3VVHA

X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (mek1) in complex with an inhibitor and mgatp
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
322
structure length
287
Chain Sequence
MELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMATRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFPPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with an inhibitor and MgATP
rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
total genus 90
structure length 287
sequence length 322
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2012-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3vvhA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3vvhA01
2BAKA 4J8NA 5AMNA 5BVNA 5J5SA 3KU2A 1BX6A 3FL4A 4JG7A 4TL0A 4AWIA 5EQYA 5JSMA 4TYHB 3ZDIA 4F9CA 5CF6A 4BL1A 2IJMA 2CKQA 2CHLA 4KIQA 3ZZEA 5K0KA 3LJ1A 3OEZA 3LLTA 2NO3A 4EJ7A 4CZTA 2PE0A 2QD9A 3EN5A 3EQBA 3OZ6A 2DS1A 3QL8A 4L7SA 1CSNA 2YIRA 1CKIA 3IQ7A 4JVGA 4L68A 5J7BA 2CGXA 1O9UA 1BMKA 4EL9A 5TE0A 3MB7A 3QTUA 5AP2A 3SG9A 5CI6A 3ODYX 3VBXA 3OWPA 4L67A 3WF7A 4KUJA 2RSVA 3B8RA 3AD5A 1H0WA 2VX3A 2XS0A 3RINA 5DR6A 2G15A 4MKCA 5GJGA 1AD5A 2B7AA 4I3ZA 4E93A 3QXOA 4JLCA 3NDMA 3E8CA 1ND4A 3A4PA 4QO9A 4U79A 2HZ4A 3N9XA 2GS7A 4DC2A 5KMIA 3P7BA 3HP5A 3RHKA 4JBPA 2WMQA 4EOOA 2QONA 2IG7A 2WTCA 1MP8A 4RX7A 4XV9A 4BDCA 4BCKA 2JKOA 5DOSA 3MPMA 5DEWA 5E9EA 3LVPA 4RIWA 3TTJA 4RJ4A 5DR2A 4JBOA 1KOAA 3JYAA 3ZEWA 4NEUA 5LOHA 1B6CB 1Q4LA 3ODZX 3Q60A 1Y8GA 1QPDA 4IX6A 3L9PA 5HU9A 3OG7A 3KKVA 3OVVA 4XUFA 3S2PA 3ZSIA 5AP1A 5E8YA 5LMKC 1XKKA 5HBHA 4AA5A 3SXFA 2R5TA 4PTCA 5L2SA 4Y73A 3MY5A 4IXPA 3QRKA 5AM7A 5B7VA 3FPMA 4BC6A 4IC8A 2OIQA 4BYIA 2B53A 3PRIA 3IW6A 4ACHA 5IQHA 2HOGA 3UZPA 2ONLA 3ZUVA 4WRGA 1YXXA 3UO4A 2WEIA 3HECA 4RSSA 4D1XA 4FGRA 1IA9A 2R7IA 3GU7A 5CAOA 3EHAA 3RHXA 3GT8A 3UJGA 5CX9A 5AR3A 4ASEA 2UVZA 3IW8A 4XYFA 4FSQA 3LOKA 3CE3A 1YOMA 3Q5ZA 2HXQA 2Y4PA 3PXKA 5L4QA 2BFYA 4YC6A 5C4LA 1GY3A 2J7TA 3ZMMA 5AV3A 2HZNA 3QHWA 1G8SA 3C4ZA 3SA0A 4NM3A 2PMNX 3W2PA 4CNHA 3N4TA 2AYPA 1H08A 2ETKA 4BF2A 3SXSA 1WBNA 3KRJA 4RQVA 4U42A 4V05A 3FMEA 4D2WA 4LQMA 5LVNA 3HAVA 5KNJA 3C13A 3N51A 3QUEA 5BVEA 4O0RA 3VF9A 1RJBA 2UW6A 3IPHA 4E5WA 4EORA 3T3UA 2OBJA 4R5YA 3MY1A 5D9HA 2W1EA 4PDPA 3D7TB 3V5JA 2W4KA 1H28A 3P86A 5M4IA 2PVJA 4O0XA 4MYGA 3NVKI 4QP6A 2XNEA 3DB6A 4G3DA 5HNBA 1OITA 1LUFA 4LL5A 5JGBA 4U3ZA 3ANQA 2J0LA 3FSKA 4CG9A 2P3GX 3LM0A 4TY1A 5TO8A 4B99A 4D58A 4DTAA 4D0WA 1ZMWA 3ACJA 3A2CA 1J7LA 2UZUE 4HJOA 4ASXA 4C4EA 2X8DA 1ZOHA 4B8MA 3AC8A 4YLLA 4O7LA 3SC1A 3SRVA 4BRXA 3UGCA 4O86A 3FMHA 4E4NA 2P2IA 4I24A 4YC8A 2VAGA 4X6QC 2ITWA 3MGYA 4AW0A 3C4FA 4NW6A 4CGAA 4AN3A 4EHZA 1OL5A 2W5BA 2WNTA 4JI9A 4O0UA 5AJQA 4E4XA 5CAPA 5IA2A 4F1MA 4MXXA 3U8WA 4EH7A 5FM3A 5HLWA 1H07A 5DGZA 3FMLA 4QMXA 2OJGA 4GG5A 3RM7A 2O2UA 2UUEA 2C3IB 3BYUA 4USDA 2Y4IB 4GYGA 3BYOA 4IX4A 4C4IA 3UMXA 2PVHA 4QYHA 5CYIA 3DBQA 3F5UA 4F6WA 2OU7A 4M68A 5JMSA 2WQOA 4MH7A 4D1SA 2J0IA 4UMPA 3F82A 3RKBA 2WMTA 4NT4A 5M06A 3H4JA 1YXSA 2OIDA 1QL6A 4ANOA 4Y83A 3KXMA 4YJOA 2HXLA 2IZSA 3QKLA 4A06A 4CMUA 2YJSA 3F2AA 3RK7A 3DNEA 3VVHA 4AN2A 4UWYA 1Y91A 2XBAA 2YEXA 5M4FA 2CCIA 5AUWA 4FL2A 2X81A 1DAWA 4I22A 3FKLA 4FVPA 4UY9A 4BB4A 3LKMA 1XHAA 3UNJA 4AW2A 3G15A 5CS6A 3RPYA 3NUNA 5JN2A 3PFQA 2IW8A 3W8LA 5EI2A 4DGMA 3GC8A 1U5QA 3KA0A 3V01A 2WU7A 3AC4A 4JX3A 5HNGA 1Q99A 4J95A 3R8LA 4N0SA 3TJDA 3UG2A 4BYJA 4HPUE 5FGKA 4EH3A 2OJ9A 2BZIB 3DXQA 4FV8A 4E8AA 3MIYA 4IMYA 4ENYA 4FTUA 4EKLA 5IISA 3C0HA 3VS6A 4FSYA 3LW0A 4FKJA 1Q5KA 4XLVA 3VUTA 3QGWA 1I09A 2E9OA 3I5ZA 4RBLA 4XG9A 3W10A 3VBTA 4C4GA 3FUPA 5EI6A 5GHVA 2C30A 3MY0A 4XRLA 5E8TA 5HVYA 4R77A 3ZM9A 4GVAA 2WOTA 5I4NA 2XIXA 5JQ8A 1PMUA 3EQHA 4JBVA 5H2UA 4ZS4A 4RPVA 3LCOA 5G6VA 3NUUA 3H0YA 4P2KA 3ZEPA 2XNMA 3UOKA 2V7OA 2ZMDA 4O0TA 2ERZE 5ANIA 2C6EA 3BQRA 4RX9A 5ANKA 1NVSA 5F95A 2JEDA 5BVKA 4XX9A 2PUNA 2PUUA 1URWA 3D5VA 2ACXA 4P7EA 5IG1A 3POZA 4FT7A 4G9RA 4EZ5A 3R7IA 5M51A 3MFRA 2QHNA 2QO9A 2PVYA 4U41A 4E73A 4LMUA 5JKGA 1OBGA 3T9TA 3R2YA 3OW3A 4YGAA 5EHOA 5HI2A 4F7LA 4R1VA 2Z02A 5LVLA 5AV0A 1RDQE 4I5MA 4IBMA 4JG8A 5FEEA 4I5PA 3MSSA 4GJ3A 3KY2A 1Q3WA 3WILA 1SVGA 5A4EA 4ZLOA 1J91A 3POOA 2UZDA 3FDNA 2O0UA 3S0OA 5HIBA 4W8EA 4MXZA 2YACA 3SOCA 5K3YA 4MF0A 1PMNA 3MESA 4RIXA 4UALA 4I94A 4BTFA 1W84A 4AGUA 4FKOA 4PV0A 4QYEA 3IOPA 4RIYB 1ATPE 4KKEA 4JR7A 2G2HA 4ZSEA 4AZVA 1PXOA 4MD9E 3QRTA 3VRYA 4MBLA 4GK4A 3PJ8A 4CCBA 3ZDUA 4ZJVA 3PIZA 2Y4IC 2ITNA 3E63A 4KRDA 3ZUTA 3CQEA 4NTTA 3RAWA 4N6YA 2AC3A 5CVHA 2VTMA 4XP0A 3ZXTA 3EYGA 5JQ5A 2YIYA 1E9HA 2W5HA 2XYUA 4XBUA 1Q8YA 2VWIA 4PY1A 2IPXA 4H39A 2EXMA 3KQ7A 3QBNA 2BROA 4NFMA 3QALE 2JDOA 4I4FA 3O8PA 4HGLA 3FXXA 4FV3A 1IRKA 3NLBA 3UC3A 3RMFA 1OPJA 5EYMA 3SHEA 3W2QA 1O6LA 2BKZA 2VRXA 3EFJA 2Z7LA 4TYJA 3T3VA 5CF4A 3TT0A 3WZDA 2UVXA 3Q4ZA 5EH0A 4MXAA 2ETMA 4FK6A 4EQMA 4C61A 5LWMA 4D2TA 2YZLA 4J7BA 3P23A 4CMTA 4EOIA 3JPVA 1OKYA 2OZAA 3UQGA 4DFXE 5BX0A 4FV0A 4MNFA 4QMLA 3U9CA 1KUTA 2CN5A 3QCXA 3FXWA 1UKIA 5EG3A 3ORKA 4EBWA 1Q8TA 4D2RA 1OECA 5CZHA 3VHEA 4EUTA 3QRIA 1H01A 4FTIA 1S9IA 2OFVA 4PPAA 4TW9A 2DYLA 2GCDA 2VTQA 3EWHA 2WIPA 3R1YA 3TCPA 4C62A 3EL7A 3UOHA 2WTJA 2BRMA 3NUAA 4QTBA 1DI9A 5IF1A 3ZZWA 3ETAA 5JGDA 2UW0A 4ALWA 3TL8A 4D4VA 3IK3A 4QP7A 3FKNA 1H26A 3FAAA 4G3GA 3CPCA 3IO7A 4EYMA 2J9MA 2XK3A 2J50A 4NU1A 4FV7A 3SOAA 4BI1A 5FTQA 1UA2A 2WTKB 4TT7A 4U44A 2B52A 2ETRA 2EXEA 3HNGA 4B0GA 2E9VA 4UN0C 5J87A 1GIJA 5CSHA 3EFWA 1JSVA 2E9NA 4WD5A 2H9VA 2GSFA 4EJNA 5I9UA 4G3CA 4C4HA 3FQSA 3QTRA 1NY3A 3CC6A 1OKVA 3UPXA 3M1SA 2YM8A 3MPTA 4R8QA 3COMA 3D83A 3JVRA 5IA5A 2WKMA 5FUTA 1OB3A 4AE6A 3RWQA 3MJ2A 3F7WA 4QMOA 3RP9A 3F3ZA 4BCGA 3GGFA 3LXLA 4BWXA 5BUJA 4L7FA 3D15A 5D41A 4FIJA 3DKCA 3TZMA 5DYJA 3PE1A 2PMOX 3ID6C 3THBA 2Q0BA 5HE1A 1M2PA 4FODA 1VYZA 1Q62A 2VTIA 3PPKA 2QKWB 2GPHA 3ORLA 5DWRA 4O81A 2X9FA 2RF9A 4X2KA 4QMQA 4EONA 5FP5A 3BHYA 2X9EA 2O64A 2RFNA 3DKFA 1PF8A 1NVRA 1QPEA 3SKCA 2R3HA 1PXIA 1R78A 3PA3A 3PWDA 5DT0A 4ANNA 5IA0A 3UVQA 1U4DA 2V62A 2WMBA 3QWJA 4I1ZA 4PPCA 3O2MA 3BCEA 3O8UA 4XS2A 3PA4A 4DH8A 4QQTA 4EH6A 4RJ8A 2J0KA 4YPSA 4H3BA 4A4XA 2J5FA 2PHKA 1VEBA 2WMSA 3KRXA 3PYYA 3NNVA 4UYNA 5CAVA 5HIDA 4YZCA 3FLNC 4H1MA 3HP2A 4C2WA 2OJFE 3KEXA 4ALVA 4FT9A 2IW9A 4KA3A 4WNMA 5KMNA 2HZIA 2FSMX 4XG4A 5D7VA 2A4LA 4WA9A 4U9AA 3ZHPC 5CU0A 5L3AA 1J1CA 2YM3A 1F0QA 3CXWA 4PF4A 4KSQA 4CYIA 3ZXZA 5EOLA 1T45A 5CTPA 1KE9A 3VS5A 3EFKA 4JT3A 4LI5A 2JGZA 3CEKA 4W4YA 4YLKA 4CKIA 2CKPA 4BDFA 5IA1A 1SYKA 5CEMA 1HCKA 2PZ5A 4KIKA 4KSPA 5EM5A 5B2KA 2F7ZE 2X6EA 2XKEA 3TNWA 3FLSA 3CY2A 3IGGA 3R83A 3OD6X 4FSNA 3WF5A 4DEEA 2YAAA 3IONA 1GIIA 3QQKA 4FV5A 5HCYA 1UU9A 5AR4A 2GFSA 4KBAA 1IEPA 2QG7A 4ONAA 5E1EA 2C1AA 3DKOA 2QCSA 4WNPA 4MK0A 4IADA 5C26A 3C0IA 4L6QA 1YWRA 4HVSA 2QR7A 3GCPA 1J1BA 4LMNA 4IAFA 3CGOA 5DT3A 3M11A 4AUAA 5F9EA 4IWOA 3ZFYA 3F61A 3DAEA 5C8KA 1FOTA 4E4MA 4QP3A 2NRUA 5BYYA 2IZTA 3RNIA 1PYEA 3R9HA 5CAQA 5EHLA 3ZRKA 1E1XA 3MB6A 2ZOQA 3GU5A 3UODA 4AN9A 5IQIA 3QU0A 4D9UA 3ET7A 4JIAA 4XV3A 1RQQA 3OXZA 3TZ8A 5KMKA 2CDZA 4N4SA 4ITHA 4AZFA 4BIBA 3CGFA 4D4YA 3EL8A 4M66A 3ZSHA 5L6OA 3HRCA 4QP2A 3H9FA 3DZQA 2HK5A 3MV5A 3E92A 4WUNA 1XH9A 4FKLA 4I0RA 4CKRA 1PRYA 4IB3A 1ZYSA 3NUPA 2GQRA 3PZHA 4XV2A 2A0CX 4ITIA 3ZRMA 5IUHA 2YLEA 4QRCA 2R3MA 4OTGA 5M55A 5FBNC 3P79A 1BYGA 1U5RA 4F64A 5CWZA 1E1VA 3I6UA 2ITVA 3L9NA 3LCDA 3BBTB 3WF8A 4F9BA 4K6ZA 2YISA 4FL3A 4G5PA 4UYAA 1KE8A 3FEGA 4W9XA 3F69A 3RPVA 5A6OA 4YPDA 4BICA 2YM6A 4DFLA 3I60A 4EH4A 5A4LA 2XKCA 3R7YA 4I6QA 3MW1A 3A7IA 2F2UA 3ORIA 4O38A 1MRVA 5JFVA 5B2LA 3DPKA 3ORXA 3AT2A 4MD7E 3ZRLA 3L8SA 4D5HA 3COKA 4E3CA 3UBDA 3QCYA 3HDMA 4KD1A 2GHMA 2J2IB 2BDJA 2FUMA 2WMWA 5J7HA 3QC4A 1M2RA 5H9BA 4NH1A 5ITAA 3LFAA 5HG8A 3I5NA 3PRFA 3I1AA 4WUAA 3W33A 3OT8A 5CEIA 4I6BA 3TXOA 2YFXA 4O0SA 4AP7A 4CFNA 2FSLX 4C02A 1PW2A 3R9NA 3NX8A 4HGTA 4FV4A 4KB8A 5L2WA 1OPLA 5LMKA 2OI4X 4BN1A 2CMWA 4DEHA 3QX4A 4HPTE 4XG6A 4BBFA 3I0QA 2J0MB 2ZV8A 3R00A 1CM8A 5CF5A 3BELA 1LPUA 2OW3A 3BI6A 1SZMA 2ZM1A 5AV2A 4BCHA 4UX9A 3EQCA 3R9DA 2HWPA 2PVFA 4C35A 4TXCA 4ZMFA 5CSVA 4IVAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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