4BDFA

Fragment-based screening identifies a new area for inhibitor binding to checkpoint kinase 2 (chk2)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
304
structure length
285
Chain Sequence
MSVYPKALRDEYIMSKTLGGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-Based Screening Maps Inhibitor Interactions in the ATP-Binding Site of Checkpoint Kinase 2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
total genus 87
structure length 285
sequence length 304
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bdfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4bdfA01
2XK7A 1IA8A 4L3LA 2CGWA 2X6DA 3CTHA 4R5YA 5IQCA 3B8RA 4ZTSA 4TKSA 4XG9A 1Q61A 4JG7A 3O2MA 4ZEGA 4FKTA 4DEDA 4DG3E 2VAGA 5GZ8A 3V6SA 3LKMA 2GHGA 5F94A 2G2HA 4JBQA 1JKKA 2JBOA 4JQ7A 3EFWA 4EOQA 1OKWA 4H1MA 4EL9A 4ARKA 5CVFA 1YW2A 4EQUA 3IDCA 5HE1A 5AADA 5CEKA 2C6DA 3QGWA 2ZJWA 1XHAA 1T46A 4RWLA 5LCKA 5DOSA 4RVKA 1O6KA 3EQRA 2RKUA 4KBAA 5F95A 3FBVA 4XOZA 3GEQA 4M0ZA 4C4HA 3UC3A 4FZ7A 4XRJA 3UVPA 2F2CB 4JDHA 1U54A 5M06A 2W4KA 4GU9A 3QUEA 4J52A 2F4JA 4F7JA 2CLQA 4YZDA 3OT3A 4XOYA 5DI1A 4C61A 4C8BA 3DLSA 5IMXA 4OAUC 1YVJA 2BUJA 2PULA 4B0GA 4R3PA 4R7BA 3FMJA 3O51A 2F9GA 2GMXA 2EXCX 3FMEA 4JVGA 4JI9A 3E93A 4K6ZA 5CU2A 1JKLA 3F3UA 5AP3A 3C9WA 5FXSA 3VBTA 3LIJA 2C6LA 2QOLA 4YJRA 5IQFA 4FTOA 4K11A 3LCDA 4H1JA 2ITUA 1CKJA 4E3CA 3H0ZA 2BAJA 4J97A 4XYFA 4IC7A 4IX4A 5HU3A 2R64A 4FT7A 4FV8A 2HXLA 2HW7A 3S1HA 2Y9QA 1YHVA 2C6EA 2WAJA 1PKDA 4BICA 5M4IA 4B6LA 2IWIA 3SKCA 4HZSA 4EQMA 1IAJA 3KXGA 3C7QA 2YM4A 2YDKA 4YC3A 4G9CA 3BQRA 3F88A 4RJ5A 5C01A 3BU3A 1Q24A 3F5GA 3PA3A 2B9JA 3G0EA 4FNXA 5K3YA 2PYWA 4FIIA 1UNGA 2WTJA 4PTEA 4NSTA 4RVTA 2QR7A 4IZ7A 4G6LA 4WUAA 4NFMA 3LFNA 2IG7A 5K5XA 1ZYSA 1STCE 2A27A 3HX4A 5EM5A 3QUDA 3O7LD 3DS6A 3P0MA 3V5QA 1JSUA 3CY3A 3MSSA 3R1YA 4KAOA 5EI2A 4FEUA 4XG4A 4IANA 5DT4A 4FZAB 1MQBA 2VTRA 1WZYA 3DDQA 4IM2A 3R30A 4U79A 3IGGA 2XK8A 3E8NA 3OHTA 4NL0A 2I0YA 2QU6A 1WBWA 1ZY5A 3QL8A 2R3QA 3VAPA 4W4VA 2Y6MA 5AA9A 3F2RA 2EU9A 3W2RA 4DH8A 3LCSA 3TDVA 3ZXZA 4CZUA 2OFUA 3D2IA 1W7HA 4HCVA 5IA5A 1H26A 3RMFA 2C5OA 2IJMA 2J5FA 3E87A 4LV5A 1H0VA 4E5AX 4ERKA 2YIWA 5CNNA 4ZIMA 4DGMA 4NCTC 4E5BA 1QPCA 3AGLA 5E1SA 3EL7A 5FBOA 2PZRA 2P3GX 4YTFA 2PMLX 4N6ZA 4PMMA 2YEXA 1GOLA 4UZDA 3FY2A 3TZMA 1PMEA 3MW1A 2OBJA 4F6SA 3PP1A 4EQCA 2F57A 3I7BA 4LI5A 2JIUA 2VWUA 1PXIA 3KF4A 4GK3A 5FD2A 5HX8A 3ATSA 1UV5A 4F1TA 4KS8A 3FQHA 5CF6A 5KNJA 4QP7A 1BMKA 2AC3A 2R3PA 4KKGA 4LL0A 5JZNA 3RNIA 4AOTA 4WSQA 3VS7A 2XF0A 2W96B 2ITNA 3D5XA 3KU2A 4R3RA 2VTLA 5G1XA 3WYYA 2GS2A 3FZRA 4QMPA 3A7FA 3ZSHA 3LM5A 2EXMA 2VTNA 5E7RA 2DQ7X 4FV9A 2CNVA 3D4QA 3P23A 3C5IA 5H8BA 2P0CA 4JL9A 2WMWA 4ZZNA 4XV1A 2WOTA 2WD1A 3UC4A 3A7JA 3SX9A 1X8BA 3A60A 3P7CA 4YZ9A 2WQOA 2QO9A 5FGKA 1O6LA 1JQHA 3GT8A 4QQTA 4FGRA 4YLLA 5EFQA 3EL8A 3R73A 1PXMA 1NVSA 3PXZA 2BRNA 3P79A 5HG9A 3ULIA 1YHSA 3DJ5A 2YACA 2JEDA 1ZARA 4XG7A 1SYKA 3H3CA 3LFEA 2OK1A 2IW6A 4FUYA 4O0XA 4IZ5A 4WG5A 1MP8A 2UZOA 3R83A 4RA4A 3R9OA 5L2SA 1LP4A 5E9EA 5HVYA 1UKHA 2ZM1A 2BRMA 5HE2A 2OICA 2XBAA 3A8XA 3DAKA 4QYFA 4FZ6A 4XG2A 3I4BA 2JKQA 2I6LA 1PJKA 4XV3A 3HDMA 2Z7QA 5FP5A 4OR5A 5CANA 4E26A 1OL7A 2OG8A 3ZRLA 4E7WA 2XK4A 4DCAA 5HEZA 1BKXA 4AN3A 1OL2A 3WBLA 3IW6A 4ANBA 4XBRA 4BCHA 5IH4A 3N4UA 3AD5A 5CENA 1M2PA 4JX3A 3I79A 3LCKA 5BNJA 4RIXA 4W9WA 2NRUA 3FKLA 4XG6A 4GRBA 4KINA 4WRSA 3PZEA 1GY3A 5CAOA 1PMUA 2CCIA 4U7ZA 3ZDUA 3ZEPA 4BI2A 1B38A 2YIQA 5M4CA 2GDOA 4IZAA 2R3IA 5CSPA 2BILB 4LGGA 3ZRMA 4YUQA 2WTKB 3CCNA 2ETRA 4MEDA 4KKEA 5EW8A 3C1XA 3V8TA 4ZJVA 4DT9A 5L6WL 5HIDA 3DT1A 4MBLA 5EOLA 5E8UA 3R9NA 2XJ0A 3TV6A 4ASDA 2YN8A 3MA6A 3DB8A 2JBPA 4IJPA 4MNFA 3NVMB 5JMSA 2CDZA 4X2NA 5EQPA 4EK4A 5HCXA 4WG4A 1OKZA 4ZP5A 2C3JA 3DBEA 2XB7A 2BKKA 5EOBA 3KY2A 4MXOA 5J5TA 3BHHA 4IMYA 4ZSJA 4O7LA 5EK7A 4AE9A 3M2WA 3GOPA 3TJDA 4RJ4A 4L42A 3QCXA 5L2QA 3VWAA 1OUYA 3IS5A 5HTIA 5IA4A 2OFVA 3LXPA 5FM2A 4BDKA 1JKTA 4I6HA 4NM0A 3SW4A 4U44A 3FV8A 4Q5HA 4A7CA 1RJBA 4OLIA 4ANOA 1A9UA 4D2RA 4RC3A 4U42A 3TIZA 4JG6A 5DHJA 5FXRA 3S0OA 4FKVA 3SC1A 3EFKA 4FV3A 3MESA 2PVYA 4IWQA 3T9IA 3ODZX 4FNWA 3RZFA 3PPJA 5H8GA 5L2WA 3QRUA 4Z7HA 3ALOA 2YDJA 2QNJA 5HOAA 2RGPA 3OOGA 4CV9A 1YXXA 3HL7A 5EDQA 3FL5A 4FKPA 2IVVA 1OIRA 4FODA 5D12A 3AD4A 4RZVA 3NEWA 4QYHA 5CSVA 3GXLA 5KHWA 4YJUA 4NCTA 3TUBA 3GCUA 1ZYLA 2C6OA 1W98A 5C1QB 5EM6A 1WBVA 4L67A 3ZM4A 1H01A 4FUXA 2X8EA 4C4FA 1BLXA 4QMTA 2PU8A 1ZYCA 1V0BA 3JXWA 4M15A 1V0OA 4N4SA 4IXPA 2GNHA 4O2ZA 3MVMA 3FMHA 5M4FA 3NAYA 4DEIA 2VTHA 3BYVA 2UW3A 3H0YA 3FLYA 3IONA 1ZYJA 3R0TA 2C1AA 4I92A 1WBNA 3QWKA 3DK3A 3QZIA 2W1FA 3PVWA 2BIYA 5JGBA 3AC1A 1YOMA 1YI3A 5ANGA 4IH8A 2C0IA 1R3CA 4C36A 4C4JA 4XUFA 2R3RA 3PYYA 2OI4X 3SOAA 3E92A 3QUPA 2WMTA 3UZPA 3WYXA 4GG5A 3VUDA 3DZOA 3QYZA 3C4ZA 5JKGA 1H1SA 3FI3A 5IQEA 4TYHA 4U9AA 5IG1A 3FI2A 3DKCA 2C3KA 1Q4LA 4C34A 5KBRA 3U55A 4XH6A 5BVNA 3ORMA 3P7AA 3R8MA 1KE9A 1H08A 1P4FA 3QRTA 3LPBA 3Q5IA 3RAWA 2YDIA 5HVKA 5AP0A 4O7WA 4D4VA 4KRCA 2KTYA 2WIPA 2BZIB 4O2PA 4OTRA 1VR2A 3UIUA 5F9EA 2LAVA 1GIHA 3FLWA 5AP2A 1G5SA 2GFSA 4JXFA 1P2AA 2X8IA 2A0CX 3CP9A 5H3QA 3TTJA 4KBCA 2QOKA 4CFUA 2GU8A 1PXLA 3VS1A 1Y8YA 4X2FA 3TNHA 1OPLA 3NUXA 2WIHA 3QKLA 2YM6A 1H28A 5AIKA 3NVKI 4M14A 1GAGA 3WI6A 4R8QA 4FV7A 4O0SA 4X7QA 3UOLA 2BDWA 3LFQA 2W9ZB 3COKA 4NWMA 3FZSA 4Q9SA 4L00A 4XMOA 1UU9A 3ENMA 4A9SA 3VW6A 1ZMVA 5A14A 5LWNA 5KKRC 2BZJA 4ZSAA 4M13A 5CZIA 3SXRA 2H6DA 3EJ1A 2WMAA 3CD8A 3MTFA 4DC2A 5HVJA 5M51A 3MB6A 1F3MC 2P4IA 2F2UA 2R0IA 3I60A 3NUPA 4K2RA 2W1DA 3K54A 4CCBA 5CAVA 2Z2WA 4BIDA 4F08A 5GIOE 5FDPA 3Q2MA 2PY3A 5HNBA 3ODYX 5KMNA 4DFBA 1R0EA 3TJCA 1W83A 2UW7A 3ET7A 4J98A 4P5QA 3RCJA 4FBXA 3QD2B 2UVZA 3NW7A 1ND4A 4YP8A 3VC4A 4X21A 3F5UA 4JLCA 4LOPA 4ID7A 3PXRA 1FQ1B 3OTUA 3ULZA 3QTWA 3O71A 3JPVA 3EQPA 4YC6A 5J8IA 4JIKA 3F5XA 4Q9ZA 2PZ5A 2OW3A 2V22A 4JQ8A 2PMOX 3A4OX 2YCSA 3QAME 1YOLA 3R2BA 3AC2A 2I1MA 2Y7JA 4TYGA 2C47A 2W9FB 4LM5A 3SD0A 5T3QA 2JDTA 3F2NA 3FC1X 3O7LB 4YBJA 3PA5A 3KA0A 3DV3A 4ITJA 2FSMX 2GQSA 3FI4A 5ANJA 5EYDA 3VHEA 3DPKA 4PX6A 4KD1A 4J8MA 5CLPA 3GC0A 2VTIA 1FGKA 2JDRA 2Z7LA 4MNEA 4RWKA 3E3PA 5AM6A 5GJFA 4Z7GA 4XG8A 4RA5A 4PP7A 2JAMA 3VBYA 4O7NA 4BDGA 4GK2A 5JGAA 4FC0A 4L6QA 2VUWA 4EOOA 3QTIA 4GKHA 2A2AA 3PA4A 3R21A 4P90A 2BHHA 2ITQA 3KMMA 3GCSA 5FEDA 4BTJA 1IR3A 1OUKA 3KULB 2ITZA 3ZOSA 1J91A 1KE6A 3NUYA 2OXDA 3BQCA 3BLHA 3NW5A 4FT3A 5CXHA 4AGUA 3LM0A 2H96A 3OBJA 4LUEA 2FB8A 3Q9ZA 3PJ3A 4F9WA 2BR1A 4RVMA 4GFGA 4KS7A 2R3HA 3UMXA 5KMJA 3MYGA 1YQJA 1J7UA 5IZFA 3DDPA 1I09A 4V0GA 4W8EA 1PYXA 4Y85A 4BRXA 5FTGA 3A99A 3N4VA 2ERZE 2QLQA 2PVKA 2PK9A 1NW1A 5FG8A 4EH2A 4YSJA 4EZ5A 3CGFA 2WTVA 4N70A 2WXVA 4I6FA 3R1NA 2NP8A 2ZMCA 3F69A 4FTJA 5JEBA 1YDRE 3IW4A 5D10A 4PDSA 5A54A 1L8TA 1E1VA 2B55A 4C3FA 3JY0A 5I5ZA 1GZ8A 2P33A 3C0GA 3SRVB 2G1TA 2O8YA 2ZMDA 1LUFA 2PVLA 3OCGA 4X6QC 1FBNA 4Y72A 3U8WA 3ZSGA 4AA5A 4AS0A 2YIRA 3VUMA 3WF8A 4UEUA 3TV4A 2YJRA 3KKVA 4M66A 4EUTA 5AWMA 3VUKA 3QGYA 1T45A 5EYMA 4DT8A 3EIDA 3QQKA 1ZOEA 5AJQA 1YDTE 3A62A 4XHKB 4O0UA 5DRDA 4IAAA 1OL6A 3OWKA 4F63A 5C8KA 3RZBA 3CIKA 2VTTA 2HZNA 4FKUA 5IEYA 2EXEA 5EKOA 2E9PA 2BIKB 4LQMA 4QT1A 5J9LA 4IDTA 1XBBA 2W5AA 4MXXA 4QYGA 5TOZA 2YWVA 4FX3A 1UU3A 5BVKA 2OJ9A 3PE1A 3PWDA 4G2FA 4AGCA 5M07A 1YWNA 4C35A 4Y83A 3Q3BA 2J4ZA 4NH1A 5JN2A 1W82A 3PRFA 3FLNC 4L43A 5DBXA 5HG8A 4CLJA 1IAHA 1S9JA 4I1ZA 1O6YA 4X2GA 3RINA 2JGZA 5AUZA 3ZO1A 4AZFA 3QFVA 4GS6A 3U4WA 4AZEA 3I0QA 2F7EE 4F7NA 4M69B 1K3AA 2X4ZA 4OTGA 1TQPA 4M97A 3KL8A 5HG7A 4EHVA 1G8AA 2XM8A 5A3XA 2PHKA 3D14A 4GYIA 5DNRA 3ZCLA 4FYNA 3WARA 4U40A 4WBBB 3VHKA 4DBNA 4GT4A 5HICA 5T6KA 1MQ4A 2R3OA 2VO3A 4RQVA 2WMUA 3PY0A 4U43A 2GCDA 4AACA 2QO2A 5CAUA 3UO5A 3CPBA 3NUUA 2WMSA 2FA2A 4IB5A 4DFXE 3NYNA 3IW8A 2QHMA 3FKOA 2O5KA 2OIDA 5A4QA 1B39A 2X2LA 1U59A 2FUMA 4FIHA 4U97A 3R7UA 4FYOA 1SNUA 4EC8A 4F99A 5C27A 3RPRA 4CQGA 5HO6A 4FKIA 3PIYA 4NM5A 3PSDA 5CEIA 4O6EA 4RIOA 3NNXA 3PG1A 2VWBA 2E9VA 1QL6A 4PTGA 3RHKA 3PPKA 3VQUA 4PMPA 2CLXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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