4C4JA

Structure-based design of orally bioavailable pyrrolopyridine inhibitors of the mitotic kinase mps1
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
279
structure length
261
Chain Sequence
QSMSVKGRIYSILKQIGSGGSSKVFQVLNEKKQIYAIKYVNLEEADNQTLDSYRNEIAYLNKLQQHSDKIIRLYDYEITDQYIYMVMECGNIDLNSWLKKKKSIDPWERKSYWKNMLEAVHTIHQHGIVHSDLKPANFLIVDGMLKLIDFGIANQMQPDTVGVNYMPPEAIKDMSSKISPKSDVWSLGCILYYMTYGKTPFQQIINQISKLHAIIDPNHEIEFPDIPEKDLQDVLKCCLKRDPKQRISIPELLAHPYVQIQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure-Based Design of Orally Bioavailable 1H-Pyrrolo[3, 2-C]Pyridine Inhibitors of the Mitotic Kinase Monopolar Spindle 1 (Mps1).
pubmed doi rcsb
molecule keywords DUAL SPECIFICITY PROTEIN KINASE TTK
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 261
sequence length 279
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2013-09-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4c4jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4c4jA01
4X21A 2REIA 1YQJA 3GXLA 3IPHA 3V04A 3EH9A 3ZH8A 1PF8A 4DEEA 3OCBA 3AXWA 2VUWA 3ELJA 1H1RA 4R5SA 1NXKA 4QPAA 4UWCA 3VW6A 3KF7A 2UVZA 4BIDA 2B9IA 5CZHA 3ZXTA 4QMNA 3KFAA 5CENA 5GJGA 4C2VA 4O7RA 4O7WA 2R5TA 4PP7A 2XK6A 3JY9A 2BDWA 5BVNA 3LMIA 2PVNA 5HD4A 3NW7A 4AOJA 2QO7A 3NUSA 5AIRA 2Q83A 5FQDC 4F4PA 3WZJA 1WBVA 2J6MA 1DM2A 3HV5A 3QTZA 4HPUE 4L42A 2ZV7A 4GG5A 5DH3A 2EWAA 5FM3A 3R8PA 3CJFA 3GENA 2E9NA 3VS5A 1QPEA 2C0TA 4MF1A 4FSWA 3Q9XA 4L3JA 4O27B 4FVQA 3ZCLA 4QYYA 2F49A 2YIRA 5CAUA 3T3UA 3MDYA 2F7XE 1GNGA 3R1SA 3TEIA 4NL0A 1H1PA 2PVKA 4O0RA 3VBWA 3GC8A 3R9NA 3V51A 1FOTA 3FQSA 1FQ1B 3NYNA 5C03A 4GK3A 5HU3A 3VF9A 4HVGA 1FGKA 1K3AA 5K0KA 2UUEA 1GZ8A 4G6LA 3F5GA 4HCUA 4FEQA 3HDMA 3I1AA 2YDIA 4M69B 4OBOA 1H07A 2C0OA 1ZWSA 2ITNA 1M2PA 2R9SA 3FKOA 3CCNA 3ZSHA 4PMMA 3F3VA 2J4ZA 5I9UA 4K8AA 4JI9A 1SVEA 1PHKA 2HAKA 2JBPA 4FTQA 5G1XA 2XIYA 2V62A 3MY5A 3F5PA 4FGRA 5H8EA 4O6EA 5HG5A 4YHJA 3PRIA 3ZOSA 4EOOA 3RK7A 1NVQA 4O83A 3MBLA 4BGHA 2W1EA 3PZEA 1PXPA 3GBZA 2UVXA 3KRJA 3D9VA 4D2RA 3HNGA 5HNBA 1MRYA 4II5A 4E1ZA 1OL7A 4DEBA 4F9BA 4DYMA 2G15A 3UP7A 4DGNA 5FXSA 4R1YA 4C2WA 5FUTA 4E6AA 4X2FA 3CBLA 3VC4A 3I81A 1KV2A 5AP0A 4YTIA 1HCLA 2C6TA 5T6KA 3TCPA 3H30A 4G6NA 1FBNA 3W32A 4U43A 2CKEA 1DS5A 3LCTA 3QQUA 4GYGA 3DS6A 4AA0A 4BZOA 3MV5A 5L4QA 4CV9A 1GY3A 1Q41A 3HRBA 4KRCA 5FEDA 4TYHB 5HGIA 2OK1A 4ZY5A 3GFWA 1O6YA 1PY5A 4MWIA 3G90X 3EQGA 3HV6A 3U51A 4C7TA 4EQCA 5AEPA 3PSDA 4AW1A 2XBJA 3MJ2A 4HGSA 2VTIA 4PTCA 5HG9A 3Q32A 1H1WA 4HYSA 2R3JA 3NNWA 4YJOA 2CPKE 4ASZA 1JQHA 1NA7A 2OJ9A 4GYIA 3UYTA 2YCQA 4XV9A 3FSKA 4YZCA 4APCA 1WBTA 1YDSE 2QOHA 3ID6C 1PXNA 1GIJA 1ZXEA 2R3QA 2W17A 3EMGA 3ZDIA 5CASA 2VU3A 3NMUF 2XEYA 3AT4A 4FG9A 4QYFA 2XKFA 4FTRA 4C4HA 4CKIA 4X2KA 1PMNA 4FOCA 5LMAA 4XG9A 4L00A 5CU4A 4MBLA 5AR8A 4UMPA 3G51A 3PXRA 4U8ZA 4WBBB 4BWPA 4L6QA 2VZ6A 4PPBA 2PUNA 3D4QA 4IZYA 3VS0A 4XOYA 4IJ9A 3V5QA 5CAQA 3PJ2A 3ZRKA 3HAMA 4NW5A 4ASDA 4DFZE 3CKWA 2WQOA 2XP2A 3LFAA 3LFEA 4FVPA 5DWRA 3I7CA 4WNKA 3ZFMA 4J71A 4PMSA 3BYOA 5IEXA 2F7EE 3AC8A 5J9LA 3BEAA 3F69A 3CQUA 1W82A 1LUFA 3NWWA 3ZEPA 3H9FA 4ZLYA 2HK5A 2J0JA 4MTAA 2PZRA 3DKGA 3NYXA 3PWDA 4Y5HA 5EYCA 3CSVA 4FIEA 4F6UA 4RWIA 4U7ZA 1LR4A 3SXFA 3DQWA 2BIKB 4KBAA 3V3VA 4I5PA 4L68A 3H4JA 5FRIA 3QLGA 4CCBA 4Y72A 1E9HA 1TQMA 1PRYA 4DT8A 3IW4A 5A6OA 4YZMA 5HCXA 4FKVA 2PVJA 3F2AA 4GUBA 4ARKA 5IQEA 2P4IA 2UZEA 1QCFA 2UZTA 3O8UA 4LRJA 3UVPA 3DU8A 2I7QA 2I0YA 3LMHA 3UNJA 1YVJA 5KMLA 3II5A 5ANDA 3V5TA 3PVGA 4AF3A 3QFVA 1UU8A 3GU5A 2O64A 3C4FA 5DI1A 3S2PA 4D55A 3HMIA 3QA8A 2CGVA 5A4EA 2WO6A 2H96A 4IAAA 4DH7A 3LW0A 3CPBA 3G9LX 4FKSA 4UXQA 5DVRA 3NGAA 2R3RA 3R1YA 4I94A 1REJA 2VX0A 2YISA 3UNZA 3VQUA 5CF8A 5IEYA 2X81A 5BVDA 4JQEA 1KOBA 3D7TA 4GV1A 1ND4A 3EQHA 3HEGA 4ZTNA 1M14A 3KXXA 3SDJA 2VWVA 3LOKA 3Q6UA 4L45A 5HLNA 3P7CA 2X0GA 3QTIA 3W2PA 2W0JA 5KMNA 4I0SA 2VX3A 2RFDA 4L52A 5ETAA 2PU8A 1Q61A 2WIHA 5M08A 4FKRA 3RP9A 3ZLWA 5KBQA 3D5UA 2JIVA 3ACKA 4J1RA 5CQWA 3FMKA 3FC1X 2ITWA 4NM0A 3Q9WA 1STCE 5M06A 5CWZA 2OZAB 4FTUA 4HYIA 4FKIA 4NTTA 1H0VA 3F2NA 2CN8A 3IKAA 4YC8A 3UQCA 2DWBA 4AE6A 4EZ3A 4AWIA 4BDKA 2B9HA 4GKIA 4DINA 4MX9A 4BN1A 3E62A 3P08A 1GIIA 1Z9XA 4O0TA 4NM5A 4KABA 2E2BA 4IC8A 4DEIA 5AV4A 3VUTA 3VS6A 3QCXA 3VHKA 2C69A 4R77A 5IPJA 4F0GA 2PE1A 2R7BA 4L44A 2WGJA 3PIYA 3SGCA 2ZM4A 2IN6A 4AOTA 4YSJA 4X3FB 5KUPA 5AV2A 1S9IA 2PTKA 3CP9A 5D7AA 3RJCA 3DFAA 2WMAA 4IEBA 5GZAA 4O2PA 4E73A 4MNEA 4EOKA 4V01A 3RBWA 1FINA 2GTNA 4Y46A 4BCFA 4DEHA 4HNFA 2XNBA 2YM6A 3LCSA 4DFYA 4EK6A 2OGVA 3UVRA 2XB7A 4EHGA 4EK3A 2QKWB 3RCDA 3QQLA 3LFSA 2RG5A 1E1VA 2IO6A 3QX4A 5CAVA 2UZDA 3CKXA 2VTQA 2B52A 2GNIA 5CEKA 3QTWA 4FF8A 3A7HA 5A9UA 2IVTA 4NTSA 4FZFB 3U9NA 3KB7A 2OJJA 3D5VA 4Q5HA 3EQPA 5CI7A 3R30A 3C4XA 1U59A 4FV5A 5BYZA 3ZM9A 1YKRA 4H05A 4GEOA 3ZONA 3CC6A 5AP6A 4EZ7A 4XG8A 3P4KA 5HCZA 4YNOA 2W1CA 3NAYA 4FZ7A 3CQEA 2I0VA 1CDKA 2X7FA 5KZ0A 2W1DA 3ODZX 5DG5A 4FSYA 3KN5A 1OB3A 5H2UA 4ENXA 3R7OA 3AC3A 3ZUVA 3PYYA 4PF4A 3DA6A 2ERZE 4FTIA 5AWMA 3FMMA 3ZLXA 5M56A 3ZZEA 3UMXA 5JN2A 4XUFA 5FLFA 4CFNA 3GOPA 4USFA 3UC3A 3GCVA 4DCEA 4U45A 3QTUA 4MH7A 1Q8TA 2YACA 4OTRA 5L3AA 3DKCA 5HOAA 4FEXA 4WKQA 1ZAOA 3C9WA 3CGOA 5KNJA 4AZEA 3PIXA 3LM5A 4HOKA 4RA5A 3VS1A 4EONA 2X39A 1M7QA 1A48A 4FNXA 1Y6BA 4LUDA 2VGOA 3MIYA 4GCJA 4BTFA 4HW7A 3MH2A 1WVXA 4RA4A 3LM0A 3Q5ZA 3UO5A 5ETCA 4E4LA 3ALNA 2FO0A 1XH7A 3BHTA 3FDNA 3FYKX 5E1SA 4E6CA 2QHNA 2AUHA 2NPQA 3NUXA 3KQ7A 2OFVA 3R63A 4QQCA 4X2JA 5EH0A 5KMIA 2HZ4A 1GIHA 2X6EA 4AX8A 2VTAA 3A7FA 3WIKA 2WXVA 5EK7A 1R39A 4FIJA 3ENMA 2OXYA 2C47A 4JX7A 1ZYLA 4G16A 4ANNA 2VTSA 2UZBA 5HQ0A 3V8TA 3R9DA 2C6EA 1O6LA 4TWOA 4RGJA 3FKLA 5I4NA 4DBNA 4S2ZA 4RG0A 4PP9A 4ORKA 4WD5A 4KB8A 5HLWA 3UIBA 2EB3A 5FXRA 4GMYA 2JKMA 4EL9A 3FI8A 2FH9A 3RHKA 4UX9A 3RTPA 3UODA 3HP5A 3RPVA 1ZY5A 3QYZA 2VX1A 1SZMA 3LFBA 3VIDA 1IG1A 2YWVA 1WAKA 1WVYA 2UZNA 2BKKA 2X9EA 4LV8A 5CNOA 3UG1A 5HI2A 3W18A 4EOJA 1BUHA 3TM0A 2ZYBA 3BLHA 3G9NA 1YW2A 3NUYA 3RALA 1Q97A 4DHFA 5HX8A 3AG9A 4W4XA 4CTBA 5IF1A 5AM7A 4TZRA 5J87A 3R8VA 2W4KA 3FMNA 1JKSA 5ETIA 3VS7A 4TKSA 3I5NA 2W5BA 4BBEA 4CQGA 2PK9A 5HE1A 5JH6A 2BZHB 2VGPA 4XHKB 2XKCA 3EFWA 5JK3A 4YBKA 5EM8A 2J0IA 5EDRA 1ZLTA 4E8AA 3EN4A 4G3DA 3BPRA 5CT0A 2PE2A 3P1AA 4BZNA 3NVMB 2W05A 2B9JA 3Q9ZA 2WOUA 1DI8A 5DBXA 4RX8A 2JBOA 3QUPA 1J3HA 4HVSA 3EB0A 4OTFA 3D7ZA 3PE1A 4O7LA 3E7OA 5JFXA 4DTKA 3O0GA 3C0GA 1OIQA 3P7BA 2OIBA 3ZO3A 3DZQA 4CZUA 1IR3A 3FL5A 3SRVA 3O50A 4XJ0A 3TDVA 4LMUA 5IQGA 3MA3A 5L2IA 1OPKA 5CSHA 2HENA 3UNKA 4RJ4A 2HELA 3ZMMA 4TWPA 4UEUA 3PXQA 3L8PA 4YGAA 4TXCA 3WARA 1ZYJA 3S3IA 2GS7A 4TYIA 5AM6A 5CT7A 4YJUA 3ZBFA 4IADA 5FDPA 3PFQA 3UVQA 2IZSA 4BCGA 3IS5A 5AA9A 1UU3A 5JFVA 5JZJA 3R01A 3RI1A 5A54A 1GAGA 5HIBA 1SVGA 3TV6A 3F2RA 3Q4TA 4NCTA 4FKUA 3LXLA 1UKHA 1XKKA 2XEZA 4C61A 5ANIA 3HMNA 4ZXTA 3OXTA 1YI3A 5AAFA 5JGDA 5L6OA 2OH4A 1NVSA 3GU6A 3FL4A 3PVWA 4EOMA 3NSZA 3ODYX 3DPKA 4JG7A 5CI6A 3R7YA 4ALWA 4USEA 3ENHA 2YIYA 4OAVB 2WFYA 4LGDA 3EYGA 5C01A 3CJGA 4AOIA 2BHEA 1WBWA 4U81A 4GT3A 3GOKA 3T9TA 2PMIA 4FSNA 2Z02A 2VTJA 1YI6A 4CYIA 5EQYA 4BDJA 5BMMA 4EOQA 2R7IA 2XIKA 4FT0A 4FYNA 4H1JA 4M15A 5CEMA 1FVVA 3PXYA 2X6DA 2XCHA 4ZTLA 4O0XA 3V6RA 4PMPA 4QQTA 3NS9A 1KE9A 4D28A 4CZTA 3FZSA 3ZYAA 4DEGA 3CY3A 5FEQA 4O0UA 4I4FA 2PE0A 2XIRA 3A8WA 3V5WA 3GCSA 3ANQA 3RAHA 4ACCA 3O7LD 3OWJA 3PY3A 4JAJA 5EW3A 4B99A 2XIZA 4C3FA 4UMUA 1UVRA 4RVLA 2WB8A 3WZKA 2XF0A 4RX5A 4FT3A 5HO8A 3EWHA 3ATSA 2WNTA 4FV0A 3OEFX 4LM5A 3UOKA 1G8AA 4JDHA 4IWOA 2BRHA 1BI8A 5AV3A 3ULIA 4UYAA 3KGAA 5HNIX 5LMKC 4LFIA 2JDSA 4B8MA 4RX7A 5HIEA 4JQ8A 4WUNA 4BI0A 4TWCA 5LVMA 5AP5A 2QR7A 4I6HA 4ZSLA 3MW1A 4DFNA 3LXKA 3HYHA 2JC6A 2YITA 4NEUA 3AMYA 3LE6A 3QKKA 4FYOA 4ITJA 3GT8A 3GC0A 4ZEGA 1YI4A 2WHBA 4AN3A 4DGOA 5AP3A 4D2PA 4NUSA 3T8OA 3IO7A 3COIA 4IFCA 4ZIMA 5CXZA 4FV1A 4YJRA 3DCVA 1XBCA 4HVHA 2YM5A 4YLLA 4P2KA 4NW6A 4IH8A 3ZTXA 2E9UA 3HZTA 5AUXA 4A07A 4IX5A 2QR8A 2VNYA 3MVMA 3PA5A 2C5OA 4O1OA 5GJFA 3ORNA 3UOLA 4CLJA 2O5KA 4W4YA 3FLWA 2R0UA 2I0EA 4OTIA 4RWKA 5FXQA 3W2CA 4NFMA 5JGBA 3VW8A 4MXXA 4DAWA 4DH5A 2QKRA 3JUHA 3F66A 4DF3A 2YN8A 1KE7A 4EHVA 4EI4A 5EFQA 5EW8A 3RPOA 4FIFA 3A2CA 2YLFA 2YZLA 2G9XA 4EBWA 4AGDA 3N4VA 3HAVA 5IA1A 1YOMA 2NO3A 4RJ6A 5EYKA 5B2KA 3EQFA 2ZMDA 3POOA 3RNYA 4H3QA 4NJ3A 2I6LA 4EC8A 4B6LA 2JDRA 2FB8A 5AUWA 4DH8A 4U3YA 4KKGA 5IA2A 2IZUA 3PLAE 5AIKA 4D2VA 4OTHA 1CSNA 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