3ZDUA

Crystal structure of the human cdkl3 kinase domain
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
309
structure length
297
Chain Sequence
MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYNKIAMREIKFLKQFHHENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTDIYDDEVATRWYRAPELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPELKAKLLQEAKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Human Cdkl3 Kinase Domain
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE-LIKE 3
total genus 89
structure length 297
sequence length 309
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zduA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zduA01
5CXZA 1JSUA 2EB2A 2B9JA 3GC7A 4IM3A 5EW9A 4UMPA 5IH6A 3EMGA 2YIXA 4JQEA 4M69A 5J7HA 4QMNA 4YJUA 2VO7A 4LGDA 3ZUUA 5FM3A 5JRQA 3FLWA 3TUCA 3KMUA 1ZZ2A 2ITPA 3DDQA 2R3GA 5TT7A 5F4NA 4NKSA 3EN7A 2RFEA 4NIFB 1FVRA 1WBPA 3JUHA 3TZ7A 3DT1A 2J9MA 4BC6A 3DKFA 3IG7A 3CTJA 3L9NA 5EI8A 3VBTA 2GNHA 4JJRA 4L42A 4QP8A 3KK9A 5HO7A 4J53A 3ERKA 4FTQA 4MWIA 5J8IA 3Q2JA 3V6RA 3AC4A 5GJGA 4W4YA 3PY0A 3E3BX 4G3FA 4PNKA 3V8TA 4ANLA 1BKXA 5DR9A 4TRLA 2GQRA 4LGHA 3ZSHA 4GVJA 4DH3A 2OF4A 5C26A 2X2LA 5ACBC 4F1MA 3D7TA 4KKEA 3VS6A 2Z7QA 3GOKA 4HGTA 5HESA 3RP9A 3C4XA 5BMSA 2QURA 4DFNA 4E6AA 3PXRA 4LOOA 3ZEPA 3VBWA 3P4KA 4BGQA 1F5QA 4FKTA 4G2FA 2VRXA 5KMIA 4E4NA 4EH3A 1T46A 4OAUC 4FKWA 2CGXA 3GEQA 4OT6A 3QQLA 4ZK5A 5BVOA 4L3JA 3QKKA 3UIUA 3SOAA 3SX9A 5LXMA 4I5PA 3PPZA 3MTLA 1XH8A 4BKJA 1M2RA 1YWRA 3GCUA 2ZDTA 3MGYA 3DTCA 3Q96A 4FKRA 3UO6A 2F7XE 4PX6A 1LEWA 4BBEA 2WEIA 3TZ8A 4BDCA 3GNIB 4DINA 3MESA 1RW8A 3IONA 2X7FA 3NIEA 4L46A 4OGRA 5EYCA 2PMIA 4R1VA 3GUBA 4GW8A 4WOVA 3Q60A 4E5AX 5IQIA 3P7CA 1P4OA 4HPTE 4GV1A 4IWQA 2C6MA 4GK4A 4I23A 4BICA 4DA5A 2YCFA 3FE3A 5BMMA 5C8MA 5F94A 2BTRA 1PHKA 1JKSA 1PKDA 4DG0E 2HY0A 3GVUA 4RX5A 4TTHB 3I0QA 4QTCA 5C4LA 4BDDA 4E26A 2WXVA 5M4IA 4KIKA 5AP7A 3R73A 3R8VA 4C4HA 1UVRA 2V22A 2YISA 3WE8A 3QBNA 2BRBA 4FKVA 5CSHA 4O0YA 3SKCA 5BVKA 4FNZA 5L6WL 4HCUA 2ZM3A 4QQJA 3BV2A 5CEIA 4RPVA 3PSDA 4CFXA 2Z7RA 3PA4A 1VJYA 3FAAA 3ZO2A 3DV3A 4N57A 3QHRA 3P08A 3FPQA 4I6BA 4DGLC 3TV7A 2GCDA 4EOJA 3SOCA 3RAHA 3BE2A 4PPAA 2JKKA 2WU7A 3HL7A 4FL1A 4YC8A 2HOGA 3DJ5A 2QOIA 2W1DA 4UZDA 2J0KA 2W17A 4QMVA 3HMNA 3ELJA 4XLIA 1ZOGA 4ZAUA 4EUTA 4F0IA 2W5HA 5FXQA 5TO8A 3NUUA 3ZLYA 2EXMA 2VTMA 4O0UA 5HLNA 3BHHA 5HU3A 5KO1A 2OSCA 2H6DA 4IB1A 4O7TA 4O7WA 2IZSA 1B39A 3KN6A 3C4EA 2C3JA 4F6SA 3CBLA 3EQBA 4FZAB 4LQMA 5K4IA 2GHLA 3QUPA 4FI1A 3FL4A 2ETKA 4MNFA 1UA2A 3PJCA 2QD9A 3HV6A 3OBGA 4M69B 4M8TA 1ZAOA 3D5WA 2F49A 3FMMA 2C0IA 3A7IA 3UDBA 3NIZA 3ZO4A 3KVXA 2WOUA 4UMRA 3QLFA 4Y95A 4DN5A 3L8XA 3F2AA 2SRCA 5KMJA 3QTQA 2ITWA 2AC5A 4GMYA 4PPCA 4U3ZA 2VAGA 2WNTA 2UVYA 3A8XA 3E8NA 3TTJA 2BALA 3FUPA 3VS5A 4J8NA 1FGKA 2UW9A 4KRCA 4C4FA 4FIHA 4FOBA 3DQWA 3R8PA 3DJ6A 2CNQA 5M08A 1OM1A 5KBRA 3F3ZA 4GH2A 3R7OA 2Z8CA 4C35A 5DEWA 4PDSA 1XBBA 5DH3A 2VGOA 3OOGA 5IQDA 3RVGA 3DNDA 2LGCA 3G51A 5JSMA 3VC4A 3PXFA 5T3QA 2REIA 5HOAA 2ERZE 4FZFB 1XHAA 4D9UA 1BYGA 1VYWA 3QD2B 3O50A 4L3LA 5CU0A 2Y6OA 4QTAA 5DT3A 3FZPA 2ETRA 4I20A 4J96A 4U43A 4G16A 4RC2A 1WBVA 3HECA 4NW5A 3CC6A 3R71A 4K6ZA 2R3FA 4BDHA 1JOWB 3AT2A 4O7VA 2ETMA 3T9TA 5IMXA 4FV3A 4EH2A 3E64A 4ONAA 2PUNA 1YKRA 3QHWA 5L2TA 4ZZOA 3AMAA 2O65A 2W9ZB 4QD6A 4E5WA 2VX1A 2QO9A 5CU4A 3NYXA 5EYDA 4RVMA 3U4UA 2QKRA 4XBRA 3OXTA 3PG1A 3RZBA 2OIQA 2RKUA 4ANOA 4F7LA 3MPTA 4ZP5A 4O6EA 4E5BA 4X0MA 3FZOA 1DAYA 4KBKA 5HCXA 4BCJA 2XIZA 3EFLA 4D2SA 4E6CA 3MS9A 2HY81 5IA0A 3RNYA 4FKUA 4JG7A 5JGDA 2J50A 1UKIA 2YEXA 1WBOA 2WMSA 4LL0A 4Y85A 4M68A 4JXFA 2IVVA 4AT4A 3SC1A 5I9VA 2W0JA 1QPEA 3Q6WA 2OH4A 3DA6A 1FGIA 4IC7A 4MQ2A 4NM5A 4N70A 4O21A 2XCHA 3KGAA 4LV5A 2OZOA 3CEKA 4UV0A 3ZC6A 3DLZA 3UE4A 4FEXA 2G01A 3Q6UA 3NUNA 1R0EA 4G5JA 5DPVA 2NPQA 4EK4A 4FNWA 4NJ3A 4O2PA 4UY9A 2QU5A 4IX3A 4D2RA 3ZXZA 3O71A 3V51A 3R7GA 2YERA 4EOLA 3DBEA 2W1IA 1ZOEA 3OCGA 4ID7A 4GUBA 3PP0A 3OWLA 4JL9A 2OLCA 5H8GA 3KKVA 3GQLA 4PMTA 4B8LA 4UYNA 4V05A 3F2RA 4CGAA 3A7GA 2OJGA 2HENA 5FP6A 4I4EA 4FUYA 3AC2A 3BZ3A 3GCSA 5CT7A 4XG2A 3CLYA 1HOWA 5HCZA 5KE0A 4FL3A 4EWQA 4QMWA 3L9LA 5DR2A 4PV0A 4BDAA 5AA8A 1V0PA 4FGRA 4MBLA 5LVNA 3QKMA 2NNWB 2JKMA 3WILA 2QOOA 4XLVA 2GMXA 1ZMVA 3GXLA 4O0SA 3UO4A 4FV7A 5CI6A 3ZSGA 3LJ1A 1ZOHA 3TTIA 5IA1A 4A9RA 4FBXA 1GOLA 2WEVA 3A4OX 2BMCA 3O0GA 4XV9A 2ZM1A 3LHJA 4RC3A 1WBWA 3EFKA 2W1EA 4A4XA 3WBLA 4E3CA 2ITZA 4KIQA 2ZB0A 4ZZNA 4AA5A 2B1PA 3HUCA 4WT6A 4NL0A 1OZ1A 3MI9A 1WBNA 3Q32A 4O0WA 5A4LA 4IIRA 3FY2A 2I1MA 2JDRA 1RQQA 4PDOA 5J87A 2DQ7X 3FLZA 5DLSA 3EZRA 4G9RA 4XG4A 3D7ZA 2GQGA 3DB8A 4F6WA 5FTGA 3ANRA 3QYZA 3MFSA 4D5HA 3OWPA 5FG8A 2HYYA 3COHA 3NEWA 3NLBA 4YBKA 4I3ZA 4FV9A 4HOKA 5E8XA 4BCOA 4U41A 3NW5A 5LMKA 4IWOA 2QR7A 4FVRA 5F9EA 1J1BA 1OIUA 1H25A 3NAYA 4MVFA 2HK5A 4TYGA 5DBXA 4MTAA 4ZTSA 3N4VA 2W1FA 4RWJA 2UZDA 4BYJA 1W8CA 4O2ZA 2ZB1A 4C38A 3PPJA 4BN1A 3ZZWA 2F7EE 4CKIA 4WSQA 3D94A 4ZTMA 4FSRA 4C0TA 4W9WA 4ZTHA 2QOCA 1YXXA 2YIQA 2R64A 2XNPA 2WMBA 4I0SA 4BI2A 4BF2A 3FXXA 3TKIA 3WIKA 4LL5A 4E73A 4HVDA 4NFMA 2A27A 3QRKA 4IVDA 1PXJA 2P2HA 4B4LA 2CCIA 4E1ZA 4C2VA 4QYYA 5DOSA 3RHXA 1Y6BA 4FVPA 1OPJA 2WTJA 2WIPA 2VZ6A 2XA4A 2YM7A 3C5IA 4ZJIA 2CN5A 2BIYA 5HGIA 4M97A 4K8AA 5LQFA 3CGOA 2Y4IB 4PL5A 4JOAA 2PZIA 4AGUA 2UZNA 3VW6A 4QMQA 3DXNA 2FSLX 2QKWB 4GKHA 1GY3A 4W9XA 3BHUA 5KHXA 4FG7A 4HYHA 3KRWA 4G34A 3PJ8A 3VF8A 4BCMA 3PVUA 2WFYA 3RPYA 3KF7A 1H1PA 4GYGA 5TR6A 3VS4A 4DGNA 5CAPA 5TKDA 2PVMA 1TVOA 4RT7A 4RIYB 5HD7A 3UQCA 1UNHA 1YW2A 2VTPA 4ITHA 4TL0A 5KMMA 3LQ3A 2X7GA 1ZWSA 5K4JA 2FSTX 3OMVA 1GIIA 1BMKA 3BKBA 4ZY4A 3HLLA 4YURA 2ZV7A 3ORNA 4OTIA 2WQMA 3N51A 5K5NA 1Q8TA 2PHKA 3RM7A 3T3UA 3CS9A 3MFRA 3MH2A 3MFUA 3FLNC 3Q3BA 3QTSA 4FSZA 4QPAA 4W4WA 3LOKA 3PXZA 4Y72A 3ZFMA 3UG2A 4UWYA 2HZ4A 2B53A 4CMOA 3OTVA 4DH8A 3R01A 2XYUA 4HYUA 2W4KA 2WQBA 4DEAA 3SG9A 5CI7A 4TY1A 2IVSA 3TXOA 5GZ9A 5GIOE 3MB7A 4QTDA 5AP1A 1P5EA 4YJOA 4R7HA 4A9SA 1YHVA 4D2PA 3KC3A 2J5EA 2WMUA 3DBQA 4XV1A 2OFUA 2C3IB 4WUAA 4QMPA 3KL8A 5DNRA 3DFAA 4EYJA 3W32A 3FKNA 5I3OA 3ZUTA 2XBAA 3F5UA 2IPXA 2CGWA 4JX7A 2I0YA 4YGAA 4DFUA 4ZY6A 3ENMA 2FYSA 3QCXA 2HXLA 2IW8A 4BBFA 4N6YA 3V5WA 4R5YA 4J98A 4JRNA 3ZUVA 5B2MA 5FTQA 4FSTA 5I9YA 1Q41A 3QU0A 4YZCA 5L6OA 3EZVA 1JNKA 4K18A 3ZDUA 3ZCLA 3ZEWA 3ZO3A 4EOIA 4ZY5A 2WMAA 4YBJA 4AZEA 2CKEA 1YOMA 4E8AA 5EKOA 3FQSA 3KB7A 4HYIA 3C4ZA 3LVPA 4MH7A 1UU8A 2C5VA 4KBAA 2FH9A 4Z16A 3CR0A 5LVOA 4M14A 4QMZA 4PL3A 1CKIA 3AG9A 3BYVA 3TIYA 1H8FA 2WD1A 3FMLA 3TV4A 5E1EA 4IE9A 4KWPA 3UOJA 4D2TA 3OWKA 4R77A 1ZYJA 2XUUA 3QQUA 2BUJA 4UWBA 2RL5A 3F66A 4I24A 5CQWA 2XNEA 3QRTA 3NR9A 3O96A 4Z3VA 2C68A 2Q0NA 4F1OA 1IA9A 4PTEA 4RWIA 3OW4A 4PF4A 4NT4A 4FT9A 3U55A 2JFMA 2VU3A 3NAXA 4AS0A 4ZLZA 4GEOA 2RFSA 5C03A 3KMMA 4XP2A 4EHVA 2E9UA 5JQ8A 5IQBA 3R1YA 4R1YA 4NM3A 2BKKA 3MPAA 2J2IB 5B7VA 3IPHA 2JC6A 1A48A 2WQNA 3WZUA 3SV0A 4D0XA 3P7AA 2VTNA 3SA0A 2X6EA 3VN9A 4DEEA 5IUGA 3GFEA 5HI2A 5AP6A 1V0OA 3HV4A 4DGGA 5HORA 5BVDA 5J1VA 5DT4A 4FEWA 2GHGA 5A4CA 5HNIX 1BLXA 5M07A 2YLFA 3NCGA 1JKKA 3R00A 3AT3A 3VUMA 1UU9A 3K3JA 4D1SA 2BZIB 3LCKA 3Q2MA 3F2NA 4F09A 4EYMA 3NYOA 3UG1A 3C0HA 4K1BA 1IASA 4BI0A 4ZXTA 3BHTA 3UMXA 4DLJA 3IW5A 5I5ZA 4AA0A 3KXHA 4IVAA 1I09A 2BRNA 3DAKA 4RX9A 1H08A 1G8SA 4EBVA 5A54A 4JLCA 3LMIA 4AOIA 4C57A 2YCRA 1GIHA 4YJNA 1H0VA 2G2IA 2WTWA 3OP5A 3W8LA 2OXXA 3NVMB 4DF3A 4X3FA 3U6JA 2O5KA 2KULA 4KB8A 2YAKA 4QNAA 4ACCA 3I6UA 2ITNA 4J71A 3AGLA 5ETAA 1J91A 2CLXA 1ZYSA 3BYOA 3EQHA 4WG5A 4DHFA 3OC1A 5CF6A 5IISA 4JDJA 4A9UA 2IZRA 3U54A 4ASDA 3KCKA 1V0BA 4XRLA 5IPJA 2JKOA 3GT8A 4K0YA 3RI1A 3OD6X 2UZBA 3QCSA 1KOBA 5EM5A 4N6ZA 5CVHA 2O0UA 5GJDA 3DTWA 3W18A 2VO3A 3I7BA 3VQHA 4DH5A 3RHKA 5J7BA 1JLUE 4W8EA 1K3AA 5AAEA 2XK4A 3DKOA 5IQCA 4EI4A 5AV1A 4CFWA 1Q99A 5FRIA 1GAGA 2XNBA 3AC3A 1KE8A 3K54A 2W9FB 3I6WA 4HCTA 4IQ6A 3G6GA 3AD4A 1GZOA 3ZFXA 3WF5A 5I0BA 2XMYA 5H2UA 3QGWA 4XOYA 4DH1A 4FK6A 3SG8A 2CMWA 3MH0A 3NZ0A 3CY2A 3ZZEA 2CPKE 3RPRA 2X1NA 3VJOA 2GU8A 3SW4A 2O2UA 4B7TA 3W2OA 4HNIA 2AYPA 1OVEA 4AOTA 1M52A 2EUFB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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