4A4LA

Crystal structure of polo-like kinase 1 in complex with a 5-(2-amino- pyrimidin-4-yl)-1h-pyrrole inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
290
structure length
290
Chain Sequence
EIPEVLVDPRSRRRYVRGRFLGKGGFAKCFEISDADTKEVFAGKIVPKSLLLKPHQREKMSMEISIHRSLAHQHVVGFHGFFEDNDFVFVVLELCRRRSLLELHKRRKALTEPEARYYLRQIVLGCQYLHRNRVIHRDLKLGNLFLNEDLEVKIGDFGLATKVEYDGERKKTLCGTPNYIAPEVLSKKGHSFEVDVWSIGCIMYTLLVGKPPFETSCLKETYLRIKKNEYSIPKHINPVAASLIQKMLQTDPTARPTINELLNDEFFTSGYIPARLPITCLTIPPRFSIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title 5-(2-Amino-Pyrimidin-4-Yl)-1H-Pyrrole and 2-(2-Amino-Pyrimidin-4-Yl)-1,5,6,7-Tetrahydro-Pyrrolo[3,2-C]Pyridin-4-One Derivatives as New Classes of Selective and Orally Available Polo-Like Kinase 1 Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE PLK1
total genus 81
structure length 290
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.11.21: Polo kinase.
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4a4lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4a4lA01
1UWJA 5FQDC 2WD1A 3HNGA 1J7LA 3EFLA 3UQFA 3LCDA 3SLSA 4HNIA 4BN1A 3Q9WA 1F5QA 5HD4A 2WQEA 5BVWA 2WEIA 2BALA 3C5UA 3UG1A 3I1AA 3E64A 3ZO1A 2AYPA 3QYZA 2JDRA 2JC6A 2V62A 2YITA 4F9CA 3VS4A 2R3QA 1RW8A 2F7XE 5DIAA 3FXZA 4ANSA 3FC2A 4ASZA 4MNFA 5J1WA 4KIPA 5JT2A 4KIKA 3Q32A 3F82A 5K5NA 3KQ7A 5CYIA 3R63A 3ZSHA 5EQEA 4FZ7A 3QBNA 1L8TA 1Q99A 4IJ9A 3COMA 3SXRA 2A19B 3E7VA 4EHVA 1G8SA 4FL1A 4MYGA 1WVXA 2ZAZA 3T9TA 4W8EA 4C4IA 3R1NA 2FSLX 4M14A 4N6YA 2WMRA 4R7HA 4TYIA 2IW6A 1H4LA 3BU5A 4G1WA 4C37A 4U8ZA 5BYZA 3PLSA 4IHPA 4JDIA 2DS1A 3RK7A 3ZDIA 3LFEA 5M4IA 2VGPA 3TACA 4QP6A 3JXWA 3FZSA 4ZLYA 2F9GA 2X39A 3L8VA 5KX8A 1OMWA 5CZIA 4J98A 3L8SA 4EHGA 2VO7A 2GS6A 4M15A 3LFDA 3UOKA 3UPZA 4EK4A 1KOAA 1Q8UA 3NCGA 3MS9A 3TDVA 3LCSA 5LQFA 4RBLA 3VRZA 2OKRA 1M2QA 4MXYA 4DG3E 3BGZA 5AR8A 4R6VA 3G9NA 3H3CA 3IDBA 5ICPA 4UEUA 4JBQA 3ODZX 4NTSA 4CQGA 3UIBA 2QOBA 3RAWA 3OC1A 1Y57A 3RZBA 5CX9A 2GNGA 5ETCA 4PL5A 3NWWA 3QTIA 5ANDA 4BKZA 2P55A 4IM2A 5HX8A 3GFEA 4DLJA 1LR4A 4K8AA 4IB1A 3UG2A 1NY3A 4HYHA 3I5NA 3ITZA 5ANKA 4UN0C 3OWJA 2WTWA 4KSPA 1YI3A 5M44A 5J7HA 3LFAA 3O7LB 4YO6A 2BIKB 4KA3A 3ZZWA 3Q3BA 3TJCA 4PP9A 3ZEWA 4WUAA 2QLUA 3Q6WA 4QYGA 1W0XC 3FMDA 4O7SA 4O7TA 5GZ9A 3F2NA 4O0YA 4O81A 4TNDA 5KO1A 2RIOA 3UMWA 3U9NA 3MWUA 1SYKA 4Y83A 4TTHB 2ZDUA 3C5IA 1PKDA 4OBPA 1JBPE 5CQUA 4FEUA 4MEDA 1E9HA 5EW8A 4FA2A 2WIHA 2ZB1A 3SAYA 1U59A 4D2TA 4L67A 4DGOA 5M09A 4DEIA 3AC2A 4KIQA 3RNYA 4AN3A 5EM5A 3W8LA 2VV9A 3KU2A 3LJ0A 3P86A 3HV7A 5B2MA 3QTWA 4HGTA 4PPAA 4M3QA 3FV8A 3D14A 5CSVA 5FEDA 2Z7RA 3IDCA 2E9PA 3JPVA 1Y6AA 3REPA 5BVFA 5CVGA 3ORNA 3SHEA 4UXLA 3FMNA 5KHWA 5L8LA 3LM5A 3OCBA 4EOMA 3IQ7A 4NUSA 5LVPA 4BZNA 4QTAA 4OTHA 3FXXA 2OIQA 3UGCA 3F7WA 1QMZA 3WF9A 2C3LA 4MXCA 4G2FA 3DCVA 4F64A 3GEQA 2VWYA 4BCMA 4IB0A 1H01A 3MN3A 3RWPA 1EH4A 5H8BA 1SNXA 5DR6A 3C0HA 3FHRA 2Z8CA 2CSNA 3C13A 4PX6A 4WOVA 3IOKA 3BEAA 3JY9A 3OXIA 3UIUA 4UMTA 5AP1A 2BKKA 2J0LA 2BHHA 2VTAA 1R0PA 1PRYA 1GIJA 3NAYA 5KBQA 5E8ZA 3TL8A 4DG0E 3NNVA 4NKSA 3VAPA 3LHJA 3F3ZA 4KWPA 4FKSA 2XK9A 5HU3A 1ATPE 4GT5A 2XEZA 3CPBA 5CF6A 3HYHA 3FEGA 5IQDA 2PMNX 3JUHA 3OXZA 1XQZA 4C36A 5JQ8A 3AC3A 1MRYA 1K9AA 4PNKA 2CNUA 1OPJA 4U43A 2X2KA 4FBXA 4HCUA 4WHZA 3V8TA 4XLIA 4M0ZA 4YJUA 3E63A 5M4UA 5D7AA 2DUVA 3LM0A 4M68A 3EN6A 4QQ5A 4NIFA 3UOJA 1OL5A 4QQTA 3LQ5A 2QLQA 4N4SA 2CLQA 3U9CA 3SX9A 2WMSA 2WZJA 2ZM4A 1UNGA 2QR7A 3DAKA 4XHKB 4XH6A 2A27A 3H30A 3HUBA 4CFMA 3MB6A 5HVYA 5KCVA 2J5FA 3C4EA 2W1DA 4U5JA 3UC3A 5L6WL 3GCVA 4UYNA 2W17A 2ZJWA 3K3IA 5FDPA 2YAKA 1H1RA 3IKAA 3PTGA 4L3PA 1VYZA 3R7OA 1M17A 3Q4UA 5AUZA 2C3IB 4FTAA 3JS2A 2EWAA 1OIRA 3C51A 3QD4A 4G16A 3SKCA 5CSPA 4DTAA 3AG9A 2BKZA 4AA5A 2B7AA 3DTWA 3VBXA 3D5UA 3PIXA 3TI1A 3F3UA 4F6SA 4S34A 4FEXA 4O7ZA 2YM4A 4FUYA 3A7FA 4LRMA 5EI6A 1H1QA 4DGGA 3PE2A 5TR6A 3VUMA 3W2QA 2BRNA 4YLJA 2YN8A 5CU4A 3AC4A 5DLSA 3LVPA 2BRHA 4AF3A 4O22A 2XM9A 2CGUA 3CC6A 5T6KA 3QTQA 2VTNA 3BYOA 4APPA 4C4FA 3NZ0A 2C68A 5DWRA 1WBTA 2E2BA 4TY1A 4BI1A 2C6EA 1DAWA 3QRTA 3QRJA 1KSWA 4A4LA 3A99A 2WKMA 4FTCA 3VS2A 4D0XA 3PPZA 5CAVA 2R3NA 3AOXA 4GJ2A 2W96B 2WMTA 3DZQA 3FPMA 1BUHA 4E6AA 3A4OX 2ITXA 4X3FB 5AWMA 3DGKA 3NW5A 4B4LA 4C62A 1M7QA 4EQUA 4ZZOA 5JSMA 1J7UA 3LFBA 2XEYA 2ITYA 3MSSA 5FXSA 5K5XA 3P9JA 5HI2A 3N4VA 1XH8A 2ZV9A 3D5XA 3G33A 4ERWA 5I4NA 4UZDA 4C35A 2EVAA 3KXXA 3V3VA 4E3CA 1FOTA 2EXMA 2RFEA 3DBEA 4Z7GA 2WNTA 4RVTA 1FGKA 2QQ7A 3MH0A 2WTKB 1SVHA 1BI8A 2QKWB 5A4TA 5EHLA 4G3DA 4IWDA 4DH3A 5HIBA 4HPTE 3B8RA 4FSMA 4ANQA 5BVDA 4G17A 3MI9A 5JKGA 4FL3A 4O0XA 3VBVA 3L9PA 2ETRA 2RSVA 4DFXE 3HRFA 1WMKA 2PZRA 4OTGA 3C50A 2WEVA 3IOPA 5EYKA 4LV8A 3EWHA 4PMMA 4Y5QA 3ROYA 3QTSA 4KKEA 5HOAA 4F65A 4H58A 1LEWA 4DT8A 2OJJA 5FDXA 3V8SA 3PIYA 5LVNA 2H96A 5BYLA 2PZ5A 2GQRA 5IZFA 2UZTA 2W1FA 1R1WA 3ZFMA 2HOGA 3NLBA 2QU5A 4LUEA 4MXOA 4NM0A 4OT6A 4ITIA 4OTDA 5DA3A 1UU3A 1OUKA 5HHWA 3RP9A 4GIIA 2HELA 5AMNA 5M4FA 4JQ7A 4IC7A 4XRLA 2O3PA 3F69A 2RFDA 5HTBA 5KNJA 3GCQA 1V0PA 4D2VA 4QTDA 4XJ0A 5AR3A 4PV0A 4YUQA 5I5ZA 1XO2B 4O0RA 3KC3A 2AUHA 5TO8A 4BF2A 2IO6A 4L52A 3GU4A 2W5HA 1AQ1A 3FKLA 2HWPA 5K0KA 3KXGA 2Y6OA 3R1QA 4XV3A 3SA0A 3HX4A 5F9EA 1SVEA 2WQNA 4PL4A 2ITOA 4G6NA 4G5JA 4AN2A 4GW8A 5HQ0A 2YIWA 3DOGA 4GVJA 3HGKA 3BIZA 3DFAA 4K6ZA 5E8UA 4OTPA 2HK5A 3F88A 2XBJA 5C4KA 2W7XA 3EKKA 2C6TA 2WTJA 1OUYA 5DT3A 4PP7A 2VWBA 1E1VA 4L42A 4AN9A 3HUCA 2UV2A 5G6VA 3PWYA 1TVOA 2VN9A 1WBOA 3GGFA 3P7AA 2BIYA 5JZNA 4O7LA 2JKKA 4L46A 2H6DA 3SOAA 4M8TA 2EB3A 5J5TA 4ASXA 2Y8OA 2CMWA 1F0QA 2ZYBA 4TYEA 1YVJA 3CQUA 3DZOA 2VTQA 4QT1A 2YA9A 4EK8A 3OHTA 1DM2A 2BRBA 4RFYA 2PZIA 3CR0A 3L8XA 4XP3A 3W2PA 4N6ZA 2G9XA 2W9FB 1Z57A 2VUWA 4IBMA 4X2JA 4XEYA 1GIIA 2J7TA 4B7TA 4A9UA 4GK3A 4WO5A 4QYEA 5E8YA 4GIHA 4NTTA 4EJ7A 4C34A 4KKHA 2OFVA 3BBTB 3CD3A 4O83A 4LQMA 4LL0A 3R73A 3WZJA 4GEOA 1PF8A 5FTOA 2XNPA 3TUBA 3M2WA 3BKBA 2J51A 3R2BA 1B38A 4H1MA 2EB2A 3CKWA 3P0MA 4JQEA 1H1PA 2Q0NA 3CSVA 1KE6A 4WSQA 3T8OA 2ZDTA 2PVJA 4NM3A 5T68A 4XG3A 3W33A 1QPCA 2RL5A 3CS9A 4F9BA 1E1XA 1Q8TA 1H27A 3GCPA 2I7QA 3O17A 2C0OA 3NUXA 4BRXA 3P23A 2A0CX 3DBQA 4A9YA 4RVLA 3AGLA 4GK2A 4QMYA 1H8FA 3KEXA 3UQGA 4YPDA 4YHTA 4RIYA 2VTRA 4YU2A 1BL6A 2XIZA 3LCTA 2UW0A 1Q97A 4BTFA 4DFBA 4I23A 1OPKA 3P4KA 3ZDUA 4IC8A 3FYJX 5CT0A 4EOQA 5AP5A 4O84A 5CU2A 4M69B 1JNKA 3CQEA 4AFEA 4EK5A 1KE5A 3QC4A 4YJPA 3NUNA 4E4NA 3DXNA 4EH9A 1H25A 3BE2A 5CVFA 5EK7A 2JLDA 3ATTA 5J5SA 1TKIA 3ACKA 4FNZA 4X6RA 3LOKA 3DNEA 4IZAA 1SNUA 2VTIA 5IH5A 3WZUA 2PWLA 3KRXA 4YTIA 2CGXA 3WZKA 3H9RA 5HX6A 4EQMA 4IH8A 4MD7E 4NK9A 1AGWA 1M7NA 2QG5A 3QTRA 2VO3A 4FKOA 4IX4A 3F6XA 4S31A 4YLLA 5TE0A 3SDJA 4GFGA 2GSFA 3ULIA 5C4LA 3LFCA 3NUSA 1TQPA 4BDBA 3ZXTA 1RDQE 3NUUA 3QGYA 3S1HA 5FTGA 3QTZA 2WMQA 4X3FC 2FUMA 3ZRMA 3EMGA 2OG8A 4QTEA 1H1SA 4OGRA 3V01A 4BDCA 4XYFA 3W2RA 3FSFA 4JDKA 3PPJA 2YLFA 3WZDA 4XBUA 4HVHA 4FT5A 4C3PA 2ITUA 1JOWB 2XKFA 3CTHA 1JSUA 4E8AA 4RVMA 1UU7A 2I0HA 5CAUA 1T46A 3UZRA 4O7YA 4AU8A 4FV4A 2C6LA 3C0GA 1FQ1B 1JWHA 4U97A 4FTUA 2UZUE 1JKKA 5AUTA 4JVGA 3FWQA 4B8MA 4XP0A 5JFVA 5C9CA 1OL1A 3GB2A 5HO7A 4N57A 1PYXA 4JS8A 4OBOA 2J9MA 4EOKA 2BFXA 4E20A 2WIPA 2Y7JA 5EW3A 1CKPA 2UW6A 2YCFA 2QONA 4ID7A 5DPVA 2YABA 4ZTNA 2PULA 1W7HA 2BZJA 2O65A 3OF0A 5IMEA 4HYUA 1OITA 5J1VA 4JNWA 4APCA 3KN6A 4IVCA 3EQRA 4GRBA 5AR4A 3BLHA 3VS3A 3H9OA 4AACA 3JR1A 3RPYA 3A62A 3MFSA 2IJMA 3ODYX 4CEGA 3LMIA 3VUHA 4FKJA 3OUKA 4PDOA 4TWPA 4XCUA 3R7IA 4AOIA 3QXPA 1IG1A 3R8PA 3U4UA 4L43A 2C4GA 2OK1A 4H3BA 3KKVA 4P5QA 3FKNA 4CLJA 1OIUA 2R3LA 4JRVA 3QA8A 2VRXA 4B99A 4ONAA 3AXWA 3UIMA 4ZP5A 3DV3A 4EOIA 5IA4A 5CF4A 3RWQA 4R3PA 3ZC6A 4EWHA 2ETMA 5HEZA 3KRLA 4GCJA 3BHVA 1YDRE 4RWKA 5HG9A 4CSVA 3MTLA 5CU3A 5HE1A 4RX8A 4ZTRA 4FTOA 3A4PA 3EQIA 2Y6MA 2CNQA 4CT1A 5HE2A 5TT7A 4TWOA 3TKHA 3A61A 1LPUA 2XJ1A 4KUJA 3F3VA 3ZRLA 1ZOHA 2VGOA 2WQOA 4M69A 4O86A 2B0QA 3P7CA 4NJDA 4RSSA 3LMHA 3EYGA 3AGMA 3G6GA 5DEYA 1YKRA 1ZYJA 2XVDA 3GQLA 4O6EA 4PL3A 2E9OA 2JIUA 5ANEA 3HA8A 5HICA 5HNBA 4FSYA 3VUKA 4L7FA 1JKLA 4FKQA 4JG8A 3UZPA 5LMKC 5AFVA 4I94A 5HZNA 2UZNA 2BAQA 4UXQA 4E26A 4I6BA 2YCQA 2PE1A 4I0TA 4ZK5A 4A07A 2PYWA 5BVKA 5HESA 5B7VA 5LMBA 3A7GA 3HL7A 2O8YA 4AS0A 1VR2A 2B9FA 2W4KA 2XK3A 4J8NA 3R7VA 5CANA 5DMZA 2EUFB 3QU0A 3ZXZA 1IAJA 5FUTA 2XYNA 4QPAA 5DFPA 2W9ZB 4FKGA 3CY2A 4X2GA 2HENA 2XMYA 4RJ3A 4I0RA 4QTBA 2QC6A 4CTCA 2XIRA 3BWFA 3GP0A 4YURA 5EDRA 2UVYA 4FSNA 4DEGA 2AC3A 3C1XA 4YZ9A 5KBRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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