4AP7A

Crystal structure of c-met kinase domain in complex with 4-((6-(4- fluorophenyl)-(1,2,4)triazolo(4,3-b)(1,2,4)triazin-3-yl)methyl)phenol
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
293
structure length
289
Chain Sequence
HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery of a Novel Class of Exquisitely Selective Mesenchymal-Epithelial Transition Factor (C-met) Protein Kinase Inhibitors and Identification of the Clinical Candidate 2-(4-(1-(Quinolin-6-Ylmethyl)-1H-[1,2, 3]Triazolo[4,5-B]Pyrazin-6-Yl)-1H-Pyrazol-1-Yl)Ethanol (Pf-04217903) for the Treatment of Cancer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 289
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ap7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ap7A01
4FEXA 4J53A 3OS3A 4PMSA 4EH3A 2LGCA 4X21A 4EOMA 3FMHA 2GPHA 3SGCA 2QO7A 4DEDA 3TJCA 1URWA 3MV5A 4P5QA 5E1EA 3BHUA 4EWQA 3LHJA 1YOLA 4NJDA 1B38A 4QO9A 2WPAA 2XKEA 4QQCA 4AFJA 1OL5A 2B7AA 5HBHA 3CR0A 3WF8A 2Y7JA 3BYVA 3GCUA 2OWBA 5H8EA 3THBA 3BU5A 1ZOHA 4DEBA 2YAAA 4BFMA 3ELJA 4HJOA 1XBBA 1I44A 5K4JA 3DDPA 3U55A 2F7ZE 3F5PA 4F6SA 2QOKA 2YCSA 4MD7E 3FDNA 4OR5A 5EM8A 2W5AA 4QD6A 2B54A 3KN6A 4CZUA 5M07A 2YDIA 3NYVA 2PK9A 2PE1A 3T9TA 1DI8A 2OF2A 1BUHA 3LFNA 2CNUA 3L9PA 3R8LA 2ESMA 3QCQA 3MJ1A 3UZTA 3Q4ZA 1Q8TA 3BGPA 5D1JA 4UWBA 3LXKA 3R7EA 5HU9A 2ZMDA 4IW0A 5EM5A 2VV9A 3OWLA 2XIRA 3T3UA 4E4MA 5AEPA 5HD7A 3RCDA 2XNGA 1UNLA 3I5NA 4U97A 4AT5A 3W55A 3F7ZA 5HOAA 1U5QA 1JSVA 2WAJA 4E4XA 2G1TA 3PIYA 4GK3A 4NT4A 4CCBA 4FGBA 5C8NA 3UPZA 5CNNA 5LCJA 1SYKA 3LZBA 4CFUA 2WMWA 4PL4A 3PZEA 2XK4A 3ZHPC 4O21A 5CLPA 3OZ6A 3PP0A 4X3FA 2ACXA 4BDEA 4MNEB 4GT4A 1OBGA 5KKRC 3L9NA 4YZDA 3Q4CA 3OP5A 3F82A 3GU7A 4FOCA 3U8WA 3E87A 2YWVA 3P1AA 5CSXA 5HG8A 4EZ3A 3LIJA 3NGAA 4JQEA 3TUBA 3RWQA 5CF6A 3F5GA 2Q0BA 4FICA 4FZDB 2X81A 3AXWA 4TWOA 5LVMA 3IS5A 4EH4A 4XNEA 5L6WL 2Y4IB 4L3JA 4RX9A 1M2QA 5D9HA 3TTIA 3MYGA 5CEQA 5HD4A 4MX9A 2Z02A 4CCUA 4BDKA 3ORXA 1XHAA 2X4FA 2YIQA 3EN5A 1U4DA 2IWIA 3KF7A 4UMQA 4O82A 2WOTA 2C1AA 4XHKB 3RPVA 4D4YA 2PULA 4FT0A 2PWLA 2V0DA 4YJNA 4DH3A 3NAYA 3SHEA 4BCOA 4E3CA 2CJMA 4ANSA 1VYZA 2R3HA 3V5JA 5TE0A 4XBUA 3Q52A 2WFYA 3DJ6A 4KKGA 3QCYA 5DA3A 5D10A 1CKIA 4FODA 3G9LX 4GYIA 4BIEA 5F4NA 1SMHA 2R5TA 5IEYA 3CSVA 4HVHA 3DOGA 5KE0A 3OCSA 4ITHA 4HGTA 4W4XA 4XG2A 3KK8A 3OOGA 4IWOA 4E6DA 4O91A 2RFDA 3OY3A 4O7SA 3R9DA 1GZ8A 3WZJA 3BKBA 4IEBA 3VNTA 2GNJA 3WYYA 3C4XA 2P55A 3ZS5A 4MNFA 3LKMA 5DIAA 5KMNA 2C68A 3FY2A 4D9TA 2XK9A 2VTQA 5DHJA 4CQEA 3BZ3A 3PJ1A 2JDOA 3P78A 3R83A 2C5NA 4B99A 5A4EA 2X4ZA 3LFAA 2C5YA 5EOLA 2I7QA 5AAFA 3H3CA 3P7CA 4K0YA 3OBGA 3UBDA 2FSTX 4QMLA 4NFMA 2PPQA 3LFQA 1OBDA 4D1ZA 5KHXA 4I4EA 3QRIA 4CFMA 4DFZE 2XM9A 5E4HA 5F94A 5A14A 3TI1A 2F7EE 2IW6A 3A2CA 4GRBA 2REIA 3U87A 2CGVA 1OGUA 2O3PA 5AR2A 4AGCA 2FB8A 3R30A 4CVAA 1Q62A 2JBOA 3ERKA 3JS2A 1YOMA 3M1SA 3Q4UA 2B0QA 3S0OA 3WILA 3NYNA 1MUOA 1LR4A 2R3LA 4JG6A 2QU5A 4GG7A 4FX3A 3TL8A 4TYEA 3IOPA 1YWNA 4G2FA 3CJGA 3OC1A 4FI1A 5LVPA 3EQHA 4AW1A 4EBWA 3FV8A 4X6RA 4NTTA 4L3PA 3R63A 4KWPA 5AR4A 3U4UA 4JOAA 5CZHA 4C4JA 3HDNA 4E4LA 1E1VA 2NNWB 4FKPA 3VUIA 5JQ5A 3Q96A 2QO9A 3JVRA 4HVSA 4J8NA 5B2LA 5E8WA 4BKYA 4YZ9A 4FKSA 5AUTA 3VW8A 4NFNA 4FK3A 4IADA 5BNJA 2Z7LA 4HW7A 2E9OA 3GXLA 3PLSA 4AA4A 1Q5KA 4BCKA 3EL7A 4Y95A 4ONAA 2HZIA 3HMNA 2OI4X 1HCLA 4RPVA 5FWKK 3RHXA 4IWPA 4EHGA 5HX6A 4EUTA 4AN9A 3G51A 3QYWA 5KO1A 1FBNA 5F9EA 1Z9XA 3F3VA 4NKSA 1UWJA 2JBPA 2XA4A 3BWFA 3H4JA 5A6OA 2BIKB 3VS2A 4OTIA 3Q5ZA 3NW6A 5I9UA 4GKIA 4NU1A 3F2AA 5LMKC 2FH9A 5C4LA 3RGFA 4J1RA 4ACGA 3OW4A 4ZTLA 4B7TA 4YJUA 5HTBA 3CQEA 2GHMA 4N6YA 3LMGA 4F7NA 2G01A 4ZTRA 4IHPA 5EQYA 1KE7A 2QLUA 5J8IA 3A61A 3P08A 4FF8A 4BYIA 1XWSA 4J7BA 1FGKA 3P5KA 5AMNA 2JIIA 3RINA 1U54B 4OTRA 1JQHA 5AV3A 1CKJA 3NIZA 2VTLA 3D5UA 3BYMA 3FXZA 3ET7A 4QP2A 2NRUA 2BILB 4IX6A 1YWRA 5M53A 4JAIA 2GHLA 4FUXA 3GI3A 4FKWA 3DK7A 3TCPA 5CVHA 4F7LA 3VQHA 5JT2A 4JR3A 4L7FA 3VBXA 5KMKA 4RC4A 4FSYA 1XR1A 3CKXA 3R8MA 4XUFA 3UG2A 5IQIA 2I6LA 3ETAA 2QOFA 3EFLA 4X2FA 4NUSA 4RGJA 2R3JA 5D41A 3ZZEA 2YM5A 5H3QA 1ZARA 3C13A 3HYHA 4PTGA 2ZVAA 4EEVA 1OL2A 5FG8A 3QTWA 5AX9A 4F9CA 4OBQA 5H8GA 4JVGA 3VBWA 3KRJA 1PXKA 3O2MA 4WHZA 1MRYA 3NUSA 5HICA 4B8MA 2XNEA 4BHZA 3I7CA 2UW4A 4LOQA 4OTHA 5EOBA 2DWBA 4NK9A 3PPZA 1S9IA 2YDKA 3E92A 3MH3A 2B55A 2VX3A 1A06A 4DH5A 2JIUA 1KV1A 5LMAA 2XK7A 4IDTA 3SXFA 4E6QA 4DYMA 2R3GA 3VHEA 1G8AA 3EQBA 2Y9QA 3AD6A 4YUQA 2GDOA 2VZ6A 4IB0A 4I94A 4C33A 4D2RA 5EQPA 2X6EA 4D4RA 3B8RA 4RMZA 3RMFA 3A62A 3VC4A 4BTFA 2FSLX 3R9OA 4QMWA 5J7HA 3ZH8A 1E9HA 3QZGA 1OM1A 2XNNA 5AIKA 3VS4A 2H8HA 3MGYA 3QQFA 4XV2A 3ZEPA 3MH1A 2ZM1A 3MFSA 3NUXA 2IVUA 3H9OA 5G1XA 4C34A 3H0ZA 4RIYB 1TQPA 3AGLA 3GBZA 3RZBA 3IW6A 1GJOA 3BEAA 4CMOA 3ZLWA 2BTSA 4FR4A 3MSSA 3UOLA 1BMKA 3QGWA 4O0WA 5IZFA 4F1MA 1DAWA 2B9HA 4FSUA 4ANQA 1PXNA 1Y8YA 4IAKA 4RIXA 3II5A 4NJ3A 2JFLA 5E8XA 2OJIA 5KZ0A 3ZUUA 1WBTA 4AQCA 5FXRA 3NX8A 2CLQA 4BRXA 4DFXE 5KBQA 4F6WA 4YZNA 3B2WA 1Q3DA 5T3QA 2HZ4A 4LV5A 4DHFA 3IW5A 4GS6A 4GUEA 3ZC5A 5HTIA 3ZU7A 1GIJA 3FWQA 3FJQE 4BTMA 3KFAA 4WRSA 3AC3A 4HYSA 5AV1A 5CEKA 4Z16A 3HAVA 4DFYA 4F64A 4E20A 3MWUA 5AP4A 5E9EA 3N51A 2R3KA 2HIWA 3NPCA 4UMRA 5AM6A 3MS9A 3OTVA 5A4QA 2B9FA 2OW3A 4R3RA 3FHIA 3HMPA 1P4FA 1CDKA 5GHVA 4MEDA 3U51A 5IEVA 4BCMA 3CEKA 3F3UA 3V5LA 3HVCA 4DGGA 4F0FA 1F3MC 4ANOA 3BHHA 2PVHA 4L8MA 4B0GA 4C8BA 3C4EA 3RAIA 2A19B 2AYPA 5GIOE 3FQEA 3UO6A 2YIRA 4XYFA 4YMJA 3BCEA 3I7BA 1RW8A 2JKOA 4HOKA 3JR1A 3DB6A 2WU7A 3VBYA 4C37A 3DFCB 4BDHA 3PY3A 4L52A 2RG6A 4NM5A 4I5HA 3W8QA 4E8AA 5BMSA 2J0KA 4FV5A 5A4CA 1IAHA 3FQHA 3E3BX 4D2SA 4RJ6A 4J96A 3Q6WA 4QYYA 3TNPC 2A27A 3VULA 1Q99A 4JBOA 3C0IA 1H1QA 5BX0A 3CD8A 4BIDA 3EH9A 5DN3A 3ZO2A 5J5SA 3KMUA 5GNKA 1GZOA 2F4JA 3NS9A 3LQ3A 3ZZWA 5IMXA 2BRNA 3NCZA 2ITPA 4F6UA 2F2CB 3O96A 2WMSA 4O0RA 4JI9A 4ZZOA 5HX8A 5LOHA 4JXFA 1LEZA 1QPJA 2UZBA 4IWDA 1ATPE 4C3PA 4JLCA 4FNXA 3L8PA 1UA2A 4U3ZA 3BYOA 4XMOA 3PJ2A 3LLAA 4BC6A 4GJ3A 3FAAA 5HE1A 4XOZA 4XV1A 2HELA 4B8LA 1ERKA 3LCDA 3R9NA 5KCVA 4TKSA 3E88A 5B2MA 4RSSA 3CD3A 2XZSA 2IZSA 3QZFA 4FTJA 4PNKA 3LQ5A 2BAJA 2PZRA 5L2SA 3ODYX 1U54A 2IZTA 3I4BA 1O6KA 4UXLA 3COKA 3SQQA 2BIYA 3FYKX 4KKEA 5LMKA 2RIOA 4LQMA 4C57A 3VUDA 3NNVA 2HWPA 3VBQA 4B6LA 3BYSA 4P4CA 2RF9A 3R7UA 3LXNA 4JDHA 3UIUA 3LMHA 2CGWA 3KXGA 4X7QA 1OUYA 1QL6A 4Y73A 2OIBA 2HW7A 4FGRA 4XG6A 4IXPA 4BDJA 3DXPA 3BHYA 3RCJA 5CI7A 3W32A 2BRHA 1AQ1A 1M52A 1NXKA 1L3RE 3IONA 3Q60A 2X9EA 1VR2A 3NYXA 2VO7A 4Q9SA 3W2CA 4E4NA 2YITA 2C5XA 2R4BA 2V5QA 3KC3A 4QTDA 4ORKA 5JZNA 3TN8A 4FZ7A 4DG0E 1JPAA 4S32A 3VS7A 5CF8A 4WSYA 2ZB1A 4ZEGA 2J9MA 3U4WA 3HL7A 4ERKA 1GZKA 2OJJA 2R9SA 2F2UA 4NW6A 2ZDUA 3EN4A 2WIPA 3VRZA 4O81A 3POOA 5EKNA 1JWHA 4DT9A 4I92A 2BZKB 3F61A 2IZUA 5IPJA 1DM2A 4GFGA 4IC7A 2C0OA 5AR5A 4HVIA 4ITIA 2HXQA 2X1NA 2OXXA 4Z3VA 3QQLA 2P0CA 2PVNA 3G5DA 1H25A 3G90X 1U46A 4U43A 3BQRA 4R1VA 5BVEA 5GZ8A 4ZZMA 4YURA 4PWNA 4G3CA 4YNEA 3RM6A 5AR8A 4ZK5A 3NUNA 3P86A 4QPMA 2CLXA 4MXZA 5FP5A 3NWWA 2CHLA 1YXUA 5FEEA 4CZTA 4EOIA 4UB7A 2RFNA 3GC7A 4M66A 2O2UA 3HKOA 2UW3A 3FZ1A 1WBVA 4UN0C 1ZYDA 2HYYA 3MVMA 3FC2A 3P7BA 4LMNA 4WD5A 4ZTSA 4PDSA 5J9YA 2UVYA 4W8DA 4I24A 3PIZA 2OJFE 4JL9A 4RZWA 2WMAA 4D1XA 3D4QA 4K1BA 1YVJA 2ETKA 2AC3A 3QKKA 3UVRA 4ANLA 1OITA 4D0XA 4C36A 3FPMA 3PXQA 3I6UA 1DS5A 5AA9A 5CVFA 2BMCA 5CAQA 4PP7A 3U6IA 2YCQA 4PTCA 3ORTA 3CQWA 3DK3A 3DTCA 4TW9A 5JGDA 4O7VA 3QZHA 4M8TA 2GTNA 3O0GA 3LFDA 3MPTA 3F88A 3FLNC 5EM6A 3V5QA 2J90A 4I22A 4GSBA 4D2PA 3DU8A 1Q61A 4E5AX 5CALA 3MN3A 3BYUA 3R8UA 4YJRA 4ZJVA 2CN8A 3C4FA 1G3NA 3D5VA 4V05A 5C8MA 1LP4A 4U80A 3GP0A 3IW4A 5DR6A 5C8KA 5HNIX 3DT1A 3LXLA 4U40A 3O23A 5ETCA 3L1SA 3HLLA 2VTRA 3D5XA 3KULA 1KWPA 4NKAA 2Z60A 4TN6A 5ACBC 5E8UA 4E93A 1PXLA 3FKNA 4MAOA 1XH9A 3FZOA 2OFVA 4JNWA 5I3OA 4I6HA 5HE3A 1J7UA 2NO3A 2GNHA 4EL9A 4FK6A 4HCUA 2JITA 2UZOA 4S2ZA 1P14A 4OT6A 3CP9A 3NNUA 5ANDA 3BU6A 4OBPA 4BZNA 4DG2E 4UX9A 4FV9A 4X0MA 5LVOA 2PZPA 2ONLC 3IGOA 3EN6A 3EWHA 3VJOA 5C9CA 3QD4A 5HO8A 4U41A 2UW7A 4KNBA 5EM7A 4GFOA 2H6DA 3DPKA 4KSPA 4OW8A 4YC8A 5EKOA 4ASDA 3PE1A 2PU8A 4Z9LA 2CNQA 4G17A 2YM6A 2F57A 4K9YA 4L6QA 4MHAA 1Y8GA 2VWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2UZU E;  5IH5 A;  2IPX A;  5CEP A;  4MD9 E;  5DR9 A;  4MWI A;  5H2U A;  5A4T A;  2BHE A;  2B52 A;  3FMN A;  5CU6 A;  4IAI A;  2GQR A;  1M14 A;  2ITV A;  4OTW A;  4IX3 A;  3ZDU A;  4CD0 A;  3I0Q A;  4EH5 A;  4QP6 A;  4TTH B;  5K5N A;  1J1C A;  2GFC A;  2QLQ A;  3E63 A;  4FT9 A;  2JLD A;  2R3P A;  4IAN A;  3MVH A;  3SKC A;  1FGI A;  3M11 A;  2XF0 A;  4XP0 A;  3AMY A;  1H24 A;  3QLG A;  3SG8 A;  3D14 A;  2VTT A;  3D7Z A;  4OTF A;  2VU3 A;  3DKF A;  4WNP A;  3HAM A;  3G0E A;  1OIQ A;  1U59 A;  4LM5 A;  3WAR A;  1KE9 A;  1REJ A;  2V7O A;  3MA3 A;  4HYI A;  4QYE A;  1PHK A;  5ANK A;  5EI6 A;  4YU2 A;  3TZ8 A;  2HZ0 A;  2Z8C A;  3SOC A;  2W1G A;  1FMK A;  4F65 A;  3UIM A;  4XRJ A;  2XCK A;  4JBP A;  5HEZ A;  3PA3 A;  4ZAU A;  3QQU A;  1OPJ A;  3FL4 A;  2NRY A;  4LYN A;  2ETR A;  3C4C A;  3QRU A;  5CS6 A;  4FL2 A;  4UMT A;  4FUY A;  5CSV A;  2VWV A;  4CSV A;  4J52 A;  2YCF A;  4OGR A;  2KTY A;  4CNH A;  2C6O A;  4X2G A;  4DN5 A;  5K9I A;  4FTC A;  4BL1 A;  4GU6 A;  4LRJ A;  1O6L A;  3E93 A;  2XNB A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FEX A;  4J53 A;  3OS3 A;  4PMS A;  4EH3 A;  2LGC A;  4X21 A;  4EOM A;  3FMH A;  2GPH A;  3SGC A;  2QO7 A;  4DED A;  3TJC A;  1URW A;  3MV5 A;  4P5Q A;  5E1E A;  3BHU A;  4EWQ A;  3LHJ A;  1YOL A;  4NJD A;  1B38 A;  1W2D A;  4QO9 A;  2WPA A;  2XKE A;  4QQC A;  4AFJ A;  1OL5 A;  2B7A A;  5HBH A;  3CR0 A;  3WF8 A;  2Y7J A;  3BYV A;  3GCU A;  2OWB A;  5H8E A;  3THB A;  3BU5 A;  1ZOH A;  4DEB A;  2YAA A;  4BFM A;  3ELJ A;  4HJO A;  1XBB A;  1I44 A;  5K4J A;  3DDP A;  3U55 A;  2F7Z E;  3F5P A;  4F6S A;  2QOK A;  2YCS A;  4MD7 E;  3FDN A;  4OR5 A;  5EM8 A;  2W5A A;  4QD6 A;  2B54 A;  3KN6 A;  4CZU A;  5M07 A;  2YDI A;  3NYV A;  2PK9 A;  2PE1 A;  3T9T A;  1DI8 A;  2OF2 A;  1BUH A;  3LFN A;  2CNU A;  3L9P A;  3R8L A;  2ESM A;  3QCQ A;  3MJ1 A;  3UZT A;  3Q4Z A;  1Q8T A;  3BGP A;  5D1J A;  4UWB A;  3LXK A;  3R7E A;  5HU9 A;  2ZMD A;  4IW0 A;  5EM5 A;  2VV9 A;  3OWL A;  2XIR A;  3T3U A;  4E4M A;  5AEP A;  5HD7 A;  3RCD A;  2XNG A;  1UNL A;  3I5N A;  4U97 A;  4AT5 A;  3W55 A;  3F7Z A;  5HOA A;  1U5Q A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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