4C58A

Structure of gak kinase in complex with nanobody (nbgak_4)
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
307
structure length
267
Chain Sequence
DFVGQTVELGELRLRVRRVLAEGGFAFVYEAQDVGSGREYALKRLLSNEEEKNRAIIQEVCFMKKLSGHPNIVQFCSAASIGKEESDTGQAEFLLLTELCKGQLVEFLKKMESRGPLSCDTVLKIFYQTCRAVQHMHRQKPPIIHRDLKVENLLLSNQGTIKLCDFGSATTISHYPDLYSNFPIGEKQDIWALGCILYLLCFRQHPFEKYSIPPHDTQYTVFHSLIRAMLQVNPEERLSIAEVVHQLQEIAAARNVNPKSPITELLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of cyclin G-associated kinase (GAK) trapped in different conformations using nanobodies.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-G-associated kinase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 267
sequence length 307
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4c58A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4c58A01
4IE9A 2KULA 2GFCA 3I6UA 4JR7A 4WKQA 4C33A 2ZMCA 2PVNA 4QTAA 1CDKA 5L2QA 5HE0A 3ZEWA 1OZ1A 3TDWA 2PULA 3CC6A 3IW8A 2FVDA 4JOAA 4R8QA 4XS2A 5JSMA 2FUMA 3GOPA 4FT7A 4F0IA 4O7ZA 3VUDA 5H8EA 2C3LA 4PMTA 3DQXA 4CSVA 3UIUA 3EYHA 3O71A 4YC6A 2WTCA 5HBHA 4BC6A 1H1PA 4CFUA 2XBAA 5M09A 2HXQA 3DKOA 4FYOA 3UNJA 4XV9A 3VJOA 1CMKE 2R4BA 1NVRA 5KE0A 2QD9A 4YURA 1P5EA 3RCJA 3KRLA 3W55A 2IWIA 2YIXA 2H96A 2ONLC 3QHRA 4EONA 4O7TA 1ZARA 4B0GA 5C26A 3VUHA 1SYKA 2YDJA 1XBBA 2YIYA 3TKUA 2YCSA 1WBNA 2J9MA 3NAXA 3QTIA 3HECA 4NM3A 4ZTNA 5C9CA 1P4OA 2P4IA 1Z5MA 2P3GX 3VS6A 2X0GA 2PE2A 4F1TA 2WU7A 1G3NA 3GQLA 3E62A 3PA5A 4DINA 4CVAA 5GZ9A 1PY5A 4QQ5A 5F20A 4U6RA 4K2RA 3BBTB 2OW3A 3O8PA 1J7IA 4RFYA 5A54A 3MV5A 4JDJA 4AA5A 3F2NA 3FMLA 3Q9XA 2XMYA 3C7QA 3QRKA 4NCTA 4NKAA 4CFXA 5JMSA 4FNWA 3UZPA 3PLAE 2HIWA 2FSMX 3Q2MA 3QD2B 2A2AA 1YW2A 2C69A 3FI2A 3R73A 5E7RA 4JS8A 3EN6A 4S31A 3RM6A 3DLZA 4EJ7A 3R30A 4FKQA 5E8XA 3IK3A 3UC3A 3ORZA 4QQJA 4HYHA 2F57A 4QQTA 3F6XA 4U0IA 3W1FA 1QPEA 2R3KA 5CZIA 3LM5A 5M51A 3H9FA 4PTGA 5CSXA 4UXQA 3WE4A 4CFMA 4CLIA 4WRSA 4ZAUA 2UW5A 5CY3A 3TUDA 4PTEA 3DAEA 3R02A 4H1JA 4XG2A 3PRFA 3ET7A 2W1IA 3P79A 5HBJA 2WZJA 3MFUA 3G2FA 4RIYA 5JZJA 4QP4A 2XYNA 3MTFA 3WZEA 1AGWA 3TTIA 4E1ZA 4EH7A 4DTAA 3LZBA 5EW3A 3ZZEA 3NW7A 3DBCA 4RX9A 3LMGA 2PPQA 2VTAA 4XEYA 3PSDA 2PUPA 3PYYA 4H39A 2VAGA 2ZM3A 1GIIA 4EHEA 4RJ8A 2C0TA 4DTBA 2OH0E 3ODZX 4WUNA 4NIFB 5FRIA 4XMOA 5AUXA 3F5GA 3TIYA 3D9VA 5AA9A 3OWJA 4GFMA 1P14A 4FG7A 1H1WA 3UO4A 3RHKA 4EOQA 4RWIA 3CR0A 4RVMA 1GIHA 4P7EA 2ERKA 2JIUA 3HRBA 5DBXA 5A4QA 4X3FC 3CD3A 2UZTA 3MH3A 4BTFA 3L9LA 4A9UA 1WBWA 4X2JA 4IM2A 3O7LB 3ZO1A 3U8WA 3QQGA 2OZAA 4JR3A 4G31A 2J0JA 2PUUA 3DBDA 3SRVB 4O91A 4E6AA 5IMXA 2QO9A 5EHLA 4AT3A 5CALA 5KCVA 1XQZA 3HVCA 4YSMA 3TUCA 1EH4A 3ANRA 1L8TA 1WAKA 2XJ2A 3OF0A 4CZYB 5HNBA 3RMFA 4ANMA 3N51A 5KUPA 4JRVA 4FKRA 3MB6A 1H1QA 4C7TA 3QLGA 5AUWA 5CSVA 5J9LA 5FTGA 3DBQA 1ZMVA 2PZPA 3A7IA 4MD8E 4GH2A 5H3QA 3HP2A 1ZYCA 3K54A 2WQBA 4GG5A 1YVJA 2F2CB 3QD3A 4FV0A 5HICA 4IB5A 4WOVA 1YOLA 3R9DA 4D2VA 2UW9A 3DAKA 3MJ1A 4PTCA 4IAIA 4DEAA 4KUJA 2WEIA 4MQ1A 2HCKA 3U51A 3RTPA 3E8CA 3R7YA 4EOLA 5K5XA 3MESA 2WOUA 3HL7A 3IW4A 4PL3A 4HCVA 4O81A 2GNIA 4RVTA 4WSYA 4F1OA 4BTMA 5F4NA 2QI8A 4AU8A 4BGHA 4F09A 4R6VA 2B9IA 4BBEA 4C02A 3BYOA 4HNIA 5CAVA 2WTKC 4YPDA 2RF9A 4A9YA 3BQCA 1PXLA 2ITQA 2ZDUA 5AR2A 5BNJA 3QKLA 2XIZA 4F9CA 4O0VA 2Y0AA 5IKWA 4YLJA 5D11A 4M69A 3GU5A 1J3HA 4XNEA 3RWPA 4FT0A 2WGJA 4ANLA 3VUMA 3DTCA 3FHRA 4EH8A 2WEVA 2H34A 4BCJA 3Q96A 2XB7A 2XBJA 5IH6A 4QRCA 2GMXA 5DR9A 4E73A 3R1NA 4M7IA 5DEYA 4AGDA 5FBNC 3R9NA 3U87A 3JPVA 3D4QA 5IF1A 1PHKA 3NYVA 3P7BA 2QOIA 4D4YA 3POOA 4HZRA 2QKRA 3QRTA 3I0OA 3E7VA 3KU2A 5TT7A 3R7EA 3CQWA 5J8IA 2QC6A 3UIXA 1CM8A 1ZZ2A 5J7HA 5LMBA 4F4PA 3KVWA 5E1SA 4NSTA 4D1SA 4WG5A 3ULIA 3ORXA 4DN5A 4UB7A 3HKOA 4C61A 2C1AA 3SRVA 3Q4UA 2WTIA 3NCGA 1ZOEA 3F61A 1V0PA 4O6EA 2C5XA 2J0MB 2R3GA 5EOLA 4IX4A 3DBEA 4I6QA 5AEPA 3C4CA 2WMQA 5HTCA 3PIZA 4OW8A 2XH5A 2CDZA 2XK8A 4JG8A 4HW7A 4AQCA 2O63A 3ZO2A 2BKKA 3SXSA 5DIAA 4D2TA 5JN2A 2UUEA 4GV1A 4B7TA 2X2KA 4AS0A 1JPAA 2V62A 4QOXA 5HHWA 4HVIA 3FMEA 5HNIX 2C47A 3COHA 1UKIA 2PZYA 3AT2A 5J95A 5A46A 4I1ZA 3VBWA 2ZYBA 3MB7A 3E87A 2E9NA 2V55A 1PJKA 3BU6A 3F3VA 3KXZA 3CTHA 3QGWA 4KIPA 5AM7A 3ZHPC 5AV4A 4YZDA 3R7OA 4EJNA 1XBCA 4FIIA 4YTFA 3C5IA 4FTCA 4PP9A 1SVGA 4YMJA 4KABA 4RJ5A 5EM5A 3DZQA 4QMVA 2YDKA 4Z7GA 4MCVA 3E88A 3MY5A 1H01A 4QP3A 5BVNA 3EN5A 4AW2A 4G3CA 3NUSA 3ALOA 3CCNA 3FLYA 4YZNA 3FYJX 2J50A 4OTRA 1OITA 3QCQA 5BYLA 2W1DA 3ACJA 2ITOA 2VUWA 4FT9A 4GMYA 3QD4A 4YTHA 3N4TA 2PUNA 3R9OA 5CF4A 5GNKA 1H0VA 4IAZA 4D2RA 1MRVA 2RKUA 3AG9A 3D2IA 3FAAA 4IXPA 5HKMA 3VNTA 1PKDA 5AP4A 3LCDA 5K9IA 2R64A 5D7VA 2RG5A 3D0EA 2GNGA 1Q3DA 5HCZA 3PY0A 4F63A 5TE0A 4JDIA 3AT3A 2R3JA 4I5HA 2VWUA 4FIEA 5JFSA 4U9AA 3T8OA 1JKSA 1KE9A 2IZTA 3JVSA 3QWKA 5HORA 2PTKA 3F2AA 3IGOA 5JRSA 3ROCA 3OWLA 4BDGA 5A4EA 4RA4A 3C0IA 3G51A 4EOMA 3KN6A 3OEZA 4WNMA 3AMBA 3M42A 2BDWA 4FKSA 4OBQA 4QP9A 1FGIA 1MRYA 2VGOA 4CXAA 5IQFA 4CFFA 3AMAA 2CLQA 4WNKA 2BRNA 2DWBA 4DFLA 4DH1A 2FSOX 5C4LA 2A19B 3R9HA 5C27A 4UMTA 1PYXA 2IZUA 3RNIA 2AUHA 4D28A 4D5KA 4RZVA 1YDSE 3VS4A 4KA3A 4A4LA 1VYWA 3GCSA 5LVNA 1KSWA 2O65A 3GB2A 2IZRA 2PMIA 4GFGA 5HO8A 5HOAA 4BDAA 4L68A 4MKCA 3VHEA 1J1BA 3SOCA 1JAMA 4ZLOA 4K1BA 5TOZA 4GYGA 4NWMA 3UOKA 2I0HA 1ERKA 2PVJA 3EQHA 4CYJA 5CWZA 5CEIA 4O82A 3U55A 2YDIA 4RC4A 3CS9A 1J91A 3KVXA 4O7RA 5I0BA 1OBGA 1OI9A 2WXVA 3ANQA 2W1EA 3DCVA 4MX9A 4RIWB 1NA7A 1SZMA 5LOHA 2EU9A 1Q5KA 4BDEA 2A1AB 2WFYA 2X4FA 2XRUA 2R0IA 3I0QA 4IANA 5DVRA 4MXXA 3RAKA 4IVAA 2ITPA 2YM4A 3QYZA 4D4RA 2BZKB 4FEXA 2GS2A 4LL5A 4H1MA 5J87A 4MAOA 3RJCA 5M4IA 1O6YA 3GC8A 3MY1A 4D58A 3IS5A 4WA9A 4ENYA 2Z2WA 3FKNA 4ZS0A 2PZ5A 1NVQA 3OXTA 5E8SA 4HVDA 4OBOA 1QCFA 2WKMA 4WT6A 4HNFA 3DKGA 4WRGA 2R7BA 2WHBA 3QZFA 2BDFA 3VS5A 4G9RA 4L3LA 4AN3A 5L2WA 1ATPE 3ZDIA 4IB0A 2YAKA 4LGDA 3OBJA 4KINA 5AMNA 5EHYA 2WMAA 5BQ0A 1B38A 3MVLA 3MS9A 4QMLA 4QYHA 3HV5A 4ZY4A 1XH4A 4XP2A 3Q5ZA 2CKQA 3DK6A 2J6MA 1HCKA 4M8TA 1JOWB 1PKGA 3VQHA 2RFSA 2OK1A 3OCBA 3TG1A 1JVPP 4FL1A 4FTJA 3H4JA 4LL0A 5FD2A 4CNHA 4E5BA 3FPQA 3EZVA 4JIAA 4B4LA 5IQEA 3R1SA 4F1MA 3WF9A 5HVYA 4Q5HA 5DMZA 3QUPA 4LM5A 3ZLWA 3WBLA 2BPMA 1QMZA 3DB6A 5FM2A 4EH3A 4EZ7A 4EEVA 4U81A 3SXRA 3V5QA 4TN6A 1Q61A 3PG1A 3V5LA 2J4ZA 3DLSA 2W5HA 3R7GA 2XZSA 4FUYA 4GK2A 2BR1A 3S95A 5EFQA 3QL8A 2PSQA 5J1WA 4CFNA 1JNKA 3EJ1A 4M66A 3PY3A 1YXUA 3RAHA 3W18A 3WIGA 2Q0NA 4OTDA 2QR8A 2XP2A 5CNOA 5KHWA 4AOIA 2ONLA 2EXCX 1Q8YA 2JKOA 3DPKA 3FBVA 4L3PA 4Z9LA 3RAIA 3P08A 3UTOA 2VWYA 4UMPA 1JSTA 3EFJA 1IA9A 3A8XA 4QYGA 3VW6A 3HMNA 2VX0A 5HGIA 3G0FA 4GUBA 1L3RE 3CKWA 4CFVA 4KAOA 4C37A 3MPMA 3GCVA 3DV3A 5EYDA 2HELA 1OL6A 4U7ZA 3NNWA 2PVYA 5BX0A 4BZDA 1E1XA 3KQ7A 5DYJA 5ANIA 1W0XC 1IA8A 3DK7A 4KBCA 4BVUA 4AUAA 5L8KA 4AX8A 3BHUA 5F95A 2I0YA 1QPCA 1UNGA 4YZ9A 1PXMA 4TY1A 1OIYA 3R8ZA 1AD5A 4IX3A 2BIYA 5EYCA 3FJQE 4O0XA 2YM3A 4V04A 4FOBA 2PVLA 3Q3BA 4N0SA 2XCHA 3F5UA 4K77A 3KN5A 2WTKB 4ASZA 4GKHA 1QL6A 3ZLSA 4AW0A 3HV4A 4LGHA 2BRMA 5B2LA 3UOLA 1WBTA 4O7YA 1OUYA 3A60A 1YXSA 3P7CA 4FKOA 3VS7A 4QTBA 5LVPA 4FEQA 3UVRA 1UWJA 2Z02A 3KRXA 3OWKA 1M2RA 2CMWA 5JT2A 5JGBA 5HNGA 4EZ5A 3BWJA 3D94A 3LQ3A 4BCKA 1KV2A 3NVMB 1PXIA 4QMXA 3HYHA 4BCFA 3OUNB 4DGOA 4AFEA 2QU6A 2ITYA 4XYFA 5FEQA 4ZEGA 2YCQA 5CANA 4BDHA 5AADA 1WVXA 2X8DA 2P2IA 3BHVA 4F70A 2VN9A 3CP9A 3UG1A 3VIDA 4Q9SA 1PMVA 5EQPA 4NUSA 2PE1A 4KSQA 4II5A 5FM3A 3UP2A 4ANNA 4XRLA 2Z7RA 4I3ZA 4PWNA 5IQDA 2O0UA 2R7IA 3DZOA 4RMZA 2IG7A 4XP0A 3AT4A 5TO8A 3DTWA 1IAHA 4O0RA 2XNMA 1UWHA 3JY9A 5H8GA 1UU9A 3HP5A 3BYVA 2BROA 4YJQA 3A7GA 1H1SA 5KO1A 4X3FA 3OCTA 1DAYA 1FQ1B 2VTRA 4LRJA 4J52A 5LCJA 3Q9WA 5A4TA 5C4KA 2P55A 4G9CA 2GNLA 5DI1A 2XKFA 3Q6UA 4NTTA 4O21A 2XIXA 3OUKA 5EM8A 4DFNA 5L4QA 2X8IA 2W9ZB 3FSFA 4BDFA 4PPAA 5BYZA 5A4LA 4WHZA 4KRDA 4QMUA 3DT1A 4YTCA 4FIGA 4N6YA 4MNEB 2JDTA 5C01A 2CNQA 1PRYA 4QPAA 4NYEA 4EC8A 4KS8A 3NW5A 4V05A 4MD7E 3IDBA 3ATTA 2QLQA 2J51A 3ERKA 3OWPA 1YI3A 4FTRA 4NTSA 4EH2A 5KMIA 1I09A 1YWVA 4BWKA 1YKRA 1XWSA 2OU7A 3C51A 3KXXA 4TWNA 4YBJA 2IVSA 4U45A 2VNYA 4WG4A 1UNLA 4FGRA 1PXOA 2OG8A 2OJJA 3O96A 3TT0A 4EYMA 4HPTE 2I40A 2QOOA 3LHJA 5FXRA 3P4KA 4O84A 4WBBB 3D83A 3PY1A 4ALVA 4HGSA 4RG0A 5IEXA 2UZNA 3O17A 4MWHA 2IVVA 3VVHA 4ZTRA 1W84A 3QTUA 4DCAA 3V8SA 1U46A 4GKIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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