4D5HA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
272
structure length
255
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE 1
total genus 79
structure length 255
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d5hA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d5hA01
2GS2A 4YNEA 4NKAA 4AA4A 3II5A 3LXLA 2XEYA 4XUFA 3ZH8A 5BVNA 3MI9A 3MSSA 3KVWA 4KBCA 4M12A 1AD5A 4QPSA 2JFMA 5E8VA 1JSTA 3EQCA 3TKHA 4F6UA 3KREA 2PHKA 3DBCA 1PRYA 4RMZA 4DA5A 2A19B 3V5PA 3UNJA 5F95A 4D5KA 3DDPA 3R7OA 5T3QA 4AGUA 3GU6A 5AUXA 5KE0A 3H9OA 3QTIA 4O0SA 2B53A 2YN8A 2B7AA 1VYWA 2WQBA 3GFWA 3NSZA 5TOZA 3UO6A 4GG7A 4JG6A 1WMKA 5CEOA 2QC6A 4LM5A 1Y8YA 4QYEA 3RHXA 3PLAE 3EFWA 4QO9A 4Y83A 2R3RA 4EQUA 5J5TA 4GK4A 3LFFA 5GZ8A 4W4YA 3W2PA 4CT1A 3BQCA 4M8TA 4X3JA 3O8PA 3QYZA 3NUXA 1CKPA 4DFBA 3GENA 3MH1A 5HTCA 5FUTA 4FTAA 3DBQA 4XV1A 4MXCA 4YC3A 1OGUA 1OKZA 2UZBA 2ZV7A 1E1VA 2IW6A 3BV3A 3DAEA 3F3TA 3HVCA 3OROA 4BDJA 3H4JA 4QQJA 4BDFA 3PP1A 3EQBA 3BE2A 3G33A 3MJ1A 4WKQA 1BMKA 3S2PA 4MXAA 3DJ5A 4BICA 4EYMA 4QQTA 5DMZA 2C6LA 4TYHB 5A6NA 1JBPE 2YAAA 4RX7A 5AM6A 3OF0A 2VRXA 3LLAA 5K9IA 1PXMA 4J71A 4RZVA 4XNEA 4CZYB 1FVVA 2I6LA 4ZTNA 3IG7A 3IK3A 3SAYA 3RVGA 4HCUA 3FKOA 1VJYA 4IXPA 3TWJA 5EM6A 2QI8A 3E8DA 5EI2A 5K5XA 4D1SA 2NPQA 2F57A 2F9GA 3IW4A 3VQUA 3BYUA 3PWYA 2VO6A 3GOPA 3RPOA 1GAGA 3CTHA 4W4WA 4RJ6A 4EK8A 3R28A 2ZM4A 5HX8A 4DFZE 3E62A 3NUAA 5M06A 4EHZA 2HZIA 5DH3A 1BX6A 2XJ0A 5L6PA 3UQGA 1HCLA 3MW1A 4YHTA 2P3GX 4M0ZA 3U8WA 2DQ7X 2YZLA 4IM2A 3QTSA 5F20A 3CPBA 4IJ9A 4TRLA 4FKOA 5KMMA 2IVUA 2HIWA 3VNTA 4CG9A 3RAKA 3ZZWA 3DB8A 2R3OA 1ERKA 4GKHA 3HNGA 3AC5A 4LI5A 3LJ2A 2RKUA 3PYYA 4APCA 3T8OA 5HE3A 3NLBA 4W8EA 3MBLA 4XG9A 3THBA 5A54A 3JPVA 1Q41A 1UKIA 3KK8A 3PXRA 4FIFA 4KIQA 3OS3A 4AFEA 4KIKB 4FBXA 4J8NA 4JIKA 3MFRA 3QA8A 5CT7A 4I5PA 1GOLA 4D0XA 4EYJA 4XG4A 3VHEA 5FWKK 3AQVA 4ITIA 3I5ZA 5CSXA 4TYIA 4BRXA 5FLFA 2VO7A 5IH6A 2W4KA 3Q9YA 2C5YA 4IACA 4DC2A 2C1BA 4EJ7A 3N4UA 2QO7A 4RIXA 4WT6A 5BUJA 5EQPA 4H05A 5DEWA 2VWWA 3UP2A 4A4OA 3I7BA 3AT2A 3NUYA 4IB0A 4C59A 2YM5A 3BIZA 5CU4A 3U4WA 4F0FA 2R3LA 3JXWA 4FTCA 2FUMA 4WA9A 4YZNA 5AUUA 4R7BA 4I94A 3IPHA 5CVHA 3TZ7A 4EH2A 2XZSA 2YACA 2GNGA 4X2NA 3C4FA 3OC1A 4BDGA 4E73A 2R64A 1YRPA 2JBPA 4FSQA 3MA6A 2Q83A 1GY3A 3ANRA 4XG8A 1XBBA 2ZDUA 5HQ0A 2PVKA 2PWLA 3RWQA 2ZMDA 4AA5A 4L9IA 3QC9A 5L2TA 2W1FA 4ZY4A 3BHUA 2Q0NA 2XB7A 1M2QA 3AT4A 3F61A 3BGQA 4N6ZA 3NIZA 3WIKA 4FGRA 1H1QA 3DQWA 1Q8TA 5ANOA 3NCZA 4OTGA 2OIBA 3QUPA 5KMIA 3H10A 4O0UA 4IADA 2ITQA 3ALOA 2GNHA 3CQEA 2XKCA 5AM7A 3P7BA 3MJ2A 4DH1A 5GINE 2FVDA 4HW7A 3DKCA 5AAGA 3RMFA 1YHVA 4WG3A 4DFYA 4D4VA 4MNFA 3NNUA 5A4CA 1OIYA 5DNRA 3K5UA 2XNNA 5HE2A 4DTAA 1OB3A 4BHZA 3CY2A 4E4NA 3GEQA 2QOQA 2XP2A 5ETFA 1OKVA 3D0EA 3DOGA 4ACCA 3GQIA 3DA6A 3QX2A 3V5QA 4BY9E 3SRVA 2W1EA 3JVSA 4FT0A 1KWPA 3DFCB 4BDEA 4MD7E 3DK7A 2BDFA 4AG8A 4M14A 5M55A 4NYEA 3QRKA 4A9UA 3BHYA 3F82A 4YZDA 3AC4A 3QRTA 3TZ9A 4P90A 2BDWA 3WZKA 3DAJA 3BBTB 4BWPA 4B4LA 3OXIA 4U6RA 2GU8A 2ITPA 1T45A 4GU6A 3OUKA 3E3PA 3VBVA 4D58A 2B55A 4XP2A 3QRUA 3H9RA 4EUTA 4UWYA 1YQJA 3BQRA 4ZY6A 5IQGA 3TEIA 3QHWA 3UTOA 3ZCLA 3VS5A 1YXXA 2XEZA 3RTPA 5IDNA 4U8ZA 2HW7A 5HKMA 4PDSA 3PE2A 5DHJA 3B2WA 5FG8A 1ZZLA 2W1CA 3COIA 4FKRA 4DYMA 5K0KA 1OIRA 1PHKA 1UU3A 2A0CX 3EJ1A 3GB2A 3PY1A 4JDHA 3TZ8A 3B8RA 3UOLA 3VS3A 3WZUA 3ZFXA 4IMYA 4EL9A 2V55A 3ZXTA 3LCDA 5IA2A 4DTKA 4FEXA 1UKHA 4IBMA 2ONLC 4LG4A 3GC0A 3TACA 4EOSA 2QOLA 2I7QA 2NP8A 1CM8A 3EQHA 3VBTA 3QQUA 1YXTA 3OBGA 3VBXA 3M1SA 5KMJA 2JKQA 3QCSA 2VTNA 3WF5A 1CKIA 1NVQA 2V7AA 3OY1A 3PXFA 4RWIA 4EC8A 3UNZA 3Q04A 3QZIA 5LJJA 3V5JA 4E5BA 5C4LA 4AN3A 4RA4A 5HO8A 4QQ5A 4BCGA 3RPVA 1ZZ2A 4ZK5A 3V8TA 4JAIA 2JDVA 2PVLA 4DGLC 3BZ3A 4FIHA 2UZNA 4Q5HA 1BUHA 3W2OA 1GNGA 2OH0E 3UZRA 2XA4A 3PZEA 3ORTA 2QOBA 3BU3A 2WPAA 2WO6A 5D41A 2GHLA 4GMYA 4ASZA 2CGUA 2R3FA 3TNPC 4ACHA 4D4RA 4NKSA 4YBKA 1KE8A 3ZLYA 5DWRA 5CX9A 1BKXA 3OXTA 3EMGA 4K11A 4QYFA 4RFMA 4U42A 4L8MA 3WZJA 2PZRA 2F7EE 3OD6X 2AUHA 4X2GA 2W7XA 4EOKA 2XVDA 3ORZA 4XRJA 5DR9A 3H30A 2G2FA 4C4IA 3CS9A 4X7QA 2X2KA 4LGHA 4QPAA 4O7VA 5IA5A 5EQYA 5EW9A 4RC4A 2XK8A 3QTWA 3SOCA 3LPBA 4GVAA 3O8UA 4D2TA 3ZSIA 3ZU7A 4RIWA 4EKKA 1KV2A 5DRBA 1H0VA 2J5EA 4I6HA 3DNEA 3FMLA 3E88A 4FV9A 3UVQA 4O7NA 2PVJA 1TKIA 4LYNA 4RC3A 3QCXA 3SV0A 3SA0A 3EN5A 3LAUA 4S34A 3LQ8A 3R7YA 4GRBA 4EH5A 3G9LX 4F9YA 2QU5A 1I09A 4MXXA 4R3PA 4DBNA 5IQFA 4DLJA 2XH5A 3LIJA 4O2PA 1JKKA 2X8DA 4RVKA 3FZ1A 3A99A 2EXMA 2WOTA 4B6LA 4BIEA 3AT3A 5IMEA 3G9NA 4CSVA 1PKGA 3FXWA 4DEIA 4EZ7A 3CQWA 3PSDA 5EKNA 2X8IA 3FHRA 3BV2A 4XV3A 4UMQA 4F9WA 1Q24A 2OFUA 4GYGA 1QPDA 4LOPA 4YO6A 2OXYA 3ODZX 4OTHA 4DCAA 1KE6A 2XNPA 3KRXA 1U5QA 5CU3A 5FTOA 5IQDA 2Y4IC 2CSNA 4EH4A 5G1XA 3FZTA 3V3VA 4KWPA 5E7RA 3OY3A 4EONA 1OBGA 2CNVA 1BI8A 3BU5A 3WF9A 3TDWA 2C6KA 4BL1A 1YWNA 2VAGA 3QGYA 2GNLA 5AADA 3CXWA 4IAAA 4LRMA 4NM0A 4UYNA 3ROCA 1H00A 4UV0A 5HCYA 4FA2A 5IQCA 3MH2A 1YHSA 3WARA 4K77A 1OI9A 3R7VA 4FKLA 4JQEA 5DEYA 1KOBA 5CI7A 4RT7A 5T68A 4E1ZA 3MVJA 5BMMA 3DKGA 3FI4A 4AW0A 4USEA 3R1QA 5JGAA 3SG8A 4IAFA 3ROYA 3FMEA 4ZLOA 1H08A 2GHGA 2PZIA 2XYNA 5K0XA 1AGWA 5H3QA 3NW6A 3VUTA 3MVLA 3S4QA 4ITHA 4HCVA 3Q5IA 4C2WA 4U0IA 4O22A 2YISA 2J6MA 3AOXA 4G34A 4ZS4A 4EBWA 2PTKA 4TY1A 2IVSA 2UW9A 2UZLA 4O38A 4C4FA 4CXAA 4JQ8A 3KB7A 1Q5KA 1ZMVA 2RSVA 3O2MA 4QMNA 3ENMA 5AR2A 3GC8A 3HUCA 4TT7A 4MNEA 4IVAA 2XIYA 3IW6A 2PPQA 3KGAA 2W05A 2B1PA 3R73A 4QMWA 4CFUA 5AA8A 3O23A 3E63A 4WNPA 3F7ZA 4V04A 4IW0A 2OBJA 5J8IA 4AT3A 2J0IA 3GQLA 5EH0A 4RSSA 4UYAA 3ANQA 3R00A 4GT3A 4KA3A 1E1XA 2XK4A 1MRUA 4RC2A 4IX5A 4TYJA 1W84A 2YHVA 3R2BA 4KS7A 5CS6A 2EWAA 5LVNA 3VUIA 5DLSA 4GK3A 3G90X 3LXPA 3OXZA 3CR0A 2VN9A 4E4XA 5ANEA 4BCQA 4ZMFA 4O21A 3BELA 3ZS5A 5KNJA 5E1SA 4DH8A 4C34A 1FVRA 1M2PA 2HOGA 4J95A 4BCMA 1LEZA 5E1EA 4HYHA 3FPMA 4IDVA 1Q3DA 2O5KA 3PA5A 4D55A 1F0QA 4KKEA 3P5KA 5FXSA 4AE6A 4EHGA 4FTKA 4I3ZA 4KBKA 3RP9A 2W4JA 1FQ1B 1J1BA 5AUTA 4TYHA 2XCKA 2WMBA 1HCKA 3A60A 3ULIA 4YSMA 2OKRA 3OVVA 5BVFA 1Q8YA 4ZTQA 4O1PA 2C3KA 1PY5A 4KD1A 1OBDA 5A3XA 3LE6A 3DCVA 3BHTA 3TV7A 4QP8A 4AZVA 2JDSA 5EYCA 2VX3A 5DI1A 4PNIA 2X2LA 4YSJA 1Y6AA 4FV1A 4NCTA 3MIYA 4NTTA 4YJQA 4HVDA 2RFDA 4FSYA 4PPAA 4DEEA 5CAOA 3ZEPA 2UW5A 4IVBA 2X8EA 3BBWA 3VF9A 4WOVA 5GJGA 4JBOA 4AZWA 4G9CA 2VTHA 4ZEGA 4O0XA 5FD2A 3TG1A 2LAVA 5KHWA 1XWSA 2X6DA 3Q6WA 3MWUA 3FLYA 3HL7A 4U81A 4V01A 5E8UA 3HRCA 3S00A 3QQGA 3EL8A 4EWQA 2F2CB 2IN6A 2CN5A 4RG0A 4U44A 3D5XA 2IJMA 5CEQA 4O2ZA 3D2KA 3R2YA 3FMKA 3DXQA 1WBPA 4QP9A 4RJ7A 3ZMMA 4LL0A 2X9FA 4HNFA 2W17A 5HU3A 4GIHA 4LUEA 3TNWA 2WTCA 3GGFA 2Y6MA 4DG0E 2QURA 4G2FA 4DINA 2DS1A 4FV2A 4KIKA 2JLDA 4TL0A 5BVOA 1G3NA 1PYEA 1XR1A 3FLNC 1Z5MA 1ZOHA 3RK5A 3CQUA 1LR4A 5AP0A 5LWMA 4IFCA 4YGAA 5A14A 1Q62A 1OUYA 4MBIA 3H0YA 5CVFA 4BB4A 4DH5A 5LCKA 4EQMA 4F7SA 4HVHA 2OXXA 3DGKA 3GI3A 3CD8A 2GNIA 1IAJA 3DAKA 1UV5A 2E9OA 3FYJX 4YNOA 3KULB 5I9XA 4R5YA 3RINA 2BR1A 4JBQA 3Q2JA 2BAQA 3ZDIA 5BQ0A 2P2HA 3BHHA 4EH6A 4OTFA 5KCVA 3G6GA 3F5PA 1PXIA 2HY0A 3R6XA 4IWQA 3A7GA 3CP9A 4L7SA 3UIXA 4IVCA 3BE9A 1Y57A 3UJGA 3HAMA 2B4SB 5ACKA 5JGBA 5EM7A 2GTMA 2VZ6A 3EQRA 4CRLA 2WU6A 5ANDA 5BUEA 5M4FA 3MPAA 2YM6A 3QD4A 1YOMA 4NK9A 4PL5A 2XM9A 4FIEA 3VUMA 4XG3A 5K5NA 4F9BA 1W83A 4TWNA 2O65A 5IMXA 2JDTA 4A06A 4EHEA 5HG8A 4DT9A 2UVYA 4QMUA 2I0HA 2BRMA 4EK5A 3G15A 3AMBA 4ACDA 2ERKA 3NUSA 4WO5A 3S95A 3UVPA 3AC1A 3ETAA 3PRIA 1VEBA 4BHNA 4BKZA 5BVDA 1R0PA 1JSVA 3TJCA 2V5QA 2QG5A 2EXEA 2UVZA 3PIYA 1MQBA 5DRDA 1O6KA 4II5A 3P7AA 2OJJA 4ZSEA 4AW1A 4I23A 2VX1A 4R6VA 3VULA 3REPA 4LQMA 2WB8A 4DEHA 4X2KA 2BTRA 2W1ZA 3PVGA 4RX8A 2WQNA 3AD6A 3LJ1A 4D2PA 3GC9A 4Y72A 1GZKA 3R0TA 4FIGA 2YDKA 3LJ0A 2X81A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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