3UVQA

Human p38 map kinase in complex with a dibenzosuberone derivative
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
349
structure length
333
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLTRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Dibenzosuberones as p38 mitogen-activated protein kinase inhibitors with low ATP competitiveness and outstanding whole blood activity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 104
structure length 333
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2011-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3uvqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3uvqA01
3ORLA 1Q4LA 3NNWA 3HRCA 4MXZA 3PP1A 3IQ7A 2QOIA 3KRWA 4ZJJA 3C1XA 4YHTA 3FKNA 2R3HA 5GZ9A 3PRFA 4BDIA 4JX3A 4FZFB 4TWPA 3H4JA 4Z9LA 1H24A 4GFOA 4EEVA 3AC4A 4LGGA 5HO8A 3ZUUA 1ZLTA 2BRGA 2VO0A 4IMYA 5IH5A 3F69A 4ZMFA 3VUKA 3VUMA 3HAVA 3CR0A 4IBMA 2GCDA 5TT7A 5BUJA 2OJGA 5AUTA 1L3RE 1R1WA 4QT1A 5DHJA 1BX6A 2JDSA 3AQVA 2J50A 4H1MA 5JEBA 5LJJA 4WRSA 4H39A 5KE0A 2HK5A 2YISA 3R22A 4G5JA 2H96A 1H01A 2CCHA 1H0VA 3DBDA 4ZY4A 2H8HA 4IVCA 3MWUA 1A9UA 4C36A 4B6LA 4FKUA 1RQQA 2VTRA 3SAYA 3D2IA 3GC8A 4D2VA 5A14A 1FMKA 4EH3A 5AJQA 2ITYA 1I44A 4U3YA 2WU7A 4E5WA 3KMMA 4FT9A 4UEUA 3A7JA 3VQUA 5HCZA 1PY5A 5K0KA 4R7BA 5DIAA 3R7OA 3QCXA 3A8WA 5DWRA 2WMTA 3OBJA 2R4BA 5KHWA 5CF8A 5AFVA 4DHFA 3BWJA 3LFAA 3A99A 3NNXA 4RC3A 2HZNA 4YHFA 3D7ZA 4AU8A 3ZZWA 2PSQA 4HGLA 4IX4A 5I5ZA 2CGWA 3G5DA 4IB1A 4EQMA 3A7IA 2W9ZB 5JK3A 3F82A 1UKIA 3VRZA 4HZRA 3DK7A 3MFSA 3Q4ZA 4PQNA 4PX6A 3E5AA 4ZS4A 1H25A 3SHEA 4YZCA 5LOHA 3GU7A 1OPLA 4IAIA 2JFLA 4U45A 2XEZA 2ZMCA 4NFNA 5FEEA 1YHWA 3PFQA 2R3PA 4UY9A 1H1PA 2WGJA 1W98A 1YHSA 3QKMA 5J95A 5AMNA 3DA6A 5F9EA 5EQEA 2WQEA 3ORIA 4X2FA 5AUUA 3DAJA 4QRCA 4ACCA 5JFSA 2RL5A 4YMJA 2J5FA 4FMQA 5FP5A 4H3BA 1U5RA 2PZIA 3EOCA 4LRJA 2B7AA 3ZXZA 2GS6A 1GY3A 4XV3A 3DJ5A 3TNQB 2O63A 3KXMA 3IGGA 3F5PA 5EW3A 2JKOA 2UZWE 4MNFA 2PY3A 3TNHA 1KE9A 4FA2A 1LP4A 4BDDA 4C7TA 5JQ5A 3EL7A 2W0JA 3GC9A 2ITVA 4XV9A 4DH7A 4K2RA 4S34A 1YI6A 3F5GA 5AUVA 3CPBA 3COIA 4AZWA 2YZLA 3E8CA 2G2HA 2REIA 4GK4A 4Y85A 4GUEA 3QBNA 4A9RA 2IO6A 4YC6A 5FM2A 5T68A 4MYGA 3DY7A 3NNUA 2ZMDA 2VTOA 2X2KA 4J7BA 2GNJA 4Y72A 5CU4A 3LFEA 2C6IA 4FTQA 4AW1A 5CAPA 3LLTA 3TEIA 4IZYA 4FK3A 4C3PA 4NW6A 2ITUA 3R1SA 4WKQA 3UOJA 4O0TA 2BALA 2ZB0A 1K9AA 3GXLA 4I6BA 4D55A 3OWJA 3Q5IA 4CCUA 2F7XE 3B8RA 3MVJA 3KXGA 1A06A 3OY3A 5AM7A 3FZ1A 3HV6A 3I81A 4K6ZA 2P2IA 4A9TA 4CLJA 4ZMEA 3FL4A 2FYSA 3KEXA 3RKBA 3NUAA 4LMNA 5A46A 3LM0A 3GI3A 3MPAA 5C8KA 1H4LA 3PDTA 3NRMA 5EM5A 2UW0A 4OTPA 3C13A 3JR1A 2OW3A 2ITQA 4O0YA 4WG5A 3GQIA 4W4XA 4KS8A 5AUZA 5IMEA 3ZBXA 3KF7A 3R8MA 5J8IA 4FTLA 2OSCA 3W2QA 3PPKA 2EXMA 2W99B 4ZY5A 3GUBA 5A4CA 4FV6A 4MWHA 4QTDA 3MFTA 3R63A 2V5QA 2VWWA 1IAJA 4M8TA 5CVHA 3DBCA 3WZDA 1R0EA 2O3PA 2W5AA 3CQEA 5CY3A 3TDVA 3ROYA 4FKLA 3Q5ZA 2WTKC 3RHXA 5KNJA 4E5BA 4JR3A 4FT7A 1CKJA 3V3VA 5B2MA 4IZ7A 3C0HA 1H26A 4XBUA 4BGHA 3CTJA 4BHNA 3ELJA 2XKEA 3QZFA 3V04A 4GFGA 2DUVA 4CKJA 5KMMA 3CP9A 3K3JA 2JDVA 4LRMA 3CBLA 5FG8A 2JITA 2ZV9A 4U44A 3W2SA 3VS6A 4CNHA 5C8MA 4CFVA 4FV9A 3ZDUA 2WMSA 4J1RA 2WTVA 3MJ2A 4LYNA 3V5WA 5AP0A 4EH2A 4A06A 5A6OA 2YEXA 3U6IA 4DT8A 1DAWA 4IFCA 4CFXA 3C4XA 2UZLA 4R7HA 4BI0A 1JSUA 4FSUA 4CRLA 4I6FA 3BU6A 3RALA 3FMMA 4DEAA 3S00A 4KA3A 4R1YA 4DGGA 4G3DA 4U5JA 3UMWA 3QRIA 1FVRA 3LMHA 2WQNA 1DI8A 1Q41A 2ERZE 2XF0A 5IQFA 4EHEA 4ITJA 2W1CA 3ZSGA 1E1XA 3HZTA 3RINA 4HCUA 2R7BA 3MTFA 3NLBA 3DPKA 1O6KA 3TTJA 2OU7A 4BZNA 2W1GA 3HP5A 5EOLA 1JPAA 3FKOA 3HA8A 2XIRA 3AC3A 4NU1A 3EQGA 3LQ5A 4OR5A 4XRJA 3DNDA 2PWLA 2WKMA 4BDHA 2W9FB 3QC9A 2C68A 4NIFA 3DTWA 3B8QA 3IDPA 5D12A 3ZDIA 3EN6A 1FBNA 3CQWA 1NVRA 4IX3A 1RJBA 2HXQA 4R1VA 1G8SA 5M09A 4ZLOA 5LQFA 1VYWA 2WPAA 1G3NA 2I1MA 3U55A 1UA2A 4Y5HA 3HVCA 4EOOA 4HZSA 4XOYA 5IQAA 1J1CA 3PJ2A 4JBVA 4YBKA 3NAYA 5L8JA 4YUQA 3Q9WA 2WTWA 3CQUA 3IK3A 2X7OA 2Y4IB 4NW5A 5HO7A 2I40A 3TV6A 5IA1A 1XH8A 4GFMA 3HRFA 3QUEA 3PXZA 4AGWA 3AD4A 4C0TA 1BI7A 3RHKA 2C6LA 2CNQA 3PA4A 4I5HA 1JWHA 4EYMA 4MXCA 4PTCA 4G34A 3WOWA 3FXZA 5L8LA 3VS5A 5IQEA 1YOMA 2X2MA 3OG7A 1OM1A 5GJFA 5K4JA 3OY1A 3JY0A 2R0IA 4YLJA 4C8BA 2B53A 3PUPA 4MX9A 3IOKA 5FQDC 4J8NA 4O82A 2HZ0A 3LFBA 3PZHA 3KRLA 5AUYA 4CGAA 2G1TA 3A61A 4WSQA 5FBNC 3VVHA 2ZAZA 3IGOA 3QQUA 3H10A 3FLYA 5AWMA 4DH1A 5I4NA 3NMUF 3V8TA 1YHVA 4XJ0A 3DB6A 3DZOA 3LFCA 3D94A 3SLSA 4D28A 4FL1A 3BQCA 4U42A 3DXNA 1I09A 5CEKA 3W33A 3AGMA 3NPCA 2HZIA 4EYJA 1NT2A 3HUCA 3ZONA 3DAKA 1V1KA 2XZSA 5HVYA 4G17A 3TM0A 2BTRA 4FV2A 4X0MA 1YKRA 4LL0A 4C2WA 1MQBA 4BDBA 4CFNA 5F94A 2FSMX 1EH4A 2XEYA 3GBZA 4P90A 4FTOA 4RMZA 4CKIA 4EOSA 3EN5A 4ZTMA 5FTGA 3FMKA 3KCFA 4D4VA 1DI9A 3MPTA 2JDTA 2ONLA 3ZO2A 4FK6A 4GEOA 1JAMA 2FSTX 1WBTA 4FV3A 4CQEA 4HVHA 3W2RA 3Q4CA 3OMVA 2JFMA 5CNNA 5EYCA 1XBBA 4DFXE 4BDKA 5GIPE 5JN2A 4U40A 4MD8E 5AR7A 1TQIA 4QMPA 3TT0A 3R21A 4AAAA 3OXIA 4L42A 1QL6A 3UIBA 3QTUA 5KMJA 4J71A 4FTIA 4I0TA 4L53A 4YBJA 1Q8YA 3OTUA 4FTTA 4OTFA 5HIBA 4MXXA 3ALOA 2ZOQA 4EH4A 2YDIA 3GFWA 2Y8OA 1PXIA 2E9OA 3FI3A 4UWCA 2NNWB 2EVAA 3ENHA 1OGUA 1YXUA 2OK1A 2XCKA 3PXRA 4QMVA 3OTVA 5EHLA 4BTKA 3NYNA 4EK4A 3IG7A 3MBLA 2RFDA 4G3FA 4X3JA 3O8UA 4AA0A 1PKDA 3NDMA 3RCJA 5KKRB 4PV0A 4LOPA 1JKKA 3EYHA 2F7ZE 3QD0A 5K5NA 3EJ1A 4C4HA 2GQSA 4HCTA 4ACGA 4EK5A 4MK0A 3W2OA 2V22A 1BYGA 4KAOA 1WCCA 2W4OA 2X9EA 3E88A 3SXSA 4ANOA 1YDRE 4UMTA 4AS0A 1IEPA 5HBHA 5KHXA 1SZMA 3VJOA 2Q0BA 2XNPA 4ACDA 5GJGA 1JVPP 2RF9A 2B55A 4RLLA 2CKQA 3NVMB 4P5QA 2ITOA 4N6ZA 3RPVA 5H8GA 1NVSA 5FP6A 4EK6A 3PVWA 4QTBA 4I22A 4F0IA 3KK8A 4DH8A 4DTAA 2QNJA 3OOMA 4BCKA 1H8FA 4PTGA 3W8LA 5AA9A 3TNPC 3FC2A 4Y5QA 2CGVA 5BVEA 2R3MA 2BR1A 4X6QC 3R8VA 2VNWA 2PTKA 1OIQA 3QA8A 4A7CA 4A9UA 4TNDA 4C02A 4A4LA 4CMTA 3E8DA 4FKOA 4YJNA 4V01A 1Y6BA 3OF0A 3PSBA 4LV8A 5C01A 3ZEPA 3R28A 4AWIA 3LXPA 4W9WA 4B8MA 5DI1A 3E87A 4GK3A 4XLVA 4AN2A 4NEUA 2XNMA 3EFKA 4RVMA 2C6EA 2R3RA 3P1AA 4B99A 4S30A 4F63A 4YU2A 2C5NA 5IQGA 5JGBA 4GRBA 4FSQA 3W16A 5AV1A 2V7AA 3PE2A 4CTBA 4FL3A 4GVJA 4KBCA 5L2IA 2YZAA 3LCKA 4JG7A 2IW9A 1XJDA 3TTIA 4GT5A 2YM7A 3VS0A 3DK6A 5AA8A 2X8DA 2BZKB 4E6CA 5J9LA 4FBXA 4KBKA 2O8YA 4FG8A 5J79A 4OGRA 3FMDA 4OBPA 3VBXA 2J4ZA 3DNEA 2C69A 2Y9QA 3NSZA 4QYYA 2Z7QA 4TN6A 3NIEA 4WG3A 5FTQA 4I23A 1M7QA 3WIKA 4BDFA 3OHTA 1STCE 3NW7A 4MCVA 5DFPA 3UG2A 2C3LA 5L4QA 1LEWA 4U9AA 4Y83A 2GHMA 4TYEA 5A6NA 4UX9A 2HOGA 2I6LA 2VU3A 5F1ZA 4YTCA 2JIUA 3F3TA 3LCOA 4KNBA 2G01A 3I6WA 4QNAA 5HQ0A 4PL4A 5LVOA 4X2KA 4D2TA 3I5ZA 4NZWB 1IG1A 3P4KA 4IFGA 3Q6UA 2YFXA 4J8MA 2XKFA 2ITPA 3GB2A 2R3LA 4H1JA 4RZVA 2UVZA 2GPHA 3SX9A 4FTUA 4D2PA 5JFXA 3L9PA 1B39A 1WMKA 1YXTA 4MKCA 4YTIA 2QO2A 4QMTA 5DGZA 5M4IA 4O0SA 4MF0A 2VX0A 3G9NA 3ZXTA 4RGJA 5IA4A 3D2KA 4FIFA 4BBEA 4HCVA 2JC6A 4I24A 2Y4IC 3DDQA 3R1NA 2BPMA 3R2YA 4YNOA 3VUDA 4BY9E 4IAZA 5HNIX 3Q4UA 5EI2A 2VGOA 1OL6A 3PA3A 2BCJA 3TXOA 1KOBA 4FTRA 4MBLA 4RX8A 2YM4A 1H27A 4TNBA 3MFRA 4ZOGA 4G5PA 1NW1A 3BHVA 4ITIA 3NUYA 3H9OA 4MQ1A 1OMWA 2WELA 3FI2A 2JBPA 2XNEA 3BYUA 3F5XA 2BAQA 3DU8A 3MTLA 5HCXA 3TI1A 5J1WA 4I4EA 1OUKA 2PZYA 3D7TB 2JDOA 3BLHA 3W10A 1BMKA 3QLFA 2XJ1A 3ACJA 5EH0A 3CPCA 2P2HA 3JVRA 3TKHA 3DJ6A 3CY2A 4UMPA 1B38A 2VAGA 4TTHB 3MH3A 4WSYA 4E93A 3G15A 4BTFA 2X9FA 4ZZMA 5KMNA 2XA4A 2CSNA 5ANGA 4D5HA 4B0GA 3KRJA 3PG3A 4C4IA 1OKZA 3UNZA 4C57A 4OUCA 4BDCA 4HW7A 5EQPA 4PDSA 3GNIB 4XH6A 3KL8A 4IVBA 4AFEA 3A8XA 3DV3A 4KIKB 3SRVA 4WUAA 2GNGA 1MRUA 1IR3A 2YLEA 1VJYA 3NAXA 4ALVA 4AOIA 3GENA 4NH1A 4HYHA 1CTPE 2AYPA 1Q62A 2CLXA 2OJIA 2OXDA 3DKFA 3N9XA 3DLSA 3BRBA 4PMTA 4E4MA 4PRJA 5A9UA 4ANBA 2YAAA 4OAUC 4O7RA 4DBXA 3CY3A 3D0EA 4XP0A 2A4LA 4F70A 3FHIA 2J0LA 2IPXA 4H3QA 2ZB1A 3PPZA 4XYFA 4EOMA 3ZSIA 2GFCA 4BI1A 4X6RA 3UO5A 2WMVA 3OOGA 3NYOA 4AZVA 1XR1A 5HNBA 1FVTA 5IUHA 3MESA 4YGAA 3O71A 1UU3A 4FTCA 1QPJA 3TG1A 2QC6A 3C4CA 3OEZA 3R2BA 2IWIA 3ORKA 3GFEA 4WO5A 2IG7A 3OUKA 4KKHA 4W9XA 5TO8A 4MNEB 3AT4A 4WBBB 2WOUA 5AP3A 4EHVA 1OL7A 1DM2A 4IWDA 4E4LA 2Z7SA 2YIRA 3EQPA 2YDJA 4RX9A 4BC6A 3TJCA 3CC6A 1FVVA 3ITZA 4IC8A 3RZFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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