3ZO4A

The synthesis and evaluation of diazaspirocyclic protein kinase inhibitors
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Synthesis and evaluation of heteroaryl substituted diazaspirocycles as scaffolds to probe the ATP-binding site of protein kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA
molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 107
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2013-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zo4A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zo4A02
3MH2A 4Z55A 3V5WA 2PE0A 2ZYBA 5A6OA 4LL0A 4MTAA 4BDJA 4M7IA 4D1XA 4XG3A 5A4TA 2B9IA 4ZJIA 1QMZA 2R3LA 3N9XA 5D10A 4I0SA 4UMUA 4IE9A 3LZBA 3RK5A 3GCSA 3FY0A 4AU8A 4RG0A 3Q6WA 1XH9A 2PPQA 5IQBA 4AT3A 5EI8A 4FNYA 5C26A 2YM8A 5J8IA 3W2RA 4QMOA 4CT1A 1FMKA 2GNFA 2IW9A 2HZNA 3C51A 2PE1A 3PJCA 2IVVA 5B7VA 4V0GB 1P5EA 1ZMUA 1L8TA 2Y7JA 3NR9A 4BCMA 2UZTA 5M09A 2BZJA 4O7ZA 3ZM4A 2G1TA 4G3DA 3C9WA 3PTGA 5IQIA 2XNEA 4Q5HA 4HVIA 4RIYB 4QQTA 2EXCX 2JDOA 1JVPP 3LCSA 3BKBA 5AP0A 4GT5A 5JZJA 2W1FA 2YAKA 5F95A 2JAVA 3N4UA 4IVAA 4R7IA 3OD6X 5E91A 3CLYA 2QU5A 4R5YA 4R1YA 3QUPA 1OZ1A 5FBNC 5AUXA 4JBOA 3RK7A 3R7GA 2GNIA 3RWPA 2UZOA 1Q8UA 3M11A 4FT0A 5HIDA 4DAWA 4USFA 2YAAA 3O0GA 2JBOA 2O64A 5CU4A 5HNGA 4BCQA 5DRBA 4IZAA 3RAWA 3A7GA 2ZJWA 4RQVA 4NTSA 3GU5A 3UGCA 2KTYA 5FGKA 4IWQA 2E9UA 2HW7A 2W1EA 1P2AA 3L8VA 5KKRC 2R4BA 2WTJA 4R7BA 3MFUA 3UNZA 3Q6UA 4FTJA 1OITA 1OPJA 2CGWA 4YU2A 2WU7A 4EZ3A 3BQRA 4DINA 4E6QA 5CEOA 4C0TA 3LXPA 3CE3A 3QAME 2QI8A 2OICA 3D7TB 4CFMA 4DTBA 2ITQA 3Q32A 4WNPA 5KBRA 5LMKC 3PZEA 4YURA 2F49A 5GINE 4AF3A 3HMIA 5IMEA 3RZFA 5EG3A 3HDMA 4O27B 1ATPE 4GEOA 4RA5A 4FV1A 5L3AA 3LMIA 1S9JA 3KXGA 3VULA 5IDPA 4DEGA 1GZKA 3OEZA 4I92A 5IA4A 3IGOA 2C6MA 3SXRA 4FT7A 1CDKA 2H6DA 5I9YA 3QQKA 2BFXA 5GIOE 3UJGA 5EDPA 4CZYB 3VF9A 4FV0A 2YM3A 4FSMA 1T46A 4F4PA 3F66A 3TG1A 3TTJA 4USEA 3D2KA 4XOYA 5FDXA 1ZZ2A 3R9OA 4J98A 1QPCA 3FKNA 3FYJX 3GGFA 3VUTA 4BDCA 4WKQA 3BZ3A 3RPYA 4O7RA 5HGIA 4BCFA 4GFOA 1Y6AA 4TTHB 1H07A 2CSNA 5EQPA 2BHEA 4RZVA 2YJRA 5IQAA 1OMWA 2V62A 4WOVA 2XIYA 2IZUA 4IXPA 4YJVA 4YJNA 3VRZA 5JGAA 2QO2A 4EJNA 1U59A 4I4EA 3IECA 5DIAA 3W10A 3ZO1A 3AC2A 4N70A 2ZMDA 1IASA 1MQ4A 2J0JA 3VQUA 3JY9A 3R9DA 5I9ZA 4FTIA 2HY81 1V1KA 3PVWA 3ZLSA 2ITVA 2JFMA 4JG6A 4QQJA 1CTPE 3IK3A 4S34A 4FL3A 1NA7A 3V5LA 2E9PA 4CKJA 1W0XC 4IWDA 4F0IA 3QUEA 4XUFA 4YZDA 5AX3A 3ZU7A 1Q3DA 2J7TA 2QODA 3FWQA 5EHLA 4I93A 4X3FB 4C33A 4ACDA 4BN1A 5HCYA 5LCKA 4DG0E 3SAYA 4FSTA 1PXIA 5KMOA 1GAGA 3VQHA 4MBIA 1NVQA 1XBCA 2XNGA 3FZ1A 3OBJA 3QWJA 4QMXA 3VBVA 2OIBA 3D83A 4E4XA 4FE2A 2R3QA 2VWVA 4IAFA 4D5HA 2XJ1A 1OKZA 2X2KA 2X2MA 3HECA 4LRJA 4YGAA 5AUVA 2Z7LA 5A4LA 2ONLA 5CXZA 3PG1A 3P9JA 4O81A 1H26A 1ZOGA 4JQ8A 5J9LA 4QTEA 4IB1A 4CKRA 2C3LA 4AN3A 4HOKA 4ZXTA 4JBQA 3SX9A 1YOLA 1PRYA 3E3PA 4AZSA 3UNJA 4PNKA 5IA2A 4XV3A 4UWYA 3F5GA 1FGIA 2B55A 3DPKA 5AAFA 3F5PA 4DBNA 5EHOA 2IJMA 2HYYA 5HX8A 3K3IA 4PL3A 3KK8A 3FMNA 4M67A 2JGZA 4ZTNA 4LOQA 5H9BA 3N51A 4EOQA 3HMOA 2C3JA 5JZNA 4LRMA 1OIQA 2YITA 4EOMA 3QTSA 4ACCA 2HZIA 4L01A 2G15A 4LMUA 2J51A 2J4ZA 4EH7A 2XIKA 4CNHA 4EBVA 4Q9ZA 4U42A 3KXXA 1A06A 2RL5A 5DR9A 2GTNA 3ZZEA 3AOXA 2R3JA 2NPQA 3G9NA 3NNVA 4FTQA 5DE2A 2VTQA 3BELA 4O83A 5CT7A 4L6QA 3OOGA 5M4UA 3U6JA 4D4YA 2UW3A 4FKPA 5ETAA 1M52A 4NKAA 4ZTLA 5A9UA 4YZBA 4FVPA 3QC9A 4WSQA 4GCJA 3RVGA 2ETKA 3FLQA 4M84A 4KWPA 1AD5A 3R28A 1WMKA 3DLSA 1YVJA 1XR1A 5DVRA 4PTEA 4DH5A 3DS6A 1NVSA 3PXQA 2QG5A 4KKHA 3O51A 3QBNA 4C37A 5HLNA 4XX9A 2VTOA 4FG8A 4BWKA 3PP0A 5GJDA 1H8FA 4C62A 5KUPA 2QOHA 4RWKA 4FIEA 1BUHA 1LPUA 3Q04A 4EOJA 4YSJA 2PL0A 4FKLA 4RJ6A 5BPYA 5AR8A 1PXKA 2WMAA 3IONA 4MHAA 4YTCA 1LEWA 3T3UA 4WUAA 1IAJA 4LGDA 3C50A 2C69A 3NIZA 4FTOA 4DT8A 3PJ2A 3RAKA 3QD4A 2VO6A 4R78A 4UMPA 3G2FA 4IFGA 2R3FA 4QYGA 3A7FA 3E7VA 2PMLX 3SRVA 4ARKA 4QP2A 5HESA 2Q0BA 4TYEA 5AP2A 2J0MB 2QLQA 4FIIA 4FV6A 4U7ZA 4XG2A 3VBYA 4A9RA 3MVJA 1UU3A 5IQCA 4FV7A 2QOBA 3F6XA 3R2YA 4TYHA 4AFEA 4MQ2A 4RX7A 4AX8A 1K2PA 1PXJA 3R7IA 2ITZA 1E1VA 4HGEA 3G5DA 4G3GA 4H05A 2PVMA 3BRBA 2XK3A 3FYKX 4QMTA 4QMPA 3F7ZA 4H3PA 4BI1A 3R01A 1H25A 3THBA 4HGLA 5E90A 3DAEA 2PZPA 3GVUA 1NXKA 5D7VA 2I40A 2X9EA 4RJ8A 4U80A 3COMA 1J91A 2AC5A 2ONLC 2BFYA 4M13A 4J1RA 4YLJA 3ZRMA 1PYEA 3DB8A 1ERKA 4W8DA 5TOZA 2GFSA 3EN6A 1MRUA 1RW8A 3HMMA 3V5TA 4BZDA 5EW8A 4NM3A 4O0UA 4CQEA 3D5XA 2X9FA 4CMTA 3QD2B 3LM5A 1WBOA 4IBMA 3VC4A 4DFZE 5LWNA 4RIOA 3H9OA 5M4FA 3CKXA 3DT1A 2GU8A 5J9ZA 3TL8A 4QPMA 4Y46A 3UODA 5AWMA 3TT0A 4O2PA 3ZFXA 4BFMA 4G17A 4ZTQA 1M17A 4IWOA 4QNYA 3UIBA 4F9YA 4O7NA 3QRKA 3A99A 4FEUA 2QKRA 3I7BA 5CI7A 1Q97A 4YZMA 4ZY4A 2UZWE 2Y0AA 4I1ZA 4BL1A 3EL7A 1I44A 3SQQA 2JITA 1XQZA 3GQIA 3D9VA 3TEIA 3VUKA 5DBXA 4C7TA 2BR1A 4EH9A 4MWHA 4YJQA 4CT2A 2OSCA 5BUJA 1PXNA 4XV9A 4O1PA 4MXXA 2BTSA 5HE0A 3ZONA 3AMBA 3KC3A 4M14A 2XKDA 3LAUA 3GEQA 4GMYA 4WD5A 4WNKA 2B9HA 2W4JA 2WU6A 3A7IA 1M14A 3HV7A 4QTDA 3UBDA 2WHBA 5DFPA 4YSMA 3FDNA 3GFWA 3FLWA 2UW4A 4FTUA 2E2BA 2P4IA 4RMZA 2VTLA 4HYHA 4D0XA 1PXLA 2EB3A 2UUEA 3POOA 4IX5A 5ETIA 3VW8A 4D2VA 2PVLA 3WF9A 4DLIA 3MH3A 3WZUA 4EOOA 1BYGA 2BIYA 3PSCA 3IO7A 4LRKA 3PXRA 3PSDA 3DGKA 3AD6A 3VWAA 3MPAA 1FPUA 1FINA 3PY1A 3H0YA 3NNWA 4MNEA 3LW0A 3E62A 4Z9LA 1ZOEA 3D5UA 4CEGA 2PSQA 3MVLA 2BTRA 2GS6A 2YFXA 4L52A 4U41A 3P1AA 4C3RA 3MI9A 1KOBA 3E92A 5JRSA 4JR7A 3JXWA 3NUNA 1HOWA 4CFNA 4NYEA 3H30A 4RVTA 5GHVA 3PJ8A 2WMSA 5FWKK 5CVGA 3LFFA 4RX8A 4W4VA 4CSVA 2WXVA 4PTGA 4FOCA 4CMUA 5K5NA 4L43A 4BKJA 3NUUA 5EQYA 3QKKA 4DA5A 3I81A 4P5ZA 2FGIA 3ENMA 3PJ3A 4FEXA 4HCVA 4D1ZA 1J3HA 3ORMA 2E9VA 5L4QA 5DT4A 4FA2A 4ZS4A 1OL6A 3RHKA 1M2RA 1PY5A 2GMXA 2J0IA 3LFCA 4FI1A 2X8EA 3WE8A 3ZCLA 4C34A 4H39A 3R71A 2O63A 4PL4A 4XH6A 4WNOA 4F6WA 4FBXA 3DJ6A 3FC2A 4FUYA 1XH8A 4Z7GA 4UXLA 3OUKA 4HYIA 4YC3A 3ZUTA 5JKGA 4CV8A 3HA8A 3ODZX 3ODYX 4I6BA 3C4CA 2GNHA 3R8MA 4BI2A 3RAHA 4TYJA 4F7LA 2GNGA 5M53A 3F2RA 3E8EA 1CM8A 4L53A 3VS5A 1DM2A 4YO4A 3PDTA 3QTXA 3FZPA 4FSRA 2ZV7A 3RNIA 4H3BA 4EC8A 3FMLA 4ID7A 4XG7A 1M2QA 3VBWA 3D14A 1YOMA 4C8BA 5HO8A 2CGUA 3VJOA 2JKOA 4ACGA 4Z16A 5H8GA 5JMSA 4D28A 4FKUA 4QRCA 4UB7A 4O86A 4JIAA 5F94A 4D2SA 5BVEA 2X6DA 3V6RA 5DMZA 3IG7A 3ZRLA 3MB7A 3BWFA 4FV3A 3LQ5A 3NUYA 3QQJA 3BBTB 4N6ZA 5DT0A 5FP6A 2HW6A 2UW0A 3R73A 4BRXA 3R9RA 4BVUA 3VUDA 1LUFA 5JSMA 3ITZA 3PLSA 5E8YA 4PTCA 3IQ7A 5HHWA 4V04A 3EQPA 4AW2A 4M0YA 4QP7A 4I6HA 5JFSA 3LFAA 4EHEA 4X2GA 1F3MC 2YM7A 4QD6A 2VTNA 2ETMA 3KMUA 4OTIA 1YKRA 3FLSA 3BHUA 1BL6A 4RFYA 5CAPA 3UOJA 3NUAA 3ZZWA 1ZOHA 5GZ8A 4IEBA 3LE6A 4DGOA 3FBVA 3COHA 3EN5A 4LM5A 5ANEA 1H24A 4EK3A 4KBCA 2BAJA 4GYGA 2V22A 3QRTA 4L44A 1L3RE 2A27A 2AUHA 3FZSA 4O0TA 4B8LA 5I0BA 4MVFA 3I79A 4XV2A 4F0FA 5EDRA 1WZYA 3AC3A 3ZTXA 3R9NA 1HCKA 2C47A 4GFGA 3OBGA 4FV2A 1UU8A 1YWRA 2QOFA 3H4JA 3WF5A 2FVDA 3EZRA 5LWMA 3NUSA 4GUEA 3MA3A 5I9VA 4Y72A 3OWJA 2J6MA 3EFWA 3S1HA 4YUQA 5L2WA 4FEWA 2DUVA 4ANOA 4L42A 3FPMA 3P78A 4H1MA 3UTOA 4BZOA 4R3RA 5HZNA 1G8AA 3I5NA 2JIUA 4CMOA 4U81A 5A6NA 1S9IA 1E9HA 3QQLA 4WT6A 2IPXA 3R8UA 4RVKA 1JOWB 3FMKA 4HNFA 5EHYA 4FODA 2XKFA 2WMUA 4ANNA 3F88A 4QP8A 3JVRA 4U9AA 4ACHA 2XB7A 5CALA 1F0QA 3G9LX 2PHKA 3DFCB 3H9RA 3MVMA 2XMYA 2BDFA 3QQHA 3W2PA 3PPKA 3MS9A 5H8BA 3BV3A 5CVFA 2CNVA 2YZAA 4IM2A 4R8QA 3OY1A 4WRSA 2RFSA 4C35A 3VUGA 5JQ5A 4J95A 3IW4A 3LPBA 5DN3A 3BGQA 4FVRA 3WF8A 4A4OA 3NVKI 4RC2A 5I9UA 4LI5A 4D0WA 5M4IA 5AAEA 4PWNA 4IW0A 4FMQA 1Q8YA 3BPRA 4RBLA 5LCJA 3EIDA 4BTFA 3I6UA 1YI3A 3GU4A 3QLFA 4OGRA 5B2LA 3HV5A 3R0TA 4OAVB 2VZ6A 1PKDA 3R7UA 5ICPA 4AN2A 4GK3A 3DNEA 2ZAZA 2ZV2A 5DH3A 4KRDA 3MIYA 4J8MA 3PRIA 3F3WA 4LQMA 5AP1A 4RVLA 3ULIA 4K0YA 4XMOA 3QYZA 5CQUA 2I0EA 2I1MA 2X8DA 3BV2A 2WEVA 4JG8A 1ND4A 1TVOA 3FMHA 5KE0A 1FGKA 4RT7A 2WOUA 4DN5A 2BCJA 3F61A 4IQ6A 4JG7A 5HBJA 3P86A 4M0ZA 5CSWA 1GZ8A 4ENYA 3PRFA 4HYSA 3WZJA 4AACA 4RJ4A 3IW5A 3ZOSA 2V5QA 4FX3A 4UY9A 3TV6A 2OF2A 3O71A 3KCFA 2W05A 5CWZA 4AZTA 4AZEA 2PVYA 3RINA 4FYOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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