4D5HA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
272
structure length
255
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE 1
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 79
structure length 255
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d5hA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d5hA01
3DFAA 5EYCA 3A60A 4EBWA 3LVPA 2PZIA 5I9UA 2RIOA 1PMNA 1YXXA 3EKNA 2PVHA 4QYGA 4GL9A 4UWYA 3T3VA 2VTIA 3KN6A 2ZV2A 4L46A 4B6LA 4YTCA 4MNEB 2BRBA 4MWHA 3D94A 1WBSA 5TKDA 2C3LA 3G9NA 4QNYA 5IDNA 1SNXA 5HI2A 1URCA 3G2FA 3G33A 4GW8A 4ZTNA 4XLIA 4X6RA 4QYYA 4IE9A 5IA3A 4I6FA 1B39A 4OUCA 3I0OA 4PY1A 3NYOA 5H8GA 4BL1A 1I09A 4D2PA 5A54A 3MVHA 3FL5A 3MVLA 3PA5A 3VC4A 3LJ0A 3CTQA 4EH8A 4ZEGA 1VZOA 5IQIA 2W4KA 2ITPA 4UXLA 3UNJA 1Q5KA 3E3BX 4AGDA 4CGAA 2Z2WA 3R1QA 3M2WA 4FODA 4RA4A 4BCGA 3WF9A 1OKZA 3VS1A 5AUYA 4IVCA 4CT1A 2YCFA 4UB7A 3ID6C 3DT1A 2C0IA 3IOPA 3KK9A 3QLFA 5FEQA 4F64A 3BGZA 1V0BA 4GS6A 4PWNA 2R3FA 4YNOA 4M66A 4EZ5A 4YLKA 3KF7A 2PSQA 4YJUA 5CSXA 2C5YA 2JIIA 1MQBA 4GCJA 4M15A 1REJA 2R7BA 3Q5IA 3GU7A 3W8LA 5HTBA 5H9BA 5IEXA 4QYFA 1Y8GA 2VWXA 4MD8E 3MPAA 3COIA 5T68A 3RJCA 4B0GA 2AC3A 4NZWB 4TY1A 3FLYA 4F6SA 3PJ8A 2W4OA 4M97A 5F95A 3FI4A 1TQPA 4DLJA 3OXIA 2W1FA 5CU4A 3GI3A 3QC9A 4I0SA 3ZLSA 2YDJA 4K2RA 5D7VA 4YC3A 4HYSA 3VVHA 3M42A 5IUGA 4DG2E 3PRIA 4E6CA 3BV3A 2EU9A 4BWKA 3QTIA 3MSSA 4ITIA 3VF9A 5CEOA 1P4OA 1UKHA 3SC1A 2PZRA 2NNWB 4IADA 5FRIA 1YRPA 4IAKA 5AP3A 2Z7LA 1KV1A 2XH5A 4FF8A 4IDVA 5ANIA 4EH6A 3EHAA 1ZY4A 3CD3A 2OWBA 1W83A 2W99B 4J99A 4JAJA 2Z02A 5FTGA 2V7AA 3VQHA 3GFWA 4IAFA 4RBLA 5HD7A 2VWUA 3AC3A 2H9VA 3CEKA 3MPMA 5IUIA 3SD0A 3Q3BA 4AN9A 4ANMA 3OHTA 4KABA 1OVEA 3P78A 3GXLA 3QHWA 2XMYA 3DAJA 4YTHA 3FQEA 3O2MA 3TZ8A 3ZTXA 4F0FA 1UWJA 2GNIA 4PTCA 4LGDA 3NS9A 4CFWA 4EH3A 1SVHA 3IDPA 5HD4A 5KMOA 2HZNA 4BCIA 4CCUA 4I1ZA 4MD7E 4O38A 3RMFA 3W1FA 4LOPA 2PVKA 4AW5A 5KBQA 5KHWA 1V1KA 4CZTA 4FZ6A 4NM7A 2E9UA 4ZS0A 2XNEA 4L8MA 5I0BA 1JPAA 3PUPA 3QGYA 3QF9A 1QCFA 3F5GA 4BDJA 3R83A 4CZUA 3R8LA 2BROA 2IVUA 2ONLA 3E92A 2O3PA 4J1RA 4OW8A 4A7CA 2VWZA 3W2CA 4D0WA 1YW2A 3EOCA 4YTFA 2QG7A 4I23A 2Q0NA 3NW6A 3QQKA 3VS3A 2HW6A 3V6SA 4OT5A 2XF0A 3PVGA 4BDGA 5L6WL 5HNBA 2X9FA 3MYGA 4G3FA 3CPCA 2QQ7A 5LOHA 1PXNA 3E93A 5HO7A 2CLQA 2OKRA 2XEYA 2OK1A 4E4LA 3QCYA 3GU6A 1PXPA 2QR7A 1KE5A 3R7VA 3HAVA 4M12A 4C4EA 2YCQA 3NW5A 3FDNA 4FV1A 4TYEA 4ASDA 2P4IA 5IDPA 4EK5A 1O6YA 3IECA 4PTEA 4ASXA 4DGMA 5EYMA 2B7AA 3CBLA 2GPHA 2PHKA 4E20A 3DNDA 4GK3A 4NFMA 2JGZA 2W5BA 1ZYJA 5AUWA 2X2KA 3VULA 5HE0A 3VRZA 2C30A 5AIRA 4I5HA 2UW7A 3BX5A 4TZRA 1H1RA 3ATSA 1LP4A 3EN9A 4S30A 5ACBC 3OMVA 4XG4A 2GNFA 4AW0A 4L7SA 4GH2A 2VTRA 5I3OA 3S1HA 3C4FA 3F5UA 3H3CA 4XH6A 3C4ZA 3CLYA 3F7WA 3GUBA 4K18A 3FI2A 4RFYA 4ARKA 2JBOA 2PVYA 4ASZA 2V0DA 2YIQA 2JITA 2QCSA 3MN3A 4JLCA 3OOMA 3PDTA 2YISA 5T6KA 4RJ3A 3RALA 1K9AA 1Q97A 1IG1A 4TW9A 2XK3A 2Z7SA 3L8XA 3ITZA 1JLUE 4OTFA 1JAMA 5CI6A 4LL5A 5IH4A 4I4FA 1IAHA 3GQLA 2HIWA 2PK9A 4FSMA 2BAQA 3MA3A 4OBOA 5FBNC 4ACDA 5BVWA 4FICA 1G5SA 3IQ7A 2C6EA 4WKQA 3ROYA 4DTBA 1PY5A 4FOCA 3AD6A 3UPXA 3HRBA 4KIQA 5J87A 1DI8A 3V5PA 4C02A 4I6HA 3NNWA 2VTNA 3FKNA 3ORLA 5IQEA 4EEVA 5ETFA 4CV9A 2C6LA 5HVYA 4DGNA 3HMIA 3KQ7A 3LFFA 4RG0A 2VX0A 3DOGA 4TL0A 3KRXA 3V51A 2XM9A 4PPCA 1JSTA 1ZARA 3DU8A 1BL7A 3QZGA 2G1TA 2QO2A 3NDMA 4QMTA 3S95A 5C8MA 3TV6A 5AM6A 3PIYA 3LIJA 5AV2A 3NUSA 4UV0A 1W82A 3RCJA 3NNUA 5E90A 2J0KA 5KE0A 4ZLYA 1OKYA 2QOOA 3LE6A 3E62A 2QOFA 2OIBA 4E4XA 2FVDA 4O7ZA 3OCSA 4XOYA 3E88A 3ZXTA 2IG7A 2O2UA 3C0GA 4QQCA 1JSVA 3NWWA 1Z57A 4UMQA 1CDKA 4M8TA 2PE1A 5J95A 2R3LA 2HELA 3R30A 2UW5A 1NT2A 4LRJA 4WG3A 3JYAA 4YC6A 4O86A 2QOLA 3LPBA 3NNXA 4AOIA 3MVMA 4R7IA 3HV3A 2PYWA 5C01A 4Y8DA 4CLJA 4KBKA 2VO6A 4PMPA 1UU7A 3SG9A 4PPAA 4NCTC 3O71A 4FKJA 2OXDA 4KIKB 2XKEA 2W06A 1S9IA 3SA0A 4CQEA 1PKDA 4R8QA 1ZWSA 2JDRA 1ZOEA 3P5KA 2WQNA 1Q61A 3TEIA 2CHLA 2C1AA 2YM7A 4U79A 2YA9A 4EC8A 5IH5A 3HMNA 3DXPA 2QLQA 4EONA 3BZ3A 2JC6A 2JKKA 2PUPA 1NY3A 4FL1A 3UO5A 4EHGA 4BCPA 2JKOA 3I0QA 4X2JA 2DWBA 4YO4A 5BVEA 4HVHA 2YDIA 2WMAA 2PVLA 1P4FA 2RF9A 4PPBA 3VBYA 4UXQA 4V0GB 2YJRA 5L2WA 4FKOA 4RX8A 4I6BA 3FXXA 4B8MA 3OROA 4JBOA 4M13A 3RK9A 2W1IA 3DXNA 4BVUA 4A07A 4BBEA 4FIJA 4CFUA 3SHEA 4DCAA 2GS7A 1BI8A 1YXVA 3MIAA 4BDIA 3LQ3A 2XNGA 3IO7A 3W10A 3L8PA 4JQEA 3HL7A 4JT3A 2YHVA 5E8UA 3VBQA 2GQRA 4U3ZA 4S34A 3ULZA 5GJDA 3UIXA 1YI3A 3R1SA 5AJQA 4CZYB 5K0KA 2ITZA 3U4WA 3ZO3A 1ZRZA 4WSYA 3U9CA 2OICA 4O1PA 4ZSJA 3F5XA 3KRWA 1DAYA 3BIZA 5HEZA 4JDJA 3GCUA 4ZK5A 4BGGA 4IAIA 1WCCA 2R64A 3RGFA 3TI1A 2F57A 4TWNA 4IM2A 2UW0A 4K9YA 3WZUA 1YOJA 4JXFA 3BCEA 2X6DA 2R2PA 3QRJA 2ETMA 5IPJA 4U44A 4I21A 3UVPA 4NW5A 1YDTE 4QP7A 2DYLA 5EM6A 4DEAA 4MEDA 5AX9A 1RDQE 3QCSA 5H8EA 3BWFA 4GRBA 3VWAA 4HVIA 5L8JA 3ZXZA 2VGPA 4C58A 3DDQA 5CEIA 4EQMA 2PMLX 2A1AB 2J4ZA 4W9WA 3SAYA 3FI8A 5IQAA 2ETRA 5I9VA 1ZXEA 3R0TA 1JKLA 4U7ZA 2C5VA 2BPMA 2E2BA 3RHKA 5HCYA 4UYNA 2JD5A 2QVSE 2VTQA 4YP8A 5H3QA 4KB8A 4JBQA 4MF0A 3QTQA 1M14A 1VJYA 5A14A 5JZJA 4ANNA 5EM7A 4FT3A 3DK7A 3EQGA 4ZP5A 4LM5A 4AG8A 3PRFA 3G9LX 4RIXB 3V5WA 4C4HA 2VTMA 4PP7A 2R4BA 1U5QA 4GIHA 2PVFA 4NYEA 3ZMMA 5IA2A 5J1WA 1QMZA 4EK4A 2PULA 2O8YA 3CJGA 4FOBA 2C5XA 3O50A 2JDTA 5CVGA 4ONAA 4C2WA 4ZZNA 1JVPP 1O6LA 2YLFA 1H08A 4BF2A 1W84A 4M0YA 4EH2A 4FC0A 3PE1A 3TZ7A 4G3DA 3EQPA 3EJ1A 5DWRA 1JKSA 4X21A 5AX3A 4C3RA 5HE2A 5L3AA 4ZTMA 2BHEA 4GJ2A 4I4EA 4WSQA 4D4VA 1NW1A 4FTOA 1WVXA 4CMTA 3LW0A 5F20A 5C27A 3VJOA 1U5RA 3II5A 4BFMA 3UO4A 5IQDA 2XJ1A 4AT3A 2BRNA 3FKLA 2PTKA 4FKVA 3FQSA 4LUEA 2H6DA 4XEYA 3F3UA 3RAHA 3FHIA 1WVYA 3PXKA 2DQ7X 4BTJA 3GFEA 2I0HA 3NW7A 1OBDA 5J1VA 4PMTA 4Z3VA 3C5IA 2CJMA 2W7XA 2YM4A 4GT4A 4CG9A 2WEIA 4YJRA 4X6QC 5EKNA 4IX5A 3FSKA 1YOLA 1AGWA 1EH4A 4PL3A 3LQ5A 5JEBA 4NH1A 3R8ZA 4GMYA 4E3CA 2I40A 3AMYA 1V0PA 4TYHB 4GUBA 4DEEA 1H0VA 4C57A 4FE2A 5JSMA 1HCLA 4YZBA 1WBOA 3FPQA 4BR3A 4FG8A 3THBA 4MXAA 4E5BA 4G31A 2VO0A 4UZHA 3W2RA 4FIHA 4JJRA 4EWQA 4XV1A 4IXPA 1JBPE 2BFYA 4XUFA 5JMSA 2GSFA 3MB7A 1BLXA 3ODYX 3QX2A 5EI2A 4U43A 1LPUA 3S00A 3LXLA 1U54A 3FPMA 1JKTA 4L52A 1MRUA 4LI5A 2CNVA 4GIIA 3R6XA 3RAIA 1OI9A 4HOKA 4F63A 5AR7A 3V5LA 4L43A 2HWPA 4YZDA 1FMOE 2KULA 2HZ4A 2FYSA 3PJCA 3WZEA 3OEZA 2OXYA 2ERZE 3MY0A 4WRGA 5AFVA 2ZV7A 4XHKB 1H1WA 4DITA 1XO2B 4FKQA 5FTOA 3GCPA 3KCFA 5E8ZA 2PY3A 4FSZA 4R78A 4ZTLA 2HOGA 4YLJA 3TJCA 4DE4A 2FUMA 5CEKA 2NO3A 5DFPA 4L7FA 3RAKA 3FQHA 2IO6A 2BZIB 3TTIA 3UMXA 2ZJWA 3WILA 4P4CA 2WXVA 5BVKA 3OUNB 1JKKA 3R22A 2IN6A 3SGCA 3DV3A 4O7SA 5LMAA 3OEFX 4R1YA 4LFIA 2WMVA 3F7ZA 1XH7A 3AD4A 3NCZA 5GHVA 1E1VA 2XK7A 4R3CA 3F66A 5J9YA 3EYGA 4FT5A 4WG4A 3BI6A 4PP9A 2GFSA 3L1SA 2X2MA 4I22A 3FMKA 5CU2A 1L8TA 3D15A 5HOAA 4QP4A 5GZAA 4DLIA 4FZAB 2CKOA 1OMWA 4EOMA 2CGXA 3QTWA 3UODA 3FLZA 4FT7A 2IW8A 2X6EA 4ZJVA 4O22A 3R63A 1KOBA 4FIFA 4BZNA 4APPA 2FSTX 5AV0A 4N6YA 3ZDUA 3ZZWA 3ZEWA 4FGBA 2JIVA 2A19B 4RC3A 2UW6A 1ZOHA 5ETAA 2ITVA 2B9IA 3FC1X 4F9WA 5DNRA 2YCRA 4K8AA 5GZ9A 3ROCA 3UOJA 4QQ5A 3EZRA 2G15A 3KRRA 4BDAA 2XKFA 3R8PA 5I9WA 5D1JA 4AFEA 3AXWA 3M11A 3DFCB 3U55A 4CKJA 2X8DA 2DUVA 1W7HA 3A62A 3RPOA 5F94A 4W4VA 4EK6A 4F65A 2W1HA 2REIA 3KC3A 5EQEA 4FTKA 1WBVA 2JKQA 4PF4A 3V04A 4U6RA 5FDXA 2I0EA 3F61A 3P1AA 3WOWA 3SRVB 4FZFB 3V3VA 4B8LA 3B2WA 4RPVA 3MIYA 3SKCA 3UQGA 4LYNA 4TT7A 3O51A 1YWNA 1H8FA 4PNIA 4AF3A 4O84A 2ITOA 4QMQA 3KCKA 2I6LA 4CCBA 4CKRA 4XP2A 4X2FA 3H4JA 3MB6A 4G17A 1CKPA 2ZDUA 2O63A 1H4LA 3OWLA 3U87A 5T3QA 3TDWA 2QOBA 3LHJA 3ZLXA 4EL9A 1GZKA 5AUUA 4BBFA 5DEYA 5TE0A 3JPVA 4PRJA 1GIHA 4FSYA 1Q4LA 2FH9A 3ANRA 3E5AA 4NKAA 3EYHA 4ACCA 5JFSA 4YNEA 4U9AA 2YDKA 4U3YA 3U51A 4ANSA 3HDNA 5HU9A 3LFCA 5EOBA 5EDRA 1PMUA 3V6RA 1YI6A 4RRVA 2R0IA 2HY0A 3HV4A 5IU2A 2F7EE 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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