4AXAA

Structure of pka-pkb chimera complexed with (1s)-2-amino-1-(4- chlorophenyl)-1-(4-(1h-pyrazol-4-yl)phenyl)ethan-1-ol
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
SVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLTKLEFSFKDNSNLYMVMEYAPGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLMIDQQGYIKVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title At13148 is a Novel, Oral Multi-Agc Kinase Inhibitor with Potent Pharmacodynamic and Antitumor Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 112
structure length 335
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4axaA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4axaA02
3V51A 1J7IA 1UU8A 3N4TA 5I9ZA 4BHZA 1SVEA 3MFSA 4FC0A 1BL6A 3QA0A 5J8IA 2O65A 5I9WA 4MQ2A 4FEUA 5HE3A 4BRXA 4YC8A 4FE2A 5EM8A 4FA2A 4QPAA 3FYKX 5HLPA 2HWOA 3JYAA 3LVPA 3MBLA 1VEBA 4NEUA 3T9IA 3JUHA 5HE2A 3W18A 4AN3A 2B9FA 5HBEA 2BAQA 3QRUA 2A27A 2BPMA 2GHGA 3UQGA 1XH4A 4FTKA 4DH1A 4X3FC 3EFJA 2QKWB 2V55A 3PIXA 4XX9A 4GH2A 3TDWA 4XOZA 4D58A 4FSUA 2X6DA 4DFLA 4O21A 4I6HA 4RJ7A 4R1YA 5CEKA 4UV0A 3OXIA 2B53A 5DR9A 3QZHA 4MXAA 3DAJA 4B9DA 4CV8A 3PFQA 3PXRA 4DEGA 3U9NA 1UNGA 4XBUA 3CKWA 5AMNA 3LMIA 4AA0A 2VTMA 1WBSA 4E6DA 1YHSA 2JDTA 1ZOEA 1ZZLA 1OKYA 3B8RA 2QI8A 3OOMA 1H01A 2W06A 2GQSA 5EQYA 3NWWA 2FUMA 2Z7LA 3SOCA 4OGRA 4JNWA 3TNHA 4ASEA 4QMSA 5L3AA 3DT1A 1ZXEA 4G1WA 4KRCA 3PY3A 3U54A 4L42A 2VX3A 2WMSA 2YLEA 1PF8A 2VTQA 3AC2A 4KB8A 3TZ9A 4BKZA 3AXWA 3FZTA 4DEHA 2BRBA 4R5SA 3UE4A 4D28A 3D14A 4AN2A 2QU5A 4DT8A 4YU2A 4FSZA 2H34A 3LCTA 4TYHB 4FX3A 2Z2WA 4EOMA 4FZ7A 2YABA 4II5A 4JI9A 4R7HA 4GKHA 2EXEA 5HG8A 4QP4A 4K77A 2ZDUA 3BLRA 4F9CA 3ZLWA 4XV3A 4O7WA 3A60A 4BDDA 2VAGA 2PZPA 3D7TA 3DB6A 4I6QA 2XF0A 2I0YA 4MF1A 4U3ZA 3PJ1A 4MX9A 5A6OA 1R0PA 1H24A 4KSPA 3SVVA 1P4FA 2OJGA 5KHWA 3LCKA 4ZP5A 4CT2A 4U8ZA 4C36A 5FP5A 1HOWA 4A9TA 4IM3A 5CI6A 2A0CX 1E1XA 4WG4A 3BRBA 4LMUA 5HNGA 4BTFA 3SXRA 2QODA 2CN8A 5I4NA 3PJ3A 3DQWA 3FV8A 4M0ZA 4EZ5A 3IONA 3CSVA 4IXPA 3RKBA 4CMTA 1CKIA 4RJ8A 3OXZA 5JN2A 1PW2A 3A99A 3POZA 4RC4A 4FKUA 5EYKA 4HVDA 5EOLA 3BEAA 4WBBB 4Y5QA 4CSVA 5KX8A 4L3LA 5HBJA 1PXOA 3THBA 1OZ1A 3OCTA 2C3IB 2ITPA 2VWYA 1Y6BA 2XKCA 2ZM1A 3D2IA 2QOIA 5JMSA 3Q52A 3R7GA 4B99A 4XP0A 5G1XA 4A4XA 3UO6A 5IA1A 2C4GA 5D11A 1GNGA 4IW0A 3V5JA 4OTFA 2GNJA 2OJFE 4G6OA 4MD7E 3UC4A 3VBYA 4NU1A 4ZEGA 5J5SA 3ZC6A 3FI4A 4FZ6A 1ZOGA 3BHUA 3MY0A 4JXFA 4O1OA 4RWIA 3TN8A 2G01A 2OWBA 3VUTA 3R63A 4QMYA 3RI1A 3LCDA 3FKLA 4FL3A 4E4NA 3R7IA 3QQGA 4Z55A 3C4WA 3L9LA 1W84A 3U6JA 4U42A 4BBEA 4HNIA 4FIHA 4ZJIA 3U6HA 1NY3A 3MJ1A 3GU5A 3KXGA 3MVMA 2WO6A 4W4YA 3MA3A 3VS0A 1OM1A 4NTSA 4F99A 3AT2A 2V62A 3GENA 3RAWA 4ALWA 1U4DA 4BBFA 3ZBXA 1IR3A 5ANKA 2PWLA 4QYEA 1OIQA 3JY9A 5F20A 3Q2JA 4GVJA 4TWPA 2PUNA 3R30A 4X3FA 3MPMA 4CRSA 4Z7HA 1U5RA 2HENA 5HVKA 4G3EA 3ZM9A 4U7ZA 4RVKA 2UW5A 1DI8A 3KRRA 1O6YA 3F5GA 5EW9A 3PZHA 4JL9A 3QTXA 3AC4A 5DBXA 3HYHA 4TN6A 3TG1A 3Q04A 5L6PA 5AIKA 1J7UA 3S4QA 3NW7A 1ZRZA 4KA3A 2VWZA 5AP0A 5CAQA 5L6OA 1Q5KA 4N70A 4BFMA 3IGGA 4I20A 5EFQA 3F7WA 3R2BA 3HMPA 3E8NA 3CC6A 3KC3A 3NX8A 5HIBA 3VO3A 1JQHA 1Q99A 3LQ5A 3UQCA 5CAOA 4IX3A 1U59A 3CP9A 1BI8A 4C3RA 1ZYDA 3KQ7A 1PY5A 2FSMX 5EQPA 4V01A 4E6CA 1L8TA 3EN7A 3BX5A 4GK2A 4RG0A 1AQ1A 4ASDA 3BYMA 3TUCA 3CQWA 4AT3A 2XNBA 3ELJA 1Y57A 3PRIA 2XIXA 2YM5A 2ZV8A 4X21A 3G51A 1Q3WA 4FGBA 4E3CA 4BIBA 2G2IA 5HNBA 5J95A 4F7NA 2XNGA 4MNEB 3PE1A 1G8AA 4CMUA 4HGEA 1W7HA 3E63A 2PSQA 2QLQA 3A8WA 4WNMA 4DEBA 4IX5A 3Q53A 4FT3A 5DPVA 4UN0C 3SQQA 4R3RA 4JRVA 4KWPA 4OTGA 2UZVA 2ITTA 5CAUA 1M2PA 4DFXE 4H58A 4G3GA 4O0TA 3NZ0A 5HI2A 4BCGA 4C3FA 4UYAA 3D83A 3QUPA 4EL9A 3DOGA 4J53A 5GJDA 4ZLYA 4I4EA 4WKQA 5M07A 3EMGA 2PU8A 2R0IA 2BCJA 4I22A 4OAUC 1OIUA 3Q4CA 4AW5A 4DBNA 2XNPA 3C5IA 3PJ2A 4WBOA 4L45A 4DLIA 4O84A 1XH6A 2VX1A 4FTTA 4MXXA 3PVUA 3IPHA 1W82A 2W0JA 2ZVAA 3PJCA 3S0OA 2R7IA 4ZK5A 4JVGA 4RJ4A 2A19B 3MY1A 1GJOA 4TWCA 3H4JA 3TACA 4FYNA 4NJ3A 3MH2A 5I9YA 3OWJA 1WBVA 4U45A 4EK3A 4BWXA 2ITNA 5EHLA 3NUUA 4X2JA 3OUNB 4I5MA 4KABA 3P9JA 5AFVA 3Q4TA 3IOKA 4EQMA 1STCE 4JBQA 1YXXA 4EKKA 4LGGA 3ACKA 3V5LA 4KIQA 4E93A 4EC9A 3PIYA 4BY9E 4YPDA 2WOUA 4DCAA 4WNPA 4NW6A 4PP7A 3RP9A 3MPTA 3GFEA 4IB1A 2QCSA 3EOCA 4W4VA 1F0QA 4BTMA 2PVKA 1ZAOA 2XBJA 4ITIA 4J8MA 4AA5A 5I9VA 2JITA 2ZMCA 3NEWA 2RG6A 4ONAA 3TXOA 2XM8A 2YEXA 3CQUA 1K2PA 4NFMA 5HTBA 4W9XA 4V0GB 5HD4A 4H1MA 2R3GA 1KOBA 1ZMUA 4WRSA 3C9WA 3ZM4A 4YO6A 3R1YA 2OXDA 2JDRA 2W1CA 3LM0A 2OF4A 5KMKA 5LQFA 4H05A 5JGDA 4PUZA 1X8BA 3LHJA 1YXUA 3QD4A 5DFPA 4ARKA 2UW3A 4BYIA 4IB0A 2B7AA 3CEKA 4K18A 3ID6C 2F4JA 3EFWA 5CSWA 3VUKA 4QP6A 4XOYA 1A48A 2CCHA 4JBPA 2QU6A 3TUBA 5KZ0A 3HUBA 3LJ2A 3VBWA 3F3VA 2W99B 3KGAA 3P08A 4MD8E 4NW5A 2WU7A 3FI2A 4RFZA 5LCJA 4YZBA 1FVVA 4O6LA 2XNMA 3D7ZA 4OBOA 3UPXA 4ACDA 5AAGA 2PL0A 1U54A 2F49A 4FOCA 2WTIA 2HIWA 3KVWA 3PY0A 2DS1A 3W2SA 3OWKA 2YJSA 3VQUA 2B9JA 4MBLA 4DYMA 4QNAA 4S30A 3HL7A 3LKMA 5J7HA 1MRVA 2GS6A 2YWVA 3HECA 4RLLA 4ZIMA 1B39A 4G16A 2Z7RA 3A61A 2UZUE 4GUEA 2BKZA 4JDIA 5FXSA 5A3XA 3ZSIA 2JFMA 4FNXA 5GIOE 3FC1X 4MBJA 5ANEA 5HORA 2PUIA 4O7RA 1W83A 5CWZA 2BZKB 3RK7A 3QRIA 2VRXA 5CYIA 3QQJA 5E4HA 3Q9WA 4PNIA 3HKOA 4X3JA 5EW8A 3ENMA 4G3DA 4CG9A 4PMPA 5FP6A 4BDFA 2C6KA 2UZOA 1JVPP 2FSOX 1OPJA 2X9EA 4FTOA 4TYEA 5IA5A 4F6UA 2GMXA 3G6HA 4FR4A 4YJUA 2W4JA 4IZ7A 4F09A 1KE8A 4IFCA 4U79A 1F3MC 4PTCA 4I92A 5IQBA 4TW9A 2BVAA 4BZOA 2OFVA 4JAIA 4CCUA 4IVBA 3DBFA 4M15A 4QMVA 4N57A 1MUOA 3D0EA 2WTWA 3HX4A 4AE9A 4GT3A 4EK4A 3LMGA 3E8CA 1WZYA 3ZBFA 2F57A 5AM6A 2H9VA 4USEA 2EB3A 2WD1A 2QQ7A 3CIKA 4O91A 4XG9A 1PHKA 4GK3A 3RCJA 3E62A 3UTOA 4E20A 4EWHA 4OTQA 1V0BA 3KRJA 3JR1A 3W33A 4XLVA 3TKIA 3CD8A 2OG8A 2VTIA 5H8BA 3F5XA 3CPCA 4D2WA 5BVWA 3H0YA 1V0PA 3Q9ZA 4RX8A 4DFUA 3EKKA 4EJ7A 4NT4A 2XS0A 4O6EA 2QOLA 2REIA 5J79A 2JKOA 3DFAA 3ANRA 4ASZA 5AV4A 3QLFA 4XJ0A 3M42A 5L8JA 1IG1A 4FTLA 4DTBA 2WXVA 4RVMA 2GPHA 2I0HA 2QR7A 2VTRA 3NNUA 3V01A 4EH8A 3WZEA 4X7QA 2PE2A 5LVNA 4G6LA 2XZSA 3UOJA 2XB7A 5KKRB 3KU2A 3NVKI 5EQEA 4ALUA 3N4UA 3FAAA 4FI1A 4CFVA 5HVYA 4DH7A 3EB0A 3IDCA 4O2ZA 4PMTA 2VWIA 1H0VA 3EZVA 3RAIA 4UYNA 3ORPA 4ITHA 4ZTNA 2X2MA 4O7NA 3I81A 4AZVA 3TTJA 1QMZA 2WQNA 5CF4A 2HCKA 4DINA 3TV7A 1PRYA 4R77A 4G34A 4IDTA 2V5QA 3AC8A 3DB8A 1H1SA 3R21A 4S34A 4Y5HA 4BCKA 1U46A 2YIRA 4M0YA 3ZU7A 2UW9A 5C8NA 5BVOA 4FKVA 2VWVA 2GS7A 4GFMA 5ANOA 4Z9LA 3DBCA 3FBVA 5EI8A 4F7SA 5BPYA 1RJBA 4GL9A 3D7TB 1DI9A 2WPAA 4M8TA 4RBLA 2QOHA 4JLCA 4B4LA 4A9YA 5CVHA 3TKHA 4DN5A 3MVJA 4YO4A 2RFDA 4K33A 5BQ0A 4L52A 3BGZA 1XH8A 3L8XA 3DKOA 1PYEA 3BHVA 3COKA 3D4QA 4J1RA 5EHOA 5TE0A 4ID7A 5AUWA 1R1WA 4P7EA 3VVHA 5JRQA 2UUEA 2WAJA 2WMQA 5GZ9A 2LAVA 2IWIA 1SYKA 3K3JA 1CM8A 4KKGA 3R7OA 1JKTA 4IQ6A 1IA9A 3WF6A 4F0FA 3IOPA 1FGIA 4G5PA 3WZKA 2ESMA 3CTJA 3W2CA 4QP7A 5A4LA 4AZWA 2RKUA 1APME 2EVAA 5JFWA 5BYYA 3L9NA 4EKLA 3M1SA 5AUUA 3KMWA 4OR5A 2WQOA 2Y4IB 4PX6A 2NO3A 3K2LA 4AT4A 4A9SA 4DTKA 3PUPA 4EZ3A 3HMIA 2JAVA 2JC6A 3OT3A 4YC6A 3MYGA 4YLJA 5CVFA 4YHTA 5B2KA 3RNYA 4FG9A 4C62A 3Q96A 2YN8A 3V8WA 4E4MA 3QQUA 4U80A 4LYNA 5M4FA 2QO2A 4AGDA 5FTOA 4YBJA 5ACBC 5KNJA 4AW1A 4D4RA 1Q8YA 4IMYA 4QQCA 4ZTLA 4XS2A 5FEQA 3ZZEA 3EQIA 2YIXA 4C59A 3CKXA 3MH1A 4IB3A 4BTJA 3VJOA 3ATSA 3OT8A 4J95A 4FT9A 4JDHA 2XKFA 1G3NA 3SX9A 4E73A 3O23A 4PL5A 3L9PA 4QP9A 3R8ZA 4O0YA 5KMLA 5CT7A 2PE1A 4B0GA 4FOBA 4RRVA 3L8SA 5CEQA 4ANSA 1NXKA 2KTYA 2VO6A 1URCA 3FQHA 3MA6A 4RVLA 1JSUA 2X81A 4RX7A 2O0UA 3KK8A 5DYJA 2I6LA 5ETFA 2C1AA 3FZRA 4B8MA 5CI7A 4FL1A 4P5QA 3WZJA 4F0GA 4OTHA 5CANA 5ANDA 3Q32A 4O38A 5AP2A 1QCFA 3DAEA 4FTRA 3BGPA 3UODA 3UGCA 4Q5EA 4DTAA 4YZ9A 3NSZA 4N0SA 2BZIB 2VNWA 4X2GA 3ZLSA 1JKLA 2B1PA 2OFUA 3MVHA 3PP1A 2UZNA 4YC3A 3D9VA 3ALOA 3LXKA 4MKCA 2VTLA 4QMZA 3VS6A 4EI4A 2XM9A 3E64A 4X6QC 2OF2A 4RSSA 4LQMA 3NW5A 4IVCA 2O5KA 3MH3A 2WMUA 3NUXA 3O96A 4RT7A 4MF0A 5HVJA 2C0OA 2C47A 1PXPA 1J1CA 5IA2A 4WIHA 3QWJA 3G2FA 4O0SA 3F61A 4XG8A 5GHVA 4AXAA 4XG4A 3FYJX 4GFGA 3NCGA 1VR2A 2QOKA 2B0QA 5AUZA 3P79A 4K9YA 4I4FA 2WMTA 2PZYA 5BYLA 4BIDA 3LJ0A 1JOWB 2BTRA 3ZUVA 4DG0E 2IVUA 3GVUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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