4AE6A

Structure and function of the human sperm-specific isoform of protein kinase a (pka) catalytic subunit calpha 2
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
339
structure length
319
Chain Sequence
SSDVKEFLAKAKEDFLKKWESPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHKETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Function of the Human Sperm-Specific Isoform of Protein Kinase a (Pka) Catalytic Subunit Calpha2
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA 2
total genus 100
structure length 319
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ae6A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ae6A02
2FSLX 3UOJA 3Q96A 3GNIB 3C5UA 3CBLA 3UC3A 2YERA 4GK3A 5LJJA 4DG0E 5BMSA 2R3LA 3LMGA 4FKRA 2JBPA 4K8AA 5EQYA 3BI6A 2QG5A 4YZBA 4FKGA 1OIYA 1J1BA 4FKVA 2ITYA 2B9HA 4JQEA 3MS9A 1UWHA 3CCNA 4P90A 1TQPA 4EHEA 3MFTA 3GC7A 3OBGA 3FZTA 2JIVA 3RZFA 4BZDA 4NJ3A 3I5ZA 4BI2A 4UZDA 1BKXA 2EU9A 3I7CA 4PL4A 3C7QA 1QPCA 2JKQA 2R3PA 4EOLA 1I09A 3ZLSA 5KNJA 5CF8A 2R9SA 5FTOA 4BHNA 4Z55A 3UIUA 1L3RE 1U46A 2G15A 5CYIA 1K2PA 3HV6A 1CKJA 3P1AA 2YJRA 4U3YA 4QTEA 2V22A 2W96B 3RJCA 2ZVAA 3N4VA 3CEKA 4DFBA 4KSQA 4BGQA 4DH1A 2UZDA 4UZHA 4RG0A 1ZYLA 2HW6A 4FSNA 4QYFA 4HYIA 2Z8CA 4BTMA 3P86A 4E4LA 4GIHA 5D7AA 5I9XA 3S1HA 4Q5HA 4FG8A 3TEIA 4ACGA 4RWJA 3OHTA 2VWZA 2B9JA 3ANQA 5EH0A 3SLSA 3DOGA 5J5TA 3FI2A 4NFMA 2FA2A 2ITQA 2P0CA 2X8EA 4OTHA 3II5A 1ZYDA 3R1YA 4W4XA 4ASXA 3EQRA 3ZC6A 4PP7A 3AGMA 2A19B 3UP2A 5IISA 3S4QA 3VS3A 5F4NA 3U8WA 3K3IA 2RL5A 5HO7A 3TI1A 4YURA 1WMKA 3LJ2A 4FV3A 4G9CA 1I44A 3QTZA 3ZYAA 4PX6A 3N9XA 2R3HA 3GI3A 4H58A 4QP4A 3QCSA 4BGHA 3TACA 3PRFA 4L46A 5CSVA 4BC6A 4R3RA 2WMVA 4EYJA 4IQ6A 5HO8A 3W2CA 2J7TA 2IPXA 2WQMA 4CZUA 3PP0A 4BTKA 4X7QA 3QZIA 4D9UA 4YBJA 3QC4A 2GNIA 3TJDA 4AZTA 4JDKA 2YZAA 2GNHA 3EH9A 3PJ3A 4DH7A 1OIUA 3AD4A 4IBMA 5HE2A 3EWHA 5AWMA 4EH9A 3PP1A 4ZY6A 4U42A 2BZKB 4IWPA 4N4SA 3RM7A 4FT3A 3A4PA 5IQAA 3G0FA 5CSHA 2VO6A 5BYYA 4EQMA 4RIYB 4BDFA 4YJQA 3HKOA 2WO6A 3LFBA 4GJ3A 4GCJA 1ZY5A 4EJNA 1J91A 2QONA 2WKMA 3V04A 5BVDA 2OSCA 4AGWA 5K0KA 2HY81 3OWKA 5AP0A 3U55A 2V55A 2Z60A 4BWPA 2F7ZE 1ZWSA 1PXKA 3R21A 4BDEA 4M0YA 3GC9A 2JKOA 4FKPA 4FKUA 2HWPA 2C5NA 4DH5A 2XRUA 3DBCA 3LJ1A 4G6OA 2CJMA 2PMNX 1GY3A 3QLGA 2ITZA 1LUFA 4NT4A 4OTIA 5DH3A 4ENYA 2QNJA 4TTHB 4AACA 5CAQA 5KE0A 4U80A 4BDHA 3HGKA 3ORNA 1ZYCA 1ZYSA 4RWLA 2XNGA 4AZEA 1KOAA 2E9PA 3BRBA 3Q4TA 3BLRA 4XOYA 3ULZA 5CAPA 2P4IA 4OTDA 4F1MA 5L6OA 3ODYX 4TWPA 2WELA 3LPBA 5CS6A 4IB3A 4I5PA 2I7QA 1OL7A 2WTJA 3U9NA 2YCSA 2FO0A 3E7VA 4F7SA 3MH3A 2Y4PA 2J5EA 3VQHA 3VS4A 5KKRC 4FKSA 3COHA 2GNLA 1OITA 4FKLA 2ZV2A 3LLTA 4A7CA 5DGZA 2OXDA 4AT3A 2Q0BA 4X3FB 4F6UA 5KMIA 3WIGA 2VWYA 3F61A 3V5TA 1BUHA 1OM1A 4X2JA 3LFFA 1U54A 3AC4A 4K1BA 4O86A 2R0UA 4UMRA 4LRMA 4HPUE 4EK5A 2V0DA 5I9YA 1J7IA 4QP9A 3RWQA 4YP8A 1UVRA 5A4TA 5M51A 5CU2A 4ZSEA 3PG1A 4I22A 1WFCA 1Q8WA 4QQCA 1W82A 3WYXA 5EQEA 2PSQA 3KVXA 4UWCA 4TYHA 3BX5A 3D83A 5FDXA 5KUPA 4CGAA 2O3PA 4I5CA 4PDOA 3FMHA 5CWZA 3WZUA 5BUEA 4WSYA 4BCPA 2OFVA 2PE1A 5D10A 5IQCA 5AR5A 5K3YA 3L8PA 3D5XA 5C8NA 1YDRE 4FF8A 4JDIA 3T9IA 4AE9A 4C38A 1NXKA 4JDHA 3S2PA 3MN3A 4ZTRA 1P2AA 5JGBA 5HU9A 1CSNA 3FMMA 3GU8A 2JKMA 2GQGA 2GS2A 2HK5A 2ZDUA 4I6HA 2XK6A 4Z9LA 4RRVA 3VHEA 1UKIA 3KC3A 1J7UA 2QOCA 5C03A 5FTGA 4PWNA 1MQ4A 3DAKA 1ZYJA 3RZBA 1ZY4A 4R5SA 4WBOA 1JKLA 5AP4A 3FZRA 5FGKA 4CT1A 5DYJA 2H34A 2GS7A 2Z7QA 4XV3A 5EOBA 1SVGA 4Q9ZA 1YOJA 2BZJA 3SAYA 1OPJA 4BDDA 3CS9A 1U4DA 2NO3A 3R2BA 5EI8A 5T3QA 4BGGA 5EOLA 3VUGA 5HCYA 2WB8A 2WMUA 4NSTA 3RP9A 2HELA 1OI9A 4M7IA 5HG8A 4AW1A 3QKLA 4CTCA 3DB8A 3UQFA 3E8EA 4FOCA 5K5XA 5CXHA 1SNUA 4F70A 2BFXA 4TWNA 4U7ZA 3TXOA 5M08A 3R63A 4YPDA 4DFZE 4ZS4A 4HCTA 1REJA 4Z7HA 2J51A 3QD4A 1XHAA 2ITVA 4Y5HA 4C4JA 2WTCA 3ACJA 3KULB 4TXCA 3D5UA 2YIWA 4E3CA 3U6IA 3RNYA 3BYOA 3VJOA 2YHVA 3L8SA 4JX7A 2XBAA 3HP2A 4DFNA 4HVGA 2R3FA 3MTFA 3HLLA 3NUNA 2G01A 4FTKA 4ALUA 2OF2A 3R02A 5E8YA 5LMAA 3VUHA 1JLUE 2JDOA 3WIKA 4RFZA 2ZM1A 3PXZA 3R9DA 3DCVA 5ANGA 1NVRA 1YOLA 2YM8A 3TV4A 2W06A 3R22A 3GB2A 1T45A 3MJ2A 3UZTA 2W1IA 2Z02A 2VTTA 2XM9A 4NW5A 3ALNA 4GUEA 4C34A 3V51A 4IWQA 1LP4A 4MXOA 3HV3A 5KMLA 3F2RA 1XBCA 5CEQA 4E1ZA 5TF9A 1IAHA 3OBJA 5B0XA 4O7LA 2YIQA 2E9UA 3OCSA 3KCFA 3MY5A 4MXCA 4NJDA 3ZEWA 3RPSA 3W8QA 4M67A 4NEUA 4DITA 3DGKA 2XJ1A 4O6LA 3UO6A 4IC8A 5J9ZA 2G2IA 2BTSA 4GYGA 4QP3A 2OZOA 3ZCLA 4WKQA 5AEPA 4GFOA 1REKA 1UU9A 3NEWA 5IEXA 3QXOA 3IW6A 4R7IA 4PV0A 4JL9A 5HBEA 3QU0A 3SA0A 3I4BA 2QQ7A 4HYHA 4ZK5A 3OWJA 2HAKA 3ZO1A 4MXYA 3C4XA 4DG2E 3EQHA 5CSXA 2PUPA 4DEIA 3LOKA 3LFAA 3UOHA 4H3BA 5JFSA 1Q8ZA 2BFYA 4WNMA 2QOBA 3DBQA 4DFYA 4E4NA 3IG7A 2V5QA 4O38A 2HIWA 2BMCA 4YTFA 2UZNA 4CEGA 3DBFA 3R8ZA 4FMQA 3UO4A 5FBOA 4WNOA 4G5PA 3W2SA 5LQFA 2FGIA 3WZJA 5JK3A 1UNHA 2GU8A 3U4UA 2YM5A 3QTIA 4F9YA 3E8CA 3FLSA 2B7AA 2R7IA 3ZO4A 1XBBA 3QZGA 4CKJA 1ND4A 1Q61A 4AGCA 4BB4A 1SM2A 3LCKA 3KREA 4ZP5A 5FEDA 3SC1A 4I5HA 4HGSA 3P08A 5CEPA 4FV7A 4UWBA 3ZBFA 4FUXA 1SNXA 4L00A 3DFAA 5DNRA 4CV9A 2A27A 2JEDA 3AMAA 4K11A 4U41A 1PYXA 3P5KA 3IW7A 4IB1A 4IDVA 3PDTA 5ETIA 2GFSA 3KA0A 2NRYA 2YACA 1ZZLA 4L3PA 5J5SA 1LPUA 4NTSA 1FBNA 2R3IA 2I0VA 4HW7A 3ZLXA 5CU6A 4KRCA 4EUUA 4EI4A 4IVAA 4UEUA 5HICA 2XRWA 4BIDA 5KHXA 3G6GA 3NYNA 3ULIA 3W8LA 5CVHA 3BQCA 4ZZMA 3HV5A 3PXQA 3UOKA 3LFEA 1GIJA 3LFSA 1YI4A 4G9RA 4O82A 2ZJWA 3R7EA 2B9IA 5EG3A 2CGWA 3F5UA 4O0WA 5CAOA 2QODA 5M09A 5IA5A 1FGKA 4AA4A 2J0LA 4JG8A 5E8SA 4CG8A 4ALVA 4LFIA 1PXMA 4DN5A 3OS3A 4GU6A 5H2UA 3ATTA 4RVMA 2CDZA 4FICA 4XCUA 4NTTA 3MV5A 3QQUA 2ZB1A 5FM3A 3KXGA 3W16A 2XB7A 5C8KA 4TN6A 4Y85A 3PY0A 4ID7A 3B2WA 4D5HA 3HYHA 2W9FB 4QTBA 1H0WA 5HIDA 4YGAA 3MH0A 3A60A 3TTJA 3NSZA 3O96A 4PPCA 1KE7A 3JYAA 5HVYA 3R8VA 4FGRA 4CKRA 1V0BA 2VTSA 3RPRA 2E2BA 4XX9A 2YIRA 4NH1A 4KABA 3DT1A 2F2UA 4RIXB 4V0GB 3W32A 3R04A 4WUAA 2OW3A 4H36A 5IA4A 3MA3A 3C5IA 2UW9A 3LXPA 3COKA 3U9CA 1A9UA 2IW6A 3WF9A 2JAVA 4UXLA 5FEQA 3ZSIA 5B2MA 2HZ0A 2X8DA 3BCEA 1H26A 2YWPA 4LUEA 3GENA 5A4EA 5KBQA 2PZPA 3VUDA 3V01A 4E4XA 4X0MA 4F64A 3B8QA 3KXXA 4JIKA 2WOTA 4RWIA 4EOSA 3LXLA 2JC6A 3O7LD 4FTLA 5L8LA 4CCBA 5M56A 3SV0A 4DH3A 2YIYA 4KBKA 3NZ0A 5T6KA 2C6IA 3UYTA 2UVZA 2I0EA 4AOIA 1KV2A 5IA3A 1Q3WA 2CGUA 4FTOA 4X2FA 5HG7A 5KZIA 5FQDC 4ANBA 2BRGA 4M14A 5A6NA 3S00A 3F82A 4OTFA 3BHYA 5EYCA 1SMHA 5I3RA 3DKCA 1Q97A 5LMBA 3Q9YA 2OK1A 4PMPA 4JBOA 4WBBB 1M2PA 4BCIA 4ZTHA 1JPAA 2YABA 4G34A 2XJ2A 1TKIA 3R6XA 3TUBA 4D4SA 5AUTA 5A54A 4ANSA 4GIIA 4QYEA 2A0CX 4AUAA 5EKNA 3SDJA 2IWIA 4F7LA 1YHWA 5AV4A 3GU5A 3R1NA 2IZSA 4W4WA 3NCZA 2EUFB 3BYMA 2XA4A 4ZZOA 5DR6A 1M2RA 2OXXA 3UTOA 3KL8A 5AR2A 4E6AA 3R71A 1H01A 4OTWA 5F9EA 2UW7A 3FMKA 2BHEA 2C1AA 5AX3A 2X2KA 2DWBA 5CNNA 3P7BA 2WQNA 3H9FA 2VGPA 4HVSA 2BILB 2WXVA 4CFNA 3TT0A 3R2YA 2PUUA 4FG9A 4DT8A 4QPAA 1IG1A 3F6XA 3PWYA 5DIAA 3AT2A 3FPQA 3EQPA 2W1CA 5LARA 4ZLZA 2W17A 3BLQA 4ZTNA 1JKKA 4PY1A 4KIKA 3IW8A 4OW8A 3JVRA 3L8VA 4IX5A 5DEWA 2WU7A 4MVFA 5IG1A 5IF1A 3WILA 4F1TA 3EL8A 4APPA 1MQBA 2YIXA 4K33A 5M4FA 3LQ3A 4MAOA 2W4KA 3AC3A 3NNXA 4L42A 1G5SA 5CZHA 4YHTA 4V04A 3R8LA 1IR3A 4R5YA 4MNEB 4YNOA 4JJRA 3EMGA 2XZSA 3TIZA 3D0EA 4LMUA 4EC8A 3EFWA 2C5VA 2CGVA 2PZYA 2GQSA 4H3PA 4FV4A 1CKPA 3GT8A 2ERZE 4PTEA 4QT1A 5E7RA 2Y0AA 5E90A 4ZTSA 4C62A 5KHWA 4GKIA 4XG8A 2YN8A 4FYNA 4O0XA 2FB8A 3FLZA 2F2CB 4AAAA 3FZSA 4FKJA 4CMTA 5EHLA 5JT2A 3D94A 4IJPA 4IZ7A 3RK9A 4G31A 4LYNA 4C57A 4UMQA 1YXVA 4WG4A 3UNJA 4EH8A 3E8NA 5BVNA 3LAUA 1NVQA 3AC2A 3R30A 1VR2A 3EN5A 5KMJA 5LVPA 2X9EA 3NS9A 3QUEA 4EOIA 5IA0A 4YO6A 4C4FA 4ZLYA 3GFWA 4GVAA 3OWPA 5DEYA 2IW9A 2XYUA 4BRXA 3F3TA 2WEIA 3A61A 2ZMCA 3ZC5A 3LM0A 4KIPA 3AC8A 4YHJA 2BRNA 5CSWA 2H9VA 4C3RA 5IKWA 5L8KA 3DXNA 2YLEA 4IJ9A 5AMNA 3RAHA 4C36A 3LCTA 3NCGA 2WTIA 2XK9A 4LOQA 4O83A 3BPRA 4AT4A 4EZ3A 2QKWB 3VNTA 3LFQA 2OZAB 2X2MA 4ZJIA 1WBWA 1GNGA 1M52A 4X2NA 3TKIA 3ZUTA 4MCVA 3FI8A 4FUYA 4BDGA 2W0JA 3NYOA 4FTNA 4YBKA 4BCNA 4M69B 2V62A 2RFDA 1Q99A 4QP7A 2NNWB 4WOVA 4QTDA 3PLAE 3RM6A 1UWJA 3ENMA 4H3QA 1R39A 1KV1A 3VBWA 2RFSA 2BAKA 4AF3A 4IACA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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