4DAWA

Crystal structure of pak1 kinase domain with the ruthenium phthalimide complex
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
294
structure length
293
Chain Sequence
SDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAIRQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAKEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The art of filling protein pockets efficiently with octahedral metal complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 1
total genus 96
structure length 293
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dawA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dawA01
3GFEA 2VTPA 4KAOA 4M14A 4HYIA 5JN2A 5KMLA 4FG8A 5E8TA 1KE5A 3WIKA 4CRLA 3SGCA 3C9WA 3OCTA 4F64A 2CKOA 3QUPA 4F9BA 4OTHA 2J2IB 2OJGA 5IMEA 2VUWA 4PMPA 3KU2A 4FC0A 5D7VA 1GY3A 2X39A 2CMWA 3KULB 4V04A 2IW8A 3TG1A 4RWLA 3HGKA 5FTQA 1YXVA 4NTSA 2E9OA 2PVJA 3PWYA 1REJA 1XH5A 3G9LX 3LFNA 3PIXA 4CMTA 5C27A 2PVNA 2XS0A 2ZV8A 3OXZA 5BVDA 4WSQA 4KSPA 5FTGA 2B9HA 4Q2AA 3K54A 5LQFA 2A0CX 4N70A 5GJGA 5CU4A 3ZRLA 3K3IA 3KRLA 3Q9YA 4UXLA 3VRZA 3DY7A 5JQ8A 3E64A 3QL8A 3B2TA 2OIQA 3CTQA 3ZLWA 1KWPA 4J96A 2UZDA 3MA3A 3COIA 4MBJA 4EKLA 4FIHA 4BCOA 3NUUA 2QD9A 4MEDA 5I9VA 2H9VA 4BBFA 5EQYA 3FYJX 4V0GA 4ZLZA 3VJNA 4AZTA 4PTCA 3WZUA 4UN0C 1LUFA 4X2FA 2WMVA 3SX9A 4BDDA 4ZJJA 2E9PA 3CD3A 4N6YA 3A8WA 4OT6A 1UKIA 3AC2A 3KGAA 2OLCA 1M2PA 3CE3A 5DR6A 4ZK5A 2OF2A 3RNYA 4X0MA 1WVWA 5EFQA 4AZVA 3A7GA 1WBWA 4KD1A 5HCXA 3D14A 4O7NA 1UNLA 5BYLA 2J0IA 2IVTA 4ZTLA 5AR5A 4E6DA 1A06A 4IAAA 2AUHA 3R9RA 2HENA 5F1ZA 4G6LA 1OKZA 1M17A 4C37A 4O0TA 1YI6A 3BLHA 2VTRA 3FXWA 1CDKA 4NZWB 5HG5A 2RF9A 1QCFA 4ZP5A 4ZTQA 2PTKA 3EFJA 3R9DA 2ITVA 4IM0A 3C4XA 4A06A 5AAGA 4Y95A 5FBOA 2KULA 4YC8A 3KXGA 2YM6A 3QCYA 2B54A 5DVRA 4OTIA 5TE0A 4X3FB 4TYHA 1CM8A 4IWOA 4P7EA 4KSQA 5JKGA 2SRCA 2W5BA 2YCSA 2F7ZE 2G1TA 4HCUA 1ZZ2A 2Z7QA 4UB7A 4XP3A 3H9FA 1V0PA 3BHVA 2WMTA 3VBTA 1R0EA 4GCJA 5DT3A 4MH7A 3UC4A 3GC7A 4PP7A 1BL6A 4WNOA 1OPKA 4IVDA 3R7OA 4AW1A 4RX5A 2W1IA 2BRMA 4CGAA 4MNFA 5BUEA 4BZNA 1IEPA 4FVQA 4L67A 3H10A 3DXNA 4YU2A 3FZSA 4A9TA 2YM8A 3DNEA 1XH6A 3FI2A 5A6OA 2OF4A 5FD2A 2YIXA 4BDGA 3G90X 4F1MA 4L6QA 5TO8A 2PK9A 4I4EA 4BICA 3CR0A 2WEIA 4ITIA 4CKRA 5FM2A 1WBNA 3QUEA 4EK4A 2YCFA 3IGGA 3NSZA 4D28A 3LFAA 5M4IA 2BRGA 4FOBA 4UV0A 1CMKE 1W8CA 3LFBA 5AUUA 4G2FA 4FT3A 4O6LA 4DN5A 4R1VA 4IVAA 2XZSA 4UXQA 4BIBA 2BR1A 2X2LA 2BRBA 2C3JA 3GCUA 5HBEA 3LQ8A 4EOIA 4DA5A 3LXLA 2BZJA 3EFLA 3GNIB 2JAVA 2VRXA 3ET7A 3QXPA 4OBPA 5HTBA 2B1PA 2CHLA 3OOGA 3QYZA 5CAQA 3ORNA 2VNWA 4NW6A 1YI4A 5JEBA 4IW0A 4AA4A 4G17A 2IZUA 2W9ZB 4IWDA 3NYVA 4TN6A 4O38A 4YR8A 5L2IA 3DFAA 5A46A 3F3VA 4QMYA 3PPZA 3D5UA 1YOJA 4QPMA 2W5HA 4EOQA 2O0UA 4JBOA 4DH5A 5GINE 4FV3A 3MI9A 2UW6A 3WILA 4UWCA 5K9IA 3RNIA 3BIZA 3VW8A 4KUJA 3TWJA 5JRQA 4J8NA 2PE2A 4R5SA 1OIYA 3ZSGA 3EL8A 4CV9A 4F1OA 4JG8A 3BI6A 4DGGA 3BELA 4CNHA 2B7AA 2QOQA 3AMAA 2XNNA 3FMEA 2RGPA 3NZ0A 4X2GA 4AG8A 3QRJA 2XP2A 3LCKA 4GUEA 3PSBA 5KZIA 2EB3A 3E7VA 3KL8A 3LFQA 4AT4A 3QTXA 3TJDA 4BDBA 4RPVA 5HGIA 2VTNA 5CAPA 3HP2A 2VGOA 3FJQE 1GZ8A 4QPSA 4BDKA 5M53A 3PPKA 4AUAA 5DA3A 4UYNA 2Q0BA 1PMUA 1A9UA 1BI8A 3CY2A 2BRHA 4ZTHA 2PYWA 4U7ZA 3HECA 3R01A 4F7NA 2YWVA 5J7HA 3V6SA 3BU6A 4IVBA 4XX9A 4FTLA 1GIJA 2QQ7A 3EB0A 5CEIA 3TL8A 2WXVA 5HIBA 3RJCA 2VTLA 3ROYA 2QOKA 2UV2A 3LFFA 4UWYA 1WVYA 3QA0A 2WTCA 4I92A 4BTKA 2VWXA 2QKWB 3C13A 3DKGA 2ZVAA 4CFXA 3KN5A 4ERKA 4QMNA 1H00A 3KEXA 4H36A 4KRDA 2OBJA 4YP8A 2B9FA 4MXYA 3P1AA 5L3AA 4IFCA 4MF0A 4O6EA 5HTIA 4J1RA 4L44A 3VRYA 5A6NA 2BTSA 5TF9A 3HV7A 4D2SA 4WG3A 2IN6A 4DBNA 3QA8A 2V0DA 4DT8A 4KKEA 3R8ZA 4L45A 1ZMUA 2F9GA 4ASXA 2X1NA 4RRVA 5HU9A 5I5ZA 5CX9A 1KOBA 2XEZA 3BYSA 2XK7A 4TW9A 3GI3A 4IX4A 4X3FA 5AP6A 1J1CA 2YDKA 3BYVA 3HVCA 3IDPA 4XBUA 2HWPA 1V0OA 4CT2A 4EOJA 4QQCA 2YDIA 5L8JA 3EWHA 2ETKA 4M69B 3R1QA 3PVBA 1PKGA 4PV0A 4FSZA 4YLJA 4I6HA 5DWRA 2QKRA 3EQFA 5T6KA 2GS7A 3NAYA 3C1XA 3W2RA 4YBKA 5A4CA 4J98A 1K9AA 3VNTA 5AP7A 3R2YA 5ITAA 4X2KA 4KB8A 4PPCA 3E7OA 4Y5HA 3ZFXA 4EOLA 3R30A 3FKNA 4C4FA 4L01A 4NT4A 4EQMA 3RM6A 3P5KA 4BB4A 4C02A 1KE9A 3QYWA 5HHWA 4H05A 1FOTA 3EQDA 3BWFA 3ORTA 3VS1A 4FTUA 4PMMA 1Q8TA 4XS2A 2HOGA 4D2TA 3DBFA 1CKJA 2DYLA 1PF8A 1M7NA 3C51A 4FIJA 1G8AA 4I41A 3B8QA 5BX0A 3VS3A 2J7TA 4O0YA 4RIYB 4B0GA 5FRIA 5C01A 3QZFA 3LIJA 1Q3WA 3VF8A 4CEGA 1YXXA 2EXCX 2F4JA 2XJ0A 4FK3A 2X7OA 3D7ZA 3FZPA 3QTIA 4RVTA 3PDTA 1W0XC 5CAVA 3O23A 1Q8WA 3L8SA 1R1WA 3R8VA 2X6DA 2JLDA 2X4FA 4TYIA 5DI1A 1OIRA 4O96A 4C38A 4WRGA 1Z9XA 3HAVA 5J5TA 4IJPA 5C8KA 5DMZA 2XK4A 2GU8A 2YJSA 5K5NA 4LOQA 4RVKA 1I09A 1H25A 3KMWA 4L00A 5I3OA 3FC1X 2QG5A 1NY3A 5J9ZA 3GOPA 3TT0A 3OW4A 2EXMA 2PU8A 4IDTA 3EQRA 5L2QA 3RINA 4CMUA 2W96B 3OUNB 4RLKA 3UG1A 4QNAA 3GCQA 1TQIA 2UZLA 2F7EE 4EHZA 3UVQA 3E3BX 4XG9A 4IB5A 5DGZA 4C2WA 4JAIA 2YCRA 5KMJA 4DEHA 3BLQA 5AP5A 1KV1A 5JZJA 4NW5A 1OBDA 3L9LA 5JGAA 4BY9E 3BHYA 4G5PA 3LZBA 4U0IA 3KXHA 3D0EA 2ITQA 5A9UA 2ZV7A 3WF7A 5AX9A 2PMLX 1XQZA 2H8HA 5LCKA 3ZRMA 4ZSAA 3FDNA 3QRIA 2BUJA 4DGMA 5D12A 3I4BA 4GRBA 5AV3A 2W99B 2XNBA 4U44A 4Z9LA 1UA2A 2O3PA 3LFSA 5HQ0A 4E4XA 1YW2A 2JDRA 2ERKA 5D1JA 5BYZA 5JRSA 5CXZA 4AQCA 5FBNC 1ND4A 4CFVA 3F7ZA 1DM2A 2YWPA 4L68A 3IW4A 5L4QA 2OZAB 4BKYA 5E91A 3D5XA 3G33A 5BYYA 5ETAA 3BWJA 3RZFA 3L8PA 3MWUA 4NFNA 5E8XA 4BWPA 2BMCA 4DITA 4FSUA 3ORKA 4FSTA 3HMMA 4FTTA 2YZAA 3HV4A 4QTCA 4FTMA 5CSWA 3TTJA 5D41A 3KMMA 5EG3A 2O5KA 3TZ8A 3M42A 3LXPA 5BNJA 2NP8A 3BEAA 3CIKA 1FGKA 1OMWA 4U79A 4QOXA 4I6QA 4N57A 4RA4A 3ZUVA 5CSHA 2I1MA 3DFCB 3FY2A 4UMQA 4KA3A 3VQUA 2J50A 2XM9A 3FQSA 2GNIA 4D1SA 1CKIA 2ITNA 4P5QA 5C26A 1OL2A 4BDIA 4EK5A 2J6MA 4ONAA 4YPSA 5JFVA 3PA3A 5C8NA 3SD0A 3Q53A 3QQUA 3CPBA 4RIXA 5JGDA 4O2ZA 3BGQA 1S9JA 3UODA 4FKJA 2XH5A 2W4JA 2QO2A 2VTIA 4YZCA 4MXZA 2ZJWA 3UVRA 4DFXE 4FIIA 3LCOA 4JLCA 4HZRA 1DI9A 4MXOA 3GCVA 1QPEA 3PIYA 4GUBA 3S1HA 2RSVA 4L42A 1GZOA 2R3NA 3O71A 1NXKA 2WTWA 5GJDA 4HCTA 5T3QA 4OTPA 4UWBA 2R3MA 3RP9A 5HO6A 3PRIA 2VNYA 5LMAA 4RMZA 4RIYA 3SC1A 1B6CB 3FWQA 3PLAE 4D9TA 2VWVA 3R00A 3FL4A 2Y7JA 3KQ7A 4FNYA 3ETAA 4KIQA 2HY0A 3NUPA 1JSUA 3EN7A 3ZC5A 1PRYA 3EH9A 3MA6A 4HCVA 2YM3A 5B2LA 3UNJA 3QTSA 3A7JA 5IEXA 4FEUA 3G5DA 3Q4ZA 4O7LA 3EQPA 1R0PA 3PG1A 2JGZA 4HVIA 4BZOA 4ZOGA 2WIPA 3HUCA 2HXQA 2Z7RA 3FSFA 1YQJA 3KK9A 4V05A 5BPYA 2OXXA 3IECA 3QTZA 4ZMEA 3SVVA 3ENMA 3H4JA 3DTWA 5J8IA 4R8QA 3DCVA 4XJ0A 4O27B 3ROCA 3U6HA 3OZ6A 3W2OA 5FXQA 4GG7A 4OBOA 2C47A 4I5MA 4Q9SA 4UY9A 3KRJA 2EVAA 4D4RA 4YO4A 4JBPA 5KX8A 1JKLA 2C0IA 4YC3A 4XRLA 4CV8A 4O84A 4FL2A 1AD5A 3F9NA 3NIZA 3K5VA 4II5A 3EKNA 5AV2A 2JEDA 5LMKA 4JG7A 4FX3A 1OECA 3AT2A 1H26A 2Y6OA 4DH1A 2Y9QA 1PHKA 3OFMA 4LI5A 4DG2E 1JKTA 3D15A 3QUDA 4MCVA 3PJCA 3R6XA 5CU6A 4YSMA 3T3VA 3S0OA 5IQIA 3VO3A 2CCIA 1Y91A 2R3OA 4YHFA 4CMOA 3DZQA 3LVPA 3UC3A 4KNBA 3ULZA 5HICA 3EJ1A 4I6FA 3ORMA 4EQUA 5CF5A 3NNWA 4RQKA 4LV8A 4X2NA 1W7HA 4XG3A 2OZAA 4ZS0A 2ITWA 4TXCA 2WNTA 4ZZOA 5HIEA 2G15A 2XNMA 2JDSA 1MQ4A 4FSQA 3U6IA 3UQGA 2OJJA 2XRUA 1PXLA 4GH2A 3HEGA 3UVPA 2BFXA 4DC2A 3LJ1A 4NM3A 4EC9A 3TCPA 2IZSA 2JDOA 4BRXA 2HZ4A 4A9RA 3HA6A 2V7AA 3GC9A 3OCGA 5HLPA 5M09A 2UW3A 3T3UA 1XH9A 4BGGA 2BAJA 2CKEA 2XCHA 3EYGA 2FGIA 4WHZA 2W0JA 2J0KA 3R7YA 3L1SA 3O0GA 4FSNA 1SVGA 3RKBA 3KY2A 3I1AA 4Q5EA 3JY9A 4JG6A 4EWQA 2NNWB 3CQUA 5GNKA 4I5HA 4QMSA 4ACCA 4QQTA 3E92A 4AXAA 4GL9A 4GFMA 3ZCLA 3LMIA 1YKRA 4FIEA 4CZUA 4BCQA 3W2SA 1Q3DA 2C3LA 4GJ2A 5EOLA 3MH2A 5J1WA 5E90A 3VUIA 2HYYA 4KBCA 3R7UA 3NGAA 5FLFA 1J7IA 4RJ7A 4MF1A 4O7WA 2UW4A 5EM8A 1NA7A 3HV5A 3UYSA 4AZWA 1ZYSA 4BDJA 2OIBA 2OJFE 3ORLA 1XHAA 2BDWA 4QTAA 5H2UA 4FZDB 3ORPA 4FEXA 4DFLA 1RE8A 4EOOA 4WG4A 1XH7A 3GFWA 4AZFA 4O7VA 4FODA 2XNGA 3NLBA 2R0IA 2RFNA 1PXPA 2RKUA 3DOGA 3NYNA 4EOPA 2XK8A 3QF9A 3NVKI 3PXQA 3WI6A 3E93A 4FNXA 3RPVA 2YM5A 4TZRA 3W1FA 1IAJA 3LJ2A 3ZXZA 2OG8A 5HLWA 4CG9A 3V5TA 4ITHA 4DG0E 4LRMA 1W98A 4R3CA 5CEQA 4X2JA 2X2KA 4GU6A 2ONLA 4ZSJA 5FQDC 3F5PA 4AAAA 3UBDA 4W4VA 4ALWA 4NCTC 4RG0A 4CTBA 1ZMWA 1MP8A 3CQEA 5M4FA 5GIOE 4H3PA 2PVFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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