4DGOA

Crystal structure of maize ck2 in complex with tyrphostin ag99
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLCGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inhibition of protein kinase CK2 by flavonoids and tyrphostins. A structural insight.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Zea mays
total genus 110
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dgoA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dgoA02
4M0YA 5BUIA 4H3QA 4J96A 4DGNA 3IGGA 4NW6A 4U81A 5DGZA 4IX5A 4HGTA 2VX0A 4MAOA 1YRPA 2ZDUA 3A61A 1YOJA 5CI6A 3PVWA 4E73A 5AP3A 3DB8A 5D9HA 3NX8A 4K1BA 1VYZA 4B8LA 5D7VA 5DR2A 4L45A 2C3IB 5DRDA 4IQ6A 3RJCA 4YZ9A 4QMUA 3RK5A 3CJFA 4PP7A 4EONA 3E8NA 3IW6A 3PA4A 5EKOA 3MPTA 5BNJA 3RWQA 4CXAA 4YC8A 4B0GA 4S2ZA 5LMBA 4RJ5A 4QTBA 4ARKA 3ET7A 2YABA 2IVVA 1VR2A 3GOPA 1NA7A 2GNJA 3KN6A 3MN3A 3PP0A 4B7TA 4HYUA 5JZJA 5LVOA 3LCDA 3FPMA 1YDTE 2Y4PA 2EXEA 2BUJA 4CQGA 5HBHA 3L8XA 4V04A 1UNHA 3PRIA 2DWBA 1RQQA 5KKRC 3EMGA 4L3JA 4OTPA 3KXXA 4R3CA 2E9OA 4QMMA 3JVRA 4B6LA 2BKZA 1UU3A 3IW5A 3THBA 5GZ8A 3QGWA 4FTLA 2R3GA 2B9FA 3KB7A 3UNKA 3BHHA 4DT9A 4F70A 4RFYA 2XJ1A 3I1AA 5FEEA 5K0KA 4BWXA 3CTHA 3PIXA 4FGBA 4M69A 3E7OA 2GNHA 4XCUA 4AOIA 4CFXA 5KMNA 5IEXA 3O50A 3FEGA 3CPBA 2XK7A 5HIEA 3SXRA 2PZ5A 3HA6A 2E9PA 2ERKA 4K33A 5EYKA 1LR4A 3R7OA 5JRSA 2X7GA 4CLIA 4G2FA 3QRJA 4AWIA 3CBLA 4M69B 3WF5A 4NM3A 5JFXA 5L8KA 4F0IA 2Z8CA 3TIZA 4WSYA 3RPVA 2VGPA 4FL3A 2PVNA 5DLSA 3K3IA 4TYIA 4ZAUA 3C4WA 2QR8A 4MD8E 4CZTA 1TQPA 1ZLTA 3F5PA 5AUZA 5G1XA 3ZONA 4EBWA 2W9FB 4GK3A 5IU2A 1GIIA 3QQFA 2O63A 4I0RA 4YLLA 2CNUA 4FT9A 4MXXA 4RWKA 2XUUA 4S33A 2XVDA 4PL4A 2FA2A 3EN4A 3ZBXA 4FTCA 4C4FA 3LM5A 4O84A 4I0TA 1S9IA 2ZM1A 4F1TA 2GPHA 1E9HA 3W2CA 5CX9A 4GH2A 5J9ZA 2ITVA 3HMOA 5TR6A 4OR5A 5J1VA 1CKJA 4J99A 2YZLA 3KXHA 1M14A 3VQUA 4CMUA 5EKNA 4FT5A 3QD4A 3BELA 3LCOA 4JBPA 5ANIA 2VTIA 3RK7A 3UIBA 3GB2A 4BTKA 2VU3A 4XYFA 3QC4A 4Z16A 2JIIA 4RX7A 5CU6A 3FQSA 4EK5A 3DZOA 3UE4A 3ZZEA 1Y6AA 3EHAA 3HAVA 4CYIA 4U5JA 4NIFB 4W8DA 5CU2A 3VUMA 1WBVA 5EQEA 4HGSA 4ZTRA 5FQDC 3R71A 5IUIA 4HYHA 2ETKA 3ZSHA 4AZEA 3O7LB 3JUHA 1XJDA 3RTPA 4QP9A 2W4KA 3O8UA 3PXRA 4ZIMA 3DBQA 3H10A 4EC8A 2FSTX 3Q9WA 3OCTA 3LXNA 3S2PA 3PG3A 3P08A 3QTUA 3D4QA 5EQYA 1UVRA 4L6QA 5H9BA 3HP2A 3QCXA 3IG7A 2C1BA 4FODA 4AZWA 4IM3A 2VWIA 3FWQA 4XLIA 4CNHA 1MUOA 1F5QA 4FKPA 3ZXTA 5CAUA 2JKQA 3NYOA 4DN5A 3W18A 3KXGA 3F2NA 3BHTA 2VX3A 3TV6A 2P0CA 4TYHA 3FL4A 3FY0A 4G3GA 4JR3A 4OTIA 3WF8A 3HEGA 4QP7A 4R5YA 3TNIA 2XIZA 3FMJA 4LRKA 4EHZA 3IOKA 4ZJVA 4QP6A 2IN6A 2OZOA 1UU9A 3IQ7A 4YP8A 1SMHA 3FKNA 4Z55A 2OI4X 4DEBA 3IO7A 2HWPA 4HCVA 2B1PA 1H07A 3QFVA 4X0MA 2OG8A 3Q4CA 2FYSA 4PWNA 4OTRA 3C0IA 4IB3A 4CFFA 5C4KA 3G51A 4FNWA 5IQHA 3W8QA 4FV1A 3WZEA 3NDMA 3U51A 3KMMA 4U40A 2RFNA 3BHUA 4FT0A 3ULIA 3LE6A 5J87A 3FV8A 2F7ZE 3OFMA 4QPAA 3TG1A 2BIKB 4L01A 4FV3A 4UXLA 3R7EA 1W83A 2PUUA 2EWAA 4NH1A 2YM6A 3CQWA 2V62A 1P14A 1ZZLA 3M1SA 4ZS0A 4BDAA 4DE4A 3BGPA 4JQ8A 4FKTA 1P4FA 2H9VA 2OW3A 3HDMA 3POZA 5CQUA 4NWMA 5TOZA 5EW8A 1IASA 2XF0A 3QX4A 2WOTA 4IAYA 4Y95A 4U9AA 3PXFA 3R7IA 4I23A 2YIRA 5DEYA 4NTSA 4PUZA 2P2IA 2ITYA 3F69A 4FVPA 4PMTA 3FI2A 3EWHA 4RZWA 2PULA 4QD6A 2YZAA 4BFMA 4HVHA 1BYGA 1PKGA 4HVDA 4LRMA 4FV0A 2YM4A 3AMBA 3NYVA 4ZXTA 2QU6A 4EYMA 4FI1A 2QOOA 4O7YA 3GU7A 2ZM3A 4FKIA 4IB0A 3VJNA 5KNJA 5FD2A 2HY0A 2G9XA 3GCVA 4R3RA 2ZB0A 3F5GA 4LFIA 4N0SA 1Y8GA 4FSTA 3E92A 4EWHA 3CIKA 1V0OA 4ASDA 3A7FA 2NRYA 3F66A 3R73A 4FSZA 5CT0A 3MSSA 4ERKA 1YOLA 3FKOA 3F61A 3DQXA 3IGOA 4O1PA 4R3PA 2QVSE 5JH6A 4KD1A 3CP9A 1J7UA 5DT3A 4QMQA 3PG1A 5E4HA 4WA9A 5J8IA 5EI8A 4EOMA 2FSLX 1JSVA 2OSCA 4S31A 4EOKA 4NEUA 1WBTA 4UY9A 5FXSA 1IA9A 3GQIA 3N4TA 5AUTA 4EOLA 4JIAA 2EXCX 3E64A 3KK8A 4IWPA 3R8MA 2AUHA 3DXNA 4XV1A 5I9XA 3NUYA 2ONLC 3TKHA 4DLJA 3FMMA 3D7ZA 4IM2A 4BBMA 3GGFA 4CKJA 4CYJA 2Q0NA 2WTIA 2WU6A 4RX9A 3TDWA 4JBVA 4YUQA 4O86A 4RVKA 4GUEA 5C03A 3FMHA 2O8YA 2JFLA 4O0RA 3V5TA 3VRYA 4F9CA 4CTCA 1FVRA 4AXAA 4BKZA 4HCTA 4ANBA 1VJYA 4Q5EA 2V7AA 4XNEA 3R01A 4AW1A 3A8WA 4I6FA 4YJTA 5CVFA 2UW6A 3G0EA 3OY1A 2PTKA 4IAFA 5CEQA 4Z3VA 3CXWA 3I79A 4F63A 1OKVA 4OLIA 3ANQA 2PSQA 3TNHA 2VWBA 3BU6A 4GV1A 1H26A 3ORLA 2QD9A 5TKDA 2RSVA 4G3EA 2C5VA 4FX3A 5AP5A 1MP8A 1XBBA 4I41A 3RCJA 4GU6A 1Z9XA 3MTFA 2RFSA 3QRIA 3OF0A 4FMQA 2FSOX 2R7IA 3NEWA 3LFAA 3UMWA 5EQPA 4BZDA 4NJDA 3B2TA 3ZO1A 2QKWB 3MY0A 4HZSA 3UQGA 3GUBA 2GNFA 2VO0A 1RJBA 4UWYA 5FDPA 2CLQA 5FP6A 4RC3A 2J0MB 3WYXA 3ULZA 4D2TA 4RVLA 3R8PA 3F2AA 2YDKA 5BVWA 2BVAA 4EORA 4EOSA 2BTRA 4FE2A 3SKCA 3COIA 1WBNA 5C27A 2CN8A 4BDHA 2CGVA 3D7TA 2F57A 4UWCA 3PVBA 2W1HA 4YZCA 4FEXA 3C9WA 4OTHA 4Y46A 5BYLA 4G3CA 2GS2A 3G9LX 4W8EA 3QQKA 4QYYA 3C0HA 3P78A 4FIHA 4NKAA 2CMWA 4CEGA 3DDQA 4RIYA 2EUFB 2YM5A 2WTWA 4BCKA 4H58A 2QOFA 4QQCA 2WGJA 4EL9A 4YO6A 3RWPA 3D7TB 2BILB 1YKRA 4FICA 4QMZA 5AP2A 3LZBA 4CVAA 4AACA 1ZMUA 1ZOEA 3UQCA 2JKKA 3OW3A 2G2FA 2UUEA 5JFVA 3SX9A 4XP3A 3PA3A 3PVGA 3D14A 4XG3A 5HVYA 2F7XE 3MH3A 2XNNA 3L8PA 5LXMA 3EL7A 3RPOA 3UP2A 5HTIA 2W96B 4D55A 4MBIA 4L44A 4QMOA 5LWMA 3GOKA 2X6DA 2XCKA 4ONAA 1WBSA 3W8LA 4C37A 3EKNA 3BLQA 2C6IA 4JBQA 2YWVA 3T9TA 4D2SA 4IC7A 1ZOHA 3VHEA 4PL3A 3IECA 4LMNA 3NCZA 2CGWA 3I6UA 3NNXA 4I20A 4KRCA 2W05A 2JDOA 4J1RA 4M0ZA 1KV1A 4FTTA 5E1SA 2ACXA 3P5KA 1S9JA 3GC8A 2OBJA 3Q5ZA 4PX6A 1Q8TA 4QOXA 3IDBA 2F49A 2E9VA 3OZ6A 3QQJA 1OZ1A 3OTVA 3H4JA 3ZDUA 3ZLYA 2HZ4A 3B8QA 3PXYA 3ZC6A 3UQFA 1GIHA 1NVRA 3FZPA 3BX5A 5M53A 5HBJA 4BI2A 2XIRA 4BCOA 3KMUA 1J1BA 4GL9A 4FKJA 2VZ6A 2BZHB 3GCQA 1OL7A 4YJOA 3P7BA 4C33A 3AGMA 4IX6A 2OJJA 2EU9A 1E1VA 4KIQA 5AP7A 2JLDA 3LCKA 4BVUA 1XBCA 3EB0A 2PE2A 3GXLA 4C38A 1OM1A 3UO4A 5FGKA 3CY3A 1MRYA 5AP4A 5FTOA 4E6QA 5HE2A 1P2AA 3FQHA 1H00A 5CWZA 2VWWA 4IE9A 4CG8A 1M52A 2WMBA 3OMVA 4CT1A 1ZWSA 2ZV8A 4LG4A 1PHKA 4RC2A 5HG5A 1ZYLA 4TNDA 1DS5A 1G5SA 5DR9A 3HRFA 3GCSA 4R7HA 4RGJA 3GEQA 3WE4A 3DTCA 2YIYA 2X6EA 2RGPA 1GZ8A 1UWJA 1CM8A 4U6RA 2ZV9A 2CDZA 2GDOA 1V0PA 4DINA 1OIUA 3NUXA 5E91A 1KE6A 2XRUA 3BE2A 2KTYA 5DT0A 3PYYA 3ORIA 1Q99A 4PNIA 3VBYA 3PLSA 5CU4A 1WMKA 4MXAA 1URWA 4IWQA 5ACBC 2Y9QA 4MH7A 4Q9ZA 3TKUA 4W4WA 5GZAA 2WNTA 4I5PA 1H1SA 2GS6A 2VTMA 3PXZA 5IA4A 5ICPA 5IH5A 3R8ZA 1DI8A 2YACA 2GNGA 5CQWA 4YU2A 3I81A 4TW9A 3PWYA 4ZSAA 3QL8A 5CF5A 4WG5A 4CSVA 3ZS5A 4BN1A 4K6ZA 1WBWA 2PHKA 2WELA 4EH4A 3TM0A 4BYJA 3P23A 5JEBA 3GNIB 1MRVA 3TJDA 3EFJA 1OPLA 3FI3A 3S0OA 5AIKA 3QZFA 4HVIA 1AQ1A 3K5UA 1OBGA 2EVAA 4YR8A 2X2MA 3MFUA 3LFQA 3RI1A 3A60A 2F4JA 4H39A 3C0GA 4PDYA 5IQCA 5C01A 2OF2A 3KRJA 1R3CA 1NW1A 2YITA 4O2ZA 4TNBA 4C62A 3PIZA 1DAWA 2C6TA 3MPMA 5IH4A 3QCSA 3O0GA 3HDNA 4PQNA 4PRJA 3FZOA 4WT6A 3LIJA 2OXXA 5A9UA 3F6XA 3REPA 4JBOA 1LUFA 3TTIA 4QPMA 1LP4A 3BHYA 2JIUA 2XM8A 3DBFA 5CU3A 2VX1A 3PE1A 2ONLA 4OT5A 5E90A 3T9IA 3UP7A 4C2VA 4EHGA 2NO3A 2BDFA 3HX4A 3SXSA 2IVSA 4PMSA 4YTHA 2FH9A 1OUYA 3AT3A 1Q8UA 2XIXA 5DN3A 2RFDA 4MF1A 3AC8A 4R1YA 2CSNA 3RALA 3UVPA 1KOBA 4FKRA 3R00A 5BMMA 4EK4A 4OBPA 4LMUA 1UU8A 3MIYA 3F7ZA 4CRSA 4DH1A 2X4FA 3VRZA 4IIRA 3MFRA 4D0XA 3TZMA 3GENA 2W5BA 3PP1A 4FTKA 4ZLZA 4GT5A 1OGUA 3UNJA 3OEZA 4HNIA 4I0SA 2DQ7X 4OTGA 2QNJA 3RZFA 4U45A 4CFVA 2Z7RA 3C7QA 3ORXA 3LFSA 3LW0A 4Q5HA 4PPAA 5IQFA 3SC1A 3EYGA 2BRNA 4G16A 4GJ3A 3DK7A 5E1EA 4C4GA 3COKA 3R7UA 3AQVA 5HE0A 5BVEA 3FXZA 4L7SA 4X2FA 3OBGA 5B2KA 4U0IA 3VUTA 3RBWA 3L9MA 3MFTA 5BMSA 5CEPA 2V5QA 3O8PA 5AX3A 5IA1A 5AUUA 3DBEA 1T45A 4B9DA 3WZKA 4GVJA 4EKKA 4EZ3A 3AC1A 2YJRA 4KUJA 4X6QC 4I6HA 4X2NA 3PSDA 2XNEA 2J2IB 2C30A 3F3ZA 3OROA 5CAOA 4YNEA 3EFKA 1EH4A 4IACA 4AX8A 2AC3A 2XYNA 3OCGA 5IQBA 4C0TA 3AC3A 3BU5A 1SM2A 4JQ7A 2XK9A 4L53A 5C4LA 5C8MA 3RINA 3VF9A 2QO7A 1TQIA 1CKPA 1RE8A 4F6WA 3NNWA 2HWOA 4C02A 3MI9A 3FZSA 1K2PA 4UX9A 4A9UA 4C4IA 2JDRA 5K5XA 4PY1A 3DJ7A 3ZHPC 2R3NA 4G6NA 1PXNA 4TTHB 4L9IA 3DDPA 5GHVA 3NIZA 2CPKE 3P0MA 3SRVA 4J98A 5KMOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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