4DGGA

C-src kinase domain in complex with rm-1-176
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
278
structure length
261
Chain Sequence
AKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGEMGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKDPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Active site profiling reveals coupling between domains in SRC-family kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
total genus 82
structure length 261
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dggA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dggA01
1H01A 4DH1A 3Q5IA 3VS6A 4E4XA 1ZWSA 1P14A 4X2FA 1QPJA 2FB8A 2YM6A 4QPAA 4F6SA 4PUZA 2IPXA 2Y9QA 5DR6A 2YHVA 1IAHA 2RFDA 4OTRA 4JDIA 1KOBA 3A7HA 3CE3A 3FMNA 4O6EA 5L8JA 3TJDA 3TZ8A 5CI6A 3MFTA 2NP8A 1WVWA 5ANDA 2CNVA 3P79A 2CPKE 3F5PA 3CY3A 3QF9A 3T8OA 5FTGA 2VAGA 3ZZWA 4CZYB 3ENMA 3QUEA 3NUNA 3RKBA 5JFSA 1YDTE 1ZOEA 4MD8E 4V01A 2QCSA 3DDPA 3HA8A 3ATSA 3VUIA 3LHJA 3OD6X 1M52A 2B53A 2HK5A 4HGEA 4U45A 3EKNA 2OK1A 4Z9LA 3TV6A 4KUJA 3VUDA 4MD7E 3G15A 4XG2A 2WAJA 3BHYA 1LPUA 4EKLA 4F08A 5M57A 3SHEA 3PY1A 4PDYA 4ZSGA 5FEQA 5B2LA 3RAKA 5JGDA 4ZY4A 3R1YA 4IEBA 3VS4A 4IIRA 3FXWA 2C0TA 3PPKA 4EOOA 3FZRA 3QTQA 4KBKA 5BMSA 3AMAA 3ORPA 3UIMA 4F9YA 4U42A 4AGUA 4AGWA 4BBFA 2OIDA 5LXMA 2WIPA 5LMAA 2WEIA 3C4EA 5HQ0A 3VUTA 3GCPA 4FZ6A 3D83A 5HVKA 1IG1A 5FP6A 3HAMA 5M09A 1SVGA 2HXLA 3BWFA 2QLQA 4O81A 2ZJWA 3MY0A 4MKCA 1QPEA 5AR8A 3F61A 3W10A 4C4EA 3H9RA 3OEZA 4UMPA 3KRLA 4ASEA 3TNIA 5M55A 2WOTA 3OW4A 3OY3A 3V5WA 1EH4A 4EOLA 3PJ2A 4IE9A 2JC6A 4GEOA 4M8TA 3KKVA 4WNKA 4EK5A 2J51A 3OW3A 2OIQA 4UMTA 4YZNA 2QNJA 2BR1A 3P9JA 1OL1A 3LPBA 4BIEA 2HY0A 4JLCA 3R9DA 3W2CA 5T3QA 3W1FA 1GAGA 4PQNA 1CKPA 1BUHA 5EG3A 2O65A 4OTHA 4AA5A 4J97A 3OS3A 1Q41A 3EN7A 4WUAA 4GIHA 3IKAA 5H9BA 2CKPA 1KOAA 3E5AA 3ITZA 4RJ7A 5AIKA 4O7LA 1OI9A 3Q53A 2GQGA 4G3FA 4TWCA 1KUTA 2EXCX 5M4IA 3HX4A 1O6LA 2XIRA 3BQCA 3DBCA 3RAHA 2YABA 4BDDA 2RGPA 3CGOA 4PY1A 2YIQA 3EQBA 3QX2A 3TT0A 2HELA 4JIKA 2R9SA 3KA0A 5DRBA 5KCVA 1FVTA 2XP2A 4X3JA 3RMFA 5HKMA 2JDTA 3GFEA 3L9LA 3F3VA 5J7BA 4BBMA 2JKOA 3GFWA 5EM7A 4L8MA 2W5BA 1PYEA 3LQ5A 3QZGA 1PJKA 2ITTA 3C4FA 1SVHA 4UMUA 3IW7A 4MXYA 4G3DA 3W18A 2I1MA 4EWHA 3P7BA 4L44A 4BCPA 4DLJA 4GYGA 5ANIA 4HCUA 4G3GA 4EJ7A 5IQDA 2VTNA 5IQIA 2F7EE 2WPAA 3A7FA 4NZWB 5FBNC 5A4LA 1PXOA 2CMWA 1MRVA 2OJFE 4QTEA 3EZVA 4RIYB 3T9IA 2OJIA 3QXOA 4BDIA 4FMQA 5CF6A 4D0WA 1YXVA 3NNXA 5FBOA 3ELJA 5E8VA 2BDFA 5J95A 2OSCA 3ZZEA 1BI7A 4TYJA 3FMHA 4YZ9A 4O21A 5L4QA 2IZTA 3PXQA 2B9FA 2X9EA 3P86A 2WOUA 4YJUA 2C6IA 1YVJA 4DFZE 4ZOGA 3KRXA 2P33A 5HG9A 4X2JA 3VBVA 3FMEA 2F7XE 4FNXA 4M68A 2PULA 3FI8A 1VR2A 1XH8A 3P23A 2R3HA 3EQFA 2ETKA 5DFPA 4M69A 1PXNA 3GC9A 3AGMA 3BELA 2HWOA 1SM2A 3PG1A 2AUHA 3PJ3A 4ARKA 3VWAA 4ZEGA 4QP2A 5ETAA 5AAGA 5M4FA 4U80A 1MP8A 3EN6A 2BAKA 5DE2A 4WO5A 5AM7A 4I4EA 4BWKA 4U6RA 4V0GB 3AC5A 4FV1A 4CMUA 4EQUA 2PY3A 4IAYA 4FV7A 5IQHA 4OTFA 3F69A 2W06A 3BLQA 4BDKA 2VX1A 3GXLA 3LXKA 4S2ZA 4RT7A 5J5TA 3FL5A 4OTPA 4MXAA 3A7JA 2XBAA 3A99A 4EH8A 3DAJA 5FXQA 3GU5A 5JK3A 1JKKA 4D9UA 2QOIA 4XV2A 1WFCA 4EOJA 2ZVAA 3Q4UA 4NFMA 5EH0A 4QMWA 4U41A 4BCKA 5I3RA 2W4KA 2CKQA 3SKCA 1M17A 3F88A 4O82A 4P2KA 1MQBA 2ESMA 4AUAA 4HZRA 4GMYA 2O64A 3QKKA 5DI1A 3DTCA 3PA5A 3GC7A 5JFVA 3U9NA 3KXZA 4P4CA 2XKCA 5JMSA 3D5WA 1Z9XA 5EI8A 4CSVA 4FVRA 4FK6A 3U54A 3VS3A 3RALA 3DBEA 4NSTA 4U43A 3UZRA 1SZMA 2XNOA 5KMLA 1QPCA 4G6NA 4QMYA 4BC6A 4HPTE 3LZBA 2PUUA 4GVJA 4DGNA 1TVOA 4EH2A 3PIXA 3EN5A 3GCQA 4FYNA 5CX9A 3R8MA 5HTCA 3OC1A 2I40A 1J7LA 5M51A 5CQWA 1ND4A 2Q83A 2VTSA 3RVGA 5JQ5A 3FLWA 4I5CA 4I1ZA 3QFVA 4HVHA 3PZHA 4FEUA 4K1BA 2PWLA 4C34A 2OGVA 3AT4A 4QQCA 3UIXA 4RVMA 2BALA 4I6QA 3D94A 1NY3A 3DQWA 3D7TB 2GHLA 4CQGA 4IBMA 3IO7A 4OT5A 4XEYA 4CKJA 3NYOA 3Q9WA 1YHVA 4A9SA 4BZDA 1H00A 4C36A 3HNGA 1G5SA 4XG3A 3SOAA 5DHJA 2ITOA 3MVLA 4FG7A 5IA1A 3H0ZA 2BIKB 4RVKA 2C47A 4G9RA 3ETAA 4FZAB 4NCTA 4FL2A 2RKUA 4RPVA 4Z7GA 1CSNA 2ONLA 1OBGA 1OB3A 5E8YA 2H96A 3VAPA 3S4QA 4GH2A 4XBRA 3DCVA 4CFUA 3DJ5A 4O7SA 2QR7A 3HZTA 1XHAA 2ZDTA 4O22A 3UIUA 3F3WA 3S1HA 2UW9A 1PXJA 1Y6AA 4BTFA 4D4YA 5AP6A 2XCKA 3HV6A 4BDAA 1OGUA 3MH3A 3OCBA 4TKSA 2B0QA 4EYMA 4IM2A 3QTRA 4QT1A 2XK4A 3NNUA 5TF9A 3CC6A 4X0MA 3Q3BA 4ONAA 4I93A 2W96B 4QMOA 3K54A 5D9HA 5AX9A 4EONA 3KXGA 2OH0E 4HZSA 4XBUA 3M2WA 4KWPA 3OXTA 4MD9E 3SAYA 5ETFA 4JBOA 1JKTA 4RWKA 3CY2A 5LWMA 5AJQA 4EK4A 1PXIA 5HVJA 4I6BA 4MH7A 5CSWA 5CQUA 4YZBA 5IQAA 3DGKA 3BX5A 3QRTA 4JX7A 3ALOA 3OBJA 3ZUVA 4UZHA 1UWHA 2J0LA 4HOKA 1UNHA 4RA4A 3MBLA 2KULA 3BU6A 3R6XA 1FVRA 2OO8X 4EOKA 2OZOA 4IWQA 2WTCA 4YUQA 4H58A 5EHOA 3R7EA 3ZSIA 5IUGA 1GNGA 5A54A 4P90A 3UG1A 3LFBA 3NCZA 3VVHA 5CI7A 3A61A 4O0YA 5KKRC 2AC5A 3BPRA 2W1DA 5HG8A 1HCKA 4BCIA 4A4LA 3EQRA 3QALE 4KB8A 4IHPA 4DEAA 4I3ZA 1GZ8A 4WHZA 4IVDA 5IEYA 5L6OA 3DK3A 3CIKA 3K5VA 5H2UA 4EBVA 4D1ZA 4PTEA 3M11A 5ACKA 3EYGA 4IB3A 4KA3A 4YZDA 3R8VA 3V8SA 4GJ2A 4QMNA 4ASZA 5DT4A 2WMVA 3SVVA 1CM8A 5I9UA 1ZYLA 3DV3A 4WG5A 5JZNA 4CTBA 4S34A 2PZ5A 3CKWA 3Q4ZA 2VWVA 5HZNA 2QOBA 4IAZA 2W4JA 2Y7JA 2DWBA 5FM2A 1WZYA 2YZAA 4FZ7A 3F3UA 4PWNA 3QZFA 4IB1A 2BHHA 2VWZA 4M13A 4FEWA 3QQUA 1A06A 5JQ8A 4YU2A 1OKVA 4U40A 4Z55A 5E8WA 2JDOA 4R1YA 5CF8A 3V3VA 4IZAA 3SLSA 3F7WA 2VRXA 4EJNA 2YWVA 3LQ8A 2R3IA 3NX8A 3S00A 4DTBA 4FSMA 4FOBA 3TV4A 4IQ6A 4WRSA 4F09A 2V22A 3ORTA 1IRKA 2V55A 2CGWA 3VBWA 2XIYA 2OXYA 4BCGA 3N4TA 5I3OA 4K18A 4LRJA 4I41A 3NSZA 4RVLA 2IO6A 3C13A 4UWYA 3G0EA 4GK3A 4IDTA 5E8UA 4JDJA 1REKA 2Y4IC 4Z7HA 3AD6A 2B9JA 3IONA 3NIEA 4FTJA 2XEYA 4S30A 2JITA 4ZSJA 4RC4A 3VUGA 5JZJA 4ZTRA 1BL6A 3LFNA 3ZHPC 2C0OA 2GNJA 4MVFA 1SVEA 5C03A 3Q2JA 3PPZA 1SNUA 4DC2A 2BRHA 4BYJA 3KU2A 3KFAA 4JT3A 4LFIA 3BYMA 3VBQA 4UB7A 3R01A 3EYHA 4AZTA 1IAJA 2BUJA 4ZK5A 2X8DA 2AYPA 3R9NA 3A62A 4XOZA 5K4JA 1AQ1A 2FH9A 1XWSA 2C0IA 2R0IA 2YCRA 2YJRA 4IJPA 5F95A 4BF2A 5JKGA 4HVGA 5HIDA 4O86A 3F6XA 3ZRMA 1L3RE 3LQ3A 3FLZA 3FPQA 5HIBA 3CQWA 3UPZA 5K5XA 3FLSA 1OUYA 1JPAA 2OFUA 4OTQA 2XIKA 5ACBC 5KMJA 4MTAA 2VWUA 4QMUA 4YLKA 3FBVA 5DNRA 5JN2A 4QP9A 4R8QA 3V51A 2J5EA 3RCDA 3D15A 5ANKA 3WF9A 3LVPA 4AWIA 4KINA 3CPCA 2WMBA 4DFUA 3UO5A 1PF8A 5E1EA 2B9IA 1Q8UA 3DFCB 4JRNA 4MNEA 3NS9A 3MDYA 5JRSA 2XRWA 3ET7A 3KCKA 2A2AA 2WMTA 3AD4A 3V04A 4L67A 3H10A 3ZO3A 2YDKA 3IGGA 3ROCA 5LWNA 2B9HA 3RPSA 1NA7A 3QWJA 4CRLA 2WMQA 3R1SA 4LV5A 5DG5A 4AT3A 2Z7QA 4YJQA 4ZTQA 1PY5A 3ORXA 4Q5HA 1X8BA 4QYFA 3QQHA 2YISA 4YZCA 4ANBA 2CLXA 3Q04A 4L7FA 1YQJA 2JBOA 4OBOA 5DR9A 5DRDA 2WTVA 5ETCA 5IEXA 4EK8A 4F7NA 4O83A 4EORA 2C3KA 2C5NA 2WQMA 3E8CA 4E5AX 1UU7A 5A6NA 1YRPA 2JGZA 1DM2A 2OF4A 3HYHA 5L2TA 5EDRA 1UA2A 5L8LA 4YR8A 4I0RA 3GI3A 4RLKA 1VYWA 4ZJVA 2X6EA 4IX6A 3MFSA 3UQCA 2P55A 3ZTXA 4UMRA 5B2MA 5L3AA 2BMCA 1UV5A 3PLSA 4EQMA 3BBTB 3JY0A 3O7LB 4EK3A 4ANOA 1Q61A 5GIOE 2YM3A 3S0OA 4PL5A 2FO0A 4JR7A 3V5JA 2W1FA 1FMOE 3BGPA 3C4CA 5EYKA 1H08A 4DAWA 3WF8A 4PPAA 4ACDA 5A4TA 4DF3A 3MVHA 4Y95A 4G6LA 4USDA 3NVKI 2R3MA 3ZU7A 4TT7A 5LVPA 2NRUA 4FKLA 4Q9SA 3PXYA 5L6WL 4FVQA 3WE8A 4J8MA 3LMHA 4ORKA 3QC9A 4O7ZA 4JS8A 4M12A 4EH9A 3DZOA 4FV2A 4EZ5A 1J1CA 2IW9A 1UNGA 3II5A 4L00A 4CMTA 5L2IA 4C4FA 2VTTA 4RA5A 4TXCA 3IPHA 3PWDA 1ZZ2A 3FYJX 2J6MA 1H4LA 4BDCA 1OKZA 2PE1A 3PP1A 5E90A 3DB8A 4GRBA 4TN6A 2PSQA 4RZVA 4ANNA 4KIKB 4QO9A 1PYXA 4XNEA 4JQ7A 4ASXA 2XJ2A 3FZTA 4RJ3A 4F64A 1PRYA 4KABA 4TYHB 3SRVB 3Q2MA 4O0SA 4QQTA 4L46A 3IQ7A 2XK6A 3NVMB 5E92A 4IVBA 1FPUA 1FINA 2XEZA 3D2IA 5DYJA 3RK5A 1TQIA 3R22A 1XJDA 4Y5HA 2VNYA 1LR4A 1H07A 2I6LA 2PVLA 4NTSA 2Y6MA 1YXUA 4EUUA 4GW8A 3MGYA 4P7EA 2X2KA 4V04A 3RNIA 5GZAA 3GUBA 3PJ8A 4DT8A 3BBWA 3CCNA 4JG8A 2A0CX 5C27A 4EYJA 1QCFA 4FV5A 1IR3A 3VRYA 1ZMVA 2ZV9A 2C30A 3ZFMA 5HO8A 3RHKA 3RK9A 4RX5A 5IU2A 2QURA 4JAIA 4G34A 4KKGA 2V0DA 2ETMA 2WB8A 4R6VA 4GT5A 2RFSA 3UC3A 2EWAA 4QP7A 4BDEA 2R3LA 4YTIA 2J0IA 2QVSE 2UZTA 3QA0A 3VW8A 3D5VA 4D2PA 4CNHA 4O7YA 2F57A 2XNPA 4H1MA 1JSUA 4XG4A 1BKXA 5EDQA 4DG0E 5AAFA 3QA8A 3PP0A 3VS1A 4RJ8A 5FUTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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