3ZS5A

Structural basis for kinase selectivity of three clinical p38alpha inhibitors
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
352
structure length
340
Chain Sequence
HSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray structure of p38 alpha bound to TAK-715: comparison with three classic inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE 14
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 340
sequence length 352
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2011-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zs5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zs5A01
2ZVAA 4D0XA 4L3LA 4QO9A 4FG7A 1UV5A 4L43A 4AGCA 4RX9A 4DCEA 3PFQA 3KMUA 2R3NA 2Y0AA 4O21A 3RNYA 4BIDA 5LMKC 1W83A 4PDSA 2XEYA 4TWCA 4E93A 2XK4A 5CEKA 1KE9A 3PJ3A 1H0WA 3LOKA 4LUDA 4QPAA 1H1RA 4WNKA 5AIRA 4BKZA 2OWBA 2PVRA 2J0JA 3QRTA 5EW8A 4Q9ZA 3HRFA 3K2LA 3ZUVA 4USEA 1GIIA 3BLHA 3U55A 4WSYA 4EOKA 2JAVA 3TV7A 4EH9A 5GNKA 3UODA 4A4LA 1FVTA 4U7ZA 5CEMA 3RALA 5KHWA 2JDRA 3HKOA 2FB8A 3TL8A 4GUEA 4FBXA 3NMUF 5DR9A 1BMKA 2GSFA 4E4XA 4O7NA 3MIAA 1M7QA 3AD6A 2X2KA 3ODYX 1UNGA 2B55A 2CKEA 3MDYA 4YJNA 5B2MA 4CKJA 2R3KA 5CI7A 3E64A 4R7IA 2C0IA 3FUPA 3W16A 5FBOA 3GCUA 5KX8A 2PL0A 4EI4A 4C3PA 4CYIA 4N70A 3IW5A 4GK2A 3PLSA 4PY1A 4C3FA 2X2MA 5FXSA 2B54A 4YSMA 4FZDB 4D9TA 3U9CA 4AOJA 5IMXA 4IB0A 1PMVA 1GZNA 1Q8WA 4DITA 4KIKA 3VHEA 5JQ8A 2QG5A 4Q9SA 2CPKE 5D41A 4XLVA 1JOWB 4M0YA 4EORA 5AP3A 3FXWA 4XP3A 1OECA 4Z7GA 4FEUA 4WD5A 1AQ1A 4IDVA 2XCKA 4PL4A 3VHKA 2XRWA 3PP1A 3OZ6A 5HIBA 5KO1A 5FP5A 1JKTA 4GMYA 3EWHA 3QKLA 4BN1A 4RG0A 3MTLA 2YZAA 1W7HA 3QALE 4KRCA 4E6QA 3G0EA 2XNMA 4N6ZA 2UZEA 3CPBA 3OOMA 4BZNA 4CFUA 4F0GA 3PY1A 2Y9QA 3VS2A 5E1SA 2EB3A 1MUOA 4J1RA 4S33A 4FTIA 2C6IA 4GJ3A 1T45A 5KNJA 5EYCA 5K5XA 4EOOA 1OKZA 3HL7A 1OL5A 4AXAA 3P9JA 3GT8A 5CAOA 3FMMA 4QYYA 2UZLA 3DKCA 3UBDA 3ZZWA 3HMIA 4UMUA 3GC8A 4FKJA 4ASXA 3VS3A 4RZWA 1WVWA 1ZYJA 4FV4A 2W7XA 3R83A 4Y73A 4EWHA 3BI6A 4KBCA 4KKHA 3KXHA 1B39A 4C8BA 4YJOA 1OBGA 3MB6A 4FI1A 1Q97A 4YC8A 2VO3A 2G01A 4IM3A 4X2NA 5L2TA 2WKMA 4DC2A 2FUMA 2J5FA 4TY1A 3VQHA 3OW4A 3AQVA 1KSWA 4IE9A 4Q2AA 2W4OA 4ZMFA 5HBEA 2R3MA 3E93A 3HDNA 1OPJA 2QOQA 5M09A 4YO6A 2ZV2A 4AGUA 3WF8A 4RVMA 4PL3A 4GG5A 1YOJA 3I7CA 4P90A 4DF3A 2H6DA 4UEUA 2GCDA 3KMWA 3GCPA 1ZOHA 2BHEA 4IAKA 2HCKA 4KS7A 4CCUA 5HIDA 4XMOA 4FL3A 5FBNC 3L1SA 3U4UA 1F5QA 3UYSA 1JVPP 4IZ5A 2X6EA 4RFMA 3D2KA 3S4QA 3WZDA 2NRYA 1Q99A 2BTRA 2PE0A 3R63A 4ZJIA 3UG2A 3UNKA 5TR6A 4NW6A 4B8LA 4FEWA 2WEIA 1OITA 1PW2A 2XM9A 3EMGA 2B7AA 4KIQA 3FPQA 3I60A 2VD5A 4H3PA 3UNJA 5CAUA 3QUEA 2G15A 3PIYA 3WE8A 3GCQA 4F1MA 4CV8A 4LOPA 3KXMA 4W8DA 3GGFA 4IAFA 3QTUA 3F3TA 2OJFE 5JZNA 4R5YA 1KE8A 4YZ9A 2E9PA 3BHTA 3FMLA 4MBJA 5A9UA 3JR1A 3C13A 4O86A 4O96A 1XH6A 4O81A 3DBEA 4CEGA 4WHZA 2X4FA 4IX5A 5GJDA 1BKXA 3RINA 2VV9A 2XF0A 4MXAA 5J9LA 4BCPA 3PVGA 5E8VA 4BDCA 2PUNA 4NW5A 1REKA 3K5UA 2JIVA 2OKRA 3EN9A 4JL9A 3UVPA 3P79A 3OWPA 5G6VA 4MNEA 2UZDA 3RHKA 3MSSA 1L3RE 2BAJA 2GU8A 4RLLA 4BDIA 1H1SA 3KF7A 3VBXA 4BDBA 3UOJA 3OEZA 1XH5A 3UDBA 4XV1A 2PMLX 2C5YA 3FHRA 3V6SA 4DGLC 4QP6A 4MXOA 3HDMA 3A60A 1YRPA 3VAPA 3P5KA 4QP7A 5CLPA 5A46A 5L3AA 2GNGA 3QC4A 1Y57A 4DEEA 2JDTA 5EDRA 4UBAA 3NX8A 1XH4A 4RIXB 3GB2A 4HGTA 3BGQA 1PMUA 4I6FA 3ZFXA 3BWJA 3QGYA 3VW8A 4XG8A 4EK3A 5J5SA 3Q32A 5J9YA 4CGAA 4FTCA 1DI9A 4QP9A 5LMBA 5M51A 2VU3A 2V22A 3OVVA 4FV2A 4I4FA 5DLSA 2C6TA 5EI8A 3VO3A 4CMTA 3NYNA 2GPHA 4OLIA 4NCTA 4PPCA 3HV5A 2RFSA 4JR3A 3PY0A 4TYGA 2OI4X 5ANJA 3IDPA 5CAVA 4X7QA 2VO7A 5HE3A 3UG1A 4BC6A 2CGUA 2YCSA 3FLWA 1RW8A 2WMWA 3FQEA 4IFGA 4ZY6A 3Q5IA 3BYUA 3Q9WA 3WE4A 3KRLA 3IPHA 1XWSA 2C3LA 4D0WA 3MTFA 3R22A 4C36A 2Q83A 4D2VA 4C7TA 2UW0A 2VN9A 5HE1A 4WNPA 3TUCA 3ZRKA 3THBA 5IUGA 1M2PA 3DAKA 3R2YA 4GSBA 5EH0A 3GENA 4BZDA 3LXLA 4RIWA 5AUUA 3MY1A 3PTGA 2IW6A 2ACXA 2R3HA 2YIXA 3I81A 3OT3A 1P4OA 3ZYAA 5AAFA 2R0IA 4LI5A 3TNWA 3B2WA 3WOWA 4CTCA 4ANMA 3E62A 2YWVA 4Z7HA 4ID7A 3OBGA 2PZYA 3BLQA 3O2MA 3QBNA 3FMEA 5FM2A 4NFMA 1LEZA 4RIOA 1PY5A 1OIQA 4FT3A 4XX9A 5I9UA 4QP4A 1V0BA 5HHWA 4JR7A 5GHVA 3CS9A 4F64A 1TQPA 2OIBA 4QQCA 2HWPA 4XG3A 4CZTA 4QMPA 4AW0A 4BICA 5CT7A 3W2CA 4O6LA 2GNJA 1XBCA 4QMMA 5IQEA 4YURA 3U51A 5HVYA 5EYMA 4DT8A 3P23A 5HG5A 3CTJA 3OCSA 4DA5A 3VUKA 4JQ7A 3UNZA 1ZLTA 4FKLA 1MP8A 3M1SA 4OTWA 4B9DA 4FC0A 3TZ8A 1OIYA 2BRNA 1UU7A 3O0GA 1ZMUA 3MW1A 5A6OA 4BKJA 4H3QA 1BYGA 4R1VA 4EOMA 2C3JA 1W8CA 2ITUA 3H9OA 2HYYA 2QOOA 2R3FA 3C4WA 1PHKA 3FY2A 4QTBA 4RJ6A 3WF7A 4GV1A 3R8LA 3DBQA 3IDBA 3BV3A 3GU4A 3DJ5A 3LKMA 4I94A 5CF4A 2PYWA 2XS0A 2AUHA 3KFAA 4NFNA 5I5ZA 3EFLA 3SAYA 2X8EA 4AP7A 4CCBA 3KN6A 1R3CA 4CTBA 1H1PA 3F61A 5C8KA 3LQ5A 3LFCA 4E7WA 4W4XA 5HIEA 3KXGA 4M68A 1GIJA 3QTXA 4TYEA 2GFSA 4BCMA 1ATPE 2P2IA 1IA9A 2HIWA 5H8EA 2RFEA 3MH2A 4FKSA 3DK3A 3U9NA 2PVFA 5AAGA 2FSMX 3D7TB 3W2SA 4UWCA 1OKYA 2WU6A 4FT5A 4L68A 3CTQA 3W2RA 4D1SA 3FL5A 2XK8A 3LZBA 2BZKB 4CRSA 4IM2A 3A62A 4BCIA 2UZWE 3BLRA 5K0KA 2X6DA 2F7ZE 3PIZA 5DPVA 3VBVA 4U0IA 3U6JA 1HCKA 4QMXA 3NUSA 3W2QA 5TO8A 2VTJA 3KGAA 3MGYA 3RBWA 4O7TA 3HLLA 4GYIA 4BI2A 4OTPA 4D28A 2GQRA 4N0SA 3PYYA 5HVJA 3ENHA 2A2AA 4OT5A 2QC6A 3PP0A 4L7SA 5BVWA 4O2PA 2C4GA 3DLSA 3PJ8A 4NCTC 4FT0A 3TT0A 2WIHA 3A61A 3MV5A 4AN2A 3FEGA 5FM3A 5CX9A 1SVEA 3ORLA 4Y95A 4JXFA 2QR7A 3G15A 2BRBA 3L9LA 1YXTA 2C6DA 4FKWA 4LMUA 4BGHA 3Q9ZA 4X6RA 4RRVA 5C1QB 5M07A 4RWJA 2BRGA 4U81A 1YI3A 2BDWA 2ZV8A 2HZIA 3ULIA 2QOFA 4O84A 5BYYA 2UW9A 4ACCA 4DFNA 4PUZA 4AF3A 1OL6A 3SOAA 1JQHA 3LFFA 2YDIA 4U5JA 4YJTA 4ONAA 3PJ2A 3ALOA 4AWIA 4L52A 4O38A 3TNIA 3UP2A 1UNHA 5TOZA 4DEIA 5CEOA 2CGVA 3VF9A 4XG4A 3DXPA 1UU8A 1UA2A 3BPRA 3QWKA 2DS1A 2CN8A 4BI1A 1KE7A 4IZAA 2CKQA 2XNEA 4YJVA 3TN8A 4YGAA 3R1SA 4ZS0A 4FIEA 5I9VA 2WMAA 5AWMA 5ANOA 3NUUA 4CG8A 3SG8A 1W98A 4FR4A 2QU5A 3DY7A 2GDOA 4FSMA 4XNEA 2YAAA 3QFVA 5EOBA 1GZKA 3I0QA 3R9NA 2CCHA 3DZOA 2X8IA 5D12A 2R3QA 4WG3A 3SRVB 4BDGA 5CSPA 4RJ5A 1WVXA 4FNXA 2FO0A 4J7BA 1W0XC 4FYNA 2VWWA 3AXWA 4PDOA 1T46A 2UZUE 2WNTA 4IB5A 2WU7A 3GNIB 3H0ZA 3MPMA 3BEGA 5M4FA 1PXNA 5C03A 2CKPA 4DLIA 3B8QA 1AD5A 3H10A 3REPA 3PA4A 2UW3A 3LFSA 3V3VA 2B1PA 4JDJA 3MJ2A 3GFWA 3CKWA 2ITXA 3CY2A 4E8AA 4G5JA 2WXVA 3TJDA 1ZWSA 4U45A 3ZS5A 3UZPA 3BV2A 4TYHB 3HMNA 1LPUA 4QT1A 3OEFX 1PXPA 4C0TA 5KMKA 2WHBA 5AR8A 2C0OA 3TEIA 4QMWA 2BPMA 4B4LA 1IASA 3FKLA 4B7TA 3T3UA 2YN8A 3FYKX 3DQWA 4DEDA 2C6LA 4MX9A 1PXOA 4FG9A 4O27B 4QP8A 3TDVA 2IZTA 1YI4A 4I93A 4NEUA 3RJCA 3LMHA 4RX5A 5A14A 4BY9E 5IQAA 3FC2A 5CNNA 4BHNA 3GFEA 4MD9E 3S1HA 4FK3A 4NKSA 2UZNA 3D5UA 3V5QA 5E92A 1P4FA 4BDDA 3UZRA 1XKKA 5J5TA 1J7IA 4I5CA 4AT3A 2IVVA 4DG2E 4A07A 2RSVA 4V0GA 5C26A 3HNGA 3VWAA 4M67A 1BL6A 3DGKA 1ZYSA 3NCGA 2CN5A 3PZHA 3UYTA 4DGNA 3GC0A 3ACKA 3QD4A 4W9WA 4BR3A 1BI7A 2YIQA 3HMOA 4RJ8A 2J51A 3QXOA 4S32A 3WF6A 3UIMA 3E5AA 3FLZA 3QQHA 4FGBA 4ANOA 2PUPA 3ERKA 4BVUA 3BE2A 5DVRA 2Z2WA 2ITPA 5EHYA 4DHFA 3O7LD 4X2JA 4E6DA 4JRNA 4MKCA 5CAQA 2QQ7A 4RFZA 3BELA 1WBVA 3GU7A 4AA0A 5E7RA 1Z9XA 1HCLA 1V0PA 4QMUA 4IFCA 4MAOA 3TZMA 5JFWA 3PVWA 2WOUA 4MQ2A 4OTDA 4UY9A 4F9BA 3Q5ZA 1RDQE 3DKFA 3BHHA 4O0WA 4ZTNA 3ZRMA 4QYGA 4QTDA 3ZHPC 1S9IA 5ETIA 3EKNA 3TCPA 2YCRA 4O91A 1J1CA 3VS6A 4FGRA 4F6SA 1I44A 3OCBA 3C4EA 4YLKA 3DBFA 5EM7A 1UKHA 3HV6A 4GL9A 2V5QA 4CFWA 1FINA 4G6OA 3MVMA 3NSZA 5HG8A 1OZ1A 5EKNA 4EUTA 4JG8A 4G3EA 2C69A 3KRJA 4XH6A 4O7ZA 3ORXA 3LXPA 5HEZA 2WB8A 4YO4A 3W8QA 3C4XA 3KRXA 4RT7A 2R3PA 2I6LA 3PRIA 2WGJA 4QMZA 3NUYA 3KEXA 1ZMWA 4JG7A 5J1WA 3LFQA 3OCTA 4IWPA 4UYAA 4OGRA 3EQPA 3PRFA 2OW3A 5M44A 3W32A 3OY1A 5AV0A 3E7OA 4W9XA 5AEPA 1VYWA 4EC8A 5HX8A 4U9AA 2P55A 4YHTA 3OOGA 3R0TA 4HCUA 2VO0A 4HZSA 5A3XA 4YLLA 2X81A 3A99A 4OTFA 3QZGA 1CSNA 4FIIA 4AOIA 4BCFA 5FXQA 2XIZA 4U80A 4CLIA 2UV2A 4FVRA 5LMKA 2R3RA 3SD0A 2PHKA 3DBCA 1X8BA 4GU6A 1XH8A 1NY3A 4ZK5A 3OXZA 3P86A 2PVLA 3ZEWA 3DA6A 4RGJA 3R8VA 2YCFA 3COMA 5LWNA 2QVSE 3E8DA 3FZTA 3Q60A 4EYMA 1QL6A 3CKXA 4XHKB 3AG9A 1H27A 2ITTA 2JKMA 5I3OA 3GC9A 2A1AB 1OIRA 5JEBA 2ZAZA 3QX2A 2AC5A 3G33A 3H0YA 3FC1X 2PMNX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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