4D5HA

Focal adhesion kinase catalytic domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
272
structure length
255
Chain Sequence
YEIQRERIELGRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPAMAVAIKTCKNCTSDSVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWIIMELCTLGELRSFLQVRKFSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSATDCVKLGDFKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDVIGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Allosteric Regulation of Focal Adhesion Kinase by Pip2 and ATP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FOCAL ADHESION KINASE 1
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 79
structure length 255
sequence length 272
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2014-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4d5hA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4d5hA01
1XWSA 4JVGA 1ZRZA 2R3IA 2XJ1A 2Z7QA 2C5YA 4J97A 4NIFA 4HGEA 4IB5A 2CKQA 4PTCA 3EIDA 1UNLA 2WMUA 4E6CA 3NW7A 3V51A 3O51A 3HV3A 4U80A 2CNQA 1BL7A 4FTRA 2GQRA 4AN2A 1H1PA 3WF6A 3LQ3A 1H00A 4R6VA 3ITZA 3KA0A 2OWBA 3IDCA 2WQEA 2YM6A 3BU5A 3O7LD 4HCVA 3PDTA 5HNGA 4EI4A 4L52A 4ITIA 3WBLA 2ZV8A 4AAAA 4S32A 3JYAA 4R1YA 4PPAA 4FA2A 5A14A 4DGNA 3CJFA 3LFCA 4AT4A 3PG3A 3MA3A 2UZUE 2X4ZA 4AOJA 3QZHA 5L4QA 5JQ8A 3FDNA 5JN2A 2B9FA 2CKOA 3LFFA 4X6QC 1PKGA 2NRUA 4U9AA 5CWZA 3KXZA 3FL5A 4O0TA 4XBRA 4ANSA 1Q3DA 3QKKA 1P2AA 5DEYA 4W9XA 1YDSE 4AW0A 1BUHA 1OIQA 3EYHA 3QL8A 5AP6A 4C7TA 5I9YA 2XM8A 3TUDA 3NCGA 4NUSA 4ZTRA 4HYHA 4FI1A 4FSQA 4U6RA 2XK8A 3E92A 2G2FA 1XHAA 1UV5A 4TWCA 5A4EA 4D2PA 5D7AA 3ZOSA 4ZTLA 1H1SA 3KKVA 3RI1A 4P90A 3HP2A 5E8VA 3ZSGA 4BI1A 2IVSA 3FKOA 3DLSA 3FXZA 5M4CA 5L2TA 4F4PA 4RFMA 2XIYA 2ITTA 2YIXA 4RWIA 5IUGA 4ANMA 4F0IA 2BR1A 5HLNA 3F69A 2A0CX 3LW0A 4A9YA 3FQSA 4Y83A 5JGAA 3QHWA 1H0WA 2GFSA 4DE4A 2A19B 4XP2A 5EM7A 3B8RA 3R7VA 2C1AA 3TKUA 1J3HA 2PVLA 3N9XA 4Z55A 2IZRA 3I60A 3QD0A 5HU9A 3HUCA 2ERZE 3GCVA 4CZUA 2VWWA 2XNOA 5KMMA 4NCTA 2VWXA 1SM2A 3ORXA 2J90A 1RW8A 5EHLA 5M55A 4DFXE 3HECA 2OXYA 5JEBA 3C9WA 4X3JA 2ITVA 3R1YA 4K1BA 3BHTA 4QMXA 4QMZA 3A4PA 3W8QA 1WZYA 4JXFA 1ZY4A 1Y6AA 3H9FA 3C4ZA 3EB0A 5AV2A 4FG8A 5HBEA 3MN3A 4AW5A 1JVPP 4C33A 2JIIA 2QKWB 4U42A 3QD3A 2A27A 2QI8A 4LRJA 3A7JA 3W10A 2CPKE 2CGVA 3CXWA 3HMOA 4M14A 3PSBA 3UO6A 4E26A 4BCMA 5AA8A 5BMSA 4DEIA 5IZFA 2B0QA 4BDJA 2ZV7A 4FTIA 2EU9A 1ZYCA 2OSCA 3Q6WA 1GNGA 2WMXA 4YJQA 2DS1A 4FNZA 3A99A 2CGUA 3Q6UA 3PRFA 1YDTE 4AGWA 5AUZA 5EW9A 5K3YA 2GS7A 3TACA 2YCQA 4QYGA 2C1BA 4RIXB 4X3FA 4WOVA 4C2VA 3UQFA 1H01A 2HIWA 2B9JA 5FBOA 3FXXA 4J53A 3HRFA 5KMJA 4MTAA 4D5HA 3GC7A 1OKYA 3UOKA 3U6IA 4HZRA 1BYGA 4MNEB 5DRBA 3SQQA 4UXLA 1U54B 1TQIA 5H9BA 5D11A 2PULA 4FEUA 3FV8A 2JDSA 4NTSA 4ZJJA 3SKCA 5AP4A 3AD4A 3R9NA 1MUOA 1SMHA 3KVWA 4PL5A 2V55A 3RM6A 2ITOA 3RAWA 3IKAA 1ZOEA 5J1WA 4OBOA 3BE9A 4FKOA 4M7IA 3V04A 4Z7HA 4EONA 3LM5A 2WPAA 3FZSA 1OECA 4O91A 3RALA 3UG2A 4CG9A 2WMRA 5HO8A 4AZTA 3OOMA 3Q4ZA 4KSPA 4XP3A 5CU4A 3ZUVA 4AQCA 4CG8A 3AT4A 5GINE 2A1AB 3E8NA 1KE6A 2B55A 4BCPA 4FIFA 5AAFA 1XQZA 4YHTA 4J71A 4YC6A 1P4FA 2WB8A 4U44A 2KTYA 2W96B 2CGXA 3BYVA 4RVMA 2Y7JA 4B4LA 3R01A 4RLKA 2VWBA 1KOBA 5TO8A 5FM3A 1VR2A 3W1FA 3Q2MA 5LVPA 4N57A 5DEWA 1Q61A 3D9VA 1JKTA 3FKNA 2XBAA 3NUNA 3BBWA 5JFSA 3QKMA 5A3XA 3RK9A 3Q9WA 5KZIA 5ANIA 4E5BA 1Q24A 2W05A 4RIWB 4G3GA 4FL3A 3S2PA 4OAVB 4FTAA 4RFYA 2F2UA 1YHSA 2WU7A 1M14A 2E9VA 1CMKE 2WEIA 4FKUA 3G5DA 3OTUA 3R9DA 3T8OA 4ALWA 4BDKA 4I0RA 5HCXA 3KVXA 4F1OA 4GG7A 1PY5A 3QQLA 4YZBA 4PQNA 1ZOGA 1JKSA 5ICPA 3W2CA 3HRBA 4JLCA 4EOKA 2UV2A 3RAKA 4LUDA 3PJ2A 3EFLA 3MY1A 3RNIA 3WF7A 5EYMA 4QMLA 4GH2A 2ZB1A 4JX3A 4N6YA 4UXQA 4FKRA 4P2KA 1P14A 1ZY5A 2VTJA 3BGQA 3W2SA 5L8LA 2UW7A 1H28A 1Q8YA 4ZS0A 5EG3A 4EZ7A 3HVCA 2VTQA 2X1NA 4IVAA 2XF0A 4Y73A 2YM8A 4BFMA 3QCXA 3ROCA 4R7IA 2OK1A 1VYWA 3C5UA 4X0MA 4EWHA 5K4JA 4O7VA 4HGTA 5HESA 3LCSA 4IQ6A 2WQBA 2XK9A 4ZMFA 3PLAE 1YW2A 3SOCA 4DC2A 5IMEA 2E9OA 2VD5A 2UW4A 5DT3A 3EJ1A 3D7ZA 1E9HA 2ERKA 4G34A 3THBA 2EVAA 4RJ3A 4C4IA 4O6LA 5L6PA 2ITYA 4KSQA 1QMZA 4H1MA 2XIRA 3DOGA 3AD6A 3R02A 4JG7A 4IBMA 3GP0A 4A7CA 3UTOA 4GCJA 2OG8A 4F99A 1FMKA 3FMMA 4PNKA 3BYSA 4BCNA 3OXZA 3MY5A 4CMOA 1WVYA 3BLQA 4XX9A 4YUQA 3I5ZA 4F9WA 4L00A 5CF5A 3FQHA 1VEBA 3H0YA 4FT3A 2W9FB 3NYXA 2X7GA 3FKLA 4J7BA 3FLWA 2RSVA 3PA3A 3SAYA 4U40A 3Q3BA 4WNOA 4F7JA 1Q97A 3QALE 2I1MA 2ZV2A 3FI4A 2GU8A 3QA8A 4YLJA 5A4CA 3DXPA 3GC9A 3FSKA 5LARA 5AV4A 4QMQA 4JBVA 2W1ZA 4PDSA 4W8EA 4KB8A 3TUCA 3QQGA 4ZLYA 1Z9XA 4LRMA 4IDTA 1JPAA 3ZBFA 3HP5A 3KGAA 2QO7A 3PSDA 4YTCA 4HYIA 4QTCA 2JAVA 2XRUA 4LYNA 3DQXA 1U5RA 5CNNA 3R1SA 3OXIA 4R7HA 3Q9XA 1PXOA 4K0YA 4MVFA 3MVHA 4FTQA 3MYGA 1LEZA 4V01A 5DIAA 5HHWA 3WZJA 4BCJA 4GK3A 3BU3A 4D1XA 1PMVA 3ODYX 5EHYA 2BZKB 3F2RA 2QNJA 4KAOA 4DG0E 2OJIA 3VC4A 3DT1A 2JKQA 2VGPA 4NTTA 4RZWA 3MJ2A 3KFAA 1SVGA 4N4SA 5AUVA 3QYWA 3H9RA 5BYZA 2ACXA 3GOPA 3I5NA 4W4YA 4WIHA 4EYMA 4BR3A 3C5IA 2CKPA 4F0GA 3EQRA 2RFDA 4O84A 3R63A 2X9FA 3FSFA 3MVJA 3A7IA 2VTNA 4RJ4A 4FUXA 5EOBA 5T6KA 2PWLA 3KEXA 5LCJA 2PZRA 2OJJA 3QQJA 2X39A 2W5AA 4DEBA 3IW8A 3OT3A 2OZOA 3OT8A 3OEZA 3E8DA 4G31A 3RCJA 3ZHPC 2VUWA 2XVDA 3MI9A 4GUBA 3TN8A 3FMJA 3TNQB 4DINA 2OFVA 4ASXA 5A6OA 4IZAA 3COIA 5A54A 5IUHA 2ZV9A 5JH6A 1MRVA 2ITUA 4YJOA 4R78A 2CN5A 3QUEA 4FTNA 3N4TA 1OITA 4WUAA 4BGHA 4F09A 3WZUA 5M57A 1PKDA 3O0GA 4XV3A 2PTKA 3DNEA 4IWOA 4RRVA 2R7BA 4I94A 4IZ5A 3SXRA 3SVVA 2PY3A 2F7EE 2Y9QA 4EL9A 5FEEA 4FKPA 2VTRA 3UZTA 3HEGA 3PWDA 4YJPA 4D0WA 3P79A 5B7VA 1IRKA 4YBKA 1FPUA 3CY2A 2X0GA 3ZEPA 2QU6A 4D1ZA 2C5XA 5DLSA 1QPDA 4GK4A 5DH3A 4BDGA 4QTEA 4N70A 2PZ5A 4L8MA 1ZMWA 5D12A 2WHBA 2PMIA 4FBXA 3HA6A 5EM5A 1YWVA 3O96A 2W4KA 2UW5A 2GHLA 3EQDA 3Q04A 4MXCA 4AT3A 2RKUA 3H10A 5HD7A 4RPVA 3UE4A 2OIBA 3HV4A 3LFBA 4EOQA 4DT8A 3CY3A 1S9JA 2JEDA 4OLIA 4CRSA 2OXXA 2B54A 3ORKA 4OBPA 5HLWA 5CU3A 4DBNA 5FM2A 5IQGA 3P08A 3TV7A 4D4VA 3DGKA 4FZ6A 3ATTA 2XJ0A 1ZMUA 3DBEA 5TR6A 2CLXA 3P78A 3VULA 3ZFMA 4EKKA 3RAHA 2XB7A 2HAKA 3GXLA 2XK3A 1M7NA 5BVDA 1OBGA 3HMIA 4IIRA 4L3PA 4MF0A 4LFIA 2XBJA 2H8HA 2XH5A 4EH9A 3JY0A 3AG9A 3LQ8A 4O7WA 2PMOX 5CU2A 4GFGA 4YHFA 2YCRA 5M4IA 1UA2A 1WAKA 2XNBA 3W2PA 3ZC5A 4CFXA 4E4MA 3PY1A 3P7CA 3WYYA 2J4ZA 2W5HA 3BYMA 3QXOA 5FTGA 4R1VA 3PVUA 2XIZA 5KUPA 2QONA 3CPCA 3C1XA 3MVLA 4L3JA 4UALA 4Y85A 5LMAA 4TXCA 5HG9A 2NRYA 3DKFA 2QVSE 3OWLA 4FNYA 4M66A 4L44A 4QMUA 4AA4A 4AN3A 4DGGA 1KOAA 1Q41A 4GRBA 4NWMA 5HI2A 1CTPE 3ORTA 3R7UA 5HTBA 4L3LA 5CXZA 5JGBA 5L2SA 1RE8A 4FV4A 3PPKA 5EI6A 1FVRA 4EZ5A 3OY3A 3KK8A 5BVEA 3GCQA 4O7LA 5H8BA 4DAWA 1W82A 2JDVA 4CMUA 2OZAA 1PMNA 4MBIA 1CM8A 4RLLA 3KY2A 4I92A 5K0XA 1PXMA 3E64A 1FGKA 3P9JA 2J51A 3ID6C 2GQGA 4E73A 4GJ2A 5FTQA 1YXTA 3V8WA 4GL9A 3GUBA 5IDPA 1YOJA 4UMPA 2Q0BA 3W18A 4M12A 3PIYA 1STCE 4QQJA 5H8EA 3LJ0A 4YO4A 4PPCA 4O7RA 3LMHA 1R0PA 3LJ2A 1ZARA 4GIHA 4LL5A 5B2LA 4Y8DA 5M07A 1WVXA 3ZUTA 3U6JA 2E9UA 3U54A 4S31A 4G17A 5K5NA 4O1PA 5AP7A 5M09A 3KRXA 1E1XA 3AMBA 2WIPA 5AR8A 1YVJA 4ZOGA 4Y5QA 4D5KA 2J0KA 1U59A 4XOYA 2I0VA 4RX8A 4USDA 3Q5ZA 3S4QA 2QR8A 1DI9A 3CTQA 3HUBA 3Q4TA 4GVJA 4EK5A 4HW7A 5KMIA 4EK3A 3L9PA 3FLSA 3GFEA 1RDQE 4ID7A 4DF3A 2QURA 2YCSA 5AAEA 5A4QA 4GT5A 4YZMA 3PFQA 4XUFA 3HV6A 3DJ7A 3UZPA 4FT9A 2B52A 2W5BA 3HMPA 3UO4A 4YJRA 1JQHA 2EB2A 3ZTXA 2R9SA 4I20A 2PVFA 4HNFA 3I7CA 2YZAA 4IADA 4KRDA 4ASDA 2XS0A 2WMWA 3G6GA 3ORNA 1TKIA 2ZJWA 4QTDA 3VO3A 2QCSA 5FP5A 1ZLTA 4MEDA 2Q0NA 1YI4A 2VU3A 2UZDA 1P5EA 3PXQA 4I3ZA 4CKIA 3RK7A 2C6EA 4A9UA 1J7UA 4BBMA 2IG7A 1CKPA 3DAJA 2P33A 1KV2A 4O6EA 3WZEA 2YA9A 5CEQA 4FTLA 3MVMA 5J87A 2OLCA 4ZLOA 1I09A 3IQ7A 5FXSA 3O50A 4AGCA 4JNWA 2YIRA 5FGKA 3PE2A 4WRGA 1ZZLA 1UWHA 3NUYA 2C3KA 4LRKA 4NCTC 4DITA 2PMNX 4GUEA 1JWHA 3CP9A 4E7WA 3PJ8A 1MQ4A 3VJNA 3I81A 1BLXA 4FV2A 4IZ7A 4GT3A 4DBXA 1UVRA 2E2BA 4L7SA 4MD8E 4TYHA 1UNHA 2BHHA 3O8PA 4U79A 4CT2A 3ZLWA 3C4FA 3KXMA 5CQUA 2VWYA 2F9GA 4G6NA 4IFCA 4O0UA 3R22A 5GNKA 5IF1A 5J7BA 4DH1A 5AR5A 5JK3A 3EOCA 2QU5A 4K9YA 1XH6A 2UW9A 2BILB 1V0BA 5KNJA 2BKZA 3A61A 3ELJA 5EYKA 3TUBA 4IM0A 3MA6A 3AMYA 4E93A 2WELA 4AA0A 3LMGA 3UVQA 3H4JA 1GOLA 1FBNA 5BYLA 1ZYDA 2IO6A 4BKZA 4EOOA 2Q83A 4PMSA 4EK6A 3PJ3A 3ACKA 4AG8A 2J2IB 2V7OA 4G3FA 3MTLA 3HV7A 3I0QA 5FD2A 4G5PA 2GNFA 1BL6A 3UMXA 4ZSGA 3VBXA 1B6CB 3VUTA 4FTJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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