4BCNA

Structure of cdk2 in complex with cyclin a and a 2-amino-4-heteroaryl- pyrimidine inhibitor
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
299
structure length
296
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/cell cycle
source organism Homo sapiens
publication title Comparative Structural and Functional Studies of 4-(Thiazol- 5-Yl)-2-(Phenylamino)Pyrimidine-5-Carbonitrile Cdk9 Inhibitors Suggest the Basis for Isotype Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2
total genus 83
structure length 296
sequence length 299
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bcnA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4bcnA01
2BRHA 5HG8A 3ZTXA 4CCUA 3VQUA 4QYFA 3QHWA 3KVXA 1P4FA 5DYJA 5FEDA 4ANLA 4R5YA 4GK4A 5IA1A 3ATTA 5IUHA 4G9CA 3DLSA 3IW4A 2XNPA 2GHGA 3MFTA 4Q9SA 5HCXA 4D28A 4EOPA 5HX6A 3VAPA 3QUDA 3SXFA 3Q5ZA 4FT7A 5IH4A 3RAIA 1ZOHA 1YHWA 4BCJA 5LVLA 5M51A 3MV5A 2YM3A 4DEGA 4BBFA 4IBMA 1J91A 2W1HA 3BWFA 1Y8GA 4YGAA 5EI2A 3HRFA 4Q2AA 2C1BA 3IOPA 5HD4A 3UMWA 4JG6A 2QC6A 4IB1A 1M2PA 1Z5MA 5AR3A 3ZONA 1XH9A 3SGCA 5A54A 3CY2A 4L68A 4IZAA 3PVUA 2XMYA 4GKIA 2Y4PA 3OHTA 2EB3A 3AMYA 3DBCA 2ZM4A 3MPTA 4EBVA 5DPVA 4TNDA 3RBWA 4G31A 5HCYA 1XWSA 4G6OA 4ZSGA 2WQEA 2XK7A 4LM5A 2V7AA 5AR4A 3P4KA 4YJRA 5EHYA 4QQCA 3CLYA 4HGLA 4C58A 2GNHA 2VO0A 3QBNA 5E90A 5JGBA 2B9HA 4O7LA 4FKOA 4GVJA 3IW8A 4YJPA 1ZARA 3PPKA 1GIJA 4DA5A 1YXUA 5H9BA 2YJRA 3RAWA 5C26A 4BN1A 3VBWA 3FLYA 3L8SA 3GC0A 2PVKA 4EH8A 1GZOA 5M4UA 4TYGA 3FEGA 4GFMA 4HW7A 5CVHA 2JKOA 4CMOA 3COKA 5LMBA 2C6KA 5GJGA 5AA8A 3MJ1A 4U80A 3A7JA 3EZVA 3G6HA 4Z16A 4BY9E 3BV2A 3RHXA 2OIDA 3ZUVA 2CSNA 1TQIA 2R3MA 4IIRA 4FVRA 4R77A 3JY0A 4Y72A 2ZYBA 1WAKA 3C4FA 3EOCA 3OCBA 3RPOA 3A62A 2QU6A 2JBOA 4BDDA 3ANQA 2X9EA 5LJJA 4P7EA 3NVKI 4EH5A 3S2PA 3HRCA 4CFFA 1A9UA 3BHHA 4DEDA 4AFJA 3Q04A 5M07A 2V55A 2O8YA 2ESMA 5AR7A 3LMHA 3D5UA 2UW4A 2WTWA 4RVLA 2C5OA 4FV1A 4W4VA 4YJNA 1QL6A 4W8DA 4XJ0A 4AT3A 3SLSA 2W9FB 4UWBA 5B2KA 4EORA 3NYNA 5I9VA 4CD0A 2R3LA 3LJ1A 2F4JA 3GU5A 4DLJA 3NRMA 4ASXA 3EYGA 3OW3A 3DNDA 3OEZA 1ZYJA 4RIWA 4JI9A 2BTSA 4YSMA 5E4HA 3PSBA 4XOZA 3FI3A 1OI9A 4H3PA 4FE2A 3H30A 2ITNA 2P3GX 3EIDA 4K2RA 4I0SA 4AW1A 1A48A 3GU7A 3RALA 5CU0A 2OK1A 4IANA 3OS3A 4YSJA 2EU9A 2HENA 2ZMCA 4RX8A 2PWLA 2XS0A 3MY0A 4KKEA 2B55A 3NUPA 2R3KA 3L9PA 3DXPA 3OC1A 2WTKC 2WNTA 2XIYA 4HNIA 4BZNA 5JMSA 2WOUA 5CASA 4NJDA 3KRXA 4PNKA 4DG0E 5M53A 3Q60A 3UNZA 3QTIA 3ZDIA 3W8LA 1LP4A 3BHTA 4I5HA 4QTDA 5DHJA 5KMOA 4J53A 3WI6A 5HLPA 3SV0A 2WTDA 3BYUA 4EQMA 2CNUA 3IO7A 4QQJA 4L8MA 4XP3A 4K77A 4Z55A 3DKGA 4TYIA 1H26A 5E1SA 4L00A 4ZTLA 1OIUA 5L3AA 4F9AA 4JDIA 2KULA 4BB4A 4AGDA 3NAXA 3ORLA 4D1SA 1OIQA 4UEUA 1XO2B 4WRSA 5CT7A 4X3JA 4BIBA 2Q83A 4N57A 5IQDA 3W2RA 4DG3E 3OOMA 4K11A 4MYGA 1Q8WA 4QNYA 5DR6A 3M2WA 2WMRA 4ANMA 4R78A 4K8AA 5A4CA 1JVPP 4ERKA 5EW9A 3QTRA 4RX7A 3V6RA 5HIEA 4FTCA 2EB2A 2CKQA 5KKRB 3HLLA 4ZY4A 2XRWA 4N70A 3TUCA 4QMSA 5ANIA 3Q4ZA 4BCMA 1WVWA 5CSHA 5DRDA 4MAOA 3OUKA 4MNEB 5EOLA 4D1XA 2OH0E 2RFEA 4I1ZA 2I6LA 5IA3A 3D4QA 3LPBA 1H1PA 4Z9LA 2GNJA 2RIOA 3DBEA 3QQGA 2CLXA 1S9JA 2OXDA 3JPVA 3FKOA 4AGCA 4LGDA 3QYWA 3LOKA 4KRDA 4O2PA 4FTAA 4IXPA 3KMMA 1PYXA 1ZMVA 3WIGA 4B9DA 3LFBA 2WO6A 4AZTA 4DHFA 1CDKA 3ROCA 3QX2A 5EKOA 5F94A 2JDSA 4L3JA 4F6SA 5CEKA 5IISA 3PE1A 4PX6A 4ITIA 5IZFA 2RF9A 3OBGA 1NA7A 4CQEA 3G6GA 3FMKA 4S31A 2REIA 4BDJA 5DH3A 3A8XA 4AE6A 2P33A 4B8LA 4ACMA 1J1CA 4LUEA 4E26A 3EQCA 4PWNA 2IW9A 2VTJA 5HTBA 1ZMUA 4OT6A 1H24A 4RIOA 3HZTA 2PE2A 2QD9A 5HTIA 4A4LA 2ZAZA 4C37A 2DYLA 2VWBA 3PVGA 4JX7A 4O83A 3AGLA 4KKHA 2UW5A 2XJ1A 4IB3A 4JBQA 4MHAA 3F5UA 1XJDA 2I0EA 4U6RA 2RKUA 2XKEA 4JJRA 3DFCB 4WSYA 4YZDA 3VJNA 1HCLA 4XV9A 4IVAA 3A4OX 5FD2A 4D2SA 3R8MA 3W1FA 4F9CA 1V0PA 3CQUA 5T3QA 5HVKA 3S0OA 4NKAA 2VTSA 2VTLA 5EH0A 3UNJA 1O6KA 3O8TA 4ONAA 5DR2A 4IAAA 3DKFA 3MDYA 4U5JA 5AP4A 4CYIA 2FSLX 2XKFA 5E8UA 1Q99A 3HMNA 4RIXB 2B1PA 3TUDA 5C4KA 3QRUA 2WU6A 4ALWA 4FKJA 2QOFA 3ODZX 1YQJA 2QOLA 2W1ZA 3D5XA 4FI1A 4PDYA 4KIPA 1FVRA 2J51A 3SRVB 4JDJA 3FLNC 4BBEA 4C33A 3TKUA 4F1TA 4MBIA 4HNFA 5CU6A 1DM2A 4LMNA 5HBEA 4BDFA 4PQNA 2XIKA 1GOLA 1W82A 4QOXA 5HBJA 3EHAA 3O23A 4KRCA 2VU3A 3I60A 2CGVA 4EOJA 1FGIA 3QX4A 2HY81 3UGCA 2R64A 1PXPA 5AADA 5BVEA 5KO1A 3ZZEA 4O6EA 2ZB0A 4R7IA 3ZBXA 1YOLA 4BDIA 1OKYA 3FE3A 3SX9A 4OLIA 4J8NA 4E3CA 5EYDA 2Z7SA 2UZWE 4C3RA 3A99A 3PXFA 3RZFA 3E8EA 4C2WA 5CY3A 4FK3A 2FH9A 4MWHA 4H1MA 3PG3A 2YCQA 4MK0A 4EK3A 2YM7A 4BHZA 4F0GA 4L67A 3NIZA 3SOCA 4HVGA 4J8MA 3G15A 3QQLA 3ZU7A 2UZDA 3EQGA 3FMJA 3QZGA 4I4EA 4M67A 4PUZA 5TKDA 3V5WA 1IA9A 3LQ5A 3MVLA 3ZLSA 4RJ8A 3CTJA 2CGXA 3R02A 1YDTE 4IB0A 4MVFA 2GS2A 3QTXA 2PMLX 3R73A 4PNIA 3W32A 3FSFA 2WMUA 4N0SA 3RZBA 2XJ2A 4H3BA 4E4XA 4V04A 4GYIA 5HVJA 1RJBA 1BUHA 5E8SA 2VTPA 2Y6MA 4YUQA 4ZJIA 4DTKA 1ZOGA 2ZDUA 1OUKA 2C3KA 2YWPA 3HDMA 3IONA 4R3PA 4USFA 2HWOA 2UW0A 4KS7A 5KMJA 2JITA 4YTIA 3ZZWA 5C27A 2BKKA 2YDKA 2QU5A 3CPCA 3EN7A 3ORMA 4EKKA 4TNBA 3UNKA 3C4WA 3KXGA 2OICA 5KMMA 3VRYA 3SHEA 3ZXZA 4EHZA 4D4VA 3DKCA 2WD1A 3LFDA 3G90X 3PG1A 4A4OA 5J7BA 1OM1A 4FZ6A 3KULA 2X9FA 2XNNA 3PZHA 4AZSA 4CG9A 4OT5A 5FBNC 4M84A 2ETRA 2JAMA 3GC9A 4BI2A 5BMSA 4FUXA 4L3PA 3C5IA 4F9WA 5K9IA 3I4BA 4BCNA 4X2NA 1GZ8A 2VD5A 2JAVA 4O0TA 1PKDA 2P55A 3UZPA 1XH7A 3RJCA 4FV2A 5FLFA 1IAJA 2RG6A 1KV1A 2JDTA 3LAUA 3R7GA 4FTOA 5CALA 1XH5A 3ORXA 2QOKA 5HCZA 4EK8A 4FG9A 3OWKA 4CMUA 5I9WA 4TT7A 5DLSA 3HL7A 2OSCA 3LIJA 5CEMA 5I9ZA 2X1NA 2UW8A 1JBPE 4XH6A 4W4XA 5KE0A 4HOKA 4FTJA 1E1VA 4LRMA 5FDXA 1ZMWA 4WOVA 1W0XC 5C8MA 4XBUA 3ZMMA 4S30A 4E4NA 4IX4A 3EQFA 3DZQA 4FGRA 3MI9A 2C6LA 2C4GA 4D9TA 3NUUA 1K9AA 3VUMA 3LCOA 1S9IA 3Q32A 4UB7A 2UW7A 5ICPA 3F7WA 5EI8A 1KWPA 2YDJA 3O8PA 3GB2A 3C0IA 3ZLXA 4ERWA 4FSMA 2BHHA 3AC3A 2BILB 3QTWA 5EHLA 1E9HA 2OJGA 3S1HA 3UOJA 4C3PA 1Q62A 4OW8A 4HVIA 4QD6A 3NS9A 4XG9A 4JNWA 5M4FA 4OBOA 3MH1A 4Z3VA 4M7IA 3VBYA 1FOTA 5CXZA 1REJA 3QFVA 3CS9A 4CLIA 5AP1A 5GNKA 4BI0A 4M8TA 3R0TA 4K1BA 3DJ7A 5CSWA 5CENA 3IPHA 3EYHA 3NDMA 4OAVB 2PSQA 3FDNA 4FZAB 3QLGA 4CZYB 1VYWA 2WTJA 3OXIA 4O0VA 5BNJA 4GFGA 3C0HA 3KCKA 4AWIA 4G9RA 1TVOA 2W1FA 4Y5HA 4FNYA 3HGKA 4KIQA 5HNBA 3TZ9A 4FL3A 3UIUA 1CM8A 4QMPA 4C4IA 4A7CA 3EQHA 3WYXA 3VO3A 4C4JA 5AAGA 3QAME 4D0WA 3UC3A 5AUXA 4M15A 2YCFA 3ORNA 1IEPA 2BRGA 2UZBA 3R8LA 1F3MC 4MKCA 3TUBA 3IG7A 3CC6A 3IOKA 4QQTA 4USEA 4IJPA 5EDQA 1G8AA 1OGUA 2O0UA 4ZTNA 2PUPA 4R7BA 4PF4A 2OXYA 2EXCX 4UY9A 4TY1A 5EI6A 4L46A 4EOMA 2ITUA 3OT8A 4G17A 3QD3A 4H1JA 1YRPA 4EWQA 1PXLA 3FLZA 4ACCA 1JPAA 3QC9A 3LKMA 1WBNA 4YLKA 5IMEA 1OPKA 2GQSA 1M7QA 5EDPA 1JSUA 3VRZA 4KS8A 3E92A 3SDJA 2HZNA 5E8ZA 4C4GA 4L7SA 3AQVA 3ORKA 3TTJA 4A9SA 3UC4A 5H3QA 4ZTQA 3LW0A 4CKIA 4FKLA 4EL9A 3F6XA 2WOTA 4QMXA 5CAPA 4E4MA 1GNGA 4ZXTA 4ZK5A 2OZAA 3LZBA 3CXWA 4IAZA 4YZ9A 3ZO3A 2QR8A 3BQCA 3ORTA 4RJ4A 4YPSA 4YMJA 3VS6A 4I6QA 5CEPA 5I9YA 3RK7A 2BTRA 4LQMA 3BBTB 1WMKA 3I0OA 4JT3A 3P23A 1M7NA 3QQJA 5K0KA 4EBWA 3U4WA 4BL1A 1YXXA 3JS2A 2XBAA 3UVPA 1H4LA 4KA3A 4TWCA 4DT9A 4FKSA 4O27B 2X81A 4XV2A 3POOA 4FTIA 3WF8A 3OCGA 3GOKA 2JGZA 3N9XA 1OL6A 5AP7A 5D7AA 3TNQB 2ITOA 5E8TA 3PVBA 5E91A 4AE9A 5GZ9A 4FSZA 2CGUA 4YC8A 5E1EA 5L2WA 4G34A 5JEBA 3VBQA 2IVTA 4RBLA 2Z60A 3MIYA 3L9NA 4U41A 5ANOA 1WCCA 2BRBA 3VN9A 2V22A 3REPA 5HOAA 2Y0AA 5DOSA 1OKZA 3AMAA 2VWVA 4PDPA 1NXKA 2QCSA 1GY3A 4CFVA 4W4YA 2WTCA 3I79A 2UZVA 3E3PA 3LXLA 2R0IA 3D9VA 3KGAA 4BGQA 2EWAA 2W05A 2WKMA 5F95A 4NCTC 5KBRA 1OECA 3NUAA 5L8JA 4LG4A 4IWPA 3KQ7A 4M13A 2ZVAA 1BX6A 2J0LA 4TYHB 3EFLA 4YBJA 3RM7A 4ALVA 2BDJA 1O6LA 4EZ3A 2WPAA 5A4LA 1PY5A 5KZ0A 3L8XA 3OY1A 4Y83A 4ENYA 3MFRA 3U6HA 1UU8A 2A1AB 4Q5HA 4OTPA 4YC6A 4I6BA 4YP8A 3EMGA 1ZRZA 4NM7A 3PXYA 4EONA 1R0EA 1AQ1A 4F65A 3QUEA 3BV3A 2CCHA 2JKMA 3DCVA 4FTKA 4KBCA 4O0YA 4EOQA 3P08A 3ALOA 3OG7A 4LFIA 4WUNA 3ZC6A 4F0IA 4F1OA 1W8CA 3AC8A 3RVGA 4AAAA 4NW5A 4WNOA 5B2MA 3IDBA 4WSQA 5JFWA 4CVAA 5E8YA 3U9NA 5HE2A 4HZSA 3GGFA 4H3QA 4I4FA 4RVTA 3W2QA 4F9YA 1V1KA 3G33A 4FZDB 3TIZA 4ZTRA 4YU2A 3D94A 2BHEA 2BR1A 3QTQA 3VIDA 2DS1A 3R04A 2J90A 4MXAA 3W18A 4DTAA 5A6OA 4ZSJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BRH A;  5HG8 A;  3ZTX A;  4CCU A;  3VQU A;  4QYF A;  3QHW A;  3KVX A;  1P4F A;  5DYJ A;  5FED A;  4ANL A;  4R5Y A;  4GK4 A;  5IA1 A;  3ATT A;  5IUH A;  4G9C A;  3DLS A;  3IW4 A;  2XNP A;  2GHG A;  3MFT A;  4Q9S A;  5HCX A;  4D28 A;  4EOP A;  5HX6 A;  3VAP A;  3QUD A;  3SXF A;  3Q5Z A;  4FT7 A;  5IH4 A;  3RAI A;  1ZOH A;  1YHW A;  4BCJ A;  5LVL A;  5M51 A;  3MV5 A;  2YM3 A;  4DEG A;  4BBF A;  4IBM A;  1J91 A;  2W1H A;  3BWF A;  1Y8G A;  4YGA A;  5EI2 A;  3HRF A;  4Q2A A;  2C1B A;  3IOP A;  5HD4 A;  3UMW A;  4JG6 A;  2QC6 A;  4IB1 A;  1M2P A;  1Z5M A;  5AR3 A;  3ZON A;  1XH9 A;  3SGC A;  5A54 A;  3CY2 A;  4F78 A;  4L68 A;  4IZA A;  3PVU A;  2XMY A;  4GKI A;  2Y4P A;  3OHT A;  2EB3 A;  3AMY A;  3DBC A;  2ZM4 A;  3MPT A;  4EBV A;  5DPV A;  4BJJ B;  4TND A;  3RBW A;  4G31 A;  5HCY A;  1XWS A;  4G6O A;  4ZSG A;  2WQE A;  2XK7 A;  4LM5 A;  2V7A A;  4O4D A;  3P4K A;  4YJR A;  5AR4 A;  5EHY A;  3W0P A;  4QQC A;  3CLY A;  4HGL A;  4C58 A;  2GNH A;  2VO0 A;  3QBN A;  5E90 A;  5JGB A;  2B9H A;  4O7L A; 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