4D4SA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
272
structure length
255
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE 1
total genus 79
structure length 255
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d4sA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d4sA01
4DGLC 2RSVA 3II5A 5AM6A 4S32A 4YC3A 4EKLA 3FLYA 2VTNA 2XP2A 4G3CA 4EOLA 4L46A 2IVVA 3DGKA 2CCIA 4FKPA 4IC7A 4QYFA 3ENMA 3VS7A 3KK9A 1HCLA 2R0UA 2JKMA 2J2IB 3U51A 5IEXA 4HYUA 3CE3A 2ZV2A 4IJPA 4DFYA 4FOBA 4YBJA 4R77A 1WBTA 5A14A 3QZHA 3VBXA 3QALE 4NYEA 3HV3A 2R3HA 4HGEA 3GC9A 4MNFA 2BZKB 5D1JA 3RHKA 3VJNA 1OGUA 3CGOA 4AS0A 3M42A 4HYIA 4CFUA 3BX5A 2V7AA 4EOKA 3QTIA 3ACKA 4CFWA 4DFBA 2GPHA 5HICA 3A62A 3QUEA 1B6CB 4C3FA 4DCAA 3PJCA 3PTGA 4BTFA 5M57A 3H4JA 5LJJA 4GK3A 5CEQA 3ZDIA 3OTUA 2GU8A 4S2ZA 1JSVA 4BCMA 4E1ZA 2VO3A 3FY0A 3K3JA 2YJRA 3VW6A 1XBAA 3UBDA 2PSQA 3DQWA 2BDFA 4JAIA 4V05A 2YCSA 5HG9A 2ITNA 4JXFA 2W1ZA 5EM8A 3BHHA 4OTQA 4FYOA 2X8IA 4H39A 3I7CA 4AZWA 1YDRE 4PNKA 3P08A 3DK7A 4YHTA 4BGQA 3FLNC 4E20A 4N57A 2UW7A 2RFEA 3ZFYA 4XRJA 2XA4A 3VS0A 2W7XA 5E8UA 3DFAA 2VGPA 4XS2A 4R3CA 4C59A 1PXNA 2W5HA 3R6XA 4PMPA 1G5SA 2C5OA 3LCDA 3W10A 4AZSA 2BTSA 1SMHA 3ITZA 3CQEA 4M3QA 5EHLA 4G3GA 5CVHA 2Z7RA 5AR7A 2UW3A 4XV9A 3BELA 4N70A 3FHRA 2AC5A 2XJ0A 3I0OA 4FOCA 1PY5A 1OIUA 2VTLA 2XF0A 4YZBA 2VWXA 5IDNA 4FZ7A 4IB0A 4X3FC 4YO6A 5AX9A 4C62A 5I9WA 4HVIA 3R1YA 3B8RA 5E90A 2XNPA 2W99B 4F1MA 3JUHA 4ZZNA 3JXWA 4CT2A 5DVRA 3OCTA 5LMKC 4RG0A 5DRDA 3P4KA 2VWWA 4U5JA 5KMKA 3W8QA 2CNQA 1PKDA 3NNXA 2IZSA 4C4GA 4EH8A 3FMKA 2XB7A 3ZLSA 3Q04A 5IUHA 2ONLA 2YM5A 1H01A 3GC8A 3PY1A 1YRPA 2DUVA 3Q60A 3A7JA 2YWPA 1OL7A 5EFQA 5LWNA 4B7TA 4QQCA 1FOTA 3EN9A 4ALUA 3NYXA 4O0XA 4CZUA 4HGLA 4GVJA 3R9HA 4D9TA 4FICA 2QD9A 3VUHA 4PL5A 1XO2B 5ANIA 4F0FA 4CGAA 3P5KA 3O8TA 4GK2A 4V04A 4LRKA 2YIYA 3BPRA 4M68A 3ROCA 3ZO1A 4RFZA 5M06A 3I79A 2HELA 5G6VA 4BTKA 2QO9A 5EQEA 4PPAA 2ITYA 3OCSA 3LQ5A 4BN1A 4BICA 4L3LA 3DKCA 3GXLA 2OXYA 1UNGA 2R3PA 2WTDA 3DDQA 3QA0A 2Y9QA 3O2MA 4G9CA 5JZNA 2VWYA 3H3CA 2XKDA 4D2PA 3FKLA 4MCVA 2UZVA 2R5TA 4PTCA 3MV5A 4BI2A 2UZWE 4YJTA 4UXQA 2JBOA 4AG8A 5KKRC 1RW8A 3VUDA 2HK5A 4FVPA 1YHSA 4J1RA 4YZNA 4P90A 4BBEA 3PJ2A 4CV9A 3LMHA 5K4JA 2OZOA 5HIDA 3GFEA 4FV3A 4XG7A 1NY3A 1H26A 1CMKE 3HKOA 4L6QA 4OTPA 4FEWA 4I93A 4L3PA 4Y46A 2JKQA 1TQPA 2E9VA 3SGCA 2QOOA 4AAAA 3PDTA 2OI4X 2UW0A 3TV7A 1LR4A 5H9BA 4A7CA 1YI6A 4LGDA 5HCYA 5I9XA 5IMXA 4AW5A 3UNJA 5C01A 4I41A 1H4LA 2PVMA 1FPUA 4O6EA 2PU8A 3ZM4A 2PUUA 3FZSA 4AOIA 4BKZA 3QD2B 2UVXA 4F7NA 2JAVA 2WELA 2GFCA 3Q4CA 4RIYA 4EH7A 3AOXA 4RBLA 4YPSA 3KN6A 2XCKA 1UU9A 4IX6A 4M15A 4YC8A 2R4BA 2Y6OA 4FGBA 3ROYA 4YURA 1FMKA 4QP7A 3LFCA 4LM5A 4GIIA 2PVNA 2RFNA 5EOBA 4CFVA 5DE2A 2BAJA 3IW8A 3KA0A 2W05A 2Y4PA 4F63A 5AA9A 3MFSA 4PDSA 5CAOA 2C6OA 2V7OA 4I23A 2J90A 4DG3E 3B8QA 3CGFA 3BQRA 4E6QA 5B2KA 5E1SA 2Y4IC 3U4WA 2OJGA 1CSNA 2WMVA 2HY0A 1WAKA 3SG8A 2W9FB 3PPKA 3QX2A 4G31A 3E3BX 4NUSA 4IMYA 5I5ZA 3QQHA 4O0UA 5KHWA 3UOJA 1L8TA 3FI8A 3Q4TA 4GFOA 5LQFA 2J5FA 4CTCA 5CAVA 4QTAA 4LI5A 3G2FA 1H8FA 4CZTA 3VS1A 3F82A 3NWWA 3OG7A 4XUFA 4NCTC 1IEPA 3GU5A 3I0QA 4MTAA 3PP0A 4QP3A 4ALVA 3TN8A 4AOJA 3FI4A 1KV1A 4RIYB 3OBJA 2ZM1A 4ANSA 3FKOA 1U5QA 3K5VA 2V0DA 1BMKA 5JH6A 3M1SA 4I5HA 4LL0A 4OTRA 3GU6A 3FZOA 4PP9A 1PHKA 1RJBA 2C6EA 4H1JA 5CQWA 4JDHA 2UZNA 4BWXA 2ERZE 4FTUA 3UODA 4HZRA 3L8SA 5HGIA 3PG1A 5BVKA 1YXUA 2HXQA 2RL5A 3TZMA 3PG3A 3Q9ZA 4O7LA 3UIUA 2C5VA 2UZLA 4ITIA 1J7LA 5IQIA 5I3RA 1CM8A 3EJ1A 5FEQA 4MXAA 3MFRA 1TQIA 3AXWA 1I09A 4AT3A 1E1XA 2UW9A 5CT7A 3RK9A 2RIOA 4D2TA 4GT5A 4O0VA 1UU7A 3L8PA 3S3IA 3QKKA 4PPCA 3RK7A 2VD5A 3CJFA 1GIHA 4F1OA 1PXOA 2Y6MA 2B0QA 4HNFA 4R7BA 3GOPA 2R7IA 4MF1A 3I4BA 2H8HA 3NIEA 4MXYA 4WSQA 1IA8A 4FK3A 3VS3A 3KEXA 4U42A 5HTBA 1KE9A 3DU8A 4JAJA 3P7AA 2QODA 2XK7A 4OW8A 2JFMA 3DBEA 3DTCA 4I6QA 2ITTA 2OSCA 4MNEA 3ODYX 3QA8A 1J1CA 4J7BA 5HU9A 3N9XA 5M4UA 2Z2WA 3N4UA 2XM9A 5HHWA 2NP8A 5HKMA 3TJDA 3UNZA 3R9OA 4WT6A 4XX9A 3F5GA 4F7JA 5IH4A 4QP9A 5HE0A 4DCEA 1YI4A 3QZIA 2VWVA 1XH9A 3DA6A 4XG4A 1JWHA 4BTMA 4C35A 3RZBA 4GUEA 3WF8A 4U81A 4DG0E 4RVLA 4ANLA 4ID7A 1EH4A 2QOFA 4BCIA 4DTKA 4FKJA 2OIBA 2CCHA 3E3PA 3E7VA 3D4QA 3QYZA 3UZTA 1ND4A 4HPUE 2PULA 1Q8YA 4NKSA 4CRLA 5HORA 3AC1A 4OGRA 2A1AB 4I94A 5AP0A 4K8AA 5AUWA 4EEVA 5CU4A 4F70A 4QMQA 4DT9A 3QCSA 3FZRA 3GEQA 2ONLC 1U5RA 4DFNA 2RKUA 4D0XA 3IDBA 2GNJA 2EXCX 3SXFA 3V01A 4JX7A 4FSWA 4LGGA 4ARKA 4H3PA 3IO7A 1F3MC 1UWJA 4OTDA 3LXLA 4NFNA 5JQ8A 2ZB1A 3QCQA 5C9CA 5E7RA 5FXQA 4MEDA 3LFAA 3Q9YA 3R7EA 3C51A 2J0IA 4MNEB 5L4QA 4A06A 1XBCA 3HMPA 4BKJA 4FUXA 2WMSA 3QF9A 3VW8A 4H05A 3FI2A 5E1EA 3WF5A 4EWHA 2JDTA 2X6DA 4JQ8A 4UWCA 3K5UA 2BILB 2BRBA 2X0GA 4FT0A 4MYGA 2ITVA 5BX0A 5BYLA 4FVQA 4BCKA 5FWKK 3ZOSA 4LFIA 2PE0A 1JPAA 4ZTLA 3AD6A 2QI8A 2X8EA 5ANGA 4BDEA 3D14A 4W4VA 2XK6A 3IW5A 4XH6A 3PVBA 3TKUA 5HX8A 1BLXA 5IQFA 3NCZA 3G0EA 2QC6A 4O1PA 3VF9A 4ANQA 3ORLA 1FGKA 2IW9A 5AEPA 3OCGA 1OKWA 3COKA 2H34A 2X7FA 4MXXA 4GW8A 3VS5A 2IVSA 3R73A 1GIJA 3EHAA 4DFUA 3UYTA 3D7TA 1GNGA 1OVEA 3QRIA 1Q3DA 3W2CA 2W4JA 3ZEPA 3L1SA 5BQ0A 3R8ZA 1FGIA 4J71A 4NH1A 4E3CA 4KWPA 3KC3A 1OKYA 5CSXA 3CTJA 3GQLA 3FYJX 3EQCA 3BZ3A 3TI1A 5K0XA 4TKSA 4NJ3A 3Q9XA 4FTQA 4S31A 2GDOA 3LFNA 4D2RA 5D7AA 3RHXA 1O9UA 3AC5A 1ZRZA 3FXXA 4NM3A 5EYMA 5AUXA 5LARA 1OZ1A 3HEGA 2Y0AA 1URWA 3RM7A 1H27A 4ASEA 5HNIX 3PIXA 4TPTA 4ZXTA 4BDIA 1G8AA 4CYIA 3CS9A 4QNAA 2EB3A 3EN6A 3JY9A 1AQ1A 5AP4A 4OAUC 2XZSA 3MVMA 3ORKA 3O23A 4U97A 4YZCA 2WMRA 1UNLA 4IVCA 2C6IA 5CEMA 4KKEA 2HXLA 4EQMA 4CXAA 4F0GA 4XJ0A 1QPEA 3MVJA 4IE9A 5DYJA 5A4TA 4TL0A 2WMAA 4FNYA 5ACBC 4TYIA 5GJDA 2BHHA 2OJ9A 4TZRA 5LOHA 4R7HA 3TKIA 4O0SA 3HMIA 4PUZA 5K3YA 4YU2A 4O7RA 3KVXA 4M14A 5GHVA 3SX9A 3D7TB 1NVSA 4X2NA 4ZSAA 3EQHA 4EZ3A 3AMAA 3OUKA 4G6OA 2RG5A 4RC4A 4IVBA 2V62A 2VNYA 3TV4A 4DG2E 4I6HA 2PE1A 5LVMA 4B0GA 1ZYDA 4QP1A 2Z02A 4FNWA 2HW6A 4FUYA 1XJDA 3SD0A 2B9JA 5KCVA 4IAIA 2C30A 5H3QA 5AR3A 1SYKA 4F65A 4OBPA 4ASZA 1Q97A 3BHTA 3ZZWA 3V6RA 3TACA 5FM3A 5IISA 3HNGA 5BYZA 4AOTA 2H96A 2G2IA 2I0VA 5AP6A 4OBOA 4EH9A 3D94A 3FQHA 3M2WA 3TNIA 4XLVA 1DAWA 5L2SA 3IGGA 5E8ZA 5LWMA 4Q2AA 3MJ1A 5CENA 4GJ3A 1U59A 1NVRA 1JKSA 2UZOA 3EIDA 1P4FA 3VWAA 2GNLA 4NWMA 4G5PA 4MF0A 5BNJA 2VTAA 4LQMA 4FEQA 4IM2A 4NM5A 4FEXA 1H1RA 1H28A 2WPAA 3SC1A 4DH8A 4RFYA 3OC1A 4D58A 4USFA 2OJJA 1BI8A 4X2KA 5FM2A 2WO6A 4WRGA 3KRWA 3ZZEA 1OIYA 2R3LA 2VWZA 3DNEA 3FSFA 4KIOA 4U6RA 3A99A 3D7ZA 3D83A 3IW6A 3R8UA 1H0WA 4D4YA 2R3NA 1TQMA 4O84A 4C2VA 4IVAA 5BMSA 5AUVA 4RA4A 1W83A 4ZTHA 3OWJA 5CF6A 3O51A 2PZRA 3NW5A 3BIZA 4H3BA 3RBWA 4RA5A 2VTMA 1OM1A 4N4SA 3W2PA 1PXJA 4ZMFA 3BHYA 2YLFA 4Z3VA 2Q83A 1ZMVA 3QHRA 3KRXA 3WE8A 1BL7A 4WKQA 4IQ6A 2WTIA 5FQDC 4IZYA 3HP2A 4O91A 3EQGA 5A4CA 3IONA 3QX4A 4FTMA 5AA8A 2BPMA 2YDIA 3HECA 5EW9A 3JPVA 5BVFA 1P2AA 3AMYA 3LFEA 3QTQA 5EKOA 3UMXA 2XEZA 3LXPA 4AACA 3LQ3A 3L9PA 4BFMA 4CMOA 3C9WA 4IAYA 4UALA 4BDHA 4FV8A 2YWVA 4DBXA 4M66A 4QD6A 4X2FA 4O96A 4GCJA 3HMOA 5LMBA 2CPKE 2G9XA 4GT3A 3VHKA 4EHGA 5E9EA 4KBKA 3SG9A 5D11A 5IQCA 2X39A 4EJNA 3NEWA 5I9YA 2CKEA 4KS7A 3BV3A 2C68A 2OKRA 2C3JA 4Q5HA 4EL9A 4ZY5A 4IWPA 2GS7A 1YXSA 3D15A 5A3XA 5CAPA 5B0XA 1W98A 4WUAA 3MWUA 4WRSA 3MH3A 3F9NA 3MA6A 1YWRA 4L52A 4C4HA 3OWKA 4U44A 5AR4A 1R3CA 2UZUE 2VAGA 1ZY4A 2WQBA 4M69A 3ZH8A 1XR1A 1Y8GA 5AP7A 4JOAA 4QTDA 4Y5HA 3HDMA 3D5WA 4F99A 1DM2A 4J96A 2YM3A 3KRRA 3RI1A 5HTCA 4S33A 2WKMA 3C7QA 4O0TA 2PK9A 2C0IA 4JBPA 4OTHA 1JKTA 1ZMWA 2P3GX 1SNUA 3PXZA 2XBAA 4K1BA 4USDA 3QTXA 2YN8A 1J7UA 5IEYA 2A27A 4O6LA 3RZFA 4I4FA 4M8TA 4KIKA 4Y95A 3AGMA 3MESA 4Y85A 3UOKA 3ZXTA 3P7CA 2JLDA 4FTNA 1J1BA 5IA2A 4FEVA 3OVVA 3QQLA 4RQVA 3F5XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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