4C33A

Pka-s6k1 chimera apo
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
338
structure length
335
Chain Sequence
ESVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSYGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVLEYLPGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLMIDQQGYIKVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Discovery of Potent Ribosomal S6 Kinase Inhibitors by High-Throughput Screening and Structure-Guided Drug Design.
pubmed rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA
molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 108
structure length 335
sequence length 338
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4c33A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4c33A02
3NYVA 2PYWA 4G5PA 2XYNA 3GCQA 3EQFA 3OCGA 3ID6C 3QCYA 3DA6A 4JI9A 4UY9A 4HJOA 4KSQA 3S3IA 3TG1A 4ANLA 5EHYA 2C6KA 2FGIA 3GCUA 4YP8A 5BYYA 3GU8A 2B55A 4XRLA 5HCXA 4U8ZA 4YZBA 5LJJA 2ZM3A 4OW8A 4I0TA 1IG1A 1QPJA 4NW6A 5CEIA 3TKHA 1F3MC 1EH4A 3DU8A 4DFZE 3BHTA 4UMRA 2PVNA 1BI8A 2WAJA 4YHJA 4O2PA 4EQUA 3NUAA 2WFYA 4MWIA 5HO7A 3VS2A 2JLDA 2ZV8A 1FGKA 2VU3A 3PVWA 5CVHA 3PP0A 2FA2A 4AWIA 5TE0A 4FT7A 2W9ZB 4HYSA 2HK5A 3WILA 5M51A 3UIBA 4PWNA 4EBWA 1TVOA 3FBVA 4E4NA 5A6OA 4PMPA 4JNWA 4PL4A 5EQEA 3ZO4A 3BHYA 1M7QA 3OCSA 4IX3A 4YJTA 3ORIA 3GOKA 3ORLA 3NCGA 1XH9A 3UNKA 4QP1A 3R9OA 3TNQB 4EL9A 4GV1A 2QOOA 5A46A 3KCKA 3CTJA 4MBIA 3DLZA 3H9FA 3TZ7A 2YCFA 4I23A 1WVXA 2JD5A 1YOMA 4AT3A 4D58A 4GCJA 4BCGA 2P3GX 4KIPA 5KMKA 2I0HA 1P4OA 3BGZA 3OXTA 4DLJA 2RIOA 2VZ6A 5L3AA 1BI7A 2F4JA 1T45A 5LVPA 4YJOA 2GMXA 2VAGA 4W4XA 2X7FA 4CMOA 4O7VA 4NJDA 1JSTA 2C5YA 2CLQA 5CVFA 1WBNA 5JN2A 1IRKA 4I0RA 5CU6A 2J5EA 3P7CA 3B8QA 4S30A 4ZSGA 4EZ5A 2BAQA 4IVDA 4P5ZA 4PPBA 5K3YA 4HVHA 3P1AA 5HO8A 1KE5A 3AMYA 4YJQA 2VTJA 3MB7A 5EOBA 5ETCA 4CFFA 3Q5IA 4MNEB 2XH5A 4EH6A 4D9UA 3ZLYA 2PVFA 4KD1A 2VUWA 4AS0A 3FMEA 4OLIA 4N0SA 5BVEA 4M0ZA 3GQLA 4X2NA 3QLFA 2VTNA 4QYEA 4AG8A 2LGCA 5CY3A 3QQKA 3BGPA 1PYEA 5LMAA 4GJ2A 3I5ZA 1KV1A 4EHGA 2J90A 2OJIA 3ZLXA 4EOSA 4KIOA 2XMYA 1OL2A 4L43A 3SVVA 4XV9A 4PUZA 3LFBA 4FV7A 2FSMX 3ZU7A 2BZKB 1H00A 2OW3A 3ZLWA 2QOHA 1ZMVA 3AC1A 1XR1A 3QD2B 3KCFA 3CJFA 3MBLA 4PTGA 2ERZE 5CF4A 1GIJA 4O91A 2Z60A 1VEBA 1IR3A 4L46A 4M97A 2PE1A 4FKUA 4N57A 2XA4A 2I40A 4FT0A 5AP1A 3SHEA 2BZIB 4A4OA 5GIOE 2GHMA 3HX4A 3BZ3A 4JQEA 4F0GA 3QC9A 3BKBA 3ZFMA 3BELA 5E8TA 2WQOA 2WEVA 2X81A 3CQWA 2KTYA 3NNVA 4YZMA 4EK3A 3O23A 1Y57A 4O2ZA 3RHKA 2AYPA 3DFCB 4HYUA 4RX8A 5CX9A 4O0XA 1LEWA 2WMTA 1JKSA 3COIA 4FV5A 4CCBA 3QTIA 3IDBA 5AR4A 5FP5A 3PFQA 4YZ9A 4LM5A 3D15A 4UXLA 1XH4A 4OT6A 4NFNA 3VRZA 3ZSIA 2FSTX 3GGFA 4ANSA 4BL1A 5M53A 2Y8OA 2X2LA 3AT3A 3SA0A 1IAHA 1YQJA 4O0YA 1SM2A 2Y7JA 4OBQA 3RJCA 5K4JA 4BN1A 3U4WA 4DGMA 2R3NA 1RDQE 2B1PA 3HNGA 5EI6A 3EFWA 3LIJA 4FUXA 4FL3A 4OBOA 4W4VA 3UE4A 4CFVA 5I3OA 4DEGA 3S2PA 4C61A 3OROA 1BX6A 3QGYA 3WF5A 4TXCA 4O96A 1YHSA 2HXLA 4WNKA 4XH6A 3MH3A 3JXWA 4JDJA 4XS2A 4O1PA 2XIXA 4GJ3A 4TN6A 5EW8A 4Z7GA 5LARA 3SGCA 1QCFA 2PE0A 3QYWA 3OUKA 3F2AA 5K4IA 3LLAA 3DBFA 2WB8A 4BCPA 4GK2A 4QTAA 3MW1A 1BL7A 2YISA 4V0GB 4KRDA 4BDJA 3PPJA 3PIXA 3N4VA 2NRYA 3Q9ZA 1ZARA 2DWBA 4M13A 4OGRA 3R00A 3QTWA 4GVJA 3UC4A 4D1SA 4EK6A 4U42A 1H4LA 1YDSE 2R4BA 4P4CA 5B2KA 4QOXA 3T8OA 4DC2A 3FV8A 5IA3A 1Q8TA 4BGGA 3RK9A 3C50A 2PZIA 1IEPA 1LUFA 1ZYCA 4MD7E 2JITA 2W9FB 3SG9A 2WEIA 1WCCA 3F88A 4TYJA 4ACGA 4E5AX 4ZMEA 2JFLA 2O2UA 4D5HA 3QCSA 4FG9A 4JAIA 3I60A 4DG2E 3K5VA 5EI2A 4IH8A 2YERA 4UYNA 1L8TA 3G9NA 4QPAA 4ZAUA 5JGAA 5EI8A 2OLCA 4EKLA 2RFEA 2WELA 4Y83A 2ZDTA 3EWHA 3AC5A 3FLYA 2IWIA 2JIIA 3FYKX 3L8PA 5AUYA 4DEAA 1H1QA 4U97A 2R5TA 5AP2A 4HGLA 1PMVA 3UMWA 4E6AA 4B0GA 4O6EA 3VUHA 5C27A 5CU3A 5E8ZA 1IASA 4WHZA 5CU2A 3RTPA 3PXKA 1FMOE 1OL1A 2ONLC 3DJ7A 2CHLA 3ZS5A 4B7TA 4I5CA 3O50A 2W1CA 3E92A 5AADA 5DT3A 4XBUA 4BCHA 4JX3A 1ZYLA 2WNTA 3OCBA 4R5YA 2B9IA 2OSCA 4IZ5A 2PUUA 3QZFA 4TKSA 3VAPA 3HV3A 3VUGA 4L7FA 3ZBXA 3TDVA 1JWHA 4E26A 4ORKA 3E5AA 4JQ7A 2ZV7A 4J71A 4RQKA 3SAYA 3D2IA 4EOIA 1O6LA 5HU9A 3R73A 3MY1A 3A7GA 3TZ9A 2PMIA 4EONA 5AIKA 2X4FA 3OFMA 3F2NA 4QMUA 1AGWA 4F7NA 2WQEA 3NIEA 3RAWA 2C6EA 4TYGA 4X0MA 5B0XA 3R8LA 1ZLTA 1H01A 3DKGA 3ZCLA 3S0OA 3PXZA 3FMHA 1QPEA 4QMYA 5IUGA 4ASZA 4BBFA 3HDMA 3ET7A 1QL6A 4O81A 3FXWA 3HLLA 4NTSA 3WARA 3AQVA 4CNHA 3H9OA 3II5A 2RF9A 4HVIA 5EM7A 3GI3A 2R3FA 3MY0A 1SYKA 2UW9A 4GT4A 3ITZA 3KXGA 5A4LA 4QNAA 3MFRA 3THBA 3MTFA 2GNIA 4FKOA 3R8UA 2J51A 3K3JA 4IVBA 3PDTA 3DDQA 4AX8A 5CF5A 3IK3A 5I0BA 1R3CA 4D0XA 5AR8A 5IQFA 2XUUA 4O0VA 4P90A 4U0IA 4O0RA 5IF1A 2O63A 4JR7A 3OHTA 4M69A 4QP8A 5IA0A 4NK9A 4OTDA 3GQIA 3UOHA 4F6UA 4LGHA 2GQSA 4PRJA 4UWYA 1UWHA 1GNGA 4YURA 4WIHA 5CSWA 3HV4A 5E9EA 3UP2A 4TNDA 2YEXA 3EB0A 3NEWA 3UO4A 4IB0A 5KCVA 5KMOA 4FEQA 4HZRA 5LQFA 4K8AA 5D7AA 1OUYA 2ZOQA 4ZJIA 3O2MA 4XG4A 3VS4A 5M56A 2E9NA 2C5NA 4WNOA 3S1HA 4WOVA 2PVRA 3SDJA 1IA9A 2R3HA 3V6RA 2ZYBA 5HE0A 4D2SA 5EM6A 4GS6A 4FTRA 3QQHA 5L6OA 5D10A 4A4XA 5IEYA 4WG5A 3G90X 3LCKA 1Z9XA 4KBCA 3UVQA 4GMYA 3HZTA 5H8EA 3FZOA 2GNJA 4QYHA 4CFXA 5D7VA 3VVHA 5L6PA 4C4HA 2P4IA 4DF3A 3LQ3A 3QQFA 5ETAA 4FF8A 2GS6A 2ITVA 4ITJA 5FBOA 3OEZA 5EDRA 1J7IA 3RBWA 5LMKC 1V0PA 3I5NA 4L44A 4CT1A 2OBJA 2VO0A 1WBTA 4UXQA 4H3BA 5AUXA 5IDNA 4NYEA 5EYCA 1XJDA 3UTOA 1XBAA 1DAYA 4GG7A 2CGUA 3BLHA 3DZQA 2UZOA 2VTOA 3DK3A 3I0OA 3FI3A 3OEFX 4RJ6A 3D14A 3UZRA 3TV7A 2QKWB 3BU3A 1XBCA 2VO6A 4M0YA 2OXYA 3Q53A 4XOYA 2UW7A 3G33A 4EUTA 5J1WA 2I6LA 2X9EA 4AZFA 2X7OA 3K5UA 2F7XE 3BRBA 4Z3VA 5IU2A 5IUHA 3O7LD 1XKKA 3D94A 3HRFA 5H8GA 5FRIA 3CP9A 4E4XA 3RWPA 4EOOA 2VWIA 3A7FA 4F99A 1VJYA 1PXOA 1Y6AA 3RINA 3QQGA 3SXRA 4LI5A 4I93A 4UMQA 2CMWA 4GH2A 4DH8A 2YACA 4UALA 1PW2A 4HCTA 4ITIA 4MK0A 5DOSA 3FY2A 2YZLA 1H26A 3CSVA 3CQUA 3BYVA 2DUVA 2GS7A 3V04A 4O86A 4WD5A 1YDRE 2RFDA 4GRBA 5HO6A 3A7JA 4I5MA 3W8LA 5AUTA 4NCTC 4O38A 4G6NA 3R28A 4FTJA 2BHHA 3A99A 3MFSA 4KABA 5H3QA 3R7VA 4NWMA 3TIZA 2YIQA 2RFNA 3TNHA 4L42A 3ZO3A 3KXNA 5DR2A 5J5SA 4Y46A 3C4XA 1CSNA 3PIZA 3QRJA 4G1WA 3P4KA 3QTRA 3FHIA 3QUPA 5D9HA 2VTMA 4YZCA 3I4BA 3JY9A 4LOOA 4IAFA 1M17A 4IIRA 2C1BA 2R64A 2HY81 5FUTA 3Q5ZA 4CGAA 3N51A 2J50A 2LAVA 3MN3A 1MQ4A 2WXVA 4EYJA 3Q9YA 2XBJA 4KWPA 3OCTA 3RGFA 3V8WA 3UVPA 2QOQA 4WRGA 5DA3A 3RVGA 3QCXA 1OKZA 4S34A 2H96A 2SRCA 1APME 4JJRA 2WMUA 5DVRA 4DGLC 1UU8A 4MBJA 3PSBA 4NFMA 2IVUA 3GC7A 3MY5A 4C3FA 4JT3A 2GTMA 4R7BA 3PG3A 1ZWSA 4AN9A 4C3PA 2ZJWA 1M2QA 4AW5A 4UN0C 4G3FA 5KX8A 5AP4A 4EJNA 3ATSA 5C26A 2WQMA 1SMHA 4C2WA 3R1QA 3DK7A 4G3DA 4FTCA 3WE4A 2OICA 3OTVA 2OU7A 1PMNA 3H9RA 3S00A 3VW6A 3BHHA 1YXSA 3ALNA 3DQWA 3O51A 2XEYA 2QOIA 3VJNA 5IQGA 3EH9A 4YNOA 2EUFB 2Z2WA 3FKLA 4PTCA 5HICA 2O65A 3Q52A 5M08A 2QCSA 4O7WA 3IGGA 4BCIA 4NU1A 2W1IA 4L67A 4RIOA 3UIXA 4QMNA 4MNEA 4ERKA 2EB3A 2GHLA 2IG7A 4G5JA 1V1KA 3QCQA 3R2YA 4F6SA 2XCKA 3FPQA 3ALOA 4FVQA 3U87A 5CEMA 4W8DA 3LFQA 4G3CA 4GSBA 2B0QA 2BKKA 2QOBA 3WIGA 5FTGA 3OXZA 3L8SA 3VHKA 2P2HA 5EK7A 4D2WA 3PIYA 4UZHA 4FTLA 1KE7A 1YWNA 3AMAA 4YZNA 4WBOA 2HYYA 4RLKA 2XK3A 3K3IA 4BFMA 5BVDA 3R9HA 3LW0A 3KXHA 4KBKA 3VUIA 2R0IA 4CSVA 5JQ8A 5M4UA 4D2PA 3DQXA 4IVAA 4FOCA 3D5VA 4F63A 4DFBA 2PVLA 2YIYA 4XNEA 5FP6A 3UZTA 4AOTA 1XWSA 3BQCA 4FODA 2XBAA 4HNFA 4BDIA 2X8IA 1OIYA 1ND4A 5FXRA 3PVBA 1P14A 2XNBA 1Q8YA 4XG8A 2X1NA 3KF7A 5HBJA 3C5IA 3VUTA 2HELA 3F3ZA 3A62A 3M2WA 2PWLA 1OI9A 1X8BA 5I9UA 4FEUA 2ZVAA 5IA4A 4FKWA 1JOWB 4CD0A 2XK9A 5FD2A 5BUJA 3D5XA 3FZPA 3F61A 5ANIA 1KE8A 4QD6A 5DT0A 2UZVA 3ORPA 5DI1A 4BYJA 4D0WA 3IS5A 4U81A 5EH0A 2AUHA 3R02A 5AIRA 1WVYA 2UZWE 5LCKA 4DG3E 4TY1A 2XNEA 3NIZA 2XJ2A 3ZFYA 5CAUA 3QQJA 3QX4A 3C51A 4JRNA 1HOWA 3HUBA 3OT3A 4HW7A 4AN2A 4BDFA 4C3RA 3POOA 3VS7A 4CG8A 3LQ5A 3SLSA 4DINA 3U8WA 4BI2A 3F5GA 3H0YA 4J95A 3QA0A 4C4FA 3SRVB 4BWXA 4IJ9A 5HNBA 4RX5A 3VO3A 4EOMA 4L7SA 2VWYA 4BIDA 1LP4A 2WPAA 4N6YA 1E1XA 2WMRA 4RJ7A 4LRMA 3CGFA 3D7ZA 2CDZA 3WF8A 3LM5A 3TKUA 3LFEA 1O9UA 2PTKA 4JG7A 2UZBA 2VTLA 3MH0A 4L3JA 4V0GA 1YRPA 2BUJA 4C2VA 3O8PA 5FEEA 3MESA 5HTIA 3RKBA 3ACJA 3LFDA 1CKJA 1OVEA 1R78A 4GT5A 5D1JA 3K54A 3Q4ZA 4FNYA 4DEEA 5E4HA 3TM0A 4A9TA 3ZUVA 4BKZA 1YWVA 4LL0A 3O8TA 1Q99A 2W5HA 2C6DA 3TWJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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