3ZLWA

Crystal structure of mek1 in complex with fragment 3
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
344
structure length
312
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAANGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMAVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Use of Virtual Screening and Differential Scanning Fluorimetry for the Rapid Identification of Fragments Active Against Mek1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 1 M
total genus 101
structure length 312
sequence length 344
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zlwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zlwA01
5ANGA 3MB7A 4FT9A 5HGIA 4EOIA 4ZY4A 2UW9A 5J1VA 1OM1A 3FBVA 4EK3A 4ZZOA 3C4EA 1ZY4A 1OKYA 1ZMUA 2R2PA 3S95A 4QMNA 1UNHA 4DITA 2W99B 1UWHA 3OMVA 4AZEA 3RZFA 5KBQA 3KB7A 5AAFA 1U4DA 3FLSA 3PIXA 4YHFA 3RPYA 4C36A 2VZ6A 3NYNA 4BDGA 1ZYJA 3BHVA 4QTDA 2GFCA 4WSYA 4G6OA 4BCHA 3OUNB 2HZIA 4JAIA 4CEGA 3DKFA 2BZHB 3BQCA 3PVUA 2PMOX 3MFUA 4IE9A 3P9JA 2Z7RA 4YO6A 5IA0A 3ZZWA 4IAAA 1XKKA 1IG1A 4FKRA 5HCXA 1OPLA 1X8BA 2LAVA 5KMMA 3PVGA 2I1MA 4NM3A 5A4LA 2C4GA 3I7CA 4LOQA 4GEOA 4EORA 3CQWA 4F09A 2IWIA 3DK6A 3GCVA 3UYSA 4K9YA 5FXRA 4LRMA 5K5XA 4I6HA 4NM7A 4ANBA 4EH3A 4F1MA 1Q24A 3DAKA 3MS9A 3OT3A 4C57A 1WBWA 1LR4A 2VWBA 1YXSA 5K5NA 3VC4A 4DT9A 4ALWA 1OBGA 4BZDA 3SQQA 3R63A 2RG5A 3V6SA 3FKLA 3HMIA 5I4NA 5CQUA 4NM5A 4GFGA 3A99A 3FLNC 4YGAA 3C4XA 4IWDA 4L67A 4AGDA 3AOXA 2WMXA 4Z3VA 4BZNA 2ZJWA 3SXFA 2CDZA 2C5YA 3HRFA 4I0TA 3EFKA 3ALNA 2B55A 1OIQA 2H6DA 4FG7A 4RVKA 3MY0A 4YO4A 4D4SA 3NMUF 2PPQA 2G1TA 1FQ1B 3JVSA 2J9MA 3OG7A 4KIOA 3ELJA 1WBTA 3HECA 4MCVA 4AWIA 4PV0A 4EQUA 2E9OA 3E5AA 2ACXA 2AC3A 2QHNA 3AQVA 2JIIA 1P2AA 4ZOGA 3VULA 2GFSA 2X1NA 4CFMA 4B99A 3GGFA 3HV7A 4O0WA 2XIRA 2PMNX 3MY1A 1GJOA 3R01A 3C7QA 4XNEA 1WCCA 4EOKA 1PHKA 2CLQA 3PG3A 1VYWA 3ZDIA 2PVNA 3ZHPC 3WYYA 2BHHA 5I3RA 3HMPA 1YI4A 4G3FA 5ANDA 3ZRKA 4TN6A 3VBWA 3OXTA 1J7IA 1KSWA 4BWXA 3BBWA 3GUBA 4S30A 3RNYA 4IVCA 4ZTSA 1IRKA 3NRMA 3UIUA 2PVLA 4QYFA 4O0VA 2DQ7X 3PE2A 4YJOA 1IAJA 3DOGA 4XJ0A 3VS5A 4IVAA 5CU3A 5L2SA 3F2NA 5IPJA 5IQHA 4G5JA 3CPBA 3KEXA 5C26A 4DEGA 5EHYA 2PTKA 2X7OA 4GJ3A 3SVVA 2I0VA 4A9SA 3LFCA 4I41A 3SOCA 4FKTA 1ZYLA 2VWIA 4IVBA 5CSVA 4XP3A 1G3NA 3NGAA 2JDVA 1JKSA 4EEVA 4NM0A 3S4QA 2WPAA 4C02A 1ATPE 3FMJA 4CT1A 2R7BA 2BAJA 4I5MA 3JXWA 4OT5A 4R6VA 4TYIA 4DH5A 4W9XA 2BFYA 3IGOA 1JKLA 1H8FA 5FD2A 5E91A 4I93A 4AGUA 2WNTA 2A2AA 3D5VA 1WAKA 4FEUA 4GU6A 4RIWA 3ZCLA 1OKWA 4X6QC 1UNGA 4ANMA 2KTYA 1HCLA 4RIYB 5KE0A 5GZAA 1STCE 3R28A 4M14A 3BI6A 5FEQA 2C6TA 4P90A 2PZYA 5GJGA 4ARKA 1DI8A 1H1WA 2B1PA 3PXFA 4KIKB 4BI0A 3DBFA 4H36A 5L6OA 3UBDA 3AMAA 4KKHA 5M51A 3BKBA 1KV2A 2R3NA 3QQFA 2C3JA 4JXFA 4RC3A 5AR3A 4JR7A 3QD0A 3PXKA 3EFWA 3QZFA 3LXKA 4FYNA 2VO0A 4L45A 1WVWA 3ORMA 4FIIA 4HOKA 1TKIA 4LMUA 3POZA 3P86A 5E8TA 3WZUA 4O82A 5BMMA 3TV6A 1EH4A 5EYMA 2QOKA 4GT4A 4FEVA 3DNDA 5M4UA 2GPHA 2C47A 5EW8A 3CKXA 3LW0A 3HDMA 4X7QA 2KULA 5C8KA 4Q5HA 4JS8A 2XNMA 4XV9A 1WBSA 4RG0A 4AFEA 4YTFA 4YNOA 5TT7A 3LKMA 3H0ZA 2BPMA 5FP5A 3SV0A 2OF4A 4AX8A 4CT2A 3PE1A 5KMLA 3OY1A 1RJBA 4C4FA 4W4XA 2LGCA 3U55A 4O0UA 3UE4A 3L9NA 4D2TA 2YCFA 4FL3A 4AAAA 3NLBA 4IAZA 3ODYX 3PY0A 2J5FA 4EH2A 3PYYA 2C6OA 2PULA 3N4VA 3DQWA 3HRBA 3P79A 3EWHA 3VIDA 4FV9A 4A07A 4I21A 3CY3A 5G6VA 2CKEA 3KXNA 2XKEA 5AV3A 1MP8A 2YCSA 3P7BA 3F7ZA 4IWPA 2UUEA 4EOSA 1OPKA 4N6YA 3DU8A 2WU6A 4BICA 1V0PA 5FBNC 3ET7A 5A4QA 4MX9A 2B7AA 3GC9A 3SC1A 4OTRA 3ODZX 4PF4A 4PMTA 4QRCA 3QXOA 3FYJX 5KKRB 1M17A 2ONLA 4MBLA 3RM7A 2YEXA 2QODA 4AF3A 3ZFXA 2FSLX 1UU8A 2WTCA 2YIRA 2XBJA 5AV1A 2FUMA 3VN9A 2J0JA 4QNYA 3BU6A 5HEZA 3AC2A 5A4CA 1ZYSA 2YM6A 2CHLA 1XO2B 3V8WA 5A6NA 2VTTA 4MQ2A 2Y8OA 4AT3A 3BV3A 4OTQA 2GTMA 4FV0A 4WUNA 2RFEA 3NAXA 4BCQA 2VWXA 5BVFA 1Q97A 3L8SA 3F5GA 3NUSA 3Q3BA 3ZSIA 4NIFA 2WFYA 5DEWA 4AS0A 3UMXA 5CTPA 3BX5A 3QA0A 4KWPA 3KXMA 2BRMA 2ITWA 5FM2A 4NJ3A 1OIRA 2VUWA 3QLFA 4FT5A 2R64A 3NS9A 1UA2A 3FYKX 1H01A 2UZVA 4HGTA 4TW9A 4XEYA 4RBLA 4MNEB 4N70A 3NUNA 2GNFA 5GINE 4F70A 4ORKA 3MV5A 2JIVA 3FZOA 1ZOGA 4G3GA 3OC1A 4O38A 4DFBA 4CKRA 5EM8A 3KULA 1R39A 2UZDA 3W33A 3ZBFA 2UVYA 4FTTA 4MD7E 4FSNA 4QMOA 4RX9A 4AA4A 4GK4A 3D14A 3SG8A 4P5ZA 4WIHA 3TV4A 4I92A 4ZS0A 2WTKB 3KVWA 3DBCA 3IDCA 3MJ2A 2ZYBA 1YWRA 2YA9A 4UXLA 2EU9A 2PE1A 4ZEGA 2BIKB 5AUZA 5HG7A 2YM5A 3DJ6A 2PL0A 2X4ZA 3KRRA 3MA3A 5L2QA 3V5WA 4CV8A 3W2RA 4BCOA 2UZUE 2C3KA 2XRWA 4NZWB 2NPQA 2Z8CA 2NNWB 2QR8A 2P55A 3MBLA 4FX3A 4IX6A 5B2MA 4U9AA 4R3CA 4HVDA 1PYEA 2B4SB 3I0QA 4D58A 4EK6A 5M55A 2YLFA 3EH9A 3SD0A 4I4FA 2BRHA 5EOBA 3ETAA 4H39A 4DEIA 3LFEA 5AMNA 5M4CA 1HCKA 2W1HA 3FHRA 4BCNA 4BKYA 2Z2WA 4M8TA 3PJ8A 2W17A 4Q5EA 5TR6A 2RSVA 2XNBA 1M52A 4GRBA 4A9TA 1Z57A 2XA4A 4U3YA 1OL6A 4X2NA 1YXTA 4E4LA 3QHWA 3IS5A 4BDAA 3R9RA 2VNWA 2QD9A 5EM5A 1ZAOA 3TIZA 1YI3A 4M69B 3EFLA 2RL5A 3D7ZA 4QYEA 3F2RA 4RA5A 4D0WA 4MXYA 4L3LA 4EHEA 4EKLA 2P0CA 2O65A 3D7TB 4RQVA 4O7VA 3EB0A 3CGFA 4L6QA 4JRNA 4NTSA 4RJ4A 5FBOA 4C4GA 3LJ1A 5LXMA 2W4KA 4O7TA 4ASEA 2W9FB 5A54A 3A8XA 2VTAA 4B6LA 3CJGA 3DAJA 5HD4A 1ND4A 4RFZA 1H28A 3I1AA 1WBPA 2PZPA 1YDRE 5DH3A 3RAKA 4CCUA 3Q52A 2WQEA 3LOKA 5CT7A 2C1AA 1E1VA 2OZAB 4KKGA 4PPBA 5CNOA 3TKIA 3EQGA 3A7HA 4QTBA 2PMLX 3A60A 3Q32A 5EG3A 5J5SA 5IQBA 5EKNA 3UZPA 2OICA 1XQZA 2ZM4A 2WKMA 3FMHA 3OW3A 1NVQA 2IZSA 4KABA 1OL5A 3C4ZA 3QTZA 4XLVA 1PXLA 1RQQA 4PUZA 5LCKA 5DFPA 3ZLWA 4Z7GA 1OBDA 4TXCA 4HGEA 4TWNA 2XEYA 5D10A 5I3OA 2PVHA 5HG8A 4MHAA 4N0SA 5EOLA 1YQJA 2W1GA 3O0GA 1FINA 5DA3A 3TUBA 3IECA 4O0YA 4WOVA 2GSFA 2CN8A 3FKOA 4QP6A 4GIHA 5HD7A 4ZLYA 4EUUA 1OZ1A 4Y73A 3PVBA 4YZMA 5CAVA 4RJ7A 5CEMA 4UBAA 2DS1A 3UJGA 4QP9A 5K9IA 4PL3A 4ASZA 3UQCA 3WF7A 5D7VA 5E1EA 4ACDA 1G8SA 2H96A 2O63A 3JYAA 3PTGA 4AZTA 2BR1A 4Z16A 4DGGA 4HZRA 3VUTA 3QYZA 2UW8A 4MAOA 4CLIA 3VUMA 4FK3A 4IZAA 1I09A 2YIXA 4CFNA 2ITVA 2PVJA 3FI3A 4QD6A 4FF8A 3RTPA 4ZZMA 5ACBC 4IM3A 4DCEA 4GU9A 3FI2A 3QFVA 2C6DA 3RHKA 4H3PA 5LWMA 5LARA 3R8ZA 5CYIA 4FTRA 1K9AA 5E8VA 1PXPA 2WMUA 5HVYA 3WI6A 3PP1A 2J51A 5KMNA 2R7IA 4O0XA 3HV6A 1E9HA 2NRUA 2BZJA 2OWBA 4HPTE 5AUWA 1GOLA 3QCYA 4WRGA 4YTCA 3FWQA 3THBA 2QHMA 5AM6A 4FKIA 2F57A 3BLRA 2RKUA 2WMTA 3COHA 5BVKA 1YHWA 3ORTA 4DTKA 3DFAA 3LLAA 3R7UA 4OTPA 3NW5A 3HZTA 4LOOA 3QTXA 3Q9YA 3CQEA 5ETCA 3KL8A 2ZM3A 4RMZA 4O84A 5IF1A 4TYJA 1FMKA 3RAWA 4RWKA 5AR7A 5FRIA 4O83A 3ANQA 5CI6A 2ZDUA 3RPVA 3QZGA 5E4HA 4YURA 1Y6AA 3I79A 3VVHA 4O7SA 4L8MA 3HGKA 3V51A 5I5ZA 4GT3A 3F61A 3DCVA 3R8UA 3QQKA 1O6LA 4DINA 4G31A 3I5NA 3IPHA 4LUDA 3U51A 4EK4A 1KE7A 1Z9XA 2HENA 3AC5A 4WNPA 3NAYA 2J2IB 5DN3A 4ZTRA 2HZ4A 2QU6A 3VRYA 2X81A 2PUNA 3ALOA 2G01A 3UNJA 1S9JA 3UYTA 3GCPA 2H34A 3GP0A 2CNUA 3KY2A 1OKZA 2VTOA 3ZUUA 3TI1A 2QOOA 1PF8A 3Q2JA 2ETMA 4F9BA 1BMKA 3N51A 4YLKA 4QMLA 3VUIA 4JLCA 4U79A 4XG2A 3HV4A 3UODA 2J5EA 2W1ZA 5A4EA 2WIHA 5CS6A 4BZOA 4LQMA 3E63A 4CGAA 1SNXA 2WD1A 4JQ7A 3Q60A 4HGLA 3LCSA 4KA3A 1XWSA 2UZBA 2YFXA 4L46A 2XK3A 1UKHA 5LVOA 4DEHA 1M14A 4K11A 4QYGA 3R7IA 3EQDA 4MQ1A 2ZM1A 3FLZA 3VO3A 4FIGA 4Y5HA 4CKIA 3D2KA 5CNNA 5E90A 4O1OA 3ANRA 3W18A 2UW7A 4Y95A 2WTKC 4FKOA 4EL9A 3TNIA 1FVVA 2WXVA 4U41A 4FTLA 4EH6A 4X2JA 4II5A 5JRQA 4F6UA 4G1WA 5DGZA 4OR5A 1OPJA 4D4VA 3AG9A 1XH5A 3FMEA 3AMBA 1Q4LA 3FC2A 3PJ1A 4MD9E 4FNYA 5EYKA 3RALA 5JQ8A 3FI8A 2WGJA 3GXLA 3UG2A 3W2OA 3ZO4A 4HVIA 3FSKA 3ZS5A 3RCJA 5EK7A 3NYXA 3BU3A 4K8AA 2R3OA 3F5XA 2I7QA 3GB2A 4QMWA 4OBQA 2C6IA 3DPKA 4BCMA 4X2FA 2X39A 5C9CA 4FKJA 5HU9A 3OD6X 5LOHA 3G6GA 4MF0A 4M68A 4TWPA 3ZSGA 3FMDA 4F7SA 5F20A 4G9RA 2Q83A 2C6LA 4LGDA 3MFTA 1ZARA 4ANLA 5CXHA 5CVGA 3P78A 2J7TA 3OWPA 3CJFA 3TZ8A 4DT8A 4TNBA 2RFSA 1UVRA 3OCTA 4WKQA 4D4YA 5IQDA 3R73A 4XH6A 3ATSA 3Q4TA 4LV8A 3L8PA 4G34A 4BWPA 4QMUA 3PXZA 4GYGA 5JFSA 1VYZA 1UNLA 2XNGA 2WTWA 3FKNA 3PY1A 5EM6A 4BC6A 3OWJA 1REKA 4YNEA 3LHJA 4RLLA 3LFSA 5AP3A 4FG9A 2BZIB 2F2UA 4V0GA 1JNKA 1G8AA 2WOTA 4NT4A 3ZTXA 2C30A 3ORKA 4L3PA 3WZJA 4AGCA 5J1WA 5CF4A 5HNBA 2PVKA 3EQFA 2BTSA 3G0EA 3OOMA 4G16A 3EQRA 2JBPA 2WO6A 1JKKA 4R78A 1W0XC 4FODA 5IA1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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