NA 3U87A 2JDRA 5KE0A 5M06A 5DT3A 1SVEA 2A2AA 5AP6A 4UZHA 3C4XA 4L3LA 5I4NA 3CD3A 1BLXA 5KMMA 2JAMA 2OJJA 3DY7A 3ZH8A 3BI6A 4WBBB 4EH9A 4K8AA 2J0IA 4BCIA 4I24A 4ZK5A 5BUIA 3UQFA 4R3PA 1SMHA 3FZPA 4QQTA 2R3NA 3F66A 4TWCA 1I44A 2FSLX 1F3MC 3GCSA 2G2IA 1JKLA 3ACJA 4QMTA 3ZU7A 3FEGA 4F63A 3SLSA 4H3QA 4XG6A 2BAKA 3FLQA 4QYGA 4RPVA 4CKRA 4KSPA 5AR2A 5J7BA 3GC7A 5E90A 2RFSA 4UB7A 4JIKA 4RC3A 4E8AA 4FTIA 5EDQA 3D14A 5K4JA 2JDSA 3ZSHA 4RFMA 4XG8A 2C3LA 2ITZA 5JRQA 3UIXA 4DH7A 3MPAA 3HUBA 4CTBA 3VN9A 1OZ1A 4W4XA 4KB8A 2YACA 1OBDA 5HLPA 2O8YA 4PF4A 3F5UA 4GFOA 4CFMA 2HELA 3FQSA 3RGFA 4C02A 2BMCA 4IADA 5HNGA 4U8ZA 3GP0A 4ORKA 2C6DA 4FVQA 2BRBA 2WMXA 4G2FA 5HVJA 3ZFYA 4PDPA 4AWIA 5AEPA 2A27A 5DMZA 5AAFA 4O0SA 3KMMA 1PF8A 3VIDA 3EFJA 3NWWA 3AC5A 5KO1A 4IE9A 4U0IA 4YHFA 4ZJJA 2WQNA 3ZYAA 2WB8A 4BVUA 1VYWA 3KXZA 2GFCA 5AV4A 2KULA 3ULZA 5EK7A 2VN9A 1YDRE 4FC0A 3POOA 5BYLA 4MVFA 3SC1A 2PZIA 4FOCA 4QYHA 3TTJA 3O50A 3DQXA 3HNGA 1W8CA 4F6WA 1Y8YA 2VX0A 4PP9A 4O7WA 4AW2A 3PYYA 4MX9A 5B7VA 3ALOA 2WTDA 4FSRA 4P5ZA 4BRXA 2IZUA 5J87A 1FOTA 1PMUA 4DEBA 5AADA 3I5NA 1X8BA 2EVAA 4Z55A 2YIQA 3ZLWA 4P7EA 5K3YA 3VC4A 4M0YA 4IB0A 3QGYA 3F2RA 3AC2A 4EH2A 1IA9A 2J51A 4XP2A 4NT4A 3QZIA 3UG2A 4BC6A 1KOBA 3NSZA 4LV5A 5IISA 4CKJA 3MFUA 3GUBA 3KRWA 4YJQA 3DJ7A 1I09A 2R3PA 5B2LA 2QQ7A 4L52A 5G1XA 4CFFA 2ZM4A 1XH7A 3CQEA 2B0QA 5B2KA 3U8WA 5CU4A 4L3PA 4RIOA 2WEVA 1YDTE 4TN6A 5A4LA 3C13A 2Y4PA 3I1AA 4A06A 4FGBA 5HI2A 4YURA 3QHWA 4FNZA 3GGFA 1OGUA 5IQBA 3C5UA 4GFMA 3ZS5A 3PXFA 2ITVA 2QOHA 5ANEA 3UYTA 2W1CA 3FXZA 2VTPA 4I5CA 4J8NA 2WMRA 3FZ1A 5IDPA 2X6DA 5KMOA 5EQPA 3NLBA 4JDJA 4FV3A 2UZUE 4EQUA 5L8LA 3NW6A 3BV2A 2JKMA 3SRVA 4CT1A 2WIPA 1JNKA 2BHEA 5F1ZA 5LARA 5IUIA 2G1TA 3SX9A 5L4QA 2BZIB 3F3WA 4O6LA 5IA5A 5CAVA 4C37A 5IA2A 4WG3A 4KBCA 4HZRA 4F7JA 3LQ5A 3FMHA 3VUHA 1QL6A 3WOWA 2J90A 4AT5A 5E8UA 5I3OA 4GU6A 2XBJA 3O0GA 2IO6A 3QALE 3S3IA 4FR4A 2PY3A 1XBBA 4XG4A 2I40A 1M14A 4OT5A 5HD7A 1YXTA 1MRUA 3K5VA 4XP3A 5J5SA 4C38A 2V7AA 4XEYA 4ANNA 1ZYCA 2IW6A 1ATPE 3UQCA 2OG8A 4XG3A 3DBCA 4AA4A 2ITTA 2GNHA 4L3JA 5LCKA 3FPQA 4IAIA 4ZTMA 3Q4TA 1E1VA 5FDXA 3Q9ZA 3D7TB 1JAMA 3OG7A 1YQJA 3ODYX 3P7AA 4A9YA 3PA4A 3PVBA 3A99A 3PVGA 4IX6A 2OU7A 1U5QA 2ZB0A 2PPQA 5CI6A 2CGXA 4NKSA 5JFSA 2JC6A 3L8PA 4X7QA 5IA1A 4I6HA 4RIXA 3DXNA 3D94A 2DQ7X 3R2BA 3RPVA 3VS4A 3DTWA 2RSVA 3R2YA 1ZY4A 3II5A 4JRNA 3PLSA 2JDVA 1W84A 5E8WA 3E92A 3KULA 3NYXA 1YHVA 4RVLA 3RBWA 2WXVA 3E62A 2WTCA 3QHRA 1UV5A 2IZRA 4KSQA 2EUFB 2QG7A 4L44A 4EOLA 5GIPE 3P23A 2XA4A 3VUMA 5DH3A 5LWNA 4KAOA 5EYCA 4ZJVA 4F1MA 5J95A 4FSTA 4GKIA 1RE8A 1EH4A 4G16A 4YZMA 4AGCA 3R8MA 2PYWA 3EHAA 2C3KA 3VWAA 3FL5A 2IZSA 4EWHA 4WRSA 3BELA 4F99A 4C2VA 2WOTA 5E4HA 4IJ9A 3I7CA 3ZDUA 4UMQA 4FODA 3MY0A 5AP1A 3NIEA 2XK7A 3ZHPC 2JD5A 1W83A 4W4WA 4DFYA 4DITA 3TNPC 3VBTA 3P79A 2PVMA 3JY0A 3FZSA 1Y8GA 3AXWA 5EM8A 3ZO2A 4FKLA 5HO6A 4E20A 4EONA 4WRGA 2UW3A 3FQEA 4O7LA 2VTJA 3FLYA 4YJPA 3D5VA 2ZOQA 2XK3A 3NX8A 1OKWA 5D1JA 2XNBA 4D0WA 4DCEA 2I0YA 4QYFA 4DLIA 4DGOA 2X9FA 4KIKA 4YJTA 4AZTA 5JZJA 3QTRA 1IA8A 2W1GA 2DUVA 3G9LX 2XKFA 3OEZA 4YJSA 4MNFA 2QLQA 2XF0A 4NK9A 5AA9A 4FKTA 2QD9A 3RM7A 4I0SA 1SVGA 2P2IA 4DEHA 4F09A 3SHEA 3TG1A 1Q99A 4DFUA 2J0LA 4XHKB 5GIOE 2WPAA 1OKZA 5L2TA 3MV5A 2ITYA 3MVLA 4R1VA 4RWIA 5E8XA 3TN8A 3D5XA 4U43A 5FD2A 3QU0A 3VS6A 4XLIA 2UZDA 2WOUA 4OTQA 4RWLA 4UEUA 2OJGA 3DGKA 3PWYA 3QTWA 4K9YA 4BF2A 1G8AA 3TV7A 4GYIA 4R7IA 1FBNA 2FH9A 1XH6A 4QP3A 3RKBA 4TYEA 2GNFA 4MXAA 4DEGA 3RWPA 4DLJA 2WQEA 4FZFB 4W9XA 5CSWA 1UA2A 5EM6A 4LG4A 3ZOSA 2YWPA 3F88A 3BYOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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