4ASEA

Crystal structure of vegfr2 (juxtamembrane and kinase domains) in complex with tivozanib (av-951)
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
312
structure length
305
Chain Sequence
DPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANA
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular Conformations, Interactions, and Properties Associated with Drug Efficiency and Clinical Performance Among Vegfr Tk Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 305
sequence length 312
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4aseA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4aseA01
3NEWA 4M12A 3F5UA 4AT4A 4RJ5A 5L2QA 4U8ZA 5EM7A 4K8AA 4FX3A 3RZFA 2O3PA 4KBCA 4XYFA 2OJFE 5IG1A 4GG7A 4F9WA 1UNLA 3MY1A 3R8LA 3PVWA 3FSKA 3IDBA 4NTSA 2WU6A 4GS6A 4QOXA 3VS0A 2I7QA 4GL9A 3DAJA 3HRFA 2C6OA 3UVRA 3OXTA 4C34A 4GG5A 4LUEA 4U9AA 3ZM4A 4BDAA 3ZHPC 2Y7JA 1XBBA 4U3YA 4DLIA 4BVUA 3FL5A 4FV3A 4DEHA 2BR1A 4KIKB 3R9RA 5DNRA 1Q8WA 5JZNA 1W98A 3QWJA 3SW7A 4ANBA 4QP8A 5J9ZA 5KCVA 2CNQA 3LFCA 2WQNA 2W0JA 5CWZA 3BE9A 2ZM4A 4F1OA 2J7TA 5AMNA 4F63A 1RDQE 4YTCA 2WQBA 4EK4A 4FEXA 4DE4A 4HVSA 4BI2A 3IPHA 2BZHB 1OL7A 1U5RA 3BYOA 2JBOA 2W1HA 3UQFA 5M51A 4BTMA 1K9AA 4JR7A 3VBTA 5I3OA 4FKIA 3CQEA 1KE5A 3LE6A 2EXCX 1NA7A 2GTNA 2HCKA 5ANIA 4EHEA 3ZBXA 4BYJA 2PE2A 3OCGA 5HCYA 2O0UA 4EH9A 1OKZA 4XRJA 1STCE 4XV9A 2EVAA 4A7CA 4RWIA 4A07A 4APCA 2RFSA 3AD5A 3FI3A 3F2NA 3FPMA 4LFIA 3TG1A 3W2PA 3UP7A 2JFMA 2QOKA 1XR1A 4U79A 3RAHA 1E1XA 4JBPA 2V7OA 3VQHA 4FA2A 1YHSA 3E8CA 3ZLYA 4JBVA 2QO2A 3KF4A 3B8QA 3OY1A 4QP6A 4F1TA 3KRRA 1ZY5A 2J9MA 2PWLA 5IA4A 4DT9A 5C4LA 5ETFA 3UZPA 4FG8A 4PDOA 4KRDA 3FYKX 4LUDA 4ZTNA 4EK8A 4I6BA 5C4KA 4IJPA 3MH1A 2PZPA 5E1EA 4B0GA 3ZLXA 2C0TA 3EQDA 1CDKA 1MRUA 2WO6A 4TZRA 5JK3A 4XV1A 4DFLA 4X3FB 4XG2A 2QOLA 3QHRA 2R7IA 3QQGA 4EK5A 2IJMA 5JKGA 4EH5A 5M4UA 2J0MB 3DLSA 4F6SA 5AA8A 2I40A 2X2MA 5L2WA 5EI6A 4XG7A 2OJIA 1P2AA 3FMHA 4HNIA 4IMYA 4UZDA 3MIAA 5KKRC 4GYIA 5F9EA 3QZFA 4GFOA 3FLWA 4E6CA 3OWKA 1UVRA 4EC8A 5IZFA 3PWYA 1LPUA 3FMNA 3HL7A 3DBFA 4AE6A 1Q62A 2JKMA 5L2TA 3QTUA 3RHKA 4D9UA 1WCCA 4E4XA 5DEWA 3WZDA 4NM7A 3DFCB 4DGLC 3PSDA 4RJ8A 2O8YA 3IECA 3KRLA 5BVWA 2W1CA 4NL0A 2WQMA 4GVJA 3CP9A 3KVXA 3PUPA 5DA3A 3R7OA 3AXWA 4HW7A 4W8DA 3G2FA 4FKUA 4TXCA 2IG7A 2XRWA 3I60A 4G31A 4F0GA 3DPKA 3II5A 2J0IA 3COMA 3ORMA 2Y8OA 3R63A 4FTAA 1U4DA 4JLCA 2BZKB 4NCTA 5ACKA 3VS7A 3OC1A 4ZSAA 2Q83A 3K2LA 3FKNA 4CV8A 2F9GA 2XKEA 5T3QA 3ZXTA 2B54A 4C3FA 1W82A 3O7LB 1BI7A 3TJCA 2QONA 4BICA 1WFCA 4DFXE 4YU2A 3QHWA 1FVRA 3FPQA 3RP9A 4IAZA 3W55A 4OTFA 4RWLA 1QL6A 2XNBA 3D2IA 3MH3A 4B7TA 5AA9A 1UKIA 3I5NA 3VBQA 2WZJA 4AOIA 2X6DA 3H4JA 2LGCA 4H36A 3FKOA 3QCXA 3WIKA 4HVGA 1QMZA 3QTRA 4EQUA 3HMIA 3PRFA 4M97A 5AUTA 4U97A 3PJ2A 4EBWA 3MTLA 4BCPA 4C4HA 2QO9A 3KGAA 3PA3A 2VTRA 4ERWA 4ZXTA 4A4XA 5HX8A 2JDSA 2ZJWA 3VBVA 3S3IA 4DG2E 4O7WA 3G0EA 4MWHA 4RRVA 5KMMA 3SXFA 4X2NA 4PMSA 5CT0A 5HCXA 3MPMA 1B6CB 4QMLA 2PPQA 3T9IA 5IMXA 3UG2A 3ORNA 2WMWA 5AP6A 1OL1A 3GFWA 4JIKA 2OH4A 5ANOA 4BTKA 2PUUA 4TN6A 3AMAA 1UA2A 2BKZA 3KMMA 4IX4A 4M67A 4YJTA 4A9RA 2C0IA 3D5XA 4I5PA 5HE3A 3D5UA 4FKLA 3SXSA 4ANMA 4YZBA 5EYMA 4FYNA 4OAUC 3LCSA 4FICA 4ZLYA 3AMBA 5D7VA 5AWMA 4BN1A 4ZK5A 3A4PA 4F0FA 4QMQA 1JAMA 2WU7A 3QAME 2VX0A 2CDZA 3EN6A 4L9IA 3V3VA 5ITAA 4ZTSA 1JQHA 4AU8A 1JBPE 2C5VA 3FJQE 1Q8ZA 3VJOA 5KKRB 5C9CA 3VS1A 4B8MA 3LXNA 4USEA 2YCFA 3LOKA 2C3JA 3K5UA 3KVWA 2UZWE 4QMWA 4H3PA 4MHAA 2QQ7A 1KE8A 1GZKA 1M52A 3NGAA 3R7IA 1XO2B 4BKZA 2OH0E 2P33A 4EUUA 5LMKC 4R77A 5M56A 3TUBA 5G1XA 4CFFA 4NKAA 4AN2A 4M84A 1ZRZA 3KULB 4G3CA 4Z7GA 4FOBA 3RM7A 1OL5A 5B7VA 4I5HA 5EQPA 4A9SA 5JQ5A 4LOPA 5CZHA 3FMDA 3UC3A 4FL3A 4MCVA 3TNHA 3QD4A 3MIYA 2H8HA 4JQEA 4O7RA 3A62A 2VTSA 1H00A 4ORKA 5JGBA 3BU3A 3DDQA 3RINA 3GVUA 5BUIA 4EOKA 1YDSE 2WIPA 1YI3A 4X7QA 2XCKA 3ZEPA 2HENA 4EOIA 3OHTA 1YWVA 4FKSA 4HZRA 4QP1A 5L4QA 4DFYA 4Y85A 3W8LA 4JIAA 4F08A 4C02A 2VGOA 5FM3A 4ANOA 5H2UA 5CAQA 3IO7A 4HYUA 4O6LA 4XG3A 4MD8E 4L68A 2XK4A 4FMQA 5EYCA 4G3GA 4CNHA 3UPXA 4O83A 1WVYA 5IMEA 1ZMVA 5FXSA 2RG5A 3WF7A 2WGJA 4D2WA 4IANA 4M8TA 5JN2A 4ALVA 3TACA 3CS9A 3TZ9A 4O2ZA 3SX9A 4EKLA 4KABA 4LMUA 3RPRA 4BL1A 4AW5A 3FEGA 4O21A 2Z02A 3ZXZA 1Q4LA 2R64A 3G6GA 3DT1A 2VO0A 3IS5A 3VUHA 4PPCA 3E87A 1O6YA 3ZUVA 5DT0A 4E7WA 5A4TA 5C8KA 5IH4A 3DK3A 4QTAA 1YHWA 3DJ6A 4CD0A 5M4CA 3QCYA 1PMEA 2G15A 3Q53A 3RZBA 2GNFA 2PE1A 4FV1A 4QNAA 3SRVB 4C59A 2R0IA 2WOTA 2AC5A 4EONA 3NMUF 1OM1A 2HWPA 5FUTA 1BMKA 3N4VA 4BDGA 2VAGA 2W4JA 4GJ3A 4U6RA 5ANDA 5IQIA 3GU6A 3OBGA 5HLPA 5LCKA 4IWDA 2R3HA 4OAVB 4FV0A 4JG7A 4EH6A 3BI6A 1U54B 3D7ZA 3QBNA 1JVPP 3OBJA 4ONAA 3KXHA 4CKIA 5IA5A 1FMOE 4KKHA 5EM8A 3OTVA 4UXQA 3PIZA 4O6EA 3R8MA 3QKKA 4JQ7A 2VWIA 4UZHA 4JAIA 4FKWA 3OT8A 5AR7A 3M1SA 4JR3A 5FEDA 5AIRA 4C38A 1CKJA 2R3NA 4Z55A 3WILA 4EEVA 3TTJA 4DFZE 1YDTE 4XG9A 4Z16A 2YM6A 1PXMA 5DWRA 4UN0C 3A7JA 3EQCA 4I93A 4JG6A 1SYKA 4TNDA 4IW0A 3PA4A 5D11A 4UY9A 3VQUA 4FKTA 2PVRA 3QYZA 3RM6A 3VNTA 2QVSE 4DEBA 3PTGA 5KZIA 3T9TA 2NRUA 3W2CA 4DFNA 5E8XA 2QOQA 4DEEA 2X8IA 3A4OX 5ANEA 3PIXA 5CAOA 3CR0A 4O7YA 4QMUA 3Q4ZA 3R22A 1TVOA 2OFVA 3MN3A 2Z8CA 3TV6A 2CNVA 4E93A 1PHKA 5AIKA 2ONLA 3HP5A 4MXXA 4I0RA 5AX3A 2J6MA 3F3VA 2JBPA 5BYLA 1OUYA 5AEPA 3RK7A 4YGAA 1ZY4A 2YAKA 2VWBA 3P9JA 4RJ6A 4Y5QA 5IEYA 3QQLA 3VS4A 4KIQA 3ZU7A 2GU8A 4F09A 2FVDA 1WBTA 3CKXA 4OR5A 3TT0A 5HIDA 3AT4A 4HGTA 3VS6A 4KBAA 4BY9E 2VTLA 5CTPA 4DBXA 4DN5A 5HG8A 3GUBA 4IZYA 3QRUA 3QQFA 1KUTA 3TNWA 3HX4A 5KO1A 4ASDA 4O0WA 2YM5A 4XV3A 3B2WA 4X2JA 3MWUA 2BHHA 3OT3A 3V6RA 3HMOA 3V5PA 2QO7A 1Q61A 2UW9A 2X6EA 4E20A 3UODA 3H30A 3JY0A 3KK8A 2O65A 1ZZLA 4IJ9A 2FSOX 2YISA 3IW8A 3LXKA 2ZV7A 2PUIA 2JC6A 4KUJA 5AR4A 4L67A 4HGLA 3HUCA 4DEDA 5DFPA 3E8EA 4D1SA 3FWQA 4CLJA 5L2IA 5AUUA 3OS3A 4FTOA 2XP2A 1PMUA 2V5QA 3DZQA 4BHZA 3LFDA 4J52A 5AFVA 3BHHA 4BTFA 5AUVA 5C01A 3UIUA 4RX7A 3E62A 3R2BA 4RGJA 1GAGA 3R28A 5DI1A 3IKAA 3V8SA 2CNUA 4U0IA 5AR8A 5HGIA 1YWNA 5LVNA 1GZNA 3G90X 3F3TA 4HGEA 4FSTA 3ZO4A 3ZONA 4UMUA 4MQ2A 3HRBA 3ZSGA 4TYGA 4AGCA 1IRKA 3O96A 5AP3A 4XEYA 5ACBC 3C9WA 4BDIA 3EL7A 1YRPA 3BYUA 3BYVA 4C3PA 3NDMA 4TWNA 4RZVA 2Q0NA 3BGZA 4K33A 2QKRA 3KB7A 4OTDA 2YDJA 3OXIA 5AR5A 4WOVA 5FXRA 4AA5A 2JLDA 1CTPE 2YCQA 2PVLA 4HOKA 2WTIA 3SA0A 2Y6OA 4JXFA 3PWDA 3IW6A 3OUNB 2OZAA 4AW2A 3VJNA 3NW7A 4J8MA 5FXQA 3ATTA 3N4UA 4I22A 3U9CA 2XIKA 5EHOA 5GJDA 4RWJA 4CFXA 5IQHA 1PMNA 1SVEA 4EKKA 5AUXA 2P55A 2UVYA 2ZM3A 4JT3A 3P4KA 1PXKA 1H24A 1J91A 3IGGA 4C62A 4O0VA 1DM2A 4NUSA 4O0XA 5KE0A 3RWQA 4N57A 2DUVA 1OGUA 4W4VA 1E1VA 4ACDA 2ZOQA 5A6OA 4QD6A 3ACKA 5H9BA 1W8CA 3GC0A 3W2SA 5LOHA 3EQIA 3MA6A 3QTWA 2CLQA 3OUKA 4BIBA 3KCFA 5FM2A 3U8WA 4P2KA 4HYHA 4TYHB 5ETCA 5FDXA 4KA3A 4OTPA 5CF8A 2VD5A 4GT5A 3ZZWA 4WBBB 3WZEA 4FSZA 3H0YA 3ZRMA 5CQUA 2O2UA 5AV4A 4GEOA 3R1NA 4RIYB 3CSVA 3F6XA 1H08A 2JGZA 4FKVA 4S2ZA 3G9NA 1GIIA 2R3FA 4XG8A 5I9ZA 2FB8A 1YDRE 4G3DA 3DFAA 2BTSA 3DU8A 3KQ7A 3HUBA 3OEZA 4J95A 4QP4A 1RW8A 3HVCA 4UV0A 1UU7A 3ROYA 5BUEA 3RBWA 5JMSA 3C5UA 5AM6A 4K11A 4ZZMA 4Z3VA 3S0OA 4RVTA 4FYOA 3R9NA 3AC2A 1H4LA 2VTIA 2Y0AA 2YIRA 3F88A 3FI4A 4RJ7A 5K5NA 4IDTA 3HDNA 4AZFA 2C68A 1XJDA 2BIKB 4LMNA 3R8UA 4EL9A 3GB2A 3NWWA 1J7UA 3AC5A 3PG1A 2J4ZA 3EN9A 3SXRA 3O8UA 4E5WA 3V5TA 2QLQA 1KWPA 3PIYA 2QU6A 1DS5A 4J71A 1XHAA 3P08A 2C69A 3PP0A 4ACMA 1OUKA 4WHZA 4QMNA 3HV6A 5TKDA 2WTDA 4OTQA 4W9WA 4F9AA 4FGRA 4N4SA 2R7BA 3FMJA 3MFRA 1HCLA 1UNGA 2QOCA 2WELA 4JDKA 4TWCA 3BWFA 3CGOA 5D9HA 4EHZA 1BL6A 1MRYA 3HAMA 4YJNA 1Z9XA 4ZJVA 3KXZA 2R3KA 1VYWA 5CSVA 5BQ0A 4EOMA 4W4YA 4RA5A 4U45A 3RPVA 4EK3A 2CN5A 1PF8A 4BR3A 3N51A 1ZOGA 3DTWA 1BL7A 3E7OA 1PW2A 3O17A 4LRMA 4FI1A 5IKWA 5J95A 4DYMA 2ITXA 4RIXA 3SKCA 3DBEA 2W7XA 1OKWA 3NNWA 4JRVA 4N6ZA 3RHXA 3FHRA 4YHTA 4GIHA 3VVHA 3QTQA 5HD4A 3U4UA 3MESA 2VZ6A 2GS6A 3R83A 4Q9ZA 1M17A 4KIPA 4AXAA 4RA4A 4S33A 2HAKA 4U43A 4Z7HA 2HYYA 4NCTC 3QC4A 5H8BA 4EOSA 4YURA 3H9OA 4HYIA 4L44A 2UW6A 3COKA 3UO6A 2X8EA 4QYGA 3LCTA 3EYHA 5A4LA 2VWVA 4V05A 4B9DA 5HORA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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