4DGGA

C-src kinase domain in complex with rm-1-176
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
278
structure length
261
Chain Sequence
AKDAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTRVAIKTLKPGTMSPEAFLQEAQVMKKLRHEKLVQLYAVVSEEPIYIVTEYMSKGSLLDFLKGEMGKYLRLPQLVDMAAQIASGMAYVERMNYVHRDLRAANILVGENLVCKVADFGFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELTTKGRVPYPGMVNREVLDQVERGYRMPCPPECPESLHDLMCQCWRKDPEERPTFEYLQAFLEDYFTSTEPQYQPGENL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Gallus gallus
publication title Active site profiling reveals coupling between domains in SRC-family kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src
total genus 82
structure length 261
sequence length 278
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dggA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dggA01
3LKMA 4CYIA 2E9PA 4RWKA 4NUSA 2C4GA 3LPBA 1U59A 3PJCA 5DRBA 3C7QA 4GUBA 4JJRA 2PU8A 4CT2A 3HECA 4FODA 3ZZEA 2VO6A 3GEQA 3KULB 4ZTQA 1W7HA 5IA0A 1J91A 1KE7A 3DJ7A 4MWHA 5HG9A 5GJGA 4X7QA 3GCVA 3HV4A 3TKUA 5C8KA 5IA1A 5K4IA 4EH2A 3OY1A 4LGHA 2R2PA 2PZPA 3NCZA 4A9SA 4IAZA 3JY9A 3SD0A 2VTRA 4D5HA 5LVMA 2A27A 4BC6A 3OEZA 2W4KA 3SXFA 3ZDIA 3ET7A 4FTIA 5L4QA 5C01A 4PNKA 2GU8A 3NPCA 2RFDA 3HRBA 5CZIA 4UYNA 5T6KA 4EZ3A 4FKUA 5L2QA 5L2SA 2WTVA 3QCYA 4RG0A 1M2PA 3KFAA 3Q6UA 5EW9A 1MQBA 5FTOA 2OH0E 3R9OA 3VS7A 4I0TA 3PLSA 4OUCA 2ITPA 3RAWA 4K8AA 2DWBA 3DBEA 3CGFA 3L8PA 3TN8A 3ZSHA 4EBVA 5KBRA 1YI6A 3TDVA 4ZS4A 5CEOA 3KN6A 5M44A 3ELJA 2J0IA 3HRFA 4R5YA 5J79A 3QLFA 3AMAA 2J4ZA 5AP0A 3FLWA 5DR2A 4C35A 1SVGA 3Q9XA 3R7IA 4TXCA 1XH7A 1E9HA 4NJ3A 3NMUF 3A2CA 4BIEA 2G9XA 3D2IA 4TN6A 3S2PA 3RPVA 2A1AB 5FDXA 2RL5A 2CPKE 4MYGA 2UW3A 1SYKA 5EDPA 1R1WA 4FNXA 5HX8A 2CGWA 2X7GA 3DZOA 2ZM1A 3TWJA 4O1OA 1FQ1B 2XIXA 3LW0A 5C03A 3ENHA 2ZB0A 3QD4A 3RNYA 3CP9A 4FSYA 1AQ1A 2ZV8A 3IGOA 4FVRA 3VNTA 4DITA 5DOSA 4TT7A 3UNKA 5I0BA 2JDVA 2XNPA 3LFBA 3ZUVA 4MX9A 3UG2A 4CTCA 5M51A 1PXIA 3A4OX 4G2FA 4XUFA 3UODA 4D55A 4W4YA 5K5NA 3VRZA 3FL5A 5AAEA 4Z9LA 4GH2A 3MW1A 3HUCA 3A62A 3OXTA 4U44A 2BPMA 5LMAA 3ODYX 2CDZA 2HZ4A 2JD5A 4H58A 4FTRA 4H39A 5D1JA 4FSUA 4B8LA 1IRKA 4IWPA 4ZJJA 4DH3A 4MXCA 4E1ZA 4E8AA 3PPJA 3KXZA 4OR5A 4E5WA 4O83A 2BILB 3RJCA 4FEVA 4DAWA 4EK3A 4GW8A 3BLHA 3BGQA 3HA8A 4IZ5A 4N0SA 4OBOA 3RNIA 4RPVA 3UGCA 4FC0A 4AZEA 3R9NA 2GNLA 3I60A 4XRJA 4EH8A 3HV3A 4I4EA 2PSQA 5DMZA 3MVMA 2VAGA 2IN6A 5AX3A 4FSTA 2JBPA 2R3RA 4NK9A 3WI6A 3OTUA 1OM1A 1ZOGA 4P5QA 1SVHA 2YIXA 4L01A 3EMGA 4FZFB 3BCEA 2VTPA 3OWJA 3D7TA 4MWIA 3VO3A 3GU7A 3ZRMA 1L3RE 4EKKA 4QMUA 4FTCA 4WBBB 5FG8A 1EH4A 4Y5HA 1IEPA 2DQ7X 1UU9A 4AT3A 4D4VA 4HYIA 2I0VA 5BVWA 4B0GA 5IH4A 3ZRLA 4ERWA 5EK7A 4C8BA 2HWPA 2GQRA 4YSMA 3W32A 4RJ7A 4FKTA 1KE8A 2I40A 3LIJA 4QMSA 3DTCA 5DGZA 2YAKA 2HYYA 1CM8A 3LJ2A 3QZGA 4HCVA 3P7BA 4FT3A 4CFNA 1OL1A 4YC3A 4TKSA 2QHNA 2OF2A 4QTAA 3OWLA 4XYFA 5JZNA 1J7LA 3R8VA 2JDOA 4BY9E 4S2ZA 3ZSIA 4GG7A 2YDJA 5DT4A 5EQEA 2PUNA 1WBOA 4U41A 4X2FA 4FBXA 4CFVA 3UZRA 4IFCA 3AD5A 3DTWA 1KUTA 1WFCA 1YKRA 4DCEA 4ZZNA 2BVAA 1G5SA 2C68A 3PY3A 1TVOA 1SZMA 4QMYA 1KWPA 5E8WA 2GNHA 5EM7A 1KV2A 2WMXA 1QPEA 2XK4A 4JRNA 5C1QB 4QYHA 3QCXA 4JIAA 5I5ZA 1QMZA 4L00A 1K2PA 2GCDA 3FLZA 3FZOA 4OBPA 3I7CA 3PVWA 4F6WA 1GIIA 3DBCA 1OPKA 1I09A 3OZ6A 1H27A 3VHEA 3C0HA 5DWRA 3DBQA 3ZUTA 3MS9A 5EFQA 2PWLA 3DY7A 3VJNA 5E8SA 1O6KA 1RQQA 1R78A 5DBXA 4Q9ZA 4X2NA 3FI3A 3QZFA 5FRIA 2WELA 4I94A 4CXAA 3NUPA 3RGFA 4BDJA 4QO9A 5AX9A 3BELA 3E64A 3PWDA 4MQ1A 5F1ZA 3GB2A 4LFIA 1FBNA 4DBXA 2JDRA 3UC3A 4YJPA 1VJYA 4D9UA 4PMSA 3EN5A 4UMPA 3MPMA 3U4WA 4I5PA 3D15A 3TJDA 2OIBA 3DPKA 4C38A 2GHLA 2YM7A 2WMSA 2QKWB 4DFXE 2KULA 4QP9A 3NDMA 3QZHA 2W4JA 2W99B 2GS7A 2OJGA 4BZNA 4PP7A 2YJSA 3ORIA 5M08A 4IM3A 4L9IA 4IAAA 3P9JA 1SVEA 2W5HA 3R7EA 2WMBA 2A2AA 4RC3A 4RC4A 4XJ0A 1O6YA 3CQWA 4JQ8A 4GV1A 2JITA 4G9RA 3E3PA 5HE0A 2V7OA 2ERKA 3DBFA 3PSBA 2HOGA 4EI4A 4FGRA 1FMKA 2PE2A 3CQEA 2JIIA 4G5JA 4HPTE 2X4FA 4CRLA 3KULA 4H1MA 2FYSA 2YN8A 3O8PA 3FL4A 1O9UA 2Y6OA 2WPAA 3COHA 2EXMA 4YPSA 5AM7A 1H1QA 2R3NA 4K33A 2IW8A 1XH6A 3ZLSA 4MXYA 3PXFA 3S4QA 4Y73A 4FV3A 1KOBA 4AX8A 4JX3A 4OAUC 3VQHA 3P08A 1JQHA 3TTIA 3TZMA 2CGUA 3POZA 4QQTA 4FOBA 4G3EA 1W8CA 3MIYA 4E6DA 3VW6A 4OTWA 1B6CB 4MCVA 2WEIA 2LAVA 4YZBA 2PVHA 5JEBA 4C37A 4FIGA 1OKVA 1CTPE 5LVLA 4AU8A 3MIAA 1Q99A 3FHIA 4WSQA 2PVYA 5DG5A 1WAKA 2CLQA 4MBJA 5CYIA 3MJ1A 4A4XA 5G6VA 4DT8A 3UVRA 3UPZA 2X4ZA 3NRMA 4JR3A 4L53A 4E6QA 3MVJA 4QQ5A 5L3AA 2FB8A 3EZVA 2I6LA 5EHYA 4AW0A 3Q32A 3F69A 4B9DA 4ZP5A 3DV3A 2EXEA 5E90A 5EI6A 1JKSA 4I21A 3QWJA 4IB3A 2WTKC 1LEZA 4K0YA 4EORA 1GOLA 3P7AA 4EH9A 4ACGA 1O6LA 5BX0A 5F20A 2XF0A 4ANMA 4BDBA 4XV9A 3CPCA 3UC4A 4FV0A 4GYIA 2B54A 3LFCA 4GIIA 5ANOA 3REPA 4OTFA 4ACDA 3CGOA 3KMWA 3F88A 5GZAA 3R1SA 4WA9A 1S9JA 3BYVA 5E1SA 5J87A 2AYPA 3ZCLA 4ZTMA 5IQBA 4ZSEA 5IDNA 5L2WA 4NSTA 1CMKE 1PXJA 4HZSA 4ONAA 5FBNC 3DXPA 1OKWA 3QCSA 4IVBA 5ETIA 4FV2A 3ZLXA 2CKPA 2C3LA 2V55A 1UKHA 5CEKA 2XYNA 1ZMWA 4M15A 4ZTRA 3KEXA 5CQUA 4ARKA 5TT7A 3N4VA 3W2PA 5C4KA 5FTQA 4XG7A 4YO4A 3HZTA 4PWNA 2UZBA 4F9WA 2GQSA 4CCUA 4YJSA 5J7BA 4WD5A 4U80A 4F08A 2VTHA 4IAKA 4B7TA 1OL2A 3BHYA 2IVVA 5JRSA 5AMNA 2EB3A 3GFWA 3VRYA 4ZY4A 3G15A 3LHJA 3R02A 2RIOA 4OTQA 2EWAA 5CVFA 4OGRA 3RPRA 3R0TA 2UW7A 1V0OA 4EYJA 4L46A 4FEUA 5E8VA 4YJNA 1H1RA 5L8JA 4JBQA 5C27A 2ZB1A 3S3IA 3RCDA 2YHVA 2XBAA 2UVYA 4FT5A 4I6HA 4BWXA 3QD0A 2HXLA 4FKIA 3WYYA 2W9FB 2RG5A 3IK3A 2C3KA 1VYZA 1Y8GA 5IUHA 1S9IA 2EB2A 4IB1A 1A9UA 5TE0A 2IVUA 3NYVA 4QP6A 1QCFA 3OT3A 4AE9A 4CKJA 4FNZA 3RTPA 1MUOA 4IZAA 4J7BA 2VO0A 4GIHA 4GU6A 4USDA 3QHRA 1H0WA 5K0KA 3E92A 4MD8E 4RLLA 3TV6A 3CJGA 5CI7A 2PVKA 3ZEWA 4AE6A 1FMOE 3VS5A 2G2HA 4PV0A 5CSXA 4QMVA 3G51A 1ZRZA 3LXNA 4FKLA 3LCSA 2PULA 2W17A 5BUEA 4U0IA 4M68A 4QYEA 4M3QA 5BUJA 1UU8A 3QTZA 4DTBA 3LXKA 4YJTA 2QG7A 3IGGA 5CENA 4BBFA 4BDKA 3EQRA 2UW9A 1P4OA 4RT7A 5GIOE 3A7HA 3I81A 2BALA 3TT0A 3UVQA 5T68A 3Q5IA 4I5CA 4KS7A 4Y8DA 2YITA 3F3UA 5IU2A 4DF3A 4OTPA 3VW8A 3F5XA 3QQHA 3UQFA 3L9LA 3PYYA 4QD6A 4YC6A 3CD3A 3OOMA 4QMZA 4QP7A 3LQ5A 3ZC5A 4E93A 5KMIA 1JSUA 3QC4A 5DLSA 3FXXA 4FZ6A 3ZMMA 2BRNA 4ORKA 1KSWA 2CHLA 2OFUA 3GT8A 2GFSA 4J53A 4K6ZA 3VS4A 4A9TA 2G2IA 3MWUA 2BRHA 4KB8A 2Z7QA 4M84A 3RKBA 4LUDA 2O63A 2BKZA 2DUVA 2R3JA 3ORNA 2I0YA 3EJ1A 4AOIA 4BBMA 2WMTA 3IW8A 3LAUA 2OO8X 4JG6A 3D83A 5HE1A 4EWQA 2P0CA 3DA6A 3P86A 3RMFA 2HY81 3SGCA 4CSVA 2ITUA 1YWNA 2C5VA 2R3MA 3B2WA 3MB6A 2W4OA 4GFGA 2FSOX 4RIXB 3U9CA 4F7SA 5HZNA 2X6DA 4JDKA 2XCKA 4O0WA 1SNXA 4B6LA 3V6RA 5DT0A 4ZZMA 5D7VA 3VBXA 2ZV9A 4I41A 2YWVA 5HVYA 1PKDA 3F3ZA 3HA6A 5HD7A 4IAFA 5TOZA 5A4EA 5CSPA 3QTSA 1Q8YA 4R3CA 3H9OA 4V01A 1VYWA 4DFYA 2YDKA 2C3IB 2IO6A 5DYJA 1PYEA 1PKGA 4CZYB 1PY5A 1WBWA 5DA3A 2R3QA 4X6QC 5AUXA 3R7VA 4BCFA 2IZSA 4I6FA 3RWPA 5LARA 3EQGA 3U87A 3FLSA 5F4NA 4EHEA 4FTTA 3FMLA 2Z2WA 2HXQA 3CPBA 4R1VA 3H3CA 2QURA 3H0ZA 1TQIA 4O0YA 2J90A 4RJ5A 3V5QA 2J50A 2ZV2A 2WNTA 3RHXA 3U51A 3WF6A 3TUDA 2ZVAA 4L3JA 3NIZA 4TWPA 3KVWA 2H6DA 4ZLOA 2XCHA 3C4CA 3ERKA 5I9UA 4YJRA 1F3MC 2C5OA 5A54A 2O64A 4EOJA 4TRLA 4L42A 4E5AX 5DHJA 1W98A 2OZOA 4IDVA 2ETRA 2YIYA 1W84A 3POOA 5BVOA 4NFNA 2W1CA 1V0PA 4ANNA 3NNWA 4B4LA 3N4UA 3MPAA 4FKQA 3TIYA 3RBWA 5AEPA 4FZDB 4IX5A 5H3QA 2W05A 4Q5EA 4HPUE 2VRXA 4IMYA 5A46A 5GZ8A 4MQ2A 2E2BA 2UW0A 4DEIA 2XK9A 2I7QA 5IA5A 5JT2A 3LM0A 4KWPA 4DH7A 4J8MA 3BU6A 3L8VA 4PNIA 4RSSA 5I9ZA 4Q9SA 2PZ5A 2J9MA 5H8BA 3MH0A 4EC9A 3OXZA 4C58A 1OBDA 3R21A 3GC0A 2PVRA 4KAOA 1PXKA 2P33A 3R01A 3G6GA 5HCYA 3TTJA 2VTOA 1BYGA 2WTWA 3HMMA 2OI4X 3DJ5A 4D2RA 3DZQA 2Y8OA 1ZYDA 4QMTA 5AAFA 1F0QA 4QMMA 4XV2A 3RPOA 3C51A 4KUJA 4RX8A 2GNFA 3WF9A 3DDQA 4ERKA 4USEA 4I6QA 1WBPA 2ZM4A 3RAKA 4MVFA 4ANBA 3AGLA 3P7CA 3LOKA 1YXVA 2W1EA 5FXRA 5EHLA 4YO6A 1PMNA 3VF9A 4E26A 4LL5A 4Z16A 5D10A 4TNDA 3NUXA 3MA6A 4KIPA 5TO8A 4J96A 5TF9A 1M7QA 2BUJA 5CALA 4P4CA 2RFEA 3VF8A 4MK0A 2PTKA 4O6EA 4XNEA 4BB4A 4O27B 1MRVA 3LCTA 4QPMA 4H3BA 3V04A 4PMMA 4BCGA 1YI4A 1XO2B 3RWQA 5DEYA 5IA2A 3R7UA 2GQGA 1Q5KA 2YM6A 3VN9A 4DG2E 2ONLA 5I4NA 2QNJA 4JAIA 4DFZE 4W4XA 5FP5A 4OT5A 1OECA 4LGDA 3CJFA 2O3PA 2R3IA 1URCA 2R7IA 4Q5HA 4YNOA 4HVHA 4QP2A 3ZRKA 3UOHA 5EM5A 4PP9A 4FL1A 4XG3A 1UNLA 4RJ6A 2QOCA 3ZTXA 4BHNA 2B52A 4C62A 4MXOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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