4ASEA

Crystal structure of vegfr2 (juxtamembrane and kinase domains) in complex with tivozanib (av-951)
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
312
structure length
305
Chain Sequence
DPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYYKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANA
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular Conformations, Interactions, and Properties Associated with Drug Efficiency and Clinical Performance Among Vegfr Tk Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 305
sequence length 312
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4aseA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4aseA01
4H3PA 4E4MA 1YI3A 3D83A 4TWNA 2VWWA 4C57A 2IZTA 2QKRA 4M97A 4XEYA 4WA9A 1YWVA 2DYLA 2ZAZA 3UZTA 3SG8A 4RJ8A 4D2SA 5CZIA 1OBGA 4I3ZA 4FSRA 2BR1A 3RALA 3QX4A 3FUPA 4EK3A 2BCJA 3BV2A 3OMVA 4BDGA 4GT3A 5IQAA 2XYUA 5CALA 5I9VA 3QTZA 4XCUA 5EYKA 2OH4A 4U43A 2W4JA 4BIBA 3HAMA 1YXUA 2EWAA 3COKA 3IDPA 3NR9A 2OW3A 2WMRA 2WPAA 3T9TA 2UZBA 3P7CA 1IG1A 4WSQA 3QRUA 5FQDC 4X2FA 5CSWA 1RQQA 1ZMWA 4WG4A 3BRBA 3QZGA 4DFYA 3KRRA 3NUPA 2YEXA 4DFXE 4FE2A 5K0XA 2VN9A 4L68A 3GU6A 3UTOA 3WOWA 5A6OA 4O7YA 3TIYA 3W18A 5CS6A 3RAWA 4NIFB 4RFZA 2WXVA 3LFNA 4JQEA 4GYIA 5DIAA 4ZLZA 2QHNA 3TUBA 1G8AA 3H4JA 3TZMA 3HDNA 4LGHA 3F66A 4DH8A 3NUSA 2C0TA 4L3JA 3RAHA 1FQ1B 4UMTA 2WTVA 1KV2A 3P9JA 1K3AA 4FV5A 4QMXA 4CD0A 4NCTA 2GTMA 4MX9A 5CI6A 3A7FA 3NSZA 3GU4A 2ZB0A 3W33A 2OJJA 2WGJA 3LCTA 5CSVA 1NA7A 1TVOA 4HNIA 1JKLA 3DK3A 4EC8A 4LM5A 2GNGA 4L46A 5AP5A 4FV6A 4O2ZA 3MH2A 3R7IA 2YCSA 3DAEA 4GFGA 4J8NA 3KULB 2WO6A 4ENYA 1Z57A 1ZLTA 4W8EA 3IGGA 4ACGA 2X1NA 2QU5A 3PA5A 4R77A 2VX0A 4EEVA 4NZWB 5AV3A 3LXKA 2PMNX 4FSTA 3BPRA 3OG7A 3RPVA 1GZKA 3NWWA 3KXXA 1H08A 5L2SA 3W55A 3KRWA 5HG7A 2P55A 3RM7A 1HOWA 4PDSA 5IH4A 1H0WA 2XVDA 2ZMCA 3EKKA 5FDXA 3WF9A 4KKHA 4ACHA 2GS6A 4CEGA 4NWMA 1R0PA 1YXVA 3WE8A 2HWPA 2B0QA 3C1XA 3GNIB 4M12A 3QXPA 5FG8A 4CRSA 5CSPA 1Z9XA 3MW1A 3UIXA 4HVHA 3MVLA 4MNEB 5E8VA 1VYWA 2CNUA 4FT7A 4L7SA 2XKDA 4L67A 3V5QA 4AP7A 4B99A 3TZ7A 4BCHA 2CHLA 5KMJA 1GIIA 3C4CA 4DH1A 2PVMA 4OR5A 4F09A 4AGWA 2WQMA 4W4WA 2BZHB 3KF4A 3DBEA 3PUPA 2ITVA 3NYXA 4F08A 3QRJA 4IC8A 3E93A 1GNGA 4DGLC 3ZUUA 5T6KA 5FEQA 2QOQA 5M4FA 1UWHA 2C6MA 3MFUA 3ERKA 3PJ8A 3ZSHA 3VRYA 4E4XA 3C5UA 4JAJA 4O81A 5JGBA 4RC3A 3F82A 3KN6A 4I24A 2R7IA 4FUYA 4TN6A 4XBUA 4XG8A 4RFYA 3R7VA 4HVDA 2YCQA 5CVFA 4GVAA 3CJFA 4C59A 5E1SA 4RQKA 2WB8A 3QQGA 3R1YA 5D7VA 3Q9WA 3BU5A 3NUUA 3R8UA 3CE3A 3PXKA 4MAOA 2PTKA 5D9HA 5J9LA 4FTIA 3OFMA 4CZTA 4LGGA 2G2IA 2A1AB 2ZDUA 3UBDA 5IA1A 1M2PA 3R73A 4FTOA 4O96A 4X7QA 3G51A 2YZLA 2WFYA 4NU1A 2GNIA 5BVWA 5IG1A 4BHZA 4YTCA 4MXZA 4X2JA 3BYMA 4G3EA 3SV0A 4DCAA 5AFVA 3FMKA 3KMUA 3NW7A 1URWA 2B9HA 4AW1A 2XNGA 4CQGA 3F7ZA 2YM4A 3KREA 1M7NA 3EQPA 4D28A 4DINA 1BX6A 3MB7A 1OM1A 4KIPA 1GY3A 4MCVA 1OPJA 4NFNA 3MY0A 3OOMA 3OVVA 3MFTA 4PPCA 4DH5A 2QOIA 3NZ0A 4JDHA 4Z55A 4YC6A 2X7OA 1NVSA 4LMUA 3TN8A 4CV8A 3VBXA 3QZHA 4L00A 1SNXA 4XX9A 4M7IA 3PVGA 3S4QA 5J9YA 5AUWA 5A4QA 5EQPA 4R1VA 1OZ1A 5LVMA 3IDCA 3I4BA 5TT7A 5AV4A 5M08A 4X21A 2BALA 1VR2A 2UV2A 3N4VA 4BC6A 3I81A 3ALOA 4EZ3A 3GC9A 5DH3A 5HKMA 4EONA 1KE5A 4RG0A 2B54A 1B6CB 4Y85A 2X9EA 2JDVA 4IADA 5TO8A 3OXZA 4PMTA 2GS7A 1ZYCA 3A60A 4YPDA 2PVYA 3MIAA 3FMJA 4RLKA 3GUBA 1REKA 4NKAA 4JT3A 1SM2A 3OW3A 2J0LA 4HCVA 4FVQA 5AR4A 4DG3E 3OTUA 2C5OA 1IAHA 2JLDA 3R22A 4IB5A 4K77A 2CMWA 3D5VA 4G3CA 4QYGA 2YCFA 1DAYA 3MTLA 2GSFA 2ERKA 4KBAA 3OW4A 3UNZA 2YM7A 2XJ2A 4MF0A 1H1RA 2HOGA 2XKEA 2C0IA 4Q5HA 3TNQB 4AE9A 4AA4A 3LVPA 3UMXA 3G6GA 4QMUA 4XP3A 1JOWB 1H00A 1R3CA 4WIHA 4ZTSA 5IA3A 3QTXA 4TYIA 5EHLA 5EI6A 4RIYA 3OWKA 4G34A 5LJJA 1FBNA 3IO7A 3MTFA 2HENA 3BYOA 3BYVA 3MVJA 4TYJA 3UOLA 5KNJA 4MXOA 3CTJA 3P7BA 1XH4A 4U0IA 2X81A 2PVRA 4AW5A 4MYGA 2YM3A 4BBMA 2JGZA 1Z5MA 1V0PA 5IDPA 4I6HA 4I0TA 2QOHA 3KK9A 1FOTA 4LGDA 1PXKA 1BL7A 1UNHA 2GDOA 1Y57A 2QD9A 4P4CA 4RBLA 5JSMA 5CF4A 4GT5A 5DPVA 3KKVA 1QMZA 4GRBA 4RPVA 5A54A 3FHIA 2VTLA 2C5XA 3GCVA 3LFCA 4IW0A 3ZEPA 2CNVA 4IVDA 1PMUA 3MS9A 4NM3A 3RHKA 4DH7A 3KU2A 4FKPA 1R0EA 3FSFA 4G5JA 2XUUA 4BDCA 1V0BA 5AP4A 3RBWA 2IVSA 4P5ZA 3F2AA 3TXOA 3POZA 5JGDA 2C0OA 1OKZA 2VTHA 4FTQA 4QQTA 3FSKA 2LGCA 3UQFA 4C0TA 4HW7A 5HI2A 4D4YA 4I6QA 4P90A 4EKKA 2CKOA 4NCTC 3VW8A 2QOBA 2B52A 3CLYA 2OXXA 4FTMA 4GIHA 3IW4A 5BUJA 2HXLA 5DT4A 4IDTA 4BZNA 5B7VA 4FNYA 1OMWA 1SYKA 4NTTA 3BYUA 4PQNA 4IM3A 3RI1A 3IG7A 2PZRA 3ORPA 4DGNA 2ZM4A 3DFAA 4YSJA 3DOGA 2HW6A 2VTMA 3DQWA 5GIOE 2PU8A 2OU7A 4E6CA 4F64A 3EQCA 4YHTA 1QPDA 2PVKA 4KKGA 1E9HA 4FODA 5H8BA 5DNRA 2HAKA 2ITUA 3ODZX 1VEBA 3QQFA 4FZFB 3I0OA 3GENA 3V8SA 2EXMA 4S33A 4C35A 4FICA 3IOPA 4BCGA 2ITPA 1A48A 3SG9A 5F4NA 2E9OA 4RIWB 2E9NA 4FNWA 4YJVA 4YPSA 3KRLA 4E26A 3DDQA 4QTBA 4EL9A 3PTGA 4IAFA 5A3XA 3I0QA 4ZS0A 3KULA 5GIPE 3CD8A 3FMNA 2WTKC 3FLZA 3MIYA 2OJFE 4F1MA 4W9WA 2R7BA 4JAIA 1ZARA 3LE6A 2BDWA 2YM6A 1Q3WA 4L43A 4OAVB 1ZY5A 1MRYA 4CMUA 2IO6A 4BB4A 2YDKA 3OTVA 4RLLA 5E8TA 1PKDA 3A8XA 1CDKA 3TWJA 1TQMA 1ZZLA 1JQHA 3KXNA 4E93A 3QFVA 4PRJA 4WO5A 5K9IA 3GU8A 3KEXA 2J0IA 2R3OA 4ZSAA 4JIKA 4PMSA 3V51A 4P7EA 5AUTA 5M4CA 2CKPA 4H3BA 5DA3A 4MNEA 5HLNA 2IZRA 2OFUA 4F7JA 3IONA 4JS8A 3QF9A 4KBCA 2UW0A 2BRMA 4FK3A 4PL5A 4QO9A 4YJSA 5HTIA 2Y4PA 3MI9A 4PMPA 1MQ4A 2VTSA 5JZNA 4DLIA 3VBQA 3DBCA 3ANQA 4RJ3A 4AACA 2JFMA 3KY2A 4M14A 1RW8A 3HDMA 5H8EA 2BZJA 1AQ1A 4O1OA 4EH2A 3QL8A 3QXOA 4KUJA 3ZRLA 4ANOA 5CEMA 2WQNA 2H6DA 4F7LA 1J1BA 4FKUA 5BVNA 4CKJA 5KMNA 2XYNA 2FUMA 1GAGA 4FTNA 1WCCA 2UZLA 3HMPA 4GYGA 4HPUE 4QMSA 5E7RA 3QGWA 2CGUA 5GJDA 1Q99A 1YQJA 4L44A 1PXOA 5HX8A 1TQIA 3VUTA 5EQYA 2YITA 3FJQE 1H1SA 2IJMA 2WMAA 5J7BA 2ESMA 5IUIA 3G0EA 4JVGA 4ARKA 3HGKA 3R9NA 4CFUA 5M4UA 2X39A 4AA5A 5AR5A 3LCOA 5EDPA 3K5VA 4B7TA 3FYKX 4M69B 4FI1A 5HVYA 2CLXA 3K3JA 2J51A 2X4FA 3ZH8A 4EOQA 3EH9A 1ZWSA 4EOPA 4MWIA 4WBBB 5DFPA 3AT2A 3VS6A 4F0FA 5JEBA 2FB8A 3Q2MA 2F2UA 3ATTA 1OECA 4YUQA 3BEGA 3HMIA 4Y73A 2HY0A 3EN7A 2W0JA 3PY1A 3Q4CA 3FZRA 3WI6A 5ANIA 4DG2E 2RIOA 4BYJA 5KE0A 2VUWA 1W0XC 4FIEA 3BHHA 3BHYA 3BKBA 3EN4A 2FSOX 3VJNA 2DQ7X 5HG5A 4M67A 4CFNA 5ANDA 3S3IA 3L9NA 5B2KA 2BIKB 2CLQA 3OOGA 3SX9A 5LCJA 1OBDA 4OTIA 1GZNA 2J7TA 4O0VA 2PUPA 4G9RA 1T46A 2UW4A 3EYHA 3TJDA 3ZO4A 4ERKA 3IW7A 3VBVA 5C27A 3UIMA 2C6OA 3GP0A 3LJ1A 1SZMA 3Q60A 2QU6A 5D1JA 4ZJVA 3L8VA 2OICA 4FTRA 2ZJWA 3KF7A 3TV7A 5E4HA 3FI8A 4CGAA 3R9OA 2O64A 3QWKA 3QX2A 4J98A 1XO2B 3LMGA 4OTQA 4YHFA 4F6WA 5AA9A 3NCZA 4ASEA 4B9DA 5LOHA 4AOIA 2QQ7A 2X4ZA 1OL6A 5DN3A 3THBA 2UVXA 2BZKB 3SGCA 4C3FA 3CR0A 3V8WA 1B39A 4FIJA 2A19B 2B7AA 5DEYA 1WBOA 3ETAA 4F9CA 5IMEA 4FA2A 4TW9A 4U41A 2Y6OA 1Q8TA 4DYMA 1WAKA 4R5YA 2NO3A 3E8CA 3UPXA 4DEHA 4UWYA 4IMYA 4GKIA 5AUYA 1JPAA 5C4LA 5IISA 3GEQA 3PWDA 5TKDA 4IWDA 4I1ZA 4YZMA 4FSWA 1GZ8A 4YZCA 2UZDA 2O0UA 3UVPA 1VZOA 4QMYA 5DBXA 4ZSJA 3RNYA 1U5QA 3MPTA 2VTAA 4K33A 3R21A 5HOAA 2A0CX 2XK3A 3AC5A 3UOKA 2REIA 5HGIA 4PF4A 2FO0A 2CN5A 2YACA 4UXLA 3CIKA 3OXTA 4K6ZA 3OCTA 4KWPA 3U9CA 5CAQA 1M17A 1OL5A 3W8LA 2R3QA 3DQXA 4LOPA 1GIHA 4FOCA 2CGWA 4ZSEA 4EOIA 2R0UA 4C2WA 5BVDA 2OF2A 4IB1A 4XV3A 2HZNA 5L6OA 4BIEA 4DGMA 4R1YA 5JMSA 5IEYA 3OUKA 4XOZA 5AP3A 2BRNA 1DAWA 3CXWA 4IDVA 2W05A 4ERWA 2VTOA 5EM6A 5M07A 4YBKA 4JXFA 4O6EA 4DFNA 3N4UA 3GC0A 4PDPA 3C4FA 1OIQA 1NW1A 4FKIA 2XZSA 4YO4A 2OWBA 3UNKA 2XEYA 2J4ZA 3FEGA 5AAFA 4G9CA 3LPBA 4HZSA 5IPJA 4ANQA 5JT2A 3PYYA 5BVOA 4LOQA 1WFCA 4U44A 2PE0A 3R01A 1F0QA 4AZFA 5AR3A 5C03A 3SXSA 3DNEA 3HP2A 3PZHA 2BPMA 3GC8A 4TNDA 1BI7A 2QURA 2G15A 2PE2A 3G9NA 2PUIA 2BUJA 3MDYA 3NW5A 2PZIA 3F3VA 3Q4UA 4OAUC 1J91A 3F5GA 4QMZA 2F7ZE 1R39A 4ZP5A 3TIZA 4D2WA 2JC6A 5AV1A 4AZSA 4FKJA 4TYHA 4JJRA 4UYNA 1PJKA 4RIWA 3VVHA 1PXNA 3BGPA 3QD0A 3QQKA 2R3IA 1U4DA 3MBLA 3PRFA 4IH8A 4IZ5A 4FKWA 3ZLWA 4IX5A 4FVPA 3FKOA 4QMNA 2W96B 3EQRA 3NUXA 1QPEA 4LFIA 2YFXA 3L9LA 3TEIA 3NNXA 4PY1A 2GQSA 2JDTA 4LQMA 5J1WA 1JSVA 2VWBA 2XNNA 5CXHA 4ZY4A 5AV0A 3A7HA 4FBXA 3CPCA 4FL2A 4OUCA 3UIUA 4Z7HA 3EKNA 3QRKA 1J1CA 2GU8A 3F88A 2QR8A 4YZDA 2O5KA 4ZOGA 2QCSA 4FT9A 3AMAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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