4D4SA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
272
structure length
255
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE 1
total genus 79
structure length 255
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d4sA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d4sA01
4E20A 4U3YA 4TT7A 3ACKA 4FR4A 3IS5A 5HI2A 2X9EA 4IAZA 4BFMA 5M4FA 3FYKX 5BYLA 4MD7E 3PXKA 4WRGA 3OXIA 3QUDA 2VTAA 1AGWA 1RW8A 4FV7A 3MH1A 3Q9XA 4CYJA 4EH3A 5CVFA 5CXZA 3GBZA 4RMZA 5CU6A 4NW6A 4ZJVA 2RG5A 3H9OA 4X3FC 4IH8A 5EH0A 1FVRA 5CEOA 4M67A 3MFUA 2QLQA 5HG8A 4JR7A 3FQHA 1XH4A 3RPSA 1KV2A 4EHGA 5HX8A 3KB7A 4BF2A 2WEVA 5CU4A 3IK3A 3TT0A 3HV3A 5L6OA 3CPCA 3KRXA 4FSMA 5D7AA 3VUGA 3BEGA 3U54A 4GFOA 2UZOA 4MXYA 1Z9XA 2GNGA 2C3KA 4EHZA 2JDVA 3I7CA 3NIZA 5T6KA 2PVMA 4I5HA 4YPDA 2XKEA 4TL0A 3FPMA 5AX9A 4ORKA 4G1WA 5HTIA 3OBGA 4XG4A 2IG7A 4RX9A 4NL0A 4HGLA 2WEIA 4GFGA 4RBLA 3TTJA 5BUEA 1GNGA 4AAAA 2ZM4A 4HPTE 4EHVA 3S95A 3FE3A 4FOCA 5EQPA 4NUSA 4CFNA 2XNBA 2OZOA 4F1TA 1VYWA 4I20A 5HOAA 3EZRA 2R0UA 2VGOA 5F20A 3ORPA 3ZFMA 3L9PA 3DQWA 4ZSJA 3LOKA 3QCYA 3RZBA 5EHYA 3VJOA 3E88A 3ROYA 4GMYA 2BIKB 2IVTA 3CTHA 4LMUA 1UU8A 4XOZA 3ZBFA 2REIA 4ACHA 4ZLYA 1ZYDA 3Q9YA 5ANKA 4KIQA 2HXLA 2P2HA 5I3OA 3RAWA 4GS6A 4GYGA 1UVRA 1SVHA 4PX6A 3JYAA 2H6DA 3ZMMA 1GAGA 4L53A 4FV3A 1STCE 3O96A 2IZSA 3BLQA 5JZJA 4CG9A 4B8LA 3OF0A 5DOSA 3OMVA 4E1ZA 4J52A 3D0EA 2VTMA 4WRSA 3TNIA 4NM0A 4NM3A 4AZSA 4G3GA 4HCVA 3QRJA 2R3IA 4CMOA 3OT8A 3E63A 2QHMA 2QG7A 1TQMA 3DGKA 3LE6A 3ATSA 3C7QA 4C34A 4QP7A 5J8IA 4IAIA 4BDKA 3A7HA 2VX3A 3O8PA 3ORIA 2FSOX 5CS6A 4R3PA 1J7IA 2VRXA 2VTOA 2WTVA 3MB7A 4L8MA 4YZNA 1R39A 3K3JA 3MVJA 2ITPA 3SHEA 4XG6A 4EBVA 2QO7A 3VIDA 4IX4A 1BLXA 4B7TA 4MF0A 1ZY4A 3B8RA 3KK8A 4GK2A 1SNUA 4DTKA 4K33A 3NNWA 4YR8A 5F95A 4M0YA 4BCOA 2ETKA 3ACJA 4YC6A 4CFWA 3PY3A 5BYZA 4BDHA 3VUHA 2CKQA 1R3CA 5C27A 5LOHA 2W1ZA 5HU9A 3PLSA 4KIKB 5JQ8A 1Q62A 3ZO2A 3BGQA 2ETMA 4MXZA 1KWPA 3RKBA 1CTPE 4ANMA 5CNOA 1JSVA 1XR1A 3UVPA 1HOWA 3EN4A 4YPSA 3ZUTA 4GT5A 4BCQA 5I9VA 5BVOA 3U6IA 5ANDA 3G15A 4FV9A 3V5JA 4DFZE 4CZYB 1IAJA 4X0MA 4Y83A 4C2WA 2VTPA 2V7OA 4YJUA 5A4EA 2OJIA 3F5XA 5IA5A 4WSYA 3PUPA 4YC3A 3AC2A 4EC9A 1BMKA 4JBPA 5G6VA 3QC4A 5FXRA 1XKKA 2UVZA 5EM8A 4DBXA 5CY3A 3G5DA 2JIUA 2NRYA 3FMDA 3G0FA 3NRMA 4QMZA 4V0GA 4X3FB 1PXLA 5HORA 4ZXTA 5JH6A 5IQIA 3II5A 4PDOA 2G2IA 3KL8A 4IIRA 4K9YA 4WBBB 1GZNA 4RIXB 4NJDA 4DHFA 2GHLA 4LRJA 4E6CA 3V01A 4LI5A 4DF3A 3F7ZA 5T68A 2P2IA 3R7GA 4CVAA 5IQBA 2XUUA 4BBFA 3HAMA 3KXHA 2OZAB 4G17A 2E9UA 4ZTMA 3ENHA 3QKMA 1E1XA 3UOLA 1FVTA 3H0ZA 3V5PA 5AUTA 3EN9A 3R0TA 4IC7A 4R5YA 3PPJA 5L2IA 4UY9A 5C4LA 2WOUA 3FLQA 3EIDA 3DQXA 1REJA 4IDVA 3UNKA 4JT3A 1O6KA 1JPAA 4RFYA 2I0VA 4TYIA 4XMOA 4KWPA 5FXSA 3H0YA 1MP8A 1XQZA 4W8EA 4WIHA 3OWJA 5DHJA 4HVSA 2W1HA 5CVHA 2XCHA 2IZUA 4GJ3A 2GNJA 4U5JA 5AUYA 3R7IA 3SOAA 3DZOA 3UG1A 3UZRA 4DH5A 4NH1A 1YHWA 2W0JA 4FTMA 2ONLC 4PNKA 3LXLA 3VJNA 3R7OA 5K9IA 2OGVA 1YHVA 3GCSA 3EYGA 3QTXA 4I94A 3ZDIA 5J7HA 2WHBA 3PJCA 4O91A 4S2ZA 2IW8A 5DT0A 3JVSA 4LGHA 3RHKA 3EQIA 4AGUA 2WZJA 2XCKA 5DR6A 4CSVA 5EYMA 3QTQA 3LQ5A 4F0FA 3BPRA 1SVGA 3BYMA 2Z7RA 3RK5A 2ITUA 4E26A 5G1XA 2HELA 3RALA 1YXTA 2YM4A 4I6FA 4Z9LA 4I4FA 4BHNA 5M4UA 3SVVA 1DAYA 1QPJA 3BCEA 4B9DA 5CQWA 4NWMA 4C38A 2QC6A 4P4CA 2PZYA 2YIXA 4O22A 3BBWA 3DAJA 3VF9A 5I9YA 3DK3A 3R8PA 4AW2A 3UE4A 2C30A 3MPTA 2W4OA 3P86A 2W1FA 2GNHA 3WYXA 4R6VA 2HK5A 2OH0E 3QLGA 3I6WA 5HO7A 4ASEA 4ARKA 5KKRB 3VBVA 3D7TA 2JBOA 3NS9A 4B4LA 4IB5A 2IO6A 3F3TA 1YXXA 5L2QA 4RRVA 4QP3A 4IAKA 4BGGA 4ACMA 2WFYA 3Q9ZA 4QP9A 4S30A 3RCJA 5LVNA 5LVPA 1OKWA 4L7SA 3SW4A 3MS9A 2HY81 3LXPA 4Y5HA 2F4JA 4FSZA 4AE9A 3R22A 2BCJA 5EHLA 4HYIA 3HUCA 5JT2A 1IA9A 4D0XA 3UVRA 3N51A 5IA0A 5HTBA 3OD6X 3I81A 2BRMA 3SAYA 3QD3A 4KBCA 4DFBA 5CF5A 4A07A 3T9TA 2HZ4A 3FXWA 4NZWB 4K18A 1FGKA 4M69A 2CPKE 4TKSA 2JIIA 1W84A 4B99A 4D28A 3PIXA 3QLFA 4YZBA 3UG2A 4ACCA 2BRNA 4EI4A 3OTVA 4LV5A 2EUFB 3E3PA 3HGKA 2P55A 3VWAA 1URCA 5JFWA 4E6DA 3HMMA 1IEPA 2UZVA 3IW5A 3DT1A 4M8TA 3EJ1A 2UZBA 2IPXA 2R3PA 3D94A 1XBBA 3QYWA 2PWLA 2GFCA 2QOQA 4D2VA 4F9AA 2XNMA 3SRVB 2YAKA 4W4WA 3MPMA 3E8NA 1KUTA 4RWIA 3DKCA 3F5PA 4O6LA 3FC2A 4XG8A 4PL4A 4IB3A 1ZOEA 3I0QA 3UZPA 5LQFA 1U54A 4ALWA 5LWNA 4FTQA 1SM2A 2XKDA 3PG3A 3PJ1A 3KF7A 5CALA 3QC9A 3UMXA 4J8NA 4C58A 4S34A 4JQEA 1FPUA 3DAEA 3LCOA 4TWPA 3SX9A 2CCIA 1L3RE 2JFLA 3DXNA 4PP9A 4YJTA 3G6GA 2V22A 3KXXA 4L6QA 3LKMA 5E4HA 3DZQA 3COKA 1IR3A 1Q97A 4BDGA 2HW6A 2XK6A 3ZTXA 4MBJA 4CTBA 1H1RA 4QMSA 5EKOA 1P4OA 5GZ9A 3PSCA 4FG7A 4X2NA 4A4LA 2I0YA 4GU9A 4MHAA 5D41A 4JRNA 1V1KA 3DAKA 3IG7A 3UZTA 4H1JA 3MSSA 2B54A 3I79A 4ID7A 4IAAA 4RLLA 5E8VA 4ZY4A 3QTWA 5ANGA 3VS3A 2BMCA 3HAVA 2WXVA 3FJQE 4MKCA 1M14A 3CGFA 1ZLTA 4ASDA 3EQHA 3I0OA 5I9XA 3OOGA 1YRPA 3TKUA 3F82A 3QTIA 2RFEA 2Y4IC 5AM7A 1KOBA 4TYGA 4YBKA 4NT4A 4XJ0A 4RIOA 3MI9A 3G51A 4OBQA 3TIYA 5LCKA 1IA8A 4X3FA 3LVPA 3QXOA 1QPCA 4NK9A 3RM7A 4AW0A 2ZV7A 2YCQA 4A9YA 4EOPA 4BR3A 2GS7A 3O7LB 1BYGA 1OPKA 3FKLA 4GYIA 4QP1A 4U79A 5DWRA 3U9CA 4YZCA 2W9ZB 4G2FA 5DEWA 2OFUA 2C6OA 2W1GA 3AT2A 1OIQA 4BIDA 5FEQA 3F3ZA 4O84A 4PTCA 3WF8A 3QUEA 5AIKA 4OAVB 5L8LA 2G01A 2XBJA 3UYSA 2QODA 2F49A 3Q52A 2C5YA 4WO5A 3HECA 3UTOA 4DLIA 3FZRA 4QTCA 3RPOA 3JS2A 2WPAA 2ITTA 2A2AA 3FMKA 4FT7A 4F9CA 4FV2A 4KBAA 5A4TA 2ZDUA 3N4UA 4BCPA 2XIZA 2W1EA 4KSPA 3OWPA 4MF1A 3IOKA 4NM7A 2IW6A 4JRVA 1H26A 4XG3A 1QL6A 1P14A 3QRTA 4B0GA 4J53A 4P90A 4QMTA 2CGUA 5HE1A 4PDYA 1KE6A 2UV2A 3WYYA 5HG9A 5EYDA 2PULA 2W4KA 4G16A 4UV0A 1OZ1A 1IASA 4FKUA 1MQBA 5EI2A 3MJ1A 4EZ3A 3FEGA 4FMQA 4XV1A 3PVUA 3GFEA 4NCTC 4NFNA 4FT0A 4CV8A 3AC8A 4DINA 4TXCA 4IWPA 5LVLA 2NO3A 5FG8A 3WE4A 1W7HA 1LPUA 4TY1A 4I5PA 3KN5A 1UKHA 4RWJA 4DEAA 3VVHA 2BTSA 2G2FA 2EB2A 3B2WA 3KRLA 2YIYA 3CJFA 3QBNA 3C51A 3QKLA 3TJCA 2XS0A 2XP2A 2J9MA 5FLFA 3ZM9A 3LMHA 2YIRA 3ELJA 5KBRA 4YLLA 4KKGA 4F0GA 5DRDA 4F7NA 3MVMA 4OTFA 1ZAOA 4DTBA 3LFQA 5ETCA 4O7LA 5C01A 1W98A 3R7VA 3DBQA 2PVJA 1MRUA 4RIYB 4XYFA 5DR9A 4DGOA 1KSWA 4MCVA 1H1QA 4BRXA 4WBOA 4CT1A 4GRBA 5IQFA 4ZS0A 1YOJA 4GJ2A 2YZAA 2Y7JA 1OL5A 3ULZA 3NUAA 2XNOA 4W4VA 4ZTHA 3MY1A 3TUDA 2O63A 3CS9A 1L8TA 4GSBA 4QTDA 4OAUC 2JAMA 3U6HA 2A4LA 4OTDA 5AP1A 1GJOA 2G1TA 3ZEPA 2W96B 3PVGA 3EKNA 3GB2A 3QGWA 2VWBA 3RP9A 3HMOA 3FL5A 5J5TA 4GKIA 1Q41A 3R30A 4A4XA 3O23A 4F7LA 3VS5A 2UUEA 3BYSA 2YJRA 4EC8A 3T3UA 5BVWA 1BL7A 2BFYA 2XYUA 3HMNA 4P5ZA 3WZUA 4DEIA 4KUJA 4O7YA 5BX0A 3U87A 4E93A 4OTRA 4CRSA 1UNGA 3EFLA 3PSDA 5EI8A 1OPLA 4DEHA 4WUNA 4CFMA 1U5RA 1YWRA 3FMLA 5AP5A 2VTSA 3KULA 3OTUA 5C8NA 2W1CA 3PXRA 2FSMX 2WMSA 4M7IA 3R9OA 4K8AA 3L9MA 2WKMA 4UMUA 4GKHA 3FZ1A 5DVRA 5AP0A 3KRJA 3W18A 3F69A 4UYNA 1KE9A 1OM1A 3F2RA 2YABA 2Z8CA 4OGRA 5HKMA 3HV7A 1Q8TA 4ASZA 4BTMA 3R28A 4QPMA 5JMSA 3F2AA 1GOLA 2XJ0A 3KY2A 4FUXA 4L7FA 4FKLA 3SRVA 2OBJA 4JBQA 3R63A 3DFCB 3C4ZA 4ZMEA 2DYLA 5CU3A 5FGKA 3COIA 4IVBA 4Y73A 1CKJA 2RSVA 2VO7A 2IVUA 3PY0A 4WSQA 1WMKA 3C4EA 1OVEA 3NW5A 4KNBA 4N6ZA 3R2BA 4PMMA 1FBNA 5IQCA 3ZS5A 3QTRA 3RI1A 4E8AA 4RSSA 4CXAA 2X2LA 5FP5A 3TZ7A 2WGJA 3LFBA 1YI4A 5I0BA 3R8ZA 4EK5A 2QVSE 3FMEA 4E73A 1H28A 4Z16A 5AP4A 2PMIA 5LMKC 4FSWA 4WT6A 4F1OA 3PLAE 3FI4A 2YDJA 3TV4A 3W8QA 4AUAA 3Q53A 3VS7A 4XRLA 2X0GA 3CSVA 2XZSA 3LZBA 5AUZA 1NT2A 2H96A 3FLZA 4ZOGA 5H8EA 1J91A 3Q60A 4QO9A 2PE1A 3TNQB 4O7VA 4FYNA 2CCHA 4PDPA 5DA3A 2H34A 4ANQA 4BCKA 1O6LA 4ONAA 5E8YA 5JGAA 4G6LA 4M12A 2QQ7A 4AP7A 3FZPA 2IVVA 4FTIA 5HZNA 4RWLA 4JAJA 2WTCA 5K5NA 1TKIA 4P7EA 2QKRA 1JBPE 2BVAA 2R3FA 2XKCA 4EOIA 3E7OA 3V8SA 5M56A 2O5KA 4IXPA 3TNHA 3R21A 3DJ5A 5EDQA 4F09A 4O7WA 4HJOA 4O0XA 2HIWA 4BB4A 2C6KA 4HOKA 3BE9A 5EW3A 5GNKA 2YDIA 4MBIA 5AR2A 2C6IA 5AMNA 2VO0A 3NVKI 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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